Lsi09G007370 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGTCTCCTAACGAGTAAACGCCATATATATTCTCTCTTGTAATAGCCATCAATATTAATAATGTGTGATTTTTTTTTCTTTCTTAAAATATACTTTTCGTCTTTGAAGTTTGAGCTTAGTATCTATCTAGTCTTTAAAATTTCAAAAATAATATTTTACTCTTTGAAATTTTAAGAATGCTTCTAAATAATCCCTCAATTAACTTGACAGTTAGTTGACTAACAAAAAAAAAATGACATAATATATTTTTGAAACTTTTGAAAGTTCATGGTTATTTTTGACACAATGATAATTCAAAGGCATTTTCTATGAACTTTCAAAAGTTTCAAAAATATCCTTAAACTTAAAAAATAATTAAAAAATACCCCTGCCATTAGTTTTGGATGGAAGCCGTTAAAGTTTTATTTCAAAAATACCCTTGAACTTTTCAAAAGTTTCAAAAATACCCTTAACTAAAAAAAAGTTCAAAAATATCTTCACTGTAAGTATATGAACACAAATCGTTAATACCTCGTTGCAAAAATAACTTTAAAATTAAGAAAAAAAAAGTTTATAATTGCTCCTAACGTTAATATAGTGATCAATTTGTTTGAAGTTTTCTTAAGTTCGAAAATAATGAATGGTAAAACAAATTATATAGATATCCTCATTTTTTCATATAGATACTCTTATTTCCTCTTGATTTTTTAATTCTTAACTTACACCAATTTTCTCACCAACCAAAATTTTGAGTTAAAACATAAAATCCCATAAAGTCTCACAAAATTATAAAATCAAAATCTCCACTTAAACATACCAAAACGAAAAAAAAGAAACGTTAGTAGTTGGGTGTGTTAATTGCCGAATACGTTTTTTTATTTGACTATTTATCATTTCAGTATGTTTGAGAGGAGATTTTGATTTCAGAATTTTGTGAGATTTTATGTTTTAACCTAAAATTTTGGTTGGTGAGAAAATTGGTATAAGCTAAGAATTGGAAAATTAAGGGAAAAATAAGAGTAACTATATGGAAAAAACAAATGAAGATATCTTTATAATTTATTTTAAAGTTCATCATTTTCGAACTTAAAAAAACTTCAAACAAATTGATCACCATATTAATGTTATGAGCAATTTTAATTTTAAAGTTATTTTTGCAACGAGATATTAACGGTTTCTGTTTATAAACTTACGGTGAAGATATTTTTTTAAAAACTTTTTTTTAGTTAAGGGTATTGAAAAGTTCAGGAGTATTTTTTAAACAAAACTTTAACGGTTCCATCGAAAATTGATTGTAGGGTATTTTTTAACTCTTTTTTAAAGTTTAAGGGTATTTTTTAAACTTTTGAAATTTAGAGGTATTTTTGACACAAAGTGTATGGTTTATGGACATTTTTTTTTTATAATTTAACCATTTTTAAATGAGGTGGTAGTTTTTATTAATTTTATATTATTTTTTAGACTTGATTTTCTTCTCTCTCTTTTTCTTTCTCTTCTTCCTTTCCATTTTTCTCTTTCCTCTAAAAAACATTAAAAAAAACTAAAAAACAACACACTTGAAATCGATTGCAGCCCTTCTTCTATCATTCTTTTTGTTTAAATATTACTTTGGTCATTGTACTTTTGGTTTTTATTCATTTTTGTTCCTCTACTTTTAAAATGTTCAAGTCCCTATACTATTAACTTTCATTCATTTTGGTCCCTATACTTTAAAAATGTTCATTTTGGTCCTGATACTTTCAACTTCGGTTCATTTTGATCCTTAAACTTTAAAAAAAGTGACTATTTTTATCCTTTAAAAATGAAAATGAAGAGACCAAAATGACAACTTCTTTAAAAATATAAAGACAAAAATGAACTAAAGTTAAAAGTACAAGGACTAAAATGAATATTTTTAAAGTATAGAGACCAAAATGAACTAAAGTTGAAAGTATAGGGACCAAAATGAATAATTTGAAAGTATAAGGACCAAAATGAACCAAAACCAAAAGTATAGGAACTAAAGTAGTATTTAAACTTTTTTTTTTTCCTTTTTCCTCATCTCACTTTGTTTATTTCTCTTTTTTGTGATGGCCAAAAACCAAGAGACTTTGTTTATTTCTCTTTTTTGTGATGCCCAAAAACCAAGAAACCACTATTTGCATGAGACATTTGATGATTTAGAGTTAGAGAATTTTTTTTTAAGCTGTCTGGAGTGTAAATTTTCTAAGCCTATCAAATGAATGATAGCTACTCTATTTATAGGATTTCCAAGTGAGTTTCGTGGGATTGAGCTTGGGTCATGACCTTTGGGCCCAACTAATTGGATTTGGGCTTTTATTGGCTTTTGGTCCTATTAAGTCTATTTTTGCATTCAATTGAATTTTAGCCGAAACATTAATAATTAATTGAACAAAAAATAATTAATTTGATCCAATAGTGAGAACGAAAATACGTGATACTATCTAGATTTAGCAATTTACGTCATCAATTTCAATTTGGGACACATATAACTTAGTTCCAAATTTAATTATTTTTAATTAATTTCGCTATTAATTTGAGAAATGACGTGACAATTTGTGATTAGTCTAAAATTTCTCATTCAACAACCACCTACGTCAAGTTCCCCGTTAATTTTTTTCTTTCATTTTCTTGTTTTAGATATGGTTTTTTTTCTCTATCTTCTTCATTTTTCTTTTCATTTCTTTCAAGGGTTTCTTCTCTTATTGTTGGCCATGTTGTTTTTGTCTTCTATTTTGTGTGTGTGTTCATTTTTTTCTTTGGTCGAGTTTCTATTCTTTTGGATTAGAGTTTTCTCCCTAATTACTGAATATTTTTTTGGAGGAATGATTGAGGGGAGAGAAATGTAAAGGGAGAAGAAAGAGGGAAAAAGAGAAGAAAAAAAGAAAAAGGAAAGGATGCACTTCATCGAGAAAAAAAATATAAAATTAATAAAAATGGTCACCTCATCTAAAATTTACCAACCCAACATGATACATCATTTGTCATTAGTCAACTGATTAAATTAACTAAAGAATCATTTAGGAACATTTTTAGAAACCAAATAGATGTTCGTGGAAAAAATAAATAAATAAAGTTTTCAATTTCATAATTTTGATTTTTTCAAAATAAAAAATCGTTATTTCGATAATCATTTTATCAATTTATTGTTGTCCAGAAGAAATAAAAGAATTACGTCAAATGTTATTTCAGCCGGTGGAGTTGATTTGGGACTGAAATTTTGAAGCTCACTCCATTTTTTCTGGTTCCTGTCATCATGAAGCTTCAGCTTCATCCCATTTTCTGAGTCGCAATTGGCTCATAAGCCAACCGGTGAAACAATAATGGTGCCACTCATTATGGAACTTCCCGTAATCAATGGCTTTCACCCATTGCTCCGTTCCTCCTTATGCCCTTGCCCTTGCGCTTGTTCTTCAATCCGTAGCCTCTTCTTCCACCGCAGGAAGATGTTTCTCAGGTTGGCTGAATATCGGAATTCCTACCCATTTCTGCATACTACAGCGAACAGTTCTTTATCAAATGCTACTGGAAGGATCAATAACGAGAAGGATTTCTGGGATGATTATGAATTCGTGGAGGTGATTGGCATTGGCAGTAGAAAGGAAGCGGTACTTGATTTTTGTCTCGAGTCGGCCCTCAGGATTTCATCGCTGCGATTTTGGTAATTTCAACATGTTCATTTGCTTAATTCTGTACAATGATAGTAAGTATTGATTTGCTTTTAGAATTTTGGTTGTTAGTTGAGTTGCCATATGTTGTAAATAGTGAAAACCTTCAATGGCACTCACTATTTTAGCTACTATTGAAACTCTATTATGAAAAACGAGAAATTGATCTCATTCTTTATTTTTTAATTTTTGCAGGCAGATTGTAAAGCATGATTCTCTAAAAGTGCAACTACTTCAGAGATTCATTGAAAAAGGTTCTTTCAGTCTTCAGCGGTTGATTTTCCATTTTAAGCTGTTTCCATACAGTATAAGCTGTTCTATCATAACATGCATTTGAGTTAGGGAAACTTCAAATTAGCTTTTGTCTGGTATCTTTTGCTCGCAGGCTAATACAGTTAATAAATTAGTTCACCATGAAATTCCAATTTGTGAGTGAAGCTTGCGTTTATCTTAAGTATACACCTTGGAGTCTTCTCAAATGTTATAAGGTTCCCAAATGTCTACAGTTAGCTTATTTTCTTTAGAAACCAGAAAAGAAAGTTTAAGTTTTAAGTCTTGTTAAGTGAAAATAGAAAAAGGAAAGAAAAGGAAGAAGTATTGTTTGAATGCGAGAGAGCTTCTTTCTTCTGAGTGAAAAGAAGTAAAGAAAAAGAGCGCACCAATCATTTTTAGAAGTAAACTGGGAGTACTTGATGGTGATGTTTGGAATCTGGATGGTCTCAGGGTCTCCTTTGAGTGGTTGTTTTCTAAGAACTCTCTCATTAACCAATTGGCCCAAGTAGATCCTATCTTGCCACCAATTTTTCACGAAGAGATTTTGGAGATAGGAAGTTCCTTGTAAATATAGAGTTTTCTTGTAGATGCTGTCCTTGGATAGGCTGAACATGAATGATAGAATTCTAAAAAGAAGTTCTCAACCTAGTTTGTGCTGCCTTTACAAAATAGGTTTGGAAGATGCCAGTCGGCTTTTCTTGTCATGTTAGTTTTAGATGCCACGTTGCGGAGACTTCCATTTTAAGTTACCTCCTAGGTCCTCCATAGATTTTGTGGGCACAGCTTTAAGAATTGGCAAATGCTACTCTGGGTCAATAGTTTTTGTGCACTGCTTGAGAAATCTGGGATGAAACAAACTGAAGAATTTGATGAGGCAAAAAGCTTAGACTAGATCTGATATTGATGTCTATATTTCTTCTTTATGATTTCTTAGATGGAAAGCCTTTTGTAGTTACTTTTTATCTGATAAATAGACATTGGAAATATCTTCCCCTACTCCTTTGGGGTCCTCTTCTTCCTCTGAAAATTCCATTATATTAATAAACTTGTTTCTTATTAAAAAAAAGAAA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MNFSFIPFSESQLAHKPTGETIMVPLIMELPVINGFHPLLRSSLCPCPCACSSIRSLFFHRRKMFLRLAEYRNSYPFLHTTANSSLSNATGRINNEKDFWDDYEFVEVIGIGSRKEAVLDFCLESALRISSLRFWQIVKHDSLKVQLLQRFIEKDYTPRMIDVPLSLQSCSKTVILVVSAGYGFDYSAAVDILRTIRSANGFTVTIVLKPFSFEGKRRQDEVKHLVGRLKEHTSFLIDIDTDRLLEKDLVTLDEAVRSANNAVLLAINSISIVKSEMLIKFVDEPQNDVKELDVIDVMERSSGIQHEPRCLKEMALVLVKEGGANLLSFIWYSLLRMDRDENSPELSPSMIKLNTALNDINSPLIVEQPFTNHPDKGKSKLIPSELAAYSSPLQIPNSPNLMENPSIPALVENPSIPILVENPNFPILILENLKEGKIGFGAGHNFRTSILKSIYDCPFLSVHLKDLKGVVVCIVASSSIIDDNDKSTLLKTFREVTAYTGKLILSIIRDLNLEPNFLMTTVLIVG Homology
BLAST of Lsi09G007370 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6F6B5 (Protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARC3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 209.1 bits (531), Expect = 1.2e-52 Identity = 142/422 (33.65%), Postives = 195/422 (46.21%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CCE4 (Cell division protein FtsZ OS=Mycobacterium leprae (strain TN) OX=272631 GN=ftsZ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 8.3e-06 Identity = 35/100 (35.00%), Postives = 51/100 (51.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P64171 (Cell division protein FtsZ OS=Mycobacterium bovis (strain ATCC BAA-935 / AF2122/97) OX=233413 GN=ftsZ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 1.1e-05 Identity = 34/100 (34.00%), Postives = 51/100 (51.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A5U4H7 (Cell division protein FtsZ OS=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25177 / H37Ra) OX=419947 GN=ftsZ PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 1.1e-05 Identity = 34/100 (34.00%), Postives = 51/100 (51.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P9WN94 (Cell division protein FtsZ OS=Mycobacterium tuberculosis (strain CDC 1551 / Oshkosh) OX=83331 GN=ftsZ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 1.1e-05 Identity = 34/100 (34.00%), Postives = 51/100 (51.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JRB9 (protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489118 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 614.4 bits (1583), Expect = 4.5e-172 Identity = 344/504 (68.25%), Postives = 356/504 (70.63%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FFA3 (protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445197 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 609.8 bits (1571), Expect = 1.1e-170 Identity = 344/504 (68.25%), Postives = 355/504 (70.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CRX6 (protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504079 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 609.4 bits (1570), Expect = 1.4e-170 Identity = 337/504 (66.87%), Postives = 354/504 (70.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CS57 (protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504079 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 609.4 bits (1570), Expect = 1.4e-170 Identity = 337/504 (66.87%), Postives = 354/504 (70.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CS05 (protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504079 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 599.4 bits (1544), Expect = 1.5e-167 Identity = 334/504 (66.27%), Postives = 351/504 (69.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. NCBI nr
Match: XP_038907181.1 (protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 625.5 bits (1612), Expect = 4.0e-175 Identity = 351/504 (69.64%), Postives = 359/504 (71.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. NCBI nr
Match: XP_023550462.1 (protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 617.5 bits (1591), Expect = 1.1e-172 Identity = 346/504 (68.65%), Postives = 357/504 (70.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. NCBI nr
Match: KAG7016680.1 (Protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 615.5 bits (1586), Expect = 4.2e-172 Identity = 344/504 (68.25%), Postives = 356/504 (70.63%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. NCBI nr
Match: XP_022992937.1 (protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 614.4 bits (1583), Expect = 9.2e-172 Identity = 344/504 (68.25%), Postives = 356/504 (70.63%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. NCBI nr
Match: KAG6579164.1 (Protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 614.4 bits (1583), Expect = 9.2e-172 Identity = 344/504 (68.25%), Postives = 355/504 (70.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. TAIR 10
Match: AT1G75010.1 (GTP binding ) HSP 1 Score: 209.1 bits (531), Expect = 8.3e-54 Identity = 142/422 (33.65%), Postives = 195/422 (46.21%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G007370 vs. TAIR 10
Match: AT5G55280.1 (homolog of bacterial cytokinesis Z-ring protein FTSZ 1-1 ) HSP 1 Score: 43.5 bits (101), Expect = 6.1e-04 Identity = 30/103 (29.13%), Postives = 50/103 (48.54%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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