
Lsi05G008980 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAGTTCGATCTCAGTGTTTCGTTCTCCAAATCCCACAAGACGATCGTTAACAGTGAGAGCAAGTCTCATCACTAACTCAGACTCCTTCGAGGTCGGACGTCTCATTGGAAGCTATGGCTTCATGAATATCACCAGGTTTCTCTGCTTTCCAATCTGTCACTTTTTGTTTCTGATTAGGAAATTGCTTTGTGTATTATGAGCTCCGTACCGCCATTTGTTGCTACCAATGAAATTTTAGTGATTAAATTCACTATAGTTGTAACGAAATGCTTAATTTCCTTTCCTTTCTGTTAATTTTAGTTCCTGTACTCCACAGGATTAAAGATTTTGAGTTTGGGGGATTTTTCATAGTTTTTGAGCTCTGTAGATGAGAAAATTGCTAATATCAAATCAATCTGTTGCACTTAAGTTTCGTGATTTAGTTTGGACTTTAATTGAATTTCACATTACCGTCATTGTAAATGTGGTATTTCCCGCCCCCCACAGCTATTCAGGGTTTCAATCAGGGGAAGACGTTGAATATTCTTCTGGAGATTTGGGGCAACTGAGAGTTCAAGATGTAGGAGAAGGAAGTGTAAAGATCAGGTGCCCTTTTGATGTGTATTTGTGTTCTAGGGACTGATTACGGGAATCTTGAATATATGCCAACCATTTTGTTTTTGAAAAATTAAACTATTCTCAATTTCAGTGTTTTTCATCCTTATTGAGTAAAAGAGTTGAATTTGTAGCTAAATTCTAAAAATAAAAACAAGATTTTCAAAATTACTTTTCTAGTTTTCAAAACTTGGCTTAGTTTTTGACAACATTGGTTAAAAGTATATAACTAAGCAAGAAATTTATAGGTGGAAGAGGATTTTGTAGACTTAATTTTCAAAAACTAAAAATCAAAAACCAAAAATTAGATTACCAATTTTCTGAATCCATCTCATTACTGATACTATCAAGGGCAGTTCTTCTATAGGCTTTATGAAGGAAGAGTTTCTCTGGGTTCTCGTAAAGGAACTCCTCTTATTTTTAAGGTGATACTCGTGCATTTACTTCGCTTTTATTCTCTTAGTTACTTATGGGTATCTGCCTTCATTATGGTTTCAAATATTTACCCTTCCTAAAATATATATTTCCCTAACTTTAATCCTTAACCTCTCAAGGAAATTAATAAAAAGCGCCCCAATTTGAATTGATAACTAATAGGGCATTTGTCAAAATGAGCATAGCTCGACTGACATAGTGCTTGTACTATTAACTTCAAAGTCAGAGGTTTGATTCTCCTGCCCCAAATGTATATAAGACTAACGGGGTTTAGTTGCGAATTGATTTTCTAATGAGCTCCATTGGGGTGAATCGAGTCTAGCTATCTCTTTCTCTGCCACGTTCAGCCAAGCTCTAGACCATTTCTATCAATGATAAATGTCCATTTTGAATACTGTAATTATTTTGTTTTGTGAATTTATTGAATAATTATTTAGAAAATCTGTATTCATACTTTTCAATCAGCTATGATATAGTTTGATATGAATAAACTATTTTCAATACAAAGGTGTATCCTGGAAAGCGGGTTGGTGGTGTTGAAGCTGATATGATGGCTGCAAATGAGCTAAATGCTCATGCATTTCTCCAAGTAACAGATACTTTCCTTTTTTGCGTCCACAATTTTTTTTGACATATTAGTGCTGATGATGATTAGACTATGTTGGGAATCGAAGAAGTATTTGTTTTCAAACTTCACAAACTGCTTTTTTATTTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTCTTCTTTTTCGTTTAATTGTTTTGTTCTTATGGACATTCTGCAGAGCAGTTCAAAGGATATCTGCTCAAATCTTGCCCTACTTGTTGGTGGATTTGAAACAAACACTGGGGAGCAGGTTATCCATAATATTCAGTATCTAAATGTTTTATGGACTTGGTATGTTTTTGTCTTATGATATGGAAAAGTGCATGTTCTGCTTGCTTAGTGGCTAGCATTCCGTGATGATGGGAAATATAGCGCTGCAGACTATGGAAAAATAATGAGTGAAAGGATTTCCAAAAGGATAGAACAAGTCTCATGGAACCCTTACGAACAAGAACAGTTCATCAAGCGCAGGAGAAATTTTGTGATCAGGATGTTTCAGGGCATAATGAGAGGTCTTGTGTATATGCACGACCGTAACAGATTACACCAAAGTCTTGGACCATCTTCTGTAGTACTCAAGTTAAGTATAGTTCGTGGAAGTACCGCATATTGTTTGCTAGCTTTTAAAGTTTCCTAACTTATATCTTAACTCTGTCATATGTGATAAAATTGATTTGCATTTGATCACAGTACAATTGTTGAGAAAGATGCTGCTTACTTAATCCCACGACTTCGAGATTTAGCTTTTTCTGTGGATGTGAGGTAATTCTTTTCTCTTCATCAATCATCTTTTTCCTGCCAATGTAATTTTTATTTCATCATCAGCATTCTCAACCTTTTTATTAGTTGTTTTAGTCTGGGAAAGCTGAAAGAAATGAATTTTTCCTTGGTGAAATGGCCTTGGACATTTGAAAATGAAAACCAGCTTTATGGGGGAGGATTTTGCTAGCTTGTAGGAAAGGGATATAGGTAATTGGTGGTTCCGCATCCCAACCTTAAAATCACCGGGAGGCTCTTGAAGGTGCATTTTAGACTTAAGAACACCCTAACTACCAGAATTAGAAAAGTGGCTCTCCTTCCTCCTCTTTTGTAATTTCATTTGATAATTATATTTATGTGAGAACAACTTCATGGCAGAGTAATGCAGTATGAGCGAGTTAGTTATTTGTGGGGTCTCTCTCTCTCTGTTTATATATATATATATATATATAAATGATATAGATTTTCATTAAGAATATGAAAAGAGACTAGTGCTACAAAATACAAGGATACTTGAAACCAAAATAGGACCAAACAGAAAGTAGAAACAAACAAAACAAGACAAGAGTAAAACAAGTATAAACAAAGAACCAAAAGACTTAGAAAGGATTAATGAAAGCATTCCATTTGCTATAAATATCCTGAATTGAAAACGCATGAAAAATCTTGGAAAGAGAACACCAAGTAGAAGCCTTTAGACGAGCCAAGTCGAAGCGAGCAAAAGAAGTTTCAGTAGAATCATGAAAAATCCGTCGAGTTCTTTTGAACCAAATCTCAGAAAGGATGGCCTTCACAACATTACCCAAATTAAATGAGCTTTTGGGTTCCAAATGATTCCACAAAGAAGCTGCATCACATTTGTCTTCCAAGAATTGGAGAAGACCCAATGTATAGAGAAAGTGTCGAATAATAAAAATCAACAGCTCTGCGAATAGACACACTCAAAGAGTAAGTGGTTTATAGATTTTCCTTTCTTGAAGCATGAAGAGCACACTGAAGGTGAAAGGCAATGTGAAGGCATCTTTTTCTGCAAAAATATCAGTCAAATTTAAGCTACCATTGAGCAGGATCCAGAAAAGTATATTTGTTTTCTTTCGACTTTGTGACTTCCAAATTGCTTTATATAAGGCATTGTCAATAACTGTTGAGAAAGCCAAATGAGATGATAGGGATTTCACCGAAAATATTTGTGGGGAACATTTTGCAACGTAGAATAGGTGGATCCCCTTGAAGTATATTTGGTGGGGTATATTATCTGGATAAATGTAGTATTTGATACAGGAAGTTAGAAGGCTTGGGATTTATCTTTTATGTTTTTAGTGTAGAGACCAAAACCTCTGGAAAGTATAAAACCTTATGTAACTCATGATTGTTTCTGATTAATGTAAGAAAAACTCGTTCGAATTGCATACCAGGATATAATTGCAAGAGAAAGCTTGCTGAAAGTATGTATGATGTTTTCAACATTTAAGGATCTTAAATTACACTTTCTTCACCATTTTAGTTAATTGTAAATTTCTTCTTACATTCAATATAGGTTGAAAGATTTTTAAACCATTTGATTGTCAGTTATCCGTTTCCAGAAGACAGCCTTGGACAGCTTGCCGAGGGGCTATGGCGACGAGCAACAATTGCTGGTGCCTACACTCCAATGGAGAAAAGAGCATTTGGAATAGCAGATGACATGTATTATAGGCATATATACAATGATGTTCAAAGCTTCTAACTCAATCTTAACATTTTTCCTCCTTTTCTTTTGCAGATATGGAGCTGGTCTCCTTTTTGCGTATTTGGCTTTTGTGCCCTTTTGTGAAGCTGGAGTTGTTGATAGCCTCTCCTTGCAAGTAATTCATCTTACTAAACATTTTTTTCCATTGTTATATCTGATGATATTCAATCTTCTCCCTTTGACAAGTGAAGCTCTCTTTGTAATCTTTAGTTTAGGTTTCTCTTTACTGGTTGGATTGTCTATTTAGTTTCCCTAAACGTTGTTTTTCTGTGAACTTATAGAGACTTTTGGAGAGCACTTTTAGACTTGATCTTGAGGCCACGAGAGAGTAAGACTCCACATCTTTTTACAATTCGATTATCATTGTTCCTCAATAATTTGTGCAAAGGAATTTTACTTTGATCATGGTTTGTTTGATTTGTTGGATTTTTTTTTTTGTTGGAGAAATTTCATTGATGTTTGTTGGATCTAATTCTCAGTAGTTTTCTTTGGTTATTTCTTTAAGTGGGGGAATTTAATTAGTTCCTCTGGTGCTAGAATCTAGATTACCTAGTTTACCAAAGCATTTTTACCAAAGCATTAAAATGATACTCCAATTCCAACAAGAGCTTAAAAAAGCATTCAAATGATTACTGCAACTCGTTTCCTTAAAACTGTAGCATTTATATTATTTTACAGTACACTTCTACTCCAGGTCTTTTAATGTGTCTTTGTACTAAAATATATAAATGCTTTGCCTTGGAAGATATTGTTTAGCAGACGATCGGTTCATTGAAGCGGTCAAGTTTCTCGATCTCAATGATCGTGCTGGTTGGCAGTTACTTCAGGTTGTTTATCTTTCTACGTTTACATTACACTGAAAATGCAGCTGTGT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MAMRKLLISNQSVALKFRDLVWTLIEFHITVIVNVVFPAPHSYSGFQSGEDVEYSSGDLGQLRVQDVGEGSVYPGKRVGGVEADMMAANELNAHAFLQSSSKDICSNLALLVGGFETNTGEQWLAFRDDGKYSAADYGKIMSERISKRIEQVSWNPYEQEQFIKRRRNFVIRMFQGIMRGLVYMHDRNRLHQSLGPSSVVLNTIVEKDAAYLIPRLRDLAFSVDVSYPFPEDSLGQLAEGLWRRATIAGAYTPMEKRAFGIADDIYGAGLLFAYLAFVPFCEAGVVDSLSLQYTSTPDDRFIEAVKFLDLNDRAGWQLLQIRLDGENKVLPKSSLIAKSQPHGNDPHVVSTAYCIKQERESLLRLKASFIDSFDRLASWKGTDCCNWEGVGCDHTNANHVVKLDLRNYDYFSASSLVSNGVDSSLFELKHLNYLDLSGNFFNYTQTPIYFFELFELTYLNLSLTSFHGTVPRSLGNLTKLVVLDFNNNENLYPGELCIDDLGWVSSLLSLEYLDLSGVRVVQGNLGLDLMQVLNTLPSSLLSLKLSYCDLQNTHHIYAPPSSLFLSKLQHLDLSANRFDGPIPSILQNMTSLRYLNLNGNRYNSSIPSWLSNLKNLDTLYLRSNLLSSIEGGLSSMARNNCHLKNIFGSYENLSASCKKYGLERLDAERMIKFGVHTIPSWLGELKNLKSLHLPNNLLYGSIPSSFRKLSSLQDMDISYNMINGRIPISLSQNNSLHGSVPSSFRNLSSLEYLHISYNMLNGGIPSWLGELQNLQSLNLQGSPLSGAIPSSFGNLSSLERLDISYNMLNGGITNSFGKLLYLLWLNLRENNLDGVITESLRQLQNLQGSDFSKNPLRGVVTKIHFANLSRLNSVIMSGNDLLSFEIKHDWIPPFQLQYFIVRSTKGFGSDGFPRLLLTQKKLSYLDLSNNNISGPIPTWLSGPLPKSIGYQIPNMFVLYASNMHINGCLPRSICKWRGLSFLGLSNNELSRTIPSCLLTPNLAIFDLSSNKFSGVFPSSLKNLSRLEVMHLANNKLEGEPLIAMRSCESLFILDLEGNQFSGSIPSWMDNKLDGNIPPNVDNFSATKSDQFTESGLACDSSEDPTRICYVSYVRQVMKSSNRNYSYSQLYSMVNVDLSNNNLYGYIPSEIATIKGLFNLNLSHNHLSGIIPVEIGRLVALESLDLSFNQLSGSIPNNMSNLNSLGALNLSNNNFSGRIPREGHLSTFNDASSYEGNPYLCGDPLSVICPNESPGEPTTEIDNFHDHDSHEEDKLEKMWFCIIVMLGYALGFWRVVGNLILKRSWRNGYFQFMDETKDKIYVAILVETTNGRKQHASMKLAIYVFMYFDLLSPSIESNNCLLSFFMASIEHSTPFFSNNTWEYLCKRPGPAAPYACYSLVKVGLYIDLEIQIEAENQFAKKMGKNGTILVVLFFVVLIILLHTYQVSTASCIKQERESLLILKASFIDSSNRLGSWKGTDCCSWKGVVCDHTIGGHVVKLDLRNHEYTYSSALLSNGVDSSLFELKYLNYLDLSANFFNYTQTPHNLAEMLELTYLNLSHTYFHGGIPRSLGNLTKLVVLDFNNHKNDLDVLDFFHPAKLFIDGLGWVSSLSSLEDLDLSGVRVVQSKLDLDLMQSSKYPSYLCSTKFFILSANMFVGPIPSILQNMTSLRFLDLYDNGYNSSIPSWLSNFRNLDTLNLGFNLFSSIEGGLFSIVRNNCYLKSLDLSFNRLLGEDVFGNYKNLSAHCKEYGLESLFLNNIQFGMHTIPIPSWLGEFKNLKSLKLQENSLCGPIPSSFGYLFSLEDLDISNNMLNGGLPSWLGELKNLRSLNLQKNSLYGLIPSSFGNFLEYLSISYNMLSGGIPISFGKLSNLMNLDLRKNNLDGSFRKVLDNFEVSIDLSKNNLKGVLSEIHFVNISKLEFLFMDENGLLSFEMKNNWVPTFQLRIFSVRSTLGFGTIEFPRPTPTWLRFQNLYFLELSYNQINGPLPKSIDDQMPNLMGLLISNAHINGSLPQSFCRLKNLMLLVVSNNNLSETIPSCLSPLNLDLLDLSSNKLLGVIPSSFQNLSNLEVMNLARNQLQGDPLMAMRSFKSLSVLDLEGNKFCGNIPKWLGKRLQSLQILNLRGNMFNGTIPSTLWLLPSLQILILADNKLVGNIPPNVGNFSASRESITNNGLVCNSKEDPYALCYVSNITQVMKSSNLNYSYLQLYSMMAIDLSTNNLHGHIPREIVTINGLFALNLSHNNLSGTIPVEIGRSIALESLDFSFNQLSGSIPNSMSGLNSLGALKLSNNNFSGRIPREGHLSTFNDASSYEGNPYLCGDPLSSICPNENAGEPSVEIDNVQDNDRHEEDKLEKMWFYIIVMIGYALGFWGVVGPLILKRSWKHAYFQFMDETKDKIYVAILVNMARLKQRMGRN Homology
BLAST of Lsi05G008980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6JN46 (Receptor-like protein EIX2 OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=EIX2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 3.3e-126 Identity = 358/1056 (33.90%), Postives = 519/1056 (49.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6JN47 (Receptor-like protein EIX1 OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=EIX1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 429.9 bits (1104), Expect = 1.9e-118 Identity = 356/1061 (33.55%), Postives = 506/1061 (47.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DO05 (Receptor-like protein 9DC1 OS=Solanum pimpinellifolium OX=4084 GN=9DC1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 7.2e-81 Identity = 297/961 (30.91%), Postives = 431/961 (44.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DO06 (Receptor-like protein 9DC2 OS=Solanum pimpinellifolium OX=4084 GN=9DC2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 7.2e-81 Identity = 297/961 (30.91%), Postives = 431/961 (44.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5MR23 (Receptor-like protein 9DC3 OS=Solanum pimpinellifolium OX=4084 GN=9DC3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 302.8 bits (774), Expect = 3.6e-80 Identity = 293/961 (30.49%), Postives = 433/961 (45.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B5Q6 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486101 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1174.5 bits (3037), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/1048 (61.55%), Postives = 734/1048 (70.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UKC1 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold480G00630 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1164.8 bits (3012), Expect = 0.0e+00 Identity = 652/1055 (61.80%), Postives = 722/1055 (68.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BB21 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487751 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1164.8 bits (3012), Expect = 0.0e+00 Identity = 652/1055 (61.80%), Postives = 722/1055 (68.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DRZ9 (probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g33170 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022665 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1078.9 bits (2789), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/1035 (58.65%), Postives = 725/1035 (70.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CXT5 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold32G001000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1049.3 bits (2712), Expect = 2.5e-302 Identity = 593/986 (60.14%), Postives = 681/986 (69.07%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. NCBI nr
Match: XP_038887063.1 (receptor-like protein EIX2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1374.0 bits (3555), Expect = 0.0e+00 Identity = 732/1045 (70.05%), Postives = 807/1045 (77.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. NCBI nr
Match: XP_038888710.1 (LOW QUALITY PROTEIN: receptor-like protein EIX2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1349.0 bits (3490), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/1043 (69.61%), Postives = 797/1043 (76.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. NCBI nr
Match: XP_038887937.1 (receptor-like protein EIX2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1286.9 bits (3329), Expect = 0.0e+00 Identity = 690/1018 (67.78%), Postives = 758/1018 (74.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. NCBI nr
Match: XP_008442166.1 (PREDICTED: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1174.5 bits (3037), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/1048 (61.55%), Postives = 734/1048 (70.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. NCBI nr
Match: XP_008444420.1 (PREDICTED: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 [Cucumis melo] >KAA0053991.1 LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK20676.1 LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1164.8 bits (3012), Expect = 0.0e+00 Identity = 652/1055 (61.80%), Postives = 722/1055 (68.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. TAIR 10
Match: AT2G34930.1 (disease resistance family protein / LRR family protein ) HSP 1 Score: 385.6 bits (989), Expect = 3.0e-106 Identity = 325/995 (32.66%), Postives = 459/995 (46.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. TAIR 10
Match: AT5G16810.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 368.2 bits (944), Expect = 4.9e-101 Identity = 197/335 (58.81%), Postives = 232/335 (69.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. TAIR 10
Match: AT1G47890.1 (receptor like protein 7 ) HSP 1 Score: 299.3 bits (765), Expect = 2.8e-80 Identity = 304/1006 (30.22%), Postives = 463/1006 (46.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. TAIR 10
Match: AT3G05370.1 (receptor like protein 31 ) HSP 1 Score: 282.0 bits (720), Expect = 4.7e-75 Identity = 278/1004 (27.69%), Postives = 431/1004 (42.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G008980 vs. TAIR 10
Match: AT5G27060.1 (receptor like protein 53 ) HSP 1 Score: 279.3 bits (713), Expect = 3.0e-74 Identity = 290/1035 (28.02%), Postives = 434/1035 (41.93%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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