
MC04g1388 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5CDSpolypeptideutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAGTCTAAAAATCATTTCGAAGTAATTTCGTTCGGCCTGGCATTTCATGTTGTGGCCCAATAAACGTCGTCCATCTGGTAAGAAAATTCTGGGAGCTGCTTCGTCAATCAGATCCATCTTCATTCGGATGAAAAAGATTGTTTCGAAGCCGAAAAAATCTGTTTATCAAACATCAGAGATCGTTACTATTTTCAGAAATCAACTTTTCATTTCATTACTTCGATTATCTGCTCAATTTTCGAGTCTCTCTGTGTTTTGCAGTCTCTTAGTGCAAGATGATGGTCGAGGATCTCGGAATCGAAGCGAAGGAAGCAGCCGTACGCGAGGTTGCCAAGCTTCTGCCGCTTCCGGAGCTTCTGCATTCAATTAGTTCGATCAAGGCCGATTACATTACTCGTCAGCAGGTACTAGCTTCTGCCTGAATTTTCTCCCGCGTAATTTCTTGTTTCCCGTTTTTGTGCTGGAGTTTTGCAGGTATTGATGCTAATGGTAGGATGTTGAGCAAGTAACCCAATTTTTGTTTTACGTTTTGTTGCGAGAGTTACCGATGACGACGAGTCTTTGATTTAGTTTAGTCAAGAAATTCCAGAATGTTGCATCATTACTCGTCAGGACAGTGGTCGTAGCTATTTTTTAGCCTCAAAAGTTCTTAATTCCTCACCTACAGAATTCTGCCTTATGCATTTCAGAGTTTATAGCACTTGCACTTAAGAATCTTTTTCGATTTTTCATTTCTAGGAACGTTTGTGGTATGTAGTCTACTAAATTTCAGTAGTCGATGCTTTTAAATAATTGACAAATGGTAAATTAAAAACAATGCTGCACACAAAGCGTGAGTGCAGGGTTTAACAAAAACACTTGTCCATGTTATCAATTGCGGATCTCAAGTAAGCTTCCATAAGCTGAGGCTAATTTTTGCCTGCACTGAATTTATCTGGTAATTAAGTTTGAATGTTGCACGTTATGCCACAATTCAGGTACTTCACCTCATGCGGACTTCAGAACTTACGTTCTCCCGTTTTTCCTATGCCTGTGCCTAATATTGTTGCATAATTGAGGTACTTTATAAAATTTTTGGTGCAGATGCAACATATGTTTAATTGTGTAAGGATACTCCATACTACTTCTTGGAATTCAAAATACAAACACTAATACAGAATACACAACAACTTCCAGCCAGTTCGAGAGGGCTGGTAACCTCTCCACCAAGTACAACTGCTTACACAAAATACCAAAAGATAGGAACTTCCTACTAACTTCCCCCTATTTATCCCACCTTCTCCTTTCTCTCTCTTCTAACCACTTAACTAACTGATCCCCAAGTGAGGATCAACAAAGAACTTCTGATGGAATGTTGGAAATTGGTGCCGAAGGTCAACAACTGATTCCCACGTGGCTTCCTCTTCAGGCAAATGAGACCATTTAATTAGCGCCAAATGAGACCATTTAATTAGCGCCTCTTCCATTCCAGTAACCGGATCCAGGCGAGTAGCAAAACCATCTTCAGGTTCCGCAACCCATTCTAAATCCGAAGTGATCCAAGGAGTAAAAGGTTGAACCGCAACATGAGAGCCCACAGCCTTTTTGAGCTGAGAGACATGGAACACCGGATGGATAGTTGCCTGGGGGGGGGTAATTTAAGTTTGTAAGCCACCTTTCCAATGCGTTGTAGCACCTCAAAAGGTCCGAAAAACTTTGGAGCTAACTTCTCATTCTTTTGTTTGGCAACAGACTGTTGTCTATAGGGCCGAATCTTCAGATAGACCCAATCTCCTTCATTGAACTCGACATCTCTTCTTTTCAGGTATGCAAATTTTTTCATTCGGTTGTGAGCGTGCCTTAAGGATTCCTTAAGTCGGTCAATCATCAAGTCCCGATTGACTAACTGCTGATCAAGCGTTGCATTAGCAGTCTTTTGACTCCCATAAGATGTAAGATATAAGTGGAGGAGGAGCTCGACCATAGACAATCTGAATGGTGCAGTAGTAATCGATACAGGATAAGTAGTATTGTACCAGAATTTAGCCCATGGAACCCACAAACTCCATTGTTTGGGAGTGTCATTGCCGAAACAACGGAGATAAGTCTCCAGACATTTATTCACTACTTCGGTCTGCCCATCAGATTGAGGGTGATATGCGGTGCTGCGACGTAGTTGTGTTCCTTGAACGCGAAACAATTCCGACCAAAAATGGCTAACAAAGATTTTATCCCGATCAGAAACAATGGATTGAGGAAAACCATGTAGGCGAACAACCTCCTTAACAAACACCGCAACAATGGACTTGGCCGTATAAGGATGAGTGATAGGAATGAAATATCCATACTTGCTCAAATGATCCACCACAACTAGCATGGAGGTGAAGCCGTGAGATCTGGGCAACCCCTTAATGAAATCCATGTTAATGTCCTCCCAAATGCGATTAGGGATGGGTAACGGTTGCAACAACCCTGCTGGTGCCACAGCCAAAGTCTTGTTGCTTTGACATATCGAACAACGAGCCACATAGGATTTAACTTCCTCCTTTATACCTTGCCAATACAGTTCGCCCGTGAGGCGTTTATATGTTCGTAGGAATCCAGAATGTCCCCCTAACACTGAGTCATGATACATGTTTACGATAGCTGGTATTAGAGAAGAAGTCTTTGATAGAACTAACCTCCCTTTGTATTTCAATACACCCTGATGGAGCTGGAACTTGGATCCACTGTCTGGTGTGGCCGATAATTCCGCTAGGATAGCTGATAAATAAGGGTCTTCCGCGACTTCCTTAGATATGAGGTCAACATCCAAGAGCGTGGGAGCTGTTAAAGCACCCAAGAGAGCAACCGGAGTGACCCTAGATAATGCATCAGCGGCCTTATTCTCTTGATGGGGTTTATATTGAATCTCAAAACTATAATCGAGTAGCTTAGAGACCCATTTCTGGTATTCTGGTTGCACCACCCGCTGCTCCAAAAGAAACTTCAAAGCCTGCTGGTCCGTCCGGACAATGAAACGTTGACCTAGTAAATAGGGTCGCCAACGCTGCACAGCCATAATCACAGCCATAAGCTCCCTTTCATAAACTGATTTGGATTGAGCCCGAAGAGAAAGTGTATGATTGAAGTATGCCACCGCCCGTTGTCGTTGTGACAGTACAGCTCCCAAACCATAACCTGAAACGTCTGTCTCAATGACAAAAGGAACACTAAAGTCAGGTAGTGTTAAGACCGGTAGAGTAACCATGGCTTGCTTGAGTTTTTTGAAAGCTTGTGTAGCTTGCTCACTCCAAATGAAAGAATCCTTCTTTAACAGTTGAGTTAAAGGTGCTGCTAGCGTACCATAATTGGCCACAAAACGTCTGTAATAACCTATGAGCCCCAAAAATCCTCGAAGCTCCTTCAGATTCTTAGCTTGAGGCCATTGCAACATTGCCCTTACCTTCTCCGGATCCGCCTCGACTCCATTGGTAGATATCCAATGCCCCGATATTCAATTCTGTCTTGTGCGAAGCTGCACTTTTTTAAGTTAGCAAACAAACCATTATCCCACAAGACATTGAACACCATAGCTAAATGAGTCAAATGAGACTTCATATCAGGTCTATAAATCAGTATATCGTCAAAGAAAACCAACACACAATGTCGAAGAAAGGGACGAAAAACCTGATTCATGAGTGATTGAAAAGTGGACGGAGCATTGGTTAACCAAAAAGGCATGACGAGAAACTCATAGTGCCCATCGTGAGTTCGAAATGCCGGTTTAGGAACATCTGCCTCGGCCACCCGTATTTGATGATACCCTGATCGAAGGTCAATCTTGGTATACACCCGAGATCCATACAGTTCATCTAACAACTCTTCAATGATCGGTATAGGAAACTTGTCCGGCACGGTAGCATTGTTGAGAGCTCTATAGTTCACACAGAAACGCTAGCTCCCGTCCTTCTTCTTCACTAAAATCACATGGCTTGAATAGGGACTGATGTTAGGTCTGATTATGCCGGTGGCTAACATTTCCCCGACCAAACGCTCAATTTCAACTTTCTGGGCATGAGCATATCTATATGACCTCACATTAACCGGTTGTTCACCTTCTTTCAGTTGTATGCGATGGTTGATAGCCCGTGATGGAGGAAGTTCATCTGGCTGCCTAAAAAGCGTATCGAACTCTGTCAATAAATTCTTCACTTCCATCGGAACATCGGGAAATTGTTCACCAGCTTCATTTGATCCGTCCTCGTCCACAGTTGTTATAGCACGAAGCTCAACCAAGAAACCTTGATCAAGAGGATCCCATGCTCGTGAAAGTCATTTGAAGGTGACTTCCTTTTGAGTTAATGATGGATCTCCCTTCAATTGGATCTTCCGGCCATCCCTTTTGAACGTCATTAACAAAGCTGGCCAATCAACCTTCATTGTTCCCATTCGTTTCAGCCACTGCATACCCAAAACGACATCCAAACTGCTCAATTCGAGTGGTAAGAAGTCCTCCTTAACTGTTAACTCTAGCAATTCCAGCACAACTCCCTTACGTATGCCTCTCCCTTTTGACTGCTAATCCAGTCCCCATGATGACTCCATAATGAGTGGTCTCCGAGCAATGTAGTTTCAACTCCTCTGATAAAGATTGAGCAATAAAATTATGGGTCGCCCCACAATCAATAAGAATAACCACTTCACGCCCTTGTATCTGTCCCTTTAGCTTCATGGTCCCCGGCGTTGTAAACCCTACAACCGTGTTGAAGGCAACAAACTAAACAGCTTTGCCCTTCTCGTCAACCGGCGCACACACTTCCTCAATTACCTCTTGTTCATCATCGTCCTCCCCAATGTCATCATTTTGCACGACGTAAACACGGAGTTGAGGATTATTACACTTATGCCCAATGGAATATTTTTCCTCACAGCGGAAACAGAGCCCCTGCTCCTTGCTCTTTAAATACTCCGCCTCAGTTAATCACTTCTCATTATGACCTGCAGGCGTTCGTTGTATGGGGACCGTCGGAA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MMVEDLGIEAKEAAVREVAKLLPLPELLHSISSIKADYITRQQANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLSLSEKSINQIRENFISIEKLCQECQTLIENHDQIKLLSNARNNLLTTLKDVEGMMSISVEAAEARDSLSDDKELINTYERLTALDGKRRFALAAAASHKEEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLWEHISNFYKLSKESPQTLVRAIRVVEMQEILDQQLAEEAAEAEGGGAMATVANPRRTTKKSTTATASSRNLTQQKLKAQGKAYKDKCYEQIRKTVEGRFSKLLNELVFEDLKAALAEARTIGEELGDVYDYVAPCFPPRYEIFQLMVNLYTERFIQMLRLLSDRANDLTNIETLKVTGWVVEFQENLIGLGVDESLAQVCSESGSMDPLMNSYVERMQATMRKWYLNILEADKVQPPKKTEDGKLYTPAAVDLFRILGEQVQIVRDNSTDVMLYRISLAIIQVMIDFQAAERQRLEEPASEIGLEPLCAMINNNLRCYDLAMELSNSTIEALPQNYAEQINFEDTCKGFLEVAKEAVHLTVSVIFEDPGVQELLVKLYQKEWCEGLVTEYLVATFGDYFTDVKMYIEERSFRRFVEACLEETAIVYVDHLLTQKNYIKEETIERMRLDEEVLMDFFREYISISKVESRVRILSDLRELASAESLDFFTLIYTNILEHQPDCPPEVVEKLVGLREGIPKKDAKEVVQECREIYENSLVGGKPPKSGFVFPRVKSLTQSKATIWRKLT Homology
BLAST of MC04g1388 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94AI6 (Exocyst complex component SEC6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SEC6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1301.6 bits (3367), Expect = 0.0e+00 Identity = 669/756 (88.49%), Postives = 713/756 (94.31%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54BP6 (Exocyst complex component 3 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=exoc3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 258.8 bits (660), Expect = 1.9e-67 Identity = 197/770 (25.58%), Postives = 369/770 (47.92%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6KAR6 (Exocyst complex component 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Exoc3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 95.9 bits (237), Expect = 2.1e-18 Identity = 149/763 (19.53%), Postives = 299/763 (39.19%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0V8C2 (Exocyst complex component 3 OS=Bos taurus OX=9913 GN=EXOC3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 1.1e-16 Identity = 145/746 (19.44%), Postives = 298/746 (39.95%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O60645 (Exocyst complex component 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 1.3e-15 Identity = 151/750 (20.13%), Postives = 296/750 (39.47%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. NCBI nr
Match: XP_022133786.1 (exocyst complex component SEC6 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1454 bits (3763), Expect = 0.0 Identity = 756/756 (100.00%), Postives = 756/756 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. NCBI nr
Match: XP_008456686.1 (PREDICTED: exocyst complex component SEC6 [Cucumis melo] >TYK04442.1 exocyst complex component SEC6 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1409 bits (3646), Expect = 0.0 Identity = 729/756 (96.43%), Postives = 743/756 (98.28%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. NCBI nr
Match: XP_004140937.1 (exocyst complex component SEC6 [Cucumis sativus] >KGN46092.2 hypothetical protein Csa_005176 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1408 bits (3645), Expect = 0.0 Identity = 729/756 (96.43%), Postives = 744/756 (98.41%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. NCBI nr
Match: XP_022962419.1 (exocyst complex component SEC6 [Cucurbita moschata] >KAG6602219.1 Exocyst complex component SEC6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7032899.1 Exocyst complex component SEC6 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1403 bits (3632), Expect = 0.0 Identity = 729/754 (96.68%), Postives = 740/754 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. NCBI nr
Match: XP_022990251.1 (exocyst complex component SEC6 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1403 bits (3632), Expect = 0.0 Identity = 729/754 (96.68%), Postives = 740/754 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BW55 (Exocyst complex component Sec6 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006267 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1454 bits (3763), Expect = 0.0 Identity = 756/756 (100.00%), Postives = 756/756 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BZV5 (Exocyst complex component Sec6 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold409G00410 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1409 bits (3646), Expect = 0.0 Identity = 729/756 (96.43%), Postives = 743/756 (98.28%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3F1 (Exocyst complex component Sec6 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496559 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1409 bits (3646), Expect = 0.0 Identity = 729/756 (96.43%), Postives = 743/756 (98.28%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JMF6 (Exocyst complex component Sec6 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487186 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1403 bits (3632), Expect = 0.0 Identity = 729/754 (96.68%), Postives = 740/754 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HH11 (Exocyst complex component Sec6 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111462863 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1403 bits (3632), Expect = 0.0 Identity = 729/754 (96.68%), Postives = 740/754 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. TAIR 10
Match: AT1G71820.1 (SEC6 ) HSP 1 Score: 1301.6 bits (3367), Expect = 0.0e+00 Identity = 669/756 (88.49%), Postives = 713/756 (94.31%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g1388 vs. TAIR 10
Match: AT1G71820.2 (SEC6 ) HSP 1 Score: 1225.7 bits (3170), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/800 (81.00%), Postives = 691/800 (86.38%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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