Lsi08G015080 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi08G015080
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr08: 23179417 .. 23188961 (+)
RNA-Seq ExpressionLsi08G015080
SyntenyLsi08G015080
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGTTTGATTGTTATTCCAGGAAAACAGGGGATTTGGAGGTCGAATGTTTTGAAATGCTGACTTGATTGCAATCAGAGCTTGTTTATCCGTGTCAAGATTCAGAGTGGCTGACACAACAGTTGGAAATGAAGAATATTTCAAAGCTATAATGACAGTGAAAATGGCAAATTGGAAGTGGGTTGAGTGAGAAGCCATGTCTGGATGGTTGGACTTGAATGGCGGAGGAGAATGAATGAATTTATAGTATAGAGATTGCCATGAATGGGGGCCCAGCTTCTTGAAAAAGATGATTCAGTGGAGAAGGCTGCATTTGACGGTCAGAGTGCTCAGCATGATAGTTGAACATGACAACTTTCAGTGTGAATTTTATGCCCAAGACCAAGTCGTTTCTTTAACTTATGGTGATTATTAAGAAGTGTGCAATTACTTTCAACCGTTATTATCACAATATGACTATTGAAGTTTAGTCCAAAGTCCAACCATTTTACGTGACAAATTAAAATTCGTTTGGAATGACTTATCAACTGATTTAAAAAAAGTTAATGTAAACTTAACTTAGTGGTAATTTTCATGTATCTTTTCTCTTGAAGATATGCATCCGACTACCCTATTTCTTTCTTTGAACCAGGAATGAAGCAGTGTCCGAGTTGGCCATCCCTGTGCACGTGCCCGTGGGGGGAGGGTGGTTTCAGGTATATGCTTCATTTTACCTCTTCTTTCTTCTCATTTCGTACCTTCTGATTCTCTGATCTTTCTACGATGAAATTTATCTCTTTTGGGGGTAGGAATAGGAATCCTTCTGAATAACCTTGTAAACCTCATTGTTGTTGATATTGTTTTCACCCACTGTAATACTATAATGTCAAGGATTAAGAAGAGAATTTGCCTTGTTTCGAGTTTTCAAGCCCACAAATCTGGTCTACTACTGGGCTGCGAAGTTGATCTTAATAAGGACATTATTGCCCATTCCCTGATTTCCCCATCTTTTAGATTTCTACCAAAATCCACAAGTCCAAGAGTTGTTATGTGCATCCAATAATCCTACTACTGATGCATTCTTTGTGCCTGATAAATTAATGAATTTGAACAACTTAGCAATGTCTATCTCCTTATGGGATGAAAACAAAATAGATCTGCAAATTGTTAGCTCTCCTCACAGTGAACAAGCCCTTTTTAATTTTCACATATATAAAAAACTTATACAATATTCTAAATCATGAACAAACGAGTTTAAATTGTGTTAGTATGCTTATGGTAAAAGTCAACACGCTATTGTGTTTCCTTTACAAGTAATGCCGATAGGAACAAAAAGTACTTTTATTTTCCTCTATCTTTTCACTGGAGTGAAGAAAGTAATACATTATTAAGTTATTAATCACGCAACTCTTCTTGACTGCCTGTAACTCCTTTCTTTGGAGAACAAATAAGGTTGTCTCTGGCATTTTTAAGCTTTGAAACAACATCTTTGATGTCAATACGGTTTGCTGGAGAATTCACAGTACATGACAGTGCAACTTCAATTGTTTTGATCAAACAGTCCTTCTGCTTACCTAAAGTTATGATTTGATTTTCATTCTTCAAATCCACACACAGTTTCAACAACTTGAAATCTATCACTTCCATCACATCTTTCGGGAAACACGACTCTACCCACTTCACTAAATTCAATTCTCCTGTGAAGTATTCATCTGTTGGATTCTTCCCCGTAAAGAGTTCCAACAATGTTATTCCAAAACTGTACACATCTCCTGCTTTTGTTGGCTTTACTCCGTAACCATACTCTGCAATATCAAGATTCTCGATAGTTATAAAGCACTCAAAATTGGTTGACTAAGCATTGAGTTTATTCATATTACGACATGTGATTATTAACAAAGTATTTGATTAATTAACAAACCTGGAGGAAGGTAACCAATGGAACCTTTTAGGACATGTGTGGAAGTGATTGAATTTTGTGTCCTTGCACTTTCTGTAAGTAAGCTAGCCAATCCGAAATCTCCTACTTTTGCAGTCATGTCTGCATCTAGAAGAATGTTGCTGGGCTTCAAATCACAATGAATTATGGGAAACTCACAATCGTGGTGTAAGTAATTTATTGCTGAAGCGATGTCGATGGCAATGTTCACTCGTGCAAGGATATCGAGGCCGCTTCCACTTTCATGGCTTCTTTGGCCTTGAATCCAGTCTTCCAAGCTTCCGTTGCTTAAAAGTTCGTAAATCAAAGCTCGAAATTCCATGTTTGAGAAGTCTATGCTGGAGCATGATGTGATAAGTTTAACCAGATTTCGATGTCTCACATTCCGCAAGGCTTCACACTCTGCCAAAAAGCTCCTTATAGAACCAGTCTTGTTGATGTCAAGAACCTTGATAGCCACAGGAATTCCTTGCTTTAAACTTCCCATGTACACTGAACCAAAGCTTCCTTTTCCAATCAATTTTTTCTCACTGAAATTTTCTGTTGTCAAACGCAGCTCATCATAAGTGACCATTTCATGTTGCCTCTTCAGCAACTCAATCGATGGTGCAACCTTTGATTTGTTCCTCTTAAAATAGATCACCATACCAATGATAAAGCAGAGTGCTAGTGTTGAAAATACAACGGCGAAGACAATAATTTTGATTACTTTGGCATGTTTATATCCACTTTTTGGACATGAAGAATACAAGCAAAGCTTTGGATTACCTTCCAAATAAACACTGCCTATGCTTTCAAACACTCCACCCATTGGGACTGCTCCCTCCAGGTCATTAAAAGAGAGATTTAAATATTGAAGGCCTGCTATGTCTTGAAGCTCATAAGGAATGGGGCCTGAAAGATGGTTCGAAGAGAGATCGAGACGTTGGAGGCCTTTAAGATCTTTTAAAGTTTTCGGGATTGGACCCAAGAATTCATTCCTGGCCATTATCAGTTTCTCTAAGCTTTTGCAACCACTGATTGAAGGAACAATATTACCGGAGATATGATTATTAGAGATATCGATGGCAACAACATCTTTTAGTAACCCAATTTCTTTCGGCAGAGACCCACTAAAAAGATTATTGGATAGATTTAAAACCTTGCTCAAATGAGGCAAACTGAGAGCCTCTCTCGGTATACTTCCTTCCAATTTATTGCTGGACAAGTCCAGCGAGAATACATTCACAAAGTTCTCAAATGATGTGGGTATTTTACCAATCAAATTGTTTCCTGACAAATCAATTTGAATCAACTTATGGAGATTTCCCAGGGTGCTTGGGATGTTACCAGAAAATTGATTCCTGGCCAGACCAAGCATTTCTAGCTTTTCCAACTTGCCAATTTGAGGTAGGATCTCCCCTGATAGCGAGTTTTCACTCAAATTTAGCAGAGACAAGCCACGCAAATTAGAAATTGAGGAGGATATATTACCATACATACGATTCCCTCCCATGTTCAATACAGAGAGATCCTTTGAAAGATTGCCAATAGTTTCTGGAATCAAACCCTCCAACTGATTATCATCAATTGCAAGGTACTTGAGATGCGAGTTGTTTGTCAAAGAAGTTATGAAACTAAGTCCATTATCACCCACGCTGACAATTTTATTTGACCCAATATTGTAATATGAAAGTTCACGGAGATTTTCCATACCTGGTGGCAGTGTTCCACTTAAGTGATTGTGAGCAAAGCGCAGGACTTGAATTTTCGTCAGGTTGTGGATTGAGTGAGGGATTGTTCCAGTAAATTGATTGAAGCAAAAGTGGAAGACTAAAAGATTGGAGAGATTGTCTCCAATGTCAGCTGGAAATGTTCCCCAAAGTCTGTTTGAAGCTAAGGCAAGGGTGACTAATGAAGATATGTTGAACACATTGGGTGGAACCTCACCAGAGAGATCATTGAGACGGAGCACAAGATGCTTGAGATTTTGAAGGTCACCCACCTGACTTGGAATGGATCCACTTAGAGAGTTGGTCCCTAAGTTCATGGTAATGAGCGAAGAAATATTTCCAAAGGTTGCAGGAATTGTGCCATAGAGTTGGTTTCGTCCCAAGTTCAAGACTTGGAGTTTGGTTAAATGTCCCAACTCTTCAGGAAGTTGGCCTGTGATCTTATTTGACGACAAGTCAAGAATCTCCAGGGCGGCCATTGCGCTGAAGTTTAAGGGAATCCCCCCTTGTAAGTTGTTGGAACTCATGTTTACAACTCTCAGGTGCAAAAGATGATGGATTTGTATAGGGATTGGTCCTGTGAATTGGTTGTTTTGAAGTTGAAGAGATTGAAGGAAGGAAAGATTCCCAATATGAGGATCTATGAAGCCTGACAGTTCCATGCCAGAAAGACGAAGTTCAACTACTCTTTTGCTGCCATATTTGCTGCAGATGACACCATTCCAGTTGCAAGGTGATGAACTTTGGTTCCATGAAGACAGAGAGCTGACAGTTGATGAGTCGAGTCGAGACTTGAATGAAAGCAATGCTATTTTGTCAGCGTGGATGCCTTGTATGGTAAACCCAACACTAAGAAATACACAGTTCAAGAGAGTTACAGCCTTAATGAACTGAATAATTTGACAAGGAGCTGCCATGTCTATGAGAAAATGAAAATTGTGAAAGAGGAAAGAGTTTAATGCATCTTGTTTATGATTCTAATTTCTATGCACGCCTAAAGACCTTTTAAGAAGATGACGAAAGGGTTTACTGAAGATTAGTCAAGTCAAAGGACCATCGTCCTCAAGTTTCAAATAGGTAAGTTGAAGTTTTGCAAATGTTTTTATTTTTTCCGTATTTTCTTTTCAGCACACCGTTTTTTCAGCCATTTATCTTGTAAGTTTATTCTATTTTCATCCAACTTTCAAAATGTCTATAGCTTTCAAGAGTCCCCAAGTCTGTTTAAAATAGCTATTTTGTTCATTACTTTAGATTTAATTTTAACAAATATACTCAATAGTGTGTACTACTATTATGTTAGTACAACTTAAAAGATTAACGTGGGAAAAAGTGGATTTAAGGTAGAAAAGTAATATAGAAGGGACCATAATATTTTTTTTTTTTATAAAAAAAATTAGTGGCTAAAATAGACATTTTGTAAGTTCATAGCCACAAATTGTACCAACATGAAAGTTTAAGGACTAAAATAGACATCATGAAAATTTAAAGGGCATCTGAGGCAAGGAGTAAAGTTGTTTAGTTCGAGGAGTTGTTAAATATGGAGAGTTGTTTTAGATGCTGATTTTGTAAATAATGATAAAATGAGGAAATTTTGTACCAAAATTTACGTTTGCTTTAAAGAACTATTTAGTTATGTAACTTGTAACTTGTAACTTTATTTATTTATTTATTTTGATAAGAACTTGATCTTGATCATATGAATAAATAATTTATAAATTTGGTCTAGTACATGGCATTTACTATACGAAAGCACGTTTATTGTTTACTAGATACAAGAGATTATAAATTTCTTTTCAAAGGTTAAAATTTCAAATGTCTCCAATCTTTGTTTGAATTGGAAAAAGAGAAAAAAAACAGACCTACCAAAGATGAATTGAATGATTTATAGACCAATTCCAACTTTGATTAAAGTGGGATTGTGTTTGTTATATGGTCAATATTGGTAAAGTCTCTACCAACCCTGACTGCTCATGGACCCAACTACTTAATTTGAACGTTGCACTATGCTCAAACTGATGTTTTATGTGTGCACAGTAGAAATGTGATTTTTTATGGCGGTTTTTTTTCACTCAATCTAATTTCAATCGGTGCTTAGGGAGTAGAATTGTACTGCTCATAATCTTGTTTGCGGAGGCTTTACAACACTTTCAGATTGCATTGTCTCTAGTGGGGTGGAGATTTGTACCTCTCACATTTTAGTTGAAGATATACGTCTTAACTAATCAACCTACCCTTGAGAGTTTGGCTTAAGTGGTAGAAAATCTATAGACAATCTTCCAAATAATGAATAAAAAAGTTCACATTTTATTTATATTAATCGAACATTAGCAAATACTTTATTTAAAATACCCACATTCATAAATACAACTTGCAGATGCGTATTGCACACACACTAGCAATGCAGAGATTAGACAAGCTTTTATTTTGCTTGACCTCTTTTATCTTTGCTGCAGTGATGAAACCATAACAGACCATTCAACTTTTATCAACTAAAACACACCACTTTTGTTTGGAGGACGAATAAGGTTGTCTTTGGCCCTTCTAAGCTTTGAAACCGCATCCTCCATGTCAATGCGGTTTACTGGAGTATTCACGGTGCATGAGAGTGCAACTCCAATTACTTTGATCAAACAATCTTTTTGCATATCTGAACCGATGGTTCGACCTCTGTATTCCAAATCCACAAAAAGCTCTGGCAACTTATGATCAATCACTTCCATTATGTCGTCTGGATAACATGATTCCACCCATTTTATCAAATTCAATTCTCCTGTGAAACATTCGTCTGTTGGACACTTTCCTGTAAAAAGCTCCAGCAATGTTACTCCAAAACTGTACACATCTCCAGCTGTTGTTGGCTTTACCCCAAAACCATACTCTACAATATCAAGATTAATCCTTGAAAGTTAGTTAATTAACTTAAACAGCCCTTCAAACGTGGTTGATAAAGTAAAGGAATTTTATTCATGACATGACATATGATGGACAAACCTGGAGGAAGATAACCAATAGAACCTGTTAGGACATGTGTGGAAGTGATGGAAGATTGAGTGTTTGCATTTTCCATTAGCAACCGAGCCAATCCAAAATCTCCTACTTTTGCAGTCATGTCTGCATCTAGAAGAATGTTGCTAGGCTTTAAATCGCAGTGAATTATAGGAAGTTCACAATCATGGTGCAAGTAATTTATTGCTGAAGCAACATCGATGGCAATGTTTACTCGCTCAAGGATATTGAGCCCAATTCCAGGTTCATGACTACTTTGGCCATGAATCCACTCATCCAAACTCCCATTGTTCAAAAGTTCATAAACCAAAGCTCGAAATTCCATGTTTGAGAAGTCTATGCTAGAGCATGATGCAATGAGTTTAACCAGATTTCGATGTCTCACATTCTTCAAAGCTTCACACTCAGCCTTAAAGCTCCTTAGAGAACCAGTCCTGTTAACGTTAAGAACCTTAATAGCCACAGGGATATCTTGCTTTAAATTTCCCTTGTACACAGACCCAAAGCTCCCTTTTCCAATCAAGTTTTTCTCGCTGAAATTCTCTGTTGCCAAACGCAGCTCATCATAAGACACCATTTCATGTTCACCTTCTAGCAACTCAGTGAATGGTGCAGTCTTTGACTTCATCCTCAAGAAATGGATCAGCGTACCAATGATAAAGCAGAGTGCCAGTGTTGAAAACACAGCCGATAAGATTATGACTTTGACTACTTTGCCATGTTTAGAATCACTCTTTGTACAAGAGGAATACAAGCAAAGCTTTGAGTTTCCTTGTAAACTGACATTAGCCCTGCTTTCAAAGATTCCCCCTTTAGGAACTTCTCCCTCAAGGTCATTAAAAGAGAGATTCAGATACTGAAGAGCTAATAGATATTGAAGATTATCAGGGATGGGACCAGTGAGAAGGTTTGAGGAGAGGTCAATAATTTGAATGGCTTTGAGTTCTCCTAGACTATTGGGAATGGGACCTGATAACTTATTTCTCGCCATAAACAGTTCCTTTATGCTCCTCCAACCTTTGATCGACGAAGGAATCTCTCCAGATAAGAGATTGCTGGAGAGATCAATCTGAAAGAGATTTGCAAGGTATCCAATTTCCTCAGGGAGAGGACCAGTAAGGAGATTGTTGGACATGTTCAATCTAGTACTGGCAGGGAGATTGAGGGCTTCTTTGGGTATGCTTCCATTTAGCTTATTGTTGGATAAATCCATGGAAAGAAGCTTCTGGAAGTTGTTGAAAGAGGTGGGAATGCCACCAATTAACTCATTTCCAGATAAATCAAGATTGGTCAACTTTTGAAGATTTCCCAAGGAGCTTGGAATCCAACCCGAGAACTGATTTTTGGCCAAAACAAGGCTTCGGAGGTTCTCCAATTGGCCAATCTCAGATGGGATTTCGCCTGATAATGAATTGTAGCTCAAATTCAGCAAAGCCAAGCCATCTAAACGGTTAAAACTGTGATGTGGAATTGGTCCTGTTAAGAGGTTGTTTTGAAGCTGAAGGGAATGAAGGAAAGTGAGGTTGCCAATATGAGGGTCTAAGGAGCCTGAAAGTTGCAAACTTGAAAGATCAAGACCAACAACTCTGTTGCCATCTTTGTCGCAACTGACACGAGTCCAGTTGCAAGGGGAAGAGTTTGAATTATCCCAAGAAGACAGAGGATTTGAAGGCTTGAGATTGGTAAATCCAGACTTGATTGAAATCAGGGCCTGTTTGTCTGTTTCAATGCTCAAACTGGCTGATTCAACCAAGGGAAATGAGGCTGTGAAAGCTAAAATTGCAACAAATATGGCAAGCTCAACAACAAGGGTTTGAGCTCCCATGCCTCTAACCTCTAGCTGAACTATTGGTTGTGTTGTGAATTTGAACAACAAGGATTAATGAAGCCCACTATTTATATTTATACCACAATCTCCTGCATAAAAAACTATTGAATACTTCCAATTCTTTTTCATTTTTGTATGTGTCATCTCAACAAGTTAATGTGTCAGTGTCAATCCACTGCCAGTCAATTAACCTAGCTCCTAGAATAATAATGAAAAAACATAGAGAAAAATAATAAACAAAGAGTGTTAGAAATTGAGTATAGGTATAGAAAATACAATGACGGTCAAACATATTCCAGCTATGAAAAAGAAAGCCATTGCAATGAGAGTTCAGGTCAATGTCATGGACAAAGTCAAAGGTTTGAGGTTTGAAACACAAAGGCATTATCAGCAGCGTTTATACTTTATAGAGAAGATGAACATTTATTCCATTAATAAGATACTAAACAAAGAATACTTTCTTGTGGGCCTGATTACTATTCAATAATCTCATATCTAAGCCAGAATTATCTTCTCGAACATTACAAAATGATGTGCCTCTGGTCAAATTGTCTGTCCTAATCTCTATATTATGAGATATTATGTTTTTTTCGTACAACAAAGAGATATAAAGATTTAAATGAACAAATCATGTGAGAAATTGATCGTGCTATTAGACTTTAAATGAACAAGTTTTAAATCTTTTACGATTTTATCGTGTCATACTTTGTATATTTATCATTAATCATAATTATATTTGTATGCAAGCAATAACAGATCATTATGAGTAATTGATGGGATATATAAAAGTAATAAATAAGAATGTAGTACATAATTTAACTCAATTGTCTATCCATTTATTTTTTATCTGTGCAATTGACTTGCCACTTGCCAGGTCATATTTGATATTACATAATCCTAGTTTTTAAGGAGTTAAAAATAAACATAACTGAAGGTTTAGGAATGTTATTAAAACTCTTTAAAATTCAAACTCCCAATAAATACAATGTTGAAAGTATAAAAGACCAAATATGCCCTTTGAATTTTGACCTAAGTTTTTATTTTAGTTTATTAAAGCCTACTGGAAGATTAATTGCGTGA

mRNA sequence

ATGAAGAATGAAGCAGTGTCCGAGTTGGCCATCCCTGTGCACGTGCCCGTGGGGGGAGGGTGGTTTCAGATGACACCATTCCAGTTGCAAGGTGATGAACTTTGGTTCCATGAAGACAGAGAGCTGACAGTTGATGAGTCGAGTCGAGACTTGAATGAAAGCAATGCTATTTTGTCAGCGTGGATGCCTTGTATGCCTACTGGAAGATTAATTGCGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGAATGAAGCAGTGTCCGAGTTGGCCATCCCTGTGCACGTGCCCGTGGGGGGAGGGTGGTTTCAGATGACACCATTCCAGTTGCAAGGTGATGAACTTTGGTTCCATGAAGACAGAGAGCTGACAGTTGATGAGTCGAGTCGAGACTTGAATGAAAGCAATGCTATTTTGTCAGCGTGGATGCCTTGTATGCCTACTGGAAGATTAATTGCGTGA

Protein sequence

MKNEAVSELAIPVHVPVGGGWFQMTPFQLQGDELWFHEDRELTVDESSRDLNESNAILSAWMPCMPTGRLIA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi08G015080.1Lsi08G015080.1mRNA