Lsi06G007040 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi06G007040
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr06: 11220018 .. 11226767 (+)
RNA-Seq ExpressionLsi06G007040
SyntenyLsi06G007040
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGGGTAGTATTTTATCATAGTGTCGAATCCCAAGTTTTTATGAAAGGACATTGGTGTTTGACTAAAATTTGACCATTTTTTTTTTTTTACTCACCAACCCAATAAAAAGATATCTATGGATTGAAATATTTAAATTTGCATTATTTCTTGAGAAATGTGTTTACTTTAGTATTCATAGATTTTAGATCTCTCATTTTTCTACCAAGTCTATTTCCCATGAATTATATGAAATGTTGCCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTCTTTTAAGTTCATTATGAAATGTAGCTTTACATTATTCTTTTATCACTTTGTTTCATTAGGTTTTAATTTATATATTGGATTTCTTGAGATCTTTACCCTATTCAAACAATCACGATGAATGAAACAATAATTTTTTATTTTTATTTTTTAAAGTTTAACTTCAATTCAATCCTCAATTCAAATGTGTAATAAAACTACAAAATTGAGAGTACAACTATAAATTCTTAAACCTTCATATATTAGTAAAACAGGAACCAATTAAATTATACAATTTATGGTTGGGGTGTGAACTGATTTATGATTGTTTTCTTGAGGATAAGAAAATATTCAAGTTTGGGGTGTGATTCATGTTATGAAATGCATGAAATTAGGCCTTTATTTTAGTATTTTTAATGTGAAAAATGAACTCTTGCATGACTTTTATCCCAAATTTGATCTTAATATGTTTAAATGAGCTTACTGAGGACTTATTATGTGTAAAAGATAATTTTTGCGAATTTAGTACAGATCTGGTACATTTTTTTTACAGGTTTTTGGCTAATTTTCATGTGATGCGCCCACAGCAGAAAGTGATGTACCAGCACTGACGAGCCTTAATTTTCTAGATTCGATTCTGCCCAGATCAGCTGTGATTTTCTTGGCTAAAAATCATCGATTCTACCGGGTGAATCCTCAGAATGCAAATCTCGACCCTCCTTAACAAATTTGGAGTCTATAAAAGGCGAGGAAACCCTACGTCTTGAAGACGCAACTCACCGCCGCCGCAATCATCACTTTCTTCTCCGTTTTACTGTCAAATTTCAGCACCTTGGGATTCTTTTCTAAGTTCAAGCCAGTAGTCTTAAGAACGAAAGTTCCTCTGAGGCGTAGCAGCTATAGGATTACTCTTCCATAGAAGTGTGTGTTGAGGCAAGATTCTTCCTTGAAAAAGAAGGAATCGTCCTAGGGAAAGACTTGTTACTTGAGGATCTTCCCAAGTTTACTTGAGTTGTATCTATTCTCTAACTTTATTGTTTTCTTGTTGTTTTTCCATTTTACATTCTACAAATCAAACGTTATATTGTAGCTATGGTTTATGATTTAATAAAAATGATTATTTTATCAAAAGTCATGAGCTAAATATTTATAGGGGTTTGACAATGTGAAAGTCTTAGGGTTGTTATGACTTAGGTTATGTAATGCTCACACCACTTTGTGTAATCACAGTCTCTTTGTTGATTTTAAAAGACAAAATCGGTAAGTTAAACTGGTCATTTGATTTAACGATCTAGCGGAGCTTTAATGCTAAGAAGGTTAGGGTGTAAGCGGATTTCACAAAGGGATATGGGACTAAGAGCCTAGACATAGGATGGTCATGTTACCTTAGAAATAAGGGACACTATAGGATAAAAGAATTGAACTTGATTTAATCTAAGATCCAGTTAACCATGGAAACATTAGGCCTTAGCTGCTTAGAACTCCTAAAGGAACTTGACACAAGACCAAATAGGTGTAGTTTCCTGTCCATGTGTAAATCATTGTTTGGTGTGATGTGGTCATATCACTTAAGGCATAACACCCGAATGGTTGTAGCATTGTTTGTCCCTATTTGATTCCCATTGTTATTTGTTTTTAAGTTTTCTTTCACAAAAAATTCTAAACTTTTTCTTTGGTTACCCTGGTTACATTGGTCCATAGTTACAATAAATTTAAACTCAATCTAGTCCTGAGGGATTCGACACTTGGAATACTCCAAGTTATTACTTCATCGATTGTGTATGCTTGCACGTAGACCTTGCTCATTCTATATTTCTTATCATTTTTATCACTCATAGACGCTCGATTGATCAATTTGAATAAGATTCAAATAAGAAATATATTAGGAGAAGTAAAATATAATTTAATATATTTGTTTTAATATAAGATATTAAATTATAAATATATTATTATTATAGTTTCCCTATTTAGGTCACTATAAATAAGACCTTTACGAGGGGTTGAAAAAAGAATGATGTTAATTAGAAATTTATAGAGAAAGAGTTCGGGTCTCACAAGCCTTTATTCTTGTCAAAGGTATAACAAGGAAGATCTTGTTAAGCAGATGAAGATTCAACCTTATGGAGTTGGAGCGCAAAGCCAACATGTTTTCCAAAGGCATGTAATTTGCTTAACCTTATATTATCTACATTTAATTCTAAATAATATCAAAGTATGTTCAATAATTCCACTATAGGGTAAATTGTTCATCTCCTTCAGGTAGTTCTTTCGCCCATTATCCTTTCAGTCCTTCAAGCTGTCTTTAAATTTCATTTAATGATTTTATTAACTGCTTCCATCTATCCATTTGCTTGGGGATAAGTTGGATCGAGATGAATATCGATGTGTGATGTTGAGATATGAGCAAAATTTCTTGAATGTCAAGTTATCAAATTGCTTTCCATTGTCTTTGATGATTGTGTTGGGGATCCCAAATCGACACACAATATTTTTTCAAATGAAGTTGGTCATGTTCTTATCTCTTATAGTTGCAAGAGTCTCGACCTCGACCCACTTTATAAAGTAATTCACTGCTACTGATGCAAACTTTGTCTATACTTTGCCTTGGAGGAGTGGACAAATTAGGTTTATTTCCCATTGTGTAAAAAGATCATGGACTCAGCAATTTAGGTGGTTGTCTTGGGACTGGTGCATATTATTGGCATTAGTCACATGCTCTCACAAAGTCTCACACATCTCAAAGCATGGTCATCCAATAGTGACCTTCTGTAATGATTTTGTAGCATAAAGATATGGCTCTCGAATAATTGCACATATCCTTTCATGAATTTTCCTCATCACATATTATATTTCACTATGTATAAGGCACTTCAACATAAGCAACGATTAACTTCGTATATAAAGCTTGTTATCCTTTAGAACATAATATGATGCTCCATCTTTCAAATATTTGGTATTTGGATCAATTGTGAGAAGAGGAAAGCTATCCGTAGGGCAAGATTTATTAAGATTAGTAAAATCTATACACATTCGCCTCTTACTATTTGCCTTCTTTACCAATACTACATTAGGCAACCATTGGGGGGTAATGGACTTCTATAATGAATTTGACCTTCAATAAACCATCTACTTGACTTGCTATGATCTCGTTTGCTCTTGAATAATCATTTTTCGCTTTTGCTTTACTGGCTTGAAATCTCTATCTACATTAAGGCAATGTACTATTATGCTGGGATCGATCCCAGACATATCCTCATGTGACTAAGTAAATATATAAGCAATCTGCCTGAGAAACTTGATTAGGCTCCCTCTTTGTTCTTCTTTGATTCTAGTTCTAATATTTACCCTCCTATCCTCTAAGGTGAGAGGGATTGACTCTAAAGCTTCTACCAGTTGGCTTCCTTAGTTGGCCTCGACCTCTTCCCCTCGGTTGGTGGACTAATCGTTTCTTCTTCCTTTTAAGGAATTAAGGGTCCTTTTTTATTCGAGTTACCCTTCCTATCCAAGGGAAGCCTGACAAACCTATTTTGATTTGGCTCTCCTTCCTTCACCATCCTCCTTGACCGTTTCTTCAGTATGTAGCTTTCAAAACCTTTTATTTTTCTAGCTTTGGGTCGTGGGATCTGATTCACCCACTCCCTTTTCCAGCACTTCAATCATCTTCTCAAGTTGACCCTCATGTGGCAGAGGCCAAGGAAACACTTCATCTCGAATCCTCCGTGGGTGACGATATTGATCGAAGTCATCTTTGCATTAGTTGATATTTTCAATACTCCTGCTCACCCTTAGGGAATCCAGCAACAAACTGGTGCATAATATTTTTTCTTCCGCACAGACGCCGTCAACTTTTGATGCCAAAATTAGGCTAAGTAAAGTGGTTTGACCTCCATGTGGCAGCAACGATAATTTTTATTTTTGTGGAAGATCACCTGCAAACTAACAAAAAGTGCACATCGGAGGGGTGTAGGCTACGTACACCCCGATGCTTAAATGAGAAGTATGAAGATTCGTTTTGGATGGATGAATCCTTCTCAATTTAGGTTTCATCCTTGAGTTTATGAACGTCCTTTTTCACCATAGGGCAACACTTTGCGATCTGGTTCGGCTTGGTGGGCATAACCTTGACAGAGGTTGAGGTCAACTGGGCTGAATTGGCTTTGAGCCAAGTGAACCCACCTCTAATGGCCTACTAGTGTTCTTTCCAAGATGTGTGATGCATCTGGCTAAGGCCAACCATGCCCAATTGGGCTTGGGTTGAATTCAATCCCTTCCTTTGTTCCATTTCCTCCTCTTAGTGTAATAGCTTGTTCATTCAATTCGTTTTCTTAGCTCGGTAACTTCCTTATTTCTATTATGTCACTTTTACCCTTTAGTGTTGAAATTACCCATAACAACAATTATAAAACATATATATTTCTTAGAAATCAAAAAGTCAACACTACAACAAAAATGAGCTATAATGTCAGTCGAAAACCCACATTATAAGGGTACGATGTCGGTCAAGCGACTATCAAAGAACGTGTTATTAAAGATGTTCAATGTCGGTCGCCTTTAATGTCGGTTTTCGACCGACATTAATGATGTCTTTAATGTCCGTTTTCGACCGGCATTTAACACTAAAACCTGTGATCGACATTAAATGAATCTGCCTATTATTAAATATTAATTTTTTTGTGACAGGCAATGTCTGTCAAAATTGCTTTCTTAAAAAATTGAAAAAAAAAAATTATTGGTTGCATATGTGGCTGACTAACAAAATTAATATTTCTAATAAAAGTAATATGATATTTGTATACACCCTAACTCAACTTCCAACAAACAAAACAATTAAATAATTCACTCCAACAAAAGTAATGTGATTATCCGTCTCTCCACAAACTACATTCAAATTACAGAGATAAACAAAACCTTAAATACAAGACCCTAACTATAATAAATACAAGACCCTAACTATAATAAATACAAGACTCTAAAACCTTGAATTACATGTTTATCCTTAGTAATTGTCTTTTTGAGCGTTAAATATTTCATGAAGGCCCATCATCAGTTTCACTATATAATTTTTTAAGCAAAAACCTGCAAACAAAATTAAGCTCAAATTAAAATATCCCCATCTCATAAATAAATAATTAACTATAATAGATGAAATTTGAGCCATTTACATTTGAGAAAATACAAAGAACAAGATCTTAACAAGCACTTAATATCAACATAATAGTTCTAGAGAGATCTTAGCCTTAGCTTCAAAATAGAAACTGATCACATCCAAACTTTAAATTACATGCTTGCCTCTAATAATTTTACCTTTTTTAGCGTTGAATACTTCTTGAAGTCCTAGCATCAATTCTACCATACTTAGTTTTTTCTTATGAAAATCGCCAGTTTCATCACATGCAACTTAAACTCAAACATCTTCCTATTGCCATCCTGAATGTTTTCAAATGTAGCTTCATCAGACTTGTGTATCAAATCATGTGCTAGAAGAGAAGAATGAAAATAATCAAAAACCTTTTTTTCATCATTGTCAACATTCAAAGGATCACCTAATATTGTTATCCTATCTACCAACAAAAAGAGAAGAGTATTAAAACTAAGAACTTTAAATATATGAATCAAATTTCACAGAGGATAATGGACACAATATTATGATATCACGTACACGAACACGATCCACAAAGGAAAGTAGATCTCCATGAGTTAAAACTGAAATAAAAACTGAAAGTATTTTCAATTTACCAGAGTCACCCTTCGGAAAGGAAATGGTAGCTCCCTGCAACTTTCTTCCTTTGAACTAAGCTCCCTCATCACTCAAACCATCAACCTCAATTCCTTCAATAGGTAAGAAAAAAATGAAAAGAACTACTCAGTAAACTACAAACAAATTACCCAAGTATGTAAAGTGAACTAGAAAAATCAGCAAAAATTTGCTAGACATATATATCATGCTTTGTGGAGTTTGACTGTAGTCTTCCAAGAAAAATTCCATTCAACTCTTAAACATATGTAGATTTACATGTATTGCATTGTGTTGTTTTATGCTGCACTACACATAATAACATACAATGCACCATATAGTGCACACATCACTTCCCAAACAGGGGATAAAATAAATAAACAACTACATAGTTTACTAACCAAGTATTCAGAGAGTATTCAGTAAACTACAAACAAATTACCCAACAAAACTTATTGCATCTTGAAAGAAATTTGGCATTGTATCAACCTACTAAATTCAGACAACATTTATACTACAAAATTCAATCAATAGAAGACGTAGAGAAAAGCTACCTTTGGTTTTTTTACGTGGATTGGCAATTGAGTGTCACAAAATTCTACCTTTTACCGGTGGAAGAATATTGAGAAGAAGAAAAAAAAGTTCATAAATAGTTCATAAAATGAAAGATAAAATGCAAACTCGAAGGTTGACGATATGGAACAGAGCAGGAACGATTGACGAACACTTGATGGAGCTCAGATCTGGAATTGGAGATGTCACTTGA

mRNA sequence

ATGAGGTTTAACTTCAATTCAATCCTCAATTCAAATGTAGTCACCCTTCGGAAAGGAAATGGTAGCTCCCTGCAACTTTCTTCCTTTGAACTAAGCTCCCTCATCACTCAAACCATCAACCTCAATTCCTTCAATAGGTTGACGATATGGAACAGAGCAGGAACGATTGACGAACACTTGATGGAGCTCAGATCTGGAATTGGAGATGTCACTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGTTTAACTTCAATTCAATCCTCAATTCAAATGTAGTCACCCTTCGGAAAGGAAATGGTAGCTCCCTGCAACTTTCTTCCTTTGAACTAAGCTCCCTCATCACTCAAACCATCAACCTCAATTCCTTCAATAGGTTGACGATATGGAACAGAGCAGGAACGATTGACGAACACTTGATGGAGCTCAGATCTGGAATTGGAGATGTCACTTGA

Protein sequence

MRFNFNSILNSNVVTLRKGNGSSLQLSSFELSSLITQTINLNSFNRLTIWNRAGTIDEHLMELRSGIGDVT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi06G007040.1Lsi06G007040.1mRNA