MC00g0162 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5polypeptideCDSutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTTTATTTTAGTTTATTTTTTAAAATTTCTTTTAGGTTATTTTTCAACGTTCTTCTCCATTCCTCCCAAGTCCCACCATAATAGTCTCCCGCCGCCCTCTTCCGTCCGTTCGTAGTCGCACCGTGCGCGCAGCTCCGGCCGCTCCGCCGTCGCACCGCGCGGCGGCTCTGTTCCTTCAGTCGTTCGAACCTTCCTGAGCGTATCAATCTCCGCCCTCGCATCCCCGTCGCTCCCTCTCTTTCCCTTGCTTTCGCGCGAGATTGTCCGAGAAATCCCCAAAATCGTCTCTCATTAGCTCCACTCGCAGTCCATTTTCTGCTGCAATGGCGTACGAAGGAGGCAACCTCAAGTCTACCTCTATCAATGGGGTGAAACTCTACACCGTAGCATCCCAGCAACGGTCTCTTGCTACTTGGCTCGATCCTAAGAAGATGCGAGCTCTGCGCAAAGACAAGGGTGACTAGCTTTTTCTTTCCTAGAATGATTCTCTTAGTGCAAAACTCACTTTATTAGCCTCTATTAGATAATTTGCATTATGGGAAACTCATGTTATCGACTTCTACTTCAATGAAGTTTTGTTTCTTGAAAAAAATTAATGTTAAATGAAAATATGCTTGATGAATACACGATTTTTCTGTTCTGTCTCTATATTCATGCTTATTGAGCCAGTTACATGGGAATAGTGATGGTTATGCAGTGTCACACTACCTTGTTCTTGTATTGGTTTTGGCCATTATCTAATTCACCAATCAACCCTCTTAAGGTTTCTATTTTTTATTTCGTCTTGAAGTGTTTATTGGAGTTTAGTTATGAGATTTGGAGTTCAATAATGAGATATTTTCCTTTTCACTATTGTCATTTACATTGGTATGCTGTTATTTAACAGTCTACTATATTTGTATATATAATGTAGTTTGTCTGTTTTTCTGTAGACTACCTGGAAAACCAAGAATTTAACATTTCTCTATGATGGTAGCCAAGTTTTTCCTTGTTTCCTTGAAGTGTTATGGGATCAGCCATAGAAGTTCATCTTCGCCTTGTGTTGTAACAACTGCATTTTTTAAACTTGTTTTCTGGCGTGGTGGATTGGCTGCTCTGTCGACTGTCATCAATGACAGATTTCAACAAGCAGGAATCTTTCTGATCTCGATTATTTGCTTTCTTGTCCATTTCGGTACTGGGGTGTTGGTTCTATTGTTTCTTGCTTTGAGTAATACTCTTCGTATTATATTTGTAGCCCATGTAACATGATTTTCTGCATTATTTACTTAGGACCAACAGGCAACAATTTCTTTATGAAATCTTATCCTCATTCTTCTGCAGCATTGTCCTCCTGTGAAGTGTGAAGACAATAGATTTATGTTTGTGTTTTCATCATCCGTTGCTGCTTATAATTTCATTCCTTGATGTGTCAGATTATACATCAAGGGTGGACTTGGTCCAGGATTTGAGGTTTGAAATTGCAACAAGCAAAATAAAGGCAACACCTGATGGAGAGTTTCTAATAGCATCAGGTGAGTTTGAGCAAGCAAGCTAAAATTAGTATCAGTAATCAGTAAGAAGATTAGTAAGAAAAAGTGTAAAAGGATAACTACTTATTTTTGCTAGTATCTATTGTTACTTATGTATAGATGTAAATAGGTATCTATCCACCACAAGTTAAAGTTTATGAGCTGAGGGAACTCTCATTGAAGTTCAAAAGGCACTTTGATTCAGAGATAATTGACTTCCAGGTAAATTTTATGTTGGGGAGCTTTGGTTGGGTTGGATTTCTGTGGGGGTGGGGGGTAGGTTAAATTTTCAACCAGAAACAGAAGTATATCTGTTCTTCATAAAAACCAGGGGTTTATTATCATCTTTAATGATGTGATCTTTAAGCAATATGACTCTTATATGTTTTAATATCTCCTTTTCTAGTATAGGACAATGGATCAATGAAAATAAACTTGTGTTTTCAGGCTTTAGCACGTACTTGGACCAGGCAAACATCTAATTGTCTAGTAATCTTGTTATCACAGAACCTATAAAATGTTATTGATGCATGTGGTTTCTTATTAAAAACAGTATTATTCTATGTTGTATGGAGGGAAAGCAAGAAATTCAGAATTTCATTTTTCTAAATGCTTGTAACCAAAACTCTTGCAGTGTAACTTTATATAGAGTTTTATTACTCTTGATATAGACCTTGTTCCCTGTGGATAAAATAGCCACTCTTATATACTGAAATCTCAGTTGGCCTTTGATGTAATCTCTGATTTCAAACAGTTTGTGATGACTGAATGCATGGTGGTTGGATATGATATTTTTTATACAAGAAAATTAATTTTCATTGACATTAATATTTTTTTAAATGAGATTTTCCATTAGCTTTAATGAAAGAACAAAACAAGAAGGCCACCCAAAAATCTTGCTTAATTGTTCTTCAGCTCTTATTTCTTTCTGTGAAATATTGCTCAAGGTTTCTTTTTCTTTGTGCTTTAAATTAGTTAAATGCTACCCAATTAGCCTGTTCATCTTTTGCACATGTTTTTTGCCCTTTTTGGAATTTATCTGAATGTGGGGGATGGAAGACAGTTGAATATTTGATTAGGCCATGCTATGCAGGTAGTTTGTTTTTTTGAATTTTGAAATATTAACTGAATTTAATGTTTTTTTGTCGTATAGATACTGGATGACGATTACTCAAAGCTAGCATTTATGTGTGCTGATCGTTCTATTGTTCTCCATGCTAAATATGGAAAACATTATAGTTTGCGGATACCAAGGTTACTTTCTTATGGTTTATAAGAACCTGTTTCCCTTTTTTGTTTTGTTATAAGGTTGTTTTGACAATTCCAACCCCCCCTCCCATTTCTCAATTGTAAATTATTCTTGCATCTATTTTAAATAAGAGACACTATTATTAACAAAGAACACAACATACAGAAGAGGGAACCCTTGCCCAAAAGAGCTAGTACAAGAAATCCTTCAAATCCAGATTAATAAAGTAACACTTTGATTACCAAGGAATTTATTGGTTGTAAAGTGGGGTTTGTGGCCTAATTCCTACATTGGCCTCCCCTTGAATGGTAATCCTTGGGTTATATCCTTTTGGGATTCAATTATTGAAATAAAATCTTCATAGTACTTTTTCCTTCCACTATTTGTCTATTGGAGCTTGCCTCATCCCTTTTATCGAATGTAATGATGCAAATTGTGCTCTAAAGGAGTTCTAATATGCAATTTTGACATTTCTATTTTCTATGGTTTTCATATATTGGAGGAATTGTGCTCTAAGACTTTTTGTAAATTTATTTTCTCAATAAAATAGTTTCTTATTAAATAAGGATAGTTAGAGTTCATATATGGCTACATATTGACCTTAGTCCGATGGTTTCACTTTTTCTGTCTCATATGAATGACTGATCTCTACCAAAAAAATAATGACTAAGCTCTAATCGTGTCATCTATGCAATCAACAGGGTGGGAAGGGATATTGAATTTGATTACTGGTCTGCTGACTTGCTTTGTGCTGCATCCTCTCCTGATGTGTACAGAATCAATTTGCAACAGGTTTTAGTTTTTTTTCTTTTATTATTTTTTTGAACTGAATCAACTGATGCAAATTGGACAGGACTTAGTTAGATTTTCTAGATTCATATAATGAGGATGCACGAGAATTCCATGAAACATTTCCTACAACAGTAATAATGATGTGCAGCTTACGTGGCAATTTCTTTAGGGACTTGTTAGTAGCTTTGGAGAAACAATTAATGCATGGATTAATTTGAACTTTGATAGTATATTGTCATATGGCATTCTTTTTAGAAGAACGTTCTATAAATATAACAATATAGGAAGGCATGAAGACTGAGAAATACTGTTTTCTATAAAAACAAATTCAAATTCATAGAGTTTATTTTTTTGCCTGCGGTAATCATTCATAAGTGCTGATTTTTGGGTGGGTTTTGTGTTCCACGAAGCTTTGTTCATGCTTTTAGTTAAAAAGATATAGAATGCTTATTTTTCATATATCTTATCGAAAGAACAATACAACCCCAAAATAAATAAAACCTATTACAAGTAAATACCAATGGTACGAGGCATGTAAAAGGAAAGTGAAACATGTTGAACTTTAAGAAAGGTAGAAACCCTGCTCAAACTGCTGTTCTGTGGGGTTTGTGAAATGAGAGAAACAACATGAGTTTTAGAGGGGCTGAGAGATTTTGGAGGAGATTTGGGCTCAATTTCCTTTTGTGCTTCAGTGTCCAAAGATTTTCATAATTATTCCTTAGGTTTGATCTTGCTAGATTGAAGAATGTTATTTTAATTCGGCTCCTTTTGCTTGGCTGTCTTCATGTATGCCTTTTTGTATTATTTCATTTGTCTCAATGAAAGCATCTTTTCATAAAGAAAGGTAGAAATGAATCAGGGAGGAGAAACGAGAAAGAAAGAAATAAAGAAAGGGAAGTCCGAAAAAGGGATAAGTGAGGAAGGTAATATGTACAGATAAAAAATACCAACGGTAACTATATACAATAAGGTAAAATAGAAGTAAAGGGCCTAAGCACAACTTCATATGTGCTGAAACTCCAACTGTAGTTTTTTGTTTTTGTACTGCACGTTGAGTATAAAGATACGATTATAATGTTAATGTGTCATGTGCTATATGTCTTTCTGAATATATTTATTATAATTTGTGGTTTTCCAAGAATATTTTTCAAACTCAGAATTGGGATAATTTTACATATAAGTTCATAAGTAAGCCTTTGGTTTATTGTAGGGGCGATTTCTTTCACCTCTCAACACTGAATCCTCAGCAATAAATGTAGTTTCTCGAAGGTAATGGTTTATCTTATTGTTGTTTTTTTTTTCCGAACAAGAAACAAACTTCTCATCGATGAAGTGAAAAGATACAACAAATGTTAATGGATCCCATTCTTGTTACATTACTCTTCTCATATTAACTGATTTGGTTTTCTTTATTGATCAGTGAATTAAATAGTTTCGTATG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MAYEGGNLKSTSINGVKLYTVASQQRSLATWLDPKKMRALRKDKDYTSRVDLVQDLRFEIATSKIKATPDGEFLIASGIYPPQVKVYELRELSLKFKRHFDSEIIDFQILDDDYSKLAFMCADRSIVLHAKYGKHYSLRIPRVGRDIEFDYWSADLLCAASSPDVYRINLQQGRFLSPLNTESSAINVVSRSKIHGIVACGGEDGAVECFDTRTKLSSIGRIDAVAPAGDKAQEVTALAFDDIGGFQMAVGSSSGKVLIYDLRSSVPIRIKDHMYDSPILDIKWHSTLNSEKPKMITTDKHIVRIWDPDTGEGMTSIEPTLGPINDTCVFKDSGLMLLALNSSQIPSYFLPALGPAPKWCSYLENLTEELEEGAQTTIYDDFKFLTKEELERLNLTNLIGTNLLRAYLHGFFIDYRLYKKAKSLVDPFAYDAYIEQRKKEKLDEERANRITMKRKLPKVNRRLANQILEDEEAEKEKKDEDTEKEKKDDVNKTKKASKKKKGFSSEIFQDERFSNMFKNENFEIDEFSQEYLALHPVSSTKQPSLVEEHFEPVSEDSDQSISNSDASVASESEDEPGSGKHKKARVPKLYEVKDERHAEAFWNRVSLAKENRLTMEERVAAMGDNKRDSGILNEVKLGPGGSREISFRPRSSARYKEDDDDEGPRKKNMRSAEFAGSKGKSGVRGRMRPGQSRGRGRGRGRRGHR Homology
BLAST of MC00g0162 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7T0Q5 (Nucleolar protein 10 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=nol10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 457.6 bits (1176), Expect = 2.5e-127 Identity = 274/715 (38.32%), Postives = 429/715 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NVM6 (Nucleolar protein 10 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=nol10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 441.0 bits (1133), Expect = 2.5e-122 Identity = 269/715 (37.62%), Postives = 428/715 (59.86%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q802W4 (Nucleolar protein 10 OS=Danio rerio OX=7955 GN=nol10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 438.0 bits (1125), Expect = 2.1e-121 Identity = 268/755 (35.50%), Postives = 438/755 (58.01%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q66H99 (Nucleolar protein 10 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Nol10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 435.6 bits (1119), Expect = 1.0e-120 Identity = 262/715 (36.64%), Postives = 423/715 (59.16%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RJG1 (Nucleolar protein 10 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nol10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 435.3 bits (1118), Expect = 1.4e-120 Identity = 265/714 (37.11%), Postives = 415/714 (58.12%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. NCBI nr
Match: XP_022158780.1 (nucleolar protein 10 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1358 bits (3514), Expect = 0.0 Identity = 705/705 (100.00%), Postives = 705/705 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. NCBI nr
Match: XP_023540093.1 (nucleolar protein 10 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1213 bits (3138), Expect = 0.0 Identity = 637/714 (89.22%), Postives = 669/714 (93.70%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. NCBI nr
Match: XP_004137047.1 (nucleolar protein 10 [Cucumis sativus] >KGN43690.1 hypothetical protein Csa_017139 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1212 bits (3136), Expect = 0.0 Identity = 622/695 (89.50%), Postives = 661/695 (95.11%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. NCBI nr
Match: XP_038887856.1 (nucleolar protein 10 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1209 bits (3128), Expect = 0.0 Identity = 636/718 (88.58%), Postives = 672/718 (93.59%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. NCBI nr
Match: XP_022971181.1 (nucleolar protein 10 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022971182.1 nucleolar protein 10 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1209 bits (3127), Expect = 0.0 Identity = 633/711 (89.03%), Postives = 665/711 (93.53%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWS5 (nucleolar protein 10 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025246 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1358 bits (3514), Expect = 0.0 Identity = 705/705 (100.00%), Postives = 705/705 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K1Z0 (NUC153 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G058640 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1212 bits (3136), Expect = 0.0 Identity = 622/695 (89.50%), Postives = 661/695 (95.11%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I2M0 (nucleolar protein 10 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469983 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1209 bits (3127), Expect = 0.0 Identity = 633/711 (89.03%), Postives = 665/711 (93.53%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C010 (nucleolar protein 10 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495447 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1207 bits (3124), Expect = 0.0 Identity = 624/699 (89.27%), Postives = 662/699 (94.71%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EZS1 (nucleolar protein 10 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440847 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1206 bits (3121), Expect = 0.0 Identity = 632/709 (89.14%), Postives = 664/709 (93.65%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0162 vs. TAIR 10
Match: AT3G56990.1 (embryo sac development arrest 7 ) HSP 1 Score: 833.9 bits (2153), Expect = 9.3e-242 Identity = 453/721 (62.83%), Postives = 554/721 (76.84%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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