MC01g_new0197 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1

Overview
NameMC01g_new0197
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationMC01: 7358512 .. 7360846 (+)
RNA-Seq ExpressionMC01g_new0197
SyntenyMC01g_new0197
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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GGAATAATAAGTCAACTTGAAGTCAAAGCAAGCAAACAAAAGAGAACAAAAATTCTTTAAAACAATGTATAAATCCAATTTTGTTCAAACACACATTTATCCTTAAAAACAGTGACACGTTTGCAACAAAAGATTATTTTAAAGGCAAGGGTGTGTGGTGTACAAATCTCAGAGCAAACCCTCCTTCACCCTCTCCTTCGCGATTTCGCCGCCCCGCCTCCTGCATTTCTTCCAACCATCCGGCCTCCCCGCCGACTCTAACGCCCCGCCTCCCTGCCGCCCGACTCCCCTCTCTCTCCCTCATGCCGCCTGATGCCCCCTCTCTCTCCCTCTTTCGTTCCGGCCATCCCGCCTCCCTACCGCCCCTCCTCCCCACCGATCCGACGCCCCGCCTCCCAGCCGCCCGATGCCCTTCGTTCCAACCGCCGACTCCGACGCCCCCTCTCTCTCCCTCTTTCATTCCGGCCGCCACCCGACACTCCTTCGTTCCGGCCTCGTCCGCCGCCGCCCTGCTGCCTTCGTTCTATCGTCAGTGAGTTTTTTTTTCTATAAATTAGATTTTTTTATGTTTTTTTTTGTGTTTTTTTCTTTTTTTTTGTATAATATTAGTTTTTTTGTGTGTTTTTTTTCTTTTTTTATAATATTGGATTTAATATATGTTATTTTGTTTGAGAAATTGTTAAATTGTTTATTCGAGAAATTGTGAAATTTTTTAGCACACATTTTATATAATGTTTTGTATAATAGTTATTAAATTGTGAATATAGTTATTTGAGAAATTGTGAAGGTTGATAATGTTTCACCTAATATTAATAGAGTGAGTTTGAGAAATTAATCGTTGTTTAAGTTTGTGTTTTGAAACTTTATGTTCCTAATATAGAGGGGTGAAGTTGAGAAATCTTATAAGTGGACACGTGGGGAATTAGAGTTTGTAGTTGTGTTAGTTTGTGCTTTATTCTTTATTTGAAAATTTCGTAATTTTGTAATTTTGTAATTAGAAAGTTTCTAAATTTTAGGGATTATAAATATAATGCTTTTTCGTGTTGATTTCTATTTAAGTATTCAAATTATTAATGGATGGACTTTAATGGGTAGTTTGATTGTGACTTAAATATATATATAATCCTAGTGATTGTGACTTGATTGTGATTTTTACTTCATGAGTTGTTGTTGTAGGTTGGAATTTATAAGCTTCACTTTGAGCTTATTGTGGTCGGTATTGGTTCTTAGCGTTCGTTGTAACTTGTGCTAAAGGTATGTTGTGAGTTAATTTTTAAGCTGTTTGATTTTGACTTAGTTTTTTTGCTTGTGAACGTGCTTATGAACTATTTTAGTTTGAAGCATATTGGTTTGATTGTGAACTTTTTAATTAAGTTGTGAGATGTTGAAATGTTGTTTGTTTGATTTAATTTATTGGCTTTGTAAATATTAAATATTGTTATTTATTTACTTTAAAGACTACCAAATGAATATAGGTTGATTAAGCTAAGTACTTAAATTAGTGGATGGTTGTGTCTATGATTGTTTTATTTATGTTTACATGTTGTTGGATGATTCTGCAGTTATGGTAGCCATTTAAAACATATGTTACGAATGAATCAGTAATGTTTATTTTTAAATGTCGTTCGATGATTCTGTTAAATTTGTAAAGTTGATTGGTGAGTGTGCGTGTTTTACTTGGTAAGAGCAATTTTTGGAAATTTGAAGTGTTGGGGAGGGGAGGGTGTTATATGTACATACTTAGAATGAAATGTTGGGGGGTGGGGGAGGAATTATAATACTTTGAATGAAAGTGTTGGGGAGGGGATGTTCTTATATTTTTTTCTTTTAGTTTGTGCGATATAAGATTTAATTTATTGACTTTGAATGAAAGTGTTTAGAGGAGGGATCCTCTTCTACTTTAATTTAAGTTTGTGAAATGTTTACTTAGTTTGAGTTCATGACATATGTACTGAGTTAGAATGAAAGTTTGTTAACTTTTAATGGATGTGGTGAGTTAACTTTTAATGTCTAGTTTGAGTTTGAGACATGCATCTGTAATGAGATTTTTTTATGACTTTTAAGTTAGTTTTGAGAAATATATAAAATATTTTGCTAATATATAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGGATCGTTCGATTCTCTATCAAAGATTTTGGAAATCAAATTTCATGAACAAACTTTATGAAGGATTGTGTAGAATATGTTTAAGTTGTTTAAGTTTGGGACTTTTTAGAGTAGGTTGTTAAATTTAATTTATATTATTTTTTTACTTTTGTAAAACAAATGTTTGTAATATCATGACTTTTTAAATGAAATTAAATTCGTTGTTGGTGATA

mRNA sequence

ATGCCGCCTGATGCCCCCTCTCTCTCCCTCTTTCGTTCCGGCCATCCCGCCTCCCTACCGCCCCTCCTCCCCACCGATCCGACGCCCCGCCTCCCAGCCGCCCGATGCCCTTCGTTCCAACCGCCGACTCCGACGCCCCCTCTCTCTCCCTCTTTCATTCCGGCCGCCACCCGACACTCCTTCGTTCCGGCCTCGTCCGCCGCCGCCCTGCTGCCTTCGTTCTATCGTCAGTTGGAATTTATAAGCTTCACTTTGAGCTTATTGTGGTCGGTATTGGTTCTTAGCGTTCGTTGTAACTTGTGCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCCGCCTGATGCCCCCTCTCTCTCCCTCTTTCGTTCCGGCCATCCCGCCTCCCTACCGCCCCTCCTCCCCACCGATCCGACGCCCCGCCTCCCAGCCGCCCGATGCCCTTCGTTCCAACCGCCGACTCCGACGCCCCCTCTCTCTCCCTCTTTCATTCCGGCCGCCACCCGACACTCCTTCGTTCCGGCCTCGTCCGCCGCCGCCCTGCTGCCTTCGTTCTATCGTCAGTTGGAATTTATAAGCTTCACTTTGAGCTTATTGTGGTCGGTATTGGTTCTTAGCGTTCGTTGTAACTTGTGCTAA

Protein sequence

MPPDAPSLSLFRSGHPASLPPLLPTDPTPRLPAARCPSFQPPTPTPPLSPSFIPAATRHSFVPASSAAALLPSFYRQLEFISFTLSLLWSVLVLSVRCNLC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..49
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 20..49

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MC01g_new0197.1MC01g_new0197.1mRNA