MC06g1840 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1

Overview
NameMC06g1840
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionNuclear pore complex protein NUP98A-like
LocationMC06: 25719053 .. 25728094 (+)
RNA-Seq ExpressionMC06g1840
SyntenyMC06g1840
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: utr5CDSpolypeptideutr3
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GGGGACTTATTTTTAACGCAAATACGGATTAGGGAGTACGGACTTAGTTTGGACCCTACACGGCTTTGTTTCCCGTTTAAATAACGCCGTTCCGTTTCTTCGTCCGTCGTTTGTTCTTCATCTGGGGCCTTTTTCTTTGTTTCTCCTTCATTCTGCCTCAGCCTCTGCGCACCTCACTGGCTTATGCTTCCGCACTCTCTCTGATCATCGGTACGTTTTTCTCTTCCCACTAGCAGATCCTATCTTCCTGCATTTCTTCTCCATTGTTTTCCTGTCTTTTCCTCCACGGGTAGATGGATTTTTTGTCGTTTCTTCGGCGGAAGGTTGCCGAGTCTCTTGGCTCTTGGTCGAACGGTTTGAGGCTAGGGTTTTCTTATTCCTGGAGCGACGACTGGATTTGATTCTGCCATTGCTTTGTTTTTAATCTCGATGTCTTGTGTTTTTGTTGATTTAATTCGTGGTTTGAGTGCTACTGTGGATGTTGGGTTCGATTCGGAATCGGAGATTCTTTTGAAGTTAGGGGATGCAACGTTCCGTTGTTTATTGCAGCAGCGTGATTGTTCTTGGGGGTGCTCATCACATGATTTTGTTTAACTACTTGTTTGCTGTAGCATTTTTATTTTCTTCTGTTTTTTTAATTGGATACCGTCTTTCTTTCTCCGTTTTGCTTATACGTTTTGTGAGTTGTAGGGTTTTGTTTTCTGTTGTGTTCTCCATGATTGATTTGGGTTCTTTTTCTATGCCGGTTCGAGATCAGTAGCTAACCTACTCAGTTGCGGCTGGGGATTGATAAAGAAGGATGTTCGGTTCTCCCAACCGTAAGTATATCTTTTCTTTTATATTTTGTTTTTAGTTTTTTTATTCTAATTCTACTATGTTTGCAAAGCTGCTGGGTCGAATGGTTTTTTCTTTGTTGGAAAAAGATCCGAAGGAAAGCAACCAAGTAGGACTTGGGGGATTTTCAGTAAAATTAGTCTAAAGTTTAATCTCTCATCTCCGCAATTCCTTAAAGTTTAACAAGTGATGAAACTTTATGTTTTGTTTCATAATTAAATTACCTTCTCCTAGAAGAATGATGTGTATATTGTAGTCTTATACTATTATGTTATTTTGTTTTGTTGACTTGTCATTTGTTGGTTTTATATGTGTTTGTATATGTGTACAGTACAGCTTGATTATCATGGCCTTCCTATTTCTTTTCCAGGTTGCTAATGTATTTAAAACTGCACCTCGTATATGTACACATGAGTCATGGCTTAACTTGTGAATTTTTTCTTAACACTCTGAAAGTATCTTCTGATTAAGCTTCGTCTATCCTGACTTCAACTTCTTTTATCATTGAGTTTTGTTTAGCCTTTTTACTGATCGAACTTCTAAGTTCTTATCTTATACTAAGTCGGTTTGTTTTGTAAATAACTGGCCTTGGTTTCATAAACAGCTTTTGGGCAACCGTCTTCTAGCCCTTTTGCATCCCAACCAGTCTTCGGGCAAACTGCCAATGCAAGTAATAATCCTTTTGCTCCCAAGCCATTTGGAAGTACTTCCCCTTTTGGCTCACAGACAGGAAATACAGTGTTCGGTGGTACATCAACTGGTGTGTTTGGGGCAGCCCAATCCTCTTCCCCCTTTTCTTCCACAACATTTGGCGGTTCATCATCGCCAGCTTTTGGTGCTACACCGTCCACTTTTGGATCATCATCAACTCCTGCTTTTGGTAGTTCATCATCTTCATCATTTGGAGGTATGTATATAAATTATTATCTGTTCTCCTCTGATAATCAATTATTTTCCCTAGTGAAAGATTACTGTGTTTATAAGGGTTTCAGGCTTTCAACAATGCTAGTGTCTTTTATTATGGAGTACAAAAAATATGTGGTAGATTGTGCATGTATTTTATCTGGTTCTTTAACTATGAGAAATTTTCCTTTGTGCTCTCAAACTATCAGTTCTTAAATAGATATTTTATTTTGGGTTCATAATTTTTGTTGTGAACCTTCGTTAGAGGGTGATGTGATTATATTAACAAATTTCTGTTAATGTGTAGACCTATTCATCCATGAAGGACCAACTGAATGGTTTAGAAAATTTAGAATAAAGTGAAAATCGAAAAAATAATAGTAAAGTCAAGTAACTTGTCGAATTTCCCCGAAGGGACAAGTCTAGTAACTTGAGTAGTGATGGATTTTGAATTTTTCCTTGTGGGATTATGAAATGCGTTAATTGTAATGGTTACTTTTTATTCTGCTTATATGGCTGTATTTATTATCTTCCTTAGGTGAAGGATTAACTTTTCTATTGTTATTTTTTCTGAGATTATATGTCTCTTTTAATAAGGGATGATTCTTTAATATATATATATATATTTTGCATGTTTCTTTTGACTAAGCTACTGTATATGTCCTCACTACCACTACTTTTAGTAAACGACGTTCAATTCAGAACACAGATTGCAACTAGGCAAATTTGAAAAATATTTTTATCACTTATTTCATGCTGTGGATTTAACTCTGATGCACTCTTTTCCAGCAGGTTCGTCCATTTTTGGGCAGAAGCCTCTATTTGGAGGCTTTGGATCTACTACTACTCAAACAAACCCATTTGGAAGTGCAAACCAGCAATCTCAGCCAGCATTTGGAAGCAATGTCTTTGGTTCCTCATCACCTTTTGGTGCGCCTAGCCAGTCCGCATTTGGTGCTACTAGTGCTCCAGCCTTTGGCGCCACGAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACAAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACGAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACGAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACAAGCACCCCTGCCTTTGGCGCCACAAGCACCCCTGCCTTTGGGGCTAGCAGCACTCCTGCCTTCGGTTCAACAAGCACTCCTGCATTTGGTAGTACTGGGAATGCATTTGGCTCATTAAGCACCCCTGTTTTTGGATCTGGAGGTGGATTTGGTGCCTCAAGTACTCCTGCTTTTGGAGTTTCAAGTACTCCTGCTTTTGGGGCTTCAAGTGCTCCTGCTTTTGGAGCTTCTAGCACTCCATCCTTCAGCTTTGGGTCCACTTCAGCTTTTGGCCAGTCAACTTCTGCATTTGGTAGCAGCAATTTTGGTTCTAATACATCTCCTTTTGGAGCCCAGAGTTCCCCTTTTGGTGAGCCATTCTGAAATATCTTACTAGTTATACTGTTAAAATTCCTTTTGGAGTTGCAGGATTTTTTGCTTCATTGAGTAATGAACACATGTTATTTTAAATTCATTACAGGAGCACAGTCTACATCTGCATTTGGGACCAGTGGTTTTGGGCAGGCTGGTTTTGGTGGTCAGCGTGGTGGTAGTAGAGCAGCTGCTTATGCACCAACAACTGAGCCAGATCCTGGAAGTGGTAGTACACAAGCAGCTGGGAAGTTGGAGTCTATATCAGCCATGCCTGTTTACAAAGATAAGAGTCATGAAGAGTTGAGATGGGAGGATTATCAATTGGGAGACAAAGGTACGTTTTTTTTTTCCTTGAAAAAATGTACAAAAGTTTAGTCCCTGGCATGGACATTACTAAATTTATGCGTTTGTTCTGCAGGTGGACCTCTTCCTGCTGGTCAGTCTACTGGTGGTGTTGGCTTTGGTGTTTCTAATGCACAGCCAAACCTTCTAGCTACTTCAACATTTAGTCAACCAAGTTCAAATCCTTTTTCTACTGCTACATCATCCAATCCATTTGCCCCTAAGCCTTCTGGTTTTGGTACTTTTGGGCCTTCAACAACGTTTTCATTTAATTCTTCAGCATTTGCTACTTCATCTTCATCAAACCTATTTCCATCAACAACATCAGCCTCGACATCATCTTTTCTGCCGACAACATCCTCTCAATTTGGAAGCTCATCCTTATTCAATTCATCTAACACTCAAGCCCTTGGCTCACAACTTGCTTTTAGTTCAACTGCATCTCCAGGGACAAATCTTACCTTTCCTTCCAGCTTAAATTTTAGTAACACCCAATCATCTTCCCTTTTCCAATCCACAACACCTTCAATTGGGCAGACAGGTTCAGCCTTTGGCGCTCCATTTACACAATCCAGCTTGTTTAATCAACCTTCGTCTGGGGTTGGAGGGAACCTTTTCTCAAGCTCGCCACTTCTAACTTCGAGTAATCCAATGGGTTTTGGTCAATCATCTGTAAGTATCCTTTTGATGTTACCATATTACTTTGTACATTTCTTGAGGTGAGACAGACAATTGTGTATTGACTAATAGACCACATTACTCATATGCATAATTGTATGTCACCTTATTACTCGTGTGTGAAGAGAGGGAAACAAAGGTCTATAGAGTAACATATAAGTGTATGATAATGGAACTCTATGTTTGGTACGCTTGATTATACTTTGGATAGGTGCAAGAGGTGTTAAGTAAATAATTTCCTATTTCACAATGTACTCTTCTTTACGAACTTCATTAGTTGGGCTCTGATTTGAAATTGATTTTTTTATTTTTCTTCTAGACCAGTGAATTAAGTAATGATTATTTATTAAATGTTTTTTGTAGTTCATATCTCAATTTAATGTAACACCAGTAATTTGAAAGTTGTAGACAGTTATTTGTAGTTTGTATATTAATAGGCTTGTAATCTTGCTGCCTCAATGTATTCTGCAGGCCTCTTTTTCTATGCCTTTTCAACCGGCACAAGCACAGGCTCCCACTTCCTTTTTTAGCAACCTGAGTCAGACTCAACCAAGTGAGTTCATTTCTTAAAAATTGAGCGATTGTTTTATGGAGCGTTCAAACCTTTTATTACTTTACTAACTTGATTACTTTTACCCCGTAGTTGGTTCAAGTGGTTTTGCAGGAACTTCGAGTATTTTTGGTCAGAGTAACTTTGGACAATCGTAAGTCGTGTGTTCCCTTCTTATTGGCTCTTATTTGCATATTGTTGAGTTTTTCTTTCATATATGATTTCATTTGTTTTCATATTTGATAAAGTTGGTATTTGTCGATTTTTTTAAGGCAGCAATTACTGAAATTATTGTAAAGACTAAAATCTTAGGGTTATCTGGTCTTTGGTCTGGAAACAAATTTCCAGAGAAAAATAACACAAGCTCATATACTGGGTGAAATAGAATATAACAAATATTAGAGAAGATTAAATAATAAAAATCTGTCTGTATTGTTGAAGATAAGATAACAGTCATCAAAGGTATGTTGAAAACCCAATGAGGAAAAAAGTGTTAAGATGACTTGAAATAGGATGGTACCAACAACCTATACCATTCATGTATATCAGATAAAAGATCATTGAGCTACAAAAAAATCAGCCTAAATAAGCAACACACTGCAAGAAATTTTCTTCACTCTCCTGTCCGCAAGATAAGGGGTCACTCTTGGCTTGTGGCTTTCTTTATTGTCTAATGGAACATTTGAGAAGAATAGGAGTTCTAAGAGGCCTATGGAGTTCTTGGCAGGTTATGGGCTTAGAGTTTCTTATTATCAAGATTTTTATGGTCATCCTTTTATCTCTATTCATACTTTTATAATTTGGTTTGTATCCAGACTTTCCTACAGAGCATTGCCACAAGAAGTTCGATCATATTATATATTTTTCTAAATATAAACTTTTTTTAGTTCTTACCAAATGACCCTTCAATTTTATCTTAATTTTTTTGCATCAAATATCAATCATTGAAAATTCACTTCAGTGTAACCATTTTTCACTGCATAAGATTTAATGCTTTGTACTTGTTAATTAACTAACTCTGAGATTGTGGATTTAGGTTTTGGAGTTTATATTAGTGCGTGATGATGTTGTTCCCGAGCATTGCTCATGTTTCTTTTCTATTTTTGTTGGATGGAAATGTGTTTCAGTTTTCCTTTTGCATATCATTTTCTTTTTCTGGTTCTTGCGGCTGATTAGCATGGTGGTTTTATCTGTCAGATATTGACTTGTCTTAGTAAAACTTGAGGACTATGTAGATATAAAACACTGAATCACTTTTCCCTATATATTCATTGCCATGTATCGTATTGGTAATTTGCACGCATGTACTTTGCAGGCCTATCACCCAAAGCCCCGTAGTACAACCAGCAACTGCCACAAATCCATTTGGGACACTCCCTGCAATGCCACAGATGTCAATTAGTAAGCCAGGAGCAGCACCTTCAATTCAATATGGAATTTCAAGCATGCCGGTAATTTGGACTTGTTTTAACTGTGCTTTTATTTACTTAACTTTCAGTGGGTTTAGATCAATGATTTTTGATATGGTGGCTGTATCATTAAAATCTGCAGGAAGAATATAGTTCCGTGCTATTTTTAGATTCTCTATATTAATTGATATTGCCAATGTAGGTTGTTGATAAAGCTGCTCCTGTCAGAATATCATCCTTCTTGACGCCTCGCCACCTATCTCACAGACGGATGAGATTGCCTACAAGAAAATATAATCCTAAGAATGATGGCCGCCCTAGGGTATGAACGTTTCTTCTATAGCTATTATCTTTTTCTTTTCCCCTCCCACACATTCCTATTGGGTTTGGGTGGTTATTAAGATGGTGCTTCACTTGAAATTTGTATATACAGACTACTTATAGCTATTTGTCATGTATAGGTTCCATTTTTCAGTGAAGATGAAGAAACACCAAGCACCCCAAAGGCTGATGCTCTTTTTATTCCCAGAGAGAACCCTAGAGCATTGGTTATTCGTCCCACAGATCAGTGGCCTTCAAGGGCCAGTTTAGAGAAAGCATCACCATTGAAGGACACCGCAGTGCGTGAAAATGGTATAACTTTGTTGCTTTCTGCCTTCTGCTGTTCGTGTTTTATACTTTTAGGTGAATGTTGCTTTTCTGCTTCTGGAATATTTGTGCTCTGCATTGTGTTTTACTTTTTAGATGCCAGCTTGCACTGTGATGTTCTTATTTATTTTTTACTATGACCAAGTAATGGTCTTAGGGTCGGCTTGTCCATCTCATTAACATATATGGTTTTGAATTTTTTGTTCTTTTTACCTTTTTTTTTGTTTTTGTATTTAATTTTATTTTATGAATAGTGCTCTGATTCACTGAGAGCTAGGTTGCATAATGCAGAGCAATGAAATCTGTAAAATGTGATTTAGATTATTATTTACTAATAGTATAAAGTTATTATAAACTTAATTTATAATATTTTTTCAGTAACTTTAACTTACTTGATACTATTTGTATTAGTTATTTCTAATTAAAAATGAATAATTGAAGTTATAGACATTAAATCATGCAATTAATTTCTTTGTTTGTGTTTGGTAGGTTTAGGAAGTCATTATCCTATACTAACATGGATTTTCGCAACCCATTTCCTTCTCTTTATTATTGCATACTAAAAGCCCTAAAGGCGCCCTTATGGCTTATAGTTTTCTGCATCCGATTTTTTTTAAAAAATTCTGAATCGTATTTTACTTTTTAATGCAATGTTATGAGCTGTTGCCTAGCATGATGGTATAATTTCTTTCCCTTTTACCAAGATCAAGTTTTGCCTGGCCCTGTGAGGTTGGATGAGTTTTAAGCTTAATTAATACATTGTTGCTGACTAGCAAATCTTAATTTTATCAGGGAAGATTCCTGAGGACAATTCCTCCTTGCCTGTCAACAATTTGAAGAATACCGATGGTTAGTTTTTTCCCTTTGAATTTTGGTATATTTTCAGTTTGTCTGTATAATTTTGCCTGTCTACACACCTCAACGGACAAGCTGTTTAGAACTTCTGGTTGCATTTCTCTAGCTTATTGTTCTTATGAAGTATTTTGTGGTGGAATTTATTAATTAAATCGCGGCGCTCTAATGTCTATGGTGGATCTTCTTTTCTACATAAAGAAGAAAGTTCCATTATATAGATAGTGTTATGAACAACTGGGTTTTGTTCTTAATTTTGGCTCTTTTTTTTTCCCTGAATAAAGTGGTCGGCGAGGCGATTGGAATTGGTATCGTTTGCTTTGTTTATAGAAGAGTGCATCATAGTTGTAGAAGCTGCACTTTTCATGTTAAATAATTTATGTCGACTCTTTTTATTGCAGGAAATGCTGTTGAGAACGGTAGTACTAGCAAGGACAGCGTCCATCCTAACAAAGTAAACCAAAAACCCAACGGGGTCCATGAGGATCATTCTGCTCCAAAGGAGGACTTGTATAGGACATTTGGGGGGCACAGAGCTGGCGAAGCCGCCATCGTTTATGAACACGGGGCAGATATCGAGGCATTAATGCCGAAGCTCCGACATGCAGACTATTATACCGAGCCAAAAATTCAAGAATTGGCAGCCAAAGAACGGGCTGAACCTGGGTTTTGCCGTCATGTTAAGGATTTTGTGGTGGGCCGCCATGGTTATGGAAGCATCAAATTCTTTGGCGAAACAGATGTGCGACGACTTGATCTAGAGTCCATTGTCCAGTTTAACAACCGTGAGGTGACTGTGTACCTCGACGATAGTAAGAAGCCCCCTCGTGGGCAAGGTCTGAATAAGCCTGCTGAAGTAACAATACTCAACATCAAATGCTTCGACAAGAAAACCGGGCATCAGTATACGGAAGGGCCAAAAGCTGAGAAATACAAGGAGTTGCTAAGGAAGAAGACGGAGGCTCAAGGCGCGGAGTTCGTATCACACGATCCAGTGAAGGGGGAGTGGAAGTTCAGGGTCGAACACTTCAGCAAGTATAAGATGGAAGACTGTGAGGAAGTTGAAGAGTGAGAATGAATGAGTGTTGTTTGTTGAGTTGTTTAAAAGAGGGGGGGAAGCGTATGCAATGCCAAGTTCAAGTTGGTTGCTGTTTCCTGCTTTGTAGTTTAGAAAGAGATTTTGTGTTGGACAATTTTAAATGGGTCTGTAAAGAAATATATGTTCAAGTAATGAAGTACTAAGTAAGTTCTTTGTTGAGTTATATAGTTAGGAGTCCGTATTGGCCTTCACATTTGGTTTCTAATTCAATACAGTGATGTTTAAAAGGACATTCATTTGTGATGCTCAATGGTTTTTCTCAATATAAACTTATGGCAGTGTTCTCATTTT

mRNA sequence

GGGGACTTATTTTTAACGCAAATACGGATTAGGGAGTACGGACTTAGTTTGGACCCTACACGGCTTTGTTTCCCGTTTAAATAACGCCGTTCCGTTTCTTCGTCCGTCGTTTGTTCTTCATCTGGGGCCTTTTTCTTTGTTTCTCCTTCATTCTGCCTCAGCCTCTGCGCACCTCACTGGCTTATGCTTCCGCACTCTCTCTGATCATCGTAGCTAACCTACTCAGTTGCGGCTGGGGATTGATAAAGAAGGATGTTCGGTTCTCCCAACCCTTTTGGGCAACCGTCTTCTAGCCCTTTTGCATCCCAACCAGTCTTCGGGCAAACTGCCAATGCAAGTAATAATCCTTTTGCTCCCAAGCCATTTGGAAGTACTTCCCCTTTTGGCTCACAGACAGGAAATACAGTGTTCGGTGGTACATCAACTGGTGTGTTTGGGGCAGCCCAATCCTCTTCCCCCTTTTCTTCCACAACATTTGGCGGTTCATCATCGCCAGCTTTTGGTGCTACACCGTCCACTTTTGGATCATCATCAACTCCTGCTTTTGGTAGTTCATCATCTTCATCATTTGGAGGTTCGTCCATTTTTGGGCAGAAGCCTCTATTTGGAGGCTTTGGATCTACTACTACTCAAACAAACCCATTTGGAAGTGCAAACCAGCAATCTCAGCCAGCATTTGGAAGCAATGTCTTTGGTTCCTCATCACCTTTTGGTGCGCCTAGCCAGTCCGCATTTGGTGCTACTAGTGCTCCAGCCTTTGGCGCCACGAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACAAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACGAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACGAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACAAGCACCCCTGCCTTTGGCGCCACAAGCACCCCTGCCTTTGGGGCTAGCAGCACTCCTGCCTTCGGTTCAACAAGCACTCCTGCATTTGGTAGTACTGGGAATGCATTTGGCTCATTAAGCACCCCTGTTTTTGGATCTGGAGGTGGATTTGGTGCCTCAAGTACTCCTGCTTTTGGAGTTTCAAGTACTCCTGCTTTTGGGGCTTCAAGTGCTCCTGCTTTTGGAGCTTCTAGCACTCCATCCTTCAGCTTTGGGTCCACTTCAGCTTTTGGCCAGTCAACTTCTGCATTTGGTAGCAGCAATTTTGGTTCTAATACATCTCCTTTTGGAGCCCAGAGTTCCCCTTTTGGAGCACAGTCTACATCTGCATTTGGGACCAGTGGTTTTGGGCAGGCTGGTTTTGGTGGTCAGCGTGGTGGTAGTAGAGCAGCTGCTTATGCACCAACAACTGAGCCAGATCCTGGAAGTGGTAGTACACAAGCAGCTGGGAAGTTGGAGTCTATATCAGCCATGCCTGTTTACAAAGATAAGAGTCATGAAGAGTTGAGATGGGAGGATTATCAATTGGGAGACAAAGGTGGACCTCTTCCTGCTGGTCAGTCTACTGGTGGTGTTGGCTTTGGTGTTTCTAATGCACAGCCAAACCTTCTAGCTACTTCAACATTTAGTCAACCAAGTTCAAATCCTTTTTCTACTGCTACATCATCCAATCCATTTGCCCCTAAGCCTTCTGGTTTTGGTACTTTTGGGCCTTCAACAACGTTTTCATTTAATTCTTCAGCATTTGCTACTTCATCTTCATCAAACCTATTTCCATCAACAACATCAGCCTCGACATCATCTTTTCTGCCGACAACATCCTCTCAATTTGGAAGCTCATCCTTATTCAATTCATCTAACACTCAAGCCCTTGGCTCACAACTTGCTTTTAGTTCAACTGCATCTCCAGGGACAAATCTTACCTTTCCTTCCAGCTTAAATTTTAGTAACACCCAATCATCTTCCCTTTTCCAATCCACAACACCTTCAATTGGGCAGACAGGTTCAGCCTTTGGCGCTCCATTTACACAATCCAGCTTGTTTAATCAACCTTCGTCTGGGGTTGGAGGGAACCTTTTCTCAAGCTCGCCACTTCTAACTTCGAGTAATCCAATGGGTTTTGGTCAATCATCTGCCTCTTTTTCTATGCCTTTTCAACCGGCACAAGCACAGGCTCCCACTTCCTTTTTTAGCAACCTGAGTCAGACTCAACCAATTGGTTCAAGTGGTTTTGCAGGAACTTCGAGTATTTTTGGTCAGAGTAACTTTGGACAATCGCCTATCACCCAAAGCCCCGTAGTACAACCAGCAACTGCCACAAATCCATTTGGGACACTCCCTGCAATGCCACAGATGTCAATTAGTAAGCCAGGAGCAGCACCTTCAATTCAATATGGAATTTCAAGCATGCCGGTTGTTGATAAAGCTGCTCCTGTCAGAATATCATCCTTCTTGACGCCTCGCCACCTATCTCACAGACGGATGAGATTGCCTACAAGAAAATATAATCCTAAGAATGATGGCCGCCCTAGGGTTCCATTTTTCAGTGAAGATGAAGAAACACCAAGCACCCCAAAGGCTGATGCTCTTTTTATTCCCAGAGAGAACCCTAGAGCATTGGTTATTCGTCCCACAGATCAGTGGCCTTCAAGGGCCAGTTTAGAGAAAGCATCACCATTGAAGGACACCGCAGTGCGTGAAAATGGGAAGATTCCTGAGGACAATTCCTCCTTGCCTGTCAACAATTTGAAGAATACCGATGGAAATGCTGTTGAGAACGGTAGTACTAGCAAGGACAGCGTCCATCCTAACAAAGTAAACCAAAAACCCAACGGGGTCCATGAGGATCATTCTGCTCCAAAGGAGGACTTGTATAGGACATTTGGGGGGCACAGAGCTGGCGAAGCCGCCATCGTTTATGAACACGGGGCAGATATCGAGGCATTAATGCCGAAGCTCCGACATGCAGACTATTATACCGAGCCAAAAATTCAAGAATTGGCAGCCAAAGAACGGGCTGAACCTGGGTTTTGCCGTCATGTTAAGGATTTTGTGGTGGGCCGCCATGGTTATGGAAGCATCAAATTCTTTGGCGAAACAGATGTGCGACGACTTGATCTAGAGTCCATTGTCCAGTTTAACAACCGTGAGGTGACTGTGTACCTCGACGATAGTAAGAAGCCCCCTCGTGGGCAAGGTCTGAATAAGCCTGCTGAAGTAACAATACTCAACATCAAATGCTTCGACAAGAAAACCGGGCATCAGTATACGGAAGGGCCAAAAGCTGAGAAATACAAGGAGTTGCTAAGGAAGAAGACGGAGGCTCAAGGCGCGGAGTTCGTATCACACGATCCAGTGAAGGGGGAGTGGAAGTTCAGGGTCGAACACTTCAGCAAGTATAAGATGGAAGACTGTGAGGAAGTTGAAGAGTGAGAATGAATGAGTGTTGTTTGTTGAGTTGTTTAAAAGAGGGGGGGAAGCGTATGCAATGCCAAGTTCAAGTTGGTTGCTGTTTCCTGCTTTGTAGTTTAGAAAGAGATTTTGTGTTGGACAATTTTAAATGGGTCTGTAAAGAAATATATGTTCAAGTAATGAAGTACTAAGTAAGTTCTTTGTTGAGTTATATAGTTAGGAGTCCGTATTGGCCTTCACATTTGGTTTCTAATTCAATACAGTGATGTTTAAAAGGACATTCATTTGTGATGCTCAATGGTTTTTCTCAATATAAACTTATGGCAGTGTTCTCATTTT

Coding sequence (CDS)

ATGTTCGGTTCTCCCAACCCTTTTGGGCAACCGTCTTCTAGCCCTTTTGCATCCCAACCAGTCTTCGGGCAAACTGCCAATGCAAGTAATAATCCTTTTGCTCCCAAGCCATTTGGAAGTACTTCCCCTTTTGGCTCACAGACAGGAAATACAGTGTTCGGTGGTACATCAACTGGTGTGTTTGGGGCAGCCCAATCCTCTTCCCCCTTTTCTTCCACAACATTTGGCGGTTCATCATCGCCAGCTTTTGGTGCTACACCGTCCACTTTTGGATCATCATCAACTCCTGCTTTTGGTAGTTCATCATCTTCATCATTTGGAGGTTCGTCCATTTTTGGGCAGAAGCCTCTATTTGGAGGCTTTGGATCTACTACTACTCAAACAAACCCATTTGGAAGTGCAAACCAGCAATCTCAGCCAGCATTTGGAAGCAATGTCTTTGGTTCCTCATCACCTTTTGGTGCGCCTAGCCAGTCCGCATTTGGTGCTACTAGTGCTCCAGCCTTTGGCGCCACGAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACAAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACGAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACGAGCACCCCAGCATTTGGCGCCACAAGCACCCCTGCCTTTGGCGCCACAAGCACCCCTGCCTTTGGGGCTAGCAGCACTCCTGCCTTCGGTTCAACAAGCACTCCTGCATTTGGTAGTACTGGGAATGCATTTGGCTCATTAAGCACCCCTGTTTTTGGATCTGGAGGTGGATTTGGTGCCTCAAGTACTCCTGCTTTTGGAGTTTCAAGTACTCCTGCTTTTGGGGCTTCAAGTGCTCCTGCTTTTGGAGCTTCTAGCACTCCATCCTTCAGCTTTGGGTCCACTTCAGCTTTTGGCCAGTCAACTTCTGCATTTGGTAGCAGCAATTTTGGTTCTAATACATCTCCTTTTGGAGCCCAGAGTTCCCCTTTTGGAGCACAGTCTACATCTGCATTTGGGACCAGTGGTTTTGGGCAGGCTGGTTTTGGTGGTCAGCGTGGTGGTAGTAGAGCAGCTGCTTATGCACCAACAACTGAGCCAGATCCTGGAAGTGGTAGTACACAAGCAGCTGGGAAGTTGGAGTCTATATCAGCCATGCCTGTTTACAAAGATAAGAGTCATGAAGAGTTGAGATGGGAGGATTATCAATTGGGAGACAAAGGTGGACCTCTTCCTGCTGGTCAGTCTACTGGTGGTGTTGGCTTTGGTGTTTCTAATGCACAGCCAAACCTTCTAGCTACTTCAACATTTAGTCAACCAAGTTCAAATCCTTTTTCTACTGCTACATCATCCAATCCATTTGCCCCTAAGCCTTCTGGTTTTGGTACTTTTGGGCCTTCAACAACGTTTTCATTTAATTCTTCAGCATTTGCTACTTCATCTTCATCAAACCTATTTCCATCAACAACATCAGCCTCGACATCATCTTTTCTGCCGACAACATCCTCTCAATTTGGAAGCTCATCCTTATTCAATTCATCTAACACTCAAGCCCTTGGCTCACAACTTGCTTTTAGTTCAACTGCATCTCCAGGGACAAATCTTACCTTTCCTTCCAGCTTAAATTTTAGTAACACCCAATCATCTTCCCTTTTCCAATCCACAACACCTTCAATTGGGCAGACAGGTTCAGCCTTTGGCGCTCCATTTACACAATCCAGCTTGTTTAATCAACCTTCGTCTGGGGTTGGAGGGAACCTTTTCTCAAGCTCGCCACTTCTAACTTCGAGTAATCCAATGGGTTTTGGTCAATCATCTGCCTCTTTTTCTATGCCTTTTCAACCGGCACAAGCACAGGCTCCCACTTCCTTTTTTAGCAACCTGAGTCAGACTCAACCAATTGGTTCAAGTGGTTTTGCAGGAACTTCGAGTATTTTTGGTCAGAGTAACTTTGGACAATCGCCTATCACCCAAAGCCCCGTAGTACAACCAGCAACTGCCACAAATCCATTTGGGACACTCCCTGCAATGCCACAGATGTCAATTAGTAAGCCAGGAGCAGCACCTTCAATTCAATATGGAATTTCAAGCATGCCGGTTGTTGATAAAGCTGCTCCTGTCAGAATATCATCCTTCTTGACGCCTCGCCACCTATCTCACAGACGGATGAGATTGCCTACAAGAAAATATAATCCTAAGAATGATGGCCGCCCTAGGGTTCCATTTTTCAGTGAAGATGAAGAAACACCAAGCACCCCAAAGGCTGATGCTCTTTTTATTCCCAGAGAGAACCCTAGAGCATTGGTTATTCGTCCCACAGATCAGTGGCCTTCAAGGGCCAGTTTAGAGAAAGCATCACCATTGAAGGACACCGCAGTGCGTGAAAATGGGAAGATTCCTGAGGACAATTCCTCCTTGCCTGTCAACAATTTGAAGAATACCGATGGAAATGCTGTTGAGAACGGTAGTACTAGCAAGGACAGCGTCCATCCTAACAAAGTAAACCAAAAACCCAACGGGGTCCATGAGGATCATTCTGCTCCAAAGGAGGACTTGTATAGGACATTTGGGGGGCACAGAGCTGGCGAAGCCGCCATCGTTTATGAACACGGGGCAGATATCGAGGCATTAATGCCGAAGCTCCGACATGCAGACTATTATACCGAGCCAAAAATTCAAGAATTGGCAGCCAAAGAACGGGCTGAACCTGGGTTTTGCCGTCATGTTAAGGATTTTGTGGTGGGCCGCCATGGTTATGGAAGCATCAAATTCTTTGGCGAAACAGATGTGCGACGACTTGATCTAGAGTCCATTGTCCAGTTTAACAACCGTGAGGTGACTGTGTACCTCGACGATAGTAAGAAGCCCCCTCGTGGGCAAGGTCTGAATAAGCCTGCTGAAGTAACAATACTCAACATCAAATGCTTCGACAAGAAAACCGGGCATCAGTATACGGAAGGGCCAAAAGCTGAGAAATACAAGGAGTTGCTAAGGAAGAAGACGGAGGCTCAAGGCGCGGAGTTCGTATCACACGATCCAGTGAAGGGGGAGTGGAAGTTCAGGGTCGAACACTTCAGCAAGTATAAGATGGAAGACTGTGAGGAAGTTGAAGAGTGA

Protein sequence

MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGVFGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPNLLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTSASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDTAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKMEDCEEVEE
Homology
[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RY25 (Nuclear pore complex protein NUP98A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP98A PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 1047.3 bits (2707), Expect = 1.1e-304
Identity = 668/1074 (62.20%), Postives = 791/1074 (73.65%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPS-SSPFASQPVFGQTAN-ASNNPFAP-KPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTS 60
            MFGS NPFGQ S +SPF SQ +FGQT+N +SNNPFAP  PFG+++PF +Q+G+++FG TS
Sbjct: 1    MFGSSNPFGQSSGTSPFGSQSLFGQTSNTSSNNPFAPATPFGTSAPFAAQSGSSIFGSTS 60

Query: 61   TGVFGAAQSSSPFSST-TFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSS-SSSSFGGSSIFGQK 120
            TGVFGA Q+SSPF+ST TFG SSSPAFG        +STPAFG+S +SS FGGSS FGQK
Sbjct: 61   TGVFGAPQTSSPFASTPTFGASSSPAFG--------NSTPAFGASPASSPFGGSSGFGQK 120

Query: 121  PLFGGFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTP 180
            PL    G +T Q+NPFG++ QQSQPAFG+  FGSS+PFGA +  AFGA S P+FGATSTP
Sbjct: 121  PL----GFSTPQSNPFGNSTQQSQPAFGNTSFGSSTPFGATNTPAFGAPSTPSFGATSTP 180

Query: 181  AFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTP----------AF 240
            +FGA+STPAFGAT+TPAFGA+++P+FGAT+TPAFGA+ TPAFG++ T           AF
Sbjct: 181  SFGASSTPAFGATNTPAFGASNSPSFGATNTPAFGASPTPAFGSTGTTFGNTGFGSGGAF 240

Query: 241  GSTSTPAFGSTGN-AFGSLSTPVFGSGG--GFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASS 300
            G+++TPAFG++G  AFG+  TP FG+     FGASSTPAFG SSTPAFG SS P+FGAS+
Sbjct: 241  GASNTPAFGASGTPAFGASGTPAFGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGGSSTPSFGASN 300

Query: 301  TPSFSFGSTSAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQ-STSAFGTSGFGQAGFGGQ 360
            T SFSFGS+ AFGQSTSAFGSS FGS  SPFG      GAQ ST  FG SGFGQ+ FGGQ
Sbjct: 301  TSSFSFGSSPAFGQSTSAFGSSAFGSTPSPFG------GAQASTPTFGGSGFGQSTFGGQ 360

Query: 361  RGGSRAAAYAPTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLP 420
            +GGSRA  YAPT E D G+G TQ AGKLESISAMP YK+K++EELRWEDYQ GDKGGPLP
Sbjct: 361  QGGSRAVPYAPTVEADTGTG-TQPAGKLESISAMPAYKEKNYEELRWEDYQRGDKGGPLP 420

Query: 421  AGQSTGGVGFGVSNAQPNLLATS-TFSQPS---SNPFSTATSSNPFAPK-----PSGFGT 480
            AGQS G  GFG+S +QPN  + S  F Q S   +NPFS++TS+NPFAP+      S FGT
Sbjct: 421  AGQSPGNAGFGISPSQPNPFSPSPAFGQTSANPTNPFSSSTSTNPFAPQTPTIASSSFGT 480

Query: 481  FGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTSASTSSFLPTTSSQFGS---SSLFNSSNTQALG 540
                 T +F SS F  +SSSNLF S +S +TS F   +SS FG+   S LF SS+T   G
Sbjct: 481  ----ATSNFGSSPFGVTSSSNLFGSGSSTTTSVF--GSSSAFGTTTPSPLFGSSSTPGFG 540

Query: 541  SQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFG------------- 600
            S  +   +A PG   T P+   F N+Q S+LF S TPS GQTGSAFG             
Sbjct: 541  SSSSIFGSA-PGQGAT-PA---FGNSQPSTLFNS-TPSTGQTGSAFGQTGSAFGQFGQSS 600

Query: 601  AP-FTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQ-AQAPTSF- 660
            AP F Q+S+FN+PS+G  GN+FSSS  LT+S+   FGQ+  +   PFQ AQ  QA   F 
Sbjct: 601  APAFGQNSIFNKPSTGF-GNMFSSSSTLTTSSSSPFGQTMPAGVTPFQSAQPGQASNGFG 660

Query: 661  FSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPI-TQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSIS 720
            F+N  Q Q   ++G AG   IFGQ NFGQSP    S V+QP   TNPFGTLPAMPQ+SI+
Sbjct: 661  FNNFGQNQAANTTGNAGGLGIFGQGNFGQSPAPLNSVVLQPVAVTNPFGTLPAMPQISIN 720

Query: 721  KPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFF 780
            + G +PSIQYGISSMPVVDK APVRISS LT RHL HRR+RLP RKY P  +G P+VPFF
Sbjct: 721  QGGNSPSIQYGISSMPVVDKPAPVRISSLLTSRHLLHRRVRLPARKYRPGENG-PKVPFF 780

Query: 781  SEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDTA-VRENGKIPED 840
            ++DEE+ STPKADALFIPRENPRALVIRP  QW SR         + TA + +NGK P D
Sbjct: 781  TDDEESSSTPKADALFIPRENPRALVIRPVQQWSSRDKSILPKEQRPTAPLHDNGKSP-D 840

Query: 841  NSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNG-VHEDHSAPKEDLYRTFGGHRA 900
             ++   N+ +N +G     G     SV+    NQKPNG    D ++ KE  Y+T  GHRA
Sbjct: 841  MATDAANHDRNGNGELGATGERIHTSVN---ANQKPNGTTRSDQASEKERPYKTLSGHRA 900

Query: 901  GEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGS 960
            GEAAIVYEHGADIEALMPKLR +DY+TEP+IQELAAKERA+PG+CR V+DFVVGRHGYGS
Sbjct: 901  GEAAIVYEHGADIEALMPKLRQSDYFTEPRIQELAAKERADPGYCRRVRDFVVGRHGYGS 960

Query: 961  IKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTG 1020
            IKF GETDVRRLDLES+VQFN REV VY+D+SKKP  GQGLNKPAEVT+LNIKC DKKTG
Sbjct: 961  IKFMGETDVRRLDLESLVQFNTREVIVYMDESKKPAVGQGLNKPAEVTLLNIKCIDKKTG 1020

Query: 1021 HQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKMEDCEE 1025
             Q+TEG + EKYK +L+KK EAQGAEFVS DPVKGEWKFRVEHFS YK+ D +E
Sbjct: 1021 KQFTEGERVEKYKMMLKKKAEAQGAEFVSFDPVKGEWKFRVEHFSSYKLGDEDE 1037

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4ID16 (Nuclear pore complex protein NUP98B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP98B PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 879.4 bits (2271), Expect = 3.9e-254
Identity = 578/1051 (55.00%), Postives = 721/1051 (68.60%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSP--NPFGQPS-SSPFASQ--PVFGQT-ANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFG 60
            MFGS   NPFGQ S SSPF +Q   +FGQT  NASNNPFA KPFG+++PFG+QTG+++FG
Sbjct: 1    MFGSSNNNPFGQSSISSPFGTQTHSLFGQTNNNASNNPFATKPFGTSTPFGAQTGSSMFG 60

Query: 61   GTSTGVFGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ 120
            GTSTGVFGA Q+SSPF      G+S  AFG++   FG+SSTP+FG SS+S FGG+S FGQ
Sbjct: 61   GTSTGVFGAPQTSSPF------GASPQAFGSSTQAFGASSTPSFG-SSNSPFGGTSTFGQ 120

Query: 121  KPLFGGFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPA------ 180
            K     FG +T Q++PFGS  QQSQPAFG++ FGSS+PFGA +  AFGA+S PA      
Sbjct: 121  K----SFGLSTPQSSPFGSTTQQSQPAFGNSTFGSSTPFGASTTPAFGASSTPAFGVSNT 180

Query: 181  --FGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFG 240
              FGAT+TP FGAT+T  FG +STP FGA+STPAFG+T+TPAFGA+STP FG+SS+PAFG
Sbjct: 181  SGFGATNTPGFGATNTTGFGGSSTPGFGASSTPAFGSTNTPAFGASSTPLFGSSSSPAFG 240

Query: 241  STSTPAFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSF 300
            ++  PAFGS+GNAFG+     F SGG        AFG SSTP FGAS+  AFGASS+PSF
Sbjct: 241  ASPAPAFGSSGNAFGN---NTFSSGG--------AFGSSSTPTFGASNTSAFGASSSPSF 300

Query: 301  SFGSTSAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSR 360
            +FGS+ AFGQSTSAFGSS+FGS  S  G+  SPFGAQ   A  ++  GQ+  GGQ+GGSR
Sbjct: 301  NFGSSPAFGQSTSAFGSSSFGSTQSSLGSTPSPFGAQGAQASTSTFGGQSTIGGQQGGSR 360

Query: 361  AAAYAPTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST 420
               YAPTT  D  SG+   + +L+SISAMP +K K+ EELRWEDYQ GDKGG    GQS 
Sbjct: 361  VIPYAPTT--DTASGTESKSERLQSISAMPAHKGKNMEELRWEDYQRGDKGGQRSTGQSP 420

Query: 421  GGVGFGVSNAQPNLLATS-TFSQP---SSNPFS--TATSSNPFAPKPSGFGT--FGPSTT 480
             G GFGV+N+QP++ +TS  FSQ     +NPFS  T TS+  F+P  S   T  FG  TT
Sbjct: 421  EGAGFGVTNSQPSIFSTSPAFSQTPVNPTNPFSQTTPTSNTNFSPSFSQPTTPSFGQPTT 480

Query: 481  FSFNSSAFATSSSSNLFPSTTSASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTA 540
             SF S+    S+++++F S++S +T++  P  SS FGS+    S+   ++G      S+ 
Sbjct: 481  PSFRST---VSNTTSVFGSSSSLTTNTSQPLGSSIFGSTPAHGSTPGFSIGGFNNSQSSP 540

Query: 541  SPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSLF-QSTTPSIGQTGSAFG----APFTQSSLFNQPSSGVG 600
              G+N +F  +   + +Q+S LF Q+TTP++GQ+ S FG        QS+ F+ PS+G G
Sbjct: 541  LFGSNPSFAQNTTPAFSQTSPLFGQNTTPALGQSSSVFGQNTNPALVQSNTFSTPSTGFG 600

Query: 601  GNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQAQAPTSF--FSNLSQTQPIGSSGFAGT 660
                SSS L TS +P  FGQ + + + PFQ AQ   P     F+N  QTQ   ++  AG 
Sbjct: 601  NTFSSSSSLTTSISP--FGQITPAVT-PFQSAQPTQPLGAFGFNNFGQTQIANTTDIAGA 660

Query: 661  SSIFGQSNFGQSP-ITQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVV 720
               F Q NF Q P +  S V+QP   TNPFGTLPA+PQ+SI++ G +PSIQYGISSMPVV
Sbjct: 661  MGTFSQGNFKQQPALGNSAVMQPTPVTNPFGTLPALPQISIAQGGNSPSIQYGISSMPVV 720

Query: 721  DKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIP 780
            DK APVR+S  LT RHL  RR+RLPTRKY P +DG P+VPFFS++EE  STPKADA FIP
Sbjct: 721  DKPAPVRVSPLLTSRHLLQRRVRLPTRKYRPSDDG-PKVPFFSDEEENSSTPKADAFFIP 780

Query: 781  RENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDTAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVEN 840
            RENPRAL IRP ++  S    +  +PL++   R NG          V N  N +    +N
Sbjct: 781  RENPRALFIRPVERVKSEHPKDSPTPLQENGKRSNG----------VTNGANHE--TKDN 840

Query: 841  GSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKL 900
            G+  +    P KVNQK NG HE+H   K       G H +         GADIE+LMPKL
Sbjct: 841  GAIRE--APPVKVNQKQNGTHENHGGDKN------GSHSS-------PSGADIESLMPKL 900

Query: 901  RHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQF 960
             H++Y+TEP+IQELAAKER E G+C+ VKDFVVGRHGYGSIKF GETDV RLDLE +VQF
Sbjct: 901  HHSEYFTEPRIQELAAKERVEQGYCKRVKDFVVGRHGYGSIKFLGETDVCRLDLEMVVQF 960

Query: 961  NNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKT 1020
             NREV VY+D+SKKPP GQGLNKPA VT+LNIKC DKKTG Q  EG + +KYKE+L++K 
Sbjct: 961  KNREVNVYMDESKKPPVGQGLNKPAVVTLLNIKCMDKKTGTQVMEGERLDKYKEMLKRKA 993

Query: 1021 EAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKMED 1022
              QGA+FVS+DPV GEW F+VEHFS YK+ D
Sbjct: 1021 GEQGAQFVSYDPVNGEWTFKVEHFSSYKLGD 993

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VCH5 (Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Nup98-96 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 154.8 bits (390), Expect = 5.1e-36
Identity = 299/1078 (27.74%), Postives = 445/1078 (41.28%), Query Frame = 0 

Query: 146  VFGSSSP-FGA-PSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGA 205
            +FG + P FGA P+ ++FG  S    G T+T  FG +   AFG  + PAFG TST A   
Sbjct: 1    MFGGAKPSFGATPAATSFGGFS----GTTTTTPFGQS---AFGKPAAPAFGNTSTFAAQP 60

Query: 206  TSTPAFGATSTPA------FGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGAS 265
                 FGA +TPA      FGA+++  FGST+T    +   AFG+ S P   +   FG++
Sbjct: 61   AQQSLFGAAATPAQPAGGLFGANTSTGFGSTAT----AQPTAFGAFSQPQ-QTSNIFGST 120

Query: 266  STPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSA-------FGQSTSAFGSSNFGSNT 325
             T A    ST  FG S+ PAFGA+     +FG T+A       FGQ  +A  ++ FG   
Sbjct: 121  QTAA----STSLFGQSTLPAFGAAKPTMTAFGQTAAAQPTGSLFGQPAAATSTTGFGGFG 180

Query: 326  SPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPGSGSTQAAG--- 385
            +     ++ FG+ + SAF        G  G   G+  A Y PT   D    S QA     
Sbjct: 181  TSAPTTTNVFGSGTASAFAQPQATAVGASGVNTGTAVAKYQPTIGTDTLMKSGQANSVNT 240

Query: 386  KLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGV-------------- 445
            K   I+AM  ++ KS EELR EDY  G KG    AG + G  GFG               
Sbjct: 241  KQHCITAMKEFEGKSLEELRLEDYMCGRKGP--QAGNAPGAFGFGAQVTQPAQPASGGLF 300

Query: 446  -SNAQP-------------NLLATSTFSQ--PSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGT----- 505
             S AQP             ++  T+ F Q   ++N F  AT  N F  KP G  T     
Sbjct: 301  GSTAQPSTGLFGQTVTENKSMFGTTAFGQQPATNNAFGAATQQNNFLQKPFGATTTTPFA 360

Query: 506  ---------FGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTSASTS-SFLPTTSSQFGSSSLFNS 565
                     FG    F    S F  + +++  P+    +T      TT+     S+LF +
Sbjct: 361  APAADASNPFGAKPAFGQGGSLFGQAPATSAAPAFGQTNTGFGGFGTTAGATQQSTLFGA 420

Query: 566  S-----NTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLN-----FSNTQSSSLFQSTTPSIGQTG 625
            +     N  A G   A +S A+ G     P++       F N  ++S      P+ G T 
Sbjct: 421  TPAADPNKSAFGLGTA-ASAATTGFGFGAPATSTAGGGLFGNKPATSF---AAPTFGATS 480

Query: 626  SAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQAQAPTS 685
            +A   PF+   L N  ++  GG LF+S   L      GFG   A+ + P          S
Sbjct: 481  TA-STPFSNFGL-NTSTAATGGGLFNSG--LNKPATSGFGGFGATSAAPLNFNAGNTGGS 540

Query: 686  FFSNLSQ---------TQPIGSSGFAGTSSIFG--------------------------- 745
             F N ++         T  +G +G A T  +FG                           
Sbjct: 541  LFGNTAKPGGGLFGGGTTTLGGTGAAPTGGLFGGGTTSFGGVGGSLGGGGFGMGTNNSLT 600

Query: 746  ------QSNFGQSPITQSPVVQP--ATATNPFGTLPAMPQMSIS---------KPGAAPS 805
                  Q   G    +  P+ Q   A  T+P+G  P    + +S          P A  +
Sbjct: 601  GGIMGAQPTLGIMTPSHQPIHQQILARVTSPYGDSPIFKDLKLSSEADATRATNPAAQQA 660

Query: 806  I------QYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYNPKNDG-------- 865
            +      QY IS+    +  AP+++ +  +   L+ + +     +++   +G        
Sbjct: 661  VLDLTSNQYKISTS---NNPAPMKVKALGST--LNRKSLFDGLEEFDASVEGFNLKPSAK 720

Query: 866  ----RPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPR-ALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDT 925
                +P+V   S +   PS+    A   P+  P+ A   +  + +      E   P  ++
Sbjct: 721  RLVIKPKVK--SVEGGNPSSSIGSAPNTPQSRPKGATPNKERESFSGAIPSEPLPPAGNS 780

Query: 926  AVRENGKIPEDN----SSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQ----KPNGVHE 985
                NG+  +DN    S L  NNL+    + ++ G   + S H + +N+    KP   + 
Sbjct: 781  PGATNGRESQDNGRRESWLHPNNLEKVRQHNIQTG-MDQGSPHNSTLNELVPRKPLDTYR 840

Query: 986  DHSA-----------PKED------LYRTFGGHRAGEAAI-----------VYEHGADIE 1028
              S            P ED         TF   +A E+ +             +    IE
Sbjct: 841  PSSTVRLSVSTIPENPFEDQSSTIARRETFTSQQANESVLSNRSNEAEDSAANQSRLAIE 900

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P52948 (Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP98 PE=1 SV=4)

HSP 1 Score: 138.7 bits (348), Expect = 3.8e-31
Identity = 290/949 (30.56%), Postives = 409/949 (43.10%), Query Frame = 0 

Query: 182  TPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAFG 241
            TP  G T    FG TST  FG  +   FG TS  AFG   T AFGS++     +TG  FG
Sbjct: 8    TPFGGGTG--GFGTTST--FGQNT--GFGTTSGGAFG---TSAFGSSN-----NTGGLFG 67

Query: 242  SLSTPVFGSGGGFGAS--STPAFGVSSTPAFGASSAPA---FGASSTPSFSFGS-TSAFG 301
            +  T     GG FG S  S PA   S+   FG S+  A   FG +ST +  F S  +AF 
Sbjct: 68   NSQTK---PGGLFGTSSFSQPATSTSTGFGFGTSTGTANTLFGTASTGTSLFSSQNNAFA 127

Query: 302  QSTSAFGSSNFGSNTSPFG------AQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAA 361
            Q+    G  NFG++TS  G        S+PFG+ S S FG S F  A  G          
Sbjct: 128  QNKPT-GFGNFGTSTSSGGLFGTTNTTSNPFGSTSGSLFGPSSFTAAPTG------TTIK 187

Query: 362  YAPTTEPD---PGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST 421
            + P T  D       ST  + K + I+AM  Y+ KS EELR EDYQ   KG     G  T
Sbjct: 188  FNPPTGTDTMVKAGVSTNISTKHQCITAMKEYESKSLEELRLEDYQANRKGPQNQVGAGT 247

Query: 422  GGVGFGVSNAQPNLLATSTFSQPSSNP-FSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSA 481
                FG S A  +  AT  FS  ++N  F+   +   F    +GFGT  P   F    + 
Sbjct: 248  TTGLFGSSPATSS--ATGLFSSSTTNSGFAYGQNKTAFGTSTTGFGT-NPGGLFG-QQNQ 307

Query: 482  FATSSSSNLFPSTTSASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLT 541
              TS  S  F   T+   + F       FG++S     +T  +G    F  T +      
Sbjct: 308  QTTSLFSKPFGQATTTQNTGF------SFGNTSTIGQPSTNTMG---LFGVTQASQPGGL 367

Query: 542  FPSSLNFSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQ-----------SSLFNQPSSG-VG 601
            F ++   +NT + + F + T   GQT + FGA  +            SS  + PS G   
Sbjct: 368  FGTA---TNTSTGTAFGTGTGLFGQTNTGFGAVGSTLFGNNKLTTFGSSTTSAPSFGTTS 427

Query: 602  GNLFSSSPLL-----TSSNPMGFGQSSASFSM-PFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSG 661
            G LF + P L     T+++  GFG +++  S+   +PA     T   +        G++ 
Sbjct: 428  GGLFGNKPTLTLGTNTNTSNFGFGTNTSGNSIFGSKPAPGTLGTGLGAG------FGTAL 487

Query: 662  FAGTSSIFG--QSNFGQSPIT---QSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPS--- 721
             AG +S+FG  Q   G    T    +P     TAT  FG  P  P ++++ P A+ +   
Sbjct: 488  GAGQASLFGNNQPKIGGPLGTGAFGAPGFNTTTATLGFGA-PQAP-VALTDPNASAAQQA 547

Query: 722  -IQYGISSM-------------PVVD---------KAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPT 781
             +Q  I+S+             P+ D            P    +  TP H  ++    P 
Sbjct: 548  VLQQHINSLTYSPFGDSPLFRNPMSDPKKKEERLKPTNPAAQKALTTPTH--YKLTPRPA 607

Query: 782  RKYNPK---NDGRPRVPFFSE-DEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQW-----PS 841
             +  PK     G  +   F   D++ PS   A+  F+P+++ + LV++  +        +
Sbjct: 608  TRVRPKALQTTGTAKSHLFDGLDDDEPSL--ANGAFMPKKSIKKLVLKNLNNSNLFSPVN 667

Query: 842  RASLEKASPLK-----------DTAVRENGKIPEDNSSL-----------PVNNLKNTDG 901
            R S   ASP +              V EN +   D  SL           P+     + G
Sbjct: 668  RDSENLASPSEYPENGERFSFLSKPVDENHQQDGDEDSLVSHFYTNPIAKPIPQTPESAG 727

Query: 902  NAVENGSTSKDS-VHPNKVNQKPNGVH---EDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGA 961
            N   N ++  D+ V  N      NG+    E+ S   E L          E    + H A
Sbjct: 728  NKHSNSNSVDDTIVALNMRAALRNGLEGSSEETSFHDESLQ---DDREEIENNSYHMHPA 787

Query: 962  DIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRR 1021
             I      L    YYT P + +L AK   E G C  V DF +GR GYGSI F G+ ++  
Sbjct: 788  GI-----ILTKVGYYTIPSMDDL-AKITNEKGEC-IVSDFTIGRKGYGSIYFEGDVNLTN 847

Query: 1022 LDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKA-- 1028
            L+L+ IV    +EV VYLDD++KPP G+GLN+ AEVT+  +   D KT     + P    
Sbjct: 848  LNLDDIVHIRRKEVVVYLDDNQKPPVGEGLNRKAEVTLDGVWPTD-KTSRCLIKSPDRLA 893

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6PFD9 (Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nup98 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 6.5e-31
Identity = 284/969 (29.31%), Postives = 396/969 (40.87%), Query Frame = 0 

Query: 189  STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAFGSLSTPVF 248
            ST  FG TST  FG  +   FG TS  AFG   T AFGS++     +TG  FG+  T   
Sbjct: 13   STGGFGTTST--FGQNT--GFGTTSGGAFG---TSAFGSSN-----NTGGLFGNSQTK-- 72

Query: 249  GSGGGFGAS--STPAFGVSSTPAFGASSAPA---FGASSTPSFSFGS-TSAFGQSTSAFG 308
              GG FG S  S PA   S+   FG S+  +   FG +ST +  F S  +AF Q+    G
Sbjct: 73   -PGGLFGTSSFSQPATSTSTGFGFGTSTGTSNSLFGTASTGTSLFSSQNNAFAQNKPT-G 132

Query: 309  SSNFGSNTSPFG------AQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEP 368
              NFG++TS  G        S+PFG+ S S FG S F  A  G          + P T  
Sbjct: 133  FGNFGTSTSSGGLFGTTNTTSNPFGSTSGSLFGPSSFTAAPTG------TTIKFNPPTGT 192

Query: 369  D---PGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGV 428
            D       ST  + K + I+AM  Y+ KS EELR EDYQ   KG   P  Q  GG   G+
Sbjct: 193  DTMVKAGVSTNISTKHQCITAMKEYESKSLEELRLEDYQANRKG---PQNQVGGGTTAGL 252

Query: 429  SNAQP-NLLATSTFSQPSSN-PFSTATSSNPFAPKPSGFGT------------------- 488
              + P    AT  FS  ++N  FS   +   F    +GFGT                   
Sbjct: 253  FGSSPATSSATGLFSSSTTNSAFSYGQNKTAFGTSTTGFGTNPGGLFGQQNQQTTSLFSK 312

Query: 489  -FG-----PSTTFSFNSSAFATSSSSN---------------LFPSTTSASTSSFLPTTS 548
             FG     P+T FSF +++     S+N               LF + T+ ST +   T +
Sbjct: 313  PFGQATTTPNTGFSFGNTSTLGQPSTNTMGLFGVTQASQPGGLFGTATNTSTGTAFGTGT 372

Query: 549  SQFG---------SSSLFNSSNTQALG----SQLAFSSTA----------SPGTNLTFPS 608
              FG          S+LF ++     G    S  +F +T+          + GTN T  S
Sbjct: 373  GLFGQPNTGFGAVGSTLFGNNKLTTFGTSTTSAPSFGTTSGGLFGNKPTLTLGTN-TNTS 432

Query: 609  SLNFSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFGAPF------TQSSLF--NQPSSG--VGGNLFS 668
            +  F    S S    + P+ G  G+  G  F       Q+SLF  NQP  G  +G   F 
Sbjct: 433  NFGFGTNNSGSSIFGSKPAAGTLGTGLGTGFGTALGAGQASLFGNNQPKIGGPLGTGAFG 492

Query: 669  SSPLLTSSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQS 728
            +    TS+  +GFG   A  ++    A A        +L+                   S
Sbjct: 493  APGFNTSTAILGFGAPQAPVALTDPNASAAQQAVLQQHLNS---------------LTYS 552

Query: 729  NFGQSPITQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRI 788
             FG SP+ ++P+  P                   KP           + P   KA     
Sbjct: 553  PFGDSPLFRNPMSDPKKKEERL------------KP-----------TNPAAQKALTTPT 612

Query: 789  SSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYNPK---NDGRPRVPFFSE-DEETPSTPKADALFIPRENP 848
               LTPR         P  +  PK     G  +   F   D++ PS   A+  F+P+++ 
Sbjct: 613  HYKLTPR---------PATRVRPKALQTTGTAKSHLFDGLDDDEPSL--ANGAFMPKKSI 672

Query: 849  RALVIR-------------------PTDQWPSRASLEKASPLKDTAVRENGKIPEDNS-- 908
            + LV++                      ++P     E+ S L       N +  ED+S  
Sbjct: 673  KKLVLKNLNNSNLFSPVNHDSEDLASPSEYPENG--ERFSFLSKPVDENNQQDGEDDSLV 732

Query: 909  --------SLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDS-VHPNKVNQKPNGVH---EDHSAPKEDL 968
                    + P+     + GN   + S  +D+ V  N      NG+    E+ S   E L
Sbjct: 733  SRFYTNPIAKPIPQTPESVGNKNNSSSNVEDTIVALNMRAALRNGLEGSSEETSFHDESL 792

Query: 969  YRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKDF 1028
                      E    + H A I      L    YYT P + +L AK   E G C  V DF
Sbjct: 793  Q---DDREEIENNAYHIHPAGI-----VLTKVGYYTIPSMDDL-AKITNEKGEC-IVSDF 852

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. NCBI nr
Match: XP_022157427.1 (nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X2 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 1911 bits (4950), Expect = 0.0
Identity = 1027/1027 (100.00%), Postives = 1027/1027 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60
            MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV
Sbjct: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60

Query: 61   FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGG 120
            FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGG
Sbjct: 61   FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGG 120

Query: 121  FGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGAT 180
            FGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGAT
Sbjct: 121  FGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGAT 180

Query: 181  STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAF 240
            STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAF
Sbjct: 181  STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAF 240

Query: 241  GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTSA 300
            GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTSA
Sbjct: 241  GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTSA 300

Query: 301  FGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPGS 360
            FGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPGS
Sbjct: 301  FGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPGS 360

Query: 361  GSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPNL 420
            GSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPNL
Sbjct: 361  GSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPNL 420

Query: 421  LATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTS 480
            LATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTS
Sbjct: 421  LATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTS 480

Query: 481  ASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSL 540
            ASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSL
Sbjct: 481  ASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSL 540

Query: 541  FQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSM 600
            FQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSM
Sbjct: 541  FQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSM 600

Query: 601  PFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNPF 660
            PFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNPF
Sbjct: 601  PFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNPF 660

Query: 661  GTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYN 720
            GTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYN
Sbjct: 661  GTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYN 720

Query: 721  PKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDT 780
            PKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDT
Sbjct: 721  PKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDT 780

Query: 781  AVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKED 840
            AVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKED
Sbjct: 781  AVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKED 840

Query: 841  LYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKD 900
            LYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKD
Sbjct: 841  LYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKD 900

Query: 901  FVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTIL 960
            FVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTIL
Sbjct: 901  FVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTIL 960

Query: 961  NIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKME 1020
            NIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKME
Sbjct: 961  NIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKME 1020

Query: 1021 DCEEVEE 1027
            DCEEVEE
Sbjct: 1021 DCEEVEE 1027

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. NCBI nr
Match: XP_022157417.1 (nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 [Momordica charantia] >XP_022157422.1 nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 1906 bits (4938), Expect = 0.0
Identity = 1027/1028 (99.90%), Postives = 1027/1028 (99.90%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60
            MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV
Sbjct: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60

Query: 61   FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFG-GSSIFGQKPLFG 120
            FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFG GSSIFGQKPLFG
Sbjct: 61   FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGAGSSIFGQKPLFG 120

Query: 121  GFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGA 180
            GFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGA
Sbjct: 121  GFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGA 180

Query: 181  TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNA 240
            TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNA
Sbjct: 181  TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNA 240

Query: 241  FGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTS 300
            FGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTS
Sbjct: 241  FGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTS 300

Query: 301  AFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPG 360
            AFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPG
Sbjct: 301  AFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPG 360

Query: 361  SGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPN 420
            SGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPN
Sbjct: 361  SGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPN 420

Query: 421  LLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTT 480
            LLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTT
Sbjct: 421  LLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTT 480

Query: 481  SASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSS 540
            SASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSS
Sbjct: 481  SASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSS 540

Query: 541  LFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFS 600
            LFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFS
Sbjct: 541  LFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFS 600

Query: 601  MPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNP 660
            MPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNP
Sbjct: 601  MPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNP 660

Query: 661  FGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKY 720
            FGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKY
Sbjct: 661  FGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKY 720

Query: 721  NPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKD 780
            NPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKD
Sbjct: 721  NPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKD 780

Query: 781  TAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKE 840
            TAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKE
Sbjct: 781  TAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKE 840

Query: 841  DLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVK 900
            DLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVK
Sbjct: 841  DLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVK 900

Query: 901  DFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTI 960
            DFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTI
Sbjct: 901  DFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTI 960

Query: 961  LNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKM 1020
            LNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKM
Sbjct: 961  LNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKM 1020

Query: 1021 EDCEEVEE 1027
            EDCEEVEE
Sbjct: 1021 EDCEEVEE 1028

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. NCBI nr
Match: KAA0043047.1 (nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 1704 bits (4414), Expect = 0.0
Identity = 927/1034 (89.65%), Postives = 967/1034 (93.52%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60
            MFGSPNPFGQPS+SPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV
Sbjct: 1    MFGSPNPFGQPSTSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60

Query: 61   FGAAQSSSPF-SSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFG 120
            FGAAQSSSPF S+TTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFG
Sbjct: 61   FGAAQSSSPFPSTTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFG 120

Query: 121  GFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGA 180
            GFGST  QTNPFGS NQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATS PAFGATSTPAFGA
Sbjct: 121  GFGSTPAQTNPFGSTNQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSTPAFGATSTPAFGA 180

Query: 181  TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFG--------STSTP 240
            TSTPAFGA STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGA+STPAFG        STSTP
Sbjct: 181  TSTPAFGAASTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGATSSPAFGSTSTP 240

Query: 241  AFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGST 300
            AFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFG SSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGST
Sbjct: 241  AFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGST 300

Query: 301  SAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYA 360
             AFGQSTS FGSS FG+NTSPFGAQSSPFGAQSTS FGTSGFGQAGFGGQRGGSR   YA
Sbjct: 301  PAFGQSTSGFGSSTFGTNTSPFGAQSSPFGAQSTSTFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVTPYA 360

Query: 361  PTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGF 420
            PT EPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQS  GVGF
Sbjct: 361  PTPEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSASGVGF 420

Query: 421  GVSNAQPNLLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSS 480
            GVS  QPN +A+STFSQ S NPFST+T +NPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFA S+ 
Sbjct: 421  GVSGGQPNPVASSTFSQSSPNPFSTSTQTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFAPSTP 480

Query: 481  SNLFPSTTSASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLN 540
            SN F STT+ASTS+FL +T+SQFGSSSLF+SSNTQ+L SQ AFSST SPGTNLTFPSSLN
Sbjct: 481  SNPFASTTAASTSAFLSSTTSQFGSSSLFSSSNTQSLASQSAFSSTTSPGTNLTFPSSLN 540

Query: 541  FSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSP-LLTSSNPMG 600
            F NTQSSSLFQSTTP+IGQTGSAFGAPF+QSSLF+QPSSGVGGNLFSSSP LLTSSNPMG
Sbjct: 541  FGNTQSSSLFQSTTPAIGQTGSAFGAPFSQSSLFSQPSSGVGGNLFSSSPSLLTSSNPMG 600

Query: 601  FGQSSASFSMPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPV 660
            FGQ+SA FSMPFQPAQ QAPTSFFSNL Q QPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQ+P 
Sbjct: 601  FGQTSAPFSMPFQPAQQQAPTSFFSNLGQAQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQTPA 660

Query: 661  VQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHR 720
            VQPA ATNPFGTLPAMPQMSIS+PGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHR
Sbjct: 661  VQPAPATNPFGTLPAMPQMSISRPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHR 720

Query: 721  RMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRAS 780
            RMRLP RKYNPKNDG PRVPFFS+DEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPS+A+
Sbjct: 721  RMRLPVRKYNPKNDGSPRVPFFSDDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSKAN 780

Query: 781  LEKASPLKDTAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGV 840
            L+K+ P KDT+VRENGKI E  SS  VNNLK+T+GN VENG  +K+S+H NKVNQKPNGV
Sbjct: 781  LDKSLPSKDTSVRENGKIAERTSSA-VNNLKDTNGNVVENG-INKESIHLNKVNQKPNGV 840

Query: 841  HEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERA 900
            HEDHSAPKE+LYRTF GHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRH+DYYTEPKIQELAAKERA
Sbjct: 841  HEDHSAPKEELYRTFAGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHSDYYTEPKIQELAAKERA 900

Query: 901  EPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQG 960
            EPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREV VYLD+SKKPP GQG
Sbjct: 901  EPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVIVYLDESKKPPCGQG 960

Query: 961  LNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFR 1020
            LNKPAEVTILNIKC DK+TGHQYTEGPK EKYKELLRKKTEAQGAEF+S+DPVKGEWKF+
Sbjct: 961  LNKPAEVTILNIKCVDKQTGHQYTEGPKVEKYKELLRKKTEAQGAEFISYDPVKGEWKFK 1020

Query: 1021 VEHFSKYKMEDCEE 1024
            VEHFS+Y MED EE
Sbjct: 1021 VEHFSRYNMEDNEE 1032

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. NCBI nr
Match: KAG7035533.1 (Nuclear pore complex protein NUP98A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 1701 bits (4406), Expect = 0.0
Identity = 933/1043 (89.45%), Postives = 969/1043 (92.91%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60
            MFGSPNPFGQPSSSPF SQPVFGQTANAS+NPFAPKPFGSTSPFGSQ GN+VFGGT+TGV
Sbjct: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFGSQPVFGQTANASSNPFAPKPFGSTSPFGSQAGNSVFGGTATGV 60

Query: 61   FGAAQSSSPFSS--TTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLF 120
            FGAAQSSSPF+S  TTFGGSSSPAFGA   TFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLF
Sbjct: 61   FGAAQSSSPFASSTTTFGGSSSPAFGAP--TFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLF 120

Query: 121  GGFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGS-----------NVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAP 180
            GGFGST  QTNPFGS NQQSQPAFGS           NVFGSS PFGAPSQ AFGATS+P
Sbjct: 121  GGFGSTPAQTNPFGSTNQQSQPAFGSTSQQSQPAFGSNVFGSS-PFGAPSQPAFGATSSP 180

Query: 181  AFGATSTPAFGATS-TPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFG 240
            AFG TSTPAFGATS TPAFG TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGA STPAFGA+STPAFG
Sbjct: 181  AFGTTSTPAFGATSSTPAFGTTSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGATSTPAFG 240

Query: 241  STSTPAFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSF 300
            STSTPAFGSTG++FGSLSTPVFGSGGGFGASSTP FGVSSTPAFGASS PAFGASS+PSF
Sbjct: 241  STSTPAFGSTGSSFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPTFGVSSTPAFGASSTPAFGASSSPSF 300

Query: 301  SFGSTSAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSR 360
            SFGST AFGQSTSAFGS+ FG+N SPFGAQSSPFGAQST+ FGTSGFGQAGFGGQRGGSR
Sbjct: 301  SFGSTPAFGQSTSAFGSNTFGTNASPFGAQSSPFGAQSTTTFGTSGFGQAGFGGQRGGSR 360

Query: 361  AAAYAPTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST 420
               YAPTTEPD GSGSTQAAGKLESISAMP YKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST
Sbjct: 361  VTPYAPTTEPDSGSGSTQAAGKLESISAMPAYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST 420

Query: 421  GGVGFGVSNAQPNLLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAF 480
            GGVGFGVS AQPNLLA+STFSQ SSNPFSTA S+NPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAF
Sbjct: 421  GGVGFGVSTAQPNLLASSTFSQSSSNPFSTAASTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAF 480

Query: 481  ATSSSSNLFPSTTSASTSS-FLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLT 540
            A SSSSN F STT+ASTSS FL +T+SQFGSSSLF SSN Q L SQ AFSST SPGTNLT
Sbjct: 481  APSSSSNPFASTTAASTSSSFLSSTTSQFGSSSLFGSSNAQPLASQPAFSSTTSPGTNLT 540

Query: 541  FPSSLNFSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSP-LLT 600
            FPSSLNFSNTQSSSLFQST PSIGQTGSAFGAPF+Q SLF+QPSSGVGGNLFSSSP LLT
Sbjct: 541  FPSSLNFSNTQSSSLFQSTAPSIGQTGSAFGAPFSQPSLFSQPSSGVGGNLFSSSPSLLT 600

Query: 601  SSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSP 660
            SSNPMGFGQSSASFSMPFQ AQAQAPTSFFSNL QTQPIGSS FAGTSSIFGQSNFGQSP
Sbjct: 601  SSNPMGFGQSSASFSMPFQQAQAQAPTSFFSNLGQTQPIGSSSFAGTSSIFGQSNFGQSP 660

Query: 661  ITQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTP 720
            ITQ+P+VQPA ATNPFGTLPAMPQMSIS+PGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTP
Sbjct: 661  ITQNPIVQPAPATNPFGTLPAMPQMSISRPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTP 720

Query: 721  RHLSHRRMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQ 780
            RHLSHRRMRLP RKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALF+PRENPRALVIRPTDQ
Sbjct: 721  RHLSHRRMRLPARKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFVPRENPRALVIRPTDQ 780

Query: 781  WPSRASLEKASPLKDTAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVN 840
            WPSRAS E+  P KDT+VRENGKI E  SS+ VNNLK+T+GN VENG TSKD++HPNKVN
Sbjct: 781  WPSRASSERVLPSKDTSVRENGKIAEGTSSMAVNNLKDTNGNVVENG-TSKDNIHPNKVN 840

Query: 841  QKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQEL 900
            QKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRH+DYYTEPK+QEL
Sbjct: 841  QKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHSDYYTEPKMQEL 900

Query: 901  AAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKK 960
            AAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHG+GSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREV VYLD+SKK
Sbjct: 901  AAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGFGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVIVYLDESKK 960

Query: 961  PPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVK 1020
            PPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPK EKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVK
Sbjct: 961  PPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKVEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVK 1020

Query: 1021 GEWKFRVEHFSKYKMEDCEEVEE 1027
            GEWKFRVEHFS+Y MED EEVE+
Sbjct: 1021 GEWKFRVEHFSRYNMEDNEEVED 1039

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. NCBI nr
Match: XP_022958352.1 (nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 1699 bits (4400), Expect = 0.0
Identity = 933/1043 (89.45%), Postives = 968/1043 (92.81%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60
            MFGSPNPFGQPSSSPF SQPVFGQTANAS+NPFAPKPFGSTSPFGSQ GN+VFGGT+TGV
Sbjct: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFGSQPVFGQTANASSNPFAPKPFGSTSPFGSQAGNSVFGGTATGV 60

Query: 61   FGAAQSSSPFSS--TTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLF 120
            FGAAQSSSPF+S  TTFGGSSSPAFGA   TFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLF
Sbjct: 61   FGAAQSSSPFASSTTTFGGSSSPAFGAP--TFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLF 120

Query: 121  GGFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGS-----------NVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAP 180
            GGFGST  QTNPFGS NQQSQPAFGS           NVFGSS PFGAPSQ AFGAT++P
Sbjct: 121  GGFGSTPAQTNPFGSTNQQSQPAFGSTSQQSQPAFGSNVFGSS-PFGAPSQPAFGATNSP 180

Query: 181  AFGATSTPAFGATS-TPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFG 240
            AFG TSTPAFGATS TPAFG TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGA S PAFGA+STPAFG
Sbjct: 181  AFGTTSTPAFGATSSTPAFGTTSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASAPAFGATSTPAFG 240

Query: 241  STSTPAFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSF 300
            STSTPAFGSTG++FGSLSTPVFGSGGGFGASSTP FGVSSTPAFGASS PAFGASS+PSF
Sbjct: 241  STSTPAFGSTGSSFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPTFGVSSTPAFGASSTPAFGASSSPSF 300

Query: 301  SFGSTSAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSR 360
            SFGST AFGQSTSAFGSS FG+N SPFGAQSSPFGAQST+ FGTSGFGQAGFGGQRGGSR
Sbjct: 301  SFGSTPAFGQSTSAFGSSTFGTNASPFGAQSSPFGAQSTTTFGTSGFGQAGFGGQRGGSR 360

Query: 361  AAAYAPTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST 420
               YAPTTEPD GSGSTQAAGKLESISAMP YKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST
Sbjct: 361  VTPYAPTTEPDSGSGSTQAAGKLESISAMPAYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST 420

Query: 421  GGVGFGVSNAQPNLLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAF 480
            GGVGFGVS AQPNLLA+STFSQ SSNPFSTA S+NPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAF
Sbjct: 421  GGVGFGVSTAQPNLLASSTFSQSSSNPFSTAASTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAF 480

Query: 481  ATSSSSNLFPSTTSASTSS-FLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLT 540
            A SSSSN F STT+ASTSS FL +T+SQFGSSSLF SSN Q L SQ AFSST SPGTNLT
Sbjct: 481  APSSSSNPFASTTAASTSSSFLSSTTSQFGSSSLFGSSNAQPLASQPAFSSTTSPGTNLT 540

Query: 541  FPSSLNFSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSP-LLT 600
            FPSSLNFSNTQSSSLFQST PSIGQTGSAFGAPF+Q SLF+QPSSGVGGNLFSSSP LLT
Sbjct: 541  FPSSLNFSNTQSSSLFQSTAPSIGQTGSAFGAPFSQPSLFSQPSSGVGGNLFSSSPSLLT 600

Query: 601  SSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSP 660
            SSNPMGFGQSSASFSMPFQ AQAQAPTSFFSNL QTQPIGSS FAGTSSIFGQSNFGQSP
Sbjct: 601  SSNPMGFGQSSASFSMPFQQAQAQAPTSFFSNLVQTQPIGSSSFAGTSSIFGQSNFGQSP 660

Query: 661  ITQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTP 720
            ITQ+P+VQPA ATNPFGTLPAMPQMSIS+PGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTP
Sbjct: 661  ITQNPIVQPAPATNPFGTLPAMPQMSISRPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTP 720

Query: 721  RHLSHRRMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQ 780
            RHLSHRRMRLP RKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQ
Sbjct: 721  RHLSHRRMRLPARKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQ 780

Query: 781  WPSRASLEKASPLKDTAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVN 840
            WPSRAS E+  P KDT+VRENGKI E  SS+ VNNLK+T+GN VENG TSKD++HPNKVN
Sbjct: 781  WPSRASSERVLPSKDTSVRENGKIAEGTSSMAVNNLKDTNGNVVENG-TSKDNIHPNKVN 840

Query: 841  QKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQEL 900
            QKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRH+DYYTEPK+QEL
Sbjct: 841  QKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHSDYYTEPKMQEL 900

Query: 901  AAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKK 960
            AAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHG+GSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREV VYLD+SKK
Sbjct: 901  AAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGFGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVIVYLDESKK 960

Query: 961  PPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVK 1020
            PPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPK EKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVK
Sbjct: 961  PPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKVEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVK 1020

Query: 1021 GEWKFRVEHFSKYKMEDCEEVEE 1027
            GEWKFRVEHFS+Y MED EEVE+
Sbjct: 1021 GEWKFRVEHFSRYNMEDNEEVED 1039

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DUF9 (nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024117 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1911 bits (4950), Expect = 0.0
Identity = 1027/1027 (100.00%), Postives = 1027/1027 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60
            MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV
Sbjct: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60

Query: 61   FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGG 120
            FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGG
Sbjct: 61   FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGG 120

Query: 121  FGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGAT 180
            FGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGAT
Sbjct: 121  FGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGAT 180

Query: 181  STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAF 240
            STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAF
Sbjct: 181  STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAF 240

Query: 241  GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTSA 300
            GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTSA
Sbjct: 241  GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTSA 300

Query: 301  FGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPGS 360
            FGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPGS
Sbjct: 301  FGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPGS 360

Query: 361  GSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPNL 420
            GSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPNL
Sbjct: 361  GSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPNL 420

Query: 421  LATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTS 480
            LATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTS
Sbjct: 421  LATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTS 480

Query: 481  ASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSL 540
            ASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSL
Sbjct: 481  ASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSL 540

Query: 541  FQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSM 600
            FQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSM
Sbjct: 541  FQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSM 600

Query: 601  PFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNPF 660
            PFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNPF
Sbjct: 601  PFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNPF 660

Query: 661  GTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYN 720
            GTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYN
Sbjct: 661  GTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYN 720

Query: 721  PKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDT 780
            PKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDT
Sbjct: 721  PKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDT 780

Query: 781  AVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKED 840
            AVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKED
Sbjct: 781  AVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKED 840

Query: 841  LYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKD 900
            LYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKD
Sbjct: 841  LYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKD 900

Query: 901  FVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTIL 960
            FVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTIL
Sbjct: 901  FVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTIL 960

Query: 961  NIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKME 1020
            NIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKME
Sbjct: 961  NIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKME 1020

Query: 1021 DCEEVEE 1027
            DCEEVEE
Sbjct: 1021 DCEEVEE 1027

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DUF5 (nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024117 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1906 bits (4938), Expect = 0.0
Identity = 1027/1028 (99.90%), Postives = 1027/1028 (99.90%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60
            MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV
Sbjct: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60

Query: 61   FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFG-GSSIFGQKPLFG 120
            FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFG GSSIFGQKPLFG
Sbjct: 61   FGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGAGSSIFGQKPLFG 120

Query: 121  GFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGA 180
            GFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGA
Sbjct: 121  GFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGA 180

Query: 181  TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNA 240
            TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNA
Sbjct: 181  TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNA 240

Query: 241  FGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTS 300
            FGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTS
Sbjct: 241  FGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTS 300

Query: 301  AFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPG 360
            AFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPG
Sbjct: 301  AFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPG 360

Query: 361  SGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPN 420
            SGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPN
Sbjct: 361  SGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPN 420

Query: 421  LLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTT 480
            LLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTT
Sbjct: 421  LLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTT 480

Query: 481  SASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSS 540
            SASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSS
Sbjct: 481  SASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSS 540

Query: 541  LFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFS 600
            LFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFS
Sbjct: 541  LFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFS 600

Query: 601  MPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNP 660
            MPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNP
Sbjct: 601  MPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNP 660

Query: 661  FGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKY 720
            FGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKY
Sbjct: 661  FGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKY 720

Query: 721  NPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKD 780
            NPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKD
Sbjct: 721  NPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKD 780

Query: 781  TAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKE 840
            TAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKE
Sbjct: 781  TAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKE 840

Query: 841  DLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVK 900
            DLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVK
Sbjct: 841  DLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVK 900

Query: 901  DFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTI 960
            DFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTI
Sbjct: 901  DFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTI 960

Query: 961  LNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKM 1020
            LNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKM
Sbjct: 961  LNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKM 1020

Query: 1021 EDCEEVEE 1027
            EDCEEVEE
Sbjct: 1021 EDCEEVEE 1028

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TMM6 (Nuclear pore complex protein NUP98A-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold75G001300 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1704 bits (4414), Expect = 0.0
Identity = 927/1034 (89.65%), Postives = 967/1034 (93.52%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60
            MFGSPNPFGQPS+SPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV
Sbjct: 1    MFGSPNPFGQPSTSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60

Query: 61   FGAAQSSSPF-SSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFG 120
            FGAAQSSSPF S+TTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFG
Sbjct: 61   FGAAQSSSPFPSTTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFG 120

Query: 121  GFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGA 180
            GFGST  QTNPFGS NQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATS PAFGATSTPAFGA
Sbjct: 121  GFGSTPAQTNPFGSTNQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSTPAFGATSTPAFGA 180

Query: 181  TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFG--------STSTP 240
            TSTPAFGA STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGA+STPAFG        STSTP
Sbjct: 181  TSTPAFGAASTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGATSSPAFGSTSTP 240

Query: 241  AFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGST 300
            AFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFG SSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGST
Sbjct: 241  AFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGST 300

Query: 301  SAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYA 360
             AFGQSTS FGSS FG+NTSPFGAQSSPFGAQSTS FGTSGFGQAGFGGQRGGSR   YA
Sbjct: 301  PAFGQSTSGFGSSTFGTNTSPFGAQSSPFGAQSTSTFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVTPYA 360

Query: 361  PTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGF 420
            PT EPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQS  GVGF
Sbjct: 361  PTPEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSASGVGF 420

Query: 421  GVSNAQPNLLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSS 480
            GVS  QPN +A+STFSQ S NPFST+T +NPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFA S+ 
Sbjct: 421  GVSGGQPNPVASSTFSQSSPNPFSTSTQTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFAPSTP 480

Query: 481  SNLFPSTTSASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLN 540
            SN F STT+ASTS+FL +T+SQFGSSSLF+SSNTQ+L SQ AFSST SPGTNLTFPSSLN
Sbjct: 481  SNPFASTTAASTSAFLSSTTSQFGSSSLFSSSNTQSLASQSAFSSTTSPGTNLTFPSSLN 540

Query: 541  FSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSP-LLTSSNPMG 600
            F NTQSSSLFQSTTP+IGQTGSAFGAPF+QSSLF+QPSSGVGGNLFSSSP LLTSSNPMG
Sbjct: 541  FGNTQSSSLFQSTTPAIGQTGSAFGAPFSQSSLFSQPSSGVGGNLFSSSPSLLTSSNPMG 600

Query: 601  FGQSSASFSMPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPV 660
            FGQ+SA FSMPFQPAQ QAPTSFFSNL Q QPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQ+P 
Sbjct: 601  FGQTSAPFSMPFQPAQQQAPTSFFSNLGQAQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQTPA 660

Query: 661  VQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHR 720
            VQPA ATNPFGTLPAMPQMSIS+PGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHR
Sbjct: 661  VQPAPATNPFGTLPAMPQMSISRPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHR 720

Query: 721  RMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRAS 780
            RMRLP RKYNPKNDG PRVPFFS+DEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPS+A+
Sbjct: 721  RMRLPVRKYNPKNDGSPRVPFFSDDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSKAN 780

Query: 781  LEKASPLKDTAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGV 840
            L+K+ P KDT+VRENGKI E  SS  VNNLK+T+GN VENG  +K+S+H NKVNQKPNGV
Sbjct: 781  LDKSLPSKDTSVRENGKIAERTSSA-VNNLKDTNGNVVENG-INKESIHLNKVNQKPNGV 840

Query: 841  HEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERA 900
            HEDHSAPKE+LYRTF GHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRH+DYYTEPKIQELAAKERA
Sbjct: 841  HEDHSAPKEELYRTFAGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHSDYYTEPKIQELAAKERA 900

Query: 901  EPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQG 960
            EPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREV VYLD+SKKPP GQG
Sbjct: 901  EPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVIVYLDESKKPPCGQG 960

Query: 961  LNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFR 1020
            LNKPAEVTILNIKC DK+TGHQYTEGPK EKYKELLRKKTEAQGAEF+S+DPVKGEWKF+
Sbjct: 961  LNKPAEVTILNIKCVDKQTGHQYTEGPKVEKYKELLRKKTEAQGAEFISYDPVKGEWKFK 1020

Query: 1021 VEHFSKYKMEDCEE 1024
            VEHFS+Y MED EE
Sbjct: 1021 VEHFSRYNMEDNEE 1032

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LN95 (Peptidase S59 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G433410 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1699 bits (4401), Expect = 0.0
Identity = 924/1037 (89.10%), Postives = 967/1037 (93.25%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60
            MFGSPNPFGQPS+SPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFG QTGNTVFGGTSTGV
Sbjct: 1    MFGSPNPFGQPSTSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGPQTGNTVFGGTSTGV 60

Query: 61   FGAAQSSSPF-SSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFG 120
            FGAAQSSSPF S+TTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFG
Sbjct: 61   FGAAQSSSPFPSTTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFG 120

Query: 121  GFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGA 180
            GFGST  QTNPFGS NQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATS PAFG+TSTPAFGA
Sbjct: 121  GFGSTPAQTNPFGSTNQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSTPAFGSTSTPAFGA 180

Query: 181  TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFG--------STSTP 240
            TSTPAFGA STPAFGATSTPAFGATSTPAFGA STPAFGA+STPAFG        STSTP
Sbjct: 181  TSTPAFGAASTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGAASTPAFGATSSPAFGSTSTP 240

Query: 241  AFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGST 300
            AFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFG SSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGST
Sbjct: 241  AFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGST 300

Query: 301  SAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYA 360
             AFGQSTS FGSS FG+NTSPFGAQSSPFGAQSTS+FGTSGFGQAGFGGQRGGSR   YA
Sbjct: 301  PAFGQSTSGFGSSTFGTNTSPFGAQSSPFGAQSTSSFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVTPYA 360

Query: 361  PTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGF 420
            PT EPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQS  GVGF
Sbjct: 361  PTPEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSASGVGF 420

Query: 421  GVSNAQPNLLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSS 480
            GV   QPN +A+STFSQ S NPFST+T +NPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFA S+ 
Sbjct: 421  GVPGGQPNPVASSTFSQSSPNPFSTSTPTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFAPSTP 480

Query: 481  SNLFPSTTSASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLN 540
            SN F STT+ASTS+FL +T+SQFGSSSLF+SSNTQ L SQ AFSST SPGTNLTFPSSLN
Sbjct: 481  SNPFASTTAASTSAFLSSTTSQFGSSSLFSSSNTQPLASQSAFSSTTSPGTNLTFPSSLN 540

Query: 541  FSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSP-LLTSSNPMG 600
            F NTQSSSLFQSTTP+IGQTGSAFGAPF+QSSLF+QPSSGVGGNLFSS+P LLTSSNPM 
Sbjct: 541  FGNTQSSSLFQSTTPAIGQTGSAFGAPFSQSSLFSQPSSGVGGNLFSSTPSLLTSSNPMA 600

Query: 601  FGQSSASFSMPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPV 660
            FGQ+SA FSMPFQPAQAQAPTSFFSN+ Q QPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQ+P 
Sbjct: 601  FGQTSAPFSMPFQPAQAQAPTSFFSNMGQAQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQTPA 660

Query: 661  VQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHR 720
            VQPA ATNPFGTLPAMPQMSIS+PGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHR
Sbjct: 661  VQPAPATNPFGTLPAMPQMSISRPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHR 720

Query: 721  RMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRAS 780
            RMRLP RKYNPKNDG PRVPFFS+DEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPS+ +
Sbjct: 721  RMRLPVRKYNPKNDGSPRVPFFSDDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSKGN 780

Query: 781  LEKASPLKDTAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNGV 840
            L+K+ P KDT+VRENGK+ E  SS  VNNLK+T+GN VENG TSK+++H N+VNQKPNGV
Sbjct: 781  LDKSLPSKDTSVRENGKVAERTSSA-VNNLKDTNGNVVENG-TSKENIHLNEVNQKPNGV 840

Query: 841  HEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERA 900
            HEDHSAPKEDLYRTF GHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRH+DYYTEPKIQELAAKERA
Sbjct: 841  HEDHSAPKEDLYRTFAGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHSDYYTEPKIQELAAKERA 900

Query: 901  EPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQG 960
            EPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREV VYLD+SKKPP GQG
Sbjct: 901  EPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVIVYLDESKKPPCGQG 960

Query: 961  LNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFR 1020
            LNKPAEVTILNIKC DK+TGHQYTEGPK EKYKELLRKKTEAQGAEFVS++PVKGEWKFR
Sbjct: 961  LNKPAEVTILNIKCVDKQTGHQYTEGPKVEKYKELLRKKTEAQGAEFVSYNPVKGEWKFR 1020

Query: 1021 VEHFSKYKMEDCEEVEE 1027
            VEHFSKY MED EEVE+
Sbjct: 1021 VEHFSKYNMEDNEEVED 1035

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H1L4 (nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459600 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1699 bits (4400), Expect = 0.0
Identity = 933/1043 (89.45%), Postives = 968/1043 (92.81%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTSTGV 60
            MFGSPNPFGQPSSSPF SQPVFGQTANAS+NPFAPKPFGSTSPFGSQ GN+VFGGT+TGV
Sbjct: 1    MFGSPNPFGQPSSSPFGSQPVFGQTANASSNPFAPKPFGSTSPFGSQAGNSVFGGTATGV 60

Query: 61   FGAAQSSSPFSS--TTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLF 120
            FGAAQSSSPF+S  TTFGGSSSPAFGA   TFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLF
Sbjct: 61   FGAAQSSSPFASSTTTFGGSSSPAFGAP--TFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLF 120

Query: 121  GGFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGS-----------NVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAP 180
            GGFGST  QTNPFGS NQQSQPAFGS           NVFGSS PFGAPSQ AFGAT++P
Sbjct: 121  GGFGSTPAQTNPFGSTNQQSQPAFGSTSQQSQPAFGSNVFGSS-PFGAPSQPAFGATNSP 180

Query: 181  AFGATSTPAFGATS-TPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFG 240
            AFG TSTPAFGATS TPAFG TSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGA S PAFGA+STPAFG
Sbjct: 181  AFGTTSTPAFGATSSTPAFGTTSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASAPAFGATSTPAFG 240

Query: 241  STSTPAFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSF 300
            STSTPAFGSTG++FGSLSTPVFGSGGGFGASSTP FGVSSTPAFGASS PAFGASS+PSF
Sbjct: 241  STSTPAFGSTGSSFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPTFGVSSTPAFGASSTPAFGASSSPSF 300

Query: 301  SFGSTSAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSR 360
            SFGST AFGQSTSAFGSS FG+N SPFGAQSSPFGAQST+ FGTSGFGQAGFGGQRGGSR
Sbjct: 301  SFGSTPAFGQSTSAFGSSTFGTNASPFGAQSSPFGAQSTTTFGTSGFGQAGFGGQRGGSR 360

Query: 361  AAAYAPTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST 420
               YAPTTEPD GSGSTQAAGKLESISAMP YKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST
Sbjct: 361  VTPYAPTTEPDSGSGSTQAAGKLESISAMPAYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST 420

Query: 421  GGVGFGVSNAQPNLLATSTFSQPSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAF 480
            GGVGFGVS AQPNLLA+STFSQ SSNPFSTA S+NPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAF
Sbjct: 421  GGVGFGVSTAQPNLLASSTFSQSSSNPFSTAASTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAF 480

Query: 481  ATSSSSNLFPSTTSASTSS-FLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLT 540
            A SSSSN F STT+ASTSS FL +T+SQFGSSSLF SSN Q L SQ AFSST SPGTNLT
Sbjct: 481  APSSSSNPFASTTAASTSSSFLSSTTSQFGSSSLFGSSNAQPLASQPAFSSTTSPGTNLT 540

Query: 541  FPSSLNFSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFGAPFTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSP-LLT 600
            FPSSLNFSNTQSSSLFQST PSIGQTGSAFGAPF+Q SLF+QPSSGVGGNLFSSSP LLT
Sbjct: 541  FPSSLNFSNTQSSSLFQSTAPSIGQTGSAFGAPFSQPSLFSQPSSGVGGNLFSSSPSLLT 600

Query: 601  SSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQAQAPTSFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSP 660
            SSNPMGFGQSSASFSMPFQ AQAQAPTSFFSNL QTQPIGSS FAGTSSIFGQSNFGQSP
Sbjct: 601  SSNPMGFGQSSASFSMPFQQAQAQAPTSFFSNLVQTQPIGSSSFAGTSSIFGQSNFGQSP 660

Query: 661  ITQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTP 720
            ITQ+P+VQPA ATNPFGTLPAMPQMSIS+PGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTP
Sbjct: 661  ITQNPIVQPAPATNPFGTLPAMPQMSISRPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTP 720

Query: 721  RHLSHRRMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQ 780
            RHLSHRRMRLP RKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQ
Sbjct: 721  RHLSHRRMRLPARKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQ 780

Query: 781  WPSRASLEKASPLKDTAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVN 840
            WPSRAS E+  P KDT+VRENGKI E  SS+ VNNLK+T+GN VENG TSKD++HPNKVN
Sbjct: 781  WPSRASSERVLPSKDTSVRENGKIAEGTSSMAVNNLKDTNGNVVENG-TSKDNIHPNKVN 840

Query: 841  QKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQEL 900
            QKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRH+DYYTEPK+QEL
Sbjct: 841  QKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKLRHSDYYTEPKMQEL 900

Query: 901  AAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKK 960
            AAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHG+GSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREV VYLD+SKK
Sbjct: 901  AAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGFGSIKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVIVYLDESKK 960

Query: 961  PPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVK 1020
            PPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPK EKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVK
Sbjct: 961  PPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKVEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVK 1020

Query: 1021 GEWKFRVEHFSKYKMEDCEEVEE 1027
            GEWKFRVEHFS+Y MED EEVE+
Sbjct: 1021 GEWKFRVEHFSRYNMEDNEEVED 1039

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. TAIR 10
Match: AT1G10390.1 (Nucleoporin autopeptidase )

HSP 1 Score: 1047.3 bits (2707), Expect = 7.8e-306
Identity = 668/1074 (62.20%), Postives = 791/1074 (73.65%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPS-SSPFASQPVFGQTAN-ASNNPFAP-KPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTS 60
            MFGS NPFGQ S +SPF SQ +FGQT+N +SNNPFAP  PFG+++PF +Q+G+++FG TS
Sbjct: 1    MFGSSNPFGQSSGTSPFGSQSLFGQTSNTSSNNPFAPATPFGTSAPFAAQSGSSIFGSTS 60

Query: 61   TGVFGAAQSSSPFSST-TFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSS-SSSSFGGSSIFGQK 120
            TGVFGA Q+SSPF+ST TFG SSSPAFG        +STPAFG+S +SS FGGSS FGQK
Sbjct: 61   TGVFGAPQTSSPFASTPTFGASSSPAFG--------NSTPAFGASPASSPFGGSSGFGQK 120

Query: 121  PLFGGFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTP 180
            PL    G +T Q+NPFG++ QQSQPAFG+  FGSS+PFGA +  AFGA S P+FGATSTP
Sbjct: 121  PL----GFSTPQSNPFGNSTQQSQPAFGNTSFGSSTPFGATNTPAFGAPSTPSFGATSTP 180

Query: 181  AFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTP----------AF 240
            +FGA+STPAFGAT+TPAFGA+++P+FGAT+TPAFGA+ TPAFG++ T           AF
Sbjct: 181  SFGASSTPAFGATNTPAFGASNSPSFGATNTPAFGASPTPAFGSTGTTFGNTGFGSGGAF 240

Query: 241  GSTSTPAFGSTGN-AFGSLSTPVFGSGG--GFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASS 300
            G+++TPAFG++G  AFG+  TP FG+     FGASSTPAFG SSTPAFG SS P+FGAS+
Sbjct: 241  GASNTPAFGASGTPAFGASGTPAFGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGGSSTPSFGASN 300

Query: 301  TPSFSFGSTSAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQ-STSAFGTSGFGQAGFGGQ 360
            T SFSFGS+ AFGQSTSAFGSS FGS  SPFG      GAQ ST  FG SGFGQ+ FGGQ
Sbjct: 301  TSSFSFGSSPAFGQSTSAFGSSAFGSTPSPFG------GAQASTPTFGGSGFGQSTFGGQ 360

Query: 361  RGGSRAAAYAPTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLP 420
            +GGSRA  YAPT E D G+G TQ AGKLESISAMP YK+K++EELRWEDYQ GDKGGPLP
Sbjct: 361  QGGSRAVPYAPTVEADTGTG-TQPAGKLESISAMPAYKEKNYEELRWEDYQRGDKGGPLP 420

Query: 421  AGQSTGGVGFGVSNAQPNLLATS-TFSQPS---SNPFSTATSSNPFAPK-----PSGFGT 480
            AGQS G  GFG+S +QPN  + S  F Q S   +NPFS++TS+NPFAP+      S FGT
Sbjct: 421  AGQSPGNAGFGISPSQPNPFSPSPAFGQTSANPTNPFSSSTSTNPFAPQTPTIASSSFGT 480

Query: 481  FGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTSASTSSFLPTTSSQFGS---SSLFNSSNTQALG 540
                 T +F SS F  +SSSNLF S +S +TS F   +SS FG+   S LF SS+T   G
Sbjct: 481  ----ATSNFGSSPFGVTSSSNLFGSGSSTTTSVF--GSSSAFGTTTPSPLFGSSSTPGFG 540

Query: 541  SQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFG------------- 600
            S  +   +A PG   T P+   F N+Q S+LF S TPS GQTGSAFG             
Sbjct: 541  SSSSIFGSA-PGQGAT-PA---FGNSQPSTLFNS-TPSTGQTGSAFGQTGSAFGQFGQSS 600

Query: 601  AP-FTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQ-AQAPTSF- 660
            AP F Q+S+FN+PS+G  GN+FSSS  LT+S+   FGQ+  +   PFQ AQ  QA   F 
Sbjct: 601  APAFGQNSIFNKPSTGF-GNMFSSSSTLTTSSSSPFGQTMPAGVTPFQSAQPGQASNGFG 660

Query: 661  FSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPI-TQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSIS 720
            F+N  Q Q   ++G AG   IFGQ NFGQSP    S V+QP   TNPFGTLPAMPQ+SI+
Sbjct: 661  FNNFGQNQAANTTGNAGGLGIFGQGNFGQSPAPLNSVVLQPVAVTNPFGTLPAMPQISIN 720

Query: 721  KPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFF 780
            + G +PSIQYGISSMPVVDK APVRISS LT RHL HRR+RLP RKY P  +G P+VPFF
Sbjct: 721  QGGNSPSIQYGISSMPVVDKPAPVRISSLLTSRHLLHRRVRLPARKYRPGENG-PKVPFF 780

Query: 781  SEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDTA-VRENGKIPED 840
            ++DEE+ STPKADALFIPRENPRALVIRP  QW SR         + TA + +NGK P D
Sbjct: 781  TDDEESSSTPKADALFIPRENPRALVIRPVQQWSSRDKSILPKEQRPTAPLHDNGKSP-D 840

Query: 841  NSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNG-VHEDHSAPKEDLYRTFGGHRA 900
             ++   N+ +N +G     G     SV+    NQKPNG    D ++ KE  Y+T  GHRA
Sbjct: 841  MATDAANHDRNGNGELGATGERIHTSVN---ANQKPNGTTRSDQASEKERPYKTLSGHRA 900

Query: 901  GEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGS 960
            GEAAIVYEHGADIEALMPKLR +DY+TEP+IQELAAKERA+PG+CR V+DFVVGRHGYGS
Sbjct: 901  GEAAIVYEHGADIEALMPKLRQSDYFTEPRIQELAAKERADPGYCRRVRDFVVGRHGYGS 960

Query: 961  IKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTG 1020
            IKF GETDVRRLDLES+VQFN REV VY+D+SKKP  GQGLNKPAEVT+LNIKC DKKTG
Sbjct: 961  IKFMGETDVRRLDLESLVQFNTREVIVYMDESKKPAVGQGLNKPAEVTLLNIKCIDKKTG 1020

Query: 1021 HQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKMEDCEE 1025
             Q+TEG + EKYK +L+KK EAQGAEFVS DPVKGEWKFRVEHFS YK+ D +E
Sbjct: 1021 KQFTEGERVEKYKMMLKKKAEAQGAEFVSFDPVKGEWKFRVEHFSSYKLGDEDE 1037

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. TAIR 10
Match: AT1G10390.2 (Nucleoporin autopeptidase )

HSP 1 Score: 1047.3 bits (2707), Expect = 7.8e-306
Identity = 668/1074 (62.20%), Postives = 791/1074 (73.65%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSPNPFGQPS-SSPFASQPVFGQTAN-ASNNPFAP-KPFGSTSPFGSQTGNTVFGGTS 60
            MFGS NPFGQ S +SPF SQ +FGQT+N +SNNPFAP  PFG+++PF +Q+G+++FG TS
Sbjct: 1    MFGSSNPFGQSSGTSPFGSQSLFGQTSNTSSNNPFAPATPFGTSAPFAAQSGSSIFGSTS 60

Query: 61   TGVFGAAQSSSPFSST-TFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSS-SSSSFGGSSIFGQK 120
            TGVFGA Q+SSPF+ST TFG SSSPAFG        +STPAFG+S +SS FGGSS FGQK
Sbjct: 61   TGVFGAPQTSSPFASTPTFGASSSPAFG--------NSTPAFGASPASSPFGGSSGFGQK 120

Query: 121  PLFGGFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTP 180
            PL    G +T Q+NPFG++ QQSQPAFG+  FGSS+PFGA +  AFGA S P+FGATSTP
Sbjct: 121  PL----GFSTPQSNPFGNSTQQSQPAFGNTSFGSSTPFGATNTPAFGAPSTPSFGATSTP 180

Query: 181  AFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTP----------AF 240
            +FGA+STPAFGAT+TPAFGA+++P+FGAT+TPAFGA+ TPAFG++ T           AF
Sbjct: 181  SFGASSTPAFGATNTPAFGASNSPSFGATNTPAFGASPTPAFGSTGTTFGNTGFGSGGAF 240

Query: 241  GSTSTPAFGSTGN-AFGSLSTPVFGSGG--GFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASS 300
            G+++TPAFG++G  AFG+  TP FG+     FGASSTPAFG SSTPAFG SS P+FGAS+
Sbjct: 241  GASNTPAFGASGTPAFGASGTPAFGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGGSSTPSFGASN 300

Query: 301  TPSFSFGSTSAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQ-STSAFGTSGFGQAGFGGQ 360
            T SFSFGS+ AFGQSTSAFGSS FGS  SPFG      GAQ ST  FG SGFGQ+ FGGQ
Sbjct: 301  TSSFSFGSSPAFGQSTSAFGSSAFGSTPSPFG------GAQASTPTFGGSGFGQSTFGGQ 360

Query: 361  RGGSRAAAYAPTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLP 420
            +GGSRA  YAPT E D G+G TQ AGKLESISAMP YK+K++EELRWEDYQ GDKGGPLP
Sbjct: 361  QGGSRAVPYAPTVEADTGTG-TQPAGKLESISAMPAYKEKNYEELRWEDYQRGDKGGPLP 420

Query: 421  AGQSTGGVGFGVSNAQPNLLATS-TFSQPS---SNPFSTATSSNPFAPK-----PSGFGT 480
            AGQS G  GFG+S +QPN  + S  F Q S   +NPFS++TS+NPFAP+      S FGT
Sbjct: 421  AGQSPGNAGFGISPSQPNPFSPSPAFGQTSANPTNPFSSSTSTNPFAPQTPTIASSSFGT 480

Query: 481  FGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTSASTSSFLPTTSSQFGS---SSLFNSSNTQALG 540
                 T +F SS F  +SSSNLF S +S +TS F   +SS FG+   S LF SS+T   G
Sbjct: 481  ----ATSNFGSSPFGVTSSSNLFGSGSSTTTSVF--GSSSAFGTTTPSPLFGSSSTPGFG 540

Query: 541  SQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFG------------- 600
            S  +   +A PG   T P+   F N+Q S+LF S TPS GQTGSAFG             
Sbjct: 541  SSSSIFGSA-PGQGAT-PA---FGNSQPSTLFNS-TPSTGQTGSAFGQTGSAFGQFGQSS 600

Query: 601  AP-FTQSSLFNQPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQ-AQAPTSF- 660
            AP F Q+S+FN+PS+G  GN+FSSS  LT+S+   FGQ+  +   PFQ AQ  QA   F 
Sbjct: 601  APAFGQNSIFNKPSTGF-GNMFSSSSTLTTSSSSPFGQTMPAGVTPFQSAQPGQASNGFG 660

Query: 661  FSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPI-TQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSIS 720
            F+N  Q Q   ++G AG   IFGQ NFGQSP    S V+QP   TNPFGTLPAMPQ+SI+
Sbjct: 661  FNNFGQNQAANTTGNAGGLGIFGQGNFGQSPAPLNSVVLQPVAVTNPFGTLPAMPQISIN 720

Query: 721  KPGAAPSIQYGISSMPVVDKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFF 780
            + G +PSIQYGISSMPVVDK APVRISS LT RHL HRR+RLP RKY P  +G P+VPFF
Sbjct: 721  QGGNSPSIQYGISSMPVVDKPAPVRISSLLTSRHLLHRRVRLPARKYRPGENG-PKVPFF 780

Query: 781  SEDEETPSTPKADALFIPRENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDTA-VRENGKIPED 840
            ++DEE+ STPKADALFIPRENPRALVIRP  QW SR         + TA + +NGK P D
Sbjct: 781  TDDEESSSTPKADALFIPRENPRALVIRPVQQWSSRDKSILPKEQRPTAPLHDNGKSP-D 840

Query: 841  NSSLPVNNLKNTDGNAVENGSTSKDSVHPNKVNQKPNG-VHEDHSAPKEDLYRTFGGHRA 900
             ++   N+ +N +G     G     SV+    NQKPNG    D ++ KE  Y+T  GHRA
Sbjct: 841  MATDAANHDRNGNGELGATGERIHTSVN---ANQKPNGTTRSDQASEKERPYKTLSGHRA 900

Query: 901  GEAAIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGS 960
            GEAAIVYEHGADIEALMPKLR +DY+TEP+IQELAAKERA+PG+CR V+DFVVGRHGYGS
Sbjct: 901  GEAAIVYEHGADIEALMPKLRQSDYFTEPRIQELAAKERADPGYCRRVRDFVVGRHGYGS 960

Query: 961  IKFFGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTG 1020
            IKF GETDVRRLDLES+VQFN REV VY+D+SKKP  GQGLNKPAEVT+LNIKC DKKTG
Sbjct: 961  IKFMGETDVRRLDLESLVQFNTREVIVYMDESKKPAVGQGLNKPAEVTLLNIKCIDKKTG 1020

Query: 1021 HQYTEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKMEDCEE 1025
             Q+TEG + EKYK +L+KK EAQGAEFVS DPVKGEWKFRVEHFS YK+ D +E
Sbjct: 1021 KQFTEGERVEKYKMMLKKKAEAQGAEFVSFDPVKGEWKFRVEHFSSYKLGDEDE 1037

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. TAIR 10
Match: AT1G59660.1 (Nucleoporin autopeptidase )

HSP 1 Score: 879.4 bits (2271), Expect = 2.8e-255
Identity = 578/1051 (55.00%), Postives = 721/1051 (68.60%), Query Frame = 0 

Query: 1    MFGSP--NPFGQPS-SSPFASQ--PVFGQT-ANASNNPFAPKPFGSTSPFGSQTGNTVFG 60
            MFGS   NPFGQ S SSPF +Q   +FGQT  NASNNPFA KPFG+++PFG+QTG+++FG
Sbjct: 1    MFGSSNNNPFGQSSISSPFGTQTHSLFGQTNNNASNNPFATKPFGTSTPFGAQTGSSMFG 60

Query: 61   GTSTGVFGAAQSSSPFSSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ 120
            GTSTGVFGA Q+SSPF      G+S  AFG++   FG+SSTP+FG SS+S FGG+S FGQ
Sbjct: 61   GTSTGVFGAPQTSSPF------GASPQAFGSSTQAFGASSTPSFG-SSNSPFGGTSTFGQ 120

Query: 121  KPLFGGFGSTTTQTNPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPA------ 180
            K     FG +T Q++PFGS  QQSQPAFG++ FGSS+PFGA +  AFGA+S PA      
Sbjct: 121  K----SFGLSTPQSSPFGSTTQQSQPAFGNSTFGSSTPFGASTTPAFGASSTPAFGVSNT 180

Query: 181  --FGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFG 240
              FGAT+TP FGAT+T  FG +STP FGA+STPAFG+T+TPAFGA+STP FG+SS+PAFG
Sbjct: 181  SGFGATNTPGFGATNTTGFGGSSTPGFGASSTPAFGSTNTPAFGASSTPLFGSSSSPAFG 240

Query: 241  STSTPAFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSF 300
            ++  PAFGS+GNAFG+     F SGG        AFG SSTP FGAS+  AFGASS+PSF
Sbjct: 241  ASPAPAFGSSGNAFGN---NTFSSGG--------AFGSSSTPTFGASNTSAFGASSSPSF 300

Query: 301  SFGSTSAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSR 360
            +FGS+ AFGQSTSAFGSS+FGS  S  G+  SPFGAQ   A  ++  GQ+  GGQ+GGSR
Sbjct: 301  NFGSSPAFGQSTSAFGSSSFGSTQSSLGSTPSPFGAQGAQASTSTFGGQSTIGGQQGGSR 360

Query: 361  AAAYAPTTEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQST 420
               YAPTT  D  SG+   + +L+SISAMP +K K+ EELRWEDYQ GDKGG    GQS 
Sbjct: 361  VIPYAPTT--DTASGTESKSERLQSISAMPAHKGKNMEELRWEDYQRGDKGGQRSTGQSP 420

Query: 421  GGVGFGVSNAQPNLLATS-TFSQP---SSNPFS--TATSSNPFAPKPSGFGT--FGPSTT 480
             G GFGV+N+QP++ +TS  FSQ     +NPFS  T TS+  F+P  S   T  FG  TT
Sbjct: 421  EGAGFGVTNSQPSIFSTSPAFSQTPVNPTNPFSQTTPTSNTNFSPSFSQPTTPSFGQPTT 480

Query: 481  FSFNSSAFATSSSSNLFPSTTSASTSSFLPTTSSQFGSSSLFNSSNTQALGSQLAFSSTA 540
             SF S+    S+++++F S++S +T++  P  SS FGS+    S+   ++G      S+ 
Sbjct: 481  PSFRST---VSNTTSVFGSSSSLTTNTSQPLGSSIFGSTPAHGSTPGFSIGGFNNSQSSP 540

Query: 541  SPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSLF-QSTTPSIGQTGSAFG----APFTQSSLFNQPSSGVG 600
              G+N +F  +   + +Q+S LF Q+TTP++GQ+ S FG        QS+ F+ PS+G G
Sbjct: 541  LFGSNPSFAQNTTPAFSQTSPLFGQNTTPALGQSSSVFGQNTNPALVQSNTFSTPSTGFG 600

Query: 601  GNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQAQAPTSF--FSNLSQTQPIGSSGFAGT 660
                SSS L TS +P  FGQ + + + PFQ AQ   P     F+N  QTQ   ++  AG 
Sbjct: 601  NTFSSSSSLTTSISP--FGQITPAVT-PFQSAQPTQPLGAFGFNNFGQTQIANTTDIAGA 660

Query: 661  SSIFGQSNFGQSP-ITQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSISKPGAAPSIQYGISSMPVV 720
               F Q NF Q P +  S V+QP   TNPFGTLPA+PQ+SI++ G +PSIQYGISSMPVV
Sbjct: 661  MGTFSQGNFKQQPALGNSAVMQPTPVTNPFGTLPALPQISIAQGGNSPSIQYGISSMPVV 720

Query: 721  DKAAPVRISSFLTPRHLSHRRMRLPTRKYNPKNDGRPRVPFFSEDEETPSTPKADALFIP 780
            DK APVR+S  LT RHL  RR+RLPTRKY P +DG P+VPFFS++EE  STPKADA FIP
Sbjct: 721  DKPAPVRVSPLLTSRHLLQRRVRLPTRKYRPSDDG-PKVPFFSDEEENSSTPKADAFFIP 780

Query: 781  RENPRALVIRPTDQWPSRASLEKASPLKDTAVRENGKIPEDNSSLPVNNLKNTDGNAVEN 840
            RENPRAL IRP ++  S    +  +PL++   R NG          V N  N +    +N
Sbjct: 781  RENPRALFIRPVERVKSEHPKDSPTPLQENGKRSNG----------VTNGANHE--TKDN 840

Query: 841  GSTSKDSVHPNKVNQKPNGVHEDHSAPKEDLYRTFGGHRAGEAAIVYEHGADIEALMPKL 900
            G+  +    P KVNQK NG HE+H   K       G H +         GADIE+LMPKL
Sbjct: 841  GAIRE--APPVKVNQKQNGTHENHGGDKN------GSHSS-------PSGADIESLMPKL 900

Query: 901  RHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKFFGETDVRRLDLESIVQF 960
             H++Y+TEP+IQELAAKER E G+C+ VKDFVVGRHGYGSIKF GETDV RLDLE +VQF
Sbjct: 901  HHSEYFTEPRIQELAAKERVEQGYCKRVKDFVVGRHGYGSIKFLGETDVCRLDLEMVVQF 960

Query: 961  NNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQYTEGPKAEKYKELLRKKT 1020
             NREV VY+D+SKKPP GQGLNKPA VT+LNIKC DKKTG Q  EG + +KYKE+L++K 
Sbjct: 961  KNREVNVYMDESKKPPVGQGLNKPAVVTLLNIKCMDKKTGTQVMEGERLDKYKEMLKRKA 993

Query: 1021 EAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKMED 1022
              QGA+FVS+DPV GEW F+VEHFS YK+ D
Sbjct: 1021 GEQGAQFVSYDPVNGEWTFKVEHFSSYKLGD 993

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. TAIR 10
Match: AT1G80680.1 (SUPPRESSOR OF AUXIN RESISTANCE 3 )

HSP 1 Score: 143.3 bits (360), Expect = 1.1e-33
Identity = 77/170 (45.29%), Postives = 101/170 (59.41%), Query Frame = 0 

Query: 854  AIVYEHGADIEALMPKLRHADYYTEPKIQELAAKERAEPGFCRHVKDFVVGRHGYGSIKF 913
            A + EH  +I   +P L   DY+ +P I EL  +E   P +C  V DF +GR GYG I+F
Sbjct: 33   AALCEHSKEIIDSLPMLNSPDYFLKPCINELVEREIESPDYCSRVPDFTIGRIGYGYIRF 92

Query: 914  FGETDVRRLDLESIVQFNNREVTVYLDDSKKPPRGQGLNKPAEVTILNIKCFDKKTGHQY 973
             G TDVRRLDL+ IV+F+  EV VY D+S KP  G+GLNK AEVT++ +   D   G Q 
Sbjct: 93   LGNTDVRRLDLDHIVKFHRHEVIVYDDESSKPVVGEGLNKAAEVTLV-VNIPDLTWGKQ- 152

Query: 974  TEGPKAEKYKELLRKKTEAQGAEFVSHDPVKGEWKFRVEHFSKYKMEDCE 1024
                +       L++ TE QGA F+S DP  G WKF V HFS++ + D E
Sbjct: 153  ----QVNHIAYKLKQSTERQGATFISFDPDNGLWKFFVPHFSRFGLSDDE 196

[Close]
BLAST of MC06g1840 vs. TAIR 10
Match: AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )

HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 4.6e-08
Identity = 171/547 (31.26%), Postives = 252/547 (46.07%), Query Frame = 0 

Query: 149 SSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPA 208
           S  PFG    ++ G  S  +  AT++ +  +T++P      + +F  +S P     S+  
Sbjct: 2   SGFPFG--QSNSVGGFSFGSSSATNSSSASSTTSPL-----SFSFNQSSNP-----SSTG 61

Query: 209 FGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGVSSTP 268
           FG  S+     SSTPA  S++TP+FG     FG+ STP F    GFG+S++     SSTP
Sbjct: 62  FGFGSS----VSSTPA--SSTTPSFG-----FGASSTPSF----GFGSSAS-----SSTP 121

Query: 269 AFG-ASSAPAFGASSTPSFSFG-STSAFGQSTSAFGSSNFGSNTSPFGAQSSPFGAQSTS 328
           +FG  SSA    AS+TPSF FG + S+   + S FGSS   +N S     SSPFG  ++S
Sbjct: 122 SFGFGSSASVTPASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFGSST--TNASSAAPGSSPFGFVTSS 181

Query: 329 AFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEP---DPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSH 388
           A  T+    + F    G   ++A  P++ P    P SGST   G   S+ + P     S+
Sbjct: 182 ASSTATPSSSLF----GAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASN 241

Query: 389 EELRWEDYQLGDKGGPL---PAGQSTGGVGFGVSNAQPNLLATSTFSQPSSNP-FSTATS 448
             L            PL   P+  +     F V+++ P   ++S F    S+P FS A+S
Sbjct: 242 SSLFGASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPG-SSSSIFGATGSSPSFSVASS 301

Query: 449 SNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFATSSSSNLFPSTTS-ASTSSFLPTTSSQFGSSS 508
           ++     PS FG  G S  F  +SSA +T S   LF S++S A+TSS  P   S F SSS
Sbjct: 302 AS--GSSPSIFGATGSSPFFGSSSSAGSTPS---LFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSS 361

Query: 509 LFNSSNTQALGSQLAFSSTASPGTNLTFPSSLNFSNTQSSSLFQSTTPSIGQTGSAFGAP 568
             N+SN  A        S  S  T  +F  S   S T S++   S  P    + S+F   
Sbjct: 362 TSNTSNASA--------SPFSASTGFSFLKSTASSTTSSTT--PSAPPQTASSSSSFSFG 421

Query: 569 FTQSSLFN-------QPSSGVGGNLFSSSPLLTSSNPMGFGQSSASFSMPFQPAQAQAPT 628
            + +S FN        P+S   G +FS +   T+S+      S+ + S P       A T
Sbjct: 422 TSANSGFNLSTGSSAAPASSTSGAVFSIATTTTTSSSTPAATSAPASSAP-------AST 481

Query: 629 SFFSNLSQTQPIGSSGFAGTSSIFGQSNFGQSPITQSPVVQPATATNPFGTLPAMPQMSI 679
             F +   T    ++  A +++ F  + FG +  T      PAT +    T  A+P+ S 
Sbjct: 482 MAFPSFGVTSSATNTTPASSAATFSTTGFGLASST------PATGSTNSFTGFAVPKTST 481

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
Q8RY251.1e-30462.20Nuclear pore complex protein NUP98A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP98A PE... [more]
F4ID163.9e-25455.00Nuclear pore complex protein NUP98B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP98B PE... [more]
Q9VCH55.1e-3627.74Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=N... [more]
P529483.8e-3130.56Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP98 PE=1 S... [more]
Q6PFD96.5e-3129.31Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nup98 PE=1 ... [more]
BLAST of MC06g1840 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022157427.10.0100.00nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X2 [Momordica charantia][more]
XP_022157417.10.099.90nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 [Momordica charantia] >XP_02... [more]
KAA0043047.10.089.65nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAG7035533.10.089.45Nuclear pore complex protein NUP98A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma][more]
XP_022958352.10.089.45nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 [Cucurbita moschata][more]
BLAST of MC06g1840 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1DUF90.0100.00nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=36... [more]
A0A6J1DUF50.099.90nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=36... [more]
A0A5A7TMM60.089.65Nuclear pore complex protein NUP98A-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 ... [more]
A0A0A0LN950.089.10Peptidase S59 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G4334... [more]
A0A6J1H1L40.089.45nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=366... [more]
BLAST of MC06g1840 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G10390.17.8e-30662.20Nucleoporin autopeptidase [more]
AT1G10390.27.8e-30662.20Nucleoporin autopeptidase [more]
AT1G59660.12.8e-25555.00Nucleoporin autopeptidase [more]
AT1G80680.11.1e-3345.29SUPPRESSOR OF AUXIN RESISTANCE 3 [more]
AT2G45000.14.6e-0831.26structural constituent of nuclear pore [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR036903Peptidase S59, nucleoporin superfamilyGENE3D3.30.1610.10Peptidase S59, nucleoporincoord: 869..1021
e-value: 1.9E-51
score: 175.9
IPR036903Peptidase S59, nucleoporin superfamilySUPERFAMILY82215C-terminal autoproteolytic domain of nucleoporin nup98coord: 865..1021
IPR007230Peptidase S59, nucleoporinPFAMPF04096Nucleoporin2coord: 873..1019
e-value: 2.2E-42
score: 144.7
IPR007230Peptidase S59, nucleoporinPROSITEPS51434NUP_Ccoord: 872..1014
score: 48.841232
NoneNo IPR availableGENE3D1.10.10.2360coord: 344..396
e-value: 7.4E-18
score: 66.5
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 762..837
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 332..368
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 791..824
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 716..745
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 717..741
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..91
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR23198:SF22BNAC05G07920D PROTEINcoord: 3..1023
IPR037665Nucleoporin peptidase S59-likePANTHERPTHR23198NUCLEOPORINcoord: 3..1023

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MC06g1840.1MC06g1840.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0051028 mRNA transport
biological_process GO:0000973 posttranscriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery
biological_process GO:0006606 protein import into nucleus
biological_process GO:0006405 RNA export from nucleus
biological_process GO:0006913 nucleocytoplasmic transport
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
cellular_component GO:0044614 nuclear pore cytoplasmic filaments
cellular_component GO:0005643 nuclear pore
molecular_function GO:0017056 structural constituent of nuclear pore