
MC00g0333 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5polypeptideCDSutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCAAACAAAACCAGTGCTTCTTGTTCTAACTATTTAATTTCCATTTCTCATTTGGATTAATTTTGACCCTATTCTTTTTCTAACATTTGAAATATAAAGTATTCCCTCCAAAGATGTAGCTAAAAAAATCGCAACTTGGGCGACCCGTTAATTATATAGACTTGGGAAGTGGATAAAATCCGTACTCTCGTCTTCCCTCGAGCTCAGCGCAGCTGCAGCCAGAGATTAACCCAACAATGTTGGCAAACCCTTGCGGCCTCCATTTCAGACCATGCTGTTCCCACGCCTCCGAATTCTCTCATTTTGGGACATCCAAAATCTCTCTATCTTCCTATTGCCCTCGCTTTCAGGCTTCCAGGAAACCCAACTCGTCTTCTCTGTCAATTCTTCGCAGTAACAGAAATGGCAGGAAATTCGTTACGAGGGCTCTTACGGAATCTGCAGTAGCGAGCGATGGAGCGCCTGGTTCTTTGCGGCCTTTCTCGGTCAAAATTCCTGTTGGGGATAGATATGTAAGTCTGAGAAAATTTTACTTTAGCGACTTCGCTGTGTAAATAACGAGTTTAGGGAAGTTTTTTTTAGGCAGGAATCTTGAAATATGGTCGCCGTAGGTTTTTCCACAGGCAAGAGGGTGCCCGAAGTGGATGCTGGTATTAAATTGTTCGGGTGGGTTAATGATTTTATTATTCAGACCGTGAGGAAAATGTTCTAAATCGTTGTATATGCGTTTCCAAAAGAAATGTTTTGGCTGTTCAAGTATGCCGTATGCCAGTAGTTATCTAAAAATAAGAAGCATAAGTTTGAGTTATTCCAAGTGGTTGGGTGAGAGTTGTAGCTGAAATATATAAAATTATGTCACCGGGTTTTATGGATTTGTATGCTAGAGAAGCTTCGAGAGAAGGTAGAACTACAGAGTGAAGAAAGAAGCTTCGGGTGTAAGAGAAATTAGCAAACTTGAAATCCGGGGAGGGAGTTTTTCCTTCTTCAGTTTACCGTGAACTCTTTGTAATTTGCTTTGTTTGGTTATATATTTCTGATTGTCTGGGTGAGTATGTTTAACACAAATGTGCGTCAGTGCTGGAGCTTTTATTTTAAATTTTAATTATTGAATCTTTCAGATTTTGGTTGAGACGGGCCATATTGGGAGACAAGCTAGTAGTGCTGTTACAGTAACTGATGGAGAAACTGTAAGATGGATTTTGAATTCGTACAATTCTTTGCTTGTTAACTGCAAATTAGATTGGTGTTTGGCACCCACTCTTACAAACGGTAATACTGGGATCCCGGAAAGATTTTTGCTCTAATGACAGTGTCTGTCTTTTCCCTCCCTTAAATCTCTCTGTAATTTCGTTTATGCATTTATAGTATTTTCATTTACTTTAATATTGACTCATTGATACCCCAAAGCTTACAGAGTAATTCATAAAGAAGTTTACAGTATAAGGTAAGAGCAATAGTAAATAACAGGGATTAGGAAAGAAATTCATGGATAGTAATTTACATAGAGGAAGAGCTGTAATTTTGGATCTAAATGAACGAGCAGACTTGAGTTTCCTTGTTAATCAGGTGGTGCAGAGCTATAACTCTGGTACTCTGATTCCAAGAATTTTTACTTACTATTCATCAAGTCTCTTCAATTTACACCTTTAGTTCTAATGGTTTTTTTTGCCTATCTGTCATCTTAAATTTGCCTTAGCGGCATTTTTCCTTGTTCCTCCTTGGGGCTTCCCTTGCACATAATTTTGGCTTTGTGTGGCCTTCATTTGATTGGGGGTCTTAGGATATTTCCTTTTTGCTTTCTTTGATGGCTAGTTTTTTTTGCTTGGGGTTATGGATGTTTGTTTTATGGTGTCCCAGTCGTTTTTGGGAGTTCTCCTGTAGTCCGTTCTTTTCTAATCTTTCAAGCTCCCTCTTTGTTGTCCCCATTTTGGAAGGTGCATATCCCAAGAAGGTCAATTTATTTGCTTGACAGGTCTCGCATGAGAGATTAACACTGTTGACCTTATCTAGAGTGTGTCTTCTGCTCTTAGCGTCTTAGTGGTGCAACATTGGTAAGAGTGCTTTGAAGATTTTGTGGAATTTTCAGTTTGCAGGTGCAATTTGGGATAGTGCTTTTGAGACCTTTGGAGTGTAGTTGGCTCATAGTAGGTCGCATTGGTCTATGATGGGTGAGGTGTTATTTTTATTAGCCTTTCTGAGATAGGGGGCGGCTCTTTGGTATGCTGCTTTCTTTGCGATTTTATGGAATATTTGGCTTGAGAGAATGGAGAGGTTGTGGGGGAGGTTTCAGCCTCGGCTAGGCTCAATGTCTTACTTTGGGTCTCGTGATTATCCTTTGTCTCTCATTCTTTTTTGTATTGGAGCCCTTTCTCGTAATTTTCTAGCTTATTTGCTTTTTGTTTCTTGAATCTTTTCACCTTAGGCCTTTTTTTTTTAATTATTAATTAATTATTGATTTTTTTTAATGTATTCCTTGGGCATTGTTTCATGTTTATCAATCAAAGTTGGTCCCTTTGTTTAAAAAACTTAGATTTTCCACATGCAAAAGAAACTATAATTTTTCTTGCAAACTAGTTGATTAGGAGAAACTAACATGTTTGAATTTATATCTTCAGATTGTTTATACATCTGTTTGTTTGGCTGATACTCCGAGCGAACCTTCAGATTTCTTTCCTCTTTCTGTTAATTATCAAGAACGTTTTTCTGCAGCAGGTCGGACTAGGTCTGCCTTGCACCCTCTCCTTACTCGTTTCCTATAGTTATTTTTCTTTCCAGTTTGATGTATAACCTCATTTATAACATTGGCTCAGTGGAGGGTTCTTCAAACGAGAAGGAAGAGCAAGAGATCATGAGGTATATTCTATTTGCTGTATAGAAACATTGTCTAAATAAGAACACAATATTCTAAGTTAAATTTGAACGAGTTTGGCAATGTAGGTTGATCACGGGCTAGAGTTTAATTATTTTCATTATGATAAGATGCAAAATACAAGAAGCATATATAGGAAAATGGAGTTGCAAGAATAAGATAAACAAGAAATGTGTAAACAAGAAATAAATTGATTATTGATTAGTGAAAGGTTACTTCATAATGTCCACTATACCAAGTATTACATGCAGGCCAAACTCCCCAATGGAACTTACAAAAACCAACCGTTAGTTGCAGGAGTATGGTTGCTAACTCTCTCTATATAGTATATTGAAACTTTACTAACTCAAACACTCCTCTCCAATCTTTTGTCAAAGTAGATAATAAAGTAATTTGTTTGAGTTTGTTAATTGAAATAGTTAAAACCTCATGATGGCCACCTACCTAAGAATTAATTTCCTATTTGTTTTCTTGGTAACCAAATGTAGTAGGACCGATCAATTAATTTTCTCTTCATTCTGTTATATTATTTATTTCATTGCTTTTGTTGCTTTCAGGTTCTCATTTGTAGATTGATTGATCGGCCCTTGCGGCCAACCATGCTCAAAGGCTTTTACCATGAAACCCAAATACTATCTTGGGTATGATTTTAAGCTTAATGATGCAATCAATTTTCACTTATTTAAATCTAAAACATGCAAAAAGATTGTAGCCTGCCCATCTAAAGGGTACAACCGCTTTCAACTAACTGTTTCCACTGAATTGTCAAACCATGTAAAGCAGCAACTAATTGGTTATTAGAACAGCTGACAGCTATTGTTAACTAACTAAAGCAAATAACAACTAATTTATGGAATATTTTTTTATAAGGAACAGGTGAATGGTGAAGGGATCTTGAGAGGATGTTTGGAGTTAAGGCATTTCTATATCTTCCTTTAGATTTCTGATCTTAAGGTGTTATTTGGAAATGATGTTAAAAACTGTTATTGATTTCTGTTTTTTTTTTTTAACAAAGATACAACTTCTCATTGAAATAATGAAAAGATAATAGTGTTCAAGGATACAAACTCTCGAAAGAGTGAAAAATGAAAAATAAAAAATGTAAATAACAGAATTACACAAAATTAATAAAAGCTTCCCAATTAGCATAAATCATAGAAGGAGAGTGATGCGTCAAAGAGTCGACAAGCGAACACCAAAGTGAAGCTTTAAACTTAGCTGAATAGAAACTTTCGTCGTAAAGTCTTCGTTTTTCTTCAAATAATCTTGAATTCCTCTCGAACCACAATTCCGATAATAAGGCTTTGACAACATTTAACCAGGAAAACCAAACTGAAGAGGAAAGATGAGGAGGCCCATGTAAAAGCTGATAAACATTGTCCCCGGCCTTGAGATCAAAACGCCAACACATTGAATTGATGGAATAACAGATTCCAACACTTAGAGGCATAATAGTAGCAATGAAAAAAATAGATGGTCATGATCCTCCCCACTCTTTGTACAGAGGCAACAAAAAGAGGGAAGTAGGGCAGCAGAAGGAGATTTCTTATGAACAATATCAGTCATATTCAACTTTCCTTGAGAGAGAATCCAGCAAAACACATTAACCCTTCTTGGGCTCTTGGTTTTCCATAAAGCAGCAAAAAATTCCTTGGGCATCGATGCATTTGAACCAAATCTTCTTAGTGAAGTAACTGTGAACAAACCAGAAGGTTCAAGACTCCAAAATCTGCTATCAATTATATCTGAAATGGACAGCAGATTTAGAGCTGATAATAATGTAGAAAATTCCTCCACTTCTTCCTCTTTCAAAGCTCTTCGCAACACTAAATTCCATGAACTAGTATTTTTCTGTTATTAAGGTGTTGTTTGGAAATGATGATAAAATATGTTCTTGATTTTTGAGGTGAACTGAACAAACTGCTCTTGATTTCAAAAACAAAATTTGTTTCTTAATATGGAAAACCTGGCTGGATAAACCTTTTTTTTTTCCTTTTCTAAAGTTGTTTTCACTGTTTAATAGAATTGTTCCTGGAATAGCCCCAACAAGTTGAAAAAGCCCGTCCAAGAAGATCCAGTTGGCTCAAAGCCTAGTAGCCCATGTCCCTTTTCCTTTTTAAATTTT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MLANPCGLHFRPCCSHASEFSHFGTSKISLSSYCPRFQASRKPNSSSLSILRSNRNGRKFVTRALTESAVASDGAPGSLRPFSVKIPVGDRYILVETGHIGRQASSAVTVTDGETIVYTSVCLADTPSEPSDFFPLSVNYQERFSAAGRTSGGFFKREGRARDHEVLICRLIDRPLRPTMLKGFYHETQILSWVLSYDGLHTPDCLAITAAGIAVALSEVPNSKVVAGVRIGLVDDKFIVNPTMKEMEDSKLDLVLAGTDNVIKISMQGYCNFLPEEILLDAVEIGQNAVTAICKEVDALVRECGKPKMLDAIKLPPPQLYKHVEEIAGNEIEKVLQIRNKIPRRKALSSLEEKVITILTEEGYVSTDTTSGGLEPIPDLVEDEDEDDEVVVDGEVDEGDVHIKPTSRKPVLTLFSEVDVKLVFKEVTSKFLRRRIVEGGRRSDGRTPVEIRPINSRCGLLPRAHGSTLFTRGETQSLAVVTLGDKQMAQRVDNLVDVDELKRFYLQYSFPPSCVGEVGRIGAPSRREIGHGTLAERALEPSLPSEDDFPYTIRVESTITESNGSSSMASVCGGSLALQDAGVPIRCPIAGIAMGLVLDTKEFGGDGTPLILSDITGSEDASGDMDFKVAGNEMGITAFQMDIKVGGITIPIMREALLQAKDGRKHILAEMLNSSPPPSKRLSQYAPLIHVMKVQPEKINLIIGSGGKKVKSIIEETGVEAIDTQDDGIVKITAKDLSSLEKSKAIISNLTMVPTVGDIYRNCEIKTVAAYGVFVEIAPGREGLCHISELSSDWLAKAEDAFKVGDKIDVKLIEVNEKGQLRLSRRALLPDADQDPSSKENTDNPSRNKSAVQKGPDKATSKRAGRENIEQTNVKVSNSLEDAAKLQKKFIRKEVSATKDRPISKEKTKSTSS Homology
BLAST of MC00g0333 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69LE7 (Probable polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PNP1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1204.1 bits (3114), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/848 (72.64%), Postives = 719/848 (84.79%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GZQ3 (Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PNP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1173.3 bits (3034), Expect = 0.0e+00 Identity = 623/912 (68.31%), Postives = 738/912 (80.92%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6MDI2 (Polyribonucleotide nucleotidyltransferase OS=Protochlamydia amoebophila (strain UWE25) OX=264201 GN=pnp PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 666.8 bits (1719), Expect = 3.6e-190 Identity = 365/747 (48.86%), Postives = 500/747 (66.93%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3KKJ7 (Polyribonucleotide nucleotidyltransferase OS=Chlamydia trachomatis serovar A (strain ATCC VR-571B / DSM 19440 / HAR-13) OX=315277 GN=pnp PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 635.6 bits (1638), Expect = 8.8e-181 Identity = 360/742 (48.52%), Postives = 461/742 (62.13%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O84849 (Polyribonucleotide nucleotidyltransferase OS=Chlamydia trachomatis (strain D/UW-3/Cx) OX=272561 GN=pnp PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 635.2 bits (1637), Expect = 1.2e-180 Identity = 361/742 (48.65%), Postives = 461/742 (62.13%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. NCBI nr
Match: XP_022147752.1 (probable polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1745 bits (4519), Expect = 0.0 Identity = 906/913 (99.23%), Postives = 910/913 (99.67%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. NCBI nr
Match: XP_038904843.1 (probable polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1606 bits (4159), Expect = 0.0 Identity = 836/924 (90.48%), Postives = 875/924 (94.70%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. NCBI nr
Match: XP_008443302.1 (PREDICTED: probable polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1599 bits (4140), Expect = 0.0 Identity = 832/924 (90.04%), Postives = 878/924 (95.02%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. NCBI nr
Match: TYK25556.1 (putative polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1598 bits (4137), Expect = 0.0 Identity = 831/923 (90.03%), Postives = 877/923 (95.02%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. NCBI nr
Match: XP_011652202.1 (probable polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, chloroplastic [Cucumis sativus] >KGN59486.1 hypothetical protein Csa_002305 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1593 bits (4126), Expect = 0.0 Identity = 829/923 (89.82%), Postives = 874/923 (94.69%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D386 (Polynucleotide phosphorylase 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016614 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1745 bits (4519), Expect = 0.0 Identity = 906/913 (99.23%), Postives = 910/913 (99.67%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B784 (Polynucleotide phosphorylase 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486923 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1599 bits (4140), Expect = 0.0 Identity = 832/924 (90.04%), Postives = 878/924 (95.02%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DPG4 (Polynucleotide phosphorylase 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold352G007090 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1598 bits (4137), Expect = 0.0 Identity = 831/923 (90.03%), Postives = 877/923 (95.02%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LHJ6 (Polynucleotide phosphorylase 1 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G822370 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1593 bits (4126), Expect = 0.0 Identity = 829/923 (89.82%), Postives = 874/923 (94.69%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J8H1 (Polynucleotide phosphorylase 1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482241 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1562 bits (4045), Expect = 0.0 Identity = 817/924 (88.42%), Postives = 858/924 (92.86%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. TAIR 10
Match: AT3G03710.1 (polyribonucleotide nucleotidyltransferase, putative ) HSP 1 Score: 1173.3 bits (3034), Expect = 0.0e+00 Identity = 623/912 (68.31%), Postives = 738/912 (80.92%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. TAIR 10
Match: AT5G14580.1 (polyribonucleotide nucleotidyltransferase, putative ) HSP 1 Score: 432.6 bits (1111), Expect = 8.1e-121 Identity = 305/874 (34.90%), Postives = 449/874 (51.37%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. TAIR 10
Match: AT2G47220.1 (DOMAIN OF UNKNOWN FUNCTION 724 5 ) HSP 1 Score: 144.8 bits (364), Expect = 3.4e-34 Identity = 76/106 (71.70%), Postives = 84/106 (79.25%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. TAIR 10
Match: AT3G11964.1 (RNA binding;RNA binding ) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 3.3e-05 Identity = 34/120 (28.33%), Postives = 68/120 (56.67%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0333 vs. TAIR 10
Match: AT3G46210.1 (Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 2.1e-04 Identity = 36/145 (24.83%), Postives = 69/145 (47.59%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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