Lsi07G011700 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview


Name	Lsi07G011700
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	SANT domain-containing protein
Location	chr07: 17163711 .. 17179360 (-)
RNA-Seq Expression	Lsi07G011700
Synteny	Lsi07G011700

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATTTAATCATCATCATCATCATCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAAAAAAATGGAACTTTTTCCAGCTCAACCAGATTTGTCTCTTCAAATTAGCCCTCCAAATTCATCAACAAATTCAAAACCCTCTTCTAATACCAATTGGAGAAGACAACCCATTTCTTCTATTTCCCCACAAAATCCTCTAGATTTGGTGTTTTGGAACAATAATAATGTTAATAATAATAAATTATTGCCTTCTCCTAATAATTCTTCTTCTAATTCTTCTAATTTTGACCCTAATATTCCTAATTCCTCCAATTTCCTCCCCCACCATTTTCCTCCCACTGCCGCTAGCGCCAATGGCGGTAGCGCCGGGCTCTTCCACCGCCATCTCCACGATCTTCACCCTCAAGGGCTTGGATTCTTGAGACCTATTAGGGGAATTCCAGTGTATCAAAACCCTCCTTCCTCGTCTTCGTCTTCATCCTCTTCTTACCCGATATTCGGGGGTAGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCAGTGGTAGTCAGTTTGGTTATAATGGTTTTCGATCGAGGTTTTTGGCGAGGTTTCCGGCGAAACGGAGCATCCGAGCGCCGAGAATGCGGTGGACCACCACTCTCCATGCTCGTTTTGTTCATGCTGTAGAGCTTTTGGGTGGCCATGAAAGTATGCAAAAGCTTACACTCATCTCTCTCTCTCTTTTTTTTCCCCTTTTCAATCTTTCTTGCTTAGGCTTTAGGAGATGAGAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGAAAATTTTACATTATTATACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGTCTTGAGATTATTTCAAGTAATAGAGAGTTTCAAACTTCAAGGACTTTAATAAATTTTTTGCAGTGATAAGGGCTCTGCAGCAATACTTACTACTTTTTTCTTTTTTTCTTCTTTTTTT

mRNA sequence

ATTTAATCATCATCATCATCATCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAAAAAAATGGAACTTTTTCCAGCTCAACCAGATTTGTCTCTTCAAATTAGCCCTCCAAATTCATCAACAAATTCAAAACCCTCTTCTAATACCAATTGGAGAAGACAACCCATTTCTTCTATTTCCCCACAAAATCCTCTAGATTTGGTGTTTTGGAACAATAATAATGTTAATAATAATAAATTATTGCCTTCTCCTAATAATTCTTCTTCTAATTCTTCTAATTTTGACCCTAATATTCCTAATTCCTCCAATTTCCTCCCCCACCATTTTCCTCCCACTGCCGCTAGCGCCAATGGCGGTAGCGCCGGGCTCTTCCACCGCCATCTCCACGATCTTCACCCTCAAGGGCTTGGATTCTTGAGACCTATTAGGGGAATTCCAGTGTATCAAAACCCTCCTTCCTCGTCTTCGTCTTCATCCTCTTCTTACCCGATATTCGGGGGTAGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCAGTGGTAGTCAGTTTGGTTATAATGGTTTTCGATCGAGGTTTTTGGCGAGGTTTCCGGCGAAACGGAGCATCCGAGCGCCGAGAATGCGTGATAAGGGCTCTGCAGCAATACTTACTACTTTTTTCTTTTTTTCTTCTTTTTTT

Coding sequence (CDS)

ATGGAACTTTTTCCAGCTCAACCAGATTTGTCTCTTCAAATTAGCCCTCCAAATTCATCAACAAATTCAAAACCCTCTTCTAATACCAATTGGAGAAGACAACCCATTTCTTCTATTTCCCCACAAAATCCTCTAGATTTGGTGTTTTGGAACAATAATAATGTTAATAATAATAAATTATTGCCTTCTCCTAATAATTCTTCTTCTAATTCTTCTAATTTTGACCCTAATATTCCTAATTCCTCCAATTTCCTCCCCCACCATTTTCCTCCCACTGCCGCTAGCGCCAATGGCGGTAGCGCCGGGCTCTTCCACCGCCATCTCCACGATCTTCACCCTCAAGGGCTTGGATTCTTGAGACCTATTAGGGGAATTCCAGTGTATCAAAACCCTCCTTCCTCGTCTTCGTCTTCATCCTCTTCTTACCCGATATTCGGGGGTAGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCAGTGGTAGTCAGTTTGGTTATAATGGTTTTCGATCGAGGTTTTTGGCGAGGTTTCCGGCGAAACGGAGCATCCGAGCGCCGAGAATGCGTGATAAGGGCTCTGCAGCAATACTTACTACTTTTTTCTTTTTTTCTTCTTTTTTT

Protein sequence

MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQPISSISPQNPLDLVFWNNNNVNNNKLLPSPNNSSSNSSNFDPNIPNSSNFLPHHFPPTAASANGGSAGLFHRHLHDLHPQGLGFLRPIRGIPVYQNPPSSSSSSSSSYPIFGGSGGGGGGSGSQFGYNGFRSRFLARFPAKRSIRAPRMRDKGSAAILTTFFFFSSFF

Homology

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C616 (Probable transcription factor KAN2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=KAN2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 77.0 bits (188), Expect = 2.7e-13
Identity = 84/222 (37.84%), Postives = 102/222 (45.95%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQPISSISPQNPLDLVFWNNNNVNNNKL 60
           MELFPAQPDLSLQISPP    NSKPSS T  RR+  +       LDL FW     +    
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPP----NSKPSS-TWQRRRSTTDQEDHEELDLGFWRRALDSRTSS 60

Query: 61  LPSPNNSSSNSSNFD----PNIPNSSNFLPHHFP---PTAASANGGSAGLFHRHLHDLHP 120
           L S + S + +  F      NI +      HH P   P   S+N  ++  F       H 
Sbjct: 61  LVSNSTSKTINHPFQDLSLSNISHHQQQQQHHHPQLLPNCNSSNILTSFQFPTQQQQQHL 120

Query: 121 QGL------GFLRPIRGIPVYQNPPSS-------------------SSSSSSSYPIFGGS 180
           QG         LRPIRGIP+Y NPP                      SSS+SS  + G +
Sbjct: 121 QGFLAHDLNTHLRPIRGIPLYHNPPPHHHPHRPPPPCFPFDPSSLIPSSSTSSPALTGNN 180

Query: 181 GGGGGGSGSQFGYNGF------RSRFLARFPAKRSIRAPRMR 185
                 S S   Y+        R+RF+ RFPAKRS+RAPRMR
Sbjct: 181 NSFNTSSVSNPNYHNHHHQTLNRARFMPRFPAKRSMRAPRMR 217

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UHK5 (Putative transcription factor KAN2 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold344G001330 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 9.4e-78
Identity = 163/186 (87.63%), Postives = 169/186 (90.86%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQPISSISPQNPLDLVFWNNNNVNN-NK 60
           MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSN+NWR QPISSISPQ+PLDL+FWN+NN NN NK
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNSNWRTQPISSISPQHPLDLMFWNHNNNNNINK 60

Query: 61  LLPSPNNSSSNSSNFDPNIPNSSNFLPHHFPPTAASANGGSAGLFHRHLHDLHPQGLGFL 120
             PS NNSSSNSSNFDP++ NSSNFL HHFPPT    NGG AGLFHRHLHDLHPQGLGFL
Sbjct: 61  SFPS-NNSSSNSSNFDPSLSNSSNFLSHHFPPT---VNGGGAGLFHRHLHDLHPQGLGFL 120

Query: 121 RPIRGIPVYQNPPSSS-SSSSSSYPIFGGSGGGGGGSGSQFGYNGFRSRFLARFPAKRSI 180
           RPIRGIPVYQNPPSSS SSSSSSYPIFGGSGGGGGG GSQF YNG RSRFLARFPAKRSI
Sbjct: 121 RPIRGIPVYQNPPSSSTSSSSSSYPIFGGSGGGGGGGGSQFSYNGLRSRFLARFPAKRSI 180

Query: 181 RAPRMR 185
           RAPRMR
Sbjct: 181 RAPRMR 182

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CP02 (probable transcription factor KAN2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503150 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 9.4e-78
Identity = 163/186 (87.63%), Postives = 169/186 (90.86%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQPISSISPQNPLDLVFWNNNNVNN-NK 60
           MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSN+NWR QPISSISPQ+PLDL+FWN+NN NN NK
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNSNWRTQPISSISPQHPLDLMFWNHNNNNNINK 60

Query: 61  LLPSPNNSSSNSSNFDPNIPNSSNFLPHHFPPTAASANGGSAGLFHRHLHDLHPQGLGFL 120
             PS NNSSSNSSNFDP++ NSSNFL HHFPPT    NGG AGLFHRHLHDLHPQGLGFL
Sbjct: 61  SFPS-NNSSSNSSNFDPSLSNSSNFLSHHFPPT---VNGGGAGLFHRHLHDLHPQGLGFL 120

Query: 121 RPIRGIPVYQNPPSSS-SSSSSSYPIFGGSGGGGGGSGSQFGYNGFRSRFLARFPAKRSI 180
           RPIRGIPVYQNPPSSS SSSSSSYPIFGGSGGGGGG GSQF YNG RSRFLARFPAKRSI
Sbjct: 121 RPIRGIPVYQNPPSSSTSSSSSSYPIFGGSGGGGGGGGSQFSYNGLRSRFLARFPAKRSI 180

Query: 181 RAPRMR 185
           RAPRMR
Sbjct: 181 RAPRMR 182

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L171 (SANT domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G008330 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 284.6 bits (727), Expect = 3.1e-73
Identity = 159/188 (84.57%), Postives = 165/188 (87.77%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQPISSISPQNPLDLVFWNNNNVNNNKL 60
           MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPS N+NWR QPISSISPQ+PLDL+FWNNN  NNNK 
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSPNSNWRTQPISSISPQHPLDLMFWNNN--NNNKS 60

Query: 61  LPSPNNSSSNSSNFDPNIPNSSNFLPHHFPPTAASANGGSAGLFHRHLHDLHPQGLGFLR 120
            PS +NSSSNSSNFDP++ NSSNFLPHHFPP  A   GG A LFHRHLHDLHPQGLGFLR
Sbjct: 61  FPS-HNSSSNSSNFDPSLSNSSNFLPHHFPP--AVNGGGGAALFHRHLHDLHPQGLGFLR 120

Query: 121 PIRGIPVYQNPPSSS-SSSSSSYPIFGGSGGGGGG---SGSQFGYNGFRSRFLARFPAKR 180
           PIRGIPVYQNPPSSS SSSSSSYPIFGGSGGGGGG    GSQF YN  RSRFLARFPAKR
Sbjct: 121 PIRGIPVYQNPPSSSTSSSSSSYPIFGGSGGGGGGGGSGGSQFSYNCLRSRFLARFPAKR 180

Query: 181 SIRAPRMR 185
           SIRAPRMR
Sbjct: 181 SIRAPRMR 183

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KUZ9 (probable transcription factor KAN2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498429 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 231.9 bits (590), Expect = 2.4e-57
Identity = 141/194 (72.68%), Postives = 149/194 (76.80%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQ-PISSISPQNPLDLVFWNNNNVNNNK 60
           MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSN  WRRQ PISS+  QNPLDLV WNN       
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNGGWRRQHPISSMPSQNPLDLVSWNNK------ 60

Query: 61  LLPSPNNSSSNSSNFDP-----NIPNSSNFLPHHFPPTAASANG---GSAGLFHRHLHDL 120
            LPS N SSS+SSNFDP     N  +SS+FL  HF PTA +ANG   G+ GLFHRHLHDL
Sbjct: 61  -LPSTNPSSSSSSNFDPSPLLSNPNSSSDFLHRHF-PTATTANGDGAGTGGLFHRHLHDL 120

Query: 121 HPQGLGFLRPIRGIPVYQNPPSSSSSSSSSYPIFGGSGGGGGGSGSQFGYN-GFRSRFLA 180
           H QGLGFLRPIRGIPVYQN PS SSSSS SYPIFG  GGG GGSG QF YN   RSRFL 
Sbjct: 121 HHQGLGFLRPIRGIPVYQNSPSPSSSSSFSYPIFG--GGGNGGSGGQFNYNAAHRSRFLG 180

Query: 181 RFPAKRSIRAPRMR 185
           RFP KR++RAPRMR
Sbjct: 181 RFPTKRNVRAPRMR 184

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E6C4 (probable transcription factor KAN2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431165 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 231.9 bits (590), Expect = 2.4e-57
Identity = 141/194 (72.68%), Postives = 148/194 (76.29%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQ-PISSISPQNPLDLVFWNNNNVNNNK 60
           MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSN  WRRQ PISS+  QNPLDLV WNN       
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNGGWRRQHPISSMPSQNPLDLVSWNNK------ 60

Query: 61  LLPSPNNSSSNSSNFDP-----NIPNSSNFLPHHFPPTAASANGGSA---GLFHRHLHDL 120
            LPS N SSS+SSNFDP     N  +SS+FL  HF PTA + NGG A   GLFHRHLHDL
Sbjct: 61  -LPSTNPSSSSSSNFDPSPLLSNPNSSSDFLHRHF-PTATAVNGGGAGTGGLFHRHLHDL 120

Query: 121 HPQGLGFLRPIRGIPVYQNPPSSSSSSSSSYPIFGGSGGGGGGSGSQFGYN-GFRSRFLA 180
           H QGLGFLRPIRGIPVYQN PSSSSSSS SYPIFG  GGG GG G QF YN   RSRFL 
Sbjct: 121 HHQGLGFLRPIRGIPVYQNSPSSSSSSSFSYPIFG--GGGNGGGGGQFNYNAAHRSRFLG 180

Query: 181 RFPAKRSIRAPRMR 185
           RFP KR++RAPRMR
Sbjct: 181 RFPTKRNVRAPRMR 184

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. NCBI nr
Match: KAA0053021.1 (putative transcription factor KAN2 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 1.9e-77
Identity = 163/186 (87.63%), Postives = 169/186 (90.86%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQPISSISPQNPLDLVFWNNNNVNN-NK 60
           MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSN+NWR QPISSISPQ+PLDL+FWN+NN NN NK
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNSNWRTQPISSISPQHPLDLMFWNHNNNNNINK 60

Query: 61  LLPSPNNSSSNSSNFDPNIPNSSNFLPHHFPPTAASANGGSAGLFHRHLHDLHPQGLGFL 120
             PS NNSSSNSSNFDP++ NSSNFL HHFPPT    NGG AGLFHRHLHDLHPQGLGFL
Sbjct: 61  SFPS-NNSSSNSSNFDPSLSNSSNFLSHHFPPT---VNGGGAGLFHRHLHDLHPQGLGFL 120

Query: 121 RPIRGIPVYQNPPSSS-SSSSSSYPIFGGSGGGGGGSGSQFGYNGFRSRFLARFPAKRSI 180
           RPIRGIPVYQNPPSSS SSSSSSYPIFGGSGGGGGG GSQF YNG RSRFLARFPAKRSI
Sbjct: 121 RPIRGIPVYQNPPSSSTSSSSSSYPIFGGSGGGGGGGGSQFSYNGLRSRFLARFPAKRSI 180

Query: 181 RAPRMR 185
           RAPRMR
Sbjct: 181 RAPRMR 182

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. NCBI nr
Match: XP_008465527.1 (PREDICTED: probable transcription factor KAN2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 1.9e-77
Identity = 163/186 (87.63%), Postives = 169/186 (90.86%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQPISSISPQNPLDLVFWNNNNVNN-NK 60
           MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSN+NWR QPISSISPQ+PLDL+FWN+NN NN NK
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNSNWRTQPISSISPQHPLDLMFWNHNNNNNINK 60

Query: 61  LLPSPNNSSSNSSNFDPNIPNSSNFLPHHFPPTAASANGGSAGLFHRHLHDLHPQGLGFL 120
             PS NNSSSNSSNFDP++ NSSNFL HHFPPT    NGG AGLFHRHLHDLHPQGLGFL
Sbjct: 61  SFPS-NNSSSNSSNFDPSLSNSSNFLSHHFPPT---VNGGGAGLFHRHLHDLHPQGLGFL 120

Query: 121 RPIRGIPVYQNPPSSS-SSSSSSYPIFGGSGGGGGGSGSQFGYNGFRSRFLARFPAKRSI 180
           RPIRGIPVYQNPPSSS SSSSSSYPIFGGSGGGGGG GSQF YNG RSRFLARFPAKRSI
Sbjct: 121 RPIRGIPVYQNPPSSSTSSSSSSYPIFGGSGGGGGGGGSQFSYNGLRSRFLARFPAKRSI 180

Query: 181 RAPRMR 185
           RAPRMR
Sbjct: 181 RAPRMR 182

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. NCBI nr
Match: XP_011650330.1 (probable transcription factor KAN2 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN55725.1 hypothetical protein Csa_011538 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 284.6 bits (727), Expect = 6.4e-73
Identity = 159/188 (84.57%), Postives = 165/188 (87.77%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQPISSISPQNPLDLVFWNNNNVNNNKL 60
           MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPS N+NWR QPISSISPQ+PLDL+FWNNN  NNNK 
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSPNSNWRTQPISSISPQHPLDLMFWNNN--NNNKS 60

Query: 61  LPSPNNSSSNSSNFDPNIPNSSNFLPHHFPPTAASANGGSAGLFHRHLHDLHPQGLGFLR 120
            PS +NSSSNSSNFDP++ NSSNFLPHHFPP  A   GG A LFHRHLHDLHPQGLGFLR
Sbjct: 61  FPS-HNSSSNSSNFDPSLSNSSNFLPHHFPP--AVNGGGGAALFHRHLHDLHPQGLGFLR 120

Query: 121 PIRGIPVYQNPPSSS-SSSSSSYPIFGGSGGGGGG---SGSQFGYNGFRSRFLARFPAKR 180
           PIRGIPVYQNPPSSS SSSSSSYPIFGGSGGGGGG    GSQF YN  RSRFLARFPAKR
Sbjct: 121 PIRGIPVYQNPPSSSTSSSSSSYPIFGGSGGGGGGGGSGGSQFSYNCLRSRFLARFPAKR 180

Query: 181 SIRAPRMR 185
           SIRAPRMR
Sbjct: 181 SIRAPRMR 183

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. NCBI nr
Match: XP_004150668.1 (probable transcription factor KAN2 isoform X1 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 284.6 bits (727), Expect = 6.4e-73
Identity = 159/188 (84.57%), Postives = 165/188 (87.77%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQPISSISPQNPLDLVFWNNNNVNNNKL 60
           MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPS N+NWR QPISSISPQ+PLDL+FWNNN  NNNK 
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSPNSNWRTQPISSISPQHPLDLMFWNNN--NNNKS 60

Query: 61  LPSPNNSSSNSSNFDPNIPNSSNFLPHHFPPTAASANGGSAGLFHRHLHDLHPQGLGFLR 120
            PS +NSSSNSSNFDP++ NSSNFLPHHFPP  A   GG A LFHRHLHDLHPQGLGFLR
Sbjct: 61  FPS-HNSSSNSSNFDPSLSNSSNFLPHHFPP--AVNGGGGAALFHRHLHDLHPQGLGFLR 120

Query: 121 PIRGIPVYQNPPSSS-SSSSSSYPIFGGSGGGGGG---SGSQFGYNGFRSRFLARFPAKR 180
           PIRGIPVYQNPPSSS SSSSSSYPIFGGSGGGGGG    GSQF YN  RSRFLARFPAKR
Sbjct: 121 PIRGIPVYQNPPSSSTSSSSSSYPIFGGSGGGGGGGGSGGSQFSYNCLRSRFLARFPAKR 180

Query: 181 SIRAPRMR 185
           SIRAPRMR
Sbjct: 181 SIRAPRMR 183

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. NCBI nr
Match: XP_023539511.1 (probable transcription factor KAN2 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 4.5e-58
Identity = 141/194 (72.68%), Postives = 148/194 (76.29%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQ-PISSISPQNPLDLVFWNNNNVNNNK 60
           MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSN  WRRQ PISS+  QNPLDLV WNN       
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNGGWRRQHPISSMPSQNPLDLVSWNNK------ 60

Query: 61  LLPSPNNSSSNSSNFDP-----NIPNSSNFLPHHFPPTAASANGGSA---GLFHRHLHDL 120
            LPS N SSS+SSNFDP     N  +SS+FL  HFP  A +ANGG A   GLFHRHLHDL
Sbjct: 61  -LPSTNPSSSSSSNFDPSPLLSNPNSSSDFLHRHFPTAATAANGGGAGTGGLFHRHLHDL 120

Query: 121 HPQGLGFLRPIRGIPVYQNPPSSSSSSSSSYPIFGGSGGGGGGSGSQFGYN-GFRSRFLA 180
           H QGLGFLRPIRGIPVYQN PSSSSSSS SYPIFG  GGG GG G QF YN   RSRFL 
Sbjct: 121 HHQGLGFLRPIRGIPVYQNSPSSSSSSSFSYPIFG--GGGNGGGGGQFNYNTAHRSRFLG 180

Query: 181 RFPAKRSIRAPRMR 185
           RFP KR++RAPRMR
Sbjct: 181 RFPTKRNVRAPRMR 185

[Close]

BLAST of Lsi07G011700 vs. TAIR 10
Match: AT1G32240.1 (Homeodomain-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 77.0 bits (188), Expect = 1.9e-14
Identity = 84/222 (37.84%), Postives = 102/222 (45.95%), Query Frame = 0


Query: 1   MELFPAQPDLSLQISPPNSSTNSKPSSNTNWRRQPISSISPQNPLDLVFWNNNNVNNNKL 60
           MELFPAQPDLSLQISPP    NSKPSS T  RR+  +       LDL FW     +    
Sbjct: 1   MELFPAQPDLSLQISPP----NSKPSS-TWQRRRSTTDQEDHEELDLGFWRRALDSRTSS 60

Query: 61  LPSPNNSSSNSSNFD----PNIPNSSNFLPHHFP---PTAASANGGSAGLFHRHLHDLHP 120
           L S + S + +  F      NI +      HH P   P   S+N  ++  F       H 
Sbjct: 61  LVSNSTSKTINHPFQDLSLSNISHHQQQQQHHHPQLLPNCNSSNILTSFQFPTQQQQQHL 120

Query: 121 QGL------GFLRPIRGIPVYQNPPSS-------------------SSSSSSSYPIFGGS 180
           QG         LRPIRGIP+Y NPP                      SSS+SS  + G +
Sbjct: 121 QGFLAHDLNTHLRPIRGIPLYHNPPPHHHPHRPPPPCFPFDPSSLIPSSSTSSPALTGNN 180

Query: 181 GGGGGGSGSQFGYNGF------RSRFLARFPAKRSIRAPRMR 185
                 S S   Y+        R+RF+ RFPAKRS+RAPRMR
Sbjct: 181 NSFNTSSVSNPNYHNHHHQTLNRARFMPRFPAKRSMRAPRMR 217

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lsi07G011700 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9C616	2.7e-13	37.84	Probable transcription factor KAN2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=KAN2 PE=2 ...	[more]

BLAST of Lsi07G011700 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5A7UHK5	9.4e-78	87.63	Putative transcription factor KAN2 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=119...	[more]
A0A1S3CP02	9.4e-78	87.63	probable transcription factor KAN2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503150 PE=4 ...	[more]
A0A0A0L171	3.1e-73	84.57	SANT domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G008330 PE=4 S...	[more]
A0A6J1KUZ9	2.4e-57	72.68	probable transcription factor KAN2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498429 P...	[more]
A0A6J1E6C4	2.4e-57	72.68	probable transcription factor KAN2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431165...	[more]

BLAST of Lsi07G011700 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAA0053021.1	1.9e-77	87.63	putative transcription factor KAN2 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
XP_008465527.1	1.9e-77	87.63	PREDICTED: probable transcription factor KAN2 [Cucumis melo]	[more]
XP_011650330.1	6.4e-73	84.57	probable transcription factor KAN2 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN55725.1 hypo...	[more]
XP_004150668.1	6.4e-73	84.57	probable transcription factor KAN2 isoform X1 [Cucumis sativus]	[more]
XP_023539511.1	4.5e-58	72.68	probable transcription factor KAN2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]

BLAST of Lsi07G011700 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G32240.1	1.9e-14	37.84	Homeodomain-like superfamily protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 59..88
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..38
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 11..38
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 59..92
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31496:SF24	TRANSCRIPTION FACTOR KAN2-RELATED	coord: 1..184
IPR044847	Transcription repressor KANADI	PANTHER	PTHR31496	TRANSCRIPTION FACTOR KAN2-RELATED	coord: 1..184

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lsi07G011700.1	Lsi07G011700.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0010158	abaxial cell fate specification
biological_process	GO:0006355	regulation of transcription, DNA-templated
cellular_component	GO:0005634	nucleus
molecular_function	GO:0000976	transcription cis-regulatory region binding