Lsi07G012210 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGGCTTATAATTATTAGTTGAGAGAAAATCCAAATTCCCTTCATTTATTCAATGTCTCCATCTGGATCTGGATGGAACCAAAATTCAACAACTTTCAACTATTCTTTTGCTTTGAGTGTTGATCTCTTGCCCACACGAGGTAATGTTTCAGTCTTAATTTCTTCTCTTTTCTCATCTTCTCTTCTCCCGATCTCATAGTTAGTGTTGTTCGTGTTCGTGTTCATTATCATGTTTGATATCACAATTAGAGTTGTTTGTGTCCTTGTTCGTGTTCTTGTTCATGTTCGATCTCATAGTTAGTGTTGTTCATGTTCGTGTTCGTGTTTGATCTCATTGTCAACTTGCTATTTGTGTTGATGTTTGATCTTATTTGTTGACTCCTCCCTACTCATCTCAATCGATTACATTGCTCTTCAAAATCTTTTAACAATCGAGCCACCCAACTCAACTCAACTCGACTCAAATTTAGTTATACTCTGACTTTGATTCTTTTCAATCATACAATTGCATCAACTCAAATTTTGCATTAGTCCAAAAGAACTTTTCTAACTCATAACCCAACTCAACCCGTGTACACTCTATTCAAGAGGCTTCTAATCTCTGTTGTGTCCCATATATCAATTTGTTTTTATTTCTGTTGTTTTATATGTATGTGAGAGAATCTTATTAGTGTTTTTTTTATTCAAATTTTTAATTAAAGTATAATAAATGAATAAATAATCTTTAGTACTGTACTCTGAGGATTCTGTGGAAGATTTTTTTTAAACCACTACTTTTAATTAAAAAAATCATTTAATAAGAATACATGATTTAATTATTATGAAGATCAATTTGGTCAAGATAAATAATGATATATTTCACCGGAAATTTTTACAAATAGAAAAAATGTCAAACTATTTACAGAAAATAATAAAAAAATATTAATGACATATTGATAGACTTCTATCAACATCTATCAGTGATAGATTTTTATTATTTTTATATTCTATCAGCGTCTAACACAACTATTTAAAAATTTTGTTATTTTGTGTAAATAGTTTTGCTTATACTTCTATCTAGTTTCGCTTATTTTTCTATTTTTAAAAATTTTCCTATCAAGTATCTATTTTCCTCTCTTTAATGTATTGTTTTTTTAAATAAAAAAAAAAACTTTTTTTTATGTGTCAGTTGGACCAAATAATTAAAGGGAACCAGGAAGTTAAAGTAAGGTGTGAAGAGAGAGAAATAATGGAGTTGAAGAATTGTTTGGTGTTGATATTTGCAGCCTTAGTTTTAGTTTATGGAGTTTTGAAGAGATTGAATGGTTGGTATTATGAAGCCAAAGTGGGGAAATTATGGCCTAAGCTTCCTCCAGGTCATATGGGTTGGCCTCTTCTTGGTTCTACTCTATCTTACCTCAAGAATTTCAGCTCTGGTCAACCAAGAAATGTCATTCACAACCTTTCCATTAGGTAAATCTTTTATCATTAATATAATCTTACAATATATAATATGCGTAATTTCTTGTAGCTTCTTTCATGATCATACTTATTTTATACATACAAAATATATACCTCAAAACTTTGCTTTTTGTTTAAAAAATAACTTCGTTTTTTCAAAAGTTATAATGTTAGTCTTTGATGATCTTTTCATATATGTTTCAATAAAAGTAGAAACTTCTACTATTGTGTTGATGCCTAAATCTGGATTGGTAAAGTAGTCTAATCTTTATGTGGCAACAATAGTAAATTTGTATTTGAGAGAAAGAAGGTAAACTGCAAGTTAGCTAGAACTACTGATGTTAGGGGTGTTCAAATGACCTGACAATGCGAACAATTCGGACTGAGTCTCGGGTTGAATAAAAAAAAATTTTAAATTGAGTTCACCCAACCCAAATTACATATATATTAATAAGTTTAATTTTAGAGTTCAGCTTTAGGTTGAATTTTTTAATATTTTTCTATATTTCGATGTTTGTCTTTATTTAAAGTTTATAATAGATATCTGGTATTTAACATTGGAGTTTTATAAGATTTTAGTTATTAGTCATGTGTTGTTGGTAGATTTAAGTATTTTAAATTAATAAGAAAAAAATAACTCGACAATCGAGGGTTGAGTTTCGTTGGAGACCCTGTTCAGGTTGGTCTAAGAAAACCCCCCAACCTATGTATACATCCGTAACTGGTGTGGTGTAGTCTAAGAAAACCCCCCAACCTATGTATACATCCGTAACTGGTGTGGTGTAGGCTACATACACTCTGATGTTTAAGTCATGAAGTCTTAAAATAAGGTTCATTATAGAATTTCTAGAAGAGAGTCATCTTACCTCTTATATCATCTTCTTTGCGTATTTATAGGGTCAGATCGCCTGGATCTTCTCCAATTAGGGCTTTCTTAGCTTGTTTCTCACAAATTCCACTCTTTCCCAATTTGGCCAAATCATGTGAAGAATCACCTGACTTGATGGGCTTGGCCTCAACCTTGGACGAGGCCAAGCATGTTGATTTGGCTCTGGGCCAATTTAGCCCTTCTCTTTATGTCTCATGTTAGGCCGAATGTTGCAACTTTGCATGATTTGGTACGCTCGATTGAGGCCAAGAGAGCTTATTTGGTTTTGGGCCAAGTCAGTCCTTCCTTCTAGGCTCATTCCATCATTTGGACCTTATGTTGATCCATCTAACGTTATTTCCTTGGTCCAATTGCCTCTGCTTGTGCACTATGTCAATTTTACCTTTTAGTCCAAAATTATTAAAAACATATTGAATGAAAATTGAGATCTAAAACGGGTATGACATTGTTTACGGCTCCGATTGTCGTTCCAAGTTGTCACTGTGACACACTATTTTCAAGTCTCAATTTGCACCCAACATTGTAATGGATTATTATACTCTAAAGTTTAAAGAGATTTTTGCGTAATTAGCCTTCATTGACAAATAATAACTATTTTGAAACTACTCTCTTAAATAGAGAGATTAATATAGCCATCCAAATTTCAATGAATGTCAACTAATTCGTTCGAGATGTCGTAGCCTTGCTTCATCATAATTTTATACTCTGGAAATACCCTTGAACGTTTCTTTTTATTTAAAAATATCTTCATCCTTTCCAAAGTCATGATATTACTCTTGACTTTTTTTTATAAACGTTTCAAAAAAAATGTCTTGAATTGAACATTGAGACTTAAAATCACGTAAGGTATTATTTGGATCCTAATTATCATTCCAGATCATTGACCCACCATCTCCAATTCTCAATTTTCGTCAAATATTCTAACAAAATTACTATTCCAAAGTTCAGGAGTATTTTGTGTAATTTAGCCTTCATTGACAAATAATAGTTACTTTCGAAACTACTCTCTTAGATGGAGAGATTAAGCATCTAAATTTCAATGAACGTCACCTAATTCGTTCAAGACATCATAGTCTTGTGTAAAAGTATCTTTATTCTTTCAAAAGTTATGATATTACTCTTGATTTTTTTTTATAAAGGTTTAAAAAAAAGTACGTAAAAACTCATATTACAATGTCTTGAATTGAACATTGAGACTTAAAACAAATATGGTAGTGTCTGCATCCTCATTTTCATTTTAGATAATTGTCACACCATTCCCAATTCTCAATTTTAGTCAACTACTCTAACGGAAGTACTACTCCAAAGTTCAAGAATATTTTGTGTAATTTAGCATTCATGGACAAATAATAGTTACTTTGGAAACTACTCCCTTATTAAAATGCCTTGAATCTTTTATCTAGCGCTTCGAATAACCAAACACTGGTCTAATCTCTTAAGACTTTTTTTTTTCTGAGGCAGATATGGGAAAAGTGATATGTACAAAGCTCACCTACTTGGTAGAGCGAGTATAATTGTTTGTACATCTGAACTTTGTCGTCAAGTTTTAAGTGATGAAGACAAATTCAAGCCTAGTTTACCCAGAAGCATCACCATTTTATCTGGTAGAAAGTCACTGATGCAAGTGTTCAAGGGGGAGCACAGGCGGCTACGGCGGCTGACAACGGCGCCGATCAGCGGCCATGTGGCACTAGAGATGTACATCAATCATATTGAAAACACAGTGATAAGTGGTTTAGAGGAATGGGCTAGCATGAAGAGGCCAATTGAGCTATTGACGGAGATAAAGAAGCTGACCTTCAAAATTATTTGGAACATTTTCATGGGTTCTTCTGTACATTCTTCCATTGCAGAAATAGAGGCTTTGTTTGCTAAAGTTGCAGTAGGGTTTATATCTTTGCCCATCAACTTTCCTGGCTTCAGCTTCCATAAATCACTCAAGGTAACCCTTTTTCTTCTATATGCATTCCTGTTAACTTTTCTTTTTTCTTTCAATAATTCATGTGTATGGTAGAAACAGTTAAAAAAAGAATGAATTTATCGTAATCTATCTAACTTACATATTAGTGATTTAATTAGAATTAATTTAATAATTAATTCATATATATGGTAACAAATTAAATAGCACAATTATATTTGGACTATTTAATGATCATATTGTGTAATCTTAATTGTGGAGTCCATAACGTTCCATATAGAAGCGTGACCTGTTGAGTAGAATCACTCCATTAATCTTAGGAGATAATGGAAAACCCTAAGATCAACTTATAAATATAAGTTGGTTCTAGTCTCCCTAATATGCTATGTGTCATGGGGCGGAAACTTGGTATGGAATTTTTTGAAATTTTCCCGGGCAGCTTAAGGAGGTTCCTTAGTCAGCCCTATGTGTTGGACCCAAATATTTTCCACAGGTTTGCTTGAAAGGTTCCAATCTCAATTATGGTCGATCATTAGCTACATTCACACACTTTAGAAAGGGAAGAAGAAATATAACTCTTTATTATCAAAATCACAAATCACAAGACATGGAGCAAAGCTTTATACAAGACACTTAATCTCTGGAGGGATCAAAGTAGTAAAAGAGAGACATATTCACAAATAATGTCAAGGTGTTCTTAAACAAGTCCCAAGTTCCATTTTATATAGGTGTGGGAGGGTACGTAATT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ATGGAGTTGAAGAATTGTTTGGTGTTGATATTTGCAGCCTTAGTTTTAGTTTATGGAGTTTTGAAGAGATTGAATGGTTGGTATTATGAAGCCAAAGTGGGGAAATTATGGCCTAAGCTTCCTCCAGGTCATATGGGTTGGCCTCTTCTTGGTTCTACTCTATCTTACCTCAAGAATTTCAGCTCTGGTCAACCAAGAAATGTCATTCACAACCTTTCCATTAGATATGGGAAAAGTGATATGTACAAAGCTCACCTACTTGGTAGAGCGAGTATAATTGTTTGTACATCTGAACTTTGTCGTCAAGTTTTAAGTGATGAAGACAAATTCAAGCCTAGTTTACCCAGAAGCATCACCATTTTATCTGGTAGAAAGTCACTGATGCAAGTGTTCAAGGGGGAGCACAGGCGGCTACGGCGGCTGACAACGGCGCCGATCAGCGGCCATGTGGCACTAGAGATGTACATCAATCATATTGAAAACACAGTGATAAGTGGTTTAGAGGAATGGGCTAGCATGAAGAGGCCAATTGAGCTATTGACGGAGATAAAGAAGCTGACCTTCAAAATTATTTGGAACATTTTCATGGGTTCTTCTGTACATTCTTCCATTGCAGAAATAGAGGCTTTGTTTGCTAAAGTTGCAGTAGGGTTTATATCTTTGCCCATCAACTTTCCTGGCTTCAGCTTCCATAAATCACTCAAGGCTAGAAAAGAGTTGCTGAACAAGCTTCAATGCATTATCAACGAAAAGAGATTGGTGAAGAAAAGGGAAGGGGAAAGTTGGGAAGCAAAAGATATGATGGATTTGCTGATTGAATTGAAAGATGAAGATGGTGAAGAGTTGGATGATGAAACCATTATTGATTTGATTTTTGGTAAGTTATTTGCAGGCCATGAAACTTCAGCTTATACAGCTATGTGGGCTGTTTTGTTTCTTACAAATCATCCACATATATTTCAAAAAGCCAAGGTGATAGATGAGACACTTCGTGTTGGTGGTATCACGTTTATGGTTTTTCGTGAAGCAACTATTGATGTGGAAATTAATGCCACACCAGGAGCTTTCACTCCATTTGGATTAGGAAGTAGGTATTGCCCTGGAAGTGATCTTGCCAAGCTTGAGATCTCAATTTTTCTTCATTATTTTCTCCTCAATTACAAGTGTGATATTGGGGTACTCGTTAAAAAGCCTAATGGTTGTGTTGTTGCCACTATGCAGGATTTTAGACCAAGCTTCCATTCGTCTCTTTCGACGGATGCTTATGCTATCTTGGATGGTATTAGGCTTGCAAAGGCGAATGGAGATCCAGGATGTCCTTTTATCCGACTCGCAACTGATGATGCAAATATTGAATAG MELKNCLVLIFAALVLVYGVLKRLNGWYYEAKVGKLWPKLPPGHMGWPLLGSTLSYLKNFSSGQPRNVIHNLSIRYGKSDMYKAHLLGRASIIVCTSELCRQVLSDEDKFKPSLPRSITILSGRKSLMQVFKGEHRRLRRLTTAPISGHVALEMYINHIENTVISGLEEWASMKRPIELLTEIKKLTFKIIWNIFMGSSVHSSIAEIEALFAKVAVGFISLPINFPGFSFHKSLKARKELLNKLQCIINEKRLVKKREGESWEAKDMMDLLIELKDEDGEELDDETIIDLIFGKLFAGHETSAYTAMWAVLFLTNHPHIFQKAKVIDETLRVGGITFMVFREATIDVEINATPGAFTPFGLGSRYCPGSDLAKLEISIFLHYFLLNYKCDIGVLVKKPNGCVVATMQDFRPSFHSSLSTDAYAILDGIRLAKANGDPGCPFIRLATDDANIE Homology
BLAST of Lsi07G012210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B5BSX1 (Beta-amyrin 11-oxidase OS=Glycyrrhiza uralensis OX=74613 GN=CYP88D6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 372.5 bits (955), Expect = 6.9e-102 Identity = 197/440 (44.77%), Postives = 268/440 (60.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23051 (Ent-kaurenoic acid oxidase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=KAO1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 323.6 bits (828), Expect = 3.7e-87 Identity = 186/464 (40.09%), Postives = 257/464 (55.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C5Y2 (Ent-kaurenoic acid oxidase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=KAO2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 317.4 bits (812), Expect = 2.6e-85 Identity = 186/471 (39.49%), Postives = 261/471 (55.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q43246 (Cytochrome P450 88A1 OS=Zea mays OX=4577 GN=CYP88A1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 292.4 bits (747), Expect = 9.1e-78 Identity = 167/446 (37.44%), Postives = 247/446 (55.38%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9AXH9 (Ent-kaurenoic acid oxidase 1 OS=Hordeum vulgare OX=4513 GN=KAO1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 287.7 bits (735), Expect = 2.2e-76 Identity = 170/477 (35.64%), Postives = 255/477 (53.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BJR1 (beta-amyrin 11-oxidase-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490801 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 654.8 bits (1688), Expect = 2.6e-184 Identity = 340/460 (73.91%), Postives = 366/460 (79.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CIW4 (Beta-amyrin 11-oxidase-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold139G001790 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 649.0 bits (1673), Expect = 1.4e-182 Identity = 340/464 (73.28%), Postives = 366/464 (78.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L1N7 (beta-amyrin 11-oxidase-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111500298 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 611.7 bits (1576), Expect = 2.5e-171 Identity = 316/460 (68.70%), Postives = 353/460 (76.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E938 (beta-amyrin 11-oxidase-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431020 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 601.7 bits (1550), Expect = 2.6e-168 Identity = 311/460 (67.61%), Postives = 350/460 (76.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BKD0 (beta-amyrin 11-oxidase-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490801 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 593.2 bits (1528), Expect = 9.2e-166 Identity = 302/381 (79.27%), Postives = 327/381 (85.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. NCBI nr
Match: XP_008448712.1 (PREDICTED: beta-amyrin 11-oxidase-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 654.8 bits (1688), Expect = 5.3e-184 Identity = 340/460 (73.91%), Postives = 366/460 (79.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. NCBI nr
Match: XP_038905890.1 (beta-amyrin 11-oxidase-like [Benincasa hispida] >XP_038905891.1 beta-amyrin 11-oxidase-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 649.8 bits (1675), Expect = 1.7e-182 Identity = 340/460 (73.91%), Postives = 364/460 (79.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. NCBI nr
Match: XP_011650352.2 (beta-amyrin 11-oxidase [Cucumis sativus] >KAE8650035.1 hypothetical protein Csa_011096 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 649.8 bits (1675), Expect = 1.7e-182 Identity = 341/460 (74.13%), Postives = 359/460 (78.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. NCBI nr
Match: KAA0053060.1 (beta-amyrin 11-oxidase-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK11515.1 beta-amyrin 11-oxidase-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 649.0 bits (1673), Expect = 2.9e-182 Identity = 340/464 (73.28%), Postives = 366/464 (78.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. NCBI nr
Match: XP_023552542.1 (beta-amyrin 11-oxidase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 614.4 bits (1583), Expect = 7.9e-172 Identity = 315/460 (68.48%), Postives = 355/460 (77.17%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. TAIR 10
Match: AT1G05160.1 (cytochrome P450, family 88, subfamily A, polypeptide 3 ) HSP 1 Score: 323.6 bits (828), Expect = 2.6e-88 Identity = 186/464 (40.09%), Postives = 257/464 (55.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. TAIR 10
Match: AT2G32440.1 (ent-kaurenoic acid hydroxylase 2 ) HSP 1 Score: 317.4 bits (812), Expect = 1.9e-86 Identity = 186/471 (39.49%), Postives = 261/471 (55.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. TAIR 10
Match: AT2G32440.2 (ent-kaurenoic acid hydroxylase 2 ) HSP 1 Score: 317.4 bits (812), Expect = 1.9e-86 Identity = 186/471 (39.49%), Postives = 261/471 (55.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. TAIR 10
Match: AT3G13730.1 (cytochrome P450, family 90, subfamily D, polypeptide 1 ) HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 4.5e-40 Identity = 111/422 (26.30%), Postives = 191/422 (45.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi07G012210 vs. TAIR 10
Match: AT3G19270.1 (cytochrome P450, family 707, subfamily A, polypeptide 4 ) HSP 1 Score: 153.7 bits (387), Expect = 3.6e-37 Identity = 131/424 (30.90%), Postives = 190/424 (44.81%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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