Lsi09G016390 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi09G016390
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionnuclear pore complex protein NUP62
Locationchr09: 24692733 .. 24718313 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi09G016390
SyntenyLsi09G016390
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
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CTATGTAAGGGTGGTCATATATTCCTGGTAATTGTACCTCTCTGAATAGTCTTAATAGCATAGCCTACCATGGAAAAATGCCTTTAAATCCATTAGGATCATAGTTTTATTTTAGTTTTCATTACTGCATTGAGTTCTAACATTAAGCTTTGTCAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCTGCTGCAGATCGTGAATTGTTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTGAATTGTAAGGTTTTATTTGTTGTGAAGCTGCTATTGGAATTAGTGTATACAGGCCTTAACGCATTCACATTTGTGGTTTATTTTTATTCTATTTTGTTCTTTTGGGGGTGTCTTGGCTGAACTGGAAATCGTTTGATTCCCAATTCTAGCCGACATTTGTGATTTTTTGTCCAAAAGGATGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAAGAAAAACATTATACAGGGCCGGCAATCGAATTTTCGACCTTTTAGATGAGATAGAGATACTTTAATTGATAAACTAGGCACAAGTTGTGCATAAACTTTTAGTTCTCCATTTATGGATCTTTTAC

mRNA sequence

ATGAATCTCTTCCGCCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGCCTTCGGATCGTCCTCCTCCCAATCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCAGCCACTGGTTTCTCATTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTTCGGATCATCATCAGCATCATCATCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCTTCCTCCTTAAACCCTACCTCCTCTTCCTCTCCATTTTCCAATCAAACCTCCAATCCCGCTTCTTCCTCTTCTTTCGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCCTTCCCTTTCTCCCTCCCCGCCGCTTCCACTGGGGCTTCTTCCTCTTCAGCAACTTCAGCTTCTTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAGGTGGATTGACTTCTTTCGGATTTGGGGCTTCATCTTCATCAGGGAACTCGTCTGCGTCCTTGTTTGGGGCTGCTCTATCCTCTGGGAGCTCGTCTGCGCCCGTGTTTGGGGCGGCTTCGTCCTCTGGGAGCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGAGCGGCTTCGTCCTCTGGGAGCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTACTCCCTCTTCTGGGACCTCACTTGTGCCCTCGTTTGGGGCTCTTCCGTCCTCTGGGAGCTCATCTACGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCCGGGGCCTCGGCTCCGTCCTTGTTTGGTGGGGTATCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCACTACAAGTCCGGGATCAGCGTTGTTTGGCGCTTCTGCTGCCGCGGCTTCTGCTTCTAGCTCCCCCCTGTTTGGGACATCTACATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAACTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTCGGTGCATCTTCTTCGGTTTCCGCTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTCATCATCTACATCGACTTCTCCATTCCAGAACTCTCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAGAATTTGAGTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTTCATTTTCGACCACATCTTTGTCCAAAACTACTAATGTTACCACTGCATCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGCACACCTGCTTCGTCGGCATCTCAATCTTCTTTTGGGTTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTTCTGCTCCGAGCAGTACAGCTACGAAGCCTACTTCTCTATCGTTTTCAACTACTGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCAAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCACCCTCCGCTCCCTCGGCTTCTTCTTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTCGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCCCAAGCACCAGGCTCTTTCGGTTTCCCTTCTCTGGCTTCCTCTTCCACTGCTGCTACCACTACGTCTGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAAACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGCTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTGTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCGGAGCTTCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGGAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATCCTCCTTAGACTTGAGATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGCTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCAAAGTGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAAGCTGCATCTACGAGGGATGGAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAACTAGAGCAGATGACGGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAACCAGGGAGGAGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGTTAGATGCAGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCTGCTGCAGATCGTGAATTGTTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTGAATTGTAAGGTTTTATTTGTTGTGAAGCTGCTATTGGAATTAGTGTATACAGGCCTTAACGCATTCACATTTGTGGTTTATTTTTATTCTATTTTGTTCTTTTGGGGGTGTCTTGGCTGAACTGGAAATCGTTTGATTCCCAATTCTAGCCGACATTTGTGATTTTTTGTCCAAAAGGATGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAAGAAAAACATTATACAGGGCCGGCAATCGAATTTTCGACCTTTTAGATGAGATAGAGATACTTTAATTGATAAACTAGGCACAAGTTGTGCATAAACTTTTAGTTCTCCATTTATGGATCTTTTAC

Coding sequence (CDS)

ATGAATCTCTTCCGCCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGCCTTCGGATCGTCCTCCTCCCAATCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCAGCCACTGGTTTCTCATTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTTCGGATCATCATCAGCATCATCATCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCTTCCTCCTTAAACCCTACCTCCTCTTCCTCTCCATTTTCCAATCAAACCTCCAATCCCGCTTCTTCCTCTTCTTTCGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCCTTCCCTTTCTCCCTCCCCGCCGCTTCCACTGGGGCTTCTTCCTCTTCAGCAACTTCAGCTTCTTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAGGTGGATTGACTTCTTTCGGATTTGGGGCTTCATCTTCATCAGGGAACTCGTCTGCGTCCTTGTTTGGGGCTGCTCTATCCTCTGGGAGCTCGTCTGCGCCCGTGTTTGGGGCGGCTTCGTCCTCTGGGAGCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGAGCGGCTTCGTCCTCTGGGAGCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTACTCCCTCTTCTGGGACCTCACTTGTGCCCTCGTTTGGGGCTCTTCCGTCCTCTGGGAGCTCATCTACGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCCGGGGCCTCGGCTCCGTCCTTGTTTGGTGGGGTATCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCACTACAAGTCCGGGATCAGCGTTGTTTGGCGCTTCTGCTGCCGCGGCTTCTGCTTCTAGCTCCCCCCTGTTTGGGACATCTACATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAACTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTCGGTGCATCTTCTTCGGTTTCCGCTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTCATCATCTACATCGACTTCTCCATTCCAGAACTCTCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAGAATTTGAGTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTTCATTTTCGACCACATCTTTGTCCAAAACTACTAATGTTACCACTGCATCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGCACACCTGCTTCGTCGGCATCTCAATCTTCTTTTGGGTTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTTCTGCTCCGAGCAGTACAGCTACGAAGCCTACTTCTCTATCGTTTTCAACTACTGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCAAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCACCCTCCGCTCCCTCGGCTTCTTCTTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTCGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCCCAAGCACCAGGCTCTTTCGGTTTCCCTTCTCTGGCTTCCTCTTCCACTGCTGCTACCACTACGTCTGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAAACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGCTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTGTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCGGAGCTTCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGGAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATCCTCCTTAGACTTGAGATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGCTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCAAAGTGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAAGCTGCATCTACGAGGGATGGAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAACTAGAGCAGATGACGGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAACCAGGGAGGAGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGTTAGATGCAGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCTGCTGCAGATCGTGAATTGTTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTGA

Protein sequence

MNLFRRRSIEMSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSSPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGASSSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSSAPLFGATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFGSSPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
Homology
BLAST of Lsi09G016390 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L7F7 (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 418.3 bits (1074), Expect = 1.9e-115
Identity = 413/798 (51.75%), Postives = 532/798 (66.67%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSS 70
           MSGF FG S          +S  GFSFGS+SA +  S+S+++SPLS S + S NP+S+  
Sbjct: 1   MSGFPFGQS----------NSVGGFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTGF 60

Query: 71  PF-SNQTSNPASSS--SFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGASSSSATSASSLFGVSS 130
            F S+ +S PASS+  SFGFG+SS PS     F F   A+S+  S    +SAS      +
Sbjct: 61  GFGSSVSSTPASSTTPSFGFGASSTPS-----FGFGSSASSSTPSFGFGSSAS-----VT 120

Query: 131 SSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAP-------VFGAASSSGSSSAPLFG 190
            +    SFGFG ++SS   + SLFG++ ++ SS+AP       V  +ASS+ + S+ LFG
Sbjct: 121 PASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFG 180

Query: 191 A-ASSSGSSSAPLFGATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVS 250
           A ASS+ + S+  FGA P+SG++  P FG+ PS       LF A  SA AS  SLFG  S
Sbjct: 181 APASSAATPSSSPFGAAPASGST--PLFGSSPS-------LFSAPSSASASNSSLFGASS 240

Query: 251 SATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASAS-------SSPLFGTSTSSGSAGSTLF 310
           SA TS++PLFG  +S T    +   AS+A  S+S       SSP F  ++S+  +  ++F
Sbjct: 241 SAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSSPSIF 300

Query: 311 ---GSSPFGASSSVSAS--NLFASSSSSTST---SPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASS 370
              GSSPF  SSS + S  +LFASSSS  +T   SPF  ++ +SSS+ N S++S    S+
Sbjct: 301 GATGSSPFFGSSSSAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSA 360

Query: 371 SSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTG 430
           S+GFSF  ++ S TT+ TT S+   T  ++SSSSFSFGT A+S      GF++    STG
Sbjct: 361 STGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQT--ASSSSSFSFGTSANS------GFNL----STG 420

Query: 431 GSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATT 490
            S+AP+S +T     S +TT        TTTS+STPAA  T+ P+ S PA + +  +   
Sbjct: 421 SSAAPAS-STSGAVFSIATT--------TTTSSSTPAA--TSAPASSAPASTMAFPSFGV 480

Query: 491 LSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPGSFG 550
            S A  + P  +SS A  S TGFG+ S+  ++ +  S +     KTST ASSSQ   +  
Sbjct: 481 TSSATNTTP--ASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTPASSSQPQTT-- 540

Query: 551 FPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKT 610
            P+ + S  ++T+T+  + SS + T +TLVV SSS   TST  A V+ +PKLPSEITGKT
Sbjct: 541 SPAFSFSLPSSTSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGSPKLPSEITGKT 600

Query: 611 VEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKK 670
           VEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++
Sbjct: 601 VEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQSSLERQ 660

Query: 671 LELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMT 730
           LELIETHQQEVDKALQS+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRD MYEQ+E +ERELE MT
Sbjct: 661 LELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQSELVERELEHMT 720

Query: 731 EQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAA 780
           EQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A
Sbjct: 721 EQIRSIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI-A 739

BLAST of Lsi09G016390 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: G0SBQ3 (Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719) OX=759272 GN=NSP1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 2.3e-12
Identity = 211/681 (30.98%), Postives = 339/681 (49.78%), Query Frame = 0

Query: 134 SFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSSAPLF 193
           SF FG  S+SG S  S    A +SG       G   S+  SS P F   ++SG+ S  LF
Sbjct: 2   SFTFGQPSTSGASGQSNTSTAPASG-------GLFGSTTGSSTPAFSFGNTSGTQSGSLF 61

Query: 194 -GATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVS------------S 253
            GAT    TSL  +  +   +G+ +T LFG + S+ +S PSLFG  S            S
Sbjct: 62  GGATTGQKTSLFGNTSSTTPAGTPATSLFGQSTSS-SSGPSLFGNASKPSGNLFGNTSTS 121

Query: 254 ATTSSAP-----LFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFGSS 313
           A  SS P     LFG+  +TTS G++   ++  AA+A S  LFG++T++    ST   + 
Sbjct: 122 AAGSSTPAGTPSLFGSKTATTSAGAS---STTPAATAGSGSLFGSTTATTQGSSTPTSTG 181

Query: 314 PFGASSSVSASNLF------ASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSF 373
            FG SS+ S S LF      A+ +S + T+P +    S  S   + + P  A+ ++G  F
Sbjct: 182 LFGGSSTASKS-LFGSTTTPATGTSGSQTTPAKPLFGSFGSTTPAGAPPTDATKTAGL-F 241

Query: 374 STTSLSKTTNVTTASSSSLTSAST--SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSA 433
              S   TT  +T +    TSA+T   SS+  FG   +  S ++      + A+T  +SA
Sbjct: 242 GNLSKPATTGTSTPTLFGSTSATTQGQSSTPLFGAKPAETSTTTAA----SGAATPATSA 301

Query: 434 PSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTT-SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATT--- 493
           P+ST       +  T+ AP  ST T+T +ASTPAA   T+P F   A +S+  ++TT   
Sbjct: 302 PASTTPTLFGGATLTSSAPAASTSTSTATASTPAA---TKPLFGATATTSAPGSSTTTAT 361

Query: 494 ---LSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGF--GVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPG 553
               S    +  +A SS A S+  G     T+ A++SS   + S P+   +  +S+ AP 
Sbjct: 362 PGLFSTTPATTAAAGSSTATSTLFGTKPATTTAAAASSTPAATSTPSLFGSKPASTTAPA 421

Query: 554 SFGFPSLA---SSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSA-TVSSTPKLP 613
           S G P+     +S++A  TT+    S  S T+ST      +  TT+ + A TV    +LP
Sbjct: 422 S-GTPTTTTAPASTSAPATTTAAPTSGASATASTTTAGQDAKTTTAGLGASTVGPQSQLP 481

Query: 614 SEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVET 673
             +  KT++EII  W  +L +   +F++QA  + EWDR +++N + + +L     +    
Sbjct: 482 -RLKNKTMDEIITRWATDLAKYQKEFKEQAAKVMEWDRLLVENGEKIQKLYTSTYEAERA 541

Query: 674 QAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRDGMYEQAE 733
             E+E++L  +E+ Q+E+   L   E + + +Y  + G    ++AA     R+  Y+ AE
Sbjct: 542 SNEIERQLSNVESQQEELTAWLDRYERELDELYAKQMGSAAGEQAAGPDQERERTYKLAE 601

Query: 734 YIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID 765
            +  +L++M + +  +I+ +N      ++G + D      PL  +VR+LN  L+ L WID
Sbjct: 602 KLTDQLDEMGKDLAKMIKEINDMSNTLSKGSKPD-----DPLTQIVRVLNGHLAQLQWID 655

BLAST of Lsi09G016390 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H5C8 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 950.3 bits (2455), Expect = 5.1e-273
Identity = 653/786 (83.08%), Postives = 689/786 (87.66%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQ-SSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSS 70
           MSGF+FGSSSSQ SSSSSPFSS TGFSFGSTSAFSFG     SSPLSLSSSSS NP+SSS
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFG-----SSPLSLSSSSSSNPSSSS 60

Query: 71  SPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGASSSSATSASSLFGVSSSS 130
           S FSNQTSNP SS+ FGF SSSFPSS SSPF FSLPAASTGASS S  S SSLF  SSSS
Sbjct: 61  SAFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS--SGSSLFAASSSS 120

Query: 131 GGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSS 190
           GGL+SFGFG SSSSG SSA  FGAA +SGSS  P FGAAS+SG+S APLFG+A SSGSS 
Sbjct: 121 GGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSP 180

Query: 191 --------------APLFGATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLF 250
                         APLFG+ PSSG+S +PSFGA PS+GSSS+P FGAAPSAG SAPSLF
Sbjct: 181 VPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLF 240

Query: 251 GGVSS-ATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFGS 310
           GGVSS ATTSSAPLFGTSA T SPGS++FGAS AA+ +SSS               LFGS
Sbjct: 241 GGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSS---------------LFGS 300

Query: 311 SPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSL 370
           +PF +SSSVS SNLF SSSSS ST+PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGFSFSTTSL
Sbjct: 301 NPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSL 360

Query: 371 SKTTNVTTA-SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTAT 430
           SKTT++T A SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSI+NAASTGGSSAP +TA 
Sbjct: 361 SKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAA 420

Query: 431 KPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPS 490
           KPTSLSFST+VAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAA S PS
Sbjct: 421 KPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPS 480

Query: 491 ASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAAT 550
            +SSGA SSFTGFGVTSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAP SFGF SLA +STAAT
Sbjct: 481 TTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAAT 540

Query: 551 TTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAEL 610
           TTSG +ASSQSQTSSTLV+ASSSS TTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAEL
Sbjct: 541 TTSGSNASSQSQTSSTLVIASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAEL 600

Query: 611 QERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVD 670
           QERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVD
Sbjct: 601 QERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVD 660

Query: 671 KALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA 730
           KALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA
Sbjct: 661 KALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA 720

Query: 731 NQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLG 780
           +QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLG
Sbjct: 721 SQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLG 763

BLAST of Lsi09G016390 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAD4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 943.7 bits (2438), Expect = 4.8e-271
Identity = 669/788 (84.90%), Postives = 697/788 (88.45%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSL-SSSSSLNPTSSS 70
           MSGF FGSS+SQSSSSSPFSS TGFSFGST+ FSFGS   S+SPLSL SSSSS NPTSSS
Sbjct: 1   MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGS---SASPLSLSSSSSSSNPTSSS 60

Query: 71  SPFSNQTSN-PASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGAS-----SSSATSASSLF 130
           SPF N TSN P+SSSSFGFGSSSF SSTSSPF FSL +ASTGAS     SSSA SASSLF
Sbjct: 61  SPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLF 120

Query: 131 GVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAAS 190
           GVSSSS G  SFGFGASSSS N              SSAP+FGAASSSG+SSA LFGA  
Sbjct: 121 GVSSSSTGFNSFGFGASSSSAN--------------SSAPLFGAASSSGTSSASLFGA-- 180

Query: 191 SSGSSSAPLFGATPSSGTSLVPSFGALPSS-GSSSTPLFGAAPSAGA-SAPSLFGGVSSA 250
             GSS AP FGA PSSG+S+ PSFGAL SS G+SS PLFGAAPSAGA SAPSLFGG SSA
Sbjct: 181 --GSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSA 240

Query: 251 TTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTST-SSGSAGSTLFGSSPFGA- 310
           TTSSAPLFGT+AS  S GSALFGAS A AS S + LFGTS  SSGS GS LFGSSPFGA 
Sbjct: 241 TTSSAPLFGTAASAASSGSALFGAS-APASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGAS 300

Query: 311 ----SSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLS 370
               SSSVS SNLFASS SS   SPFQ+SLSSSSSQNL+SSSPFAA S SGFSF T++LS
Sbjct: 301 SSGTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAA-SPSGFSFPTSTLS 360

Query: 371 KTTNVT----TASSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSST 430
           KTT++T    ++SSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSINNAASTGGSSAPS+T
Sbjct: 361 KTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTT 420

Query: 431 ATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSA 490
           ATKPTSLS S +VAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAA SA
Sbjct: 421 ATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSA 480

Query: 491 PSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTA 550
           PSA+SSG VSSFTGFGVTS+ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP SFGFPSLAS+STA
Sbjct: 481 PSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTA 540

Query: 551 ATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA 610
           ATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSS TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA
Sbjct: 541 ATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA 600

Query: 611 ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQE 670
           ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQE
Sbjct: 601 ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQE 660

Query: 671 VDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTL 730
           VDKAL SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTL
Sbjct: 661 VDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTL 720

Query: 731 NANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL 780
           NANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL
Sbjct: 721 NANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL 761

BLAST of Lsi09G016390 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L2D4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 932.2 bits (2408), Expect = 1.4e-267
Identity = 653/800 (81.62%), Postives = 689/800 (86.12%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQ-SSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSS 70
           MSGF+FGSSSSQ SSSSSPFSS TGFSFGSTSAFSFG     SSPLSLSSSSS NP+SSS
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFG-----SSPLSLSSSSSSNPSSSS 60

Query: 71  SPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGASSSSATSASSLFGVSSSS 130
           S FSNQTSNP SS+ FGF SSSFPSS SSPF FSLPAASTGA  SS  S S+LF  SSSS
Sbjct: 61  SAFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGA--SSGISGSALFAASSSS 120

Query: 131 GGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSS 190
           GGL+SFGFG SSSSG SSA  FGAA +SGSS  P FGAAS+SG+S APLFG+A SSGSS 
Sbjct: 121 GGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSP 180

Query: 191 --------------APLFGATPSSGTSLVPSFGALP--------------SSGSSSTPLF 250
                         APLFG+ PSSG+S +PSFGA P              SSGSSS+P F
Sbjct: 181 VPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFF 240

Query: 251 GAAPSAGASAPSLFGGVSS-ATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGT 310
           GAAPS G SAPSLFGGVSS ATTSSAPLFGTSA T SPGS++FGAS AAAS SSS LFG+
Sbjct: 241 GAAPSVGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGAS-AAASGSSSSLFGS 300

Query: 311 STSSGSAGSTLFGSSPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFA 370
           ++         F SS  G  SSVS SNLF SSSSS ST+PFQNS SSSSSQNLSSSSPFA
Sbjct: 301 NS---------FASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFA 360

Query: 371 ASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTA-SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNA 430
           A SSSGFSFSTTSLSKTT++T A SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGF+I+NA
Sbjct: 361 A-SSSGFSFSTTSLSKTTSITVASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFNISNA 420

Query: 431 ASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSS 490
           AS  GSSAP +TA KPTSLSFST+VAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSS
Sbjct: 421 ASLEGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSS 480

Query: 491 AATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGS 550
           AATTLSIAA SAPSA+SSGA SSFTGFG+TSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAP S
Sbjct: 481 AATTLSIAASSAPSATSSGAASSFTGFGITSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPAS 540

Query: 551 FGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITG 610
           FGF SLAS+S AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSS TTSTVSATVS+TPKLPSEITG
Sbjct: 541 FGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSATPKLPSEITG 600

Query: 611 KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE 670
           KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE
Sbjct: 601 KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELE 660

Query: 671 KKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQ 730
           KKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQ
Sbjct: 661 KKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQ 720

Query: 731 MTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL 780
           MTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL
Sbjct: 721 MTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL 780

BLAST of Lsi09G016390 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KA27 (Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 839.7 bits (2168), Expect = 9.7e-240
Identity = 650/945 (68.78%), Postives = 673/945 (71.22%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSS 70
           MSGF FGSS+SQ  SSSPFSS TGFSFGST+ FSFGSS +  S LS SSSSS NPTSSSS
Sbjct: 1   MSGFGFGSSTSQ--SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLS-LSSSSSSSSNPTSSSS 60

Query: 71  PFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGASSSS-----ATSASSLFGV 130
           PF N TSNP SSSSFGFGSSSF +STSSPF FSL +ASTGASSSS     ATSASSLFGV
Sbjct: 61  PFPNPTSNP-SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120

Query: 131 SSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSS 190
           SSSS G  SFGFGASSSS N              SSAP+FGAASSSG+SS  LFGA    
Sbjct: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSAN--------------SSAPLFGAASSSGTSSTSLFGA---- 180

Query: 191 GSSSAPLFGATPSSGTSLVPSFGALPSS-GSSSTPLFGAAPSAGA-SAPSLFGGVSSATT 250
           GS  AP FGA PSSG+S+ PSFGAL SS G+SS PLFGAAPSAGA SAPSLFGG SSATT
Sbjct: 181 GSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATT 240

Query: 251 SSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGT-STSSGSAGSTLFGSSPFGAS-- 310
           SSAPLFGTSAS  S GS LFGAS AAAS S   LFGT +TSSGS GS LFGSSPFGAS  
Sbjct: 241 SSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS-AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSS 300

Query: 311 ---SSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKT 370
              SS S SNLFA   SS STSPFQ++LSSSSSQNL+SSSPF A S SGFSF T SLSKT
Sbjct: 301 GTLSSASTSNLFA---SSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVA-SPSGFSFPTGSLSKT 360

Query: 371 TNVT-------------------------------------------------------- 430
           T++T                                                        
Sbjct: 361 TSITNVSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 420

Query: 431 ------------------------------------------------------------ 490
                                                                       
Sbjct: 421 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 480

Query: 491 -----------------------------------------------TASSSSLTSASTS 550
                                                          ++SSSSLT ASTS
Sbjct: 481 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSLTLASTS 540

Query: 551 SSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTT 610
           SSSFSFGTPASS+SQSSFGFSINNAASTGGSSAPS+TATKPTSL                
Sbjct: 541 SSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL---------------- 600

Query: 611 SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTASS 670
           SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAA SAPSA+SSGAVSSFTGFGVTS+ASS
Sbjct: 601 SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASS 660

Query: 671 SSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVAS 730
           SSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP SFGFPSLAS+STAATTTSGFSASSQSQTSS LVVAS
Sbjct: 661 SSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVAS 720

Query: 731 SSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI 780
           SSS TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI
Sbjct: 721 SSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIINEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI 780

BLAST of Lsi09G016390 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DSI7 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023501 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 760.0 bits (1961), Expect = 9.8e-216
Identity = 507/608 (83.39%), Postives = 540/608 (88.82%), Query Frame = 0

Query: 179 FGAASSSGSSSAPLFGATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGV 238
           FGAA ++GSSS  +FGA PS  ++         S+GSSS  LFGAAPSAGASAPSLFGGV
Sbjct: 1   FGAALAAGSSSGSVFGAAPSGSSA--------SSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGV 60

Query: 239 SSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFG----S 298
           SSAT+SS PLFG+SA T +PGSAL GAS AA    S  LFGT++SSGSAGS LFG    +
Sbjct: 61  SSATSSSTPLFGSSAPTATPGSALPGASVAA----SGSLFGTASSSGSAGSALFGAPLST 120

Query: 299 SPFGASS-SVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTS 358
           + FG+++   S+S LFASS SS STS FQNS SSSSSQ+LSSSSPFAASSSSGFSF TTS
Sbjct: 121 NSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLSSSSPFAASSSSGFSFPTTS 180

Query: 359 LSKTTNVTTASSSS--LTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSST 418
           LSKTTN  TASSSS  LTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFS +NAAST  S+AP +T
Sbjct: 181 LSKTTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTT 240

Query: 419 ATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSA 478
           ATKPTSLSFST+VAPLFSTVTTTSASTP A+STTQPSFSVPAFS SSSAATT+S AA S 
Sbjct: 241 ATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTISTAASST 300

Query: 479 PSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTA 538
           PSA+SSGA SSFTGFGVT+TASSSS I SLSLPTKT TAASSSQ P SFGFPSL S+STA
Sbjct: 301 PSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFPSLPSASTA 360

Query: 539 ATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA 598
           ATT+SGFSA SQSQTSSTLVVASSSS TTSTVSA VS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA
Sbjct: 361 ATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA 420

Query: 599 ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQE 658
           ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE+KLELIETHQQE
Sbjct: 421 ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQE 480

Query: 659 VDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTL 718
           VDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTL
Sbjct: 481 VDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTL 540

Query: 719 NANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL 778
           NANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+AAT+GPAADREL
Sbjct: 541 NANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADREL 596

Query: 779 LGQKFWMS 780
           LGQKFWMS
Sbjct: 601 LGQKFWMS 596

BLAST of Lsi09G016390 vs. NCBI nr
Match: XP_022959228.1 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 950.3 bits (2455), Expect = 1.1e-272
Identity = 653/786 (83.08%), Postives = 689/786 (87.66%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQ-SSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSS 70
           MSGF+FGSSSSQ SSSSSPFSS TGFSFGSTSAFSFG     SSPLSLSSSSS NP+SSS
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFG-----SSPLSLSSSSSSNPSSSS 60

Query: 71  SPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGASSSSATSASSLFGVSSSS 130
           S FSNQTSNP SS+ FGF SSSFPSS SSPF FSLPAASTGASS S  S SSLF  SSSS
Sbjct: 61  SAFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS--SGSSLFAASSSS 120

Query: 131 GGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSS 190
           GGL+SFGFG SSSSG SSA  FGAA +SGSS  P FGAAS+SG+S APLFG+A SSGSS 
Sbjct: 121 GGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSP 180

Query: 191 --------------APLFGATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLF 250
                         APLFG+ PSSG+S +PSFGA PS+GSSS+P FGAAPSAG SAPSLF
Sbjct: 181 VPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLF 240

Query: 251 GGVSS-ATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFGS 310
           GGVSS ATTSSAPLFGTSA T SPGS++FGAS AA+ +SSS               LFGS
Sbjct: 241 GGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSS---------------LFGS 300

Query: 311 SPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSL 370
           +PF +SSSVS SNLF SSSSS ST+PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGFSFSTTSL
Sbjct: 301 NPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSL 360

Query: 371 SKTTNVTTA-SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTAT 430
           SKTT++T A SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSI+NAASTGGSSAP +TA 
Sbjct: 361 SKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAA 420

Query: 431 KPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPS 490
           KPTSLSFST+VAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAA S PS
Sbjct: 421 KPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPS 480

Query: 491 ASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAAT 550
            +SSGA SSFTGFGVTSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAP SFGF SLA +STAAT
Sbjct: 481 TTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAAT 540

Query: 551 TTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAEL 610
           TTSG +ASSQSQTSSTLV+ASSSS TTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAEL
Sbjct: 541 TTSGSNASSQSQTSSTLVIASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAEL 600

Query: 611 QERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVD 670
           QERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVD
Sbjct: 601 QERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVD 660

Query: 671 KALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA 730
           KALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA
Sbjct: 661 KALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA 720

Query: 731 NQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLG 780
           +QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLG
Sbjct: 721 SQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLG 763

BLAST of Lsi09G016390 vs. NCBI nr
Match: XP_038874708.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 949.9 bits (2454), Expect = 1.4e-272
Identity = 650/775 (83.87%), Postives = 671/775 (86.58%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQ-SSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSS 70
           MSG   GSSSSQ SSSSSPFSS+TGFSFGSTSAFSFGS   SS+PLSLSSSSS NPTSSS
Sbjct: 1   MSGSGSGSSSSQWSSSSSPFSSSTGFSFGSTSAFSFGS---SSTPLSLSSSSSSNPTSSS 60

Query: 71  SPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGASSSSATSASSLFGVSSSS 130
           SPFSNQT NPASSSS GFGSSSFPSS SSPF FSL                         
Sbjct: 61  SPFSNQTPNPASSSSSGFGSSSFPSSASSPFSFSL------------------------- 120

Query: 131 GGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSS 190
                                            P+FG+A SSG+SSAPLFG+ASSSGSS 
Sbjct: 121 ---------------------------------PLFGSAPSSGTSSAPLFGSASSSGSSP 180

Query: 191 APLFGATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLF 250
           AP FG   SSG+SLVPSFGALPSSGSSS PLFGA PSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLF
Sbjct: 181 APSFGPASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLFGATPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLF 240

Query: 251 G-TSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFGSSPFGASSSVSASNL 310
           G TSAST SPGSALFGAS  AAS SSS LFGTST+SGS+GS LFGSSPFGASSS+S SNL
Sbjct: 241 GTTSASTASPGSALFGAS-VAASGSSSSLFGTSTTSGSSGSALFGSSPFGASSSLSTSNL 300

Query: 311 FASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAA---SSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTA-S 370
           FASSSSSTSTSPFQNS SSSSSQNL+SSS FAA   SSSSGFSFST SLSKTT++TTA S
Sbjct: 301 FASSSSSTSTSPFQNSFSSSSSQNLNSSSLFAASSSSSSSGFSFSTVSLSKTTSITTASS 360

Query: 371 SSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTV 430
           SSSLT+ASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSI+NAASTGGSSAPS+TATKPTSLS S++V
Sbjct: 361 SSSLTTASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSSSV 420

Query: 431 APLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFT 490
           APLFSTVTTTS STPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAA S PSASSSGAVSSFT
Sbjct: 421 APLFSTVTTTSGSTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSVPSASSSGAVSSFT 480

Query: 491 GFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQS 550
           GFGVTS ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP SFGFPSL S+ T ATTTSGFSASSQS
Sbjct: 481 GFGVTSMASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLTSAPTPATTTSGFSASSQS 540

Query: 551 QTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA 610
           QTSSTLVVASSSS TTSTV+ATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA
Sbjct: 541 QTSSTLVVASSSSGTTSTVNATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA 600

Query: 611 NAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAE 670
           NAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVE+QAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAE
Sbjct: 601 NAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVESQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAE 660

Query: 671 RIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDG 730
           RIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDG
Sbjct: 661 RIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDG 713

Query: 731 MTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 780
           MTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
Sbjct: 721 MTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 713

BLAST of Lsi09G016390 vs. NCBI nr
Match: XP_023548092.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 947.2 bits (2447), Expect = 8.9e-272
Identity = 659/800 (82.38%), Postives = 691/800 (86.38%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQ-SSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSS 70
           MSGF+FGSSSSQ SSSSSPFSS TGFSFGSTSAFSFG     SSPLSLSSSSS NP+SSS
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFG-----SSPLSLSSSSSSNPSSSS 60

Query: 71  SPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGASSSSATSASSLFGVSSSS 130
           S FSNQTSNP SS+ FGF SS FPSS SSPF FSLPAASTG SS S  S SSLF  SSSS
Sbjct: 61  SAFSNQTSNPPSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGS--SGSSLFAASSSS 120

Query: 131 GGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSS 190
           GGL+SFGFG SSSSG SSA  FGAA +SGSS  P FGAAS+SG+S APLFG+A SSGSS 
Sbjct: 121 GGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSP 180

Query: 191 --------------APLFGATPSSGTSLVPSFGALP--------------SSGSSSTPLF 250
                         APLFG+ PSSG+S +PSFGA P              SSGSSS+P F
Sbjct: 181 VPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFF 240

Query: 251 GAAPSAGASAPSLFGGVSS-ATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGT 310
           GAAPSAGASAPSLFGGVSS ATTSSAPLFGTSA T SPGS++FGASAAA+ +SSS     
Sbjct: 241 GAAPSAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSS----- 300

Query: 311 STSSGSAGSTLFGSSPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFA 370
                     LFGSSPF +SSSVS SNLF SSSSS STSPFQNS SSSSSQNLSSSSPFA
Sbjct: 301 ----------LFGSSPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFA 360

Query: 371 ASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTA-SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNA 430
           A SSSGFSFSTTSLSKTT++T A SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSI+NA
Sbjct: 361 A-SSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNA 420

Query: 431 ASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSS 490
           ASTGGSSAP +TA KPTSLSFST+VAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSS
Sbjct: 421 ASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSS 480

Query: 491 AATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGS 550
           AATTLSIAA SAPS +SSGA SSFTGFGVTSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAP S
Sbjct: 481 AATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPAS 540

Query: 551 FGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITG 610
           FGF SLAS+S AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSS TTSTVSATVS+TPKLPSEITG
Sbjct: 541 FGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSATPKLPSEITG 600

Query: 611 KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE 670
           KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE
Sbjct: 601 KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELE 660

Query: 671 KKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQ 730
           KKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQ
Sbjct: 661 KKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQ 720

Query: 731 MTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL 780
           MTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL
Sbjct: 721 MTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL 777

BLAST of Lsi09G016390 vs. NCBI nr
Match: XP_008459731.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 943.7 bits (2438), Expect = 9.9e-271
Identity = 669/788 (84.90%), Postives = 697/788 (88.45%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSL-SSSSSLNPTSSS 70
           MSGF FGSS+SQSSSSSPFSS TGFSFGST+ FSFGS   S+SPLSL SSSSS NPTSSS
Sbjct: 1   MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGS---SASPLSLSSSSSSSNPTSSS 60

Query: 71  SPFSNQTSN-PASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGAS-----SSSATSASSLF 130
           SPF N TSN P+SSSSFGFGSSSF SSTSSPF FSL +ASTGAS     SSSA SASSLF
Sbjct: 61  SPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLF 120

Query: 131 GVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAAS 190
           GVSSSS G  SFGFGASSSS N              SSAP+FGAASSSG+SSA LFGA  
Sbjct: 121 GVSSSSTGFNSFGFGASSSSAN--------------SSAPLFGAASSSGTSSASLFGA-- 180

Query: 191 SSGSSSAPLFGATPSSGTSLVPSFGALPSS-GSSSTPLFGAAPSAGA-SAPSLFGGVSSA 250
             GSS AP FGA PSSG+S+ PSFGAL SS G+SS PLFGAAPSAGA SAPSLFGG SSA
Sbjct: 181 --GSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSA 240

Query: 251 TTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTST-SSGSAGSTLFGSSPFGA- 310
           TTSSAPLFGT+AS  S GSALFGAS A AS S + LFGTS  SSGS GS LFGSSPFGA 
Sbjct: 241 TTSSAPLFGTAASAASSGSALFGAS-APASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGAS 300

Query: 311 ----SSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLS 370
               SSSVS SNLFASS SS   SPFQ+SLSSSSSQNL+SSSPFAA S SGFSF T++LS
Sbjct: 301 SSGTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAA-SPSGFSFPTSTLS 360

Query: 371 KTTNVT----TASSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSST 430
           KTT++T    ++SSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSINNAASTGGSSAPS+T
Sbjct: 361 KTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTT 420

Query: 431 ATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSA 490
           ATKPTSLS S +VAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAA SA
Sbjct: 421 ATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSA 480

Query: 491 PSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTA 550
           PSA+SSG VSSFTGFGVTS+ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP SFGFPSLAS+STA
Sbjct: 481 PSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTA 540

Query: 551 ATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA 610
           ATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSS TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA
Sbjct: 541 ATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA 600

Query: 611 ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQE 670
           ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQE
Sbjct: 601 ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQE 660

Query: 671 VDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTL 730
           VDKAL SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTL
Sbjct: 661 VDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTL 720

Query: 731 NANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL 780
           NANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL
Sbjct: 721 NANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL 761

BLAST of Lsi09G016390 vs. NCBI nr
Match: KAG6575234.1 (Nuclear pore complex protein NUP62, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7013798.1 Nuclear pore complex protein NUP62, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 942.2 bits (2434), Expect = 2.9e-270
Identity = 655/800 (81.88%), Postives = 689/800 (86.12%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQ-SSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSS 70
           MSGF+FGSSSSQ SSSSSPFSS TGFSFGSTSAFSFG     SSPLSLSSSSS NP+SSS
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFG-----SSPLSLSSSSSSNPSSSS 60

Query: 71  SPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGASSSSATSASSLFGVSSSS 130
           S FSNQTSNP SS+ FGF SSSFPSS SSPF FSLPAASTGASS S  S SSLF  SSSS
Sbjct: 61  SAFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS--SGSSLFAASSSS 120

Query: 131 GGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSS 190
           GGL+SFGFG SSSSG SSA  FGAA +SGSS  P FGAAS+SG+S APLFG+A SSGSS 
Sbjct: 121 GGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSP 180

Query: 191 --------------APLFGATPSSGTSLVPSFGALP--------------SSGSSSTPLF 250
                         APLFG+ PSSG+S +PSFGA P              SSGSSS+P F
Sbjct: 181 VPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFF 240

Query: 251 GAAPSAGASAPSLFGGVSS-ATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGT 310
           GAAPSAG SAPSLFGGVSS ATTSSAPLFGTSA T SPGS++FGAS AA+ +SSS     
Sbjct: 241 GAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSS----- 300

Query: 311 STSSGSAGSTLFGSSPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFA 370
                     LFGS+PF +SSSVS SNLF SSSSS ST+PFQNS SSSSSQNLSSSSPFA
Sbjct: 301 ----------LFGSNPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFA 360

Query: 371 ASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTA-SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNA 430
           A SSSGFSFSTTSLSKTT++T A SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSI+NA
Sbjct: 361 A-SSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNA 420

Query: 431 ASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSS 490
           ASTGGSSAP +TA KPTSLSFST+VAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSS
Sbjct: 421 ASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSS 480

Query: 491 AATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGS 550
           AATTLSIAA S PS +SSGA SSFTGFGVTSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAP S
Sbjct: 481 AATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPAS 540

Query: 551 FGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITG 610
           FGF SLA +STAATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSS TTSTVS TVS+TPKLPSEITG
Sbjct: 541 FGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITG 600

Query: 611 KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE 670
           KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE
Sbjct: 601 KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELE 660

Query: 671 KKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQ 730
           KKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQ
Sbjct: 661 KKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQ 720

Query: 731 MTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL 780
           MTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL
Sbjct: 721 MTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL 777

BLAST of Lsi09G016390 vs. TAIR 10
Match: AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )

HSP 1 Score: 418.3 bits (1074), Expect = 1.3e-116
Identity = 413/798 (51.75%), Postives = 532/798 (66.67%), Query Frame = 0

Query: 11  MSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSS 70
           MSGF FG S          +S  GFSFGS+SA +  S+S+++SPLS S + S NP+S+  
Sbjct: 1   MSGFPFGQS----------NSVGGFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTGF 60

Query: 71  PF-SNQTSNPASSS--SFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTGASSSSATSASSLFGVSS 130
            F S+ +S PASS+  SFGFG+SS PS     F F   A+S+  S    +SAS      +
Sbjct: 61  GFGSSVSSTPASSTTPSFGFGASSTPS-----FGFGSSASSSTPSFGFGSSAS-----VT 120

Query: 131 SSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAP-------VFGAASSSGSSSAPLFG 190
            +    SFGFG ++SS   + SLFG++ ++ SS+AP       V  +ASS+ + S+ LFG
Sbjct: 121 PASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFG 180

Query: 191 A-ASSSGSSSAPLFGATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVS 250
           A ASS+ + S+  FGA P+SG++  P FG+ PS       LF A  SA AS  SLFG  S
Sbjct: 181 APASSAATPSSSPFGAAPASGST--PLFGSSPS-------LFSAPSSASASNSSLFGASS 240

Query: 251 SATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASAS-------SSPLFGTSTSSGSAGSTLF 310
           SA TS++PLFG  +S T    +   AS+A  S+S       SSP F  ++S+  +  ++F
Sbjct: 241 SAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSSPSIF 300

Query: 311 ---GSSPFGASSSVSAS--NLFASSSSSTST---SPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASS 370
              GSSPF  SSS + S  +LFASSSS  +T   SPF  ++ +SSS+ N S++S    S+
Sbjct: 301 GATGSSPFFGSSSSAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSA 360

Query: 371 SSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTG 430
           S+GFSF  ++ S TT+ TT S+   T  ++SSSSFSFGT A+S      GF++    STG
Sbjct: 361 STGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQT--ASSSSSFSFGTSANS------GFNL----STG 420

Query: 431 GSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATT 490
            S+AP+S +T     S +TT        TTTS+STPAA  T+ P+ S PA + +  +   
Sbjct: 421 SSAAPAS-STSGAVFSIATT--------TTTSSSTPAA--TSAPASSAPASTMAFPSFGV 480

Query: 491 LSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPGSFG 550
            S A  + P  +SS A  S TGFG+ S+  ++ +  S +     KTST ASSSQ   +  
Sbjct: 481 TSSATNTTP--ASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTPASSSQPQTT-- 540

Query: 551 FPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKT 610
            P+ + S  ++T+T+  + SS + T +TLVV SSS   TST  A V+ +PKLPSEITGKT
Sbjct: 541 SPAFSFSLPSSTSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGSPKLPSEITGKT 600

Query: 611 VEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKK 670
           VEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++
Sbjct: 601 VEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQSSLERQ 660

Query: 671 LELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMT 730
           LELIETHQQEVDKALQS+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRD MYEQ+E +ERELE MT
Sbjct: 661 LELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQSELVERELEHMT 720

Query: 731 EQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAA 780
           EQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A
Sbjct: 721 EQIRSIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI-A 739

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Q8L7F71.9e-11551.75Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1... [more]
G0SBQ32.3e-1230.98Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI ... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1H5C85.1e-27383.08nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L... [more]
A0A1S3CAD44.8e-27184.90nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 ... [more]
A0A6J1L2D41.4e-26781.63nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 P... [more]
A0A0A0KA279.7e-24068.78Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3... [more]
A0A6J1DSI79.8e-21683.39nuclear pore complex protein NUP62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC11102350... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022959228.11.1e-27283.08nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata][more]
XP_038874708.11.4e-27283.87nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida][more]
XP_023548092.18.9e-27282.38nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
XP_008459731.19.9e-27184.90PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo][more]
KAG6575234.12.9e-27081.88Nuclear pore complex protein NUP62, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. soror... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT2G45000.11.3e-11651.75structural constituent of nuclear pore [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 683..710
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 621..665
NoneNo IPR availableGENE3D1.20.5.170coord: 608..667
e-value: 4.6E-9
score: 38.1
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 154..230
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 435..455
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 154..223
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 43..127
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 309..389
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR12084:SF0NUCLEOPORIN 62-LIKEcoord: 197..772
IPR025574Nucleoporin FG repeatPFAMPF13634Nucleoporin_FGcoord: 113..194
e-value: 0.043
score: 14.7
coord: 206..293
e-value: 1.0E-6
score: 29.5
IPR007758Nucleoporin, NSP1-like, C-terminalPFAMPF05064Nsp1_Ccoord: 565..669
e-value: 8.0E-22
score: 77.2
IPR026010Nucleoporin NSP1/NUP62PANTHERPTHR12084NUCLEAR PORE GLYCOPROTEIN P62-RELATEDcoord: 197..772

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi09G016390.1Lsi09G016390.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006606 protein import into nucleus
biological_process GO:0006405 RNA export from nucleus
cellular_component GO:0044613 nuclear pore central transport channel
cellular_component GO:0005643 nuclear pore
molecular_function GO:0005543 phospholipid binding
molecular_function GO:0017056 structural constituent of nuclear pore