Lsi05G010940 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi05G010940
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr05: 18693669 .. 18698162 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi05G010940
SyntenyLsi05G010940
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGGTGATATATATACACATTGACTAAGACATAACTCTTTTTATAGTTGAATATTAATTTAGTGAACTTTGTCCCTTTCATTTTCAAACATTTCCAAAAGTCTTAGCTACTCATTAAATAACTTTAAAAGGCCCTCAACTAATTCTTTAATTACCCTATCAATTAATATCATTAATTTCCATTATATAATTTTAAATCCATAAATTTTAATCACATTATTTCCTTCTATTTAATAAAATTTAAATAGAGTTTGAACTTTTGGAATTTTTGTATCAATTACTTAGTCTTTGTCAATTGATTATATTTTTCTCTATAAACAGATAAGAGACCTTTACAAATATAACAATCGGATTCAAACTATTAATACATATATATCAACATTTTTAAAAAAATTGCAAATATAGCAAAATCTATCAGTAATAGACTTCGATCACTGATAAACTTTTATGGTCTAGATGGTCTATCACTGATAGACTAGAGTCTATCAGCGATAGAAGTCTATCACCGATAGATTTTGCTATATTTGTAATTTTTTTAAAATGTTATTATATATTTAGTTATTATTCCTAAAATTGCTACTCATTACCATTAAGATAATGCTGGTTAGTTTGATTATTTATGAGCTATAAATTAAATTCATTAAAATTTACATTAATTCTAAAATTTGAGATTATATGTAATTTTAGTATAAGAATTTTGACAATTCTCCCATTGGTCAATTGTTAATGGGATTTTAGGTGTATGTCTGTTTAGTATGAATATTAGACTTTTCTTTGAATTTAACTTGTCAAAGTCAAATAAAAAAGGGTATTTTTTTAATATGATAACATTAAAGTATTAATATTTGCATGCTTTCTGAGGGTGATTTGGCCTTTTACAAAGCACAATTAATGCCTTTGATATTGGTTGTGTTTTTAATTGAAACCTTATTCCTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTCATTTTATCATTCCTTTGTCACATTTAAGTTTAGGAAAGATGAAATAATCTTATCAAATATAAATATTCAATGAAAAGTTAGGATTTCAATTTATTTTTAGAGAAAAATATATTCTAAATTCTTAAATTTTGAGTTTAATTTTCATTAGATCTCTAATCGTAAAATGTTACACTCTTAGTCTTTAAGATTTAAGTTTGGATTTCAATTTAGTCCCTAAATCTCACAACGTACAATTTTACCCTTGAGATTTGATTTTTGTTGGTCCGTAAGTTTCAAGATTTACACTTTTAACTTCGATTTTTTTTTATTAAATACTCATTTCAGTTTTAGACGTTAGTATCTATTAATTAATTTAAAATAATTATGAAGTGAAAATTTTAAAATTAATTTTAATAGTAATGAAAAAAATAGTGAAACTTATTTATTTAATTATAACTCTTCTAATTCTTTTAAATTAATTAATAGACATTAACATTAAAATCTGAAAGTGAGAATTCAGTGAAAAATTAGAGTAAAAATGTGAATCTTGATATCTAAGGACTAAATTGAAATCAAACTCAAAACTAATGAACTAAAAGTAACATTTTAAAATTTAGGGATCAAAAGAAAATTAGAACCAAAACTTAGAGACTAAAATAATATTTTCCACTTAGCAGTTATTAGTAATTGTTACAAAATTTTATTTACTTGGTACTAGAAGAATTATTATATACTTTCCTTTAGAATTTAAAAGTATTAAAATGTGTTTGATAGGAGATAAGACAAACATTTTGGATGGAGAACTTGAGAAGCTCTTGCCTAGAGTGGATTTTATATATTTATTACTTTTCTTCTCTATTATTTATTTAAAAAAATAATATGAGAAAAAAAAACCAAAACTTCATAATTTAGTTGAATAACTATTAAGATAATTATTTTAATATTATAAAAAAAATGAGTGAAATTCATTATCCCTCTCTATTATTTTGAAAAGACAAAATGAAGTTGACCCATGCATTATCTTAGAGAGATTGGAGACATCACATTTTGAGTTTGGCACTATATACATTGTGGATCCAATCATACATAAATCTTTGAATATGATAGACAAGGCTACCACACCTCTATTAATTTCCAACTATGTATCAACCCCTAGCTTCCATATAATTATCATCCCATTTTCCTTTTCCTTTAATCAATATCATATTATAAAAAAAATTGGTTCTCTATTATTTGGCTTCAAATTCTATATATATATATATATGTATAAGAAAATATTTGGGTACAACATGGGTTGCATTTATCTATTGTGCAACCCCTACTGCATCCAATAAAAAACTGACACGTGTCAATTTTCTTTTTAATGATTAAAAAAAAGTTTAAATACTACTTTGGTCCCTGTATTTTTTGTTTTTGTTCATTTTGGTCTTTATACTTTCAAAATGTTCATTTTGGTCCCTATACTTTTAACTTTGGTTCATTTTGGTCCTGATATTTTTATAATGTTCATTTTGGTCCCTGTACTTTTAAAAAGTGATCATTTTGGTCTATCAATTTTCATTTTTACTTCATTTTTAAGGTATCAAATTGGTCTTTTTTTTAAAGTTGAAGAACCAAAATGAACAAAAGTTGAAAGTGTTCCATGACCAAAATGAACATTTTAAAAGTATAGGGACCAAAATGAACAAAAGTTGAAAGTATAGGGACTTGAATGAATATTTTAAAATTGCAGGGACCAAAGTGTATTTAATCTCTAAAAAAAATATTTTGTGTGTGTATAGAGGAATGGGAGCATGAAATTTAGGTGCAATCTAGTATTGCTCATATATATATACAAAAAAAAAAAGTTTAGTTCAACTGACATCAATATGTGTTGAGAACCAAAACGTCGGTAATTCAAATTCCTCCGTCCCAATTATACTAAAAAAAAATTGTATAAATAGAGAGGGAAGATATATAATGTCAAATCAAGATAGGTCTCTATTTTTAGCCCTTCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTGGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTTTTTTTTTGTTAGGAGTGGTTATTCATTTGTAGTCCTATTTATTATAAATAGCAATATTAATTTGTAGCATGTACATATATATTAAAGTAGTGAAACTTCAAAGAATAGAACATTGCTTTTGGTGTAAGTAACCATTTCTAAATAACATGACAAACAATATTAAAAAAAAGTGTATGTGAATTTACTTTTGGTCCTACGTCATGTTTTTTTATATCTCATTGTAATTATTTAATGTCATTACAACTTTTATTTATTGATTATTTATAGTAAAACTATTGTCATAAATTTCTTTATAAGTCACATATTTTCAAAATTGATTTATTAATCATGATTTTTTTAAAGAAAACAGTGCCAAAATTAGTTAATAATAAATAGTCCATACAATCTTTACTTAGCAATCAGCAATGACTTGGGATATTTTGGGATAAGTTTTTTTCGTTAATCTTTTGTTTCAATTATTTTCTAAATTTTTTTTTATCAACCTCGACATTTCTTTAAATATGATATTTTGACACTTTGTCAATATTATTATTATTTTTACACGAACATTTTTAAATATTGAACTAAATCATAAATTTTACATTAAAAATTTAAAATCATACCAACTAAATTCCAATTTACAACTTATAAGAGGAAGTTGGAAAAAAGAAATCATTCTAAAATGCTATTTTAGTTCTTGTATTTTGATATTTGTTTAATTTTAATTTTTGTACTTTTAAATTTCTAATTTTAGTCCTTTTCTATTTTTACTAAATCTCAAATTTAGTCCCCACTATTTTTTTTATTGTTGATTTAAAAAAAAAAAGCTTTTTGTATTCATTAGCATTTTTACTACAAAGGTTAATAACATATCACATGTGATATATTCATTGCATGAGTATTAGTATTATTATTTAGTCTATTTCAACTAAAAATAAATTTGAAAGAATAAATTTAAGATTTATTAAAAATTTAAGATTCTAAAATTTAGTTTTTGATTCTTTTTATAAAAATAAAATTCGAGTAAAACGTGGTCGCGCTGGCACGTGAAAACCGGCAAGTCAAAACGACGCCGTCTGCTAAAAGTAAAACTTCATTTATTTATTTATTTTTCCAGGGGGCATGTGGTGTACGGATCCGGTCCGGAAACCCGAATACACCGGGTTGAACCGACACTTGTCTGTGAAGAACCGCCAGATCTTGATACGGATAGTTCGGTGAATTTCACCAGAAATTCTGTTACTTTTCAACATCGTTCACGTGGACACGTGGCGAAAAGATATGGCGAGTGGTTTAAACGTTCCAAATTGTGCGCGTCGAGTTATTGACAGTTTGGAATAAGAATTTAATATTCTGACGTGGCAGAGCGGTGGTCCCAGAGGGGATGTGGTGGTCAAGCGCTTTTAAAGTTGGCCGAGGTGTCAGACAAGAAAGAGGTAGGCCACGTGATTGACCGACACACGTGA

mRNA sequence

ATGGGGGGGCATGTGGTGTACGGATCCGGTCCGGAAACCCGAATACACCGGGTTGAACCGACACTTGTCTGTGAAGAACCGCCAGATCTTGATACGGATAGTTCGGTGAATTTCACCAGAAATTCTGTTACTTTTCAACATCGTTCACGTGGACACGTGGCGAAAAGATATGGCGAGTGGTTTAAACGTTCCAAATTGTGCGCGTCGAAGCGGTGGTCCCAGAGGGGATGTGGTGGTCAAGCGCTTTTAAAGTTGGCCGAGGTGTCAGACAAGAAAGAGGTAGGCCACGTGATTGACCGACACACGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGGGGGCATGTGGTGTACGGATCCGGTCCGGAAACCCGAATACACCGGGTTGAACCGACACTTGTCTGTGAAGAACCGCCAGATCTTGATACGGATAGTTCGGTGAATTTCACCAGAAATTCTGTTACTTTTCAACATCGTTCACGTGGACACGTGGCGAAAAGATATGGCGAGTGGTTTAAACGTTCCAAATTGTGCGCGTCGAAGCGGTGGTCCCAGAGGGGATGTGGTGGTCAAGCGCTTTTAAAGTTGGCCGAGGTGTCAGACAAGAAAGAGGTAGGCCACGTGATTGACCGACACACGTGA

Protein sequence

MGGHVVYGSGPETRIHRVEPTLVCEEPPDLDTDSSVNFTRNSVTFQHRSRGHVAKRYGEWFKRSKLCASKRWSQRGCGGQALLKLAEVSDKKEVGHVIDRHT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi05G010940.1Lsi05G010940.1mRNA