MC09g_new0455 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1

Overview


Name	MC09g_new0455
Type	gene
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	Unknown protein
Location	MC09: 21719490 .. 21720914 (+)
RNA-Seq Expression	MC09g_new0455
Synteny	MC09g_new0455

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGCAATGGGATCGGAGAAAATGAGGGATTCAATTAAAGTATTAGAAGCTTTATTATTGAGAACTTGACCCCTACAACTCCTTTTTTCGTGTTGAGAGTATTTTAGCGTAATTCAAAAGAAACTGATGAGTCATGATTGTTGGAGTAATTAATTTGGATTGATTAAAAGCTTAATTGCCTTCAAAAGAAGTTGGAATTATGAGTCCTTTTAAGTCCATCACTCTAGAAATTAACCGAAATTGAGGTTATTTAGTTGGAATCCAAGGGGGGTTTTTTCTTTTGGTCATTTTTGGGTTTGGATCATTTTTATGTCCATTATTAAATTATTTTATTGACAAGAGAGATGAATTTAGAAAAAGAAAAAAAAATCGACCAGTAACAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATANGTGGTGCAAGGAAGATGAGCTTTAGACTATTTCGCGTTTACTTTCAACTTTGGTTGATTTTGATCTGTGTACTTTCGAAATGTTTGTTTTAGTTTCTATTTCTTCAACTTTGGTTCATTTTAGTTCTTCAAACGTCCATTCTGATACTGTATTTTTAAAAAGTGTTTGTTGATCTCTATTTATAAAATTTTACATGCAATGAAAATAGTTGACTACAAATTTATAGTTGCATTTCAAAAATCTTAGTGAATGAGTGAAGTATCATACTAAAGTTACAATAAAAAAGAATCAAAATGATCCATTTTTCAAAGTATAGAGACTACCTTGGACATATTAAACATACAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTACAAAAATAAAATAA

mRNA sequence

ATGGCAATGGGATCGGAGAAAATGAGGGATTCAATTAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTACAAAAATAAAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCAATGGGATCGGAGAAAATGAGGGATTCAATTAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTACAAAAATAAAATAA

Protein sequence

MAMGSEKMRDSIKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKSTKIK

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of MC09g_new0455 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of MC09g_new0455 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of MC09g_new0455 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of MC09g_new0455 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 5..215
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..220
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 11..220
IPR005819	Linker histone H1/H5	PRINTS	PR00624	HISTONEH5	coord: 65..84 score: 39.44 coord: 43..60 score: 41.98 coord: 13..27 score: 37.78

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
MC09g_new0455.1	MC09g_new0455.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0006334	nucleosome assembly
cellular_component	GO:0000786	nucleosome
molecular_function	GO:0003677	DNA binding