Lsi08G003850 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGGGTATTAGTGACGATTACGTAAAAGACGTTGCAACTTGTGATATTCACGTTTAACATCGCATCATGCTTGTAACATTACTTAGATGCATCGCATATTGTGACGATTTTTACATATGTGGCAATTTGTGACTTTTTTCTTGTAAGTCACAATAGGCAACATTCACAATAAACGTACATTGAGTTCAATACAAAAGTTTCAATGTCCAATTAAATAACAAGAGACTGTTATATGAGTTGCAATAACATAACCTGTCTAACATGATTATAATATAAAAAATGTACACATAACACTATTCTAATCAAGCAATAATATATGTATACACACACATTTCCGAGGAGGAGGAGGGAAGATTTGAACAGGGTGTAGAGCAGTAAGGTAGGATGTGGAAGGGTGAATGTTTTCTTTTAACTAGGTGAGATATATTCTTTATTTTCTAAAATTTTTTTGCGACACACTTTATTGTATGAGTCTATAATTTATCATTAGGATCACTTAGATTCTTAAATTAATAGGAGATAAGAGATTTTTGAAATAAAAAAGAAAGATTGACCTCAAAATAGTCATAAATGATAAAGGACGGGAGAAGAGTCAATCAAAATGGAAGATTTGAACGTGGAGTGGAGGAGTAAGGTAGGATGTGGAAGAGTGAATGTTTTCTTTTAACCAGGTGAGATACATTCTTTATTGTCTAAACTTTTTTTATGACATACTTTATTGTATGAGTTTGTAATTTATCATTAGGATTGCAGTGATAAAAACCCTAGCACAGTGGAAAAATACATAGGACCAATTTCAATTTATAATTTAGAAATTGAAAAATTATGCAGTACGAAAAATACAGAATAAACCTATTGTATTATCAAATATAGAAAGAAAAAACAAATACCTTTCTATAAACTTGAACACCACCAATGAGAGACCTCCCTAAACTCTGAATAAATGAGGTAAAGGTTTGTGGAAACCTTCCTTGAAAATTTATTGGGAACAAAAACTTTTTGGGTAGAGAAAAAGGAGAGAGCATAGAACCTTTCTCGAAAGAAAAAAAAACCAACCATCTTCTTGTCTGAATCCCTTTTTAAAAGGTATCCAGAGAGGAATATGGAGAGGGAAAGGGAGAACATTGGATCAATCCCACGTTTTAGCTAACCCCCTTTCCCATAACCAATTTGGTTATTAATTTAATTTAATTAATTAATTAAAAAATAACTAATTAATAAAATTAATATTTAATTAATATATTCATTTAAATCATATTTAAATAAATTTCTCTCACATAACCTATAGTTTTAATGTGCATCTAATGCACATTAATTTTAACCTATAGTTTTAATATAAATCTAATTCATATTAAATTAATATTTGAACTATTTCAAATATTTAATTCTCTTATGAATTAATTTTGAATCATATCCAAAATTAAATTTATAAAGTTTGATTTATAAAATAAACTTTATATAAATCAAACTTTATATTATAATGTATTATAATGTATAATGATAAATTAATTTACCTTGGTATTGACCTATGCAAACACTTTTTGAAGGGAGGCCGCACCAAGGACGACACGAAGCCGAGCATGGATCTCACAGTGTGTATTTTTAGGGACGTAAGAGCTAAAAATTGATACATCATATATACCATTTTTCTTCCACTAAAATGTTCTACCAATTTTAAGGTTTTATTATACTTAGTTAAACTCCGGCTAATGAATATATCTAAGTCTATGCCTATTATAATTCTTATAAAAAGGTCTTTACATTAAAGTTCTAGGTGAATTAGACCATTTAATTAACCTAGTGACATTGCAGGCTAATATAGGATCTTAGGAAATTAATTTTAAATTGTTTAAAATTAATTTAGAACTAAGACCACATTAATTCTATTATGATTAGAATTAAGTATTACTTTCTTTTAAAATAGTTTTAATTTTGACTAAGTAGGACAAATAAAATTTATGTTATAAGGGAACTCTACCGGTGAAGTTCTGTCTAGGCTGGGGGTTCTTAAGTTGACGGTTTATTGGAACACCTCCTACCTGGGAACTGACCCAGAACCTGAGTTGAATTAACCTAAGTTAATAGGAGATAAAAGATTCTTAACTTAATAGGAGATAAGATATTTTTGGAATGAAAAAGAAAGATTGACCTCAAAATAGTCATAAATGATAAAAGGGTTGTGATATATTAAATCTTACAAATACAAAGCCAATCACAATGTGTTGGTTCCAACAAGTTCAAACCATTGGCTTTGGGTGTCTTGGAGGCAAGTTGGATCACCATTCGTGCAAATACAAGAGCTGGTCACAATTTTTGAAGAATTTGAACTTTCAATCTGCAGACAAAGACTCTTGCCATCTTCAGTTAAAGTTGCCAAATGCAGCTTAGAGCTTGAAATGGCACTCCAAACACTTTGTTTGCTAGAGCAGTCAGTTGAAAGAGATGCCTCAAGGCCTTCTCCACTAGCCTTCAAGCACAAACCAGTGTTTGACATTGTAATTGGAGTGCTATCATTGTCATGACTCCATCGAGTTGAGGTGGAGCAATTGGTGAGAAAAATTTCTTTGTTGTCATTAGAGACTTGGATACATTGGCCACTTTGTGGATGATATATAACATATGAGAATGATGCATTGGAATTTGGATCTGTGTACCATAAAAAAATGTTATCCAAATTGTTATTTAACAAGTTTTATAAAACCTAATCGAACTATTTAACATTTATTTTCACAAATCATATTAGTTTACTAGTTATAGATCCTTGAATAAATTCAAAATCATTAAGATAGTTACCTTGCAACATGGTCTGCAGTAATTGAAACTTCTTGACAAAGTTAGGGTTCTTAATTTGAGTCCAATTAGCTTCGAGCACTCCAAACGTTTCTGTAGACTCTGCTTGACCTTCTCTATAATAATAACTACCTTGCCATGTCCACAATGCCCAGTCCAAATCTTTTTGTGCAAGATGGGCTGTGAAGCAGCTCATGAATCGATTTTCTGCATCGTCAACCTCTCTTTGATCATACCCATATTCACTAACAAATAAAGGAAATGGGTTTGATCCTTCAATTACAAACTCAGCATGGTCTATAAAGCCATTCATAATATTTGCACAAATATTGTTCAATGGTTGTTGCACAAACTTGCTCTCAGAATCTCCACTAAAAGAATACAAGTGTACCTCAAAAACCAACTTATTGTCTAAGGTCTTTACAGTCAAAGGCTTCTCCTTTAAGCATCGGAGATCATTGTCATAATTTAAACCTGAAACAATGACTAAAACTGCCGAATTTATGTTATGGATTGTGGTTACTCCTTGAGTTATATAGTTGTTCCAATCATTTGCATTTTCCATCATTCCTCGTATCTCATTTCGTAAACTCATCCCTACCACCTAAAAATTCATAAAAAGACTTCCTTTGTTTAATGAAATATTAAAGAAGTTTTTAAATACTTGAGTTTAGTTTCAAGAAATTAAGAAAATCTTTTGATGTTACATACCGTAGATTTGTTGTTAAAGCGTTGAGCAACTAAGCTAAGACCTTGTAGCCATTCTTGAGGGTCAAAATAGCGGTTCCCAAAGAAGCCATTGCCATCGTCAAGAGAACAACACCATCTTGGCTGACTCATGTGATTGTCAGCAATCACCATCAGACCACTTGCCCCCAGCACATCAACAACAGCTTCATAAGCTTCTGGAATAGTCTTGTTCAACACAAAAGGATTATATTGAGCCAATCCAGCTTTTGCTTGTTTTAAATCAAGAAGATCGAAGTTTTCTTCAATCGTCCTATTTGCGTAGCGAGTGAACATGTGGGTTGCATATGTGAGTCGTACACAATTGAATCTTAACTTGATTGCTTCGTCTGCTAGATCTTTTAACGATCTATGGTTGAGACCTTCTGCAAGCATGCTCTGTGTGTGGGAGGGCCAATTCACACACACAAGTTTCACTCGACGTCCTGTTTGCGAATCAATGATCCATCTCCCTTGCGTTGATAAGGGTAAGGAATAAGCTGAAATAGATGAAAACACAAAGATTAGGGCTAGAAAGAGAATGACTTGAAAAATTTTTCCCATTTTCTTCTATATTTTTCTCAATTGATATCCTCTTTTGGATTGTGATGAGAGAAATATAGCCCAAGCATTGCTTATATACTTTGTTTAAGTACGTTCAAATTTGATCATAGTTTGTTAGTAATGGTAAAACTTGTATTTTTTTTCTATATTGAGAAGCTTAGTTAATATGTTTCTAAATTTGGTGATTTGTTGAAAATCAATAAATGTTGCTAACAAATTAGTGCTAGCTAAGTGATCATAAAACTTCCAGCCAACAAAATAAATATGTTGAGCCTGTCTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTCATGAGATAAAATTTTGGATCCTCTTTCATCTCTCAAATTAAATATCAAAATAGTGACTAGGTAGATGCTTATGAATAGCAAGGTTTTCAATTTCTAAATAATATTTCATGCTATGTTTCTGGTTTTGGCCGTACAAACAAATATTGCATATTGAAATTTAAACCACATTCTAATCTTTTTTTTTTCTCTCCCCATCTTATAATATTGATTGCTCAAGAAATTAATAACTAAAATTATTTGGAGAATAAATATATTATTTTATTAGCAGATTTTTTTTCGGAAAATTTTTAAAAATAGAAAAATTAGGTAAACTATTTACAAAAAATAGAAAAAAAATTTATATAGTTGTGATAAACGCTGATAGAAGTCTATGAGGGTCTATAAATGATAGAAATGATAGAAGTCTATCACTGATAGATGTTGATAGAAGTCTATCAATGTCTATCAGTGTTTTTTTTTTTTGCTATTTTCTGTAATAGTTTACATTTTTTCTTTTGGTAAAAAATTTCCTTTTTTTTATTTCTATTTTACCATATTGTGTTAAATTTAAGGTTAAATTACGAGTTTAGTCTCTAAACTTTCATGTTTAAGTAAAAAAAAATCTACA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ATGAAGGTCAGCGACTCCCCTTTTCTCTTTACTTACTATCTCCACGCCGACACGACGAAACAGATCCCGGCGGCGAACTCTGACTCGCGACAGACACCCGGCAAACAAGTAGATCCGGCGGCGGCGTTGATAGATCCTCGAACGACCAGCAGCGAACGGGAAGACCCACAGCGGCGCGGCCTCTTGATCTGCCATCTATTAATCGAGCTGGTCTTACTCTCGTATACAATGACAGATACAGGTGAAAATCAGCCGCCTGAACAAGTCTGTAGCTTCTTCAGAAAACCCACAAAGAACAAAAACATCAGAAAGCGGACGGTTGATGAAGACGAAGAGGATGACTCTAAAACTGAGACTTTGTTGCTGCAAAATCAGAAGAAAGCCCCCAAGACTGAAAGCAAGCTTTATTTTTCTTCTGGACCATCTAAAAGTTCCTTGTCTAATGAGTCGAATGTGGAACCTAATAAACCAATTTTCCAATTTGAGTCTTCAAAGGAAATTCAAGTTCACCATGATAGCAGAGCAACTGCAACTCTAGAAACAGAGACTGATTTCTCAAGAGATGCACGAGCCATCCGTGAGAGAGTTTTGAAGCAAGCTGAGGAGGCTTTGAAGGGTAAAGGCAAGAGTTCTGGTGGTGAGAAGTTGTATAAAGGTGTCAATGCGTATGTTGATTACAAGGCTGGCTTCAGACGGGAACATACAATTTCAAGTGAAAAAGCTGGTGGAGCACATGGGCCACTTAGAGCTTCTGCTCATATAAGAGCTTCAGCCAGATTTGATTATCAGCCTGATATTTGCAAGGATTACAAGGAGACTGGTTACTGTGGTTATGGAGATGCATGCAAGTTCATGCATGACCGAGGGGATTACAAGTCTGGGTGGCAGTTGGAAAAGGAATGGGAGGAAGTAGAGAAAGCAAGGAAGAGAAAATTAGCTATGAAATCTGATGATGGGGATGAGGATACTTCAGAACAGAGTGATGAAGATGAAGAAGATGCCTTGCCCTTCGCATGTTTTATTTGTCGCGAGCCTTTTGTGGATCCTGTTGTGACCAAGTGCAAGCATTACTTCTGTGAGCATTGTGCACTGAAGCACCATGCAAAGAATAAGAAATGCTTCGTTTGCAACCAGCCTACGCTTGGAATCTTCAATACGGCTCATGAGATACGCAAAAGGATGGCAGAGAGTAAATAAGTTTTTTCCCCTGATCTGCATTGGTCCCTTGCCACAATATTTCAATTTGTAGCAGGATTATCTCTCTTATTTTTTCTGAGGAATTCCAGTTTCCCATATCTACTACTTGAAGCTTAAAATCAAGACCCTGTCGTAGCACGAGCTTGGAGAAGCTTGGATACTATTTCTTGAAATATGCCATATGGGCAAGGTCAGTTTTAGAAGTAGTTTCGATAAAAAGAAAACGGCCGTTCTTTTTGTTAAAGTTCGTCTCTGAATTGGATGATATCTTCTGTAAATAGTCAGAAATCTTTCAAATCTACCTGCGTTCCTACAGCTAGAAATTGAAAACTACCACTCTGATTATATAACATTTGGTCGTTAGAAGTTCATGAGATAGATAGTATTCAAGGAAGATGGTCCGAAGGGTTTTTTAAGTAGGACTCTTTGTTGAACTCAGAAGTGTTTGTATTGTACTGTACCCCAGTCTTTGGACTGGATATTAGTTTTTCTGTATTTACCACTAATTTGCACTTTCCAGAGATCATACAAATATGAGATCAAAAGGAGCCTGCCAATGTAGAACTTTGTAAGAGCATATGTGTGGGTGTGTTGAAATTGTCTTTGTTACTTCATTTTGTTGTACCTTTGGTGATTGTCTCTGATATGCTCTTGTGCCCCATTTTTTGCAACCTTTAATCTATAATGCTTGGAACTTCATGTGTTTTTTTCCATTTGTAATTGGTCCTATTCTCATTGAAGGGCAGTTCATATCAACTCTAGGATTCTGATTTTCATTATCTCATTTCAGATATTCTCATTGAAGGTTATCTGTCAAAAATGTCAAGTACAGGAGAGATTGTTTCT ATGAAGGTCAGCGACTCCCCTTTTCTCTTTACTTACTATCTCCACGCCGACACGACGAAACAGATCCCGGCGGCGAACTCTGACTCGCGACAGACACCCGGCAAACAAGTAGATCCGGCGGCGGCGTTGATAGATCCTCGAACGACCAGCAGCGAACGGGAAGACCCACAGCGGCGCGGCCTCTTGATCTGCCATCTATTAATCGAGCTGGTCTTACTCTCGTATACAATGACAGATACAGGTGAAAATCAGCCGCCTGAACAAGTCTGTAGCTTCTTCAGAAAACCCACAAAGAACAAAAACATCAGAAAGCGGACGGTTGATGAAGACGAAGAGGATGACTCTAAAACTGAGACTTTGTTGCTGCAAAATCAGAAGAAAGCCCCCAAGACTGAAAGCAAGCTTTATTTTTCTTCTGGACCATCTAAAAGTTCCTTGTCTAATGAGTCGAATGTGGAACCTAATAAACCAATTTTCCAATTTGAGTCTTCAAAGGAAATTCAAGTTCACCATGATAGCAGAGCAACTGCAACTCTAGAAACAGAGACTGATTTCTCAAGAGATGCACGAGCCATCCGTGAGAGAGTTTTGAAGCAAGCTGAGGAGGCTTTGAAGGGTAAAGGCAAGAGTTCTGGTGGTGAGAAGTTGTATAAAGGTGTCAATGCGTATGTTGATTACAAGGCTGGCTTCAGACGGGAACATACAATTTCAAGTGAAAAAGCTGGTGGAGCACATGGGCCACTTAGAGCTTCTGCTCATATAAGAGCTTCAGCCAGATTTGATTATCAGCCTGATATTTGCAAGGATTACAAGGAGACTGGTTACTGTGGTTATGGAGATGCATGCAAGTTCATGCATGACCGAGGGGATTACAAGTCTGGGTGGCAGTTGGAAAAGGAATGGGAGGAAGTAGAGAAAGCAAGGAAGAGAAAATTAGCTATGAAATCTGATGATGGGGATGAGGATACTTCAGAACAGAGTGATGAAGATGAAGAAGATGCCTTGCCCTTCGCATGTTTTATTTGTCGCGAGCCTTTTGTGGATCCTGTTGTGACCAAGTGCAAGCATTACTTCTGTGAGCATTGTGCACTGAAGCACCATGCAAAGAATAAGAAATGCTTCGTTTGCAACCAGCCTACGCTTGGAATCTTCAATACGGCTCATGAGATACGCAAAAGGATGGCAGAGAGTAAATAA MKVSDSPFLFTYYLHADTTKQIPAANSDSRQTPGKQVDPAAALIDPRTTSSEREDPQRRGLLICHLLIELVLLSYTMTDTGENQPPEQVCSFFRKPTKNKNIRKRTVDEDEEDDSKTETLLLQNQKKAPKTESKLYFSSGPSKSSLSNESNVEPNKPIFQFESSKEIQVHHDSRATATLETETDFSRDARAIRERVLKQAEEALKGKGKSSGGEKLYKGVNAYVDYKAGFRREHTISSEKAGGAHGPLRASAHIRASARFDYQPDICKDYKETGYCGYGDACKFMHDRGDYKSGWQLEKEWEEVEKARKRKLAMKSDDGDEDTSEQSDEDEEDALPFACFICREPFVDPVVTKCKHYFCEHCALKHHAKNKKCFVCNQPTLGIFNTAHEIRKRMAESK Homology
BLAST of Lsi08G003850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GX84 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g01350 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 478.8 bits (1231), Expect = 6.0e-134 Identity = 240/339 (70.80%), Postives = 278/339 (82.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FNG6 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 51 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g06420 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 476.9 bits (1226), Expect = 2.3e-133 Identity = 233/321 (72.59%), Postives = 270/321 (84.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6K4V3 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 15 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os02g0301000 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 424.1 bits (1089), Expect = 1.8e-117 Identity = 216/319 (67.71%), Postives = 248/319 (77.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q67ER4 (E3 ubiquitin-protein ligase RNF113A OS=Bos taurus OX=9913 GN=RNF113A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 196.1 bits (497), Expect = 7.8e-49 Identity = 127/330 (38.48%), Postives = 185/330 (56.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O15541 (E3 ubiquitin-protein ligase RNF113A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RNF113A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 3.9e-48 Identity = 130/331 (39.27%), Postives = 188/331 (56.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KFS0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G382870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 627.1 bits (1616), Expect = 5.1e-176 Identity = 311/322 (96.58%), Postives = 315/322 (97.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CS03 (zinc finger CCCH domain-containing protein 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504086 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 621.3 bits (1601), Expect = 2.8e-174 Identity = 308/322 (95.65%), Postives = 314/322 (97.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H4B5 (zinc finger CCCH domain-containing protein 1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459918 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 619.4 bits (1596), Expect = 1.1e-173 Identity = 305/322 (94.72%), Postives = 315/322 (97.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I9H7 (zinc finger CCCH domain-containing protein 1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470453 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 616.7 bits (1589), Expect = 6.8e-173 Identity = 304/322 (94.41%), Postives = 314/322 (97.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BYC6 (zinc finger CCCH domain-containing protein 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006576 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 605.1 bits (1559), Expect = 2.1e-169 Identity = 302/323 (93.50%), Postives = 314/323 (97.21%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. NCBI nr
Match: XP_004149426.1 (zinc finger CCCH domain-containing protein 1 [Cucumis sativus] >KGN47699.1 hypothetical protein Csa_018272 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 627.1 bits (1616), Expect = 1.0e-175 Identity = 311/322 (96.58%), Postives = 315/322 (97.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. NCBI nr
Match: XP_008466746.1 (PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 1 [Cucumis melo] >XP_008466747.1 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 621.3 bits (1601), Expect = 5.7e-174 Identity = 308/322 (95.65%), Postives = 314/322 (97.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. NCBI nr
Match: XP_023548600.1 (zinc finger CCCH domain-containing protein 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023548608.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023548618.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >KAG7032517.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 619.4 bits (1596), Expect = 2.2e-173 Identity = 305/322 (94.72%), Postives = 315/322 (97.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. NCBI nr
Match: XP_022958735.1 (zinc finger CCCH domain-containing protein 1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 619.4 bits (1596), Expect = 2.2e-173 Identity = 305/322 (94.72%), Postives = 315/322 (97.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. NCBI nr
Match: XP_038884796.1 (zinc finger CCCH domain-containing protein 1 [Benincasa hispida] >XP_038884797.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 619.0 bits (1595), Expect = 2.8e-173 Identity = 311/320 (97.19%), Postives = 314/320 (98.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. TAIR 10
Match: AT1G01350.1 (Zinc finger (CCCH-type/C3HC4-type RING finger) family protein ) HSP 1 Score: 478.8 bits (1231), Expect = 4.3e-135 Identity = 240/339 (70.80%), Postives = 278/339 (82.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. TAIR 10
Match: AT5G06420.1 (Zinc finger (CCCH-type/C3HC4-type RING finger) family protein ) HSP 1 Score: 476.9 bits (1226), Expect = 1.6e-134 Identity = 233/321 (72.59%), Postives = 270/321 (84.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. TAIR 10
Match: AT5G06420.2 (Zinc finger (CCCH-type/C3HC4-type RING finger) family protein ) HSP 1 Score: 476.9 bits (1226), Expect = 1.6e-134 Identity = 233/321 (72.59%), Postives = 270/321 (84.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G003850 vs. TAIR 10
Match: AT4G01023.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 5.2e-24 Identity = 53/114 (46.49%), Postives = 74/114 (64.91%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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