
MC03g0008 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5CDSpolypeptideutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTCGGATTGTCGTCTCCTCCACTTTGGTTCCCCTTCTCCCCGTAGACGAGAAATCCTCCACTCCAGTGAAGAAGAATCCCTTATTTATCTATTTAATTTTTGCGTTCCTTTCGTTGTTCATTCCCATGATATGGAAGCAGTGGCGGAGGGACTGTGGAGGCTGGCAGATTACCACGAGAAGAAGGGTGAAATAGGAAAGGCAATAAAGTGCCTGGAAGCCATATGTCAGAGTCAAGTGTCATTCTTTCCAGTCGTTGAGGTCAAGACCCGACTTCGCATTGCCACCCTCCTACTCACTCATTCTCACAACGTCAATCACGCCAAATCCCATCTTGAGCGTTCTGTATGATACTTTTTTTTTTCTTTTACCCGTATTTTCCTTGGATAATGATGTAGAGTGAGGGAGAAATTTGATATCAATGATGATTTTTAATTTCGCGGGCAGCAATTGTTGCTGAAGTCTATTCCATCATGCTTGGAACTGAAGTGCCGGGCTTATAGCTTATTAAGCCAGTGTTATCATCTCGTTGGGGCTATTCCTCCCCAGAAACAGATTCTTTATAAAGGTCTTGATCTCACCAATTCATCTGGTCATGAGTAAGCACTCATCCTATTTCCGTATGCCTAATCGGCCTTTTTTTTTTCATTCCTCTCATTTTCTGTTGGTATTGCACTTATTTAAGACTGTCAGTGAAGCTATGGTCTTGCAACTTCAATTCACAGCTAGCAAATGCCTTGATTATTGAAGGAGACTATCAAAACTCAATCTCTGCCTTGGAGTCGGGATACGTATTTTCTGTTGAGATATGCTATCCCGAATTGCAGGTTGGTAAATAAGCTTCTGTATTCGTGTCCCACTTTCTTTATTCCTCTGGAAGTGCATCTTCTTGTTGTTTCTGTAATATTTGAGTGGCATTGTTTTTCATGCTCCATCATGATTTGTACGCGGAATATGACTTCCCATACATTGAATATGACTTGTTTGCATGGACCATCGCCCCTCTGTTACATTGCATTTTTTTGTATTATTTTAGAGAAAGAAAGACCTTTCGTTAAAAACGAATATATAGAAAAATGGAGGACGAGACATCCTTAAGAAAATGTCTAGGAGGTTACATAAAAGTACTCCAATTGGAGTCTATATTTAGAAGAGTGTAATTAAACAGACAACTATTCGGAGCTAGACTACTCACCCCTATTCTTTCCCAACCAAAGTTCCCAAAGAAGACCCTTAATTATATTGTTCGAAAAATTGTTTTTCTTCACATTGAAAGGAGCTTTGCAGAAGTATTAGATAAGAGTTTTGTTTATTGTTTTGGAGAAGTACCAACGAGTTCCAAAAGTTTTTAAAAGAAGATATGCTGGTTTCTTAATTTTAACCAGAAACAACTTTTCATTGATGGATGAAAAAGAACAAAATGTTAAGAGAAACAACCAAAAAAGGCAAAAATCGCAGCCATTAAAAGAAAAAACCAACTAAAAACTAAACAGAACAGCAAACTAACCAAAAACACCAAAACAACAAACGAACCACCGACAATCTAACCAAAAGCCTAAGAAAACCCAAACAAACTAAAGAAACCAAGCAATGAAGAATCCAACGAAAGAACCACTCCCAAACAAGCAGAGTCATCCAAACAGAACAGCAAACCAGATGCAAAAATAATCTAAAAAGAACAAATCTTTCCACTTATAAGAGCTTCTAAGCCCTCTTGGAGCTTGATTTTTTTTATATTTCTTTTTTAACAAGAAACATACATTTCGTTGAAAAGATAGAAAAATGTTCAAGCATACGAACTCCCAAGAAGAGTAAAAAGAAAACTAAACAACGAAATAAATAAAGTTCCAGTCCTCAAAATATTACAAGAACCAAAAGATAAAGTAAGGTTTGTGTTGGTTTATTATTTGTAAATATTAGCTGTAAATTAGTTGTCAATATTAATTGTTATTTTATCTTTATTTCCATTTATGTTTGAGCCTCTATTCTATATAAGAAGACTATGTATTTCTTATTATTAATATATATTGGAATACAAATAATTTTATTCCATCAAAACCAAGTTGGTATTAGAACCAAAATAAACCAAGTTGGTATCAGAGCCAAAATAAACCCTAATATGCTAAGAGTCTTTAGAAACCCTAGTCACCATCCTTACCTTTAAACCCTAGCCGCTGTCATTACCGTTGCCGGAACCCTAGCCGCTGTTATCCAAAAACGGCGCATCCTACTTCTGGCACGGTAGGTCACTATTTCGGCATTCGTCCTCTTCGGCAGTAGTGTCATTCGAGTTCGTCGTTCAAGGCGGATCTTTACGGGTTTGTCACGGGCGTTGTTGTTCGCCGTCGAGATCTGTTGCCGTCTGCTACTATTCAAGCCTCGCGCCCCTGTTCCGTTGCCGTCAGCTGCTGCCCGAGTCGCCGTCGTCTGCTGCTTGTATTTCATGGGTTGTGGCTGTCTTACAAACCCTAGACCGGTTTGGTCGGTTCGCTCGGTTCGGCTCGGCTCAGTTCAGCTCGATTCGGTTTGCATTTTGGATCGGTTTGGTCCGGTTAGGACCGGTTCACTCAGATCGGCTTGGTTCATCTGGTTTAGTTTGGTTTGGTTCATTGGTTCTGTCTGTTTCTTGCCATTCTTTTGGCTTTCTGGTTCAGTCTTTCTACTCTAATATCAGGTTTTTGGTCTGATTGTTATAGTTAACTTGCGTTACTTGATCTGTTGTCTAGTGTTTCGTTATCCTTTGGGAGGGAAGACGTGAGGGTGTGGATTCCCAACCCCTCGGGAGGTTTTTCTTGTAGCTCTTTTTTCCATGTCCTAATTTCCCCATCGTCTTCATCCTTTTTGGCTTCTCTTTCTTCTTCCTCTTCTCCGTCCCTGGTGACCCCTTGGTTTACTTCTCTTTGGAAGATCAAAATTTCTAAGAAGATTAAGTTCTTTCTTCTTTGGGTGGCAAGTCTTACTTGGTTAAGTCAATATCTTGGATCGGATTCAAAGGATGTCTTCCTTTTGCCTGGGCCCGCAGTGGTGTGTTTTGTGTAGGAATGCTGCGGAAGATCTTGAGCATTTGTTGTGGTCTTGTCAGTTTGCGCAGAAGTTATTGTGTCGTTTTTTTAGAGGTTTTGGTATTGCTTGGGTTCGTTCCAGAGATTGCAGGGTGATGATGGAGGAAGTGTTGTTATCCCCCCCCCGCGTGATAGAGGGCGCTTTCTCTGCCAAGCGTGCTTTTCGGCTTCTTTATGGGGTATCTAGCTGGAGAGGAACAATAGGTTGTTTATGGGTGTGGAGAAATCTGTGGATTATGTTTGGGACTTCATTAGGTTTAATACTTCCTTATGGGATTTGGCTACTAAGGCCTTTTGTAATTATCCGTTAGGTCTTATTCTTTTGGATTGGAGCCCGTTCTTATAAGGGTTTCCTTTGCCGGCTGTTTTTTTGTATGCCGTTTTTGTGTATCTTCTTTTTTTCATTTCTCTCAATGAAAGTGCAGTTTCTCATAAAAAAAAAAAATTATATCAACGCCAATCAGTAGTTAGTGGGTCGTGATAAGGAAGATAGAGGGATGCCAGTTGTCACATATGAGGTTGAAGATAGATAGATGCAAATGATCGAGGAGACCAATAAGGAATTGCAGGCACAAAAATCACTGGTTGGTGAGATTATGGAAGATTCCATAAATCACCTTATCGAGGATGGAGTGATACATAACTATTTAAATATCATTAATAAGGAGGGAGGATTAGAGGAAGTCTTGGCTATGTGTATTCTGGAAAAGGAGGTTTTGATTGGTCTGCCTCTTGAAGAAAATATCGAAGGAATATCAATATCTCCGACTATTCGTTGCCCTCCGAATTTGGGAGATATTGCTGCCAACTTAGACTCAATAAGGCCTATGCAATCCTTGTTCTTTAAGCCGTGAGTTTAAAAAATGAAAGGGGGAAGGGCCCCAAAGGAAATCACCTGCCTCAAGAAATAGGAGAAAATGATCTGATGTAATCCTTAAAGCTCTTTTTTTCTTTTGAATAAAACATGTGGGGGAGGGGATCGAACTCACAACCTCTTGGTTGGAAACATATGCCAATTACTATTGAGCTATGCTTGCTTTGGCTGTAATCCTTTCAGCTCTTAATATTCTAGAATTGTTAAATAAATCCTCCCAGCCTTTGGAAATAAGAAACCTGTCCAAAAGATAATGGATTGAATCATTTACAGACTACGACCATGTAAACTTACCGTTGGATAGGGGAACCTCCATCAGTTCTAACTCCCCAATGATGGAATTGAACTTCTTAATGGCCTTTGAAATTCTACCACCAGAAGATCTTTCTAAGAACCATCTAATAACATTGAAATCACCACCAATGCACCACAGATCCAGAATAGCAAGCAATGTCATGAAGTTTTGTCCAGAAGTACTCTCTTTCCTAATAATCTGTTGAACCATAGACATTAGTTAACCAAATATAAGCTAAACTTGAGAAGGAAATATGAATTGAGATAGAAAAATTCCCTTTTGTCATTTAATCCCTTATAATTTTCACTGTTAGATATTCCTTCCAACTGTTGCTTTTGAGTTTTAATATTTCAAAGAGGTTCCCCAATTATTTGAAGTTTTTCCTATTGTTTTGAGTTTCAATATTTCAAGGAAGGTTTCCCGATTATTTGAAGCTCTTCCTATCCCAAGCACGACTATAATAGGGTTTCTCCAAGGTTGGAAGATAGGTTGTGTATGTGTGGTGTGTGCGCGTGCATGCAAAAAAGAAAGAATAATTCTGGGGTGGTGTGTGTGCTGATTCAAAAAGAAAAGGAATTATGGGGTGGCCGAAGCATAGGTGTTGAAATCTGTATCTGTGGTGTGTGCACGGACATGCGTGCTAATTAAAATTCTTTTGGGGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTATTTGAAAAAAACATAAGGAATTATGGGGCGGCCAAAATGTTGGTGCTGAAGTTTGGGGCTAGAAGAATCGATAAAAAAAA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TCGGATTGTCGTCTCCTCCACTTTGGTTCCCCTTCTCCCCGTAGACGAGAAATCCTCCACTCCAGTGAAGAAGAATCCCTTATTTATCTATTTAATTTTTGCGTTCCTTTCGTTGTTCATTCCCATGATATGGAAGCAGTGGCGGAGGGACTGTGGAGGCTGGCAGATTACCACGAGAAGAAGGGTGAAATAGGAAAGGCAATAAAGTGCCTGGAAGCCATATGTCAGAGTCAAGTGTCATTCTTTCCAGTCGTTGAGGTCAAGACCCGACTTCGCATTGCCACCCTCCTACTCACTCATTCTCACAACGTCAATCACGCCAAATCCCATCTTGAGCGTTCTCAATTGTTGCTGAAGTCTATTCCATCATGCTTGGAACTGAAGTGCCGGGCTTATAGCTTATTAAGCCAGTGTTATCATCTCGTTGGGGCTATTCCTCCCCAGAAACAGATTCTTTATAAAGGTCTTGATCTCACCAATTCATCTGGTCATGAACTGTCAGTGAAGCTATGGTCTTGCAACTTCAATTCACAGCTAGCAAATGCCTTGATTATTGAAGGAGACTATCAAAACTCAATCTCTGCCTTGGAGTCGGGATACGTATTTTCTGTTGAGATATGCTATCCCGAATTGCAGATGTTTTTTGCAACTTCTATCCTTCATGTGCACCTTATGCAATGGTACGATGATAATTCTGTTGAACAAGCTGTTAATAAATGTGATGAGGTCTGGGAATCTATTGAACCTGAGAAAAGACAACAGTGTGTTGGTTTATTATTTTACAATGAGCTGCTTCACATATTTTATCGACTTCGGATGTGTGATTACAAGAATGCTGCTCAACATATAGATAAATTAGATGCTGCTATGAAGGCTGATTTGCAACAAACACAGTACATTGAGGGTCTTACTAAAGAAATGAATGCTTTAAATCAGAGTCTCTCCAGGTTGGATCTACATTATAAAGATAGGTTGGCTCTCACTGAAAAACATGCTCAGCTTCAAGATCAACTCAGAAGTATCAACAGACCAAGTTCCATAAGCAGAGAATCTTTGGAACCTGCACATTTTGGAAGCATGAGAAGAACGTCTGGAGACAAGCTTGAGTTGGCACCATATCCTATTGACGGGGAATGGCTGCCAAAAAGTGCTGTTTATGCACTTGTGGATCTTATGGTTGTTATCTTTAGCCGGCCTAAAGGACTTTTCAAAGAGTGTGCAAAGCGTATTCTATCTGGGATGCTTACTATCCAAGAGGAGTTGGTGAAGCTTGGGATAACTGATGGTGTAAGAGAAGTCAGTTTGCAACACTCTGCCATATGGATGGCTGGCGTTTATTTGATGCTCCTTATGCAGCTTCTGGAAAACAAAGTGGCCATTGAACTGACGCGGTCTGAATTTGTTGAGGCGCAAGAGGCCTTGGTGCAGATGAAGAACTGGTTCCTGCGCTTTCCTACAATTTTACAGGCATGTGAGAGCATGATTGAGATGCTTAGAGGCCAGTATGCTCATTACGTTGGTTGTTATCATGAAGCAACTTTCCATTATATTGAAGCCGCAAAGCTTACAGAGAGCAAATCAATACAAGCAATGTGCCAAGTTTATGCAGCTGTCTCTTATATTTGCATTGGCGATGCTGAATCATCTACACAGGCACTTGACTTGATTGGGCCAGTTTACAGAATGATGGATTCTTTTGTTGGAGTTCGAGAGAAAACCAGTGTTCTTTTTGCTTATGGCCTCTTACTGATGAAGCAGCATGATTTACAAGAAGCAAGAAATCGATTGGCGAAAGGATTGCAATTGACCCATAATCATTTGGGGAATCTTCAACTTGTTGCACAATATTTGACAATCCTTGGGAGTTTGGCACTTGCTCTACATGACACTGTGCAGGCCAGAGAGATATTGAGATCATCTTTAACATTGGCAAAGAAACTCTATGACATCCCTACTCAGATATGGGTACTTTCAGTTTTAACAACTTTATACCAAGAATTGGGTGAAAAAGGAAATGAGATGGAGAATGCGGAATATCAAAGTAAAAAGGCAGATGATCTGCAAAAGAGACTGGCCGATGCGCATTCATCCATTCATCACATCGAATTAATTGACAAAGTACGGCTTGAAATTCAGCAACTCAAGGAGGTTGACATCAAGCGTGCAATAGGTGGCCCCTCCCTGGGAGTTAATCTTGATATACCAGAATCCGTTGGTGTGTCTGTTTCATTGCCGACTTCATCACTGAAGCTTGTGGATGTGGATACAGGAAGACGTGGAAAGAGGAAACTTTAG SDCRLLHFGSPSPRRREILHSSEEESLIYLFNFCVPFVVHSHDMEAVAEGLWRLADYHEKKGEIGKAIKCLEAICQSQVSFFPVVEVKTRLRIATLLLTHSHNVNHAKSHLERSQLLLKSIPSCLELKCRAYSLLSQCYHLVGAIPPQKQILYKGLDLTNSSGHELSVKLWSCNFNSQLANALIIEGDYQNSISALESGYVFSVEICYPELQMFFATSILHVHLMQWYDDNSVEQAVNKCDEVWESIEPEKRQQCVGLLFYNELLHIFYRLRMCDYKNAAQHIDKLDAAMKADLQQTQYIEGLTKEMNALNQSLSRLDLHYKDRLALTEKHAQLQDQLRSINRPSSISRESLEPAHFGSMRRTSGDKLELAPYPIDGEWLPKSAVYALVDLMVVIFSRPKGLFKECAKRILSGMLTIQEELVKLGITDGVREVSLQHSAIWMAGVYLMLLMQLLENKVAIELTRSEFVEAQEALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQALDLIGPVYRMMDSFVGVREKTSVLFAYGLLLMKQHDLQEARNRLAKGLQLTHNHLGNLQLVAQYLTILGSLALALHDTVQAREILRSSLTLAKKLYDIPTQIWVLSVLTTLYQELGEKGNEMENAEYQSKKADDLQKRLADAHSSIHHIELIDKVRLEIQQLKEVDIKRAIGGPSLGVNLDIPESVGVSVSLPTSSLKLVDVDTGRRGKRKL Homology
BLAST of MC03g0008 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FGN7 (Sister chromatid cohesion protein SCC4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SCC4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 931.4 bits (2406), Expect = 6.5e-270 Identity = 475/723 (65.70%), Postives = 586/723 (81.05%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B1H1Z8 (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=mau2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 2.2e-07 Identity = 38/137 (27.74%), Postives = 69/137 (50.36%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y6X3 (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAU2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 4.9e-07 Identity = 39/139 (28.06%), Postives = 69/139 (49.64%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9D2X5 (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Mau2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 4.9e-07 Identity = 39/139 (28.06%), Postives = 69/139 (49.64%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B4ZIX8 (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=mau2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 2.4e-06 Identity = 38/139 (27.34%), Postives = 68/139 (48.92%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. NCBI nr
Match: XP_022158435.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1404 bits (3635), Expect = 0.0 Identity = 721/721 (100.00%), Postives = 721/721 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. NCBI nr
Match: XP_022949168.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1345 bits (3482), Expect = 0.0 Identity = 684/721 (94.87%), Postives = 706/721 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. NCBI nr
Match: XP_023521217.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023521218.1 sister chromatid cohesion protein SCC4 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1343 bits (3475), Expect = 0.0 Identity = 682/721 (94.59%), Postives = 706/721 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. NCBI nr
Match: XP_022998788.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita maxima] >XP_022998789.1 sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1343 bits (3475), Expect = 0.0 Identity = 683/721 (94.73%), Postives = 704/721 (97.64%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. NCBI nr
Match: KAG6607383.1 (Sister chromatid cohesion protein SCC4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1342 bits (3473), Expect = 0.0 Identity = 683/721 (94.73%), Postives = 705/721 (97.78%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DVU1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024925 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1404 bits (3635), Expect = 0.0 Identity = 721/721 (100.00%), Postives = 721/721 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GBA4 (sister chromatid cohesion protein SCC4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452599 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1345 bits (3482), Expect = 0.0 Identity = 684/721 (94.87%), Postives = 706/721 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KHQ8 (sister chromatid cohesion protein SCC4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493351 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1343 bits (3475), Expect = 0.0 Identity = 683/721 (94.73%), Postives = 704/721 (97.64%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BJ17 (LOW QUALITY PROTEIN: MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490628 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1317 bits (3409), Expect = 0.0 Identity = 675/721 (93.62%), Postives = 699/721 (96.95%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CHS2 (MAU2 chromatid cohesion factor-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold139G00010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1287 bits (3331), Expect = 0.0 Identity = 664/721 (92.09%), Postives = 688/721 (95.42%), Query Frame = 0
BLAST of MC03g0008 vs. TAIR 10
Match: AT5G51340.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 931.4 bits (2406), Expect = 4.6e-271 Identity = 475/723 (65.70%), Postives = 586/723 (81.05%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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