MC02g1309 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTTTAATCTCAGTCGTAGCAAAAATTGCAGAGTACACAGTTGAACCCATTGGACGTCAACTAGGTTATCTCTTTTTCTACAATAGAAACATTAAGGATCTTGAAAAACAACTTGAAAATCTAAAGACTACTAGAGAAAAAGTGCAAATTTTGGTTAACGAGGAAGAAGTAATTCATATGAAATCTATGACGAAGTCTCGACATGGTTGTTGGCCGAAGTGAATGTTCAACTACCCAACATGCCACAACAAAACAAAGGTGTATCAAATAGGGAGGCTTCTTATCCTTCGTGCCTTAATTTTTTCAAACGACATAAGCTAAGTAGAAAGTCAAAGAAGAGGGTGAAAGATATTCTTGAACTCGTAGAAAAAGGAAAGAAGTTTGACAAAGTTGGTTATCCTGTACCTCTTCCACATACTAAAAGTCCTACTCTCCCTACAGATTATCAAATTTTAGAATCAAGAACGTTATTGACAGAAAAAATTAAGGATGCACTTGCAGATCCTAACGTTAACAAAGTTGGAGTATATGGTATGGGAGGTGTTGGAAAAACTAAGTGGCTGGATGAAGTTAAGAAATTAGTATTAGAAAACAAATTGTTTGATCGAGTGATTGATGTGACTATAGGTCAATCTAATGGTGTAGTAGAGATACAAGATCAAATTGGAGGAAAGTTAAATATGGGATTAAATATGAAGGCAGAAACTAAGGAAGGAAGAGCAACTTTCCTACAAAATAAGTTGGTTGAGATGAGAGAGAATATCCTTATTTTGTTGGATGATTTATGGAATGAATATGATCTTCAAAAAGAGGTTGGAATTCCTTGTCGTTCAGAATCAAGTAAAGAAGGATGTAAGATACTTATGACAAGTCGATCTCGACGTATATTAACAAATAACATGAATACTGAAAAGTGTTTTAAGGTGAATTCCCTAAGTGAAGAAGAGTCTTGGAAGTTTTTTATGACAATAGTTGGAGAGTTTGACAAAAATCGTATAGAACACATGGCAAAAAATGTGGTAAAAAAATGTGGAGGGTTACCAATTGCACTTAAAATTATTGCCAAAGCATTGAAGGGGAAAGAACTACGTATTTGGAAGAATGCTTTAGAGAAATTGGAAAAACGTGTTTCAGTGAAAATTAAAGGAGTGAGTGACCAATTATATTCTTGCCTTAAATTAAGTTACGATTGGATAGAAGATGAAGAAACTCGATTATTATTTCTGTTGTGTAGTGTATTTCCAGACGATCACGAGATTTGTGCGAAGGATTTGCAGATGTATGCTATGGGTATGGGATTACTAAATGAGGTAGATAATTGGGAAACAACAAGGAATATGGTAATTGAGTTGGTTGACCATCTTAAATCTTCCTCATTGCTTCTAGAATCCAATTCAGGTGACAATTACGTTCAAATGCATGATGTGGTCCGCGATGTTGCCAAATACATTGCATCAAATGAAAATAATATGTCCTCATTAAGCTATGGGTGTGGACAAAGTGAATGGCGAGAAAAAGATAGATACGGATCTTACAATGCAATCTTTGTAGATTGTATGGACTTTCCCAACCTTCCCAAGAATTTGGAGTTTCCAAACCTTCAAATGTTGATATTAAGAATTCAAACTTTTTTTGGGGAGGGGCAAGCTATTCAAATTGCGGATACTTTTTTTGAAGGAATGAAAAAGCTTAGAGTTTTGGACATGACGAAGATGCGTTTTGAATCATCAAGGACATCGTTGACCAACTCATTAAAGAATCTTCAAACATTATGTATGTCATATTGTGAATGTGATGATATTTTAACCATTTTTCAGCTAAAAACATTGGAAATTTTGAGGATTAATGGAAGTACGATTCAAGAGCTACCTGCAACTATGGATGATTTAACCCAACTTAAGGTGCTAGATGTGTCGAATTGCTCCGACTTGGAGGTGATTCCTGCAAACCTTATTTCAAGTATGACAAAACTGGAAGAGTTGAGTTTATGGAGAAGCTTCAAAAGAGGGGGAGAGGAAGTATCATACAAAAATGAGTTGATTAAGAATGTCAAACTCTCCTAATTGAATCATCTAACACATCTTTCCAATTTAATGTTAGAAATTCCAAATGTTGAGATTTTGTCAGATAATTTGAGTTTAGAAAGAGTTGAGAAATTAGAAGAATATTGTATTTGTGTCGGTGACAATGAGGATTTCGAAATATGTGACGAATATGCAAGAAGCTTGGTGGTTAATATAAAATCACAAATTGTTTCAAATGGTGGAGTACTTGAAATACTATTGGAAGGATGCGAACAATTGCGTGTAAAAGATTCAGTGGGTTTTATAAACCATCTTTTCAAACCAAATGGAAACTATTGTTATCCCCGCATGAAGAATCTCCATATCGAAGGAAACTCAGACATGCCACGTCATATCGATTTTCAGGTACCTGCAAAAGCATTTCGCCTTTTTTTTTTCTTTATCAATTTTACTTTTATATGCTGTTTTAAAAAAATATATATATATATCTATTTGTTTACAACGCATTTTAGAAATTCTATCACATTATTAAGAAAAAAACAAAAGTAGCTATAACTATAGTTTTTAAAATCGTTATCAAATGAAATATATAAATTGCAACTCTGTACTTTCAAAGTGTTCTTCGTTTTTTTTGCTTTTTTTAACTAAATTAAGATTATAATATTGCAGGTTTCATTTCCTAAGTTGGAGGATTTAAATATTGAAGGAATTAGATTCGAGACGTTATGACATAATAATGGGCTGACTGCAAATTCCTTTTGCAGACTCCAAACTATACGTATTCAATATTGCAACAAATTAAAACACGCATTTCCTTCAAATGTGGTGACATCACTTGTTTTCTTAAATATATTAGAAATTTTACATTGTGCGTTATTAGAAGGGATATTTGAAGTTGATATGTTGACTGATGAAGCCAAAGTAGTGCCATTGAAAAATTTGATTCTAATTAGTCTACCTAAATTAAAGTACGTGTGGAACAAAGATCCTGATGAATTTATGACATTTCCAAACCTAAGACAAGTCGAGGTTTCTCGTTGTCCTCATCTTAAAACTATTTTTCCAACTTCCTTCATCAAACATATGGATGAAATTGAAAATTTAGTCACAGATGAAGTAAATGAAATATTTCCAGAGGATGAAGCTTCAAAGTTGGTGGCTCCTGAGGTAATGCATCTTCGTCATTATTTATAGCCTATTCACGCAATATTTTGTGTATGTTTCTATTTGGTACTAATTTCATGGTTTATACTTTCATGATACTCAAGTAATTAAAACAATAGTTTAAAAGTTTTGTTGATTTTCAGATTGTATTCCCAAGCTTGAAAAATTTGAAAATGGAAACGAAGAGAAGCTTCTGGTTTAGATCGAGGTCATTTCCCAAACTCCAAGGACTTGTATTGAATGGGTTTGAAGATGAGAATATGGTTACTCTGCCATTAGAAATGAGTCAAGAAATAAACTTGGTTCGAGTGAAGAACTGTGACAAGTTGAAGTGTTTACTGCCATTATCAGTCTCATTCTTCCATCTGAAATTTCTCACTATTTGGGATTGCAATGGAATGATAAATTTGTTTAGTTCCTCCGTGGCAAAAAATCTGGTGAGTCTCTCTTGCATTAAAATATCTAATTGTAGAGGAATGAGTTCCATAGTTGCAACAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGATGAAGAAATTATTTTAAAAAAATTGACTGATCTGGAATTGGATGATTTACCGAGACTAGCCAACTTTTACTCTGGAAAATACTCGTTTAAGTTCCCTTGCTTGAAGAACCTGCGTATAACAAAATGTCCTCAAATGAAGCCATTTTCACATGGAATATAAAGTAGGCTCAAGTTGGAAGGCAGGTATAAATGTCATAGCCCAACATTTTCGTCCGAAGAGGTATGAATGTTGTTTTTTTTTTTTTCACTAATCATTTTCTTTGTTTTGGTACTTTTTATGGACTAACTTTCCTAGCCCCCACTCTCGTTTGCAGTAGTTAACGGCAATCAAGTCTCTTAAGCATTGATATATGGTTAGTTTTAGTCGTTAGATTTTGGCCTTGGGATCTAACTTTCAACAGGGTCAGTGGTACTTGTTTTGAGTTTCAACCTCTTTGGCTTTTGCCCATGTTTTATACCTCAGATTTTACTCTTGAGTTTCTAACCCATTTGGCTTTTGTCAATAGCTTTTATACCATGAGTTTAGTCGGCACCCTTGGGTTTCTAACATATTTGGTTTCTACCGGTTGTTTACCCCAAGTTAAATCAACACCCTCGGGTTTCTAACCTATTTTGTCTTTTGCCACACGGTTTGTTACCCGTGGGTTTCATTGATTGGTTAGACTTGCCTGTTTTCTGTTTTAACCTTGCTGAGCCTGTACGCAGGCCTTTTTCAGCACCTCGGGATTCTCTTCCCTGATTTCACTAATTTGCTTTTTGCTTATTGGCCTGCTCGTCCCAGTTTGAGTTCTTTGAGACCAAATTTCTTGTCTTGGTGTCCTCTTGATCTTATCTTTGATGCACGGTTCGACCGGATGGCATTCTTTTATTGACGGCAGTATGCCCAAGGCCGACTAGGTCAACTGGGTTGCTCTTGTTTTCGTTCGGCGTGACAGATCTCTATTGTCGTACAACTGCTTGTCGGCCTGTCTGGCCGAGGACGTTAGCTCGAGGTTTGTCGTTTCCTCCTACCTTCAACTTGGTCCGTGCATGACTGGTTGTCTCCCCAACTCCTTCAATCATCGAAGCTTTACCCTTTCGTGGATCGCGAACAAGCACTGGTTGTTCCACCTCATGTTGCTCGAGTTTTTGCAGAAGTAGGGACATGCTCCAGTCCATTCCCTCTACCCTCTCTTCTAAGGCGGCCATCTTGTCACCTTGTTGATCCGGACCTTCGATCGGTTTGTCTTTCAGACCAAGAACTGGTTGGCCAGTATCCCTCTGTCCGTCATCTGGTCGGATCT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ILISVVAKIAEYTVEPIGRQLGYLFFYNRNIKDLEKQLENLKTTREKVQILVNGRSNSYEIYDEVSTWLLAEVNVQLPNMPQQNKGVSNREASYPSCLNFFKRHKLSRKSKKRVKDILELVEKGKKFDKVGYPVPLPHTKSPTLPTDYQILESRTLLTEKIKDALADPNVNKVGVYGMGGVGKTKWLDEVKKLVLENKLFDRVIDVTIGQSNGVVEIQDQIGGKLNMGLNMKAETKEGRATFLQNKLVEMRENILILLDDLWNEYDLQKEVGIPCRSESSKEGCKILMTSRSRRILTNNMNTEKCFKVNSLSEEESWKFFMTIVGEFDKNRIEHMAKNVVKKCGGLPIALKIIAKALKGKELRIWKNALEKLEKRVSVKIKGVSDQLYSCLKLSYDWIEDEETRLLFLLCSVFPDDHEICAKDLQMYAMGMGLLNEVDNWETTRNMVIELVDHLKSSSLLLESNSGDNYVQMHDVVRDVAKYIASNENNMSSLSYGCGQSEWREKDRYGSYNAIFVDCMDFPNLPKNLEFPNLQMLILRIQTFFGEGQAIQIADTFFEGMKKLRVLDMTKMRFESSRTSLTNSLKNLQTLCMSYCECDDILTIFQLKTLEILRINGSTIQELPATMDDLTQLKVLDVSNCSDLEVIPANLISSMTKLEELSLWRSFKRGGEEVSYKNELIKNVKLSULNHLTHLSNLMLEIPNVEILSDNLSLERVEKLEEYCICVGDNEDFEICDEYARSLVVNIKSQIVSNGGVLEILLEGCEQLRVKDSVGFINHLFKPNGNYCYPRMKNLHIEGNSDMPRHIDFQVPAKAFRLFFFFINFTFICCFKKIYIYIYLFTTHFRNSITLLRKKQKLQTIRIQYCNKLKHAFPSNVVTSLVFLNILEILHCALLEGIFEVDMLTDEAKVVPLKNLILISLPKLKYVWNKDPDEFMTFPNLRQVEVSRCPHLKTIFPTSFIKHMDEIENLVTDEVNEIFPEDEASKLVAPEVMHLRHYLLFTQYFVYVSICFVDFQIVFPSLKNLKMETKRSFWFRSRSFPKLQGLVLNGFEDENMVTLPLEMSQEINLVRVKNCDKLKCLLPLSVSFFHLKFLTIWDCNGMINLFSSSVAKNLVSLSCIKISNCRGMSSIVATEEEEEEEKDEEIILKKLTDLELDDLPRLANFYSGKYSFNGTLSHDDDSELYLSHMYWINGIMIITLQVSFPELEDLRSEGLSLETLWHNNGLSTHPFCKLQNIRIQYCNKLKYVFPSNVVTSLVFLKILEIYTCELLEGIFEVEKLTDEARATVPLTKLILISLPKLKYVWDKDPGEFLTFPNLRKVEVSGCPRLKSFVPTSFIRHMDETKTLVTDEASKLVVPEVMHLFHYYSLAQHLYMFIFGTTFEDFHDTRVIKIIVUKLLFYFQMVLSKGFGDENIVTLSVETSQESNFIQVKKCDKMNCLLPSSISFFNLNSLIIWECNGMINLFSSSVAKSLVSLYCLTISNCEEMSSIIAREEEEEKDEEIIFKKLTDLELDDLPRLANFYSGKYSLKFPCLNNLRITKCPKMKPFSYGI Homology
BLAST of MC02g1309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O81825 (Probable disease resistance protein At4g27220 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g27220 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 232.6 bits (592), Expect = 2.9e-59 Identity = 254/963 (26.38%), Postives = 451/963 (46.83%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T048 (Disease resistance protein At4g27190 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g27190 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 220.3 bits (560), Expect = 1.5e-55 Identity = 235/879 (26.73%), Postives = 420/879 (47.78%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q42484 (Disease resistance protein RPS2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPS2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 201.1 bits (510), Expect = 9.4e-50 Identity = 198/693 (28.57%), Postives = 331/693 (47.76%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LVT4 (Probable disease resistance protein At5g47250 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g47250 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 196.4 bits (498), Expect = 2.3e-48 Identity = 191/674 (28.34%), Postives = 314/674 (46.59%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LMP6 (Probable disease resistance protein At1g15890 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g15890 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 191.4 bits (485), Expect = 7.5e-47 Identity = 186/715 (26.01%), Postives = 338/715 (47.27%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. NCBI nr
Match: XP_022143564.1 (probable disease resistance protein At4g27220 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1603 bits (4152), Expect = 0.0 Identity = 838/1178 (71.14%), Postives = 956/1178 (81.15%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. NCBI nr
Match: XP_022155050.1 (disease resistance protein RPS5-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1431 bits (3705), Expect = 0.0 Identity = 845/1552 (54.45%), Postives = 891/1552 (57.41%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. NCBI nr
Match: XP_022155051.1 (probable disease resistance protein At4g27220 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1088 bits (2813), Expect = 0.0 Identity = 572/686 (83.38%), Postives = 577/686 (84.11%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. NCBI nr
Match: XP_038887230.1 (probable disease resistance protein At5g63020 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 983 bits (2541), Expect = 0.0 Identity = 623/1275 (48.86%), Postives = 777/1275 (60.94%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. NCBI nr
Match: XP_038902150.1 (disease resistance protein At4g27190-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 942 bits (2436), Expect = 0.0 Identity = 632/1569 (40.28%), Postives = 856/1569 (54.56%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CPP4 (probable disease resistance protein At4g27220 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013433 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1603 bits (4152), Expect = 0.0 Identity = 838/1178 (71.14%), Postives = 956/1178 (81.15%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLB8 (disease resistance protein RPS5-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022189 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1431 bits (3705), Expect = 0.0 Identity = 845/1552 (54.45%), Postives = 891/1552 (57.41%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQJ3 (probable disease resistance protein At4g27220 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022191 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1088 bits (2813), Expect = 0.0 Identity = 572/686 (83.38%), Postives = 577/686 (84.11%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHN4 (disease resistance protein At4g27190-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501064 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 912 bits (2357), Expect = 4.00e-306 Identity = 629/1569 (40.09%), Postives = 848/1569 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LTN4 (NB-ARC domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G433370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 875 bits (2262), Expect = 9.52e-293 Identity = 555/1202 (46.17%), Postives = 766/1202 (63.73%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. TAIR 10
Match: AT4G27220.1 (NB-ARC domain-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 232.6 bits (592), Expect = 2.1e-60 Identity = 254/963 (26.38%), Postives = 451/963 (46.83%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. TAIR 10
Match: AT4G27190.1 (NB-ARC domain-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 220.3 bits (560), Expect = 1.1e-56 Identity = 235/879 (26.73%), Postives = 420/879 (47.78%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. TAIR 10
Match: AT4G26090.1 (NB-ARC domain-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 201.1 bits (510), Expect = 6.7e-51 Identity = 198/693 (28.57%), Postives = 331/693 (47.76%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. TAIR 10
Match: AT5G47250.1 (LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 196.4 bits (498), Expect = 1.7e-49 Identity = 191/674 (28.34%), Postives = 314/674 (46.59%), Query Frame = 0
BLAST of MC02g1309 vs. TAIR 10
Match: AT1G15890.1 (Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family ) HSP 1 Score: 191.4 bits (485), Expect = 5.3e-48 Identity = 186/715 (26.01%), Postives = 338/715 (47.27%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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