Lsi08G000150 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTAAGTCAGACTCGTCCAACATTATCAAAGTTGTAAATAGAGGGTGTGTGGATCTCATTGAATCTTATTCTCGTAGATGAAATTATTTGGCATATTTTGCTTATTGTCCTAGATCTGGTAATGTTATCGTTCACAGATTAGCTAGGACTACTGTTTTTAATAGTGATTTTGAGAAATTCTTTTTTTTTTTTGTTAGAAGTCCCTCTTCTTCCTCTAAAGAGGCCAAGAGGACGTGGTGGGTTGGGGGCTCAATATGCCCAGTTGGTTTGCCTCGATTAATCAGAGATCTTTGATGTATCTGTTTCTTTTTCTAGTTAATGAAGTTGTTAGAAAAATAAAAAATTTACTGATGAGGTATGGCGACTGGCCTCTGTTATTTTTTACAAGAATTAGCATTCCCAAAGTTGTATCCAGATGCACCACAATTTAGAGGAAAAAGGCCACCAGAATTAGTCTGATCAAAACAAAAATTGCCACAGGAAGCATTCGACCCCAAGGAGAAAATGTCGTTTTCGATGGCCATGGTTAAACCCATGGTTTTCTCCTCAGCCTCAAGCATAACATGAAGTTCTTCAACAGAAACAGTTTCACTTCCAATTCTAAGAGATTCAAGCCTCAAACCAATCAAAGATGTTGAGAACATCTGCAAGTTTATCAACAATAAATTTGATCCTTCATGTATATTGTTCAATAGATTTTGGAGAGCAGCATACTGCAATCAAGAATGGTTTTTGAGCAAATATAGTAAAAAAAATATATCTTTTTAGCATATAGAAAGTCAATTCAAACAGACCAAACTCTTAAAACAGTATCAATATGAGCTAAAATCTATAGCCTCCTAGTGTAAATAGTATAATACAATAATACAAGGCTACAATAGATAATAATTGTTGGAGTCTCGTTCTTCTTCACCTGCTATGAACATGAGATTTGGAAACAAATAGGAAAGCAACAAACGCTACAACACTTAGCCAGACAATAGCAAATAAAAGTAATCAAGATGTGCCTTGTTCAGATCGTTAGAAAACCAACTATTATTCTTCCCACTGCCTCCAGTTATTTCATCAATAACAGAAACTAAAAGACTGCTTAAAATGCTTCCCATGCCCAACACACTAGTATAAAAGGCAAGCCCCATACTTTTCAAATCTGTTGGAACTTGATCGTAGAAAAACTCTTGGGAGACCAACCAATGTAAAAGCTTCAGCCAAACCAAACAAGGTATATTGAGGAACTAGCCACCAAAAACTCATTGGAATTGTTAAGTCAGGCCTATCGACTAGACCGTGTTCGTTTGCCATTCTTAATCTTTTCCTCTCAACCATGGTTGCAACCAACATTGAAATGGCAGACACAACCAACCCAGTTCCTATACGCTGCAGTGTTGTGATACCAGATTGTATTCCTGTAAAAGCTCTAGCTATAGGAACAAATAAAAGATCATAGATGGTAATACAGATAACGATCGAAAGTGGAACAAATGAATCGAGTGCAGCAGCAGGAATGATAAAGCCTGAAAAAATGGATCTGTCCATTGTAGCTCCTTGCTTGGTGAAGAATGTTGAATCCTGTGCAAACACAATAGCAAATACAAGGACTGTAATCCATACTGGAAAAATTCTAAGAACTGCCTTTGCTTCTTCAACCTCGCTGACACTACACATCATTCCACATTTGTTGGAATCCTTTGGCACAATGCAAGCTTTGTTAAGAAACCTGCCACATTTGAGGATCCAACTATTGTTAACACTATAAGTTGGCAATTATGCAATCTGATTAAAATTTCATAACACCCACTTCATTTCATGCTGAACCTATTAGTTGAGAGTAACGGAAGTTTTTTATTGAATTGATGAAAACTCTAATTACTGAAGTCATTATGATATCTAACTCATCTAGCATTTCATTAACTGTAATGACAATTAGAGAAAATAGAACCATCAATTAAATTGTAATTACTGTAAACCCCATTTTCATATGGGGCATGGATTTTGTAATATTTCTTACTTGAATTGTCCAGCATTCTGTAATGACAAATCTCGACTATTTTCTTCTTCATCAAAGATGACTGTTGAAGAAGCTCTCCAATTCCTAATTGCAGACACAAATACTCGACCAATTCTCAGAAATGGGGTCTTATCATACGTTTTGATGCTATAACGATATGTTTTGGTCCCAAATACAAACAAAAAGGAAGCAATCAGCATCATAATACAAGGAATTCCAAATCCCAAACTCCAACTAAGATTCTCCTCTGTATATGTAACCACCAAAATGGCTACAAAGGTACCAGCGCAGACACCAAAAAACCACCAATTGAAGAAGGAGCTTTTAGATTTGGCCTCTCGAGGGTCTAGGGCATCGAATTGATCGGCTCCAAAAGCCTGTACGCAAGGCTTGTGCCCACCTTGGCCTATCCCAATTAAATATAGGGAGACGAAGAAGAAGAGAAGCTGAAACTGGGGAGAAATGGTTGGAGAAAGCAAAGCAGAGAAAGAGAGGAATGAGAGTCCCTGTTAGGAAATTTCAAGAATAGGATCATATTCAAATAGTGATGGAAAGGAATATGAAAGAAGGAAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGACCAAGACGTAAATTGCAGAAGAAAAAAGAATGGTGCGATAACGTCCGAAGAAGGAATCGGCGAGAAAAGCTCCGAGAAGAGTGAGAAGCATGGAGATGCCTGACCAGATGTTAACAGTCTCGGCGGCGGTGGCTACAGACTGGCCGAGTGGGCTGGTTAGGTAAGTTATGAGGTTCGAACCGATTCCGTAGTAAGCAAATCTCTCCGCTACCTCCACTCCTAAATCAAATCAACAAAATGATATATATGTGTCATGTGTGTGTGGGAAGTTGACTTAAATGTGAATGTATGAACACTAATATACGAACCTATCATGAAAGAGGCGGACCTCCAACCACCGGAGCTCAGTCGGAAGACTGGCTGACCTTTGAAATCCACGGCGCCGTCCACAGTCTGGCTGAGAAAAGGAGTTCGACGCTCCATTTTTTATCGGGAGGTTGACAGCAATCTTAACTTGAAATGTCACACCCTTTCCCAGATTATCCTCTTAAACCTGAGAAATAGCATGAAATCATACATTACATTCCTATTACATACATTAGTCCCTCTCCTTTAGAGGTTTTACCTTAACTTGTACACCTAGACACCTGATAAACAGTTCACAATAGAACACCTCGACTTAATAGGCATACCACTTAATTCCTATCCTGAACATGAATATATATGCATCATGATATAATACTGATACACAAAAGTATTTCCAAACCTAAGCATCACACCCCAACTATTACATGACATACATCTCCAAAACTTATTTACTACAAGGGAAAGATCTGTAGCAGGCTCTTCGCGAGGGTAGGTCAGACTTCTGGATTCCTTCCACTACCTGGAAAATAAAAAAAAACATTTTGAAGAAAAACATTAGACATAAGGTCTAGTGAATAACAAGGCTATTTAACGTTCTTACTAAAACAAGTTGGTTTCAACATAGAGAAATCATTTGCATAAAACATTTCATAGATATAAACATTTACAACCATAACTCATATGTACTTAATCCACCTAAAATCATAGCTCAATAACTATTGTCACCATCTATAAACGTAGTTCATATAACATCAAAATCATCTGAAAACATAGTTCATAAACATCGTATTATCATAAACTGTCATACGTTCTATAACATGCTTGCCCTAAATATCAGAAATCTCTTAATAACACTTTATAAACATTACATAAAGAGTCATGGTATATGATCATGTAAGATTCCTGAGAAACTTAGTATCCAAATTTCCTTAGTTGAGGTGGATAGCTCAACACTCTCAATGTCATAACATCATAAATGGCCATACGTGCTCGTAGAGCTAGCATACATCGGGTTGTCCTGATACGTCACTAAAGTCCTTATATATCAGAGTCTCATTTATCTCGATACCATCTCCATGTCCTTAGGTATCGTTACACACATTCATCTCGATATCGTCTTAATGTCCTTAGATATCGCTTCATGTTTACCTCGATACTGTCTCCATGTCCTTAGGTATCGTTACACACATTCATCTCGATATCGTCTTAATGTCCTTAGATATCGCTTCATGTTTACCTCGATACTGTCTCCATGTCCTTAGGTATCGTTACACACATTCATCTCGATATCGTCTTAATGTCCTTAGATATCGCTTCATGTTTACCTCGATACTGTCTCCATGTCCTTAGGTATCGTTACACACATTCATCTCGATATCGTCTTAATGTCCTTAGATATCGCTTCATGTTTACCTCGATACTGTCTCCATGTCCTTAGGTATCGTTACACACATTCATCTCGATATCGTCTTAATGTCCTTAGATATCGCTTCATGTTTACCTCGATACTGTCTCCATGTCCTTAGGTATCGTTACACACATTCATCTCGATATCGTCTTAATGTCCTTAGATATCGCTTCATGTTTACCTCGATACTGTCTCCATGTCCTTAGGTATCGTTACACACATTCATCTCGATATCGTCTTAATGTCCTTAGATATCGCTTCATGTTTACCTCGATACTGTCTCCATGTCCTTAGGTATCGTTACACACATTCATCTCGATATCGTCTTAATGTCCTTAGATATCGCTTCATGTTTACCTCGATACTGTCTCCATGTCCTTAGGTATCGTTACACACATTCATCTCGATATCGTCTTAATGTCCTTAGATATCGCTTCATGTTTACCTCGATACTGTCTCCATGTCCTTAGGTATCGTTACACACATTCATCTCGATATCGTCTTAATGTCCTTAGATATCGCTACATGTTTACCTCGATACTGTCTCAATGTCCTTAGGTATCAGTTCATAGGGTACTTATCATTTAACGAAAACATGTTCAATAATCAAGAGCTTGTAAAACATATATTTATGAAATATGAAGCATAAAATTCCTTGTAAAACTGTCATACGTTCTA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Match: A0A0A9DUX8 (Uncharacterized protein OS=Arundo donax OX=35708 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 3.4e-05 Identity = 39/101 (38.61%), Postives = 50/101 (49.50%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi08G000150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: U7DUE1 (C2 domain-containing protein OS=Populus trichocarpa OX=3694 GN=POPTR_0689s00200g PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 2.9e-04 Identity = 31/61 (50.82%), Postives = 41/61 (67.21%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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