MC00g0057 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5polypeptideCDSutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTCTTATTAACCTTATCCTGCGATAGAAAACACTTTAGTTTCGTGCAGCACAAACTCACAGAAGGACCAAAACTGGGTACAAATCTTTGGAGAGAATGAAACTCGACCAATAAAGAATACTAATTTCAATAATGAAAATAAAACTCTGAAAATGACTTGAAATGGGGTCGTCAAAAGTGGGCACGCCGCCAGTAGGCAGCGTTGAATGGACTGACATTCCATTCAGCTTCCTACCGAAGAGGCATCTGCTTGAATATAAAACAAAACAAATACCCCACCGTTCCATTCATTCCATAAAGTCAAAATCGCCGTTATGGACTTCGCTGGCTCCCAATATTTTCATCCTGAAAACCGAACTCCCCAATCCCCCACTTCCACTTCCATTTCCACTTCCAATCATGGGGAATGGCAGCTCCAACCACTCCTCATCCTCCTCCTCCTCCGATCCCGATGCCGACGACTCCCGTCTCGCTCGCTTCAAGAATCGTCTGCACCGCCGTCGCTTTCTCCGCCGACGCCGTCGTGCCTCCAATGCCCGGGGTTCTGGTTCCCATACCAAACTCGGCTCCGAGGACGATTTCGCTGGAATCGCTGTTCTTACTCTTATTCGTGTAATTCACTTGCTCTTTTCTCCTTTGATTCTCTCTCTCGTGCTTGCTTTTGACATGCTTCGCTATTCTTGTTTCTCTGTAGGCGCGGATGAAGTTCAAGGACAAGTGGCTCGCTTGTGTCTCTTTTGGAGAGCAGACTTTTCGTACTGGAATCTCTGACCAGTTAAGTGCCTGATTCTTTCATAAAGTACATTCGCTTCCCGTTAGAAGATGTTATTGTTGGAGAAGAAGGAACTTTTAGAATATAAAGGGAAAAAGTGAAAATGGTTCACTGTGTAAGAATTCAAGAAAGCCTCATTGTGTGGAAAAGACGACTATGGGCATTACATTAGGTTATTACAGCTACACGCACGAACCATCTGGGGCGTGGAAAAAAATGGAATTTTTTTCAACTCCTGTGGCTGTGGCTGCTAAAATTGAAATGTGTGTTAAATATGGAATGGAATGTTAGAGCAGAAAAGTGATATTTGGCGGCAGATTTAGAGAAGAAGAGGAAAAACTTTCATTGAATCACATAGTTTCTTACATAAGAAAGTGCTGACAATCGAATACAACTTTTCTGATTGAGATGAACTATATCACTTAGTAGAGAGGATCTTTCTGATCGGAATAACTAATTTAAGAAAAGAAGGTATCAATGACATGGAAATAAGGAGGTGGTGCAATGTCAATGTTGGCACTTTTATTGGGATTAGTTTTTATTTGAACTTAATTTTTATCAGGTTTCAGGACTACAAATATTTGACAAAAAAAAAAGAAAAAAGAGAAAGAAGAAAAGAAAAAGAAGTATAAATGTAATAGTAGGATTTTATTGTAGAATTCCCACCACTTCTTAGGAGCTCTTGGTAAAATTGGAGCATGGTGTCTTTATCTGAATGTTATCTACGACGTAAGAATGTACCATCCTCTTTTATTTTTATTTTCTTCTGAAAAGTAATAGAACTGTATGATATCTGTGACATGTTCATAAAATTGTCACTCAAGTTATTTATCTTATTGTTTTGCGATAGTGGCTCTGCCATTTCAAAGACCCTTACATATACATATACATACGCATAAATATATATATACGGTTGAGTTTGTTGATTGGGCTTCATTGGTTCTGCAGCACTAAAGAACCAGCTTGGAACTCTGTGAGTACTCAAACCTCTATTGTTTTGCAGCAAACTAAATTTTTTTACTTGTTGTCTAATTAATTTTTTATTTGCTTTTGTATTTAGCATGCTTTTCCTATCAAAGTTGGAGTGGATCTTTGTTGTACCATCTTGCACTTTTATTTAAGTTGCACATTTATTTTCTTTTGCAAAAGTCATGTCATGTATATTGCAAGGAAAAATATGATCTCATAGCCAGAGATCAAGACGAAAAAGAAACACATAGGTCTGCCAAAATACCCACAGAGACACCATTAATAAGAAAACAAACTCAAACAAAACAGCATAAGAAACACAGCTCACAATTTGAGCGAGATAAAAAAAATACAAACCCATACATGAAATATAAATCTCAGGTAGACCCTATTAATGGGTGGAAACTAGAACGAATGCTATCTCGCCAAGTAACAACACGAACATACACATCACTCTGAACAAGAGGTAAAATAGTCGTGGTTGGATGAAGAACACTCCATGAATCCTCATGACATTTAACAGGGTCATTTAGCAGCATTCCACGAACACCAACTAGACATGGCCAGAGTAGAAGGATCCTCTGGACTCGAGTGAGACAAATGAGCCAAGTGCCCCTTCTAAAGCTACATAGTTTGTTTCTTAGATAAAACCACAGAGAAATTCTCAGGTGACTTCGTAGACAATTAGCACCCCTATCCTTTGGAGGAACCATAAAATCCGAGGTTCCTAAAGCCAATGATAAGGATCAAGAGGAACTAACCGCAGTTTTAAAGTCACAATCTGAGCGATCTAATATTGAAAACCTATTTGTAGGACCTTGTGTTGACTTTGTAGGGGAAGTGGGAGGGGGGAAATATTGAGAAACATCCACCTTAGCTGGTTGTTGGCTAAATTTTGAGGCATCTTTGGTACCCATGCCTTCTTAGGACCATGAGGGCATAAGGCACTATAATGCCTGTACACCATACACCGATCGTACTTCTTGGGTTTCCAAGAGTACTCAATAGGGATAACAAAATTCAAACCTCGAACGTGAACCTTGACAGAATTAGGAAGAGGATCATCAGCAACCACTTCTACACACATTCTAGCAAAACGCAATTTACTTTCCTCCCCAATAGCTTTATCAAGGCATTGTGGTCTACCAACTGCACTAATACCTTTGAGGAGTTAATCCACAAGGGAAACATGATGAAACTCAAAGCGTTGGAGCACAATAATGGGCATCTACTTCCATAGTATCACAGGCTTTCCTCCGATACGCTATGGCCTATTACCCAAAATCCAGTCTCGAATCTCGAGATTCCACTCCACATGGCGAAAACCAAAATAGAATAAGCCCATTTTCCAACATGATAATAGTAGGCTACTCCAAATTTTGGTCACCAGTTTAGAGAGAACATCAAAAGGGACACACGAATCGATAAATTCCCACCATTGAACCTTACCATTTTTTAATACCCTGTTCTACAACATTATTGACGGAATGACCACATTTTCACCATTAATAAGCACTGGTGATAATTTTTTCTTTGTTTCTACCAATAAGAAACAATATGTTTATTATTTTGATATTTGTGGGTTTCGAGGCCAACTTATATGCACCTTCGCTAATCTCTTGAGATAACCATTTTTTTCTTGAGAAAATTTATGGATGTTTTTGAACTATAACCTAAAAAATATCTAGTTTTATAGCTACAACTATTAGGCCAACCCATGTTGATTTTGATAAAAATAGTATTTCATTAATACGATAAAATGGAGAAAAGGGGGAAGAGGCTGTAACCTGAAGTTATTAAAAAAAGGCTCTGCAGTTCAGACTTCAGAGTGAAAAAAAATAAAGATAGTTGTAGAACTCCTAAAGGAGGAGCTACAGGGAAGAAACAGATAACCTAGAATGCACCTAATTGCATTAATCCAAAAGCGTTAGCTTGTGTGTGATATAGGATTGCCCTATAACTACACTCATGACTTTGGGGTGTCTTTAAGACTCTCTCTTGCCTTCAGGCTCATCCCATCACCTATCTCTTTCTATCAATTATCCCACGAGTCCACCAATGATGATGGGTCTTGCCTTGACTTCCGTTTATTTGTGCCTTCGCTTCACATAACATCATTCATACCTTTGTCGACCCACAATTGGATATTTGTCCCTAGGTTATGTCCTCTGCTGATACCTTTAGTCCATGGAACGCAATGTTTGTGCCGTTGCCCAAGGGATTGCGGCTCCCAATGAAAGACAATGGAGGCTCACCTCAACCCTTATTGCTAGCTCACACCATAGCACACCATGTTCCAAGGTGACTCACGTAGGCTCATGGTTCAAGAATTGTGGAGATTTTACACCATTCCTCATCTATCGTACATTTTGAGCTATCTAGGCTTTTTCATCCATGAATATCAAAATAGCAAGGAGTCACTTGCTTTGTGGAATCTACATTCTTGGCCACATGACCCCCAACTTGGCTTGTCATCATGTGCCATCTTCATATGCTCTCATTTGCATGACTTGCTCATGACACTGCCCAACCCATCTGATTTAGAACATCTTTTCTTGATTAGTTCTTGACACATCTTTAAATGTTGGTTGTAATCTCGATGTTTGAATTACATTCTTGTATTCGGGTAGCCTAAGGTATTCATTTTACAGTAGCTTTTCTTACCTAGCTCTTTTTACAGCAGGTAAATTGTGTTACCTTAGCTGTTGGATTTTACCATGAGTTGGTTGTTAGGCTGTTACTGTGGCCTCTCTATTATAAGCAGAGGCCGCTGAGATTTATTTGAAGCATCTTTAAGTGAATTAATAAAATATTCCCTCATTTGAATACATCAAGTGGTATCAGAGCGCTCGATCCAAGGCGTTTCTTTTGGATCTCTTAATGTTGAGAAACAAAACCATTGAAGTGGGAGCTTCTTCACAAATCCCTCCAGCAGACCAACACTTGCACTCGGTTAAAACAGCAGTGGGTGAAATGAAGAAAGCTACAGGCTGTAAAATGAACACCGTAGGGCTTAGACTACCTGAATGCAAGAATGTAACTCAAACATCAAGATTACAACCAACCAATATTTAAAGATTTGTCAAGAACTAATCAAGAAAAGATATTCTATATCACCATCCTTGAGTCTTAAGTCGAGACATTAATACCCTAAGTCCTAACAGAATAGACAAATAAATAAAGAGAGAGAAATTCCTCTAAAGTCAGCCGAGGAAGAAAGAGAGAAATTCCTCTCCCACAGTTGACTTGACCG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ATGGGGTCGTCAAAAGTGGGCACGCCGCCAGTAGGCAGCGTTGAATGGACTGACATTCCATTCAGCTTCCTACCGAAGAGGCATCTGCTTGAATATAAAACAAAACAAATACCCCACCGTTCCATTCATTCCATAAAGTCAAAATCGCCGTTATGGACTTCGCTGGCTCCCAATATTTTCATCCTGAAAACCGAACTCCCCAATCCCCCACTTCCACTTCCATTTCCACTTCCAATCATGGGGAATGGCAGCTCCAACCACTCCTCATCCTCCTCCTCCTCCGATCCCGATGCCGACGACTCCCGTCTCGCTCGCTTCAAGAATCGTCTGCACCGCCGTCGCTTTCTCCGCCGACGCCGTCGTGCCTCCAATGCCCGGGGTTCTGGTTCCCATACCAAACTCGGCTCCGAGGACGATTTCGCTGGAATCGCTGTTCTTACTCTTATTCGTGCGCGGATGAAGTTCAAGGACAAGTGGCTCGCTTGTGTCTCTTTTGGAGAGCAGACTTTTCGTACTGGAATCTCTGACCACACTAAAGAACCAGCTTGGAACTCTGAAAAGAAACTTCTCTTGGAGAAAGGTGGACCCCATATGGCGAGAATCTCTGTTTTTGAGACTAATAGAATATCTCGCAACAACCTTGTAGGGTATTGTGAGATAGATCTACTTGAATTTCTATCACAAAATTCAGAGACTGATACTGAGGAACTTGAATTGTTGGATCCTTCACCACCTAATGCAGTGGTGGGCAACATTTCTGTGTCATGTTCTATCGAGGACCCGATTGAAACAGAGAAACAATTTGCAAAGCGCATCTTATCTATTGTGGATTATAATCAGGATGGAGAGCTCTCATTCTCTGAATTTTCTGACTTAATTGGTGCTTTTGGAAATCAAGTGGCAGCTTCTAAGAAAGAGGAGCTTTTTAAAGAAGCTGACAAGAATGGGGATGGTGTTGTTGCGCTTGATGAATTGGCTGCTCTTCTTGCTGTTCAACAAGAGAAGGAACCATTGATGAATTGCTGTCCTGTTTGTGGTGAAACTCTCGATGTTTCTGATAAACTAAACAGTATGATTCACTTAACACTATGTTTTGATGAAGGAACTGGAAACCAAGTTATGACCGGAGGATTCTTGACTGACAAACAGGCTGCATATGGGTGGATGTTTAAATTAAGCGAATGGGCTCATTTTGCATCTTATGACGTTGGTCTAAACTCTGGTTCAAGTGCATCTCATATTGTAGTTTACGATCGGCAGAAAAAAAGGCTTGTGGAAGAGATAATTGATGGAAAGATTGTTTTGTCAATGAGAGCCATCTATCAGTCAAAAGTGGGTCTCACCCTTATGGATAAAGGGGTTAAAGAGCTCTTACATAGCATATCTGAAAAGCAAGGGAAGCGGATGGATTCAGTCGAATCTGCAAAAGATATTCCACATTTCATTGAATCTTTCAAGGATCAACTCAATTTGAGTGAGGTGAAGCATCCTTTGGAACATTTCAAGACATTTAACGAATTCTTTATACGAGAGTTGAAGTCTGGTGTGAGACCAGTTGCACACGTGGAATGTGACGATATTGCAGTGTGTGCTGCTGATTGCCGACTAATGGCATTTAAATCAATTGATGACAGCCTAAGGTTGTGGATAAAGGGGCGGAAGTTTTCGGTTCAAGGTCTTCTAGGGAAAGATATACATGCGAGTGCTTTTACTGATGGGGCGTTGGTGATATTTCGTTTGGCACCACAGGATTACCATCGCTTCCATTTTCCAGTTTCTGGATTCATTGAACAAATTGTAGACATACCTGGATGCTTATATACTGTTAATCCAATTGCTGTCAATAGCAAGTATTGCAATGTCTTCACAGAGAACAAGCGATCAGTAGCAATAATTTCATCTGCTGATTTCGGCAAGGTTGCTTTTGTTGCAATTGGAGCTACAATGGTTGGTAGCATAACCTTCTCAAAAGGGAAGGGAGATTATGTAAAGAAAGGAGACGAGTTTGGGTATTTTTCTTTCGGTGGAAGTACTGTAATTTGTGTCTTTGAAAAGGACTCGATCCAGATAGATGAGGACCTGTTAGCAAATAGTTCCAGATCACTTGAAACCTTGGTTCGTGTCGGGATGAAGCTTGGTCTTTCTACCAGAACAGTTTCTCAAGCTGATTTTCCAGACGTAAGAAGTTGTGCCTTAGATGATCGAAAATGA MGSSKVGTPPVGSVEWTDIPFSFLPKRHLLEYKTKQIPHRSIHSIKSKSPLWTSLAPNIFILKTELPNPPLPLPFPLPIMGNGSSNHSSSSSSSDPDADDSRLARFKNRLHRRRFLRRRRRASNARGSGSHTKLGSEDDFAGIAVLTLIRARMKFKDKWLACVSFGEQTFRTGISDHTKEPAWNSEKKLLLEKGGPHMARISVFETNRISRNNLVGYCEIDLLEFLSQNSETDTEELELLDPSPPNAVVGNISVSCSIEDPIETEKQFAKRILSIVDYNQDGELSFSEFSDLIGAFGNQVAASKKEELFKEADKNGDGVVALDELAALLAVQQEKEPLMNCCPVCGETLDVSDKLNSMIHLTLCFDEGTGNQVMTGGFLTDKQAAYGWMFKLSEWAHFASYDVGLNSGSSASHIVVYDRQKKRLVEEIIDGKIVLSMRAIYQSKVGLTLMDKGVKELLHSISEKQGKRMDSVESAKDIPHFIESFKDQLNLSEVKHPLEHFKTFNEFFIRELKSGVRPVAHVECDDIAVCAADCRLMAFKSIDDSLRLWIKGRKFSVQGLLGKDIHASAFTDGALVIFRLAPQDYHRFHFPVSGFIEQIVDIPGCLYTVNPIAVNSKYCNVFTENKRSVAIISSADFGKVAFVAIGATMVGSITFSKGKGDYVKKGDEFGYFSFGGSTVICVFEKDSIQIDEDLLANSSRSLETLVRVGMKLGLSTRTVSQADFPDVRSCALDDRK Homology
BLAST of MC00g0057 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4KAK5 (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PSD2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 911.8 bits (2355), Expect = 5.1e-264 Identity = 452/643 (70.30%), Postives = 545/643 (84.76%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4GNA8 (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PSD3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 899.8 bits (2324), Expect = 2.0e-260 Identity = 456/659 (69.20%), Postives = 551/659 (83.61%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5JN42 (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PSD2 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 819.3 bits (2115), Expect = 3.5e-236 Identity = 419/644 (65.06%), Postives = 505/644 (78.42%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O14111 (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 3 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=psd3 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 261.9 bits (668), Expect = 2.1e-68 Identity = 154/375 (41.07%), Postives = 222/375 (59.20%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5AK66 (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Candida albicans (strain SC5314 / ATCC MYA-2876) OX=237561 GN=PSD2 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 261.5 bits (667), Expect = 2.8e-68 Identity = 182/524 (34.73%), Postives = 271/524 (51.72%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. NCBI nr
Match: XP_022154387.1 (phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1295 bits (3351), Expect = 0.0 Identity = 657/657 (100.00%), Postives = 657/657 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. NCBI nr
Match: XP_038888956.1 (phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1182 bits (3059), Expect = 0.0 Identity = 596/658 (90.58%), Postives = 629/658 (95.59%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. NCBI nr
Match: XP_008455245.1 (PREDICTED: phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1174 bits (3037), Expect = 0.0 Identity = 591/661 (89.41%), Postives = 628/661 (95.01%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. NCBI nr
Match: XP_011658767.2 (phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 [Cucumis sativus] >KAE8645793.1 hypothetical protein Csa_017374 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1174 bits (3036), Expect = 0.0 Identity = 590/660 (89.39%), Postives = 624/660 (94.55%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. NCBI nr
Match: XP_023553974.1 (phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1150 bits (2974), Expect = 0.0 Identity = 586/656 (89.33%), Postives = 616/656 (93.90%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLJ7 (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021669 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1295 bits (3351), Expect = 0.0 Identity = 657/657 (100.00%), Postives = 657/657 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C020 (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495456 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1174 bits (3037), Expect = 0.0 Identity = 591/661 (89.41%), Postives = 628/661 (95.01%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HGJ7 (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463896 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1148 bits (2969), Expect = 0.0 Identity = 585/656 (89.18%), Postives = 615/656 (93.75%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HVG6 (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467035 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1142 bits (2954), Expect = 0.0 Identity = 581/656 (88.57%), Postives = 614/656 (93.60%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N5HSM0 (Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme 2 OS=Pyrus ussuriensis x Pyrus communis OX=2448454 GN=PSD2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 987 bits (2551), Expect = 0.0 Identity = 491/657 (74.73%), Postives = 568/657 (86.45%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. TAIR 10
Match: AT5G57190.1 (phosphatidylserine decarboxylase 2 ) HSP 1 Score: 911.8 bits (2355), Expect = 3.7e-265 Identity = 452/643 (70.30%), Postives = 545/643 (84.76%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. TAIR 10
Match: AT4G25970.1 (phosphatidylserine decarboxylase 3 ) HSP 1 Score: 899.8 bits (2324), Expect = 1.4e-261 Identity = 456/659 (69.20%), Postives = 551/659 (83.61%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. TAIR 10
Match: AT4G16700.1 (phosphatidylserine decarboxylase 1 ) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 6.1e-10 Identity = 73/296 (24.66%), Postives = 108/296 (36.49%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. TAIR 10
Match: AT1G66400.1 (calmodulin like 23 ) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 2.6e-05 Identity = 27/86 (31.40%), Postives = 44/86 (51.16%), Query Frame = 0
BLAST of MC00g0057 vs. TAIR 10
Match: AT5G17470.1 (EF hand calcium-binding protein family ) HSP 1 Score: 43.5 bits (101), Expect = 8.5e-04 Identity = 21/63 (33.33%), Postives = 38/63 (60.32%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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