MC08g1970 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5CDSpolypeptideutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AATAAATCAAAATTTATTATTTTTGTTTGAGACATTTGTATTTCTATTTATGTTCTTTTTGCCTTTTACTCCCTTTTCCGAAACTCAAGTGTTGTGAAAGAAACTCTGAAATTCGTTTTCCATTTCTCTTTCCTACTCATTTACTCGAAGAACCCCTATTGTTGTTCTTTCTTCTCTTATCAGTCAGTCATCAGCCAAACCACTACCGCTTTCTTCCACTATCTCTCCAGTCCGCCATTTCCACACTTGGATCATTCCCATTTTTCACCCTTGTTCATCTTCATCAGCTCCTCAATTTGAATTTCAGCTGCTGGGACTTTTGCTGCCCAAAGGGTTTCGGGGCCAATGGAATCGGAGGACGAGCTCGACATGCACGATGCCCACGACGACGACGACGAAGACAATGAGGACGCCTTCTACAGTGGCGGCGACGATGATGCTGCCGCCATCGACAGCGACGATGCTGATGTCGGCGATTACGAGTTTATTGATAATGATTCCGACGATTCCGACGATATGGTCTCCTATCGGCACCAGGTTGATTTTGTTCCCAATCCCAGGTTTATCTGAGTTTCGAACCTTTCGCGTTTCCCGATTGGCACTGACAATTAGTAGTTTTAAGCGTTGATGGTGAATACTCGTATTCGCCGATTTCAGTATTGTACTCTCTACTAATCTCAATCTCAATTTCGACTTATATCTGCTTTCCTTCTTTTTCTTCCCCTCGTAGAATACGAGATTGGGTTTTTCTTTTTTTTAGCCCTTCTTAGAAATGCTTAACTAGAGCGTGTGCCGGACGATCTTTCCTCTCTCTAGTCTCTATCTCTGAAATCTAAATGAAAACAGCAACCACATTAATCTTAATAATTTTTGTCATTCTACTGATACGGGGTTTGTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTCCGGTTTTGATGGTTTAATTGATTATTTAAGTGCAATTAAAATATTGAAAATTGTTAAATTTAGGTTTATATGTTGAAATATAGAATATATGATACTTTTCTGGAAGAATTTGAGAATTTTAGAGTGTTCCAGTCCTCGTGGAGTTCGAGCAATGGTACCTGGTCGGTTTTAGTAGGCAGAAGCTAAGCCTACTGGTAGTGGCTTGTATAATTTTTTAAAGATAATAATAAGAACAAGAGTCAACCAAGAGGATCTTTTGTATCTGCCAAGCCATGATTCCTTTATGGTCGTCCAAGATTGGCCGGTAATCTGGTGGTTTAGGCGATTGTAGGGCAAAGTTTTAAGAATCATTGGAAGGTTTTGTGGACTAATGTTTGTGGTGCTCTTCTCTAGAACATGTGGCTAGAACATTATAGAGAAAAGTAAAAATTCAAGGGTGAGTAGACAGGAGAGAGTAGCTTTGGGAAGATATTGTTCATCGTGTCTCTCTGGGCCCTAAAATCCAAGTACTTTTGCTACAACGTAACAATTTTGATGAGTAGTTGGAGATCCTTTTTATAACTCTGATCTTTTTACGTTATCTTTCTATTTAATGAGAAGATTTTTTCTTGTAACAGAAATTTCTGTATGGTTGACTGTTCAATTTCTCAAACACAGATTTAAACTGTTCCAATAACTCAGCCACTTCGGGTGCCATGGCCTCGCATCGGACTGCCTCAATATTTGAATCCCCTTCTTGCTTTGTTGTCTTAGTCTAATAAGATACCTCTGGCTGTTATTGGCCCTCGATTTGACCATGGATTTTAGTGAGGCTTCAGTGTAAGTCAGACTGAGATCTCCTTCTTAGGACCATTGATCTCCAGAAAATTTGACCTTCATGTCCAGGGTCCTACAATCTATCTCGATATATACTACCCAATTTTCTTAGCTGGGACATTCCCAAGATTGTATCGATATAACATTCATAAGGTAGGAAGTTCTCTATCAGACGTACCCCTTGTTTAGAAAGACCCCTCCTCAACATTATCCCTTTACTTTGACAGAAATTCATATCCCCATTGGATGTTTTGGAGATTGGAATATTATGTTTTGCACTAGTTGGTACAAAAAAAAAATTGTGGTGTAGTTCTATTTCAGTGAAAAAAAAAAATTGTGGTGTAGTCCCACATTCGTGGGAACCAACAGTTTGGTCTAGTTCAACTTGCCTTAAGCTTCATGAACTAGTCAATCCTACCATAAAGTTAAGTGATAATTCAGTAACCTCTTCAATCTCTAGGAGAGGAGACGTAGGTTAAGGTTCCACTTCTTTTTCTTCCTTATCTTTCGAGTCATTTGACCAAACAACTCCTTCAATTCCTTTGCTTGTAGTAATGTATCACTTTAAACTTCTCATCAAATTGAAAATGGAGGCCCTTCTCTTTCTTGGCCTTCAATTTAGCTTCAAATTAGTGTTTGAAGGGTTGAGGCTTTGCTTGACTAAGTGTTCTCCCCATTGCCACCATTCCGTTCAAAATGGTTCTAGACCATTAGCTGCATTTCGAGCTGCCCATGGCACGTGCAGAGTTTTTGGTGGGTTGATGAATCTCGGAATGAAGATAGGGCTTGATTGTTATCTTTTAAGTGCTCGGCCGTCTACATTATTTCATCCAACCCATTGGGTTTTAGCATCCTTATTTCAGCTCAAATTACTGTACTCAGCCCATTGATAAAGGCATTTCCCAGCACCTCATCCTATGTATCTAGTAACGACTTGGCCAAGGTATCAAACATCCGTTGGTATATTGCCTAGAAGCTACTCATTGATACCATGATAATGGGTCTCCCTCAAAATTGCCTATGGGTTTTTCTTCTTGTTTTTAGACAATACATGAATTTTGAAGAATCTCTCTCTACTCGAGAGTCGAGACAACCAAGAATTTCGAACCCCTCACATTCTAGCTGATTATCTCTTAAAGACTAAGGGACCTTGATGGAAGATGAAGGACACTGCCGTAACAAACTGCATTCCAAAATTATAATGAACAATCCAACCCAAATCCTATAGAATTTATAGGCATTTCCAAATATCTCTAAAATATAATGTCAAGTGAGATAAAAAAGTAGAACATGCAACTGGGAAAGTAGTCATTGCTACTTTCCTCTCCATTGAGTTCGTTTTTCTTTCAAGCTTTTACTTGGTTTAAATGTTCTCTCTCCATTTTCAAACTATAGCACAAATGATCATTTGGCTAACTGGAAGAATTTTATGTAACTTTCTATATCTTTGGGGGGGGGGGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGNNNNNCTCTGTGTATGTTTGTGGGGGGGGGGGGATTCTTTTTTTTCTTTCTTCTTTTGGCTATCTGGGAAAGTATCTGTTCCCTATTAAAAAAAAGAAGGTAATCATCACTACTAAAATGAAATCAAAGAAAATTTGCATCTTTGTCTTGAATAATTTTGTCTTCTTTATTGTGTACTTTCTTGATTTCTTCTATAATTGCCAAATTCTTTTGAAAAGGAAAATTAACTTTTCATTAAATTAGTTCAAGTACAAGACCCTATAGGGGTATGACACAGATTCCTAGTACGACAATAAATCTAAAGATCTTATGAGGTTATCAACCACCTCTCATATTACAAGGAAATTATGAAAAAGCCCCCAATTAATGGAAATGTTCTTGATTTCTTCTATTATTGTCAATTAAATAGCCTATTAACTCCATTGCCTTGGATTTTGGTTGCTCTTGGTTATCCTTCTTTGTACGTAATGACTTTTTGGTTTCTTATTTGAAAGAAAATGATCCCCACTCTTTTGTTACTGTACTAATGTATCACAATGAACTATTTATATTATTTTTCAGCAAAACTATATAATCTTGGCTGAGGCAGATATACGGCAACGACAGGAGGAAGACATCATGAGAGTATCCACTGTTCTTTCTATTTCAAAAGTTGCAGCTAGCATCCTGCTCCGATATTACAACTGGTATAAATCTATGACCTGTATGTAAACTACTTCAATATGGCTGATTCACATAATGGGCTCTACTGATGCGAAGTACATGTCATTTGTTTCTGTGTTGTAGTTATTAGACTACAATATAGTTCTTTAGTACCTTGCATAGCATGTCATGCACCTGATCCCACATCATGTTTTCTGTATTGATCTTGCTTTGCAGGAGTGTCAGTAAAGTGCATGATGAATGGTTTGCAGATGAAGAAAAGGTCCGTAGAGCTGTTGGCTTACTAGAAAAACCAGTTCTGCAATCTTCAAATGAACTAGAAGTAAGCAATCTCATATTTTTTAAGATTAATTGAGCTTCTTCAAATTGTTTTTTCATTAATAATTGCTTGGTAAAATTGAGAAATACATGGTGTTATGATATATACCTTATTTTTTGGCAGCTACCTTGTGGTATATGTTTCGAAATTTATTCACGTGATAAGATTCAGTCTGCTGCTTGTGGCCATCCATTTTGCAATACGTGTTGGACAGGTTTGCCAACTTATATAACAAGCCATTTTGGTCAACTACTCTATTATATTTACTTGGTTCTAGCTTGTCCTTTTTCTTGATTAAAAATAACAAATTGAAAGAAGGCTATAGAATAAGAGATTTATCTAGGGAGCTTTTTGGTTAGACTTCTTGTTAATTGAGATAACCTCTTGTGCCCCAGAAATCCTTGTGACTCTTATATGGCCTTAGAAAGATGGATTGAGGCTTTAAATTTGGAATTGGTAAGATTGCAAAAGGAAATGGTTTCTTTCATAGAGGGTCGGGTTAAAAGAAAGTTGGTGCTGCAATTCGAATGGAAGAAGGAGTTAGCTGATGGCTATGCTTAATGTTTTGCAAAATAAGAGATTTATCTAACCTATAATATTTTGCTATTTAACTCAGCCATCATCCTACAAGGTGAAAGCAGGATATTAAATTTTTGTCAACATGGCGCTATTTCCATCTATCTATTGGGTTCGACATCGACGTAAGGGGTGAATCGACATTTCCATAGTATTGCATTAAAAATTGACAAAAAATAAAAAAAATATCAATAAAATAGCACTAATATGGAC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ATGGAATCGGAGGACGAGCTCGACATGCACGATGCCCACGACGACGACGACGAAGACAATGAGGACGCCTTCTACAGTGGCGGCGACGATGATGCTGCCGCCATCGACAGCGACGATGCTGATGTCGGCGATTACGAGTTTATTGATAATGATTCCGACGATTCCGACGATATGGTCTCCTATCGGCACCAGCAAAACTATATAATCTTGGCTGAGGCAGATATACGGCAACGACAGGAGGAAGACATCATGAGAGTATCCACTGTTCTTTCTATTTCAAAAGTTGCAGCTAGCATCCTGCTCCGATATTACAACTGGAGTGTCAGTAAAGTGCATGATGAATGGTTTGCAGATGAAGAAAAGGTCCGTAGAGCTGTTGGCTTACTAGAAAAACCAGTTCTGCAATCTTCAAATGAACTAGAACTACCTTGTGGTATATGTTTCGAAATTTATTCACGTGATAAGATTCAGTCTGCTGCTTGTGGCCATCCATTTTGCAATACGTGTTGGACAGGTTATATTAGCACATCTATCAATGATGGTCCAGGATGTCTTATGTTGCGATGTCCAGATCCATCTTGTGGTGCTGCTGTTGGTCAAGATATGATAAATTTATTAGCTTCTGATGACGACAAAAAGAAATACTTCCGCTATTTTGTTCGATCCTATGTTGAAGACAATAGAAAGACCAAATGGTGCCCTGCTCCAGGATGTGATTATGCTGTAGATTTTATAGTTGGAAGTGGAAGCTATGATGTTACTTGCAGATGCTCCTATAGCTTTTGCTGGAATTGTACTGAGGAAGCTCATCGTCCTGTTGATTGTGGCACTGTAGCTAAATGGATACTGAAGAATAGTGCTGAGTCAGAAAATATGAACTGGATATTGGCAAATTCAAAACCTTGTCCAAAATGCAAACGACCTATTGAGAAAAATCAAGGATGCATGCATATTACTTGCACACCACCCTGTAAATTTGAGTTCTGCTGGCTTTGCCTTGGTCCATGGTCTGATCATGGAGAGAGGACAGGAGGATTTTATGCATGTAATCGCTATGAAACTGCAAAGCAAGAGGGAGTGTATGATGATGCTGAAAAGCGCAGGGAGATGGCCAAGAATTCTCTGGAGAGGTATACTCATTATTATGAAAGATGGGCTACCAACCAATCGTCTAGGCAAAAGGCACTTGCAGATCTCCATCAAATGCAAACTGTGCATCTGGAAAAGTTAAGTGACATTCAGTGCCAACCTGAGTCACAGCTAAAGTTCATAAGCGAAGCATGGCTACAGATTGTTGAGTGTAGGCGAGTTCTTAAATGGACTTATGCCTATGGATATTATCTACCTGAGCGTGAACATGCGAAGAGACAGTTCTTTGAATATTTGCAAGGTGAGGCTGAATCTGGGTTGGAACGACTCCACCAATGTGCAGAAAAGGAGTTGCAAGTTTACCTAAATGCCGATGGTCCTTCAAAAGATTTTAACGAGTTCCGTACCAAACTTGCTGGACTAACCAGTGTAACTCGGAATTACTTCGAAAATCTAGTACGTGCTCTTGAGAATGGTCTGGCCGATGTGGACTCCCACGGTACCTGCAGCAGAACTGCGAGCTCAAAGAGTACTGGCAGCTGTAGGAGTAAAGGTGGTAAGGGCAAGATGAGCGCATTCCGAGCTAGTGGGTCAAGTCGGAATATTGATGATACCGACCATTGGTCTTGTGAACATTGCACCTTTGCAAACGTCAAGTCAGCTACCATCTGCCAGATGTGCCAGCAAAGGCGATAA MESEDELDMHDAHDDDDEDNEDAFYSGGDDDAAAIDSDDADVGDYEFIDNDSDDSDDMVSYRHQQNYIILAEADIRQRQEEDIMRVSTVLSISKVAASILLRYYNWSVSKVHDEWFADEEKVRRAVGLLEKPVLQSSNELELPCGICFEIYSRDKIQSAACGHPFCNTCWTGYISTSINDGPGCLMLRCPDPSCGAAVGQDMINLLASDDDKKKYFRYFVRSYVEDNRKTKWCPAPGCDYAVDFIVGSGSYDVTCRCSYSFCWNCTEEAHRPVDCGTVAKWILKNSAESENMNWILANSKPCPKCKRPIEKNQGCMHITCTPPCKFEFCWLCLGPWSDHGERTGGFYACNRYETAKQEGVYDDAEKRREMAKNSLERYTHYYERWATNQSSRQKALADLHQMQTVHLEKLSDIQCQPESQLKFISEAWLQIVECRRVLKWTYAYGYYLPEREHAKRQFFEYLQGEAESGLERLHQCAEKELQVYLNADGPSKDFNEFRTKLAGLTSVTRNYFENLVRALENGLADVDSHGTCSRTASSKSTGSCRSKGGKGKMSAFRASGSSRNIDDTDHWSCEHCTFANVKSATICQMCQQRR Homology
BLAST of MC08g1970 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W468 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 912.5 bits (2357), Expect = 2.4e-264 Identity = 435/576 (75.52%), Postives = 495/576 (85.94%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84RR0 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 863.6 bits (2230), Expect = 1.3e-249 Identity = 420/568 (73.94%), Postives = 483/568 (85.04%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L829 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 798.5 bits (2061), Expect = 5.1e-230 Identity = 386/566 (68.20%), Postives = 466/566 (82.33%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0C8K8 (Putative E3 ubiquitin-protein ligase ARI6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI6 PE=5 SV=1) HSP 1 Score: 751.1 bits (1938), Expect = 9.4e-216 Identity = 365/563 (64.83%), Postives = 452/563 (80.28%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SKC2 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 594.3 bits (1531), Expect = 1.5e-168 Identity = 286/520 (55.00%), Postives = 379/520 (72.88%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. NCBI nr
Match: XP_022144490.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1221 bits (3160), Expect = 0.0 Identity = 594/594 (100.00%), Postives = 594/594 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. NCBI nr
Match: XP_022965653.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1165 bits (3015), Expect = 0.0 Identity = 568/597 (95.14%), Postives = 577/597 (96.65%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. NCBI nr
Match: KAG6586185.1 (putative E3 ubiquitin-protein ligase ARI8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1165 bits (3015), Expect = 0.0 Identity = 568/597 (95.14%), Postives = 577/597 (96.65%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. NCBI nr
Match: XP_022938050.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1165 bits (3013), Expect = 0.0 Identity = 567/596 (95.13%), Postives = 577/596 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. NCBI nr
Match: XP_023537577.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1164 bits (3011), Expect = 0.0 Identity = 567/597 (94.97%), Postives = 576/597 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CRR9 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014168 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1221 bits (3160), Expect = 0.0 Identity = 594/594 (100.00%), Postives = 594/594 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HPL6 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465486 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1165 bits (3015), Expect = 0.0 Identity = 568/597 (95.14%), Postives = 577/597 (96.65%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FIK3 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444256 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1165 bits (3013), Expect = 0.0 Identity = 567/596 (95.13%), Postives = 577/596 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4U8 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485827 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1161 bits (3004), Expect = 0.0 Identity = 563/597 (94.30%), Postives = 578/597 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Y9 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485827 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1094 bits (2830), Expect = 0.0 Identity = 537/597 (89.95%), Postives = 551/597 (92.29%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. TAIR 10
Match: AT1G65430.1 (IBR domain-containing protein ) HSP 1 Score: 912.5 bits (2357), Expect = 1.7e-265 Identity = 435/576 (75.52%), Postives = 495/576 (85.94%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. TAIR 10
Match: AT2G31510.1 (IBR domain-containing protein ) HSP 1 Score: 863.6 bits (2230), Expect = 9.2e-251 Identity = 420/568 (73.94%), Postives = 483/568 (85.04%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. TAIR 10
Match: AT1G05890.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 798.5 bits (2061), Expect = 3.6e-231 Identity = 386/566 (68.20%), Postives = 466/566 (82.33%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. TAIR 10
Match: AT1G05890.2 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 778.1 bits (2008), Expect = 5.1e-225 Identity = 386/608 (63.49%), Postives = 466/608 (76.64%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1970 vs. TAIR 10
Match: AT2G31760.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 592.0 bits (1525), Expect = 5.2e-169 Identity = 283/504 (56.15%), Postives = 364/504 (72.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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