MC04g0004 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptideutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGTACGCACATGCTCCTCAAATTAACTCACGTCCATGGAGTTCTGTTCTTGTAACTATGCGTGCAAGAAGTCTATGCCCATTTGGATCACTTAACTTCAGAAAATTTGGGAGGGATGAAATATGTTCCCCCACTGGAAAATTGACAAGGGCCACTGGTGATGGCAGCTTCCGGAGGGTTGCTGATGAAGAGGAGAAAGAAGTTGAAGAAGAAGACGCATTTCAAGTGTTGACCGCTATAACTAGCAATTACAATGACATTGTAATTGTAGAAACCCCCAAATCCAGAGTGCTGCTACTCGACTCTTCTAGTACACTACTGCTCCTGCTCTCGCTTATTCTCAATTTCGTTCCTTCATGACCTTCTAACCTCTTCCCCCGTGTTGACGCAGATAATGTCCACAGCATTCTTTACAAGGAGCAGAAGTGGACAGGTTCTTACTGGGTCAGTAAACTCGGTCTCCTTTGTCTCTCTCCATGCGCGCGCACATTTACACGGATACACACACCAACCTGTAAAGCTATTATCTTCAACTAAAAAGAATCAATAAATATTGTAATTGGACAAAAATCTTCCATTCGCACTTGTCTGCTTTGTTGGTCTCAGCTATATAGCATTTATGTTTTGTGTTATTAGCTTGTTACTGCAGTCGACTCAAGCTATGTTGTAAGTTGTAATGAAGATCATTATACGACACTAAAGAGGACACGTGGAATAGAAATGGACTTCCATTTTCTAAGAGCTATCACTTAGAAATACAAGTCTATACAAATGCAATTATGCGAATTGGTCTAGTCGAGTGACTAAGAGGAGATTGACTTTAGTCATTTACATTTCTTACAGAACATTTCGTTTCTCAATAGATCAAGGGCGGTACGGTATGCAGTGCAGAGGTAAACTTTAGAGGTCTGACACATGGGATATTGGGTTGCTGACTTGTCATTAGGGCTAGCCGGGAAGTCTGTTGCAAGAAACCAGACTGTCTTTGGTGAACAGAAGATTAGTGGAGTCCATTTGGAGTTCTAAGCACATTGCATGGAAGATCTTGGATGTTTTCAGACCCTATTAGAGGTATTTTCATTTTGTGGATGGACGCTTCTTTTGGTATAGAGGAAGTTGTAGAAGGTTCATTTTCCATTTCTGTCAAATTCTTGCCTGTGAATGAGTTTGGTTTTTGGCATCGTTGCGGTGGTCATTTAAAAAGACGTCTGGGAGTCCATTAAGAAAGTGTATGAAGAGACATAAAGGCTTGTATGCTCTTATTTGCCTAAGTTTCTTAGTGAGGGAGAGTTTTTATCTTATTGCTTGCTCAAGAACCTTGTAAGGGTAAGAGATTCGTCATTGTTAGTGGTGTAACCAAGAGGAGAGAATTTTATTAAAAGGGATTAGTCATCCTTTACAAAGGGAAAGGCTTCCTATTTATACACAAAGGAGCCACGGGCAGAAGAAGCTTAACTAACTGATCTGAAGCTAACTAACTAAAGAGCTGAGTTTCGTTGAGGACACTCATTCGACAGATAGCCAACTTGCCCACAGTGAAAACATTTACCAAGTGTGGGTTGGGCATACGTATTTGTGGTTTTCTTGGCAGTTTGTTGTTCCCAATTTTCACTTCGTCTCTGATGTAACTAAATTCTATCTAGGTTAGTTTAGTTTAGTTGGTAAGGGAGTTAGACTTTTACTGTTATCTACTTAATCCTTTTACCGTGGCCTTCCTCTTATAAATAGGAGGTCCTTATGTCTTTAATTCATTCATTCAATCACAATAAGATTTCATTCCTTTGATCTACACCAAATTGGTATCAGAGCACCAATCTTTGGCTTGTAAATGGCGGGAAAGAAGAGCATGCCGACTTGAGGTAATTCTTCACTCACTGAAAAAGAGGCGGACACCATTGTTGTCCTCTCTCCACGATCCACGACAACCCGTTTAATGATGGTTGGGGGGGCTGTTGAAAACCTCCAATGGAATATGGTAGAGATTCGCCAAATTCTGAATGTCATCGCGGATAAGTTGGATGACCTTAAACTTTGCCAAGATCAACCAAGATCAGCGCATGGAAAAGAGGTGCGGGAGCAAGGAATAAGATTGACACTAATGTTAACAACCCAGCTCCAAGATTCCAACAAGACCCCCTCTTCAAATACCCCTCCCAATGGCCCGTCGAAATTTAGATATTCCTGGTACTCAGGCCAAGAATTCCATAACAGAGGCCCACGCAATTATCAAGAACCAATCTTTTTTCCGCGGCGACAGCAAGACTGGCAGGGGGATCAGGTTGCACACCGAAGATATGGTCGCTTCCCACGGCGCCAGGATTTTCAAGGTGATTCTTCAAGTGATGAAGAGGAGTTCCAACACTGGGGTGATGGTAGACGACAGAACAGAGCACATCAACATCACTAGAGGGAACAAAATGAATACAAAGTGAAGGTGTATCTCCCCCATTCTAATGGAAAGATGGATATCGAAGCCTTTCTTGAGTGGATAAAGAATGTCGAAAGTTTCTTTGAGTAATCATAAAAAGGTAAAGTAAAACTAGTGGCTTTCAAATTGAAAGGGGGGCGCGTTGGCATATGGTGGGAGCAGCTGGAAACGAATAGGCAACGTTTTGGTAAGACTTCTATTTGCAATTGGGAGAAAATGAAAAAACTTATGAGGGCCCGCTTCCTCCCTATCAATTTTGAACAGATCTTGTACAATCAATATCAAAACTGCAAACAAGGGACACGTTCTATTGCCGAATATATGGAAAAATTCCATCGGTTGGGAGCAAGAACCAATCTTGGAGAAAGTGAGCAATATCAGGTAGCTAGATTTATCAGTGGGTTACGGGCAAACATTAAGGACAAGCTACAAATCTAGCCTATTGGATATCTTGATGAAGTTATAGCCACTATAGTCACTGTGGAGGAACAATAGGCTAACCAGTTTAGCATTCAATATCAACGACGAACCGTATGGGACAATCAGGCCAGCTCCTCAAGAAAAGGAACCTCTCTCTTGGACAAAGCCACAACCAGTAACACATCTAGTTTCAAAGCTAAAGGTTCGTATGATAAAAAAACATCAGACTTGGCAGTAAAAAAAACATCCAATACCTATAATAGACCTACTTTGGGAAAGTGTTTTCGTTGCAGGCAAGTCGGACATCTATCAAACGAATGTCCTCAACGGAAGGCCGTCAATCTTGTAGAGGATCTTCAGTACCTTGACATTTCTTGCAATCAAGAATCCAACGAGGAGATAGCCTACCTAGAACCGGATGAAGGTGATCAAGTTTCATGTGTCCTGGAAAGGATCCTTCTTGCTCCAAAGACACCATCAGTCAGCAACGCCACTCTTTGTTCCGCACTAGGTGCACCGTGAATGGAAAAGTCTGCAATATTATCATTGACAGTGAAGTACAGAGAACGTTGTTTCAAGTAAATTGGTAACAACCTTAAACCTTAAAGTTTCTCCTCACCCCACGCCCTACAAGGTTAACTGGATTCGAAAAGGGGGAGAAGCCCTTTTCAACACAATCTGTACTATTCCACTGTCCATTTGAAACAGATATAAGGATCAAATTAAATGTGACGTCCTTGATATGGATGTGTGCCACATCCTCTTAGGACGACCATGGCAATTTGATACCCAAGCTATCCATAAAGGCCGTGAAAAACCTATGAATTTACATGGATGGGCACAACTGTGGTGCTTTTAACATTATCAAGCCCTACGCCCAGTAAACACTTGGATAAAGGGAATTTGTTCCACCTTTGCAGTGCTAAAACACTTCTTCTCCAACACACAGAAACCATCCTAGGCCTTGTTATCATAAACTTTGACACCTCTGACATTTTACAAGATGTCGATGTCCCTCCCGAAGTTCAAACCCTTCTTCATAAAGTCCCTACTCTACTCCAACCCCATGACTCTTTACCTCCCTTCTGTGACATCCAGCATCATATTGATCTCATTCCCGAAGCAACTTTACCTAACCTTCCTTATTACAGAATGAGTCCTATCGAATGCAAAATATTACACGACCAAATAACCGAGTTACTTGCCGAAGGCCATATACAATCCAGCCTCAGTCCTTGTGTTGTTCCAACACTTTTAACCCCCAAAAAAGATGGGTCGTGGAGGATGTGTGTTGACAGTAGGGCTATCAACAAAATTACTATTAAGTACAAGTTTCCTATTCCGCAGATCAACAATTTCTTGGACCAATTGGGAGGCACCAAGTTTTTCTCTAAGGTGGACCTACGAAGTGGCTGCCACCAAATCAGAATCCGGTCAGGAGATGAGTGGAAAACTGCTTTCAAAACCAACGAGGGACTATTCGAGTGGTTAGTGATGCCTTTTGGTCTGTCTAATGCACCTAGCACCTTCATGAGGCTCATGCATCATGTTTTTACTTCCTTTCTTACATAAGTTCATTGTTGTCTATTTTGATGATATTTTAGTCCATAGTAAAACTAGAGAAGAGCACTTATCACACCTAGACTCCCTATTCACAGTCGTAAACAGTAATAAGCTAGTCATAAATCTTAAAAAATGCCTCTTCTTAGTCACAAAGATCTCATTCTTAGGCTTTATAATCGGTCAAGACGGGCTTAAGATGAATCCGTCTAAGATAAAAGCAATTTCTGACTGGCCTCAACCACAATCTATAAAAGGTATACAATGTTTTCTAGGAATAGCTTCTTTCTATAGGAAATTTATTAAGACTTTAGTTCTATAGCAAGTTCCCTTACTAACTGCCTAAAGAAAGGCAACTTCAATTGGGATAAGGACCAAACTACTAGTTTCCTCACGTTAAAAGATAAGCTAACACAAAACCCAGTGCTTAAAATTCCAGATTTTACACAACCTTTCGAGGTGGCTGTGGATGGGAAATATTTTAGTGAGAAACTCAGCCCCTCTAAACAAAACTAGAGCATGTATTAACAAGAACTTTATGCCCTTGTTAGAGCCCTCAAGCAATGGGAGCATTACCTATTAA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BLAST of MC04g0004 vs. NCBI nr
Match: XP_022147906.1 (uncharacterized protein LOC111016725 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 577 bits (1486), Expect = 1.07e-206 Identity = 288/319 (90.28%), Postives = 292/319 (91.54%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. NCBI nr
Match: XP_038876684.1 (uncharacterized protein LOC120069080 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 469 bits (1208), Expect = 5.57e-164 Identity = 244/339 (71.98%), Postives = 258/339 (76.11%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. NCBI nr
Match: XP_022147907.1 (uncharacterized protein LOC111016725 isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 456 bits (1172), Expect = 2.75e-160 Identity = 217/217 (100.00%), Postives = 217/217 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. NCBI nr
Match: KAA0062832.1 (putative polyamine aminopropyl transferase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 456 bits (1174), Expect = 6.24e-159 Identity = 235/335 (70.15%), Postives = 256/335 (76.42%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D1F5 (uncharacterized protein LOC111016725 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016725 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 613 bits (1581), Expect = 3.59e-221 Identity = 305/339 (89.97%), Postives = 305/339 (89.97%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D3S0 (uncharacterized protein LOC111016725 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016725 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 577 bits (1486), Expect = 5.16e-207 Identity = 288/319 (90.28%), Postives = 292/319 (91.54%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D3M5 (uncharacterized protein LOC111016725 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016725 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 456 bits (1172), Expect = 1.33e-160 Identity = 217/217 (100.00%), Postives = 217/217 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V3L2 (Putative polyamine aminopropyl transferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold357G00550 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 456 bits (1174), Expect = 3.02e-159 Identity = 235/335 (70.15%), Postives = 256/335 (76.42%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GJG8 (uncharacterized protein LOC111454843 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454843 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 443 bits (1139), Expect = 5.95e-154 Identity = 236/340 (69.41%), Postives = 253/340 (74.41%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. TAIR 10
Match: AT5G44600.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 253.4 bits (646), Expect = 2.2e-67 Identity = 131/272 (48.16%), Postives = 172/272 (63.24%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. TAIR 10
Match: AT5G44590.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 236.5 bits (602), Expect = 2.8e-62 Identity = 132/288 (45.83%), Postives = 165/288 (57.29%), Query Frame = 0
BLAST of MC04g0004 vs. TAIR 10
Match: AT5G63100.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 152.5 bits (384), Expect = 5.4e-37 Identity = 91/227 (40.09%), Postives = 132/227 (58.15%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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