Lsi11G015940 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi11G015940
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr11: 24314801 .. 24319403 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi11G015940
SyntenyLsi11G015940
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGAAAGCTCACAGTTGTATTGTTCATCTTCCTATCCCTTTCTTCTGGTATCGGATCCGATCTGATGCGGTTATTTAATTTTGTGGTTTAATTTAATATCTTTGTTATAGGAATGAAATAGAGAGAGCAATATAATAGAAGTTGTAATGTTGTTGATTACAGGTTGGATGGTGGCAGAGACGGAAGGAAGGACTTGCTACAAGTCGAGCCCATCATTCAAGGGAAAGTGTAGTTCGGACGAAGATTGTCTTAGAGTTTGCGATGGATATTGCTCCCCTGGTCGTGGTTCTTGCATGTGTCCCGTGCCTTGTTGACTCTCACTCTTATGCTGCTCTATCTTCTCTTAACTCTGCTCTTATATATGTAATTCGTGCTCTTTCTAGAACTTGTTATCTTAAATAAGCTACTGTCTACTAAGTTATACGCAGTACGCATGCACAATACATTATTAATCAATGGATTTCAACTTATATATTCACATTCTCGCATTACCTACTATGCTCAAAGTAGATGAGTGATGATTTTAGAAGTGCCCAAATTGAGTTTAATTTAGGTCATGTTTGAGACTGATTTTAAAATTTTTTCTTCTAAACTTGTGATGTTTGGCAAAGATGAGAAAATTATTTTTAGTTATTTCCTATCAATCACTTGGAAGGTGATTCCAATTGATTTTTGTTAGGTGGTTTTTGTTAAATGTCCATTTTTATCTTTATTTCTCTCTAATTCTTACCCGTATCTAAAGTTTTTATTATGCTTACCTCTAATTTTTTTTCTATTTTCTAAAAGACACCATTTTTCTCACAATTTTGTCTCCAATGATTTTTAACTCTCTAGTTTTTTTCACCTCATTCTCTAACTTTTTGCTCTGATTTTTTTATTGAATTTTCTACGCATATAACATAATATATATATTAATACCAAAAAAAAGCATGTAAGGTAAGTTTCTTGTAATTATAAATTTTTCAAAACGAGTTTCTTTTCAAAACATACACACTTAAAGAAAGTTTTTCTAAAAATTCGAAAAGTATTACCCTCATAAATGAAAGTAAGAACCGACAAGAAGTTTCGAATTATGAGAAAACAAAGTATATTTGATGTATACAACACTATATATTTAAACGTGTTTTATATTAATAACTAGCCAAATACTATTGTGTCGCACGTGTTTTATAAGAATAAAATAAATATTTGAATAGTTTAAGAAAAATATGTGATAGAAGGTATATTGGTTAATTTATTTTTTTTCACAAAATTAAGTCTTTTAAAATTTCGTGATCATTGTCCCTTAGTTAAAAATAATTCTTTTTTATTTTTATTTGAATGATTTGATTATCTCTTAATATCAAATTTTAATTTAAATCTAAAAAATATATATTTTTAAATTTTCATGATAACCCTCTTTTAGCTAGTTTTTTTTTAAGAAAAACAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATTTTAATTTAGATCTCCTCCTAATTTTAAACTTTAATTGAAATGGAAATATTTTTTCATTCTTCTTAGAAAATTCGTGATAATCCTCTCTTATTTTAAAAAATCTTTTTTTATTTATTTTGATTTTGACTATTTTATTAATCTTGTTAGTTTAAAACTTTCATTTTAATCAAAGGATCATTAATTTTTTTCCTTAATTTCATAATCATCCTCTCTGAATAGAAAAAAACACCATTTTTTTAACCCACAAAATCTTTATTTATTTATTTATTTTAGAATTGGATGATCTAATTATACTTTTAATTTTATTAATATTTTTTTCGTGATAATCCATGTAGTTAAAAAATCTTTTTAATTTAGATTTGGATGATGTGATTATCTTCTAATTTCAAACTTTATTTTAAACTAAAATATATATATTTTTTAATATTATTTCTTTCCTTAGACATAAACCCTAAAAACTTATTTTTATCTTATTTAATTTGAACAATTCAAATTTTTCAAAACTAAATAATCCATGTTTTACCTTAGTGAGCTAGCAAGGGGATCTAATGAAACTTTAAATTAGAAGCTCCAATTATTCAGGATTAATTAATTAAATTAATCAACATTCATTAACTGTAGGTCACTCCACTAAAGAATCGCACCTGCACTCTTCGCACTGTAGATATATTTTTGTGTCCATGGATATCACTGTTATTAGTAAGTCGACCCTTCACGAATTGCTCGTAATTATAGTTGGGTCAAAATTACCATTTTACCCTTATAATTACCTTTTACTCTTAAGTACCACTGATCCCGTTAATGAACAATCAATTTATAGTCTAACTATAAATTAAATTCCTCCTGGGCCAGTGAGAGGGTGAAGTCTCATTGTTTAAGACTCGAAATCAACCCTTAAGAGAGCAATTCATCTACTTATCCTAAAGACGGGAAGGAGTGAACCTCATCTTGTGTAGCTATGTTCCCAGCTCCTTACTTGAACAAGTCCTTAAGATGGTAGGCTTATTAAGTCGGCGACACAAGCTACTCTCACCCATACAAGTCAAAGGACTTTCCTCATAGACAGGAATTCATAACTCACTCAGGATTGAGATCGAGTTACACGATTATTCTATGAAATATTAATCTCTTCAATTAACGGTGTTATAAAGAGAGATTAATCATTTCGCGGTCCGGTCTTATACAAACTCTTTGTATAGGATACCCTCACCCGCATGTCTCCACATGAACGATTTGGATCAAATCGTTTGTAACACTTACAACTCTTGTAACATTTACAAGGTGGGTTGTATCTGCAGTGTCACCACGATAAGGCACCCAACCTTATCTATATACTGTAGACTTTTTATGTTATTAATTGAACACGATTCACTTGTATGTCTACCACATATTGTTCAAGTTACATAAAATAACCTTGGATCTTAGTTTATTGGATTGAGTTACACAAGACTAATTGTTGAATAAAATAATACTTTATTTTATTGAATAAATGAATATTTGTTTATACATTACAAACTACGAGATTTAGGACATAAATCCCAACATTTGAATCCACCATCAAAAGAATTACATAGATGACACATTTAATATCTGTCATTGTTGATTTTTTCATGACCATTTAGGGTGTGTTTGGAATACATTTTCAAGTATTTAATTTAAAAAATAAATCATTTTGGCAAAAATTGGAATGTTTGGTAATTACTCAACATAGATTTTGAAGTGTATTTTAAACAGTTTTTATCAAAAGAGTTTAAATAAAAATGAGTTTTTTTAAAAACACTTTTTTCTCAAGTCAATCCAAACGAGCCATTGATATAGTCAACAATAAGCATTTATTGACATCTATTACCTATCATGGAAACATTTTTTATGACAATTTGTCATTGTCAATAAATTACTCAAAAGTTGACTTTTTCTGTTAATTAAACCTTTATATTAACGTTGAAAATATATCATAGAATTACATATATTGACATTTATTTATAGTCACATTACATGACATATGTGAAATATAAAAAAACTGCTTATAATGACGGATAATTATTTGTTTCATGTCTATCATTACACTTATATTTCCTCCAATTTAGACACAAGATACATACAAACATAAATATAACAAGATTGGTAACGTTTATACAAAGAAACTATATATATAAGGAAAGTAGTAACCAAACTTTGGTAAGTTATTTATAAAGATACTAGATACAAAAAATGTTAGCCAAAAAAGTTTGGCATTATCCCAACAAAAAAAACACATACATAACTTGGTTGGTGGTTTCCTCACTTCAACAGTTTTGCACAAGGCCTACTAAAAAACAACATTTATTTTAGAATTCAATTCAATACATCAATGTCAATAACAATAATAATATTGCAGGGTGTGTATATCTTCTTAATGTTCACTCATGTATATCTTATTAATGTTCACTCTTCTAGCATACACAGAAAATAATCAAAATCACACTTTAATAAAATAAAGAACAACAGTAAACAAATAAACCTTGAAGTATAATCATTTATAAAACAGAAATGCATATGATTTCCATAATATAAATTAGGAAAAGCTTGGCTGTTCGTTCCAAAAAAGAAAAAGTGTAGAGAAATAACCAAATTTATTGAGGAAAACATGAAGGGAAAAGGAAAAGACATGTGTGAGCATATAAATTAAAAGGGGGTATTGAGTCCTAAAAGTTGAAGTGCGGGAAATATTAAAAAGAAATTAAAGAGATGGCGAGAGAAGGATGGAGAAAACTCACAATTGTGTTGTTCATCTTCCTATCCCTTGTTTCTGGTACTGGAACTAATCTGATGCGATCCTTCTAGTTGTTTAATTTTGTGGTTTAATCTAATATCTCTGTTACGACAGGAATGAAAATAGAGAGAGTAATATAATAGAAGTTGTGCTGTGTTATTGCTCATAAGATGGATGGTGATGGAAACGAAAGGAAGGGCTTGCTACAGGCCGAGCCCGTCGTTCAAGGGATGGTGTAGTTCAGACGAAGATTGTCTTGGAGTTTGTGACGGAATTTGCAACCATGGTTCGTGCATGTGTACTGTACCTTGTTGATTTCTACTCTTATGCTCTATCTTGTGTTAACTCTGCTCTTATGTAA

mRNA sequence

ATGGAGAAAGCTCACAGTTGTATTGTTCATCTTCCTATCCCTTTCTTCTGGTATCGGATCCGATCTGATGCGGTTGGATGGTGGCAGAGACGGAAGGAAGGACTTGCTACAAGTCGAGCCCATCATTCAAGGGAAAGTGTAGTTCGGACGAAGATTGTCTTAGAGTTTGCGATGGATATTGCTCCCCTGGTCGTGGTTCTTGCATGTGTCCCGTGCCTTGTTGACTCTCACTCTTATGCTGCTCTATCTTCTCTTAACTCTGCTCTTATATATGAAGGGCTTGCTACAGGCCGAGCCCGTCGTTCAAGGGATGGTGTAGTTCAGACGAAGATTGTCTTGGAGTTTGTGACGGAATTTGCAACCATGGTTCGTGCATGTGTACTGTACCTTGTTGATTTCTACTCTTATGCTCTATCTTGTGTTAACTCTGCTCTTATGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGAAAGCTCACAGTTGTATTGTTCATCTTCCTATCCCTTTCTTCTGGTATCGGATCCGATCTGATGCGGTTGGATGGTGGCAGAGACGGAAGGAAGGACTTGCTACAAGTCGAGCCCATCATTCAAGGGAAAGTGTAGTTCGGACGAAGATTGTCTTAGAGTTTGCGATGGATATTGCTCCCCTGGTCGTGGTTCTTGCATGTGTCCCGTGCCTTGTTGACTCTCACTCTTATGCTGCTCTATCTTCTCTTAACTCTGCTCTTATATATGAAGGGCTTGCTACAGGCCGAGCCCGTCGTTCAAGGGATGGTGTAGTTCAGACGAAGATTGTCTTGGAGTTTGTGACGGAATTTGCAACCATGGTTCGTGCATGTGTACTGTACCTTGTTGATTTCTACTCTTATGCTCTATCTTGTGTTAACTCTGCTCTTATGTAA

Protein sequence

MEKAHSCIVHLPIPFFWYRIRSDAVGWWQRRKEGLATSRAHHSRESVVRTKIVLEFAMDIAPLVVVLACVPCLVDSHSYAALSSLNSALIYEGLATGRARRSRDGVVQTKIVLEFVTEFATMVRACVLYLVDFYSYALSCVNSALM
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi11G015940.1Lsi11G015940.1mRNA