MC06g1893 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5CDSpolypeptideutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAAACTTTCCAAATTGATATGGAGTTGAAGTAGAAAATTTGGTATTAAGTAATCTATCCTTTCTTGTGGAGACATCATTTGTATACTTACAAATTCAAACAATAGTCAGCAAAGGCGTGGCAGGTGATTGCACACGTGTAACACGAGTCAAGGAGGCGACGGAGGAGGTGGCAGAATGCATGGTTGCTAGGAAAAGAAAAAAATAATAAAAGAAAATTAAACCGAAATTAAAAGCATAAGAAATTGCAGAATACGGAGCGGGTTTTAAAATTCCGTCGAAATGTGGTTTTTGAGAAGCAAAGGGTCCTCTGGATTTTCATACTCTTCCACAGCCGAGGAAGTTACTGACGGAATCGATGGCTCCGCTCTCACCGCCATTGTCACAGGTCTTCATTTACCTAAAACACTTTCTTCTTCTTCTCTTTTACTTCGTTTTTAGTTCTGTATTTGCTGAAACATGAAATTTTATCTGTTCCTCTGAATTTGAACCATCGGAAATGGTTTTAGAATTTAGTTTTGGTACTTCTATATCTTTTTGTTTCTGTATTCATTTATTTCCTGTTCTCGCCATGACTGTGGACGGATATATGATTAGAATAGAAAACATTGGGATCTTGAGCTTGGACTGTAGTAGTTCTGCCTGTTTTACTCTCAGTTTCTCGATCAACATTAATTGGCAATATTTTGGTTCATTAATTTTATTTTTAATATAATTTTTTTTATCTTGTAATTAATATATTTTTTAAAATATAAACATTACTTTATACTATAAAATTTTAAAAATTTTGTTTTAAAACCGGATCAAAATGAACATTTTTAAATACAGTCTTAAAATGAACTAATACTGACATTAGAAAATAGTATTTTAATCTTTTAAAAATAGGAAACCAAAAAGGAAAAGTTATTAAATGAGAAATGCATAACAGGTTTCCAACTCGCTCTTATTGTTTGTTTTTGAATGTGTTTCTAAATCATAATGTGTAATTAGTTATTGAAAAGTATGCTTTTTCTTTGATTTTTTATGTAATTTTAAAATAACAGGTTTTAGTTCACCATTTGATTAACCATTCTCTTGGCTTGATCTTCATTACTAAACACAATAGTGCTGAAACCACATATCTGCAGTTTGCTGTATCTCTTCTTTTTGCTCATGACTTATTGTAACCAAGCATTGTTTAGTTGCAGTTACTAGTTTTTTGTTCTTGCTTATGCTTCTATATTCTTACAGGAGCATCGAACGGTATCGGCTCTGAAACTGCGCGCGTTCTTGCATTACGCGGAGTCCATGTCATTATGGCTGTTAGGAACTTAGATGCTGGTAGAGGTGTTAGAGAAGCCATTGTCAAGGAGAATCCCTCTGCAAAGGTTGATGTCATGGAGTTGGATCTTAGCTCGATGGTGTCTATAAGAAAATTTGCCTCAGATTATCGGTCGTCTGGGTTTCCACTTAACATCCTCATGTAAGAAATGGACTTTGTTTTTAGCTCACTAGATTCTCTCCGTCTAATAGACGTGTTGCTTATGAAGGTGAGTGTGGTATGTATGACTTTTGGAATGGTGACAAGTGCTTTTTAACCTGTTAATATGTCTCAAAATTTTCATAGATTTTAGACTAAGTCATAGATTTTAGACTAAGAAGCACGGATATAGACACCCAATACGGATTTGACACGACAAAGATACGGTGATACGTCATTTCTTAAAAATCTAGTGAACGGACACAAAAATGACACGTTTATTAAAATATACATTATTTTCTTAAGTATCATTTTTATATCAGAAGGAAAATTTAAAGTCACTATATGCATTTTTATGTTAAAAAACGAGTCTGATGTATTTTGCTCTCAAAATCTATTTTTGTCCAATATTACTATTTTTGTCTATTTTTTATGCTTAACGAATATTTTATAAGTGTCTAACAAGTGTCGGATCTATATTATAAGTGTCTAACAAGTGTCGGATCTATATTTAGAGTGTGTGACACATATTTATTGAGTTAACAAATGTCCCATATATGTCCAATAAGTGTTGGAGTGAATTATAGTGTTTCTTAGGGTTTTAGAGTGAGTGTCTCACTCATTCCAAAACTCATTCCAAACCCACTCTTTATTCTTGCTAGTTCCTCATTTTCATGTCCTGGTATTAGCTATTTAGTTGAAGATGTGAGGCAATTTAGCAATACTTTTCTAATTCCTTTACTGTATCGTTGGAAGTAATAATGCAGGAATATTTGGTACCCCTTTTGGACTTTCGAAAGAGAACATAGAACTGCAGTTTGCAACGAATCACTTAGGTATGTAGCTTACATACTAGATTATTTCTTGCATAATGAAAGCTTTTAATTTATGTGAACTTGCAAGAAGATTTAGGATACACATGAAACAATGGATTCTTGAAGACTTTCATCTATAAACGGGGATTATAACTACATATCTTCCCTGATGTTAGATGTGGGTGACTCAAATATTTTATGGCCTAACTTTAAAAGGCCAAAAGAATTGAGGTGTTGTGACAATTGAGGGATCAAGCTAGGCAATGAAGCTAGGGCTTTTTTTAAGTACAACAAAATGTAGGGTGAGGATTTGAATCTCCGACGCTGAGAAGTTGGGATACACGAGACGTGGATATGATACAACACGGACACGGTGACACGTCATTTTCTAAAAATCTAGGACACAAAAATATGCAATTTTTTTTAAGTATATATACTTTTTATATTAGAAAATTTAAAGTCAATAAATTTATGCATTTTTAGACTTAAAAACACGGAGTAGGATGTATTTTGCTCTTAAAATTTATTAGTCTGTTTCATATTACTATTTATGTCTATTTCTTATGCTTAAAAAGTAACCGGTTATCTGCCCTCCCTTAAATTGTACCCTTATCTTCGCATTCTTGGATCTTATGCCTAACAAGTGTTTGATATGTGCCTAACAAGTGTTGGATCAATATTCATTATGTACAATTATTGTTTTGATACACATTTATTGAGCTAAAATATCGATACATCTCCAATAAATGTTGGAGTATCTGGCACGTGTCTAATACGATCACCTTACTCAAACTAAGGTGTCCACTTAATTAGTTGAACTATACTAAGATTGCAAGTTAGGTCTTTTCCTAAATTTTAGGAGGTTAGGATTTTTTGATATTGTAGGGATATATTGGCAGCTGCGATTTTCATTACAATAGATTTCTTTCTTCTTCTTTTCCTATGTTTTTTCGTTGTATGAATTTTCATGTAAATTTTGTTTAGTGGTGGTTCTCTTCCTTTATTTTGCCTTTTTCATAACTAAGATCTCCCCAATTCAAACAAAACCGTTTATTAAAATAGAATTACCAACTCTAACATGATTTTACCCTTTCGAGTCTTTCCAGGTCATTTTCTCTTGACAAATTTGTTGTTGGAAAATATGAAGAGAACTGCCATTGATAATAAAAAAGAAGTACGAATCGTAAATGTCTCTTCAGAAGCTCACCGTGCCACATATCCTGAAGGCATTCTATTTGACGGGATTAATGATCAGTCAAGGTAATTATTTTTAAGCTTATAGAAACTAAGATGGAACGCACCTACTTTTATGATATAGGAAGCTTATAGAAATTACCTTGTAGATCCTGAGTTTCCTGACTTTTAGCTCTTTGATTTTGGTAAAAATACTTCAAATTATAAGGCGTAAAAGGTGGTTCTACAATTTTAAAATTGGGTTCGAAGTATTTTCTGTTCATGCACTTATGTAAAAAATGTTTTACAAATACTTTCTCACAAAAGTGCTTTCATGCTCTTACTCATAAACTAACAATTTTAAGGAAAAAAATATTTTTAACATCGAAAGAGTGCTTTTACCATCAGCACTCCTAGACATAGCCTTACTAACACTTACTCATGTAAAAGTTTGATAGTTCAAATTTACTCATGGTAGGTACAGTAAATTTCGTGCTTATGGCCAATCAAAGCTTGCAAATATTTTACATGCCAATGAGCTTGCAAGACGTTTCAAGGTACGAGGACTTGCATTCTCTAATGTCTGTCCTAACAGGTCTGTCTAACAAGTTGTAGATCTTAAATATTCAATTTTGTATCTAATATGCGTTTTAACTTTAAATAGTGTCTAAAAATTGAAAATTCAACGACATATAAAAATCCAAAATTAATGGAATTGGAGGGACAAACTTATGACATGTTATAGACACGCTTCTAAAAAAAGTTGAAATAACTAGACCATTCTCTAGATTAAAAAGCTCACTTCACACCAGAAAATGAAGGTAATAAAAAATGAAAAATACTTAGGTTAACATTCAATTTTTTACAAGTATCAGAGAGCAATCTAGAAAAATAGATATTTTTATTGTTTCTCGAAAAATAAAAAAAATTGTCAAACTTATTTGGTGGTTAGCGCGAGGATATTTTTATTGTTTCTCCAAAAATAAAAAAAATTGTCAAACTTATTTGGTGGTTAGCATGAGGATGAGTCTTGATTGGTAAGTAGCTAAGTATTGTTAATAATGGACATGGTGTGGTGAGGGAAATGTTTGATGTTTAGGACAAATTTTTTTGAAAATAGAAAAGATCACTTATGGCATGTTGATTTTCTCCCTCACATATGAAAATGTCAAAGGGAATGTTGGAAATGTCGACGGAAATTTAACTCACACCTTTTTAATGAATTGTGTTGTCTTTTTTAGTACAATAAACGGGGAAGACGGGAGGTTGAATTTTCGATCTCTAGAGAATGTGCAAAACACCTTAACTGCTGAGTTATGAGTTGTATGTTTCCTTTTAATGTTTCACTTTAGATATTAAATTTGTTTTTAAAAATATTCTGTAGGGGTGTATACGAATTAGTTCGGTTTGGTTCGATTTAGTAAAAAATTGATGCTGAATCATTCGATTCTGAAATGTTTTAAACTGAGAAGAAGAAAATTTTCCTCAATTAGGTTAAAAATCGATCTGGTCGGTTTTGGGTCCAGATGGTTCGGTTCGACTTTTAATC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TAAACTTTCCAAATTGATATGGAGTTGAAGTAGAAAATTTGGTATTAAGTAATCTATCCTTTCTTGTGGAGACATCATTTGTATACTTACAAATTCAAACAATAGTCAGCAAAGGCGTGGCAGGTGATTGCACACGTGTAACACGAGTCAAGGAGGCGACGGAGGAGGTGGCAGAATGCATGGTTGCTAGGAAAAGAAAAAAATAATAAAAGAAAATTAAACCGAAATTAAAAGCATAAGAAATTGCAGAATACGGAGCGGGTTTTAAAATTCCGTCGAAATGTGGTTTTTGAGAAGCAAAGGGTCCTCTGGATTTTCATACTCTTCCACAGCCGAGGAAGTTACTGACGGAATCGATGGCTCCGCTCTCACCGCCATTGTCACAGGAGCATCGAACGGTATCGGCTCTGAAACTGCGCGCGTTCTTGCATTACGCGGAGTCCATGTCATTATGGCTGTTAGGAACTTAGATGCTGGTAGAGGTGTTAGAGAAGCCATTGTCAAGGAGAATCCCTCTGCAAAGGTTGATGTCATGGAGTTGGATCTTAGCTCGATGGTGTCTATAAGAAAATTTGCCTCAGATTATCGGTCGTCTGGGTTTCCACTTAACATCCTCATTAATAATGCAGGAATAATGGCTGTCCCTTTTGGACTTTCAAAAGATAACATAGAACTGCAATTTGCGACGAACCACTTAGGCCATTTTATTTTGACAGATCTACTATTGGAAAATATGAAGAAAACTGCCATTAAAAGTGAGAAAGAAGGAAGAATTGTAAATGTCTCCTCGGAAGCTCACCGTTACACGTATCCTGAAGGCATCCGGTTTGATGAAATTAACGATGAATCAAGGTACAATAAAATGCAGGCTTATGGCCAGTCAAAGCTATCTAATGTTCTGCATGCGAATGAACTTGCGAGACGTTTCAAGGAAGAAGGAGTAAACATAACTGCAAATTCACTTCACCCCGGAATAATTCGTACCAATCTTTTCCGCCACTTCAGTTATGGCAATGGTATAGTAAACACTGTTGGCAAACTCGTATTTAAAAGCGTCGAACAGGGTGCAGCAACAACATGTTATGTGGCATTGCATCCACAAGTGAAGGGGGTGAGCGGTGAATATTTTCTAAATAGCAACCTACACAAGGCCAGTCCACATGGCCAGGATGTTGACTTGGCTAATAAACTTTGGGATTTTACCACTAACTTAATCAAGTAATCCAACTCTTTTTTTCTCCGTACATTTTGTTGTAATATTTCTATCTATGTTTTTAGGAAGCTGCATTAATATCTGACCATTTAAGTTATGCTCGGGTCCATCGTTGTGTCTGTATCTTGTGTGGAGTTGCAATAAAGTTTATGATAATCCTCTGGTTTGCCAAAGAGAAATGATATTTAAGTTGGTTCTTTTTTTCTTTTCTGAGATC ATGTGGTTTTTGAGAAGCAAAGGGTCCTCTGGATTTTCATACTCTTCCACAGCCGAGGAAGTTACTGACGGAATCGATGGCTCCGCTCTCACCGCCATTGTCACAGGAGCATCGAACGGTATCGGCTCTGAAACTGCGCGCGTTCTTGCATTACGCGGAGTCCATGTCATTATGGCTGTTAGGAACTTAGATGCTGGTAGAGGTGTTAGAGAAGCCATTGTCAAGGAGAATCCCTCTGCAAAGGTTGATGTCATGGAGTTGGATCTTAGCTCGATGGTGTCTATAAGAAAATTTGCCTCAGATTATCGGTCGTCTGGGTTTCCACTTAACATCCTCATTAATAATGCAGGAATAATGGCTGTCCCTTTTGGACTTTCAAAAGATAACATAGAACTGCAATTTGCGACGAACCACTTAGGCCATTTTATTTTGACAGATCTACTATTGGAAAATATGAAGAAAACTGCCATTAAAAGTGAGAAAGAAGGAAGAATTGTAAATGTCTCCTCGGAAGCTCACCGTTACACGTATCCTGAAGGCATCCGGTTTGATGAAATTAACGATGAATCAAGGTACAATAAAATGCAGGCTTATGGCCAGTCAAAGCTATCTAATGTTCTGCATGCGAATGAACTTGCGAGACGTTTCAAGGAAGAAGGAGTAAACATAACTGCAAATTCACTTCACCCCGGAATAATTCGTACCAATCTTTTCCGCCACTTCAGTTATGGCAATGGTATAGTAAACACTGTTGGCAAACTCGTATTTAAAAGCGTCGAACAGGGTGCAGCAACAACATGTTATGTGGCATTGCATCCACAAGTGAAGGGGGTGAGCGGTGAATATTTTCTAAATAGCAACCTACACAAGGCCAGTCCACATGGCCAGGATGTTGACTTGGCTAATAAACTTTGGGATTTTACCACTAACTTAATCAAGTAA MWFLRSKGSSGFSYSSTAEEVTDGIDGSALTAIVTGASNGIGSETARVLALRGVHVIMAVRNLDAGRGVREAIVKENPSAKVDVMELDLSSMVSIRKFASDYRSSGFPLNILINNAGIMAVPFGLSKDNIELQFATNHLGHFILTDLLLENMKKTAIKSEKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDEINDESRYNKMQAYGQSKLSNVLHANELARRFKEEGVNITANSLHPGIIRTNLFRHFSYGNGIVNTVGKLVFKSVEQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFLNSNLHKASPHGQDVDLANKLWDFTTNLIK Homology
BLAST of MC06g1893 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6RVV4 (Short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic OS=Pisum sativum OX=3888 GN=TIC32 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 458.0 bits (1177), Expect = 8.6e-128 Identity = 227/314 (72.29%), Postives = 270/314 (85.99%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2RVM0 (Short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TIC32 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 1.7e-120 Identity = 220/312 (70.51%), Postives = 262/312 (83.97%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A078ISJ6 (Short-chain dehydrogenase TIC 32 B, chloroplastic OS=Brassica napus OX=3708 GN=TIC32B PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 8.2e-94 Identity = 170/305 (55.74%), Postives = 225/305 (73.77%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A078IS66 (Short-chain dehydrogenase TIC 32 A, chloroplastic OS=Brassica napus OX=3708 GN=TIC32A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 342.0 bits (876), Expect = 6.9e-93 Identity = 169/306 (55.23%), Postives = 225/306 (73.53%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q91WL8 (WW domain-containing oxidoreductase OS=Mus musculus OX=10090 GN=Wwox PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 195.7 bits (496), Expect = 8.0e-49 Identity = 118/312 (37.82%), Postives = 177/312 (56.73%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. NCBI nr
Match: XP_022159698.1 (short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 584 bits (1505), Expect = 4.89e-209 Identity = 297/313 (94.89%), Postives = 303/313 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. NCBI nr
Match: XP_038876125.1 (short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 553 bits (1426), Expect = 1.64e-197 Identity = 277/313 (88.50%), Postives = 293/313 (93.61%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. NCBI nr
Match: XP_022922238.1 (short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 553 bits (1425), Expect = 2.33e-197 Identity = 274/313 (87.54%), Postives = 293/313 (93.61%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. NCBI nr
Match: XP_023549791.1 (short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 552 bits (1422), Expect = 6.66e-197 Identity = 273/313 (87.22%), Postives = 293/313 (93.61%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. NCBI nr
Match: KAG6579380.1 (Short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 551 bits (1421), Expect = 9.47e-197 Identity = 273/313 (87.22%), Postives = 292/313 (93.29%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZK2 (short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111026040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 584 bits (1505), Expect = 2.37e-209 Identity = 297/313 (94.89%), Postives = 303/313 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E611 (short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430281 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 553 bits (1425), Expect = 1.13e-197 Identity = 274/313 (87.54%), Postives = 293/313 (93.61%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AUS1 (short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103482905 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 550 bits (1418), Expect = 1.31e-196 Identity = 271/313 (86.58%), Postives = 295/313 (94.25%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ID90 (short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471523 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 550 bits (1416), Expect = 2.65e-196 Identity = 271/313 (86.58%), Postives = 292/313 (93.29%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KQF8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G141100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 548 bits (1411), Expect = 1.53e-195 Identity = 270/313 (86.26%), Postives = 295/313 (94.25%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. TAIR 10
Match: AT4G23420.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 436.4 bits (1121), Expect = 1.9e-122 Identity = 224/312 (71.79%), Postives = 262/312 (83.97%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. TAIR 10
Match: AT4G23420.2 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 436.4 bits (1121), Expect = 1.9e-122 Identity = 224/312 (71.79%), Postives = 262/312 (83.97%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. TAIR 10
Match: AT4G23430.2 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 1.2e-121 Identity = 220/312 (70.51%), Postives = 262/312 (83.97%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. TAIR 10
Match: AT4G11410.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 430.3 bits (1105), Expect = 1.4e-120 Identity = 217/311 (69.77%), Postives = 253/311 (81.35%), Query Frame = 0
BLAST of MC06g1893 vs. TAIR 10
Match: AT4G23430.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 426.8 bits (1096), Expect = 1.5e-119 Identity = 219/312 (70.19%), Postives = 261/312 (83.65%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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