MC08g_new0362 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1

Overview
NameMC08g_new0362
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionCACTA en-spm transposon protein
LocationMC08: 18886158 .. 18908614 (-)
RNA-Seq ExpressionMC08g_new0362
SyntenyMC08g_new0362
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGGGGTTTTTTTTGTTCCCTTTCAATCTTACAAAAATTTTGGTTCGTCGTGCCTTGCTCCGTGAGTTTTGTGGCTACTGTCCATCCGTGCCGGCTGTTGTAAGCATCACCATCTCGAGGATGTCGTCTTCAAATCTTGGACCAGGAAACCGACAAAGTTACACAAGCAATGTCGATAGAATAGAAAGCACTCAACCAGGAGAGGCTAGTCAAACAACACAGAGTTCTGGCACGACTAAAAGAAAAGGTAGACATAACACTGAAGGGCTGAATGTTGATAAACATGTCCAAGATCATGGTCTGATAGAAATTAATATCGAAGAAGAAGATGACAAGCCAGTTTGTAGCCATAGTTTGAAATTGGTCTCTCAAATTGGGGTATGGGTTCGGTCGATCGTTTCTCTGAATTGTGAACATTGGTCAGATGTCAACCAAGACGATAAAAACAGTATCATAAATAGACTTAGCAACCAATTCATTCTCAATCTAAATGATCCAATTGTTTATCGTTATCTGGAGCATGAGATGAGTAGTAGGCATATAGATTTCCGATACAGGTTGCATAAGCATTACATGCAATATTCCCCAAAAGAAGCACGACATCACAAACACAAAGATGTTGCACGAGGTGAAGATTGA

Protein sequence

MGFFLFPFNLTKILVRRALLREFCGYCPSVPAVVSITISRMSSSNLGPGNRQSYTSNVDRIESTQPGEASQTTQSSGTTKRKGRHNTEGLNVDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLKLVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSIINRLSNQFILNLNDPIVYRYLEHEMSSRHIDFRYRLHKHYMQYSPKEARHHKHKDVARGED
Homology
BLAST of MC08g_new0362 vs. NCBI nr
Match: XP_022156301.1 (uncharacterized protein LOC111023227 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 419 bits (1078), Expect = 7.71e-148
Identity = 211/212 (99.53%), Postives = 212/212 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 1   MGFFLFPFNLTKILVRRALLREFCGYCPSVPAVVSITISRMSSSNLGPGNRQSYTSNVDR 60
           MGFFLFPFNLTKILVRRALLREFCGYCPSVPAVVSITISRMSSSNLGPGNRQSYTSNVDR
Sbjct: 1   MGFFLFPFNLTKILVRRALLREFCGYCPSVPAVVSITISRMSSSNLGPGNRQSYTSNVDR 60

Query: 61  IESTQPGEASQTTQSSGTTKRKGRHNTEGLNVDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLK 120
           IE+TQPGEASQTTQSSGTTKRKGRHNTEGLNVDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLK
Sbjct: 61  IENTQPGEASQTTQSSGTTKRKGRHNTEGLNVDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLK 120

Query: 121 LVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSIINRLSNQFILNLNDPIVYRYLEHEMSSRH 180
           LVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSIINRLSNQFILNLNDPIVYRYLEHEMSSRH
Sbjct: 121 LVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSIINRLSNQFILNLNDPIVYRYLEHEMSSRH 180

Query: 181 IDFRYRLHKHYMQYSPKEARHHKHKDVARGED 212
           IDFRYRLHKHYMQYSPKEARHHKHKDVARGED
Sbjct: 181 IDFRYRLHKHYMQYSPKEARHHKHKDVARGED 212

BLAST of MC08g_new0362 vs. NCBI nr
Match: TYK04806.1 (formin-like protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 4.44e-20
Identity = 59/123 (47.97%), Postives = 76/123 (61.79%), Query Frame = 0

Query: 41  MSSSNLGPGNRQSYTSNVDRIE-STQPGEASQTTQS------SGTTKRKGRHNTEGLNVD 100
           MSS N GPGNR   +SN++    S Q     Q   S      S +TK KGR  T G+ ++
Sbjct: 1   MSSRNFGPGNRSRSSSNMNEANNSNQNSIGEQEVVSIDSDIQSSSTKTKGRGATRGVGLE 60

Query: 101 KHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLKLVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSIIN 156
           K+VQ +G I I I+ ED KP+C  S KL SQIG  VR+IV L CEHWSDV+++ K  I++
Sbjct: 61  KYVQANGPIRIRIDFEDRKPICKDSSKLNSQIGKEVRAIVPLECEHWSDVSKEVKREIVD 120

BLAST of MC08g_new0362 vs. NCBI nr
Match: KAA0046978.1 (formin-like protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 1.81e-16
Identity = 44/81 (54.32%), Postives = 58/81 (71.60%), Query Frame = 0

Query: 76  SGTTKRKGRHNTEGLNVDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLKLVSQIGVWVRSIVSL 135
           S +TK KGR  T G+ ++K+VQ +G I I I+ ED KP+C  S KL SQIG  VR+IV L
Sbjct: 26  SSSTKTKGRGATRGVGLEKYVQANGPIRIRIDFEDRKPICKDSSKLNSQIGKEVRAIVPL 85

Query: 136 NCEHWSDVNQDDKNSIINRLS 156
            CEHWSDV+++ K  I++RLS
Sbjct: 86  ECEHWSDVSKEVKREIVDRLS 106

BLAST of MC08g_new0362 vs. NCBI nr
Match: KAA0035606.1 (Transposon, En/Spm-like protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 1.70e-15
Identity = 56/125 (44.80%), Postives = 73/125 (58.40%), Query Frame = 0

Query: 39  SRMSSSNLGPGNRQSYTSNVDRIE-STQPGEASQTTQS------SGTTKRKGRHNTEGLN 98
           S +SS N G GNR   +SNV+    S Q     Q   S      S +TK KGR  T G+ 
Sbjct: 629 SGISSRNFGSGNRSRSSSNVNEANNSNQNSIGEQEVVSIDSYIQSSSTKTKGREATRGVG 688

Query: 99  VDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLKLVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSI 156
           ++K+VQ +G I I I+ ED KP+   S KL SQI   VR +V L CEHWSDV+++ K  I
Sbjct: 689 LEKYVQANGPIRIRIDFEDRKPIFKDSSKLNSQIEKEVRVVVPLECEHWSDVSKEVKREI 748

BLAST of MC08g_new0362 vs. NCBI nr
Match: XP_026429332.1 (uncharacterized protein LOC113325351 [Papaver somniferum])

HSP 1 Score: 79.7 bits (195), Expect = 1.45e-14
Identity = 43/120 (35.83%), Postives = 70/120 (58.33%), Query Frame = 0

Query: 72  TTQSSGTTKRKGRHNTEGLNVDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLKLVSQIGVWVRS 131
           TT + G+ + +G   T GL +D+HV  +G I I IEEED+KP   ++ KL S+ G  VR 
Sbjct: 24  TTDTDGSMRHRGP--TRGLEIDEHVGRYGRIPIIIEEEDEKPTDENAQKLSSECGCIVRQ 83

Query: 132 IVSLNCEHWSDVNQDDKNSIINRLSNQFILNLNDPIVYRYLEHEMSSRHIDFRYRLHKHY 191
              L  + WS +  +D+ ++   L N+F + ++ P + ++L H M  R+ D+R+ LH  Y
Sbjct: 84  FAPLQVQKWSKIPVNDRKALFPYLLNKFDIEISAPHICKFLNHNMGRRYADYRHDLHLQY 141

BLAST of MC08g_new0362 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DUJ0 (uncharacterized protein LOC111023227 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023227 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 419 bits (1078), Expect = 3.73e-148
Identity = 211/212 (99.53%), Postives = 212/212 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 1   MGFFLFPFNLTKILVRRALLREFCGYCPSVPAVVSITISRMSSSNLGPGNRQSYTSNVDR 60
           MGFFLFPFNLTKILVRRALLREFCGYCPSVPAVVSITISRMSSSNLGPGNRQSYTSNVDR
Sbjct: 1   MGFFLFPFNLTKILVRRALLREFCGYCPSVPAVVSITISRMSSSNLGPGNRQSYTSNVDR 60

Query: 61  IESTQPGEASQTTQSSGTTKRKGRHNTEGLNVDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLK 120
           IE+TQPGEASQTTQSSGTTKRKGRHNTEGLNVDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLK
Sbjct: 61  IENTQPGEASQTTQSSGTTKRKGRHNTEGLNVDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLK 120

Query: 121 LVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSIINRLSNQFILNLNDPIVYRYLEHEMSSRH 180
           LVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSIINRLSNQFILNLNDPIVYRYLEHEMSSRH
Sbjct: 121 LVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSIINRLSNQFILNLNDPIVYRYLEHEMSSRH 180

Query: 181 IDFRYRLHKHYMQYSPKEARHHKHKDVARGED 212
           IDFRYRLHKHYMQYSPKEARHHKHKDVARGED
Sbjct: 181 IDFRYRLHKHYMQYSPKEARHHKHKDVARGED 212

BLAST of MC08g_new0362 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C2Z5 (Formin-like protein 4 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold68G001300 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 2.15e-20
Identity = 59/123 (47.97%), Postives = 76/123 (61.79%), Query Frame = 0

Query: 41  MSSSNLGPGNRQSYTSNVDRIE-STQPGEASQTTQS------SGTTKRKGRHNTEGLNVD 100
           MSS N GPGNR   +SN++    S Q     Q   S      S +TK KGR  T G+ ++
Sbjct: 1   MSSRNFGPGNRSRSSSNMNEANNSNQNSIGEQEVVSIDSDIQSSSTKTKGRGATRGVGLE 60

Query: 101 KHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLKLVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSIIN 156
           K+VQ +G I I I+ ED KP+C  S KL SQIG  VR+IV L CEHWSDV+++ K  I++
Sbjct: 61  KYVQANGPIRIRIDFEDRKPICKDSSKLNSQIGKEVRAIVPLECEHWSDVSKEVKREIVD 120

BLAST of MC08g_new0362 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TVR8 (Formin-like protein 4 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold230G001640 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 8.78e-17
Identity = 44/81 (54.32%), Postives = 58/81 (71.60%), Query Frame = 0

Query: 76  SGTTKRKGRHNTEGLNVDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLKLVSQIGVWVRSIVSL 135
           S +TK KGR  T G+ ++K+VQ +G I I I+ ED KP+C  S KL SQIG  VR+IV L
Sbjct: 26  SSSTKTKGRGATRGVGLEKYVQANGPIRIRIDFEDRKPICKDSSKLNSQIGKEVRAIVPL 85

Query: 136 NCEHWSDVNQDDKNSIINRLS 156
            CEHWSDV+++ K  I++RLS
Sbjct: 86  ECEHWSDVSKEVKREIVDRLS 106

BLAST of MC08g_new0362 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T089 (Transposon, En/Spm-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold285G002870 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 8.23e-16
Identity = 56/125 (44.80%), Postives = 73/125 (58.40%), Query Frame = 0

Query: 39  SRMSSSNLGPGNRQSYTSNVDRIE-STQPGEASQTTQS------SGTTKRKGRHNTEGLN 98
           S +SS N G GNR   +SNV+    S Q     Q   S      S +TK KGR  T G+ 
Sbjct: 629 SGISSRNFGSGNRSRSSSNVNEANNSNQNSIGEQEVVSIDSYIQSSSTKTKGREATRGVG 688

Query: 99  VDKHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLKLVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSI 156
           ++K+VQ +G I I I+ ED KP+   S KL SQI   VR +V L CEHWSDV+++ K  I
Sbjct: 689 LEKYVQANGPIRIRIDFEDRKPIFKDSSKLNSQIEKEVRVVVPLECEHWSDVSKEVKREI 748

BLAST of MC08g_new0362 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BIG6 (DUF4218 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold156G00880 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 9.22e-14
Identity = 65/176 (36.93%), Postives = 91/176 (51.70%), Query Frame = 0

Query: 41  MSSSNLGPGNRQSYTSNVDR-IESTQPGEASQTTQS------SGTTKRKGRHNTEGLNVD 100
           MSS N G  NR   +SN++    S Q     Q   S      S +TK KG+  T  + ++
Sbjct: 215 MSSRNFGSRNRSRSSSNMNEPSNSNQNSIGEQEVVSIDSDIQSSSTKTKGQGATRRVGLE 274

Query: 101 KHVQDHGLIEINIEEEDDKPVCSHSLKLVSQIGVWVRSIVSLNCEHWSDVNQDDKNSIIN 160
           K+VQ++G   I I+ ED KP+                            V+++ K  I++
Sbjct: 275 KYVQENGPSRIRIDFEDRKPIY---------------------------VSKEVKREIVD 334

Query: 161 RLSNQFILNLNDPIVYRYLEHEMSSRHIDFRYRLHKHYMQY-SPKEARHHKHKDVA 208
            LSN FIL++N+P+V  YLEHEMS  + DFR  LHK Y +Y SP +AR H+HK VA
Sbjct: 335 GLSNYFILDVNEPLVQDYLEHEMSVLYRDFRCSLHKSYKKYDSPAKARKHRHKRVA 363

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022156301.17.71e-14899.53uncharacterized protein LOC111023227 [Momordica charantia][more]
TYK04806.14.44e-2047.97formin-like protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0046978.11.81e-1654.32formin-like protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0035606.11.70e-1544.80Transposon, En/Spm-like protein [Cucumis melo var. makuwa][more]
XP_026429332.11.45e-1435.83uncharacterized protein LOC113325351 [Papaver somniferum][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1DUJ03.73e-14899.53uncharacterized protein LOC111023227 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023... [more]
A0A5D3C2Z52.15e-2047.97Formin-like protein 4 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676... [more]
A0A5A7TVR88.78e-1754.32Formin-like protein 4 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27... [more]
A0A5A7T0898.23e-1644.80Transposon, En/Spm-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_... [more]
A0A5D3BIG69.22e-1436.93DUF4218 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E567... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 62..80
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 62..92
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33499:SF13TRANSPOSASE, PTTA/EN/SPM, PLANT-RELATEDcoord: 62..207
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33499FAMILY NOT NAMEDcoord: 62..207

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MC08g_new0362.1MC08g_new0362.1mRNA