Lsi08G004900 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi08G004900
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr08: 12795184 .. 12799532 (+)
RNA-Seq ExpressionLsi08G004900
SyntenyLsi08G004900
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACAGTAACATCCTTCCATTCTCCAATATTTCTAGTAAGGCTTAACATTTTTATTATGAAATTTTGGTTTTCTTGCTTATTTCCATTTCAACATTTTTTCAACTTAATCCTTTTGCAATTTTTTCAGCTTACAATAGTATGTTTTTTTTTATCGGACATTTGTGATAAGAAAATGCGAGAAAAATTTGATCAACAAATTTTTTAACATCTTGAAAATTTTCTCGCACCTTCTCACTGTGAGTTCTGAGGAAATTATTTTTATCAACTAATTTTTTAAACTTTTAACATTTTTCTCACACCTTCTCATTGCGAGAAAAATTTAATCAACTAATTTTGTAAGCTTTTGAAAATTTTCTCGTATCTTATCATTGCGGAAAATTTTTTATGAACAATTTCTTTAAGCTTTTGATACTTTTCTCGCATCCTCTCGCCCCGAGAAATTTTTTATAAACCAATATTTTTCTCGCACTTTCTTGTTGCAAGAAAAATAAGTTTATCAATTTGTAAGCATTTAAAATTTTTCTCACAGCTCCTCGTTGTGAGAAAAATTTTATGAACAAATTATGTAAGCTTTTAAAAAATTTCGTGAGAAAATTTTATCAACCAATTTTTTGAGCTTTTGATTTGCTTTTTTTCACACATTCTCGTACTAGAATATGCGAGAAGAATTCTATCGACCAGTTCAATAAGTTTTTAGATTTTTTTCTCACATATCTTCTTGTCGAGAGAAAAAAGTCTCTCTTTAATTTTCAATGTTTGCGAGCAAATATGAGATAAAATCTATCATTCAATTTTTTAGTTTTTGAATTTTTTTTCTTGTATCCTTGTTGCAAGAAAAATTATAACACTTTGATAATGAAGGTTAATTCTAATGAAATATTTCTTTTTCTTTTCTTTATAATGACGAGTTGAATGACAAAGTTTAGGGTAATATGTAAATTTTCTCGCACTTCTTCGTTGTAAGAAAAATCTCAGCGCCTCTTTTCTTGCTGCTTCTCACAACGAGAAAATGCGAGAAAAGATTCAACTCTCTTTTCTCGTGTAACCGAGAAAAAATCTAGCACCTCTTTTTGAAAATTTATCGTACTTTCTCGCTATGAGAAGATGCGATGAAATTTTAAGCACATCTTTCTTTTCTCGCACTTTCTTGCTTACAGAAAAAATTCCAACACTTCAAAACTTGAAATTTTCTTGCACTTTTCCATTGTCATAATCTACAAGAAATTTCGAGCTCCCCACTTTTCTTGCACTTTCTTGCTGTAAGCCATTGTTTAAGTTTAAAATTAATCTAAATAAGTCATTTGGATCAAAAGCCCTAAAATATGCATATAGTTGAATTTAATGTTGATGTTTAGGAATTTGAGCTTAATTATCATGGAAATTTTTCCTTTTACTATTGAATATCCTAGCATTTTGTTGTGTGTTGAAATAGTGATTGAGAGTGGAAAATTGGCTAAGTATTAAGTGAGTTAGAAGCAGAATTTATAAGAAAAAGGGGAAGGGTACCCGAGGATAAGTTGAGAAATTTTGGGTAATTTATTTTAGGTTAAATTAAAAAATAAACTAATTAAATATTTGTTATTAAATTACTTCAAGGAGAAGAAAAGAAGGAAAAATCAAGGGAGAGCCACATATTTGAGCTTGGAAGTAGTTGTGTGAATGAATACTATTGGAGAAAGAAAAGGCAGAATTTGGCTAAGAACAAGAAGTGTAATATCCTACGGGTAGGTTGACAGCCCGCCTGTTGTAGGGTCGGGTGGGTTGTCCCGTGAGATTAGTCGAGGTGCGCGTAAGCTGGCCCGGACACTCACGGATATAAAAAAAAAAGTAAAAGAAGGTTGGTTCTTCCAAACTACTCGTGCAAAATGTGGAATTTTTTAACTACTCGTGCAAAATGTGTAAAAGAAGGTTGGTTCTTCCAAACTACTCGTGCAAAATGTGGAATTTTTTAACAAGAGTGAAGAGGAACGAGTGAGGAGCTTAAACCTAAGGCTGCCATGACGATTTCTGATGGAAAAAACTAAGCAATTATTAGGTCTCCTCACTAACAGTAAAACAAAGATTAATTAGTTTTGAAAATTTTGAATTGTTCAATTTTTAATAAGAAAAAATGCATTAATTGTATTAGATACAATTAATATAATATATATATATACATTAAAATATAAAGTTAATTTTGAATAAGATTCAAAATTAAACTTTATAATTTGAGAGTATTAATGTTTGAATGAGATTCAAATATTAAACTAATATGAATGAGATTCATATAATAAGAAAATTAAATGATAATTGTATAAGATATAATTAACATAATGTATATTGATACATTATATTATAAGGTTAATTTTGAATTGGTTCAAAATTAAACTATATAATATGAGAGATTAATATATTTATATAAGATCAAATATTAATATGAATAGAATTCATATTAAAATTATAGGTTATGAGAGAGAAATATATTTGAATTTGATTCAAATGTAATATTAATTAAATATATGATATTTAATTAATTAATAAGAATTTAATTAAGTTAAATTATATGTGATTTAATTTAACATTAATTAAGGTTTAACTTCCCATCATTAAGGGAAGTTAATGATGGGTTAAAGGGAAGTTATACGTGATAACTTCTCTCATTGCCCTCAATGAGGAACACAAAAGAGTTCTGTGTTTTGGACATCTCTCACACTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCAACTCTCACATACAATTAAAAGAAAAAGTTTCTATGCAAGATATAGATTCTTCCTTTAGCTTTCTAAAATGGGTTCCCACGCAACCTAATCCTTGTTGGAGAATAGCAGGGAAGATTTCGTAGTGGTGTCCTTGTTCGAGGTTGTTCATGAGGACCGAGAAGTTGTTGAGATCGAAGTTACTGTGAAGAATTGGAAAAGATTGAAGAACTTCTAATTCAAAGGTAACCACTTCTCCTTGAAATTTCTTCTAAAATCATGCTTAATTAGGAATGTATGTTTATCCTGTTTTCAACATTTCTCTGTTTTCACGATTTCCAAAATGAATTTTGAAAGCACAAGCGTTCATGCACTTCTGCTGAGGAATTCGATTCCTTCACATTGGACTATTCACAACTAGCATAACTGACACCATGCTTCAGTGAGAAAATTCTAGAATAAGGGAAATTGTTTTTATTTTTTAATTTTGTGAAAATAAAGAAGGGGAAAAAAATGAAAAATTCAAGGGAAAAGGGAGGAAGAAATGGAAATGGAGGGAAAACAAAGTTGCCGACAGCCAACGGTCATAGGTAACCTATCGACAGTAATTCCTGACTATCTTAGGTAGTCATGCATCGATCGTTGACGGTCACGACAGTCGGTCGCCAACGATCACTACAGTTGGTCGCCAACGATCATTACGATTAGTCGTCGACAGTCAGTTGGTTGGTCACCAACGGTCACAACAGTCGGCCGTTGAGGACATGGTGTTTGGTCGTTAACTGTCACTAGAGTCAATTTTTAACAGCCACAACGGTCAATCAGCAACAATCAAGACATTCGATCATTCACGGTCAATCACTAACGGTCAAGATGATTGATCGATCACAAAAGTTGGTCGATGGTCATCGACGACTATTAATAAAAGTTATGAGATGAAGGAAGTTTTTTTTTTTTTTCAAACTCATGACATTCAATAAAATACATATTCCAAAGGACTATTTTCAAATATAGAAAAATGAGTCAAACTATTTACAAATATAGAAAAATTTTACAGTTGATCAATGATAGACCGCGATCGAATTTTATCGCTTTCTATTGCTCAAGCGATAGAATTTATTTGCTTGAGCGATAGAACGCAATATAATTCTATCGCAGTCTATCACTGATAGACAGTAAATTTTTTCTATATTTATAAATAGTTTGATATTTTTTTTGTTTATAGTAATTTTCCTATTCCAAATTTATGGAATTTTTTTTTATTCCTAGGAATTTTATTCCAATGGCCCAAATATGGGCTTGACTTCAAAAGTCAAACCCCTTTATCCTAAACCCATAGGCCAATCACTCCCTTAGGAGTTTTGTTAAAAATCTAAATAATGTCATTGCCTCTAATCTTCCCTCTTCATCGTGACGTTAGGTAGTTGCCAGCCATACTTTCTTCCTTTTTTCAATCGTCGACCATTTCTCCTCCGATGAAGTTCCAACAGTGAAGTTGTCCTTCTCCAATGAAGCTTCCGCAGCTGACGCCGACATCCCTTCATTGTTCATCCGCTCTTTCGGTGATAGGGCAACGATGGCCGGCGCTCTTTCTGGTGAATTTTCAGCGTCCTCCGATGTTGTGACAACAGGCAACGTCTTGTAA

mRNA sequence

ATGACAGTAACATCCTTCCATTCTCCAATATTTCTACTTACAATACTCCTCGTTGTTGACAGCCCGCCTGTTGTAGGGTCGGGTGGGTTGTCCCGTGAGATTAGTCGAGGTGCGCTTGCCAGCCATACTTTCTTCCTTTTTTCAATCGTCGACCATTTCTCCTCCGATGAAGTTCCAACAGTGAAGTTGTCCTTCTCCAATGAAGCTTCCGCAGCTGACGCCGACATCCCTTCATTGTTCATCCGCTCTTTCGGTGATAGGGCAACGATGGCCGGCGCTCTTTCTGGTGAATTTTCAGCGTCCTCCGATGTTGTGACAACAGGCAACGTCTTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGACAGTAACATCCTTCCATTCTCCAATATTTCTACTTACAATACTCCTCGTTGTTGACAGCCCGCCTGTTGTAGGGTCGGGTGGGTTGTCCCGTGAGATTAGTCGAGGTGCGCTTGCCAGCCATACTTTCTTCCTTTTTTCAATCGTCGACCATTTCTCCTCCGATGAAGTTCCAACAGTGAAGTTGTCCTTCTCCAATGAAGCTTCCGCAGCTGACGCCGACATCCCTTCATTGTTCATCCGCTCTTTCGGTGATAGGGCAACGATGGCCGGCGCTCTTTCTGGTGAATTTTCAGCGTCCTCCGATGTTGTGACAACAGGCAACGTCTTGTAA

Protein sequence

MTVTSFHSPIFLLTILLVVDSPPVVGSGGLSREISRGALASHTFFLFSIVDHFSSDEVPTVKLSFSNEASAADADIPSLFIRSFGDRATMAGALSGEFSASSDVVTTGNVL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi08G004900.1Lsi08G004900.1mRNA