
MC04g1472 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5CDSpolypeptideutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAACTAATCAATGTGTGCTCCATCATCCAGATGGGAAACCCAAGAATCCACTCTTTGATAGCTCTTCGGGCAATACCATGGGATGCTCCATTTGCATCTCGCTGGATGTGCACCTTCGAAACCAGATTGATCTCTTCATCTTTCTTTTTGTATCTTGGAGTAGCCATCAAATTTCATTCAGATTTTGAATTCGTCCGCGAAGAAGCTCAACCACCTCTAGAGAATCGATCTCTAAGTAGATTGGTTTTTGAATTTCAGTCCCAATTGAATCCAAACTCTTGCAAATCGTAAACATTTCAAGGTAAGTAATCTATCTTTCTTCTCTAATCACTTCACAGCCCGCCTTCAAAATTTATCCTTTATCGTTTATGAGTATCCAACCCAACCCAACCCACCAAATCTCCTTTATGCACTCCAGGCCGCGTCGGTATTGAGCTTCCATGATCCTGCCGGGGGAGGGGTCCATCAAAATAGTTAAAGTATTTTCTTCTCTACATATTTGGTACGCTTCTTCCAAACGACTTGATAATTTCCTGAAATTGTGCCATTGTTTGATAATGTAGTTCTCTAAATAGATGTATGTGGTGATGAACGTGGATTGAGAAAAATATTAATCTTATGTTGGATGTCTGTAGTGCTTGAAATTTCTCCTTTAAAAATCGCTCGGTTCCTAGCCTCCCAAATCTGCCATGTTGTGATAAAAAATTTTAGGCTAAAATACACTTTTAGTCAATGAGTTTGAGGAGAAGTGTCTATTTGGTTCTTAAGTTTCAAAAAATAATTTGGTTACTAACTTTTAGAAAATGGTTATAAATAGTCCATAAACTTATTTGACCGTTAGTTGACTAACAGAAAAATGACATGGCATAATTGAGTGGTTAAGTTTTAAATGACGTGACAATGTTAAATAAATTTATATTATTTTTATGATATGTGGTCAAATTTTAAATGACGTGAGATATCATCGGCATAAAATTAAAATTTTAAAATATGGTTAAATATTTTTATAGTTAAATCATCTATTAGACTCCTTACGATTTATGGAAAGACAGAGAATAAATTTATAAATAAAGCAACCAAAAAAAAAAAAAAGAAAACAATAAAGCGAAAGAGAAAATTTCAGCAGAAGGAAGAAGCAGCGGCGAGAGGAACAGATCGCGGAGTCCTCAGAGCTGTGCTGACACAGAAGAAAGCCGAATTTGTGTCTTCATGCCACCGCCCCACTCCACAGAAATCTCTTCCCATAACGCTACAACAAGACAAATTCCAGAGCTTTATCTGCCGTGACTTCGCGATCCTCAATAACCCACTGCTGGGTTCTTGGATAAGCAATTTCAATAACCGGCTGCTTGGTCTTCTAGGGTTTTCTGTGAGTTCTTATTTCTCTCCTTTCGCCTTTTCTACATTCCTCTCATTGTAAGCATTAGATTATGAATGGAGAATGAAGATGCTGTTTTTAGATTTGATGTTCTTTGAATTGTTTGATGATGTGATATTTTAGCTGGGTGTTAAGAAAGTATAAGTTATTCTTCGTTATTTATATTTGAGACGGATGATACCTCATGGAGGAAATTAGTGCTGGCGTTGGATCCGAAACATTGAGGTGTTTGTGTTTCAGCTGAGACATGAAAGTATTAGCATTAGTAGCGAAAATGGTAGATAGGCTCAAATTGTTTTGTTTGTTATTTGCAATCTATTGATAGCTGTATGTTGTACACGATTTCATGGTTAGATTGAATCCAATTTCTATCGATTTGGTGGGTCATTGACAATAAAATATTGTTGACAAACCTCCGTTTAGCGATAAGGGTGGGTTTTTGTGGCAGGCAGGCGGGTTTTTTTGTTGTTTTTTTATGAGATTTGTGGTATGAGAGGAACAACAGGATTGTTAGGTGGACGAAGAGATATGGGGAGGAGGTGTGGGTCGTTGCCCGGTTTCATGTTTTCATTTGGGCTTCAGCGTCTAAAGTGTTTTGCTAATGTTTGCTGAATCCATTCATTTGAATGCATAAATTATCAAATCGAGCCATAGAAAACCATTGTTTTGTCACCACAGTAAAGGGCTGTGTTAAATACACAAAACTAACTAATCTTGTGGGAACTTAGGGGTGTAAGTTGTTGTTGGTTGGTTGAACTAACTAATCTTGTGGGAACCTAGCGGTGTAAGTTGCTGTTGGTTGGTTGACTTTGATTTTGGCCCCCTCGGTATAAATCTAACATTGAGCTTATGTGTCGGTTCAGCAAAAATTTAAGATAAAACTGCATTGACTGTCGGAAAAAACCATCGAAAACCATGTGAAAACAACCCAACCACAATAGTTTGTCTCAAAGTTCTATAAAAAACCACATCAACTGGACCAAACATGGCATGGTAACAAAGCAGTTCAGTCCCGTTTGTTGGTCTTGCTCGTTGTGCTTTGGCATTTCAAAAATGCATTCCCTTCCCTAAGTATGAAGGTTCATCACAGTTTAGCCGAGTTATGTGGTAAATTTTATGTTGGTTAATCAGGTCTGAAATGTATAATCTCAACTAGAATTAAGCAGATCATTCGTACTTCTTTGGGACCATTGCATATGTATGCACGTCAGCAAGTGTACACGGTCGATTTGTAATCATCATAGGTGAAGTAACAGGGTCTTAATAGAGAAAAGTGAAGGACTCAATTTCTGGTGTCAGATGTGATCCATAGTTGGACCTTACATGCGATGGCATGAAACTATAAAGCGGCCAATCATCAGCCCACAATAAACCCATAGTAAATCCCTCTCATAATCATGCCCCCACTTGGGTCACATGCCCACATAACCTAGCTCGGAGAGACATTGTCAAGCCTTATCCTTCGATTAAGGACAGAATCACCTTTCGCTTGGGCAATGGCTCCCTTCCTCGGTTTTGGAAAGATGTTTGGATCAACAATGAGCCCTTATGCCGCACCTACCCCCTTCTTTTGCTCTTCATTCCAGAAAATCTGATTTTGTTAAGAATTTCTAGTCTTTGGAATCTCACTCCTGGGATATTCACTTTTGGCGCAACCTTAAGGATGCATAAATATCTGAGCTGGCAGCACTTCTCCATAATTTACCCTCCCATCGGCCCTCTATAAATTTGGTACCTACATTTGGAGTTTGGAATCTCATGGCTCCTTTGCCACAAGCTCGCTTATTAAAGACCTTAACAGGCCCATCTCACCTACTGCTCCAACGGATTTGTATCGGGCCATCTAGAGGGATTCGTATCCAAAGACGATCAAATTCTTCTTGTGGGAAACTAGCCTTCACGCATTGAATACGCACGACAAACTCTAGAGAAGATTGTCTTTCAAGACCCTGTCGCCAATGCGTGAAGGCTAGTTTCCCACCAGAAGAATTTGATCGTCTTTGGATACGAATCCCTCTAGATGGCCCGATACAAATCTGTTGAGAATAGGAGGGTATCATGAGGAGGGTACCATGAGGAGGATCGCCCACCGAAAAGCCCTCAATTGATCCAGAACTGCTAGCATGGGAGAGAAGCCTGCTGAAACAATCAACAACTAAAATAAAGAGAAAGGGGAAAGGGGGTTTAAAGTCTGGTTTGGGCTTTAAAGTATCCTCAAGTGAAAAAACGAGACTGTGGTTTTTTTTTTTTTAACAAGATATGAACTTTTAATTGATAGATGAAAAGGAACAATATTGTTCAAAAATACAAAAATACAAACTCCCGAAGGGGTGAGAGTGAAAAACAAGAAATAGAATATAAAACATAGGACAAAACTACAAAGGAGAAATAAAGGCCTCCCAATTCATACAAATCATACTAGGGGAATACAAAGAAAAAATATCGGAAAGAGCAAACCATTGAGCAGCTTTGAATTTGGCAATGTTGAAGCATTCTAATGACGTACGACCAGAATCTTCAAATATCCTTTGATTCCTCTCAAACCATAATTTTGAGATGATTGCCTTAAACCCATGAATCCAAAGTAGATTAGCTTTTGGTACCAACCAAACTCCATGGAGAAGCTGAAAAATATTATTGATCCCACACCCATGCTAATTCGAACATCTGGAACAAAAGATTCCAACAAGCAGCAGTATATGGGCAGAAAAAGAAAACGTGACTCAAACCTTCCCCCTTTTCATAAACAGATGGATGGTTGCAAAGCCATTTTAGGAGTCTTCCTTTGTATAACCTATGCTGTATTGACCTTGCCATATAAGAGCCTGTAACTGTTGGTACTACCATCCATTTGACACACATATCTCTAATGTCTATTTTGAAATTAGTTTCTTAAAATGAAGGAAGGGAGTTGTTGCTTTTGTGCTGCATTTTTTTTCCTGTAGAGAGTATATGCTTCTCCAGGGGGAGATATCATGACATGCATTAAGTTCATTTTAGGACTGTTATTTGTGGATGCTGTGCTATTATGTTTTTGTTTCTTATTATAATAGGTAGTTTTGCCCTTTCAGCTTGGTTTCAAGAATCAGTTGAATGACTTGAGTTGTGCTTCGACAACTACCTGCTGCTCTTTCTTAGGTAAAGGCTCAAGATGGGAATTTTTGATGGCTTGCCAGTACCTCCTGAGAAAGCTGTGAGTCTTCTTTTAGACATTCATTTTCATGTAGTTCAGGAATGCATCTCCCCAAGCAGTGATATTAAAAAATATCCCACTCAAGAATAATAAGATGAATTGAGTAATTACAAAAATGCTTATGTAAAGACTCCAACTAGATACTGCATGTGTGCAAATATGTCACCTATCATATCTGGTGCATTTGGAAAGAAAGTAACAATAGCATTTTTGGAGATGAGGAAGGTGCTAAGTCTTTTGCAGAGTTGTTTATTTATTGACTTCATTATGGATGTGTTTTTCTAGTTGTTATGGTTTACTTTCATCTTTTATTTTCTTTGTTATCGTGGGTAGTTCTTTGCTTGTTTTATAGGACTTATTGCTCTTCCTTTTTATATGATATTTCCTCTATTTGCTCCATTTGTATTTGTGAGTCTTAA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Homology
BLAST of MC04g1472 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93YU5 (Exocyst complex component SEC8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SEC8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1423.3 bits (3683), Expect = 0.0e+00 Identity = 749/1085 (69.03%), Postives = 889/1085 (81.94%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54P76 (Exocyst complex component 4 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=exoc4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 136.7 bits (343), Expect = 1.5e-30 Identity = 251/1187 (21.15%), Postives = 460/1187 (38.75%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q62824 (Exocyst complex component 4 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Exoc4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 2.4e-23 Identity = 218/1051 (20.74%), Postives = 401/1051 (38.15%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O35382 (Exocyst complex component 4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Exoc4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 111.3 bits (277), Expect = 6.9e-23 Identity = 221/1051 (21.03%), Postives = 398/1051 (37.87%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96A65 (Exocyst complex component 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 105.1 bits (261), Expect = 4.9e-21 Identity = 217/1051 (20.65%), Postives = 395/1051 (37.58%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. NCBI nr
Match: XP_022134188.1 (exocyst complex component SEC8 [Momordica charantia] >XP_022134189.1 exocyst complex component SEC8 [Momordica charantia] >XP_022134190.1 exocyst complex component SEC8 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2008 bits (5203), Expect = 0.0 Identity = 1060/1082 (97.97%), Postives = 1061/1082 (98.06%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. NCBI nr
Match: XP_008456522.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: exocyst complex component SEC8 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1841 bits (4768), Expect = 0.0 Identity = 968/1094 (88.48%), Postives = 1015/1094 (92.78%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. NCBI nr
Match: XP_004140077.1 (exocyst complex component SEC8 [Cucumis sativus] >KGN48109.2 hypothetical protein Csa_002980 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1833 bits (4747), Expect = 0.0 Identity = 964/1094 (88.12%), Postives = 1014/1094 (92.69%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. NCBI nr
Match: XP_038884800.1 (exocyst complex component SEC8 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884801.1 exocyst complex component SEC8 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1828 bits (4735), Expect = 0.0 Identity = 965/1094 (88.21%), Postives = 1010/1094 (92.32%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. NCBI nr
Match: KAA0036497.1 (exocyst complex component SEC8 [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ99988.1 exocyst complex component SEC8 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1816 bits (4703), Expect = 0.0 Identity = 956/1080 (88.52%), Postives = 1002/1080 (92.78%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BY37 (Exocyst complex component Sec8 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006511 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2008 bits (5203), Expect = 0.0 Identity = 1060/1082 (97.97%), Postives = 1061/1082 (98.06%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4Q4 (Exocyst complex component Sec8 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496450 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1841 bits (4768), Expect = 0.0 Identity = 968/1094 (88.48%), Postives = 1015/1094 (92.78%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BPD8 (Exocyst complex component Sec8 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold360G00330 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1816 bits (4703), Expect = 0.0 Identity = 956/1080 (88.52%), Postives = 1002/1080 (92.78%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JSA4 (Exocyst complex component Sec8 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489328 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1804 bits (4673), Expect = 0.0 Identity = 952/1094 (87.02%), Postives = 1005/1094 (91.86%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FFH3 (Exocyst complex component Sec8 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444981 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1804 bits (4673), Expect = 0.0 Identity = 952/1094 (87.02%), Postives = 1007/1094 (92.05%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1472 vs. TAIR 10
Match: AT3G10380.1 (subunit of exocyst complex 8 ) HSP 1 Score: 1423.3 bits (3683), Expect = 0.0e+00 Identity = 749/1085 (69.03%), Postives = 889/1085 (81.94%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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