Lsi06G003420 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi06G003420
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr06: 3790494 .. 3794276 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi06G003420
SyntenyLsi06G003420
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAAAAGTACGCAATTCAACCTTGAATTAAAGAAATTTTTTAAACTATTCAGACATTGAATTTGTCGATTTAATTGATGACAGATTGATCCAACCATAAAATATTTAGATTCGGGTTGATTAAGTTTGTTTTTGTTTCTTGTTGTACATATCTTGTCTTATAAGTAAGTATTATTATACAAATAATGGGATTAGTCTATATTCAAATTTTTGACATTTTGGTCAAGTTATGCCCCGACTAGATGAGCTATGAGCAAGCTATTTAGAATCTCTATTGTTGGTTGTAAGTTTGAATAATCCACTTTCTTTTGAATTGTAACTTTTTTTAAAAGAAAATGACTAACTCAAAATGAGTTTGTCACATGATGTTAATGTAACTAAAATCGTTTCAGTGGATGTGATACGTAACATATGTCACTTTTTTTTTTTATTACATGTTGGGTGGCGAAATCGAACATCTGACTACAAGTACTAAGTTAGTTAAGTTATGTACATTTAGGCAACATATGTTAACTTTCTACTATTGAAGGTGAAATCGAAAATGTTCAAAATTTAAGGAATAATTTGACATAATAATGCATAGTGTCTTTGGCAAAAATTTATTTGTTTTTTAATCTCTATTTAACTTTATTAGGTAATTACCAACAAACAAACGAAAAAGTCAAGCATTTATTTATTGATTTATGATACTTTCAATTACAGAAAGAAAAGTGGACCTTCTAAAATGGAAAAATAAATATGGCGAATATTTATTTCTCAACAAAAAAAACTTTAATTGAAGGAAGCAGGAGATTGGAAATAATTAGTTGGAAGCTTTTAATGGGAACTAGGCCCATTTACTTCAAGAAAATGAAAATCAAGGAAGTTTCACGATCCACCACTAATTTGAAAATCTTTTATTCCGTAAAAGAGATAATAGCATTCCTCTTTAAAATCGATTTTTTTTAGTTCAACAATTGGGGTAGGAAAATTTGAACCACAAACCTCGTAGTTACTATGGTATTTTCATTAGGGTTGACAATAGCATTCCTCGTAGTTGGATGTCAATTGAGCTAAGCTTTTGTTGGTAATCGAATTTTTTTGTTAGTATTATGGTATTTTCATTAGGGTTGACAATGGGGCGGGGCCGGCATCCCCGTCTCCATAGGATTTGTGATCCTTGTCCCCGTTCCATTCTCTGTTTTGAGGGTTGGGGAATCCCCGTTCGGGGATCGGGTCCTTGCGGAAAAAAATTTCAATTTTTTATTTTTATTTTTTTAGTTTTTATTTGAAATCAATTAAAAATCAATATTTATATTAAAATTATAAATATTTTAGACAACAAATTAGTATTATTATTGTTTTATTTATTTAAATTGATAATAAAAAAAATTTTAACATTTGTTTATTATAGATTTAATAAAATCTAAAAGTTAATTATATTGAAATGAAATTTGAAAAAAAAAAGTTTAAAAAAATAAAGAAAAGCTACTGTTTTAAATATAAATAAATATATAAATATACATACATATATAAATAAATAAATAAATATATATATATATATATAAATAATAAAAATATTCGGAGCGGAGTCGGGGTTGGGGCAGGTACTCGCGGAGATTTTGGCCAACCTTAATTTTCATACTTTTTTTATTCCTTGTTTGCCATAAAATAGTCTTTTAATAATGGCGTGGAGTTCAAAATGTAAAATAACGTATCACTGAATAACATATCAAATGTTGAATAGAATGAGTTTAACATTTTCCTTCTTATTATTTTGTGGTCTTTATAACATTTTCATTAATTATTAATATTTTATTCTTTCTCGACCTTTATATGGATTCTCTTACAAATTTTTTCTTTAGCTTTTTTATTTACACTAATAGTTCTTCTAATAGATAGAGGGGGGAAATCATTTTTTTTGCATGGTATCAATTTTCATACTAAATTTTCAATTTGATCGATTTGCAGCTCAAACTTAAACGAGTGTTGCAATCTTAATATTAAATTTTGAAAAGAAAAAAAAAAAAGAAGAGAAGATAATCTTTCTTTCTCTACTTTTATGTGAATGCTATCTTGAATAAAGAAAAGGCTTTCTATTTGGAATGGTTGTTCAAAAGTGTAAACTTCAACTCAAATGCGATAGGATTGTGCATATAAAATCTCTAATTTATGAAAAAATTATTAAATAATTAATTTATAGGAAATTTTTAAAAATAGAAAAATAAAGAAAACTATTTACACAAAATAGTAAAATTTTATATAGTTGTATAGATGCGGATAGAAGTCTGAAATATTATTATTATTTTCATTAAATATATGATCATATTATTTAATAATGCATTTTAGTTAGTAAAAGATATGAGAAAATTCACCATTTCAGACTTCTATCATTTCTTTTACGGTTGATAGACTTCTATTAGCGTCTATCACAATTATCTAAAAAAATTTACTATTTTGTGTAAATAGTTTTTCTTATTTTTCTATTTAAAAATCTTTTTTGAAAATTTATAGATGACATGCACAAAAAATTACTACAACATACCTATACAAGTAGAAATTAATATTAATTAAAGAGAAATAATATTGCAATAGTTTCAATGCAGGACTTTCTTGAATCACTAAATTTAAATTTATATTATCTAAGACTTATAATTATCTAAAAAAAATCTTATGGAATTAGGGTTTTTCAAGAAGTAGAATTGAATCGGTACTTCAATTGGAAAATCATGATCATAGCAGTAGATTTCGATTTTCATCCCGAAACCGCCATTTTCGAATTTCAAACACAGAACAAAGAATGTAGAAGTTCGATAAGAATCTTGAATCGCGATAATGGGTCATACTCTGCTTCTCCTGGCTCCGCCAAGGCACTGAAATGTCGACTGTTCTCGAAACTGGTGGCTATGGTAGGAGTTTGAGATACCAAAATCTTTCCAGAAAAAACGTGTTACAACATGTTTTCATCGGCGAATGAACAGAATTAATCAGACATCAAGAACTTGGAACTTTAGCGATAGCGTAAAATGGAATTGAATTCGTCCTCGAGTTTCGAATCTGAACTTGAATCTCCAATCCTCAGCAATGGTTTTCCAGTTGAGTACGTTACTAACCCCACTTCCTTTTTGTCTTTGTCATCTGTTTCTATTCTATTCGATTCTTCAAATAGATCATACCCACTCCGTCACCTTCAATTCCAGATTCTCGGAGGCCCATATCGTTATTTCTGTTCATGTGATTCTCCAATACCTAATAATGGGCCAGAGATTGGGTGTTTTTCAGTTTTCATTACAATTTGATTTGATATCAGGCCCGAGTATGCTCTTAAGCCCGCGTCATGCTCACACGCACACCAACTGTTTGTAGAAATGTCAGGTATTTTTCTTTTCCCCATTTGTTTAAGTGGCTTGGAGCTTTTTACTTTTCAATGAATATTATTCAATGTTTACATTACATTAATCTGTAGTTTCCTCTTTGTCTAGCTCGAGATGCTGATTCGTCATATGATCTATGCCCTTCTCCATTTTCTAGGCATTTCTCCTCCACGTGCGTTCTGAGCTTACCTACTTTCCATTTTGCTTCTTTGCTATACACCATCTCTCAACACTGAAAACAGCTAAAGCAAAGACATAGAAACTTACTTACTTATGTTCATTTCTTTTTACTCTATTAAGGCTAAAGAATGAGCAAACTCCAAAATCTCACTTGAAGGAAACCCAGATGCCTATACTTTGCCAATTAGTCTTATACAGGTTTAGGCACGCCAGGTACAGGCTTTTCTCACAGCCGTCTTTACATTATTAA

mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGAAAAAATTGAATCGGTACTTCAATTGGAAAATCATGATCATAGCAGTAGATTTCGATTTTCATCCCGAAACCGCCATTTTCGAATTTCAAACACAGAACAAAGAATGTAGAAGTTCGATAAGAATCTTGAATCGCGATAATGGGTCATACTCTGCTTCTCCTGGCTCCGCCAAGGCACTGAAATGTCGACTGTTCTCGAAACTGGTGGCTATGCGTAAAATGGAATTGAATTCGTCCTCGAGTTTCGAATCTGAACTTGAATCTCCAATCCTCAGCAATGGTTTTCCAGTTGAGTACGTTACTAACCCCACTTCCTTTTTGTCTTTGTCATCTGTTTCTATTCTATTCGATTCTTCAAATAGATCATACCCACTCCGTCACCTTCAATTCCAGATTCTCGGAGGCCCATATCGTTATTTCTGTTCATGTGATTCTCCAATACCTAATAATGGGCCAGAGATTGGGCCCGAGTATGCTCTTAAGCCCGCGTCATGCTCACACGCACACCAACTGTTTGTAGAAATGTCAGCTCGAGATGCTGATTCGTCATATGATCTATGCCCTTCTCCATTTTCTAGGCATTTCTCCTCCACGCTAAAGAATGAGCAAACTCCAAAATCTCACTTGAAGGAAACCCAGATGCCTATACTTTGCCAATTAGTCTTATACAGGTTTAGGCACGCCAGGTACAGGCTTTTCTCACAGCCGTCTTTACATTATTAA

Protein sequence

MKKLNRYFNWKIMIIAVDFDFHPETAIFEFQTQNKECRSSIRILNRDNGSYSASPGSAKALKCRLFSKLVAMRKMELNSSSSFESELESPILSNGFPVEYVTNPTSFLSLSSVSILFDSSNRSYPLRHLQFQILGGPYRYFCSCDSPIPNNGPEIGPEYALKPASCSHAHQLFVEMSARDADSSYDLCPSPFSRHFSSTLKNEQTPKSHLKETQMPILCQLVLYRFRHARYRLFSQPSLHY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi06G003420.1Lsi06G003420.1mRNA