Lsi05G017000 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview


Name	Lsi05G017000
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Unknown protein
Location	chr05: 24557542 .. 24564826 (-)
RNA-Seq Expression	Lsi05G017000
Synteny	Lsi05G017000

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGAAGTAGTGATGAGAACGGAGCCACGGGAGGCTTGGGATTTGACTTTGGAAAGAGCCTCGAGGATGGAGGCGATGAAGGAGGGGCTGAGGCGGTGGTCGTCGTCGCCGGTCAGAGTTAGGATGAAAAGATTGCGTCGCTTCTCGAGTGTGCACATTTTCGGAGTGTTGCGTTCAACCAATTATCAGATTCCTTTATTTATTTATCTTCAAATGGAAATAGTGATTGATCCAAAATTAACGCAATCTTTATCTTTACTTTTATCTAATTTATATTTAAATTCAATTCCGACGTTTGTTCCAAATTTATCTTTCAAGTTTAAATTTTTTACTTAGTGCTAGCAAATTTTAAGCTTAGATTTTTTTTTTTTTCCAATGAAATATAAAATATGTGTAATTTCTCAAATTTAGGTTCCTAAAATTAAAAGGATTTGAATATTGAATTTTGTTTCGTTATTAAACTTTGAAAAACGTACAATATATTCTTATCTTTTCCTTTTGTATTTAATAAATTTTGCATTTATGTGTATGATTCACCTAATTATCTAATTAAAATCTGGAATGCAATAAATGTTTTTTTAAAAAAATTGAATTATTATTATTTTTATACTATGTTACAAAAAGTTGCATGATATAAGTGCATCCTTAGGTTAAATCTAATCATGGTGCTTTTTTAAATTCTATTATACATAAATTTTGATTTAGTGTCTTTTATTTTTTTTAAATGAATAAAATGATTTTGAAAACTGATGCACGATAATGTTGATACTACCCTTTCTAGACCTTTCCAATAAAATCTTGACCCCAGTTTGAGAAATAAGTTTTAAGGTCATATTTTAATTTAAACTAAATTATAAAAATAATGATATTCAACTTTGTACTTTTGTGTTAAAAATATTCTTCAATTTTTTAAAGTTTTAAAAATACCTTTAAATTTTAAAATAGAGTTAAAAAAAATACTCTTATTATTAGTTTTGGATAAAATCATTAAAGTTTTGTTTCAAAAATAATTTTAAACTTAAAAAAGAATTCAAGTTTAAGTTCGTATATTAAAAGAAACGATTGATACATTGTTGTAAAAATAACTCTATAATTAAAAAAGATTAAAAAATGCTAATTGAAGGAGGAATTTTGGACCATTCATAAATATTTTTTACTTTTCAAATTAATGACGAAATTATAAATGATTGAATTTGAGACTAATTAAAAGTTTACGAGTCCCAAATTGAAATCGATGACATAATTGACAAATTTTGATGATGTCATGTGTTTTCATCGTGACCATGGGATCGAATATAATTTGGTCTAATTTGATATTAATATTTGCGCTAAAGTCCAATTGACCTAAAAAAAATAGGTTTAATTTGGCTCAAATGCCAACTAAGACGTAAATCCATTTAGTTGGGTCCAAAAGCCAGATCCATGAATCAATCAAGTCCAAAGGTTTATAAAATTTATCCTCAAAGAACTTATATAAAATTCTTCCTATAATTAGAAGATTAACACTTGAAGACTAAAGTTTTTAGAATACAAACAATATTTCAAGACTTTAACTTCAATAACATCAACACGAGGTGCAGAGCTCTCGAGACAAGTCAACACCAAAAACAAGTTGCAAAGCTTTCGAGACAAGTTCACTTTTTTTTTAGAGAAAGAATCAAAAGATCATTTATTAGATATTGTACTCAAAATAATAAAAATATACAAATTCAAAATTTATTTTCAACTAATTAAATTTATCTGAAAGTCTCGACAAACAACTCCTATTGTTAGTATGTTGATAAAATTGTTTGAAGTTTTATTGAGTTCTAGAAGAACCAATTTTAAAACAAATTATATTGATATCTCTCAAATTATGGATTCTCCCATTTTTCTCCTATTTTTCCAAATCTTACATTAATTTTTTTTTAAAAAAAACAACATTTTATGTTAAAACATAAAATCTCACAAAATTTCAAAATCAAAATATCCCTTTAAAATATACCAAAATGATAAGTAGTCAAATAAAAGTGGCTATTAACACACACCTACTACTAATGTACAACTTTGTTAAAACATTTAAGTCATAAAATCTATTAGTGCTTCCATTATTATCTTTATTCTTATTATCGACCATATACATTAAGTGAAGTGTGTTTTAAAAATGGGAGTAATAGGGTATTAAATAAGAGAGAGGAGAAAAAGAGGGAAAATAGAGAAATAAGATGACATATTAATTGTTTTTTTAAATTAAAGATATTTTTTAAACTTTTGAAAGTTTTCGTTTCCATCCAAACTAACCATCGTCCAACTAACAAAAGAAAGAGAGACACATTTTGTATAGTAAAGATTAAAGAAGATAAAGATACATGCATACTCATTTTCCAATTAACACTCATCATGGAGCTTGTCATACTTAAACTTCAAAAGTATCTCATAGATTCATGAAGTTATGCATATTGATTCAACCCTAAAAATTGCATGCACTAAACTTTGCTGTAAGCTGGAAATTTTTTAAAGTTGAATGTATTTCACATGAACCTAGAGTTTACTAAATTTATAGTTTTAACTTTTGCCAAACTATTTACAATTTAACTTAAAATGAAAACTCTAAACTAAATTTTTTTTAAGGTTAAATATATTTGACACAAACATAGAGTTTACTGAACTCATAATGCTAAAAAAAATTTCTCACAATCCGATCAAAGCTTAGAAATTGTTATGACCTTCGGGGTAAATCCAAGCAACCCAGAGATTTCAGGATACAAGCTCTTCCTAATCTCGGCGTAGGCATCTCCATCCCAATTCCTCTCCACCAGCTCCTCCCCAAGTCGCACCGCCGCCTCCATGACGCCGTCCTCCCCGTGGTGTGTAGATTCCGCTACCCCCATCCTCACTGCGGCCTCACCTCTTACTTTCATCCCCCTCAAGAACACATCCCGCCTTACCGAACTCGACCCGATCTTGGACTTGGCTAGAGCCATGAAGTAGTCCGGGAGACTGGCACCCAAGTCCAGCTCGCTCATGTACAACACGCCTCGGTCGCTCCTCATGAGCATATAGTCGTGGGAAAGCGCCAAGAGGAGGCCAGCGGCAGCAGCATGGCCTGGGAGGGCGGCTACGGTGGGTAGGGGGAAACAGAGGAGCTGAGCCAAGAGGGACTTGAAAAGCTGGATCATGTGGTTGAGGCGGTTTCGGGCGACGAATAGGGAGGAAGCGGAGAGAATCCAGGGAAGATCGAGGCCGTTGGAGAAGAATTTGCCTTGGGAAGTTGTGATGAGAACAGAGCCAGGGGAGTCTCTGGCTTCGGCCTTCAATTGGGACAGAGCTTTGAGGATGGAGTTTATTAAGGATGGGTTCAGCCAGTGCTCGTGGTTGCCGGTTAGAGTTAGTATGAACAACTTCCCACGCTTCTCAACGCTGCACATTTTCAGAACGAAGGTTTCACCAATTATCCCTCGATCCTCTCCAACGAATCACCACCATTTATCAAATTTGCCAAATAATTATAATTTTAAATTGTGGATAATGAAATGGAGCAATGATTAGGTGCATCCTAGCACAATGCTCCCCTCCCCTGTACCACACAAATAAAAAAAAAAATACAAAAATATATAATTTTAAAAAAAATAAAAGTGCAATGTGGCACATTCTAATTGAATGGCGATAAGTGTAGTCAAGCTGCACCTAATTTTTTTCCAATGAAATGAGTTGTCTATTTTTTATTGTGGACATCCATATTCATTATCAATAATCCAACAATTATTTGATTCTTGATGACATACAAGGTGAATTGTCGTTACTCACGTTTCTATGCTCCAGAATCCAATTGTGAGACAAAAAGTCCTAACAAATATTTTATTCATCACGAGAGGTACTCCAAAACCCTATACATCTAAAAAAAAAAACTATAATTTATTGGTCAAGTAACAATCTCATTTTTCAATTTTTTTTTTTATATTTTAATTAACAAGGGAAACTAACAAATAAAAGTAGATATATCTACTTTTAATTGGTGCACACATTATTTCTAATCAACCCCCCTCCCCCCTTTCATCTATATTATGTAGGATTGTATATTTTGCATAATTCTTATGCTAGTAATTCACTACTTAGAACCATATAATTTTGGATATGTTTTTTTGTATGGGGTTTGAAAGATTCTACTAATTAAGTAGACAATGTAGTGATAAAATTATATTCTTTTATATAAACTATGATAATTTTCCGTTTTCAATCAATTGAATCTTCCAAACAAGATCGGAGAATCTTAATAATTAGTGTGATATTTTTTTAAAGATCAATTGAGGTCATCACGAAAATCAAAACAAAACAAACAAAAAACCCAATTTTAAACATATTATAGTACTAAAATTTCAATATCCAAATTTGTCCAGCTAAGCCAATTGATGAAAACAGAGTCCAAAATTATTGATTATACTTTGCAACAGGATCAACCAAAATACTCGCACACGACAAACAAATCCACCAAAATGACACGTCGAATACAAATACAATTCCTTTAGCTTTACGCCATGTTTACATCTTTCCATTCAATTCATTAAGTAACGGAGACATTTTAGGATACAGACTCTTTCTAATCTGTGCGTAAGCTTCTCCTTCCCACTTCCTCTTAGCTAACTTCTCCCCCATCGTCACCGCTGCCTCCATCAACGCCTCCTCACCGTCATGCACCGCGTCAGCAATTCCCAACTTCACCGCTGTTTCACTATTGACCTTCATCCCCACCAGCAGCATGTCTCGCTGGACCGAAGCTGAACCGATCTTTGACCTCATCAACGCCGCAAAGTAATCCGGCATGGTTAAACCCAAGTCAATCTTACCAAGGATGTGAAGAATTGACAATGTCAGTGTTGTGCTAAATTACAAGTTTGGTCATTAAATTACTTTCAATTTGTGTCTACCAGTGTGATTATGAGCATAATTCAAATAATTAAGCCATATACTATCAATCAAGAAGTCATTAATTTTAAATCCTTCGTCCCCTATATCATTGCTTATAAGAAGAATTGAGTGCATACTCTTACTAAAAGTGTTCTCTTAAAGAAGACAGGGCAAGCAAATAGGGTGCGATTAAGCTTATTTCTTCTCTTTTCTATATTCTTTTTGGTGGATCCTTTCTTTTTTGTACGAAAGAAAATAATGATGTTGTAAGTCAGAGTAGATGAATTGCTTGTGGTTTGCTTAATTGGACATAATAGCCGACCTCTTTTCCTTTATGAGTTTTATAAAAATACTAAAAAGATAAGGGGTTTCGAACTAAACAAAAAATTGTATTTGACGTGTTTTTTTTGTTTCCTATTAGTTTCCTATCGATCTGAATCTATAACTTTTTCATCCAAATTATAAACGCTTATTAGTTGGTTTGTGCTAAGGTTACTCGACATATTTAATAAGATGATTAAACTTAAAATAAGTATCTCAATTTTGTTCGTCTAATAGGTCTCTATCATAACCATAATCTAAGCATAGCTCAATTGGCTAAGTCATTTGCCTACAACTAAAAAGTTAGAGGTTAAAAAAAAAGAGTCCTATCATAATTTACCTTTTAAAATATAAAAGATTTAGCTACCTCAAACATTTAATTTTTATCGATCTATAATTTTATTTTTTTTATAATCGTGAGTGTTTAGGCCAGCTTACGCGCACTTCAACTAATCTCACATGACAACCTACCTGACTTTGTAACATTTGGGTGTCAAGAAAATGCGTAGGATATTAATTTATAAGTAGGTGGCTACCACGTATTGAACTCATTACCTCTTAGTCAATTTATCGAGACTATATTTCATTTTTTACTATTAGGTCAACCCACGATGGTTATAAATCTATAAACCTCTCGAACAATTCTTAAAATTCACAAATTTGTAGTCAAAATTTTAAAATGAAGTAAAACGTTTATAGCTCATATGACATAGCTTCTGCTATCAACTTCAAAGTCATAAATTCAATTACTTGACCCACGTACTTAAATAATAACCATAATAATAATATAAGAGTTTTAGTTCAATAATGTTTTCTAGTCCAGTTCAATAGTGATTTAATATAATATTTAATGATAGTGTAATTTATTATCCTAATGTTAATTTAACACTAAATTGGTGATTTTTTTCAAACTGTAATTTAATATGATCTTAATTGACGTGTTTAGTGATTTGACTCTTTAGTTCCTTTTTCTTCTTTATTGTCATTTTTTTCAATAGTAATTTAAGATGACATTAATTGAAATATCATGTTTCTAATAATAATTTAAAGGGCAAAATACACTTTTGGTCCTAAAGTTTGAATGAAATATCTATTTGGTCCCTAAAGTTTTAAAATAGACATTTTTAGTCCTCGAGGTTTGAAAAATTATTTTAAATAGTCCTTAAAAATTATTTAATTGTTAGTTGACTAACGAAAAGATGATGTGGCATGATTAGTTGACATTTCAATACTAATTTAATAACATATTAATGACATTGTCCTATACGAAGGTGAAGATACGTGTGATAACTAACAATAGTTCAATATCCCTTACCATAACCACAAGTATGGACTCCTTTTTTCCAATACCAATTTAATATGATATTAATGATAAGGTTAAATTGTGCTAATTTATTTGTTTGTTTTTTAAAATTTCAGATTAAGTTGAATTTGAATTAGAGATGCATCAATCTCTATACATCTTACTATCATCATGCATACCAAAAGATAATTAAAATATTATAAAAAATAAATAAGAAGAAACACATGTAAAAGTATGATTAGACAATTTGATTGAATGTACAAATATAAGTATCACGTGTATGTGCATAAGAATTTTTCTCATAAGTTTATAACTTTTAGTTTTATGTCTTATTGATAAATTTAAAATTTTAGAAGTTAACAAACCTCGCTCATGTAGAGGACGCCTTTATCGCGCCTCATGAGGACGTAATCGTGGCAGAGGGCGAGAGCGAAACCAGCGGCGATGGTGGGCATGGGGAGAGAGAGAAGGGCGGCAACGATTGGCTTGAAGATGTGGACCATGTGGACTATATGCGGTCTCTAGCGGCGGATTTGGAGGCGGCGGTTTGGGCCCAGGGAAGGTCGAAGCCGTTGGAGAAGAAACGGCCATGGGAAGTGGTGAGAAGGACTGAACCGCGAGTGGCTTGGGACTTGACTTGGGCGAGAAGAGAAAGGAAGGAGGAAATGAAATTTGGACCGATCCAGTGCTCGTTGTCGCCGGTGAGGGTGATGATGAACAGACTGCCACGCTTCTCTAGACTGCACATGTCGTCGTCCTCGTTTGAACCAAATTGA

mRNA sequence

ATGGGAATGATGAGAACGGAGCCACGGGAGGCTTGGGATTTGACTTTGGAAAGAGCCTCGAGGATGGAGGCGATGAAGGAGGGGCTGAGGCGGTGGTCGTCGTCGCCGGTCAGAGTTAGGATGAAAAGATTGCGTCGCTTCTCGAGTGTGCACATTTTCGGAGTGTTGCGTTCAACCAATTATCAGATTCCTTTATTTATTTATCTTCAAATGGAAATACTTAGAAATTGTTATGACCTTCGGGGTAAATCCAAGCAACCCAGAGATTTCAGGATACAAGCTCTTCCTAATCTCGGCGTAGGCATCTCCATCCCAATTCCTCTCCACCAGCTCCTCCCCAAGTCGCACCGCCGCCTCCATGACGCCGTCCTCCCCGTGAGCCATGAAGTAGTCCGGGAGACTGGCACCCAAGTCCAGCTCGCTCATGTACAACACGCCTCGGTCGCTCCTCATGAGCATATAGTCGTGGGAAAGCGCCAAGAGGAGGCCAGCGGCAGCAGCATGGCCTGGGAGGGCGGCTACGGTGGGCGGTTTCGGGCGACGAATAGGGAGGAAGCGGAGAGAATCCAGGGAAGATCGAGGCCGTTGGAGAAGAATTTGCCTTGGGAAGTTGTGATGAGAACAGAGCCAGGGGAGTCTCTGGCTTCGGCCTTCAATTGGGACAGAGCTTTGAGGATGGAGTTTATTAAGGATGGGTTCAGCCAGTGCTCGTGGTTGCCGGTTAGAGTTAGTATGAACAACTTCCCACGCTTCTCAACGCTGCACATTTTCAGAACGAAGCTAAGCCAATTGATGAAAACAGAGTCCAAAATTATTGATTATACTTTGCAACAGGATCAACCAAAATACTCGCACACGACAAACAAATCCACCAAAATGACACCTAACTTCTCCCCCATCGTCACCGCTGCCTCCATCAACGCCTCCTCACCGTCATGCACCGCGTCAGCAATTCCCAACTTCACCGCTGTTTCACTATTGACCTTCATCCCCACCAGCAGCATGTCTCGCTGGACCGAAGCTGAACCGATCTTTGACCTCATCAACGCCGCAAAAGTAGATGAATTGCTTGTGAAGTTAACAAACCTCGCTCATGTAGAGGACGCCTTTATCGCGCCTCATGAGGACGTAATCGTGGCAGAGGGCGAGAGCGAAACCAGCGGCGATGGTGGGCATGGGGAGAGAGAGAAGGGCGGCAACGATTGGCTTGAAGATGTGGACCATGTGGACTATATGCGGTCTCTAGCGGCGGATTTGGAGGCGGCGGTTTGGGCCCAGGGAAGGTCGAAGCCGTTGGAGAAGAAACGGCCATGGGAAGTGGTGAGAAGGACTGAACCGCGAGTGGCTTGGGACTTGACTTGGGCGAGAAGAGAAAGGAAGGAGGAAATGAAATTTGGACCGATCCAGTGCTCGTTGTCGCCGGTGAGGGTGATGATGAACAGACTGCCACGCTTCTCTAGACTGCACATGTCGTCGTCCTCGTTTGAACCAAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGAATGATGAGAACGGAGCCACGGGAGGCTTGGGATTTGACTTTGGAAAGAGCCTCGAGGATGGAGGCGATGAAGGAGGGGCTGAGGCGGTGGTCGTCGTCGCCGGTCAGAGTTAGGATGAAAAGATTGCGTCGCTTCTCGAGTGTGCACATTTTCGGAGTGTTGCGTTCAACCAATTATCAGATTCCTTTATTTATTTATCTTCAAATGGAAATACTTAGAAATTGTTATGACCTTCGGGGTAAATCCAAGCAACCCAGAGATTTCAGGATACAAGCTCTTCCTAATCTCGGCGTAGGCATCTCCATCCCAATTCCTCTCCACCAGCTCCTCCCCAAGTCGCACCGCCGCCTCCATGACGCCGTCCTCCCCGTGAGCCATGAAGTAGTCCGGGAGACTGGCACCCAAGTCCAGCTCGCTCATGTACAACACGCCTCGGTCGCTCCTCATGAGCATATAGTCGTGGGAAAGCGCCAAGAGGAGGCCAGCGGCAGCAGCATGGCCTGGGAGGGCGGCTACGGTGGGCGGTTTCGGGCGACGAATAGGGAGGAAGCGGAGAGAATCCAGGGAAGATCGAGGCCGTTGGAGAAGAATTTGCCTTGGGAAGTTGTGATGAGAACAGAGCCAGGGGAGTCTCTGGCTTCGGCCTTCAATTGGGACAGAGCTTTGAGGATGGAGTTTATTAAGGATGGGTTCAGCCAGTGCTCGTGGTTGCCGGTTAGAGTTAGTATGAACAACTTCCCACGCTTCTCAACGCTGCACATTTTCAGAACGAAGCTAAGCCAATTGATGAAAACAGAGTCCAAAATTATTGATTATACTTTGCAACAGGATCAACCAAAATACTCGCACACGACAAACAAATCCACCAAAATGACACCTAACTTCTCCCCCATCGTCACCGCTGCCTCCATCAACGCCTCCTCACCGTCATGCACCGCGTCAGCAATTCCCAACTTCACCGCTGTTTCACTATTGACCTTCATCCCCACCAGCAGCATGTCTCGCTGGACCGAAGCTGAACCGATCTTTGACCTCATCAACGCCGCAAAAGTAGATGAATTGCTTGTGAAGTTAACAAACCTCGCTCATGTAGAGGACGCCTTTATCGCGCCTCATGAGGACGTAATCGTGGCAGAGGGCGAGAGCGAAACCAGCGGCGATGGTGGGCATGGGGAGAGAGAGAAGGGCGGCAACGATTGGCTTGAAGATGTGGACCATGTGGACTATATGCGGTCTCTAGCGGCGGATTTGGAGGCGGCGGTTTGGGCCCAGGGAAGGTCGAAGCCGTTGGAGAAGAAACGGCCATGGGAAGTGGTGAGAAGGACTGAACCGCGAGTGGCTTGGGACTTGACTTGGGCGAGAAGAGAAAGGAAGGAGGAAATGAAATTTGGACCGATCCAGTGCTCGTTGTCGCCGGTGAGGGTGATGATGAACAGACTGCCACGCTTCTCTAGACTGCACATGTCGTCGTCCTCGTTTGAACCAAATTGA

Protein sequence

MGMMRTEPREAWDLTLERASRMEAMKEGLRRWSSSPVRVRMKRLRRFSSVHIFGVLRSTNYQIPLFIYLQMEILRNCYDLRGKSKQPRDFRIQALPNLGVGISIPIPLHQLLPKSHRRLHDAVLPVSHEVVRETGTQVQLAHVQHASVAPHEHIVVGKRQEEASGSSMAWEGGYGGRFRATNREEAERIQGRSRPLEKNLPWEVVMRTEPGESLASAFNWDRALRMEFIKDGFSQCSWLPVRVSMNNFPRFSTLHIFRTKLSQLMKTESKIIDYTLQQDQPKYSHTTNKSTKMTPNFSPIVTAASINASSPSCTASAIPNFTAVSLLTFIPTSSMSRWTEAEPIFDLINAAKVDELLVKLTNLAHVEDAFIAPHEDVIVAEGESETSGDGGHGEREKGGNDWLEDVDHVDYMRSLAADLEAAVWAQGRSKPLEKKRPWEVVRRTEPRVAWDLTWARRERKEEMKFGPIQCSLSPVRVMMNRLPRFSRLHMSSSSFEPN

Homology

[Close]

BLAST of Lsi05G017000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L773 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G141800 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 4.0e-29
Identity = 66/79 (83.54%), Postives = 70/79 (88.61%), Query Frame = 0


Query: 184 EEAERIQGRSRPLEKNLPWEVVMRTEPGESLASAFNWDRALRMEFIKDGFSQCSWLPVRV 243
           EEAERI GRSRPLEKNLPW+VV+RTEPGE+LASA  WDRAL MEFIKDGFSQCSWLPV V
Sbjct: 2   EEAERIHGRSRPLEKNLPWDVVIRTEPGEALASALTWDRALSMEFIKDGFSQCSWLPVSV 61

Query: 244 SMNNFPRFSTLHIFRTKLS 263
            MN+FPRFS LHIF  KLS
Sbjct: 62  RMNSFPRFSILHIFVRKLS 80

[Close]

BLAST of Lsi05G017000 vs. NCBI nr
Match: CBI23584.3 (unnamed protein product, partial [Vitis vinifera])

HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 3.6e-08
Identity = 54/159 (33.96%), Postives = 77/159 (48.43%), Query Frame = 0


Query: 83  KSKQPRDFRIQALPNLGVGISIPIPLHQLLPKSHRRLHDAVLPVSHEVVRETGTQVQLAH 142
           +S+Q   F +   P+L + +++P    QLL ++HR LH A+  V           V+  H
Sbjct: 135 QSQQSAYFGMHRFPDLSIHLAVPFTTAQLLRQAHRSLHRALRAV-----------VRRIH 194

Query: 143 VQHASVAPHEHIVVGKRQEEASGSSMAWEGGYGGRFRATNREEAERIQGRSRPLEKNLPW 202
             H       H+    +   AS S +A  G      +  + + A   QGRS+PLEKNLPW
Sbjct: 195 NPHPHRLLRFHLFC-SQHHIASCSRIADPG-----LQHCHEDPAAWAQGRSKPLEKNLPW 254

Query: 203 EVVMRTEPGESLASAFNWDRALRMEFIKDGFSQCSWLPV 242
            VVMR EPG S  S+F W   L   F    FS+ SW+ +
Sbjct: 255 AVVMRAEPG-SFQSSFFW--RLTTLFFSRIFSEWSWMMI 273

[Close]

BLAST of Lsi05G017000 vs. NCBI nr
Match: XP_042942924.1 (uncharacterized protein LOC122277109 [Carya illinoinensis])

HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 2.6e-06
Identity = 33/58 (56.90%), Postives = 37/58 (63.79%), Query Frame = 0


Query: 420 EAAVWAQGRSKPLEKKRPWEVVRRTEPRVAWDLTWARRERKEEMKFGPIQCSLSPVRV 478
           + A WAQ RS PLEK  PW V+ R E R AWDLTW R E + EM  G  +CS SPV V
Sbjct: 34  DLAAWAQDRSNPLEKNLPWAVLVRVESRTAWDLTWERIEMR-EMTVGLKRCSPSPVSV 90

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lsi05G017000 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lsi05G017000 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0L773	4.0e-29	83.54	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G141800 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Lsi05G017000 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
CBI23584.3	3.6e-08	33.96	unnamed protein product, partial [Vitis vinifera]	[more]
XP_042942924.1	2.6e-06	56.90	uncharacterized protein LOC122277109 [Carya illinoinensis]	[more]

BLAST of Lsi05G017000 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 382..401

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lsi05G017000.1	Lsi05G017000.1	mRNA