Lsi08G000740 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGAGTGGGGAGTAAGTGAGTGAAACAGCTGGAGCAAGCTATGATAGCTAAAAGGAGTTTCTTTTCAAAAACCTTTTTCTTTGTAATTTTATTTTCAATCAAATGAGAAAGGGAGAGTTTTGTTTGTGTGTTATTTTTTTTTTTTATTATTATTTTTTATTTGATTGTTACAGGCAACAACCGTCAAAAACCATTTAATAAATGCACCGGCAGGGTCTTCTCCATCTCGTCTCGTACGTCCCCACGTACGGTTTCCGCGTCCACCGGCTCTCCCGGTTGACCGTACCTTACCTGCGAAAATCTTTCATTGCGCCCACCAAAACCTCTCGTGTGCATTTTTCTCTATTTAATACTACCTTTCTTGTCCTCCAATCTCCAACCAACACCTCCAAATAATCTCTCTCATTTCAAAATTAACCTTTAATTACAAAATTTACTCTTTATAATTAAATTAAAGAGGAATTTTTTTAAAATAAAAAAAAATAAGAAAAACTATTTACACAAAATAGCAAAATTTTTAAATAGTTGTAATAGACATGGATAGAAGTCTATTAGAGTTTATAAGTGGTAGAAATGATAGAAGTCTATCACGGATAGATGCTGATAGAAGTTTATCCATGTCTATCAGTGTTTTTTCTACTATTTTTTGTAAATAGTTTGATATTTTTTCTATCTATGAAAATTTTCTTTAAATAAAATATTGATGTGATAAATAATTCATTTAAGGCTTCTATCGAATTATAGGGATTAAATTTCATCTTTCTCAAATCTATGGGAACCAAATTTATAATTTAACCTAAAAAACAAAAGGCAAATGTATAACTTTATAATATGGGAGAATTAATTTATTTGAATATGATTCAAATAATTAATTATTTGGATGAGATCCATATAATAAAGTTATTTAATTTAAATAAGATTTGAATTAAATAATTGGAGGGAGAATTAATTAACTTGAATTGAATTCAAATAATTAATTGTTTAATTTGGATGAGATTCAAATTAAAGATTCTACTGGACATAAATATTTAACTATGATTTAAATATTTAAAACCATTTAATATGAGATATTATTTGGGTAGATATTTAATAATATTAGATATTATTAAATATTTAATTTAAAAATCTCTGCAAAGAGTTATCCCAGCAAGGATTCAGAGTAACATAGGGTCCTAGGGGAGCCCTCGTAGACAACATACTCTACACTCTCTCTCTAGAGATTCTTCCAATTTTCTTAGAAAAGTTACAAAAAAATTATTCTTCTCATTCCCTCTATTCTATTCTTCTCATTCCTTCTATTCTTTCAAGAAGCGGTTCCCACAAACTAGATCATTGCCAGAGTCATAGCAAGGAATATCTCGTGGAGGAGAAGATTTCTCTGCATTTGTGGATCGACAAAGGTATGATGCTTAATCTTTTCTTGTTTATTTGTATTTTTAATTCTTTCAAGAAATCAAAGAACGCTTCTGCCAGGATTCAATTCCCTTCAATACCATGTTGTTTTGTATATCTTTATTGAATAATTAGATTAATCAGAATAATCTATGCAATGGTGAATGGAGGAATAAATACACTGAGATACATAAAAGAAAAAAAAATACTAGAAAGGAAAAATACAAATTAGGAATAACACATAAATTATGCTAACACATTGATTGATCATCAATGCATGTTAGGTTGAATGTTCAATTGAAAGATTACATGTTTAACCAGATTTATAGTATTGAATCATTATCTAACCTATCATGTTTAATTTTCAAAAACCAAAAACGAAAAGATGAAATAGTAATCAAATGAGGCCTAAATAGTTACCAATCGAAACCTTAGTTATTGATTCCAAATTCTCTAAAAAAGTTTGGCCTATTCTAAGAAAAAGGGTAAAATGTAGCCATCTCATATCCAAATTTCAATTATGAAAGAGGAAGAGGCAGTGGGCCTCCTTTGCATATTGGGCTCTTAGATTATTTCATGCATGTCTTCTAGTATATCCATGAGTTGAAATTTCCAACTTTCATATGTTTGCTTCTAGTTCTCCTTCTACTTGGATCTAATTGTAAAAGGGTGACAATTCCATGATTTACATCATCACTGTCCTCTTTAGAATGGTTCTTCTCTGAATAAAGTTAAAATAATGCTAGAAGAATATGTGTGTTTTGTGTTTTGTCCTTGAGTTTTTACGTTTTTAATCCTCAAGCTTTTAAGAGTAGATGTATTTGGTCATTGAGGCCCGTTTGGTAACGTTTCCGTTTCTTGCTTCTTGTTTCTCGTTCCCTGTTTCTTGTTTCTTGTTTCTTCTTTTTTGAAAACAGGAACATGTTTGATAACTATTCCTGTTTTCTGTTTCTTAAAAAAAGAGAAACAGAAATAGAAACTTGTTTGATAACCATTTCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTAATAATATAATATAAAAAAAGAATATATATCATATATTAAACATTGAAAAAGATATTATCAAAAGTTTGTGTCATCTAATACAGGTAAGTCTCGATGACAACTAAATATAATAACAAAGTTGTGTCCTATCCTTCATATATGTTGCTCAAATTTGATCAGCGTTGTCATCTCTAATTCGTGTCATTTGTCTTAAGTGATGTCGAGTCAAATCCAACTTAATTATATTATTATGTAAATATTATTACGTAAATTTTGTGATTGTAAAATATTAAAGTAAAGTTAAATGAATGTCTTAGTCAACAAAATTTATATAATGTAAAATTCTACTCGATTTCATATATACTAAAAATATTTGAATTAAAATAATATATAAACATGTATATTACAAATTTTAATATTCAAAAGTTGAATTATAAAAATAAATTAATATACAAATTGAAAATTAAAATAATATATAAATCTAATTATTGGAGAATTTTTAAATCCAAAATTAAAATAGAATATAAATATAGCAAACTTATTTTTATAAATAGCAAAATTAATAAATAAAATATAAAAGATAGAAATAAATATAAAACAAAAAAAAAATCAAAGTGTCCATTCTTGGAGTTGAAATTTGAAATGTAAAAAAAATTAATAAACCTATTGAAAATTAAAATAATATATAAATATAAATATTTGAGAAATTTAAAATTTAAAATTAAAATAAAATATAAATATAGTAGAATTAATTTTGTAAATAACAATATTAATAAAGAAAATATAAAAATATAAAAGGAAAAAAAAAACAAATAAAAATGTCAATTTTGGGAGTTGAACACACAACCAAAAAGTGAAAAGGTGTAATAAGAATGCATGACTACCAACAAGCCAATGAATAGAAGAAACAACATGGTATAAAATAGAAACGAACCAGGGAGAAACTACTTTTTATAGTTTCTCAAATTTGGTCCCATTTTAAGAAACGTTTCTCAAATTTTAGAAACAAGAAATGGGAATGTTATCAAACAAGTGAGTTTTTTAAAAAATGAGAAACAGAAACGTTATTAAACGGGTCCTTAGAGACTAAAATGATATATTTTAAAAACTTAGAAACCAAATATACCTATTATTAAAAACTTGAGGATTAAAAAGTTATATTTTGAAAACTCAAAAACTAAATGCATCTATTCTTTAAAACTTCGAGAACTAAAAATGTAATTTTTTCAATAAATAAACAAATAGTGGAATATGATTGGCATGGTATATATATAAAAAGATATAGCCTTTGGTATCATGCTTCCATCTTGTGGAACAATGTCGAAATGATTCACATTACTATCAATTTTGGATATAAAATGGACAGAAGTTTGATAATAGTGGAATATGATTGGCATGCATGTCATTGAGTATTTCTTACTCATTATTATCACTAAAAGTAGACAACTTAATAATTTCCAAAGGAATCAACATACCTTGCCATTCTCCTTTGGAAATTTTTCTCAACCTTAATGTTTTTTTTTGCACCATATAAATCTTCTAAGGTGGTAAATAAGATTGTAGTTTAAATGGGAAATCTCTTCATTGAGTTCTTCCATAAGAACTGAGCCTTTATGGTCTTCTCTTTCTCATCAAAGTAATTCTCTTAAAAGTATTGTGGGCACATATCCCTTGTAGTTGATTTTTAACTCTTGTCTCGAATTTTGAAACTTGTAAAAGGATCTAGGAACAAACAACAAATACAAGAGCCAAAACTAACATCTTAAAAGTATATGGACTAAAATCGACAAAAACTGAAGGTATAAGAATTAAAATAAACATCTTAAGGACTGTCTGGCCCATGAATTTGAAATTAGGTGGGCAAGAAAGTCCATATTTGGACACTTGAAATAAAATTCTCTGAAAGGTTTGCAAGAGGAAATTTTTAATTAATGCCATGGATTTGAAAAAATAATTTTCCTTCATCTTCTACCTCTTATCATTGGTCGTCGTGATCATCGGTAGTGGCCATCAGTCAACCGTTGTGATTGTCGTTGACTGTCATCAACAACTGCAGTAATTTCTAAGTTTCAAAACTCCCTCAAACAAGTTTTCAAGCATTTGATTCTCATGTTTATAGTTTCGGACCTGTACACCAAAATTTTCTTAAAAGTACAGAAATTTGTTGGATATTTATAGTGAAATAAAAAGTGAGATGTTGATGAATATTTGAAACATAAAAATTTGAATTTAATTGTAGAAATTAAATTCATTGTTGGAAACTTCAAATTGGATTGAAACCATCAAACTAAGATGAAGTTTCATGTACAAATTTAACATGTATGAAAGTTAAATTTGTAGTTTCTTCAATTTGAATGAGTTATATGTGATTTTTGTCAAGTAACAAGTTAAATTTGACAAATGTTTCAATTTTTGTATTTATTTGATTTTATTTTGCATTTTGGAAAGTTACTAAGTTGCTAGCCTATAAATAGCAACTTGTTTCTTCATTTGTAGCATCCCATTTCAAATTGAAGAATTATCTCCTTTCTTTCTTTATTTCTTTCTTTTTCATCTTGGGTCAAGTTGAGAGTAAGTATCCAAGAGTTCTGCCAAATTCGAGT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Match: Q9C994 (Protein DETOXIFICATION 14 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX14 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 2.1e-06 Identity = 31/61 (50.82%), Postives = 44/61 (72.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GXM8 (Protein DETOXIFICATION 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 2.1e-06 Identity = 34/84 (40.48%), Postives = 54/84 (64.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L731 (Protein DETOXIFICATION 12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 3.7e-06 Identity = 35/81 (43.21%), Postives = 50/81 (61.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KST7 (Protein DETOXIFICATION OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G649880 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 6.9e-16 Identity = 50/58 (86.21%), Postives = 54/58 (93.10%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CA38 (protein DETOXIFICATION 3-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498682 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 1.0e-14 Identity = 48/61 (78.69%), Postives = 54/61 (88.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAK3 (protein DETOXIFICATION 12-like isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498682 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 1.0e-14 Identity = 48/61 (78.69%), Postives = 54/61 (88.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TDD2 (Protein DETOXIFICATION 12-like isoform X3 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold169G00690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 8.5e-14 Identity = 47/58 (81.03%), Postives = 51/58 (87.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAP0 (protein DETOXIFICATION 3-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498682 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 8.5e-14 Identity = 47/58 (81.03%), Postives = 51/58 (87.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. NCBI nr
Match: XP_038889425.1 (protein DETOXIFICATION 3-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 2.9e-16 Identity = 52/58 (89.66%), Postives = 55/58 (94.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. NCBI nr
Match: XP_004141549.1 (protein DETOXIFICATION 12 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 1.4e-15 Identity = 50/58 (86.21%), Postives = 54/58 (93.10%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. NCBI nr
Match: XP_008459600.1 (PREDICTED: protein DETOXIFICATION 3-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 2.1e-14 Identity = 48/61 (78.69%), Postives = 54/61 (88.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. NCBI nr
Match: XP_008459603.1 (PREDICTED: protein DETOXIFICATION 12-like isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 2.1e-14 Identity = 48/61 (78.69%), Postives = 54/61 (88.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. NCBI nr
Match: XP_008459601.1 (PREDICTED: protein DETOXIFICATION 3-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 1.7e-13 Identity = 47/58 (81.03%), Postives = 51/58 (87.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. TAIR 10
Match: AT1G66780.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 9.6e-10 Identity = 34/59 (57.63%), Postives = 47/59 (79.66%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. TAIR 10
Match: AT2G04050.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 1.2e-07 Identity = 32/60 (53.33%), Postives = 45/60 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. TAIR 10
Match: AT1G71140.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 1.5e-07 Identity = 31/61 (50.82%), Postives = 44/61 (72.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. TAIR 10
Match: AT2G04080.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 1.5e-07 Identity = 34/84 (40.48%), Postives = 54/84 (64.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000740 vs. TAIR 10
Match: AT1G15170.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 2.6e-07 Identity = 35/81 (43.21%), Postives = 50/81 (61.73%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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