Lsi09G015360 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTTTTTTTTAAAAATTAGAATTCTCTCCCTCAGATTAACCAATACAACCATCAATGATAATTTGGATTTATTGCAAACATGAGTCATCTATATGCTTTATACTTCATGTTAAGTCATTATGGAGCTGAAAAGAAATTAATTGAGTGAACATGGAATCTTTTGGTCGATTGGGAGGCTTGGTAATCATGTGGGATGAGATGCAAGGTGAAGGTTTTAGAAGTGTTAAAAGGTGGCTATTTCCTCTCAGTGTAAGTATCTTTTCAGCAAAATAAAGTTTGTTGGATTTCAAATTTATATAGTGCAAATGATTGCAGAGAATTAAAGCATTTTCGGAGTGTGCTGAGATCTTTTCATTCTTATTGTGAAGATTCGTGGTGTGTAGGGGTGATTTTAATATAGTCCGTTGAGTTCACGAGCAACTCCCAATTGGAAGACAGACTAAAGGTATGAGAGTTTAATAAAATTATTGATGAGATTGGTTTGATTGGAATTCCTCTAAAATTCACATGGATTAGAGAAGGTGATGGGCCTCAGTCTTTGTTAAATCACATTCTTTGAGAATTAAAGAGCAGCTCCCAATTGGAAGACAGACAAAGAATAGGATTATATTACTACAATACTTTTCTTGAGTTTTTTCATTTAATGCAATTGGTTACCTATCAAAAAATATCTTTGAAATAAACATTTAGAAACACTTTATAGTATTTTTAGAAATCACCAGTATTACATTTTTAAAATCTCTCTCTCATAGTTTATACTACCAAAAGTTGTAGATTCATGGACGTTACCAAGAAAATTGATTGATTAAAAATACGATGAAATTTCGAGGTTATAAACTCTAATTAGGAGTGAAAAGGAAACAAAAAAAATCCAACAAACTAAGACATGGATATCACAGCGCCTCAATTTGTACAAATATCATTGAATTAGTAGCTTGCAAATAAAGAAAAGAGAAAACACCAATAAGAAACTTTAACGTTGATTCCAAAATGTTCTTGCCAAACTAAATGTTTATCTTAAAAAGCTCTCTAATTTTTTTCAAACCAAACGTCAGAGGTGATAGCCTCAACAAAATTAACTCATATTAGTTGAGCTTTTGTAAGCAATAAGAGAGAAAGTAAATTCGGTGTGAAGTTAGTTAGCTTTTGGGGAGGGGACCACTAAGAGAACGTTGTGGGAGTGAGTGTGGTCAGTATATAGAACAATGCTTTGGGGTAGAAGATTTTTATGCTTTTTGGTAGTAAGAAGTAAGTACTCGGTAGGGAGAGAACCATCCCTCTCATTTGGCTGGATTTTGTATCGCCTCAGGGCTTTCCAGTTATCGAAATATCACTAATAGTAAGGATATACCTTACATTTTTATGGGTCCCTTGGATAATCTTCACATAGATGAACCAAAAAAATATATCCAACTTGTCACTTGATTATTTCACACTCAAAAGTTATTATTATTGTCATATATGTGTCTTTTTGGTCTACTCAACAAGTGTTCAATGTATGTCTAACACATTTGTTGCACTAGCAAGCGTCCGATACGTGTCCAACAAGTGCGGTGTGTCCAAGTGTCCGACACGTGTCGGACACGGACACGCTAGCCAAACTAAAGTGTCCGTGCTTCTTAGTGTATAGCTGACGTCCCTTTTTGTGGGCTTGGTTTTTTTGTATGTCCGTGTATTCTTTCATTTTTTCTCAATGAAAGGTGTTGTTCTTATAAAAAAAAGATACAAAATCATTATTCACTTTCCTCACCACCAATAGACACTTACTCAACAATAGTTGGCTTACACATAAAACTATGGAGTTGTCCCCACCCGAAAAGAGTGAAATTCCTTCTTTGAGAAATCACTAACTCCTGTTTTAATACTATGGATAGGTTATAGAAACGCTGCCCTTGGATCAACCTATCTCCCTCTTGGTGCTACCTTTTCCAATCCAACAATGAATATGTCCAACATGTTTTCTTTGATTGTCCCTTTTCTAGAGGGATTTGGTCCGAGTTTTTCTCTGCCTTCAACTGGTCTGTTGCACTTCCTTTTGACACACATATTTGGCTTTGTTTACTGATCATCAATCCACCTTTCAAAGTCGCCAAAGACCATTTGTGGTTATGCATTATTTGTGCTGTTTTGGGGATTTGGGATAAAAGAAATGCAAGAATCTTTCAGAAAAAATACATAATGACAAAGGGCGTAATAGATACTATCATTCATAAACCATCATGTGTTGGCCTTGTGGTAAATAGGGGGACGTGACCTTGATAAAGGGGTAAGAGATTATGGTTTGAATCCATGGTGGCCACTTACCTAGGATTTAATATCTTACAAGTTTTCTTGACACCCAAATGTTATAAGGTCAGGCGGATTGTCCCGTGAGATTAGTTGAGGTGCACATAAGTTGGCTCAAACACTCACAGACATAAAAAAAATACTATCATTCATAATGCTTTTTTTTGGTGCAAAGATATACCGGCTATAAATAGTCATAGCTTTTTTTTCCTTATTACAAATTGGAAACACCTTTTGTATACTCTATGAAATGGGCCCTTTTGACCTTTAGATATCTTCGGATATTTCATTCAATCAATGAAATTATTTCATATAAAAAAAACTTGTGATTGGAACCATAGGTAATTGCAGTTTTGCAAGGATTAGAACATAGGGAATGATTTTTGGATCAGATTGAATACAAAAAAGATGTTAAATAGAATTAGAACAAAATATTGTGTTGAAGAAATTAAATTTTACTTTGGATATTATAGAAAGAGATAGACATATTTCATATTTTCAGTTCAATCAGTTTGTATCTTATTTGAACTTTTATTTTCAGTTTCAATTTTATTGTATTCTGAGCATCACACTATTTTCATTACTTCAATGAAAGGTCTTGTTTCCTTTTCAAAAAAGAAAGAGAGAAAAAAAAGGTAGACATATTGTTTGTATGGCTATTTGTAACTCTTCATCCATTTGTTTGTGATAATGCAGGTTGATGTGTTTATAGTAGCAGTGAAGGTTAAGTTGGGTTTAGTTGACTTGGTAGTAGAGTATTGTGGTGGTGCATGAAACTTGTTAATGATTGAGCTATGTCGTTGACACCAAAGGAGCCAGAGCATGTTATGAAGTTTAGAGGAGGATCAGTTCTGGGTAAAAAGACAATTCTTAAAAGTGACCATTTCCCTGGATGCCAAAACAAGCGCTTATCACCTCAAATAGATGGTGCTCCAAATTACCGTCAGGTGCATTCCCCCTCCTTTTGTTTTTCTTGCCTACTTCCATAGTTTTCTCTTGCTTTTTGTCATAACTTCATCACATCTTAGTGTACTTCCACCAATATTTATCATAATTATTCTCTATTTTTTTTGTGGTGCTAGTGCCACCTCAAATTTCTTCTCTAATAATTTATGGTTTTACAAATTTTCAACAAATATTGCTTCCAGTTCTATTTCTAATTAAAAAAGAGGTGTTTTTTTATTGCCTTTTTAACCTTTTCCCCAGATTTTTCCCTTGTTTTATTTAGTACTTTTTTTTTGTGCTCTTTCTTTATTTCCCTATTTTCTTGTGTATGGTTTTTAGTTCTAATTCAAAAAATTGATGTAGTTTAACAATATGATTAAGACATATAAGGTTTTACATTTTATGATTTTTATTTTATTTAAAATGAGGCGTACACCTCATACCACCTCAAAGCTTACACATCGCTTCTTTATGAGGAAAAGCCTTGAGGCCACCTTAAGCTTTTTAAAACCTCGGGTTAAATTTGTGGAGGTCTTGTTGGAATTTCTTTAGGCACTACTAGACTGTTGAATTACTTCAAAGCCTCTACAAAAGTGATGACAATGCAATGCTTGATAATACCCTCATTAATACTATTGAATTGTTTGAATGTTGTTCTGGTTCAAAAGTGAATTGGGCAAAGCCAGCTGACTCCAAGATACAACAAGTGTTCTTGTTTGAATTGTTAAGTAGAAATGCTGCCAATCACTTATCTTGGTTTTCCTTTTGGTAGCTACCCCAAAAAGACTTATTTTTGGGTGTTTGAAAAGATTCAAAAGAAATTAGATAGATGGAGGAGATTTAATTTATCAAGAGGAGGTAGATTGACTCTTTGTATGTCCGTACTCTCTTGCTTTATTATATGTGCATATTCTTAATGACCCCTAATGTTTGTTTGGTAGTGGAAAGACTAATGCGATCATATTTCTGGGAGGGTGATAAAATAAACCATCTTATGACGCTAGATGTTGTGAACAATTTATAGTTGACCAAAATAAAGCATTTGACTAGTAGAAGAAAAGCACCTTTACCTAACAAAATTAAGTGAATACCCAAAGTGGTAGTAATTTAATTTCTATCTTTCAACACATAATCAAAGAATGAAAAAGATTCTTCAATTCCCGGTCCTAGAAGTGCATGATAATTTGAAATACCACCAAAACTCAATATTGCGGTGGGAATTTAGTGAAGTATGGAAAAGTATTATATTGCAAGCTCTCATTGAGTTGTTTTGGTTCTTAGGCGGTGAGGATTTTGGAGCACTCTATTGTTCTTTAAATGTTTTATTGATTATAATTGTCTCTAATTTCTTGTTTTTAATTTTTAATTTTCCCTTGAGCATATATTCTTTATCATTATAAATCAATGAGGAGGCGTTCATTAAAAAACAATTATATATGGTTTCAATTTTCTATTCTAAAATCAAAGTGTCTCCACTTTGTTAAGCTTCCCAAAATCTTCCCCGGAGGGTGCTTTGTGTGAAACTGTAATTATGGATGCATTTCAATTAATTAACTGGATGGTTAATTGCGTAGTTCACCATTTACTAATCATTCTATTTTTCACAATGTTTCTTTAGGCCGATTCATTACAAGTCCATGGTGTTGCTATTCCTACAATTCTTGGAATTCAGAACGTTCTCAAGTATGTTGGAGCTCAAAAAGATGGGCAACAAGCTCAAGTTCTTTGGATTAACCTTCGGGAAGAACCGGTAAATCCCCTC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Homology
BLAST of Lsi09G015360 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Lsi09G015360 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8JHZ8 (Paladin OS=Gallus gallus OX=9031 GN=PALD1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 2.3e-39 Identity = 193/794 (24.31%), Postives = 333/794 (41.94%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DIR8 (Paladin OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=pald1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 163.7 bits (413), Expect = 1.2e-38 Identity = 184/800 (23.00%), Postives = 349/800 (43.62%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q803E0 (Paladin OS=Danio rerio OX=7955 GN=pald1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 154.8 bits (390), Expect = 5.4e-36 Identity = 188/795 (23.65%), Postives = 341/795 (42.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P70261 (Paladin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pald1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 104.4 bits (259), Expect = 8.3e-21 Identity = 106/402 (26.37%), Postives = 175/402 (43.53%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KXW3 (paladin isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499203 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2079.3 bits (5386), Expect = 0.0e+00 Identity = 1039/1076 (96.56%), Postives = 1058/1076 (98.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BVY0 (Paladin OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold46G00810 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2078.1 bits (5383), Expect = 0.0e+00 Identity = 1041/1075 (96.84%), Postives = 1058/1075 (98.42%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C832 (paladin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497744 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2078.1 bits (5383), Expect = 0.0e+00 Identity = 1041/1075 (96.84%), Postives = 1058/1075 (98.42%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L094 (paladin isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499203 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2077.4 bits (5381), Expect = 0.0e+00 Identity = 1038/1075 (96.56%), Postives = 1057/1075 (98.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H3T5 (paladin isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460243 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2073.5 bits (5371), Expect = 0.0e+00 Identity = 1036/1076 (96.28%), Postives = 1057/1076 (98.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. NCBI nr
Match: XP_038874640.1 (paladin isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2098.2 bits (5435), Expect = 0.0e+00 Identity = 1047/1076 (97.30%), Postives = 1060/1076 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. NCBI nr
Match: XP_038874639.1 (paladin isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2096.2 bits (5430), Expect = 0.0e+00 Identity = 1046/1075 (97.30%), Postives = 1059/1075 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. NCBI nr
Match: XP_023006486.1 (paladin isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2079.3 bits (5386), Expect = 0.0e+00 Identity = 1039/1076 (96.56%), Postives = 1058/1076 (98.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. NCBI nr
Match: TYK02992.1 (paladin [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2078.1 bits (5383), Expect = 0.0e+00 Identity = 1041/1075 (96.84%), Postives = 1058/1075 (98.42%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. NCBI nr
Match: XP_008458276.1 (PREDICTED: paladin [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2078.1 bits (5383), Expect = 0.0e+00 Identity = 1041/1075 (96.84%), Postives = 1058/1075 (98.42%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. TAIR 10
Match: AT3G62010.1 (unknown protein; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; Has 553 Blast hits to 216 proteins in 93 species: Archae - 0; Bacteria - 124; Metazoa - 193; Fungi - 58; Plants - 108; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 70 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1689.1 bits (4373), Expect = 0.0e+00 Identity = 840/1077 (77.99%), Postives = 946/1077 (87.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G015360 vs. TAIR 10
Match: AT3G62010.2 (unknown protein; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages. ) HSP 1 Score: 1679.1 bits (4347), Expect = 0.0e+00 Identity = 837/1077 (77.72%), Postives = 943/1077 (87.56%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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