Homology
BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)
HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 1.4e-05
Identity = 94/248 (37.90%), Postives = 107/248 (43.15%), Query Frame = 0
Query: 159 LSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLP----------PFP 218
LS P+ CG P +T PP SLP P PP P P P
Sbjct: 376 LSRPPVNCGSFSCGRSVSPRPPVVTP-------LPPPSLPSPPPPAPIFSTPPTLTSPPP 435
Query: 219 SFPLPPL---PPLPPLPPIPYFPLPTCP--------NPPSLPFPFPPLPPLF----PSPP 278
P PP+ PP PP PP Y P P P +PP P P PP PP++ PSPP
Sbjct: 436 PSPPPPVYSPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPPSPP 495
Query: 279 SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPP 338
PPPP PPPPP P + P PP SPPPP SP P + R P PP P
Sbjct: 496 PPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPVYSSPPPPPSPAPTPVYCTR---PPPPPPHSP 555
Query: 339 PPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWI 382
PPP F P P + PP S PP P P + P I P+ PPPP + P
Sbjct: 556 PPPQFSPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPPHSPPPPHSPPPPIYPYLSPPPPPTPVSSPPPTP 613
BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A0A0KAD5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G092550 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 694.5 bits (1791), Expect = 2.5e-196
Identity = 365/398 (91.71%), Postives = 374/398 (93.97%), Query Frame = 0
Query: 1 MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+ FG TAEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1 MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
Query: 61 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINC DGMTMQSFCQA
Sbjct: 61 PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCADGMTMQSFCQA 120
Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
SLIGSSS VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEKIPD
Sbjct: 121 SLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKIPD 180
Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---------PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPT 240
P TSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF PLPPLPPLPPLPP+P+FP PT
Sbjct: 181 PFTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPT 240
Query: 241 CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSS 300
CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSP PSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSS
Sbjct: 241 CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSS 300
Query: 301 PPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIP 360
PPPFSLSDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAFDPRDPRTWIP
Sbjct: 301 PPPFSLSDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIP 360
Query: 361 HIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
IPPFFPPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 RIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 398
BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A5D3DMB9 (Extensin OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold266G002120 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 7.6e-193
Identity = 361/392 (92.09%), Postives = 372/392 (94.90%), Query Frame = 0
Query: 1 MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+ AEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1 MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSL--RIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
Query: 61 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 61 PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
SLIGS S VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEK PD
Sbjct: 121 SLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKNPD 180
Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPS 240
PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF PLPPLPPLPPLPP+P+FPLPTCPNPPS
Sbjct: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPS 240
Query: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSL 300
LPFPFPPLPPLFPSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSSPPPFSL
Sbjct: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSL 300
Query: 301 SDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF 360
SDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAF+PRDPR+WIP IPPFF
Sbjct: 301 SDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFF 360
Query: 361 PPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
PPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 PPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 390
BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A1S3CB81 (extensin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498870 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 7.6e-193
Identity = 361/392 (92.09%), Postives = 372/392 (94.90%), Query Frame = 0
Query: 1 MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+ AEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1 MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSL--RIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
Query: 61 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 61 PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
SLIGS S VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEK PD
Sbjct: 121 SLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKNPD 180
Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPS 240
PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF PLPPLPPLPPLPP+P+FPLPTCPNPPS
Sbjct: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPSPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPS 240
Query: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSL 300
LPFPFPPLPPLFPSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSSPPPFSL
Sbjct: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSL 300
Query: 301 SDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF 360
SDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAF+PRDPR+WIP IPPFF
Sbjct: 301 SDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFF 360
Query: 361 PPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
PPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 PPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 390
BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1GPH0 (formin-2-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455950 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 647.9 bits (1670), Expect = 2.7e-182
Identity = 350/418 (83.73%), Postives = 363/418 (86.84%), Query Frame = 0
Query: 1 MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
+FLMDPTIS LLLFL SFF N FGLTAE ASV RI+VVGAVYCDTCLSNS+SKHSYFL
Sbjct: 56 VFLMDPTIS--LLLFLLSFFANLFGLTAETPASVARISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFL 115
Query: 61 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQM+FSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDG NCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 116 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGSNCVDGMTMQSFCQA 175
Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
+LIG+SS VCNVPGLRT SEEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRP+KKN SLCG++KEK PD
Sbjct: 176 TLIGTSSEVCNVPGLRTASEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPVKKNASLCGDQKEKTPD 235
Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPSLPF 240
PLTSSKFFLPFFPPYS PFPFPPLPPFPSF PLPPLPPLPP+PYFPLP+CPNPPSLPF
Sbjct: 236 PLTSSKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPF 295
Query: 241 PFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSP---------------- 300
PFPPLPP FPSP SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP
Sbjct: 296 PFPPLPPFFPSPSSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLSSSSPPSPPPFS 355
Query: 301 -----------SPPP--PSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP 360
SPPP PS PPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP
Sbjct: 356 LSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP 415
Query: 361 PFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
PF+ PPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQG QNQKP
Sbjct: 416 PFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP 468
BLAST of Lsi09G017500 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1JLM5 (extensin-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488025 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 629.4 bits (1622), Expect = 9.9e-177
Identity = 343/416 (82.45%), Postives = 357/416 (85.82%), Query Frame = 0
Query: 1 MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
+FLMDPTIS LLLFL SFF N FGLTAE SVTRI+VVGAVYCDTCLSNS+SKHSYFL
Sbjct: 9 VFLMDPTIS--LLLFLLSFFANLFGLTAETPTSVTRISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFL 68
Query: 61 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQM+FSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDG NCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 69 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGTNCVDGMTMQSFCQA 128
Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
+LIG+S VCNVPGLRT SEEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRP+KKN SLCG++KEK PD
Sbjct: 129 TLIGTSPEVCNVPGLRTASEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGDQKEKTPD 188
Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPSLPF 240
PLTSSKFFLPFFPPYS PFPFPPLPPFPSF PLPPLPPLPP+PY P P+CP PPSLPF
Sbjct: 189 PLTSSKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPVPYLPHPSCPIPPSLPF 248
Query: 241 PFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPP----PPSSPPPFS 300
PFPPLPP FPS SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PP P PPPFS
Sbjct: 249 PFPPLPPFFPSLSSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLSSSSPPPPPPFS 308
Query: 301 LSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFS----------------PSL--- 360
LSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPF+ P +
Sbjct: 309 LSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPF 368
Query: 361 ----PPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
PPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQG QNQKP
Sbjct: 369 AAPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP 419
BLAST of Lsi09G017500 vs. NCBI nr
Match:
XP_004140544.1 (leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus] >KGN46433.1 hypothetical protein Csa_004791 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 694.5 bits (1791), Expect = 5.2e-196
Identity = 365/398 (91.71%), Postives = 374/398 (93.97%), Query Frame = 0
Query: 1 MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+ FG TAEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1 MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
Query: 61 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINC DGMTMQSFCQA
Sbjct: 61 PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCADGMTMQSFCQA 120
Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
SLIGSSS VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEKIPD
Sbjct: 121 SLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKIPD 180
Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---------PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPT 240
P TSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF PLPPLPPLPPLPP+P+FP PT
Sbjct: 181 PFTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPT 240
Query: 241 CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSS 300
CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSP PSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSS
Sbjct: 241 CPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSS 300
Query: 301 PPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIP 360
PPPFSLSDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAFDPRDPRTWIP
Sbjct: 301 PPPFSLSDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIP 360
Query: 361 HIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
IPPFFPPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 RIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 398
BLAST of Lsi09G017500 vs. NCBI nr
Match:
XP_038906532.1 (leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida])
HSP 1 Score: 691.8 bits (1784), Expect = 3.4e-195
Identity = 366/388 (94.33%), Postives = 370/388 (95.36%), Query Frame = 0
Query: 5 DPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVD 64
DPTIS LLLLFLTSFFTN FGLTA A SVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVD
Sbjct: 4 DPTIS-LLLLFLTSFFTNLFGLTAAAPTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVD 63
Query: 65 VHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIG 124
VHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIG
Sbjct: 64 VHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIG 123
Query: 125 SSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTS 184
SSS VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTS
Sbjct: 124 SSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTS 183
Query: 185 SKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIP---YFPLPTCPNPPSLPFP 244
SKFFLPFFPPYSLPFPFPP+PPFPSFPLPPLPPLPPLPP+P YFPLPTCPNPPSLPFP
Sbjct: 184 SKFFLPFFPPYSLPFPFPPMPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLQYFPLPTCPNPPSLPFP 243
Query: 245 FPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPR 304
FPPLPPL PSP SPPPPS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PP PSSPPPFSLSDPR
Sbjct: 244 FPPLPPLLPSPASPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLPSSPPPFSLSDPR 303
Query: 305 TWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPP 364
TWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPS PPAFDPRDPRTWIP+IPPFFPPPP
Sbjct: 304 TWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFFPPPP 363
Query: 365 PAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
PAFDLRDPRTWIPH PPSPPQ PQNQKP
Sbjct: 364 PAFDLRDPRTWIPHLPPSPPQVPQNQKP 390
BLAST of Lsi09G017500 vs. NCBI nr
Match:
KAA0039837.1 (extensin [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24662.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa])
HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 1.6e-192
Identity = 361/392 (92.09%), Postives = 372/392 (94.90%), Query Frame = 0
Query: 1 MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+ AEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1 MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSL--RIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
Query: 61 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 61 PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
SLIGS S VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEK PD
Sbjct: 121 SLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKNPD 180
Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPS 240
PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF PLPPLPPLPPLPP+P+FPLPTCPNPPS
Sbjct: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPS 240
Query: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSL 300
LPFPFPPLPPLFPSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSSPPPFSL
Sbjct: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSL 300
Query: 301 SDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF 360
SDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAF+PRDPR+WIP IPPFF
Sbjct: 301 SDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFF 360
Query: 361 PPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
PPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 PPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 390
BLAST of Lsi09G017500 vs. NCBI nr
Match:
XP_008459888.1 (PREDICTED: extensin [Cucumis melo])
HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 1.6e-192
Identity = 361/392 (92.09%), Postives = 372/392 (94.90%), Query Frame = 0
Query: 1 MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
MFLMDPTISLLLLL LTSFFT+ AEAL SVTRIT+VGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL
Sbjct: 1 MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSL--RIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
Query: 61 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
PGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 61 PGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
SLIGS S VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG+KKEK PD
Sbjct: 121 SLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKNPD 180
Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPS 240
PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSF PLPPLPPLPPLPP+P+FPLPTCPNPPS
Sbjct: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPSPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPS 240
Query: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSL 300
LPFPFPPLPPLFPSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSSPPPFSL
Sbjct: 241 LPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSL 300
Query: 301 SDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF 360
SDPRTWIPH+PPFSPPPPPAFDPRDPRTWIP+IPPFSPS PPAF+PRDPR+WIP IPPFF
Sbjct: 301 SDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFF 360
Query: 361 PPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
PPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQGPQNQKP
Sbjct: 361 PPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP 390
BLAST of Lsi09G017500 vs. NCBI nr
Match:
XP_023515622.1 (formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])
HSP 1 Score: 648.7 bits (1672), Expect = 3.3e-182
Identity = 350/418 (83.73%), Postives = 363/418 (86.84%), Query Frame = 0
Query: 1 MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 60
+FLMDPTIS LLLFL SFF N FGLTAE ASVTRI+VVGAVYCDTCLSNS+SKHSYFL
Sbjct: 56 VFLMDPTIS--LLLFLLSFFANLFGLTAETPASVTRISVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFL 115
Query: 61 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 120
PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQM+FSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDG NCVDGMTMQSFCQA
Sbjct: 116 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGSNCVDGMTMQSFCQA 175
Query: 121 SLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPD 180
+LIG+SS VCNVPGLRT SEEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRP+KKN SLCG++KEK PD
Sbjct: 176 TLIGTSSEVCNVPGLRTASEEISIKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGDQKEKTPD 235
Query: 181 PLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPSLPF 240
PLTSSKFFLPFFPPYS PFPFPPLPPFPSF PLPPLPPLPP+PYFPLP+CPNPPSLPF
Sbjct: 236 PLTSSKFFLPFFPPYSFPFPFPPLPPFPSF---PLPPLPPLPPVPYFPLPSCPNPPSLPF 295
Query: 241 PFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSP---------------- 300
PFPPLPP FPSP SPPPPS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP
Sbjct: 296 PFPPLPPFFPSPSSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPLSSSSPPSPPPFS 355
Query: 301 -----------SPPP--PSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP 360
SPPP PS PPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP
Sbjct: 356 LSDPRTWIPYVSPPPPLPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP 415
Query: 361 PFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP 390
PF+ PPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQG QNQKP
Sbjct: 416 PFATPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFSPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGLQNQKP 468
BLAST of Lsi09G017500 vs. TAIR 10
Match:
AT5G13140.1 (Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein )
HSP 1 Score: 189.9 bits (481), Expect = 3.9e-48
Identity = 133/299 (44.48%), Postives = 171/299 (57.19%), Query Frame = 0
Query: 8 ISLLLLLFLTSFFTNFF-------GLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFL 67
+ LL LLFL S T+ +L +RITVVG VYCDTC N+ S+ SYFL
Sbjct: 3 LPLLYLLFLASCLTHQALGRGRGRPSPEGSLDPSSRITVVGVVYCDTCSINTFSRQSYFL 62
Query: 68 PGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQA 127
GV+VH+ C+F+A +PK AE++ SVNRTT++ GVY+LEIP VDGI+CVDG+ + S C A
Sbjct: 63 QGVEVHVTCRFKASSPKTAEEVNISVNRTTNRSGVYKLEIPHVDGIDCVDGIAISSQCSA 122
Query: 128 SLIGSSST---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGN---- 187
++ +SS C++P +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P KN SLCGN
Sbjct: 123 KILKTSSDDNGGCSIPVFQTATNEVSIKSKQDRVCIYSLSALSYKPPHKNTSLCGNGGKK 182
Query: 188 ---KKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLP 247
K EK+ SKFF P+ PY P+P+ P LPPLP LPP P FP
Sbjct: 183 HHRKDEKVEKKFRDSKFFWPYLAPYWFPWPY-----------PDLPPLPTLPPFPSFPF- 242
Query: 248 TCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPP 290
PSLPF P L P F +P TWIPY+P F P P
Sbjct: 243 -----PSLPFGNPNL-----------------ALPAFDWKNPVTWIPYLPRFPPGDHNP 267
BLAST of Lsi09G017500 vs. TAIR 10
Match:
AT5G41050.1 (Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein )
HSP 1 Score: 152.1 bits (383), Expect = 9.0e-37
Identity = 74/166 (44.58%), Postives = 108/166 (65.06%), Query Frame = 0
Query: 10 LLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQC 69
++LLL L N L + +ITV+G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C
Sbjct: 6 IMLLLLLQLLSLNSLSLKHSSAKPNGKITVMGLVYCDVCSNNSFSNHSYFIPGVEVRIIC 65
Query: 70 KFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGM---TMQSFCQASLIGSS 129
+F + + + E + FS NRTT++ G+Y+L+I S++G+ C ++ + CQASLIG S
Sbjct: 66 RFNSASSRTREMITFSANRTTNELGLYKLDITSLEGVACAAEAKKDSLMASCQASLIGRS 125
Query: 130 STVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG 173
CNVPG RTT+E++ KSK NLC++ AL++RP++KN LCG
Sbjct: 126 KDSCNVPGFRTTTEQVVFKSKISNLCVYGFTALNFRPLEKNLHLCG 171
BLAST of Lsi09G017500 vs. TAIR 10
Match:
AT3G26960.1 (Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein )
HSP 1 Score: 146.7 bits (369), Expect = 3.8e-35
Identity = 67/141 (47.52%), Postives = 99/141 (70.21%), Query Frame = 0
Query: 37 ITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVY 96
IT++G VYCD C NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A + E + FS NRTT+++G+Y
Sbjct: 37 ITIMGFVYCDVCSKNSFSKHSYFMSGVEVRIVCRFKAASSTTTETITFSANRTTNEFGLY 96
Query: 97 RLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCI 156
++ I S+D C D ++ S CQASLIG S + CN+PG RTT++++ KS+Q N C+
Sbjct: 97 KVAISSLD---CADVDSLASSCQASLIGRKNFSDSSCNIPGYRTTTDQVLFKSQQSNSCV 156
Query: 157 FSLNALSYRPMKKNESLCGNK 175
+ NAL++RP K++ +LCG K
Sbjct: 157 YGFNALNFRPFKRDLALCGKK 174
BLAST of Lsi09G017500 vs. TAIR 10
Match:
AT4G13340.1 (Leucine-rich repeat (LRR) family protein )
HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 9.7e-07
Identity = 94/248 (37.90%), Postives = 107/248 (43.15%), Query Frame = 0
Query: 159 LSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLP----------PFP 218
LS P+ CG P +T PP SLP P PP P P P
Sbjct: 376 LSRPPVNCGSFSCGRSVSPRPPVVTP-------LPPPSLPSPPPPAPIFSTPPTLTSPPP 435
Query: 219 SFPLPPL---PPLPPLPPIPYFPLPTCP--------NPPSLPFPFPPLPPLF----PSPP 278
P PP+ PP PP PP Y P P P +PP P P PP PP++ PSPP
Sbjct: 436 PSPPPPVYSPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPPSPP 495
Query: 279 SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPP 338
PPPP PPPPP P + P PP SPPPP SP P + R P PP P
Sbjct: 496 PPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPVYSSPPPPPSPAPTPVYCTR---PPPPPPHSP 555
Query: 339 PPPAFDPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWI 382
PPP F P P + PP S PP P P + P I P+ PPPP + P
Sbjct: 556 PPPQFSPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPPHSPPPPHSPPPPIYPYLSPPPPPTPVSSPPPTP 613
The following BLAST results are available for this feature:
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Q9T0K5 | 1.4e-05 | 37.90 | Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
A0A0A0KAD5 | 2.5e-196 | 91.71 | Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G092550 PE=4 SV=1 | [more] |
A0A5D3DMB9 | 7.6e-193 | 92.09 | Extensin OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold266G002120 PE=4... | [more] |
A0A1S3CB81 | 7.6e-193 | 92.09 | extensin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498870 PE=4 SV=1 | [more] |
A0A6J1GPH0 | 2.7e-182 | 83.73 | formin-2-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455950 PE=4 SV=1 | [more] |
A0A6J1JLM5 | 9.9e-177 | 82.45 | extensin-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488025 PE=4 SV=1 | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
XP_004140544.1 | 5.2e-196 | 91.71 | leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus] >KGN46433.1 hypoth... | [more] |
XP_038906532.1 | 3.4e-195 | 94.33 | leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida] | [more] |
KAA0039837.1 | 1.6e-192 | 92.09 | extensin [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24662.1 extensin [Cucumis melo var. maku... | [more] |
XP_008459888.1 | 1.6e-192 | 92.09 | PREDICTED: extensin [Cucumis melo] | [more] |
XP_023515622.1 | 3.3e-182 | 83.73 | formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
AT5G13140.1 | 3.9e-48 | 44.48 | Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein | [more] |
AT5G41050.1 | 9.0e-37 | 44.58 | Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein | [more] |
AT3G26960.1 | 3.8e-35 | 47.52 | Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein | [more] |
AT4G13340.1 | 9.7e-07 | 37.90 | Leucine-rich repeat (LRR) family protein | [more] |