Lsi09G017500 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi09G017500
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionPollen Ole e 1 allergen and extensin family protein
Locationchr09: 26161387 .. 26163332 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi09G017500
SyntenyLsi09G017500
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CGGGCACATTATATGCAAACAGTATATAGCAAACAAACGCTTGAAAATTTCAAGGCCTTACCCATTGATGCTTCTCTCACAACCTTCTCTTCTTCATTGAATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTTTTTTAACATCTTTCTTCACTAACTTCTTTGGCCTAACAGCTGAAGCCCTAGCATCGGTCACTCGGATCACGGTAGTGGGTGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTATTTCTTGCCTGGTAAGAAAATTCCATTTCATAGTTATAATGAGAGAATTTGAACTGCCTAGCATTGTGTGTTAATAGACTATGTGGTGTGTGGTGGTCAGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAGTTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATTGGAAGCTCATCTACAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGTGGGAATAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCATTGACCTCCTCAAAGTTTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCTCCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTTCCTCCACTGCCTCCATTACCCCCTATTCCATATTTTCCTCTCCCTACTTGCCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCATTATTTCCTTCACCTCCAAGTCCACCTCCGCCATCTGCACCACCTCCGCCGCCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTCCTCCATTTTCTCCTTCCCCGCCTCCACCATCGTCGCCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATCCCTCCATTTTCTCCCTCCCTACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCTGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCTCATTTCCCCCCATCCCCTCCACAGGGCCCTCAAAATCAAAAGCCCTAATATTATGCTTTGTCTTCCCTCTTCTTTACCTCTACAAACTTCCTTTCAATATCATATTGTTTGATGTGTGCTTATGTATTTTTCCGGTGCCCTGTCCATTCAGGCAAAACAACAAACACCTTGTGCGCCAAAATGTTGTTTCTAGCAAAAACCACTATAATTCATGTACAGAAAACAAAAGGGGATTTGTCTGTTTATATGATAAATCAAGAAGCTGGATATCATAAATGTATTATTTCATTAATCTTCAGATTTGTAAGAAAGTTTAGATTCTCAAGTCTTTAGTGAATGATGCGAAAAGGAAAAGAGAACAAGTAAAAGAAAGAAACCCTTAAGACTGTCCGTACCTTGCGCTTCCAGATAATACCACCGCAACGAACCAACGCCAAAGGAAAAAAAATGAGAGAAGGAATTGAATTGCCTTCTTCATTACAGAGTACCTTTTCTACCTAATTTGGACGGTGGCAATGGCGAATAATATCATTCACTTCCCGTGTTTTTTTCTTTTCCTTCTTTTTCTGATTCTGATGCTTTTTTTTATGTGATGATTATAAGAAGAATCCAACATCCCAAACTAAATTCCCTCT

mRNA sequence

CGGGCACATTATATGCAAACAGTATATAGCAAACAAACGCTTGAAAATTTCAAGGCCTTACCCATTGATGCTTCTCTCACAACCTTCTCTTCTTCATTGAATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTTTTTTAACATCTTTCTTCACTAACTTCTTTGGCCTAACAGCTGAAGCCCTAGCATCGGTCACTCGGATCACGGTAGTGGGTGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTATTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAGTTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATTGGAAGCTCATCTACAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGTGGGAATAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCATTGACCTCCTCAAAGTTTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCTCCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTTCCTCCACTGCCTCCATTACCCCCTATTCCATATTTTCCTCTCCCTACTTGCCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCATTATTTCCTTCACCTCCAAGTCCACCTCCGCCATCTGCACCACCTCCGCCGCCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTCCTCCATTTTCTCCTTCCCCGCCTCCACCATCGTCGCCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATCCCTCCATTTTCTCCCTCCCTACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCTGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCTCATTTCCCCCCATCCCCTCCACAGGGCCCTCAAAATCAAAAGCCCTAATATTATGCTTTGTCTTCCCTCTTCTTTACCTCTACAAACTTCCTTTCAATATCATATTGTTTGATGTGTGCTTATGTATTTTTCCGGTGCCCTGTCCATTCAGGCAAAACAACAAACACCTTGTGCGCCAAAATGTTGTTTCTAGCAAAAACCACTATAATTCATGTACAGAAAACAAAAGGGGATTTGTCTGTTTATATGATAAATCAAGAAGCTGGATATCATAAATGTATTATTTCATTAATCTTCAGATTTGTAAGAAAGTTTAGATTCTCAAGTCTTTAGTGAATGATGCGAAAAGGAAAAGAGAACAAGTAAAAGAAAGAAACCCTTAAGACTGTCCGTACCTTGCGCTTCCAGATAATACCACCGCAACGAACCAACGCCAAAGGAAAAAAAATGAGAGAAGGAATTGAATTGCCTTCTTCATTACAGAGTACCTTTTCTACCTAATTTGGACGGTGGCAATGGCGAATAATATCATTCACTTCCCGTGTTTTTTTCTTTTCCTTCTTTTTCTGATTCTGATGCTTTTTTTTATGTGATGATTATAAGAAGAATCCAACATCCCAAACTAAATTCCCTCT

Coding sequence (CDS)

ATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTTTTTTAACATCTTTCTTCACTAACTTCTTTGGCCTAACAGCTGAAGCCCTAGCATCGGTCACTCGGATCACGGTAGTGGGTGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTATTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAGTTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATTGGAAGCTCATCTACAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGTGGGAATAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCATTGACCTCCTCAAAGTTTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCTCCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTTCCTCCACTGCCTCCATTACCCCCTATTCCATATTTTCCTCTCCCTACTTGCCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCATTATTTCCTTCACCTCCAAGTCCACCTCCGCCATCTGCACCACCTCCGCCGCCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTCCTCCATTTTCTCCTTCCCCGCCTCCACCATCGTCGCCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATCCCTCCATTTTCTCCCTCCCTACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCTGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCTCATTTCCCCCCATCCCCTCCACAGGGCCCTCAAAATCAAAAGCCCTAA

Protein sequence

MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP
Homology
BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 1.4e-05
Identity = 94/248 (37.90%), Postives = 107/248 (43.15%), Query Frame = 0

Query: 159 LSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLP----------PFP 218
           LS  P+      CG      P  +T         PP SLP P PP P          P P
Sbjct: 376 LSRPPVNCGSFSCGRSVSPRPPVVTP-------LPPPSLPSPPPPAPIFSTPPTLTSPPP 435

Query: 219 SFPLPPL---PPLPPLPPIPYFPLPTCP--------NPPSLPFPFPPLPPLF----PSPP 278
             P PP+   PP PP PP  Y P P  P        +PP  P P PP PP++    PSPP
Sbjct: 436 PSPPPPVYSPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPPSPP 495

Query: 279 SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPP 338
            PPPP   PPPPP     P  + P  PP   SPPPP SP P  +   R   P  PP   P
Sbjct: 496 PPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPVYSSPPPPPSPAPTPVYCTR---PPPPPPHSP 555

Query: 339 PPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWI 382
           PPP F P  P  +    PP   S PP   P  P +  P I P+  PPPP   +  P    
Sbjct: 556 PPPQFSPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPPHSPPPPHSPPPPIYPYLSPPPPPTPVSSPPPTP 613

BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KAD5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G092550 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 694.5 bits (1791), Expect = 2.5e-196
Identity = 365/398 (91.71%), Postives = 374/398 (93.97%), Query Frame = 0

Query: 1   MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
           MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+ FG TAEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1   MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60

Query: 61  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
           PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINC DGMTMQSFCQA
Sbjct: 61  PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCADGMTMQSFCQA 120

Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
           SLIGSSS VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEKIPD
Sbjct: 121 SLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKIPD 180

Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---------PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPT 240
           P TSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF         PLPPLPPLPPLPP+P+FP PT
Sbjct: 181 PFTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPT 240

Query: 241 CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSS 300
           CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSP  PSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSS
Sbjct: 241 CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSS 300

Query: 301 PPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIP 360
           PPPFSLSDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAFDPRDPRTWIP
Sbjct: 301 PPPFSLSDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIP 360

Query: 361 HIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
            IPPFFPPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 RIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 398

BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DMB9 (Extensin OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold266G002120 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 7.6e-193
Identity = 361/392 (92.09%), Postives = 372/392 (94.90%), Query Frame = 0

Query: 1   MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
           MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+     AEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1   MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSL--RIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60

Query: 61  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
           PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 61  PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120

Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
           SLIGS S VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEK PD
Sbjct: 121 SLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKNPD 180

Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPS 240
           PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF   PLPPLPPLPPLPP+P+FPLPTCPNPPS
Sbjct: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPS 240

Query: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSL 300
           LPFPFPPLPPLFPSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSSPPPFSL
Sbjct: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSL 300

Query: 301 SDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF 360
           SDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAF+PRDPR+WIP IPPFF
Sbjct: 301 SDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFF 360

Query: 361 PPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
           PPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 PPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 390

BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CB81 (extensin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498870 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 7.6e-193
Identity = 361/392 (92.09%), Postives = 372/392 (94.90%), Query Frame = 0

Query: 1   MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
           MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+     AEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1   MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSL--RIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60

Query: 61  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
           PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 61  PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120

Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
           SLIGS S VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEK PD
Sbjct: 121 SLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKNPD 180

Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPS 240
           PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF   PLPPLPPLPPLPP+P+FPLPTCPNPPS
Sbjct: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPSPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPS 240

Query: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSL 300
           LPFPFPPLPPLFPSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSSPPPFSL
Sbjct: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSL 300

Query: 301 SDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF 360
           SDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAF+PRDPR+WIP IPPFF
Sbjct: 301 SDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFF 360

Query: 361 PPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
           PPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 PPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 390

BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GPH0 (formin-2-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455950 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 647.9 bits (1670), Expect = 2.7e-182
Identity = 350/418 (83.73%), Postives = 363/418 (86.84%), Query Frame = 0

Query: 1   MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
           +FLMDPTIS  LLLFL SFF N FGLTAE  ASV RI+VVGAVYCDTCLSNS+SKHSYFL
Sbjct: 56  VFLMDPTIS--LLLFLLSFFANLFGLTAETPASVARISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFL 115

Query: 61  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
           PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQM+FSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDG NCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 116 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGSNCVDGMTMQSFCQA 175

Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
           +LIG+SS VCNVPGLRT SEEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRP+KKN SLCG++KEK PD
Sbjct: 176 TLIGTSSEVCNVPGLRTASEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPVKKNASLCGDQKEKTPD 235

Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPSLPF 240
           PLTSSKFFLPFFPPYS PFPFPPLPPFPSF   PLPPLPPLPP+PYFPLP+CPNPPSLPF
Sbjct: 236 PLTSSKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPF 295

Query: 241 PFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSP---------------- 300
           PFPPLPP FPSP SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP                
Sbjct: 296 PFPPLPPFFPSPSSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLSSSSPPSPPPFS 355

Query: 301 -----------SPPP--PSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP 360
                      SPPP  PS PPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP
Sbjct: 356 LSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP 415

Query: 361 PFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
           PF+   PPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQG QNQKP
Sbjct: 416 PFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP 468

BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JLM5 (extensin-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488025 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 629.4 bits (1622), Expect = 9.9e-177
Identity = 343/416 (82.45%), Postives = 357/416 (85.82%), Query Frame = 0

Query: 1   MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
           +FLMDPTIS  LLLFL SFF N FGLTAE   SVTRI+VVGAVYCDTCLSNS+SKHSYFL
Sbjct: 9   VFLMDPTIS--LLLFLLSFFANLFGLTAETPTSVTRISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFL 68

Query: 61  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
           PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQM+FSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDG NCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 69  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGTNCVDGMTMQSFCQA 128

Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
           +LIG+S  VCNVPGLRT SEEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRP+KKN SLCG++KEK PD
Sbjct: 129 TLIGTSPEVCNVPGLRTASEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGDQKEKTPD 188

Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPSLPF 240
           PLTSSKFFLPFFPPYS PFPFPPLPPFPSF   PLPPLPPLPP+PY P P+CP PPSLPF
Sbjct: 189 PLTSSKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPVPYLPHPSCPIPPSLPF 248

Query: 241 PFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPP----PPSSPPPFS 300
           PFPPLPP FPS  SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PP     P  PPPFS
Sbjct: 249 PFPPLPPFFPSLSSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLSSSSPPPPPPFS 308

Query: 301 LSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFS----------------PSL--- 360
           LSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPF+                P +   
Sbjct: 309 LSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPF 368

Query: 361 ----PPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
               PPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQG QNQKP
Sbjct: 369 AAPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP 419

BLAST of Lsi09G017500 vs. NCBI nr
Match: XP_004140544.1 (leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus] >KGN46433.1 hypothetical protein Csa_004791 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 694.5 bits (1791), Expect = 5.2e-196
Identity = 365/398 (91.71%), Postives = 374/398 (93.97%), Query Frame = 0

Query: 1   MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
           MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+ FG TAEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1   MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60

Query: 61  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
           PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINC DGMTMQSFCQA
Sbjct: 61  PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCADGMTMQSFCQA 120

Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
           SLIGSSS VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEKIPD
Sbjct: 121 SLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKIPD 180

Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---------PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPT 240
           P TSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF         PLPPLPPLPPLPP+P+FP PT
Sbjct: 181 PFTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPT 240

Query: 241 CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSS 300
           CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSP  PSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSS
Sbjct: 241 CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSS 300

Query: 301 PPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIP 360
           PPPFSLSDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAFDPRDPRTWIP
Sbjct: 301 PPPFSLSDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIP 360

Query: 361 HIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
            IPPFFPPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 RIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 398

BLAST of Lsi09G017500 vs. NCBI nr
Match: XP_038906532.1 (leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 691.8 bits (1784), Expect = 3.4e-195
Identity = 366/388 (94.33%), Postives = 370/388 (95.36%), Query Frame = 0

Query: 5   DPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVD 64
           DPTIS LLLLFLTSFFTN FGLTA A  SVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVD
Sbjct: 4   DPTIS-LLLLFLTSFFTNLFGLTAAAPTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVD 63

Query: 65  VHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIG 124
           VHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIG
Sbjct: 64  VHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIG 123

Query: 125 SSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTS 184
           SSS VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTS
Sbjct: 124 SSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTS 183

Query: 185 SKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIP---YFPLPTCPNPPSLPFP 244
           SKFFLPFFPPYSLPFPFPP+PPFPSFPLPPLPPLPPLPP+P   YFPLPTCPNPPSLPFP
Sbjct: 184 SKFFLPFFPPYSLPFPFPPMPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLQYFPLPTCPNPPSLPFP 243

Query: 245 FPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPR 304
           FPPLPPL PSP SPPPPS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PP PSSPPPFSLSDPR
Sbjct: 244 FPPLPPLLPSPASPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLPSSPPPFSLSDPR 303

Query: 305 TWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPP 364
           TWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPS PPAFDPRDPRTWIP+IPPFFPPPP
Sbjct: 304 TWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFFPPPP 363

Query: 365 PAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
           PAFDLRDPRTWIPH PPSPPQ PQNQKP
Sbjct: 364 PAFDLRDPRTWIPHLPPSPPQVPQNQKP 390

BLAST of Lsi09G017500 vs. NCBI nr
Match: KAA0039837.1 (extensin [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24662.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 1.6e-192
Identity = 361/392 (92.09%), Postives = 372/392 (94.90%), Query Frame = 0

Query: 1   MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
           MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+     AEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1   MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSL--RIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60

Query: 61  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
           PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 61  PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120

Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
           SLIGS S VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEK PD
Sbjct: 121 SLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKNPD 180

Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPS 240
           PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF   PLPPLPPLPPLPP+P+FPLPTCPNPPS
Sbjct: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPS 240

Query: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSL 300
           LPFPFPPLPPLFPSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSSPPPFSL
Sbjct: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSL 300

Query: 301 SDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF 360
           SDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAF+PRDPR+WIP IPPFF
Sbjct: 301 SDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFF 360

Query: 361 PPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
           PPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 PPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 390

BLAST of Lsi09G017500 vs. NCBI nr
Match: XP_008459888.1 (PREDICTED: extensin [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 1.6e-192
Identity = 361/392 (92.09%), Postives = 372/392 (94.90%), Query Frame = 0

Query: 1   MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
           MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+     AEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1   MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSL--RIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60

Query: 61  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
           PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 61  PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120

Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
           SLIGS S VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEK PD
Sbjct: 121 SLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKNPD 180

Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPS 240
           PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF   PLPPLPPLPPLPP+P+FPLPTCPNPPS
Sbjct: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPSPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPS 240

Query: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSL 300
           LPFPFPPLPPLFPSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSSPPPFSL
Sbjct: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSL 300

Query: 301 SDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF 360
           SDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAF+PRDPR+WIP IPPFF
Sbjct: 301 SDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFF 360

Query: 361 PPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
           PPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 PPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 390

BLAST of Lsi09G017500 vs. NCBI nr
Match: XP_023515622.1 (formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 648.7 bits (1672), Expect = 3.3e-182
Identity = 350/418 (83.73%), Postives = 363/418 (86.84%), Query Frame = 0

Query: 1   MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
           +FLMDPTIS  LLLFL SFF N FGLTAE  ASVTRI+VVGAVYCDTCLSNS+SKHSYFL
Sbjct: 56  VFLMDPTIS--LLLFLLSFFANLFGLTAETPASVTRISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFL 115

Query: 61  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
           PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQM+FSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDG NCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 116 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGSNCVDGMTMQSFCQA 175

Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
           +LIG+SS VCNVPGLRT SEEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRP+KKN SLCG++KEK PD
Sbjct: 176 TLIGTSSEVCNVPGLRTASEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGDQKEKTPD 235

Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPSLPF 240
           PLTSSKFFLPFFPPYS PFPFPPLPPFPSF   PLPPLPPLPP+PYFPLP+CPNPPSLPF
Sbjct: 236 PLTSSKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPF 295

Query: 241 PFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSP---------------- 300
           PFPPLPP FPSP SPPPPS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP                
Sbjct: 296 PFPPLPPFFPSPSSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLSSSSPPSPPPFS 355

Query: 301 -----------SPPP--PSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP 360
                      SPPP  PS PPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP
Sbjct: 356 LSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP 415

Query: 361 PFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
           PF+   PPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQG QNQKP
Sbjct: 416 PFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP 468

BLAST of Lsi09G017500 vs. TAIR 10
Match: AT5G13140.1 (Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein )

HSP 1 Score: 189.9 bits (481), Expect = 3.9e-48
Identity = 133/299 (44.48%), Postives = 171/299 (57.19%), Query Frame = 0

Query: 8   ISLLLLLFLTSFFTNFF-------GLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 67
           + LL LLFL S  T+              +L   +RITVVG VYCDTC  N+ S+ SYFL
Sbjct: 3   LPLLYLLFLASCLTHQALGRGRGRPSPEGSLDPSSRITVVGVVYCDTCSINTFSRQSYFL 62

Query: 68  PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 127
            GV+VH+ C+F+A +PK AE++  SVNRTT++ GVY+LEIP VDGI+CVDG+ + S C A
Sbjct: 63  QGVEVHVTCRFKASSPKTAEEVNISVNRTTNRSGVYKLEIPHVDGIDCVDGIAISSQCSA 122

Query: 128 SLIGSSST---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGN---- 187
            ++ +SS     C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCGN    
Sbjct: 123 KILKTSSDDNGGCSIPVFQTATNEVSIKSKQDRVCIYSLSALSYKPPHKNTSLCGNGGKK 182

Query: 188 ---KKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLP 247
              K EK+      SKFF P+  PY  P+P+           P LPPLP LPP P FP  
Sbjct: 183 HHRKDEKVEKKFRDSKFFWPYLAPYWFPWPY-----------PDLPPLPTLPPFPSFPF- 242

Query: 248 TCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPP 290
                PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+P F P    P
Sbjct: 243 -----PSLPFGNPNL-----------------ALPAFDWKNPVTWIPYLPRFPPGDHNP 267

BLAST of Lsi09G017500 vs. TAIR 10
Match: AT5G41050.1 (Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein )

HSP 1 Score: 152.1 bits (383), Expect = 9.0e-37
Identity = 74/166 (44.58%), Postives = 108/166 (65.06%), Query Frame = 0

Query: 10  LLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQC 69
           ++LLL L     N   L   +     +ITV+G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C
Sbjct: 6   IMLLLLLQLLSLNSLSLKHSSAKPNGKITVMGLVYCDVCSNNSFSNHSYFIPGVEVRIIC 65

Query: 70  KFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGM---TMQSFCQASLIGSS 129
           +F + + +  E + FS NRTT++ G+Y+L+I S++G+ C       ++ + CQASLIG S
Sbjct: 66  RFNSASSRTREMITFSANRTTNELGLYKLDITSLEGVACAAEAKKDSLMASCQASLIGRS 125

Query: 130 STVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG 173
              CNVPG RTT+E++  KSK  NLC++   AL++RP++KN  LCG
Sbjct: 126 KDSCNVPGFRTTTEQVVFKSKISNLCVYGFTALNFRPLEKNLHLCG 171

BLAST of Lsi09G017500 vs. TAIR 10
Match: AT3G26960.1 (Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein )

HSP 1 Score: 146.7 bits (369), Expect = 3.8e-35
Identity = 67/141 (47.52%), Postives = 99/141 (70.21%), Query Frame = 0

Query: 37  ITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVY 96
           IT++G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E + FS NRTT+++G+Y
Sbjct: 37  ITIMGFVYCDVCSKNSFSKHSYFMSGVEVRIVCRFKAASSTTTETITFSANRTTNEFGLY 96

Query: 97  RLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCI 156
           ++ I S+D   C D  ++ S CQASLIG    S + CN+PG RTT++++  KS+Q N C+
Sbjct: 97  KVAISSLD---CADVDSLASSCQASLIGRKNFSDSSCNIPGYRTTTDQVLFKSQQSNSCV 156

Query: 157 FSLNALSYRPMKKNESLCGNK 175
           +  NAL++RP K++ +LCG K
Sbjct: 157 YGFNALNFRPFKRDLALCGKK 174

BLAST of Lsi09G017500 vs. TAIR 10
Match: AT4G13340.1 (Leucine-rich repeat (LRR) family protein )

HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 9.7e-07
Identity = 94/248 (37.90%), Postives = 107/248 (43.15%), Query Frame = 0

Query: 159 LSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLP----------PFP 218
           LS  P+      CG      P  +T         PP SLP P PP P          P P
Sbjct: 376 LSRPPVNCGSFSCGRSVSPRPPVVTP-------LPPPSLPSPPPPAPIFSTPPTLTSPPP 435

Query: 219 SFPLPPL---PPLPPLPPIPYFPLPTCP--------NPPSLPFPFPPLPPLF----PSPP 278
             P PP+   PP PP PP  Y P P  P        +PP  P P PP PP++    PSPP
Sbjct: 436 PSPPPPVYSPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPPSPP 495

Query: 279 SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPP 338
            PPPP   PPPPP     P  + P  PP   SPPPP SP P  +   R   P  PP   P
Sbjct: 496 PPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPVYSSPPPPPSPAPTPVYCTR---PPPPPPHSP 555

Query: 339 PPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWI 382
           PPP F P  P  +    PP   S PP   P  P +  P I P+  PPPP   +  P    
Sbjct: 556 PPPQFSPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPPHSPPPPHSPPPPIYPYLSPPPPPTPVSSPPPTP 613

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9T0K51.4e-0537.90Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KAD52.5e-19691.71Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G092550 PE=4 SV=1[more]
A0A5D3DMB97.6e-19392.09Extensin OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold266G002120 PE=4... [more]
A0A1S3CB817.6e-19392.09extensin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498870 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1GPH02.7e-18283.73formin-2-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455950 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1JLM59.9e-17782.45extensin-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488025 PE=4 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_004140544.15.2e-19691.71leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus] >KGN46433.1 hypoth... [more]
XP_038906532.13.4e-19594.33leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida][more]
KAA0039837.11.6e-19292.09extensin [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24662.1 extensin [Cucumis melo var. maku... [more]
XP_008459888.11.6e-19292.09PREDICTED: extensin [Cucumis melo][more]
XP_023515622.13.3e-18283.73formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT5G13140.13.9e-4844.48Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [more]
AT5G41050.19.0e-3744.58Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [more]
AT3G26960.13.8e-3547.52Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [more]
AT4G13340.19.7e-0737.90Leucine-rich repeat (LRR) family protein [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePRINTSPR01217PRICHEXTENSNcoord: 193..214
score: 36.36
coord: 243..260
score: 35.56
coord: 217..233
score: 38.82
coord: 261..286
score: 31.54
NoneNo IPR availablePFAMPF01190Pollen_Ole_e_1coord: 39..136
e-value: 9.3E-19
score: 67.7
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 368..389
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 306..331
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR46995OS09G0508200 PROTEINcoord: 333..383
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR46995:SF6POLLEN OLE E 1 ALLERGEN AND EXTENSIN FAMILY PROTEINcoord: 289..334
coord: 333..383
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR46995OS09G0508200 PROTEINcoord: 4..288
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NoneNo IPR availablePANTHERPTHR46995:SF6POLLEN OLE E 1 ALLERGEN AND EXTENSIN FAMILY PROTEINcoord: 4..288

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi09G017500.1Lsi09G017500.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane