MC08g_new0362 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTGGGAGGTTAGTGTCCCCACGTCACTGCTTTTGTTTTTTAGCAGTTCTGCAAAAGTTACAGAACACAGAACAAAGGTGTGGAATTCCCAGATCTCTCTGAAGGAAAAGCTCTCTCTCTCAAAATTCTCCCTTACGTTCCAAATTGACGCTCCCACAAGCACGATCCTGAAACCTAAGAGGATAGCCAGGAAGACATAGTGGTGGTGTTCGAGGGCAACTTACTGAAGAAACGTTCTTCAAAGGTTTGTTTTTCCCCTGTATTTTCCTTCTTTAAAATTCGATTTTGTATCCCGAAAATCAATAACGAAAATCCGTTTCCGCTCCGGGATTAACATCCCTTCATGTTTGACACCATAGCACCGTAGTCGTGCGGTAATTGCTTTCAGGGCAGTGGCTTCGTCCACGACACAACAAGACAATCGTTTTTCATCTAAATTCACCTTTTATTTCCAACAACATTTACATGTACATAATGAAACAAAGAAGCCTATAGATCAATTACTTGCATTCATAGTTCTCTGACATCCTGAAGTTTGTACAAGACCTAACGAAAAAAAAAATACCTAATTAGATAAATCAATAAGCAAGAAATAGATAAAAGAAAAAAAACTCACTTCTAAATGCATCCCATAAGGTATTGTAGGTAGGGGTGTTCACGGTTCAATTCGGTTTAGTTTGAGGATCGAACCAAAATCGAAACAGATTTAAAAAAAAAAATTCCAGAACCAAACGGAATCGAAGTACATGGCTAATGGTTCGGTTCGGTTCGATTCTTGTGGTTTGGCCTCTAGGTCTGCTACTGTGGGCCTGGGCTTCTGGGATTAGGATCTCCAATTTGTTTATGTGTTGTTTGTTTTTTTTTTCTTATTTTGTTAATTATGATAGATTTGTACATTTATTTTTAATTTTTTTAGGTAATAGTTTAATAATTATTAATTTCAAAATTCATTACTTCTAAAAGGTTTAAATATTTAATATAAAATGTAGATATTTTATTTCAAACAAATATGTTTCAATTCCAACATTAAATGTTAAAAGTACAATTTCAATCCTAACATTCATTCAAATTTAAAAATACAATCGACGAGTTCTGAATAAGTCGCTAGCCACAAGTTCTAAATTAACAATTCAAGATAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACACACACACACAAATTGTAAAGATGGAAGTTGGAAGGTTCTAAACGTTAATAAAATACATATTAATCATTCTCCTTCTCTTTCTCCTTTGCGGTTTCTTCTAATTTAGTTTTGAAGTCTACAAAATAATAATACTAATAATAATAAATAAATAAATAAAATGGTAGTTACAACCACAGTTTACTAGCAAGCATTGAAAGCAGATGCCATAATGACTCTTTGAATTGAACGACATAACAAAGGAACTAGCAGCCATTAAGACTGAACGAGATGAGGATCAAAGAAAGTCGAAGTAACTGTGATAAGCAGGTTCATTTTACCATAAAAGTAGAAAGAAGGAAAGAAAAGGGAATCCACTTTTTTTTTCTCTTTCAAAACCTTTCTTTTTTCGGTATGCCGCTCCAAAAGTAAGGAGTGCCACGCACCAGCGGAGCGAAAACAAAGCCAAAGCAGGGGGCAACGCTTCCTTGCTCATGACCAATCCCTCAAAGCAATGAATGCAAAAAGCATGCCATAGAACAAGAAAAAGTTTCTGCATGGCGAAATACAGCATTGAACGGTGGTACGTAAGGCTTAGAGTCAAGGCATTCATAGGTCTCCTGTCGGAGCTCTACGGAAGTGATAGCAGAAAAGGCAAGTCTTCCTGGGTCTACTTGTTGTCCTCAAAAGCTCTTTGACACTTTTCCGATCAGTGAAATGCCATGATCGGTCCGTACGTCCTTCTTTAGTTTAGGATATTTTTTAGTTGAGTAGCCATCTTCGAGTAACTTACCATGAATCTTTGGTAATAGTTCACGAGCCCTAAAAGTGATATTAGCTCACTCAACAACTCGAGTTTTGCTTCGCATCAAACAACTGGTATTATGCATTCATCTTCCAAGTGTCATTCTCAATGGTTTTTTTACATTTACACTGGGCCCGAGCTCGTTCTTCTATTTTGAGATCTTTAGATTCATAAGATCATGATAGAGTCCCCTTTACTTTGATATTCAATTATTAAAGCTCGCCAGTGCCTTTCTTTTACGGCCTAAATTCCTATTTGTCACTTGTGGGAGTTAGTTCCTTTCTCTAAAAGATGAGGAGAACAACGTCGAAAGGGTTGGACTTGGCCTGCCTTCAACCAAAGCGTTAGAAGCCTTTACCTTAATTAAGGAGACCTTTAGTAGATTGGGAGTGTTCCTAGCTTGATTCTTTCTTATCTAGTAGCAGCTTTAAGAATGCATCTGGTTCCCTCTTTCTTTCGTTAGTTACCCACCTTTTTCTAAAAGGGATTGTAGTAATTCCAGCATTCCTTCACTGGAAACTTGTCGACCTTCTCGATAATCGGAGTGAAAAGCCTTAAAGAGAAAGCTTTAGCAACGGTAGGAGTTACTATTGGAAAAATGGTAAGATTAAATAAAAGATTGTTGTACCGTGGACAAAACCACTGCCTCAAAAGCAATTTCGGCATGGCCTCGGTGCTATATCGTATACTCGCCGGTTGCTTCCCAAGGTTAACACAACTTCGAACCCAAAAGTGCACTCGTCGGGGCCAAATGGAATCGATAAACGTGCTCAGAAACATATTCTTGTTTTCTAAAACAAAAACAAGTCTTTATTTATATAGAGATAGTATGCTATTTTTGGAAAAATAGTAAAGTTAAAAATAACATAGTCTAAATTTATAGTAAAGTTAAAAATAACATATTCTAAATATATCAACTTTAAAAATAGCTGTAAGACTAAGTCTTTTAAGGACGAATTAGTCATTCCCAACAATCCTCCACGAGTGACTAACTAGTTCTTAAAATATACAATTCAGAGCAGTGAAGGAAAATAAACTTAAACATTACTATCTTACGATTTGAGTTAATGCATAGTGAAGTGAGACAACAACCTAAATAATGAAAGTGAGTTACCTCTTGAACTTCCAATAATTATGGTTGAGACCCCCACAACACATTTTATTCCCTGTTTTCGATCCCGCAATATAAATCAAGTGCTATTAATGGTTATGCAAATAAACCTTGGGTCATCGTGAAAGCTCTAGAAAGATACTTTTTAACTCTTTCATAGAAGGCGACCTACCTTCATAATTACATTATTGCTTCATCAAGTCTATCACAGATAAACCACTCAAAATTGAGTTATGAATACTTCATATATCATCCATTAAGTCCATAAAGACCATCTAAATAAAAGGCTATGGATTCTCATAGTACATTACAACTATTATTCATCAAGTCTGTACATACTACCCAAATAAAAGGCTATGGATTCTCATAGTACATTACAACTATTATCCATCAAGTCTATATAGACCACCCAAATATAGAGCTATGGATTTAAAGCTTCAACAAAATCATCGATTAAGTCGTAGCTAGGACCACCCAAAATATAGAGATATGGATTCTTAGCTTCATTACTAAATAAGTCTTATTAATTTCTACTTGTTTTCAACCAAAAAGGTGGTTAAGAGAATTTAATTTCATAGGATTATAATCATAATATCTTAAATTAATTATTCTACCAATAACTAATTTAAATTCATATAATCATGTTAATAAACCTCACCAAAAAGATAATTTTCAACAGTTTACTAAATAATTTAAATAGCAACATTTCATCGTTAATTGACATTAGATGTAATTATTTTATATATTTAATCAAAATAAGACTATATATTCGACTACAGTCAAGCGAGATCTCAAATCACCCATAAATTAAGATAAACTTAAATTGAGATATTTCATTACCTTAAGAAACTTGCTTTAACTCATACATAAAATTGTCAATAAATATCTTGCTCAATTTATGACAACGATATGAATTGAAAATTGTTAAAAACCTCGTCAGAAAATTAAAAGATTTAAAAAATTTACGCCATAATATAGGAAAAACCAGCCTATATAAAACTTAAATATGTAGTGAGAATAATAACAATCCAACTATTTCCAACTTAATTTTGACATAAATAATCAACATATTTATGCCAAATCATTTATGCATGAGAAAATTATATTATCATTATATCATTGCACAAGTCTCACTAGAGCACGGAATTCACCTGCTCAGCTTCCCTTTTTCCAACTTTCAAAATTTTCCCGGCGGCCTTCCCCACAATTGTGGCATTTGCGCATAATCCATTCTTGAATGCTAAGATTTCTCCTCAACTGTGTTGGGCCAATCAACAATTCTGAAGGAAAAATTGAAAGTAGGGAGATTATAAAATGTAAAGAAAATCTCACACATATAAACCACGAGTAGTACTGAATTATAGTATGTCGGTCTGGTTTGCGATTTTTTCTTTTAAATGAATTTTTCTCTCTTTGATAAGACAAAAGAGATGACCCATTTTCTCTCTCTTCATCTTCTCTCCACACTTATATTGTCCGTTTTTTCATTACAATCTTCACTTTTTTTTTTCCCTTCATTCATTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCTTTTTCCTTTATTCCTTTCCCTTTCTTTTGGAAAGAAACCCATTTCTCCTTCTCTCTTTTCAATCTCGGAAGCCAACACCCAAAAGCCAAAATGCTTTCCGCTTTCACCACAGCCCCTCGCCAAAGGCCTCTGCGACTACCTCCTCTCTCCATCGATCTCGTATCATCCGCAGCCTATCATTTCCAGCAACACACGTACGTCTCCTATACCGGTGACCACAAGCAGATCCGACTGCGCAACCCAGCAGTGACCACGAACAGCAAATCTACAACCAACTGTTCAGATCCGGCGCAACCTATCGGTTTGAAGCTTCTGTAGTCCACGAACGGCGGCTTCGACTAATGGGTGCAAACCATGTTCAGATCCGACCAGCAGACGACGACCC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Match: XP_022156301.1 (uncharacterized protein LOC111023227 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 419 bits (1078), Expect = 7.71e-148 Identity = 211/212 (99.53%), Postives = 212/212 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0362 vs. NCBI nr
Match: TYK04806.1 (formin-like protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 4.44e-20 Identity = 59/123 (47.97%), Postives = 76/123 (61.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0362 vs. NCBI nr
Match: KAA0046978.1 (formin-like protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 1.81e-16 Identity = 44/81 (54.32%), Postives = 58/81 (71.60%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0362 vs. NCBI nr
Match: KAA0035606.1 (Transposon, En/Spm-like protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 1.70e-15 Identity = 56/125 (44.80%), Postives = 73/125 (58.40%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0362 vs. NCBI nr
Match: XP_026429332.1 (uncharacterized protein LOC113325351 [Papaver somniferum]) HSP 1 Score: 79.7 bits (195), Expect = 1.45e-14 Identity = 43/120 (35.83%), Postives = 70/120 (58.33%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0362 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DUJ0 (uncharacterized protein LOC111023227 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023227 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 419 bits (1078), Expect = 3.73e-148 Identity = 211/212 (99.53%), Postives = 212/212 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0362 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C2Z5 (Formin-like protein 4 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold68G001300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 2.15e-20 Identity = 59/123 (47.97%), Postives = 76/123 (61.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0362 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TVR8 (Formin-like protein 4 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold230G001640 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 8.78e-17 Identity = 44/81 (54.32%), Postives = 58/81 (71.60%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0362 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T089 (Transposon, En/Spm-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold285G002870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 8.23e-16 Identity = 56/125 (44.80%), Postives = 73/125 (58.40%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0362 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BIG6 (DUF4218 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold156G00880 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 9.22e-14 Identity = 65/176 (36.93%), Postives = 91/176 (51.70%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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