Lsi09G002590 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGGTAGAAAGAATTTTCGGCTCAAGAGATTAGGTATGTTTGCCATAAATTCATAGTCATCCGTTATATCAAGTTCGAGTTTTTCTGTTAGATTATACTGCTTTCACCATCCGGTGTTTGTTAATTTGTTTGGGAATATTTTTGAAGTTCTGTTCGATTTTCGTCTCTCATTGTTGTTCACGATGGTTGGTCCACATTGTAGAATGCATTGGTCCTATCCACGTTGTAGAATGCTTTGGTCCTAGATTACAAAAGAAATCTTGTCTGTTACTACTTGATTTCAAAAACCCAGAAACAATTAGATATTTTATCAATGTTCCTTTATAAGAGTCCTATGATTAAAACAATTATATCATTACAACCATGTAATAGAGAATCATTTTTTTTAATCGATGGGAGTTCTTTATATTGAATCATTCTGCTTTTCGGCAACTGGAGTTTTTGAGAATGATCTTTCTGGAACTAAACTTGCTCTTGCTAACATTCCTTTAAGCCATAACCATGAACTATATGAGAGATATACTAGTTCTTGGATCAATTTCTGAGACTCATTTGAGCCCAAGGCAAAATGATAGCAATCAATTTATTGAAATTGAAGGCACTTTAACAATTTCTTTATCTGACTGAATGACTCTTCTGACTCTTATGTATAGATCGACGCATAAATATATATATATATTTTTTCTGATAACGATGGTGTTCTGCCTTTGTGTAGTCTGAGTTCACATGCAAGCGGTCTGGTTTGTGTGAAGTTTCTGTCGAGCAGTTAGGGGGCCATGACATATGACAACATAATCCACAGAGGTAAGCCACTGTTTTCACTAAACTTTATCTTTTTTATCATAGAAAAAATGTTAAGATACACTCGAAGATAGGAACTTCAGAAGAGAGTGGAAGTAAAAAGTAATAAAATGAAGCATCAAAAAATAAATCCAGTGAATAAAACAAAATGATCCAGTGGTAAAAAAAGGTTACAAAGGATATAAGAAGACATTCCAATTGAGACAAATATCTTGTATTGAAAATCCAACAAATGACTTTGAGAAACAATGCGAAGTTTAGATGAGTTGATTCAAATCAATCAAACCAAGGAAGTTGGCTTGCTGTGGAAGATTCTTTGATTTTTTCCATCTGTAATTTTGGTAAAATAGCATTCACTGGATTAATTCATAGTAAATTGGCCTTAGAATTCGAAGATTGTTCAATAAGTAATTGAGAAATTTTGTACCTGAGAGCATTGTAGAATACCCACTGAATATTGAAAATTGGGAACAACTTTTCCAATCTTCTACCGTTCTCTAGCTTCTTATAAATCTCAAAGATGAAATACAGTGCTTCCAATCTTCTAGCTCATCCAACAATCCTATTTGAATAAAACAAGTTTTTGCCACACTCGAAATTTCTGTGTCTTTTTTTTAATAGAACTTGAATTAGAGATTTACTATTTTGTCAACGCCAAAGGAGTTTGAGAGCTCTCGCCTCCTCTTAATGCTCACCTGATCTACAATTCAGCAAAAGTAAAAAAGATACCCTCTCTTCACTACAAGGGGCCTTAATATTACCCATCTAACACACTTCCACAAACAATCAAAACTAACTGGATAATATGAGCCTACCAAACTTGGATCTCGAAAATACTCCTTCAAATTATTCTATTCATACCTGTTGCTTTTGGGTATGAAAAAGTTGACAAGCTTAACACAATTTAATTCCTAAGATAAACAAGCTAGAGCTAGTTCTATTTACTTGTCAAACTTTAACCAAAACTTGTTGATGTTATGGTTTCAAATTATCCATATCTCCATTGGTTTGACGTTATTGTTTGCATTTCCTTTGCTGATGAAGAAGATTTTGATTAGTAACTATGTTGTGAAAATCTCAGATGGAAATGGAGATAAATAAAGTTGGGGTCATCTGGCAAGTAAAACCATCACCCAGTTGCTAACACTCCATCGCGTAAGAAATTTTCTGTTGACATCATGAACCACCATGTGGCCTAGTGTGCTCCTTATAAGGTTAGTTATCATGTTTTATGTTTATCATATCTTATTTTATTTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTATGTTCTTTGTGCCAATGATATAGCTCTTGTTTTGAGAGTAAAGGATTAAATTGCAATAACTAATCGCAATGAATGTGGAACTTGAGAGAAGTTCACGAAGGAATGGAATTATATTTATTGATTTATGAAATGTTTTAGGCAGTTAGGAATAATCTTTTTGATTTCATTTGAAAAGCCTAGCTTTTAGTTGAGATCAAATGAAAGAATACAAGGTAAACATAATAAAAAACCACCACAAGAGGAGCCCAATTGACCTAAAATCGGGCTCCAATTAAGCAACATATGACCTTAAGGGGAATTAAAAAAACTTTATGCACCTTACCATACAGAGGTGTGATATCTAACAATTATTGCCATATAGAAGATAAAACTAGAGATTATGTACTTAGAAAGGTAAAAGATATATGGAGTGTGCGGGAATGGAAGATTTACTTCAACACACATCAAATAAAAAACTGAAGTAATCTGTGTGAGAATTCTTTTGGAACTAAATGACATTAAGGAGTTTGAAAATTTTCTTGGTTCGTGTTGAAAGGTAAGACATCCAATCGATTTATTGTAGTTGTGCTTCTTTCATGGACATGAGGTTTGTTACAATTAGAGATTTGTTGGTATAAAGTTTTGAGGTGTACAAGTTTTCTTTTATAATTAGAGTAACTCACAAGTCTAAAAGGACTAATTGGAGAAGGGATCACGACGAGAGGTTTGAGAGAATTTTAAGCAAAGGAAGCACTAGAATAGAAGGTCTTTGGGTAAATTGGTGGTAGGAAATGTCGGATTGTATTGATCTATAATAGAAGGTCTTGAATTAGGATACAAGAATTTTGGATTAAAGCGTGAGATTGGACCTTAAGTTTTTGATTGAAGACTCTTGCCATTCTTTGGATAAATGATTAGCAATGTGGATTGAGTGTTAAGATAAGGCATGAAGTGATTTGCCATGGACAAGGGTATGGGATAAGATTATATCTCGTAATTAAAATTGGAAAAAAGCAAATGGTGGACTATTGGATGAAATGCACATCAACAGAAAACAACACAATATTCTTGGAAAATATTAGTTTGGAGTAAAAGCTGTAAAGGACTTTCGTATGTATTAGATTTTTGTGGAAAGTTTAGACATCCATTGGGTTCTTGGTAATATAGGCGAAAGAAATGTAGAACTGTATTGGCCGTAAACAAGGCAATGGTGAATATCTTGGTTTTGTTGAGTTTTATAGTTATGCAAGCATGGTGGAAGGAACATGAGTTTGGAAACGAAAATTTTGGATTAAAGCGAGAGATTGGAGCTCAACTTTTTTATTGAAGAACTCTTGCTTCTTTGGATAAAAGCTTAGCAATGTGGATTAAGTGCTAAGGCATGGAATGATTTGCCATGGACAAGGGATATGGGAAGAAAAAACTATACCCTGTAATGAAAATTTAAAAAAGGCAGATGGTGGACTATTGAATGGAATACACATCAACAGAAAATATCACAATATTCTTGGAAAAGAATAGTTTTGAGTAAAATGGCGTAAAGGACTTTGAATACGTATGTATTAGGTTTGTGGGAAAAGTTTAGACATCCATTGCGTTTTTGGTAATATAGGCGAAAGAAATGTAGAACTGTATTGGACGTATACAAGACAATGGTGAATATCTTGGTTTTGTTGAGTTTTATGGTTATGCAAGCATGGTGGAAGAAACATAAGTTTGGACACGAGAATTTTGGATTAAAGCGTATGATTGGAGCTTAAGTTTTTTTATTGAAGAAGTCTTGCCAGTCTTTAGATAAAGGAATTGCAATGTGGATCAAGTTTTCGGATAAGGAATGAAGTGATTTGTCATGGACATGGATATGAAAATATAAGATTATAGTTTGTAATTAAAATTGGAAAAAAGGGACATTGTGGGCTATTTAATTCAATCCACATCGACATAAAAGATCACAATATTCTTGGAAAAGATTAGTTTGAAGTAAAGTGGAGTAAGGACTTGAACATGTATGTATTCAGTTTGTGAGGAAAGTTTAGACATTCATAAGCCTTTTGGTAATATTGGCGAAAAAATGTCGAACTATATTGAACGTAAACAAGATATTGCACAATCTCTTATGCTTATGTACGTAACGAGGGAGGAAGATAAGTTTGGATACGAGAATTTTGGATTAAAGCGTAAGATTGGACCTTAAGTTTTTTATTGAAGAACTCTTGTCATTCTTTGGATAAAGGATTAACAATATGGATTAAGTGTTGAGATAAGGCATGAATTTATTTGCCAAGGAAAAGGAAATGTGAAGATAAGATCATATCTTGTAAATAAAATTGGAAAAAGGCAAATGGTGGACTATTGAATGGAATTCACATCAACAGAAAGTATCACAATATTCTTGGAAAAGATTAGTTTGGAGTAAAATGGCGTAAAGGACTTTGAATGGGCATGTATTAGGTTTGTGTGAAAAGTTTAGACATCCATTGGGTTTTTGCTAACATAGGCGAAAGAAATGTTGAACTTTATTGGACGTATAGAAGGCAATGGTAAATATCTTGGTTTGGTAGAGTTTTATGGTTGAGGGAAGGAACATAATTTTGGATAAAAGAAATTTGGATTAAAGCCTGAGATTGGAGCTCAAGTTGTTTATTGAAGAAGTCTTAGAAGTATTTGGATAAAGGATTAGCAATGTGGATTAAGTTTTAAGATAAGACATGAAGTGATTTGTCATGAACATGGATATGGGAAGAAAAGATTAATGTATGTAATTAAAATTGGAAAAAGGGACATGGTGGGCTATTCAAATCAATACACATCGACAAAAAAATCACAATATTCTTGGAAAAGATTAGTTTGGGATAAAGTGGAGTAAAGGACTTGAATATATGTATTCGGTTTGTGAGGAAAATTAAGACATTCATTCAGCTTTTGGTAAT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BLAST of Lsi09G002590 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Lsi09G002590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LFH0 (ABC transporter G family member 37 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCG37 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 3.4e-48 Identity = 128/242 (52.89%), Postives = 151/242 (62.40%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZUT8 (ABC transporter G family member 33 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCG33 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 183.7 bits (465), Expect = 3.5e-45 Identity = 131/282 (46.45%), Postives = 158/282 (56.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XIE2 (ABC transporter G family member 36 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCG36 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 1.8e-41 Identity = 122/294 (41.50%), Postives = 165/294 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9GDE5 (ABC transporter G family member 50 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ABCG50 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 169.5 bits (428), Expect = 6.9e-41 Identity = 112/245 (45.71%), Postives = 147/245 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UFY6 (Pleiotropic drug resistance protein 3-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold352G006020 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 8.4e-58 Identity = 152/242 (62.81%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B6X0 (pleiotropic drug resistance protein 3-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486825 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 8.4e-58 Identity = 152/242 (62.81%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B7C4 (pleiotropic drug resistance protein 3-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486825 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 8.4e-58 Identity = 152/242 (62.81%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LBH1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G814320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 229.2 bits (583), Expect = 2.7e-56 Identity = 149/242 (61.57%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F4L0 (pleiotropic drug resistance protein 3-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442302 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 218.0 bits (554), Expect = 6.2e-53 Identity = 142/242 (58.68%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. NCBI nr
Match: XP_008443151.1 (PREDICTED: pleiotropic drug resistance protein 3-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 1.7e-57 Identity = 152/242 (62.81%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. NCBI nr
Match: XP_008443150.1 (PREDICTED: pleiotropic drug resistance protein 3-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 1.7e-57 Identity = 152/242 (62.81%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. NCBI nr
Match: KAA0053948.1 (pleiotropic drug resistance protein 3-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK25456.1 pleiotropic drug resistance protein 3-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 1.7e-57 Identity = 152/242 (62.81%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. NCBI nr
Match: XP_011652141.2 (pleiotropic drug resistance protein 3 [Cucumis sativus] >KGN59512.2 hypothetical protein Csa_002232 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 229.2 bits (583), Expect = 5.6e-56 Identity = 149/242 (61.57%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. NCBI nr
Match: XP_038903615.1 (pleiotropic drug resistance protein 3-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 222.6 bits (566), Expect = 5.2e-54 Identity = 145/242 (59.92%), Postives = 162/242 (66.94%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. TAIR 10
Match: AT3G53480.1 (pleiotropic drug resistance 9 ) HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 2.4e-49 Identity = 128/242 (52.89%), Postives = 151/242 (62.40%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. TAIR 10
Match: AT2G37280.1 (pleiotropic drug resistance 5 ) HSP 1 Score: 183.7 bits (465), Expect = 2.5e-46 Identity = 131/282 (46.45%), Postives = 158/282 (56.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. TAIR 10
Match: AT4G15230.1 (pleiotropic drug resistance 2 ) HSP 1 Score: 172.9 bits (437), Expect = 4.4e-43 Identity = 119/241 (49.38%), Postives = 148/241 (61.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. TAIR 10
Match: AT1G59870.1 (ABC-2 and Plant PDR ABC-type transporter family protein ) HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 1.3e-42 Identity = 122/294 (41.50%), Postives = 165/294 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi09G002590 vs. TAIR 10
Match: AT4G15236.1 (ABC-2 and Plant PDR ABC-type transporter family protein ) HSP 1 Score: 168.7 bits (426), Expect = 8.3e-42 Identity = 113/232 (48.71%), Postives = 145/232 (62.50%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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