MC08g1173 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptideutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTCTTCTTACTTCAAAACTGCAAGAATTTCAAACATCTCAAGCAAATCCACGCCAACATAATTCGCAGCGGCCTTTCCAACCATCAGTTACTCGCTAGGAAATTGATTCACCTCTACTCTTCTCATGGAACGATAGCGTACGCGATTATTCTATTCCGCCAAATCGAGATTCCTTGCACGTTTACTTGGAATCTGTTCATCCGGGCCAACACTATCAATGGTCTCTCTGAAGAAGCCCTTCTTTGGTACAGGAATATGGTACGTCATGGAATTGCACCCGATAAGTTTACTTTTCCATTTGTCATCAAAGCTTGCACAATTTCCTTCGCAATTGACCTTGGAAAAGTGGTTCACGCGTCGTTGATCAAATACGGATTTTCGACGGATACATTTGTGCAGAACAATCTGATAGATTTGTACTTCAAGTGTGGACATAAACAGTGTGGTCATAAGGTGTTCGAGAAAATGCGTGTTCGCAATGTGGTGTCGTGGACAAGCATGATATCCGGGCTGGTTGCTTGCGGGGAAGTCCAGGCAGCACGAAGGGTATTCGATGAAATGCCATCTAAAAATGTTGTCTCCTGGACAGCAATGATTAATGGGTATATAAGAAGTCAACAGCCTGAAGAAGCTGTGGAACTATTTGGGAGAATGCAGGCAGAGAATGTTTGCCCAAATGAGTATACGCTGGTAAGCTTGATCAAAGCATGTACTGAAATGGGAATCCCAAGTTTAGGTAGAAAGATTCATGATTTTGCCATCACAAATTGTTTCGAGATCGGTGTTTATCTAGGGACGGCTTTGATTGACATGTACAGCAAATGTGGTAGTCTAAAGGATGCGGTAGAAGTTTTTGAGACGATGCCCGAAAGAAGTTTGGCGACTTGGAATTCGATGATCAGTAGCTTAGGGGTGCATGGGCTTGGGGAGGAAGCGCTCAATGTTTTCAGTGAGATGGAAAGGGTAAATGTGAAGCCAGATGCAATCACTTTTGTGGGTGTTTTGTGCGCTTGTGTACATATGAAGAATGTGGAGGCAGGCTGCGCTTACTTCAAACGAATGACACAACATTATGGCATTGTGCCAATTCCTGAGCACTACAAGTGCATGGCTGAGCTATATGCTCGTTATAGTTCCTTGGATGAAGCCTTCGAATCAGCGAAACCCACGTAGATGGAAAGGACGCGTTGGCCTGTGAGCGGGCACGCATGTAAGATATTGATAGAATAATACTTGGTTACTGATTCGCTAGTAGCCAAGTGTTATTTGCAGGGATAATGAGTACAGAAATATGTAAATGAATGAGGTTGCAAGTTCGACCAACATCCCTTTCTAAGCAGATGCAGACTTCTTGCGGAGTATTTTGACTTCTTGCTTGCTTTTTAACTGTCATTTTGTATGTTGAAGAAGCGTTTTTTTATGCAATACTTGTAATTGATTGTCATTTCAATGGTTATACGATTTTAATGGATAGCAAATTGTTGATATCAAAATATATAGATGTAGCATACAAGAGTTGGACTTGCATTCATTATTCTTATGTTTGTGCAATTCTTTGTCTGGAATTTTCACAGGAGCAATCTTCTATTAAATTAGAAGAAGTTAGTTTCTTTAAATTTTAGTAGACCACAACATGATCCTTATTTGATTGAATCAATGAGACCGCACATGTAATTATTTAATAAAATGTTCTAATTATGGGTAAGTTTTGGTTTAACGGAGTAATTATAAAATGACAATGGGTAAAATATATAGATACGTAGTTTTTTTGTCGGTTACAGAGGGGTTATGAAGTCGAGAAATCTATAAGACTAATTCGTGATTATCTAGACTTGGAAGGTCAAATCCATTGATCAACTTTAATTATGGATCAAGGTATGTTTCCATTTCTTTGGTATTAATTCTCTTGAATTTAACATGGAAACCGATCTCTGACTTTTAAATTTTGGGTTTTTATTTTCCCAACAAACCAATCTTTAGTTAATAATATCCAAAAAGTTTATCAATCTCAAGATGCTCCAAACTCATTAAGGGGAAGTCACTTGATTTCTTTTTAGTTCTTCAATTAACCAATTTAAATAATCACAAAGTTTGATGAGGTTATATTAAAAAACTATAACTGTAAAATTAGTCGAAGTGTGTGTTAGCTGTTCCAGACACTCACAGAGATCAAAAGGAAAAAAAAAACCTATAATCTATGTTATGTTGGTTGGGTGACCTGAGTAATAACCTACCTATCACATTTGGTTGTAATATCAACCTAGTTTATATGCTACGAACCAACAAACCACTTGCAATGCTCAACTTGCCTAAAACATTTTACTGAGGTAATAGTGGTGAGGACAAAATTGCTCTTTACGGTTCAGGAACCAAGTATTTTTCTAATATTATTATCTTACTTTTGACCTTGTTTGTATCACTCCATCAATTTAATTAGCTGCAACAAAAAGTATGCAACACTGAGAAATGATGACCTAACCTTTATATGATGCATCATGCATGTCCTCTTATAAATAATTGCGAGTGCCACAACTAAAAGGAAAAAGAGTGAAACAATTTAACATTTCACGACACATATTCCAACTTCTTCTCTTTGGTCTTCAAAACAATGCAACTTCTTTCTAAGAATATAAATACAAAAACATAAATTAAACTTGTGAGAAAACATAACTCAATTGGTTAAAGAATTTATATTCGATCAAGAGTTCGAATCTCCACCTCCACTCGTTTTAAAAATAATAAAAGATGGTGACAAGTTTTTGTTCAAAATCTGGGTTGAAAATGGACTGGGCCCAGCTTAAAAGCGTTTGGCCCAAATTATGCCATGGGCCTATCATCCAAATAGCTAAATTGGACTCATAGGTCTATAATATTATTATTTTTTTGGGACATTCGATAGCATAATTTTTAAAAATATTTAAAAATGTACATAGTTACATATTTTTAAAATAATAATAATAATAAATAAATAAACAATTATAGATATAATATTTTCTTTTAAGGCGTATTAATGATATACCTACGCACTAATTCATATGTCATATTTGTCGTTCAAAAAAAAATCAAATATCTTTTTTTTCCAATAGGTTGGAGATATGGATGTTCGAACTTCTACCTCAAGAAAAGAAATAGATGCTAATTATCATTGAATTATGTTCATCGTCCATAAATATCTATCTTTTTGTTGTGACGTTTAAGTTTTTGTATTTATTCGTACCAGTAATTTGATATTCAAAACTTGTGAATTTTAGTTGATTTGGACAAGTTTGCTTTTTCTATAAAGTTGAAATATTTACATGATCGTTTTTTGTTTTTATTAGTATGTCTCTATCTTTTTCTTTTCGAGTTAAAAAGAATAAAAGGTGAATATTTAAACCTCGATTTTTAAAGAAGTAAGTAATATCTTAACTAGTTGAATTATATGCTTTAGTTGACTATAAATTTCAAATTGACGAAAAACAGAAATATAATTGAGCATATTATAAATAATAAGTTTAAACCCAATTTTGGTCTCTAAACTTTCAAGATTATTTTATTTGGTTCTTAAACTTTCAAAATGTAATTAACTTTAAAATTTGTTCTATTTTGGTCTCTAAACTTTTGTAAAATTTATTTCAACAAATTGACAACATGATTTCAAATATCTGTACCAATGTGTTACTATGAACATGTATTGCAATCAAGGTTTTAAATATCGATGTCGATGAAAATGTCGAGGTTTCAATTTCATGAAAATATCGATGAAAATATCGATAAAATGTCGACATCGATGGATATTACTGTAAAAGTTATAAAAATTAAAAAATCGTAAAAAATATTTAAATTAATAAAATAAACATTTTCCTATCTCTAAATTAGTTAAAAATAATTAATATTAATATTATGTATATATTAGTGACATTTTGTTGATATTTTTCATATTTTGTCGATTTTATTGTGCTATGATGGAAACGTCGATTTATCCCTTCATGTCAATGCCAAACTCATAGAAACATGAATATATTGATGAAAATATGGACATGTCGACGGATATTTAGAACCATGATTGCAATTTGGCAAAAATATGGCGAAGATTCACAAAATATCTCCAAGGTGATGGGAAAGTGTGTGAAAGCATCCTCCAAATGAAGGAATGTCAAAGGAAGGAAAAGCAAAGGAATCTTATCTGGAGGAGCAGGCTCAGGCTGTTGCATATAAATTGGTAATCTCAGTAACATGCTTCTACTCATTCAACTCTCAAACTCACCACTAATTATCACTTCCAAATTACATAATTTTTAGCATTAAACATCATAAGAATGCAGGCTGTTCTTACCATTCCTGTCCTTCCCCTTCTCCTCCCAACACCTTCCAACAACTCTTTTCCCTTGAACTCTTTCGGCTCTCTCTCGTCACGTCGCCCCGCAATCAAAGCAACCTCCACGGTCGCCTACGACACCTCGGTGGTTGATTATAGCTCCGCTGTCTCGTAAGTTATTTTCTTTCATCTTTAGGTATTGAACTCGAACCATCCCATGTCAATGTATAAAAGCAGACATGACAGGAGGCAAGATAAGAAGGACATATTAAATTATAAGTTTGGTCTTTAAACTTTTAAAGTTAACTCGTTAGTTTACCATTTACAAGGCCTACCTACAATATGATTCAAAGATTACATGGTGAGCAGATTCTTGACAATTCAAATATTTAGTAGTATAAACATTCGACTTTACGAAATTCGAGTTCATCAACTCGGTATAAACATAAAATATTTTGAAATACACAGACTAAATAGAATATCCATCTTGAGGATTAGCATGTATATAATCGTCAGGATGCTCCAAAACGTTAAGAGCATAAAATTCATACATCTATTAGAAGTTTTTTAAAGTACCTTCCCAATTGATTGGACAATAGAACTATAAAAGTTTTGACCGATCGGATCAGAGAGAGGTGTTAGAATATAAATAAATAATTATATTCCTCATAATCCATTAACTTAAGTTTTTGGATTC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LFLLQNCKNFKHLKQIHANIIRSGLSNHQLLARKLIHLYSSHGTIAYAIILFRQIEIPCTFTWNLFIRANTINGLSEEALLWYRNMVRHGIAPDKFTFPFVIKACTISFAIDLGKVVHASLIKYGFSTDTFVQNNLIDLYFKCGHKQCARRVFDEMPSKNVVSWTAMINGYIRSQQPEEAVELFGRMQAENVCPNEYTLVSLIKACTEMGIPSLGRKIHDFAITNCFEIGVYLGTALIDMYSKCGSLKDAVEVFETMPERSLATWNSMISSLGVHGLGEEALNVFSEMERVNVKPDAITFVGVLCACVHMKNVEAGCAYFKRMTQHYGIVPIPEHYKFRMGISNHSSIELLFPLKLCWRRYSSNPNLATWFNKYVDKSNVHSWNSVIADLARGGDSVEALRAFSSMRKLALSPSRSSFPCAIKSCSALCDLVAGKQTHQQAFVFGFDTDLFVSSALIDMYSKCGQLKDARQLFDEIPLRNVVSWTSMITGYVQNEQADNALLLFKDFLEEETEVEDGNKIPLDPVVMVSVLSACSRVSEKGITEDVHGFVIKEGFDGNVGVGNTLIDAYAKCGQPLVSRKVFDGMEEKDEISWNSMIAVYAQSGLSEEALEVFHGMVRHDGVRYNAVTLSAVLLASAHAGALRAGKCIHNQVIKMDLEENVCVGTSIIDMYCKCGRVEMAKKTFDRMKEKNVKSWTAMVAGYGMHGCAKGALDIFYKMIQARVEPNYITFVSVLAACSHAGLVDEGWHWFNAMKYKYDIEPGIEHYGCMVDLFGRAGCLSEAYNLIKGMRMKPDFVVWGSLLGACRIHKNVDLGEIAAQKLFELDPDNCGYYVLLSNLYADAGRWADVERMRTLMKNRQLVKPPGFSLVELKGRVHVFLVGDKEHPQHEMIYKYLEKLTLELQKIGYVPNMTSVLHDVDEEEKEIILRVHSEKLAVAFGVMNSAAGTTISIIKNLRVCGDCHTVIKLISKVVHREFVVRDSKRFHHFKDGLCSCGDYW Homology
BLAST of MC08g1173 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of MC08g1173 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SVP7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g13650 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H42 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 636.0 bits (1639), Expect = 7.4e-181 Identity = 345/988 (34.92%), Postives = 539/988 (54.55%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7Y211 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g57430, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H81 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 613.2 bits (1580), Expect = 5.1e-174 Identity = 348/955 (36.44%), Postives = 504/955 (52.77%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1V3 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g63370, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H83 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 594.7 bits (1532), Expect = 1.9e-168 Identity = 325/906 (35.87%), Postives = 511/906 (56.40%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FIB2 (Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At5g09950 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H35 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 585.5 bits (1508), Expect = 1.1e-165 Identity = 346/1015 (34.09%), Postives = 555/1015 (54.68%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. NCBI nr
Match: XP_022148174.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1347 bits (3486), Expect = 0.0 Identity = 658/659 (99.85%), Postives = 658/659 (99.85%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. NCBI nr
Match: XP_011651585.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Cucumis sativus] >KGN58242.1 hypothetical protein Csa_017551 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1241 bits (3210), Expect = 0.0 Identity = 601/659 (91.20%), Postives = 632/659 (95.90%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. NCBI nr
Match: XP_038878074.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1238 bits (3202), Expect = 0.0 Identity = 597/660 (90.45%), Postives = 633/660 (95.91%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. NCBI nr
Match: XP_008450012.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Cucumis melo] >XP_008450013.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Cucumis melo] >XP_008450014.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Cucumis melo] >XP_008450015.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1231 bits (3185), Expect = 0.0 Identity = 595/659 (90.29%), Postives = 631/659 (95.75%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. NCBI nr
Match: KAG7017863.1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein, mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1225 bits (3169), Expect = 0.0 Identity = 590/659 (89.53%), Postives = 626/659 (94.99%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D374 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016910 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1347 bits (3486), Expect = 0.0 Identity = 658/659 (99.85%), Postives = 658/659 (99.85%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LC14 (DYW_deaminase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G598390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1241 bits (3210), Expect = 0.0 Identity = 601/659 (91.20%), Postives = 632/659 (95.90%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BPA8 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491728 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1231 bits (3185), Expect = 0.0 Identity = 595/659 (90.29%), Postives = 631/659 (95.75%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IZS5 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482143 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1222 bits (3163), Expect = 0.0 Identity = 587/659 (89.07%), Postives = 626/659 (94.99%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F879 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441773 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1221 bits (3160), Expect = 0.0 Identity = 589/659 (89.38%), Postives = 625/659 (94.84%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. TAIR 10
Match: AT3G26782.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 908.7 bits (2347), Expect = 4.2e-264 Identity = 433/641 (67.55%), Postives = 530/641 (82.68%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. TAIR 10
Match: AT4G13650.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 636.0 bits (1639), Expect = 5.2e-182 Identity = 345/988 (34.92%), Postives = 539/988 (54.55%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. TAIR 10
Match: AT3G57430.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 613.2 bits (1580), Expect = 3.6e-175 Identity = 348/955 (36.44%), Postives = 504/955 (52.77%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. TAIR 10
Match: AT5G09950.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 585.5 bits (1508), Expect = 8.1e-167 Identity = 346/1015 (34.09%), Postives = 555/1015 (54.68%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1173 vs. TAIR 10
Match: AT1G11290.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 583.2 bits (1502), Expect = 4.0e-166 Identity = 322/878 (36.67%), Postives = 472/878 (53.76%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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