MC08g_new0172 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTCCTCGTGTCGTACACAGGCCGGTCGACGCCACCGTTCCAGTCCGCCATTGGAGGTTCCCTACCTCTGTCCGCCCGCCATAGCTCCAACCCAGTTGCCTCACACCTGAACAACGGGTTAATAGCGCGACTCGAGGAGAACCGAAGCAGGTCAAAAATACAAAATAACCCATCATCCAATCGTGGCCCAGCATTGGTTCAACTCTACAAAGTGAGATAAAATCAGACTACATGTTCCTGAATCTTATCTAATGATTGTCAATTTCATGCTGCTTACATTTTTGATATACAATTGTGCACATTGAACTAAGTGCATACATGTAATGGAAAATTTGAACAAAGTTTTGCACCGATGAAGTTATATGTATGTCCCATTTTGTTTACTTCTGTCTGAATACAATTCCCAGATTTAGTTGCTTTATACGAACCAAACTGGCATGATAGTATGCGTCTGTGAGATCGAACCCTCAATAGGCAACAGGAGATGATAGGATTGCAATATAATGATTTTATTGATGGGTTTTATTTGTGATGATCTGGGTAAATTAGCTTGCGCTTCTCGGAAATGGTAGCATGATTACGTGAGCTTGGTTTATTGATTTGTTCGTTTATTTATTTTCAGGGTTGTAAAAGTTGTAAGCCTCTGTGGACTGGGCCAGTCGCTTGGGGTTAATCTGCTGGAGTTTATAATGCAGCCATGGACACAGCTTCAGAGTAAGCAAATATGCTGTAGATGGCGTCGCGTTCGGAATGGAATTTCTTGAAAGTGTTTCTGTAGTTGCAGTCAGCATACTTGGGCCATTGTTATGCTTTGTCCGAGTCAATAGCTAGTTTCTTCTTGGAATACTGAAAAACAAAGATAAACTACATAGGTGTTAAAGAGATGGAATTACGAATGAAAGTCACTCAAGCGGTTCATGTCCTAAATCATGATACCCAATCTTGCAACCGCGTGGCAGCAAATCAGTGGTTAGTTCAGTTTCAACAGACTGGTGCTGCTTGGGAAGTTGCCACTGCTATCCTTACCTCCGATCGAATTCAACATCCGCTGTCCTCCTTTGTCCCTGAGTTGGAAGTCGAGTTCTTTGCTGCTCAGATTCTTAAGCGGAAGGTTAGTAACTTAGTAGTTTGACTTTAATTTTAATACCATCTAATTTCGGATTGCTGAAATATTTTTTTTCTTATTTTGCGACAGCCTTGTTCCATTTGTTTTGCTTAAGAATAATAATTTCGACACTAGATTTAATTTTGCAGCCAGGAAGAATCCAAATTATTTTTTTTTAAATTTTTTTTTTTGAACAAGATACGAATGAAAAGAAGCAAAAGTGTTCAATGATACAAGCTCCCGAAAGAGTGAAGATAGACAAAAATAAAAAAAACAAGGAAACTAATGAGCTTCAATTGAGATTAACGATCCACAACTTGGATCCTTCACAGTTAGGATTTCAGATGATTGTAGATCTGGGATGAAAGAAGCCATTCAAGATGATAGGATCCTCCATCACTGTTGGCCGTCGTTGTTGCCACCGCTGCTTCTGCCGCCGCGATAGTTTTTTTTCCTCAAGAGAGTAACCTAATATTCTCTTTGTTTCCTCTTATTTATCATACAATGTTAGGATCAGAATCACAAATTCTTGTTTCGCCCTTCACCGAGAACAACCATGCTTAGGTAACATGTCACAAACTCAAAGGCCAAAACTATCATATTAACTATGGCCTTACACCGAACTAGACTTGGGGGGCTTATTTTCGAGCTTGGAATGACTAGCATATACCATCCAGCTTGAGGGGGAGTGTAGAAAATCAAGCTGAAGCTTAACCAATTCAGCTAGAAATTAGGAAGTTAGCTAAGATTTTTGTAAACTAAATTATTTCTTTTTAGTTCATATGGTTCTTGTAAATATGGGTGTTACTCATCACTTAAGAGATAAGGAAAAATCTTTCTCATATACAAAGTTTCATGGTATCAGAGCTTTGATTTTTTTTCCCCTCAAACCTTAGCTTTGTCGTTGGAACCCTAGCCGCCGTTGTCGGAACCCTACCTTTCTTCCTTAGACGAAGCTGCCGCTGCCACCATCGCTACCCTTAGACGCCGTCGTTGCCGCCCTCAGACTATGCCACCACCGCCATAGTTTTTTTTCCCTCAAGAGAGTAACCTAATTATTCTATTTGTTTCCTCTTATTTATCATACAATGTCAGGATCAGAATCACAAATTCCTGTTTCGCCCTTCACTGAGAACAACCATACTCAGGTAACATGTCACAAACTCAAAGGCCACAACTATCATATTAACTATGACCTTACACCGAACTAGACTTGGGGGGCTTATTTTCGAGCTTTTAATGACTAGCATATACCGTCCAGCTTGAGGGGGAGTGTAGAAAATCAAGCTAAAGCTTAATCAATTCAGTTGGAAATTAGGAAGTTAGCTAAGATTTTTGTAAACTAAATTACTTCTTTTTAGTTCATATGGTTAGAACTTCTTGTATAAATATGAGTGTTACTCGCTACTTAAGAAATAAGGAAAAATCTTTCTCATGTACACAGCTTCAAATGTAGTGGCTAGAAGCAAAATTTAAGGCCTCACCCACGGTATTTGTGAAGGGATATGGATAAAAAGGCTACTTTTTCAATTTTCAGAAGGCGCCCATTGCGACAACAAAGCTCCATCTCCATAGCCCACGATCCAGTTCTAACATGCATTTTTTAAAAATTTTGAATTTTAAATTTGAATTTGTAATTTGTAATTTTTTTTAGTTCTTATTCTCTCATTCATTTTTTTTTCCAAAAAAGACAAGAAACAACTTTTCATCGACATATGAAAAGTAGAAAAAAGTTCAAGGATGCAAACTCCCAAAGGAATGAGAGAAAAAGAAGACAGACCAAAGCAAGAAAGAGGCTCAACAATGAGCATTACAATCAAAATAAGAAAATAATAAAAGCCAACAATAGGATCAAGAGTTTTTAACTTCAGGCTCGCCTACTTTAACTTCTGGATATAGATCTTTGAGATCATGCGAAAATTTGGCACGAATTTAAGTTGATCCTCAAACATGATAAGCTTGTAACTCCAATCATCTTCTAAAAAACTCATCTATCATCATACTCTGTAGTCTGTTCAAAGGTTTTTTCTGTTCAAAGTTTTTCTAACTGTTGCTAGCCAAGCATATTAAGATAAGAAATGTGCTTAAAGAAAAATCTCAACCCAAGTAAATCAACCAATCAACGAGATAAAGGACAATCAGCCCCCTTCTCCAACCAACATTAATGTGGTTGCTGCAGAAAAGACTTTTCATATCTCTCAACTGAAAGAAATCAGAAAACCGCCTAAAAAACCCTGATTCTTCACCTTCCAAACCCTAAAAATGCCCCAACTCTTCACCTTAAAAACCCCTAAACTGCAAAGCACAAATCCAACACTCAATACAACTTAAAAATCAGAGGTTAATATCAATCGGGACCAGTGTAATCCCCATTTCTTCAAAATATGGAGGAATATAAGGTTGCTTCGAAAATTCTGACTTCTCGGCTTCTTTTTGCTCATAAAAAAGAATCTTGAAATCTTCCTCAAAAGATTGCTCTGAGATACCTCAAGAGGAAGATCTGACTTTGATGAAGAATTCAAACTAATAATACTAATTGCTCAATCCTCTTCTCCCAAGATCATTATTCGGAGCTCAAGGGTAGAAAACCTATGAGCTAAATCTTCATTAGGAATTCGACCATAAGAAAGAGAATTAATTTTGAGTGATCTACTTTTACTAACTCTTTCACTTTTCATATTAAAAGTCTCATTCAAATTTACTTGCACCTCTTTAACTTCTAGAGACTTTGCAAACCCCTTTTCAGAAAGAGAGTTGGACTTCCTTTGAGAAAAGAAAAGCGGAAGAGGCTGAATGAGTCTTTTAGTATTCTTCATACCTTGTGGAAAGATTGGATTGTCAACACCCCACCCTTGTCCACTACTTTCCAGCCAACTAGAGTATTAAACTGATCTTTCAGATCTTTTTCAATAATAAAATCAACTGGGGCATTTTGAATAATCGAGGGGCCATCTGCAAGCTGATTTGTCTGACTATCCGAACACTCAACCAAACTTCGAGCTTCTTCCAATGATTTAACTGAACTTTGTCTCCTGACCAAATTGTCTTTGAAAGAGGCCTCTTTGCAAAAAATGAGACTCTTCATCTACCATAGCTTCTTGCTAAGAAGCACGGACACGGATACGGGACACGGACACGGACACGATAGGACACGGCGATACGTCAATTCCTAAAAAATTAGGACACGGACACGTTGGGGATACGTTTATTTTTTTAATATTTTTTAGGATATATGTAAATTTAATACAAAAAATGCTAAATACAATGAAATGCATAAATATGAAGTCAATTACATCCTTCAACAAAAGTTAAAAAAGAAAGTTCCAAAAGACCAATATAGTGACAAAACAAAGAAGGGATGTAAAAGAGGATTGTTTTTATTAGAGTTTACCTAAGAAAAATGAAAAACTGAGGCAGAAAACAGAGACGAAGGAGTTTACCTGAGGAAAAAAAAAAGAAAAACAGAGGCAGGGGCGTCGGTGGCGGCAATAAGGGCGGGCTGCGCGGTGTCGGCGTCGGCGGCAAAGAACACGTGCAGCGGCGTCGGCTTCGTGGGGGAGGGGTGGTGGTGGGTGGGTATTAGGTTTTTATCATTTATTTGTTTTTTTTTTAAATTACTCATGGGCATTGGGCCTTTTTATTTGGGCCCAGAAAACTTCCAAGGCCGTGTCCAGGTCGTGTCCCAGCCGTGTCTGATTTAAAAAAAAAAAAAATCAGACACGCATTTTGGCGTGTCTGACACGTGTCCGGCGCGTGTCCGGGCGTATCCGTGTCGGACACGTGTCCGACACAGATACTTCGCCCAAAAATAAGTGTCCATGTTTCCTTGGCTTCTTGCAATCTTTGAATGTCCAAAGGGTTAGAAGAGTCAGACTACAACAAAGAAT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ATGTTCCTCGTGTCGTACACAGGCCGGTCGACGCCACCGTTCCAGTCCGCCATTGGAGGTTCCCTACCTCTGTCCGCCCGCCATAGCTCCAACCCAGTTGCCTCACACCTGAACAACGGGTTAATAGCGCGACTCGAGGAGAACCGAAGCAGGGTTGTAAAAGTTGTAAGCCTCTGTGGACTGGGCCAGTCGCTTGGGGTTAATCTGCTGGAGTTTATAATGCAGCCATGGACACAGCTTCAGAGTGTTAAAGAGATGGAATTACGAATGAAAGTCACTCAAGCGGTTCATGTCCTAAATCATGATACCCAATCTTGCAACCGCGTGGCAGCAAATCAGTGGTTAGTTCAGTTTCAACAGACTGGTGCTGCTTGGGAAGTTGCCACTGCTATCCTTACCTCCGATCGAATTCAACATCCGCTGTCCTCCTTTGTCCCTGAGTTGGAAGTCGAGTTCTTTGCTGCTCAGATTCTTAAGCGGAAGATCCAGAATGAAGGCTACCTTTTGCAATTAGGAGTAAAAGATGCTCTACTAAATGCTCTTCTTGTGGCTGCCAAAAAGTTTAGTTCAGGCCCTCCTCAGCTTTTAACTCAAATCTGTCTTGCACTCTCTGCGCTTATTCTGAGGACGGTAGAGCATGGGAAACCCATTGATCGTCTTTTCTACAGTCTTCAGAATCTGCAGAGTGTGGACAACGGCAATTTAGCTGTGTTGGAGATGCTTACTGTTTTACCTGAAGAAGTTGTTGACAGCCAAAATGTCGATTGTAAAATAAGTTCATCCTGTCGAAGCCAATATGCCCGAGAGCTTCTGTTGCACACTCCTATGGTTCTTGAGTTCCTACTGCAGCAGTCTGAGAAAGGATTTGATTGTGGTACACAGCCACAGGAAAGGAACAGAAAAATTCTTCGATGTTTGCTGAGTTGGGTTCGTGTTGGGTGCTTCTCCGAGATACCTCAGGGTTCACTGCCAACGCATCCCCTTCTTAATTTTGTGCTCAAGTCCTTGCAAGATGCTGCTTCATTTGATTTGGCTATTGAAGTTCTCGTTGAGCTCGTGAGTAGACATGAGAGTGCTCTATTTGAATACATGGATGAGGGGTTACCGCAGGTTCTGCTGTGCAGAGTACATTTTCTCAAGGAAATGCTTCTTTTGCCTTCTCTTGGTAGTGGAGATGAGAAAGTAATCGGTGGTCTTGCATGCTTGTTCTCAGAAGTTGGGCAAGCAGCACCATCCTTGATTGTAGAAGCCAATGCTGAAGCTCTCGCATTAGCTGATGCACTCTTGAGTTGTGTGGCTTTTCCAAGTGAAGACTGGGAGATTGCTGACTCTACATTGCAATTTTGGTCTTCTCTTGCGAGTTATATTCTTGGCCTTGATGAGAACAATTCGGGAAATAGGAAACATGTGGAAGATGTATTTTTATCTATCTTTTCAGCACTGCTTGATGGGCTTCTATTACGTGCTCAGATTGTGATGCTCTTGGTACGTGTCGTGCAAAAATTCAAAATCAACAATTCTTGGTACTTGGTTCTTGGAGTGGGTGATCTGGCAAAAGGCAAGCTTCCATGTGTAGAACTAAACAAAGGAAAGCTAAACAGTGGAAAGCAAAAAGGGAGGTTGAAATCTCAGATTTTCAGCAAAGAAGAACAGAGGAAGCCACGATCTTATGCTGAGGTAGCTCTTGGTGTTCCATCAGGAGAAGGGAGTTTGCCTGAAGGATTACAGATGGGGTGA MFLVSYTGRSTPPFQSAIGGSLPLSARHSSNPVASHLNNGLIARLEENRSRVVKVVSLCGLGQSLGVNLLEFIMQPWTQLQSVKEMELRMKVTQAVHVLNHDTQSCNRVAANQWLVQFQQTGAAWEVATAILTSDRIQHPLSSFVPELEVEFFAAQILKRKIQNEGYLLQLGVKDALLNALLVAAKKFSSGPPQLLTQICLALSALILRTVEHGKPIDRLFYSLQNLQSVDNGNLAVLEMLTVLPEEVVDSQNVDCKISSSCRSQYARELLLHTPMVLEFLLQQSEKGFDCGTQPQERNRKILRCLLSWVRVGCFSEIPQGSLPTHPLLNFVLKSLQDAASFDLAIEVLVELVSRHESALFEYMDEGLPQVLLCRVHFLKEMLLLPSLGSGDEKVIGGLACLFSEVGQAAPSLIVEANAEALALADALLSCVAFPSEDWEIADSTLQFWSSLASYILGLDENNSGNRKHVEDVFLSIFSALLDGLLLRAQIVMLLVRVVQKFKINNSWYLVLGVGDLAKGKLPCVELNKGKLNSGKQKGRLKSQIFSKEEQRKPRSYAEVALGVPSGEGSLPEGLQMG Homology
BLAST of MC08g_new0172 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUL2 (Transportin MOS14 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MOS14 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 116.3 bits (290), Expect = 1.1e-24 Identity = 109/375 (29.07%), Postives = 166/375 (44.27%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7YWD2 (Importin-13 OS=Bos taurus OX=9913 GN=IPO13 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 104.4 bits (259), Expect = 4.5e-21 Identity = 109/410 (26.59%), Postives = 190/410 (46.34%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8K0C1 (Importin-13 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ipo13 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 5.9e-21 Identity = 109/410 (26.59%), Postives = 189/410 (46.10%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O94829 (Importin-13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IPO13 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 1.0e-20 Identity = 109/410 (26.59%), Postives = 189/410 (46.10%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZIC8 (Importin-13 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=IPO13 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 101.3 bits (251), Expect = 3.8e-20 Identity = 107/410 (26.10%), Postives = 186/410 (45.37%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. NCBI nr
Match: KAA0048525.1 (transportin-3 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 780 bits (2014), Expect = 8.42e-278 Identity = 409/458 (89.30%), Postives = 423/458 (92.36%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. NCBI nr
Match: XP_022148147.1 (transportin-3 isoform X4 [Momordica charantia] >XP_022148148.1 transportin-3 isoform X4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 761 bits (1966), Expect = 1.30e-265 Identity = 397/407 (97.54%), Postives = 398/407 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. NCBI nr
Match: XP_022148146.1 (transportin MOS14 isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 761 bits (1966), Expect = 1.79e-264 Identity = 397/407 (97.54%), Postives = 398/407 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. NCBI nr
Match: XP_022148144.1 (transportin-3 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 761 bits (1966), Expect = 6.34e-264 Identity = 397/407 (97.54%), Postives = 398/407 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. NCBI nr
Match: XP_022148142.1 (transportin-3 isoform X1 [Momordica charantia] >XP_022148143.1 transportin-3 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 761 bits (1966), Expect = 6.75e-264 Identity = 397/407 (97.54%), Postives = 398/407 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U4I2 (Transportin-3 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold61G001460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 780 bits (2014), Expect = 4.08e-278 Identity = 409/458 (89.30%), Postives = 423/458 (92.36%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D3A4 (transportin-3 isoform X4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 761 bits (1966), Expect = 6.31e-266 Identity = 397/407 (97.54%), Postives = 398/407 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D4H9 (transportin MOS14 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 761 bits (1966), Expect = 8.65e-265 Identity = 397/407 (97.54%), Postives = 398/407 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D347 (transportin-3 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 761 bits (1966), Expect = 3.07e-264 Identity = 397/407 (97.54%), Postives = 398/407 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D496 (transportin-3 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 761 bits (1966), Expect = 3.27e-264 Identity = 397/407 (97.54%), Postives = 398/407 (97.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. TAIR 10
Match: AT1G12930.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 466.8 bits (1200), Expect = 2.4e-131 Identity = 249/406 (61.33%), Postives = 309/406 (76.11%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g_new0172 vs. TAIR 10
Match: AT5G62600.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 116.3 bits (290), Expect = 8.1e-26 Identity = 109/375 (29.07%), Postives = 166/375 (44.27%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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