MC07g_new0274 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1

Overview
NameMC07g_new0274
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationMC07: 9624519 .. 9629440 (+)
RNA-Seq ExpressionMC07g_new0274
SyntenyMC07g_new0274
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGAGGGAGAGCGAGAGCGAGCAATTTGGACGTGGAGATAGCGATGGGTATTCTAGCCATATTATTGTTTAATTGTTAGTTATTTTTTACAAAAATATCGCAATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATACACACCTCAAGTTGCTGGTTTGAACATGTATTTAATAAGTATCTCATGTTTCCTAATTCGAAAATGGTGATGGATTAAATATGGTGATAGATTTCTACTTAACATTCTACCACTCACTGTCAGCTCATGGCTAGAGTGCCTTGGGTGGGTCGTGTCAATAAGAGGCCTGAATAATTATGTAGCTTCAACATTTAATTATTTGAATGATGCGATACCAAGACCAACCATTGAAACAAATTAAACCATTTTGAACTAGTTAAACCATTTTGAACTTAAACCAGTGATGTTTCCGATGATAAATGCTGAGCATGGGACAATTTGGAAGTCATCTTACTGAAAGTCACACTCTCATTTAAAATCCTTCATGGAAGTGTGTGACTCATTTGAAATTCAAGGAGTGTTAGATGAAGTATTGAGACTAAAATTATTAAGAAAGGAGAATGATGAAGCTCAACTTAAGAAATTTTTTAATGTACTGAAGCAGCTTCAAATAAATATCCCGAAGCTCTGGAACAAATGCTCATCTATGTAAGTTCCTTAAAAGACATTTTGACAAACAACTTGACAGACATTTTGACAAACAAGAGAAAGGTTGGGAAAGTTGAAACTGTGGTCTTAACAAAATAATGTTATGATATTTTGAAGAGTAAGCTCCCCAAAAGCTATGAGATCCAGGAAGGCTTCAAAATTTCGTGCAATATAATGTATGTTGGCAAAGCTTTATGTGATCTAGGAGTAAGCATGAATCTGATGCTCCTCTGAATCTTTAAAGCAGCTGGACAAGGGAGAAGCACGACCAATGAAAAAAATCTATGGATTTAATCATCCTGAACTATGAAACAGACGTAAATAATGTACCCATTATCTTGGGTAGACCATTTTTACCCACGAGGCAAACATTGATTGATGTGCAGAATGAGAACTAACCATGCGAGTGAATGGTGAACAAGCTATCTTTAATGTGCTAAACACACTCAAGCTCGTTGGTACAACTGAAGAGCTTTTTGCCATCATAGCACATGAAGAGGGTGAAGGTAATGCAGTGAATAGGGACGATTAGATAGAGGAAATCCTGATATGGCGAAGGAGTACAATGAAGAGGAAGAAGGGAAGTTTGAACTCTTAAACACACAGCAACAGATCCTAGTGCACAAAAAAAAGTTGAAGTGATAGAGAAAGAGGCGTTAAAGCATAAGAAAGGTATAGGCACAACCCTTGCATAGAGTGAAGAAATTAGTCCAACATATGGCATGCCCCAAACAAGACGTGAAGAAAGTGTTGCAAGTTCTGAAAGGCAAACATTCATGAAATTTTCCAGTTGCGTAAGCTGCAGCAAGTGCCACCACCTTGGTTCGCTGACACAAGATTCCATCTCGATGAGTCGTTCATACTTAAACTGTGAGTGGAAAAAATTTTGAGAATAGACATGATAGAAGAAGAAGTGCCAAAAATGCTGAAGCTAGACAAAGTTGAAAAAAATGGAGAAGTCTGAAGGGAACTCTCTCTCATATATTTGGAGAATGCTTGGAGCCTAACGCCGAACAGAAAATTTTCAAAAAGGGGCTAAGTTTTTACTTTTACGTATTTATTCTCAGTAATTTTTATTTTTATTTTCCATTCTTGTTGTTTTTTCATATTTAATTTCATTTAATTTTTAGGATGCTACAATTGCGTGATGCCTAAATTTTCGACCGGCTAGCTCGCTTTGGCTCCATCGATTGATTCTTTGTTATGGTTATGGAATATTATTGATTTTTTGAATTTTCATGTTAGGATTTGGGGCAAGTAAATATTTTCGAAAATTTTGATTTTTCAAGAAAATATATATTTTTTTACCTTAATGGTAATATTGTGAAGGGATGACAATTAATGCCAAATTTTTTAAATGATTGACTTCTTTAATAGGCGTGATTTAATTTGTTTTCAAAATTTGTATTTCAGTATTAAGGAAATTTTAGGCGTTGGTAAGAACTCCTTCCTTGCTCGCAACATTCCTTTAAAACTGCCCTCACTTCCCAATGTATGCTCCACTTTCATTCCTTTATGTTTGTGAACCCCTCTTTAAAAATCAATGCAATTCATCTCTTATGCTCCAAATAATACGTTTAATCCATAACTAACTTATGATTTATAACTTTAAGATCATTTAATAATTATTTCTGTTTTTAGTTATTGGTTTTTGATTTTTTCATTAAAAAAACAAAAGCCATATATGTTTGATAACCATTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTAAAAAACAGAAAACTAAACATGTTTGGTAACCATTCTATTCTTAAAAATTTTGAAAATTGAAAATACATATTAGAGAGAGAAAATTATATGTAGAGTAGGGATGATAAGAGTGTGGGTGCAAGTGAGGATGCTCTCCCCCATTCTCGTACTCGTGAAAATTTTTAATTTCCATCTTCACCTCGTTCTTCATAGATGTTATCGACAAAAATTATCGGTTTTATAATTGTTTTTAATTATTTTTAGAATTTAAAAAACAAAAAGGTATAATAAATATATATTAATTATTTAGAAAATGGAATCGGGGACAGGGTCGTGATATGCATTTCCTATTTTCGGGGCTTGATCGTGCAAAAATTTTGGTGATGCCTAATGTAGAGACATGAGAATACAAATTTAGCCCTATGTAAATAAACTTTTGGAAGATAAATTTTAGAGAGATAAATAAAAATATTTAGTAAAAAATTAGTGAAAGAAAAGTTTAAGACAAAAAGAGAAAACTTTTAGGGAAAAAAAAGTAAAGTAGACAGGACAAGATATGTTAAAGAAAAAAAAAATAGAAAGAAAGAGAAAATTATAGTGGGAACAAATTTAGAGATAAAAATAAGATTCAAAATATAATTTTTAGAGAAAACAAATAAATATAGAGATAAATAAAAATGACAGTGACAGAAAATTGAACGAGAGAAAAGAAGATATAGTTTTCAGAAGGAAAAATAGATTAGGAAGAGAAAGAAAAGTTATAAAAGACAAAATTTTAGAGAGGAAAAAGTTCGGAAAAATATTAAAATTTTAAAGAGAGAAATGAAACTGATCTGTTTAAAAAAAATAAATAATAAAAATCCATAAAATTGAAAAATGTGGAGAAAGACAAATAATATATATATATATATATTAATACAATATGTTGGGGAGAAGATTTGAACTCACGACCTCTTGGTTGGAGATATATGTTAATTACCGGAGTTATGCTCGTTTTGGCAATAATAAATACTCAAAATATGAAAATTTTAGAGAGAGAAAAATAAATTGTATTGAGAGAAACTTGGACAGAAAAAAATTTTAGGATGGAAAAGAATTTTTTTAGAGATAAATATGAGAAAGAAAAAAAATTCGAGTATTACAAGAAAAAAATCAGATTTTGAAAAACAGAAATCTATTTTTGAAAACTTTTTTCGTTGTTTTTGAAATTTACATATACTCTCAAAATGGGTTTTGAAAAACAATTAACAGAAAATTAAATTGGTTATCAAACAACGGCTGTGTTTAAAAAACTAAAATATAAAAAAACCAAAAACTAAAAATATCAAACGATCCTTAATTTTCCATTCAACATATTGTATGTTGTTGAACGTGAGGTGGAAAGGTAAATAATGATGTTTATGTGAGCTAAAATATAATGTGCTAATCAGATTGTCCTAGAATAAATCTCCTTTAGGCTAGAATGCACTCTTTAAATGCTGCAACATTCCCCTAAAACTCCTCATATTACTTTGCTTTTAGATAGGTGTAACATTTCCCACTACCAAGTCTTTTCTTTTTAACACTTTAAGTCCTTCACATTTACTTTTAGTTTTTGTTCAACTTAGATGCTTGCACGATACAAACCTTCAAAATGAGGTCTGTTTATGCAGGAATTTGCACAACGGTTCTACACGAATCAAGCTCGAACCCGGTCTCTGGTTCCGACCTGAACACTAGAGTGGGCCTGCACAAGAGGGCAAGCACTCCGACGCTCAAGTCAGTATAGATCGGATTCCTTATTTAGTTCGAGGTGAGATTCGATACCTGAGCGTGAAATGAAGCCCTCTATTTATAGGTGACGGATCCGACAGCACACACGACCGGCGGTTACATGTCTTTTCTCATATCGGACCTGTCGGGTTCCGAGCAGGTCGGTCCCCGGTCAGATCGAACTTTGGTGCCCACACTTAGTCTTTTATAATGGGCAAACCCGGACTCCTCGGCGAGGCCGAGGTGGACCTAAGCAATCCTTTTTTATCTAATTTCTTCAAACACTAATAGGGGTCCTCCACGTGTCTTGGGTATGTTTACCCCCAAACAAGGTCCAACCTTTAAACTAATCCTTTGATTTACTTTGGTCTAATGAAGACTGTTCACACAAACTGGAGAAATTATATTTTGTGGACTAAATATAATTTGTATTTGATATTGGGGGTTCGTACAATCTCTAATATTTATCATCTAATTCATTCCCTTGAATTCTTGGCGGCTTGTTGATCTTGATCGGCCTATCGACAGCTTTGTTGATCTTGATCGGCCTAATTACGGCTTTGTTGATCTTGATCGGCATATCAGCGACTTTGTTGATCTTGATCGGCCTATCGGTGGCTTTGTTAATCTTGATCGGCCTATCGGTGGCTTTGTCGATCTTGATCGGCTTATCGACGGCTTTATGTTGATCTGGATCGGCCTCTGGCTTGATGTTGATCTCGATCAGCCTCTTGGCGGCTTGATGATGTTCTTGATTGGCCTTTGGCTTGATGATGATCTTGATCGGCCTCGGGCGTGA

mRNA sequence

ATGGAGAGGGAGAGCGAGAGCGAGCAATTTGGACGTGGAGATAGCGATGGCTTTGTTGATCTTGATCGGCCTAATTACGGCTTTGTTGATCTTGATCGGCATATCAGCGACTTTGTTGATCTTGATCGGCCTATCGGTGGCTTTGTTAATCTTGATCGGCCTATCGGTGGCTTTGTCGATCTTGATCGGCTTATCGACGGCTTTATGTTGATCTGGATCGGCCTCTGGCTTGATGTTGATCTCGATCAGCCTCTTGGCGGCTTGATGATGTTCTTGATTGGCCTTTGGCTTGATGATGATCTTGATCGGCCTCGGGCGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGAGGGAGAGCGAGAGCGAGCAATTTGGACGTGGAGATAGCGATGGCTTTGTTGATCTTGATCGGCCTAATTACGGCTTTGTTGATCTTGATCGGCATATCAGCGACTTTGTTGATCTTGATCGGCCTATCGGTGGCTTTGTTAATCTTGATCGGCCTATCGGTGGCTTTGTCGATCTTGATCGGCTTATCGACGGCTTTATGTTGATCTGGATCGGCCTCTGGCTTGATGTTGATCTCGATCAGCCTCTTGGCGGCTTGATGATGTTCTTGATTGGCCTTTGGCTTGATGATGATCTTGATCGGCCTCGGGCGTGA

Protein sequence

MERESESEQFGRGDSDGFVDLDRPNYGFVDLDRHISDFVDLDRPIGGFVNLDRPIGGFVDLDRLIDGFMLIWIGLWLDVDLDQPLGGLMMFLIGLWLDDDLDRPRA
Homology
[Close]
BLAST of MC07g_new0274 vs. NCBI nr
Match: XP_023655155.1 (uncharacterized protein LOC111837369 [Paramormyrops kingsleyae])

HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 8.60e-04
Identity = 28/78 (35.90%), Postives = 42/78 (53.85%), Query Frame = 0 

Query: 10  FGRGDSDGFVDLDRPNYGFVDLDRHISDFVDLDRPIGGFVNLDRPIGGFVDLDRLIDGFM 69
           FG     G +D  RP  G +D  R +   ++  RP+GG +N DRP+GG +D  R + G M
Sbjct: 31  FGGQQMGGSMDTGRPMGGSMDTGRPMGGSMNSGRPMGGSMNSDRPMGGSMDSGRPMGGSM 90

Query: 70  LIWIGLWLDVDLDQPLGG 87
                +   +D D+P+GG
Sbjct: 91  DSGRPMGGSMDSDRPMGG 108

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MC07g_new0274 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MC07g_new0274 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_023655155.18.60e-0435.90uncharacterized protein LOC111837369 [Paramormyrops kingsleyae][more]
BLAST of MC07g_new0274 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MC07g_new0274 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MC07g_new0274.1MC07g_new0274.1mRNA