MC04g0965 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTAGTTTTAGTGGCAGTCGCTCTTCTTTCCCATCAACTCCCTCTCATCAGTAAGAAGCTTTCTCGAATACAACACTAGTCATTTTAATTTTCATCTTACCAATAAAAAACACCCTTAATTTACGTTGGCAGGTGGTTTGGGCGGCATCGGAGTGAACTATGGACTTAACGGCGACAATCTGCCACAACCAAGTGATGTGATAAACCTGTATGGACGGTGCGGGATCGATATCGTGCGGATATTTGAGCCGAACCACGGTGTTTTGGATGCGTTGCATGGCAAACCAAATGCTTTGTGGTTGGGAACCAGAAATGAAGATATACACAGCTTCGCCACTGACCAAATGGCGGCCAATGCTTGGGTTAATGCTCACGTGCTTCCTTATTATGCAGATGTTAATATCGAATACATCACCGTTGGCAATGAAGTCGTCCCTGCTGACCCAGCTACACCTTTTGTTGCCAATGCAATTAGAAATATAATGCAAGCGCTCGTCACTGCCGGCATAAAAAAGGACATCAAGGTGATATTTTAAATTAAAGTTTAAATTATAAATTTGGTCACTAAACTACCATATTACTATAAATTTAGTCTACGTAATTTTAAAAGTTTCAATTTGATCTTCTATTATTTCGATTTAAGTTGCCATTTAGTTGATATAGTTTTAAATGAGCTAATTTAGTCTCTTAGTTACACACCAGTAAGTTTCTTTTATGGTGTGGCGTGTAATTTCATTAGTTTCACTTTTACTATATTAATAAAAAATGGATATATTATGTAATAAAAAAAATGGATATATTAAAAACTCTGAAACATCACATTGGAAAATAGGGAATCAGGGTGTAGCAAATTTTGTTTTTTTTTTTTGTTTCTTTTTCTCGATTTAGTTGTAGTTTTAAAAATTTCAGTTTAATCTTTACCATTTGAATTAATTAATTTTAGGTTAGTAAATATAATTTTAAAATTGGTCAATATAATTTGGGTTTTACTCAATTAAATTTTTGTGCTTTTAATTTATATTCAATTTAATCTCTTTATATTTATTTTATCTTTATTCTTAAATTATAAATTTCCCTCACCATAGGTAACCACGGTGGTCCACATGGGCGCCATGGGAGTCTCATACCCTCCATCCGCTGGAGTATTCACTGTCGCAGCTGCGGGACCTCTGAGCGACATCGCAAAGGTGGTGGGCTCGAGCGGTACACCACTATTGCTGAACGTGTACCCATATTTCGCGTATGCATCAAGCCCACAACAAATTCCACTAAATTATGCTCTCTTTACTTCCACGACACCGGGAGTGGTGGATGGAAATCTGAACTACTACAATCTGTTTGATGCCATGGTGGATTCTTTCTATGCGGCACTAGAGAAGATTGACGCTGCCAATGTCAGACTAGAGATTTCAGAGACTGGGTGGCCGACCAAAGGGAATGAGCCATTCACCAGCGTTGAGAATGCAGTGACGTATAACAAAAATTTTATGAACCATGTGGCGAGTGGAGCAGGAACTCCGAGGAGGCCAAATGTGAAATACAATGGGATTTTGTTTGAGATGTTCAATGAGGATCTTAAGGCAGCTGGAGTTGAGCAGAATTTTGGGTTTTTTTATCCGAATATGCAGCCAGTTTATCCATTTTGGAATTGCTAGTGAAGAAAAAAAAATAATAAATAAATAAATATGTCTCAGTCAAAATGTTACTTGCATTCAAATGTTGCAACTCATTAGATTTGTTGCTCTAAAATTTTCAATTGCATCCATTATATGTAAATTTTAAAAATTTTTAAAATTGTTGACACCATCGTGGGAATTTAAATCAAACTTGCGACTTTAAAGAAATGATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTACCACTACTTTGAGAACAACTACTTATGGGATAGGAATTCAAACTCTAATCGACAAATGATATATACATACTACTTTGAGAACAACTACTTATGGGATAGGAATTCAAACTCTAATCGACAAATGATATATACACACTACTTTGAGAACAACTACTTATGGGATAGGAATTCAAACTCTAATCGACAAATGATATATACATACTACTTTGAGAACAACTACTTATGGGATAGGAATTCAAACTCTAATCGACAAATGATATATACAGCTATGTTTAGATAGACTTAGAAAAGAAATGATGTGGTTTTGTAGCATGCTTAGATTGCTAGAAAATGAAAATTGATGCAAAAATAAAATTATTTTTTTTAAACAACAAATATCAATTATAACAAGTCTTATTTAAAGGCTAAAAAGAATAGATTTGCATACTTAGTTGAGAGTTATTTATGATGAAAAATATATGATCATGCATCTATCTTAGCAAAAATGTGCATGTTTTGTGATTAAGGACTTGGGCATTTAGTTATAGGTAATGAGGACTAATCTGTGTAATATGTTTATTTTATAAGGAAAAATTGAACCTTGGTGATCACAATGCGTTAGGCGCATCACACTCCCAGAATTTCCAGCTTACTAGGGTAATGCGCTAGCCACACTACTTTGAAAGATCCAACTTCACTATGCTTCAACCATATTCGATGCCTAGATTATCAAAACGTGAATAACCACTTTTGACCAAGTATTGGTCCAATATCTGGTTGTTTCCTATTACTCGTAAATCTGATGTTCCTGTTGTGTTTAAACGTTTTAAGCCTCTTGTTGAGAATCGATTCTCTTCTCGTATTAAAATTCTTCATAGTGATGGTGGGGGAGAATTTGTCAATCATACTTTGGGTTCTTTTTTGCATGAAAATGGTATTCTACATCAAAAATCTTGCTCCTACACTCCTCAATAAAATGGAACTGCTATTGTGGAGGTCGCTTTAACTCTAATGTCCAAATCTTCTCTTCCCTTAAAATTTTTGCCTTTTGCCTTTGCTACAGCTGTTTTCATTATCAATCGACTCCCTTCTCCCTTACTATCTCACAAATCTCCTTTTGAGTTACTATTCCAACGACCTCCTGATTATTCCACCCTTAAAACATTCGGGTGTGCCTGCTATCCCTTGTTAAAACCATATACCACACACAAATTACAACCCAAAACTTCACAATGTATCTTCCTAGGCTATTCGTTAGATTATAAGGGATACTTGTGCTACAACATGAGCAACGGTCGACTCTATACCTCTAGCCATGACGTTTTTGATGAGTCTCTATTTCCCTTTTCTCTTCCTTCTTCACCTGCTAATTCTCCTTCTTCCTCTTCCTTGTCTCAACTTCCTCTTTCTCTTTTATTTCCCTATGATCCTTTACCTCACTCACCTATCATGCCTCCCATTCCACCTATTTTGCCTTCCATGTCTCCTATTCAGCCCAATTTAATATCATACCAACCCTGCCACTTATCCCAACTACTTCACCTAATCCTCCATCTCTTTCACCTATTGAACCCAATTTCCATTCCACTACACCTATTCATCCAAATTCTACCTCTCCTTTATTACATTCCTCATTGCCAATTCATACACCTTCTTCACCTTGTCCGGCTATGCCTATGGGCTCTGCTTCAGATCCATTGATTCATGATTTTGTAGCTTCTGGGATAAATTCTCCTTCAGTAGTGACTATACCACATAATACTCATCCTATGCAGACTCGTGCTAAGTCGGGTATTTCCAAGAGGAAAGTGTTCATGGCAACCTCTCTACCTAGTTCATATGTTGAACCTACTTCGTTTATTACTGCATCTAAGTTGTCTGTCTGGAGAGATGCCATGGCTGAGGAATTTAATGCTTTAATCCGGCAAAATACTTGATTTCTTACTCCTCTCCCAACGGGTAAAATAGCTATCGGTTGCAAATGGGTGTATCGTGTTAAACATCACCCCGATGGAAGTGTTGTGAGACATAAAGCTAGGTTGGTTGCCAAGAGGTAGTATTGATTATGAAGAAACCTTTAGCCTGGTTGCCAAGAAACCCATCAATTGGATGTTAAAAACGCCTTTCTCCATGGTGAACTTCAAGAGGAAGTGTTTATGCAACAACCTCAAGGGATTGTTAGTTCTTCTCATCCTCATTACGTGGGCAAGCTTTTAAAGTCGCTCTAGGAGCTTGTTTTGAATGTTTTACCTCTAATTTACTAACCCTTGGTTTTGAAGCTTCACATGCTGATTCATCCCTTTTTGTGTGCATTTTAATGATTCTATCACATATCTCCTCTTGTATGTTGATGACATTATTATTACCGGCAGTCATCATGTTTATATTAAGTAGTTGATATCCCAGCTTCGTTTACGTTTTGAAATGACTGACTTGGGTGTCTTGCGGAATTTTCTTGGACTTGAAGTTAGTTATTCTTCTGTTGGGATATCTGTTAATCAAGCTGAGTATGCCCGCGATGTGCTTACTTGGTTTGGTATGCTTGCTTCCAAACTTTGTCATACTCCTATTGCACTTATTGCTTCATCTGATGTTGGTTCACCCTGTACTGTCGAGAATGCTCATACTTATCGAGCTATGGTTGGTGCCTTGCAATATCTCACATTTACTCGATCAGATATCACGTTTTCTGTTGGGAAGTTATCTCAACATATGCATGCCCCTTACGTTTTCTGTTGGGAAGTTATCTCAACATATGCATGCCCCTTTTTCATCTCATTTGATTGCAGCTAAACGGGTATTGCGCTATATAAATGGTTTTCTTCATGCCGGTCTTTTGTTCAAGAAAAGTGGTTCTATTGATGAAGCTCTTAGGCTTCGAGCCTTTTCTGATTCGGACTGGGCTGGTGACACCCTTTCGATAGACGATCTACTACTGGATTTGTTGTTTTCTTGGGCTCAAATCCTATATCTTGGGCTGCTAAGAAACAGTCCACTATTTCTTAGAGTTCTATGGAGGCTGAATATCGAGCTCTTGCCATCACTGCGGCTGAAATTTCTTGACTAAGACAGCTTCTTAAAGATTTTCGTCTCTTCAGCCCTTACCCGCCTATCCTATAC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CTAGTTTTAGTGGCAGTCGCTCTTCTTTCCCATCAACTCCCTCTCATCAGTGGTTTGGGCGGCATCGGAGTGAACTATGGACTTAACGGCGACAATCTGCCACAACCAAGTGATGTGATAAACCTGTATGGACGAAATGAAGATATACACAGCTTCGCCACTGACCAAATGGCGGCCAATGCTTGGGTTAATGCTCACGTGCTTCCTTATTATGCAGATGTTAATATCGAATACATCACCGTTGGCAATGAAGTCGTCCCTGCTGACCCAGCTACACCTTTTGTTGCCAATGCAATTAGAAATATAATGCAAGCGCTCGTCACTGCCGGCATAAAAAAGGACCAAGGCGGTTTGGGCGGTATCGGAGTGAACTACGGACTTAACAGCGACAATCTGCCGCAATCAAGTGATGTGATAAACTTGTACGGATGGTGTGACATCGATATCGTGCGGATATTTGAGCCGAACCAAGCTCTGTGGTTGGGAACCAGAAATGAAGATATACACAGCTTCGCGACCGACCAAATGGCAGCCAATGCTTGGGTTAACGCTCACGTGCTTCCTTATTATGCAGATGTCAATATCGCATACATCACCGTTGGCAACGAAGTCGTTCCCGCCGACCCAGCTTCGCCTTTCGTTGCTAATGCCATTAGAAATATAATGCAAGCGCTTGTCATAACCGGCATCAAAAAGGACATCAAGGTAACCACGGTGGTCCATATGGGTGCAATGGGAGTCTCATATCCTCCATCCGCTGGAGCATTCACTGCCGCAGCGGCGGGACCTTTGAGCGACATCGCAAAAGTGGTGGCCTCCAACGATGCACCACTATTGTTGAACGTGTACCCATATTTTGCGTACGCATCAAGCCCACAACAAATCCCACTAAATTATGCCCTCTTCACTTCCACGACACCTGGAGTGGTGGATGGAAATCTGAACTACTACAATCTATTCGATGCCATGGTGGATTCTTTCTATGCAGCGCTGGAGAAGATTGGCGCTGCCAATGTCAGACTAGAGATTTCAGAGACTGGGTGGCCGACCGAAGGGAACGAGCCGTTCACCAGCATTGAGAATGCAGTGATGTATAACAAAAATTTCATGAACCATGTGGCGAGTGGAGCAGGAACTCTGAGGAGGCCAAATGTGAAGTACAATGGGATTTTGTTTGAGATGTTCAATGAGGATCTTAAGGCAGCAGGAGTTGAGCAAAATTTTTTCTTTTATCCCAATATGCAGCCAGTTTATCCATTTTGGAATTGC CTAGTTTTAGTGGCAGTCGCTCTTCTTTCCCATCAACTCCCTCTCATCAGTGGTTTGGGCGGCATCGGAGTGAACTATGGACTTAACGGCGACAATCTGCCACAACCAAGTGATGTGATAAACCTGTATGGACGAAATGAAGATATACACAGCTTCGCCACTGACCAAATGGCGGCCAATGCTTGGGTTAATGCTCACGTGCTTCCTTATTATGCAGATGTTAATATCGAATACATCACCGTTGGCAATGAAGTCGTCCCTGCTGACCCAGCTACACCTTTTGTTGCCAATGCAATTAGAAATATAATGCAAGCGCTCGTCACTGCCGGCATAAAAAAGGACCAAGGCGGTTTGGGCGGTATCGGAGTGAACTACGGACTTAACAGCGACAATCTGCCGCAATCAAGTGATGTGATAAACTTGTACGGATGGTGTGACATCGATATCGTGCGGATATTTGAGCCGAACCAAGCTCTGTGGTTGGGAACCAGAAATGAAGATATACACAGCTTCGCGACCGACCAAATGGCAGCCAATGCTTGGGTTAACGCTCACGTGCTTCCTTATTATGCAGATGTCAATATCGCATACATCACCGTTGGCAACGAAGTCGTTCCCGCCGACCCAGCTTCGCCTTTCGTTGCTAATGCCATTAGAAATATAATGCAAGCGCTTGTCATAACCGGCATCAAAAAGGACATCAAGGTAACCACGGTGGTCCATATGGGTGCAATGGGAGTCTCATATCCTCCATCCGCTGGAGCATTCACTGCCGCAGCGGCGGGACCTTTGAGCGACATCGCAAAAGTGGTGGCCTCCAACGATGCACCACTATTGTTGAACGTGTACCCATATTTTGCGTACGCATCAAGCCCACAACAAATCCCACTAAATTATGCCCTCTTCACTTCCACGACACCTGGAGTGGTGGATGGAAATCTGAACTACTACAATCTATTCGATGCCATGGTGGATTCTTTCTATGCAGCGCTGGAGAAGATTGGCGCTGCCAATGTCAGACTAGAGATTTCAGAGACTGGGTGGCCGACCGAAGGGAACGAGCCGTTCACCAGCATTGAGAATGCAGTGATGTATAACAAAAATTTCATGAACCATGTGGCGAGTGGAGCAGGAACTCTGAGGAGGCCAAATGTGAAGTACAATGGGATTTTGTTTGAGATGTTCAATGAGGATCTTAAGGCAGCAGGAGTTGAGCAAAATTTTTTCTTTTATCCCAATATGCAGCCAGTTTATCCATTTTGGAATTGC LVLVAVALLSHQLPLISGLGGIGVNYGLNGDNLPQPSDVINLYGRNEDIHSFATDQMAANAWVNAHVLPYYADVNIEYITVGNEVVPADPATPFVANAIRNIMQALVTAGIKKDQGGLGGIGVNYGLNSDNLPQSSDVINLYGWCDIDIVRIFEPNQALWLGTRNEDIHSFATDQMAANAWVNAHVLPYYADVNIAYITVGNEVVPADPASPFVANAIRNIMQALVITGIKKDIKVTTVVHMGAMGVSYPPSAGAFTAAAAGPLSDIAKVVASNDAPLLLNVYPYFAYASSPQQIPLNYALFTSTTPGVVDGNLNYYNLFDAMVDSFYAALEKIGAANVRLEISETGWPTEGNEPFTSIENAVMYNKNFMNHVASGAGTLRRPNVKYNGILFEMFNEDLKAAGVEQNFFFYPNMQPVYPFWNC Homology
BLAST of MC04g0965 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22317 (Glucan endo-1,3-beta-glucosidase OS=Musa acuminata OX=4641 GN=BANGLUC PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 281.2 bits (718), Expect = 2.0e-74 Identity = 147/310 (47.42%), Postives = 200/310 (64.52%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O49352 (Probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase BG4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BG4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 255.0 bits (650), Expect = 1.5e-66 Identity = 137/312 (43.91%), Postives = 191/312 (61.22%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O49353 (Probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase BG5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BG5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 247.7 bits (631), Expect = 2.4e-64 Identity = 133/312 (42.63%), Postives = 192/312 (61.54%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P52408 (Glucan endo-1,3-beta-glucosidase, basic isoform OS=Prunus persica OX=3760 GN=GNS1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 226.1 bits (575), Expect = 7.5e-58 Identity = 132/329 (40.12%), Postives = 192/329 (58.36%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q02439 (Putative glucan endo-1,3-beta-glucosidase GVI (Fragment) OS=Hordeum vulgare OX=4513 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 223.4 bits (568), Expect = 4.8e-57 Identity = 131/316 (41.46%), Postives = 182/316 (57.59%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. NCBI nr
Match: XP_023521459.1 (probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase BG4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 572 bits (1474), Expect = 8.16e-200 Identity = 305/496 (61.49%), Postives = 346/496 (69.76%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. NCBI nr
Match: XP_022152302.1 (probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase BG4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 565 bits (1456), Expect = 1.03e-199 Identity = 287/319 (89.97%), Postives = 291/319 (91.22%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. NCBI nr
Match: XP_022135630.1 (probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase BG4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 533 bits (1372), Expect = 4.29e-187 Identity = 266/319 (83.39%), Postives = 286/319 (89.66%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. NCBI nr
Match: XP_022141986.1 (probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase BG4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 518 bits (1334), Expect = 3.58e-181 Identity = 264/319 (82.76%), Postives = 283/319 (88.71%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. NCBI nr
Match: XP_016899853.1 (PREDICTED: probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase BG4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 523 bits (1346), Expect = 2.24e-178 Identity = 310/643 (48.21%), Postives = 354/643 (55.05%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DFU0 ((1->3)-beta-glucan endohydrolase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020050 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 565 bits (1456), Expect = 4.98e-200 Identity = 287/319 (89.97%), Postives = 291/319 (91.22%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C1J7 ((1->3)-beta-glucan endohydrolase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007535 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 533 bits (1372), Expect = 2.08e-187 Identity = 266/319 (83.39%), Postives = 286/319 (89.66%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKU8 ((1->3)-beta-glucan endohydrolase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012224 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 518 bits (1334), Expect = 1.73e-181 Identity = 264/319 (82.76%), Postives = 283/319 (88.71%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DV56 ((1->3)-beta-glucan endohydrolase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487671 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 523 bits (1346), Expect = 1.08e-178 Identity = 310/643 (48.21%), Postives = 354/643 (55.05%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V7B6 ((1->3)-beta-glucan endohydrolase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold548G002240 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 515 bits (1326), Expect = 1.68e-175 Identity = 310/655 (47.33%), Postives = 355/655 (54.20%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. TAIR 10
Match: AT1G77780.1 (Glycosyl hydrolase superfamily protein ) HSP 1 Score: 261.5 bits (667), Expect = 1.1e-69 Identity = 141/313 (45.05%), Postives = 190/313 (60.70%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. TAIR 10
Match: AT5G20330.1 (beta-1,3-glucanase 4 ) HSP 1 Score: 255.0 bits (650), Expect = 1.1e-67 Identity = 137/312 (43.91%), Postives = 191/312 (61.22%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. TAIR 10
Match: AT5G20340.1 (beta-1,3-glucanase 5 ) HSP 1 Score: 247.7 bits (631), Expect = 1.7e-65 Identity = 133/312 (42.63%), Postives = 192/312 (61.54%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. TAIR 10
Match: AT1G77790.1 (Glycosyl hydrolase superfamily protein ) HSP 1 Score: 246.9 bits (629), Expect = 2.9e-65 Identity = 147/330 (44.55%), Postives = 194/330 (58.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0965 vs. TAIR 10
Match: AT1G33220.1 (Glycosyl hydrolase superfamily protein ) HSP 1 Score: 239.6 bits (610), Expect = 4.6e-63 Identity = 127/310 (40.97%), Postives = 186/310 (60.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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