Lsi05G005390 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi05G005390
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr05: 6693414 .. 6697436 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi05G005390
SyntenyLsi05G005390
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGTTGGTAATACCTACCTCGGTTTTGCAATTTCAAAACATCACATTCCGTCTGATAAAAGTAAAGTTACTTCCTCACGGTCTAAGTTTTCAAGGTGCTGATTCTTGGGTGGTCGGCCTCCACAATAGGCCAACCTGGTTCTTTGAGCTGTTTCCGACTTCTAAATTTTGCTTGAAAAGGATTTGAATACACGTTGTGCTGGTCGACCCTGACTAGATGTGTATTCGTTTTCCATGCTTAGACTCGTCTCACTTGTCAACAATTGATCTTCACATGCATCTCCTACAACGTCCATGTGTCTGCTTTCCATCGATCCACATCGACAATACCAAGCCCGAGGCACTGCAAGTCTTCTTCCACAAGAATTCTATCAACATCACCTTTATGACCAACCTCTTCTAAGTAGCTCAACCCCTCTTTGTGTCGACATTTGGCTGGTCAACCTCGACATTGAGCTGACCGAGCAGTCCTCCTCCTTTATTTTGTTTATTTTCCTGGTTCATTTAGATTTTTGGTAAGCACTCTCCTCCTCTTTCCTTTTCATGCCAGGCTTGACTGTCGAGCCCTTTCACTTTTTTTTTCTATTCGGAACTATTTTTCCTTTTCTAGTGATTATATAACTGATTCATGCTATAAAAGGCATGAAATTAGGCCTTTATTTTATTATTTTAATGTGAAAAATGAACTATTGCATGACTTTTATTTCAAATTTGGTCTTATTATATTTAAATGAGCTTAATGATGACGAATTATGTATAAAAGATGATTTTTGCGGATTTAGTGCAGATCTGGTGCGTTTTTGACAGGTTTCTGGCTATTATTCATGTGATGCGCCCACAACAGCAAGTGATGTACTAGCACTATCAAGCCCAAATTTCCCAGATCCGATTTTGTCTGAATCAGCTGCGATTTTCCTGGCTAGAAATCCTCGATACTGCTCTGAGAATCTGGAGAACGAAAATCTTGGCTTTCCTTAACCAATTAGGGTCTATAAAAGGCAAGAGAGTAACCCTAGAAGGGGGACGATTCACTGCCGCCACACTCACCACTTCCATTCTCCATCTCACGGTCACGTTTCCAACACCTTGGGATTTTCTTTGAATTTCAAGCCAGTAGTCTTAAGAACGAAAGTTCCTTTGAGGCGTAGCAGCTCTAGGATTACTCTTCCACAGAAGTGTGCGTTGAGGAAAGATTCTATCTTGAGAAAGAAGGAATCGTCCTAGGGAAAGGCTTGTACTTGAGGATCTTCCCAAGTTCACTCGAGTTGTACTTGTTTTCCAGTTTTACTGTTTTTCTTGTTGTTTTCCATTTATTATTATTCTATCGATCAAACGTTATATTGTAGCTATGATTTATGATTTAATATCAATGATTATTTCAACTAAAGTCATGAGCTAAATATTTTTAGGGGTTTAACAATGTGAAAGCCTTAGGATTGTTATGGCTTAGGTTATGTAATGTTCACACCACTTTGTGTAATCACATTCTCTTTGTTGATTTTAAAAAGATAAAATCGGTAAGTTAAACTGGCCATTTGATTTAACGATCTAGCGGAGCTTTAATGCTGAGAAGGTTAGGGTGTAAGCGGATTTCACAAAGGGATATGGGGCTAAGAGCCTAGACATAGGATGGTCATGTTGCCTTAGAAATAAGGGACACCATAGGATAAAGGAACTGAACTTGATTTAATCTAAGATCCAACTAACCATGGAAACATTAGGCATTAGCTGCTTAGAGCTCCTAAAGGAACTTGACACAAAACCGAATAGGTGCAGTTTCCTGTCCATGTGTAAATCATTGTTTGGTGTGATGCGGTCACATCACTTAAGGCATAACACCCGAATGACTGTAGCATTGTTAACCCTGTTTGATTCCTGTTGTTAACTGTTTTCTAAGTTTTCTTTCACCAAAAATTCCAATCATTATCTTCGGTTACCTTGGTTACATTGGTTTACAGTCATAAGAATTTTAACTCAATCTAGTCCTGTGGGATTCGATACTTGGAATACTCCAAGTTATTACTTCATCAATCGTGTATGCTTGCACGTAGACCTATCTATTCCATATTTTTATATTATCGTTGTCATTCACACACGCTCGGTCGATCAATAACCGTTGGTTTTCCTTTTTATCTCTTGTAGTTCCTCGTCATTATCAATCCTCAGCTGCAGTGCTTCCCTTTCTTCAAACCGTCAGTAGTTTCCCCAGAGGTATTCAAGGTTATTGCTATGGTCCTCCTTTGGTTTGTCAAAGTAATTTTGTCTCTATCAGCTTTAGCTTCACTGTCTTCTAATCCAACTTTGTTGTATCCAACTCATATACCATTTTTTTACGGTCGACCTTGGCCACTTCTGAGGGTCGAGTCTTGGGTAAGTTGCATTTTTTCATTGTTTTATTATCGTGGAAAGAGTCCATTAACCAGTTCCTTATTTGCCTCTCATTTGTAGAGAATATGTCTTTCCATGTGGCTTTTCATATACAGTGTTGTTCCATCAAATGATAAATATTTGAATACAGAGAACTTTCTAAATAAATTATAACCCTCGGATTCAACTAATTTGATTTGGATCTTAGTTGGTTTTTGGGCCAAATTAAGCCTATTTTTTGGGCTCAATTGAACTTTAGCCCAAATATTAATACCAATTTAGACTAAATTATTTTATTTGATCCAATGATCAAGATGAAAACGCGTGACATTATGAGATTTTCCAACTTATATTTTCAATTTTAATTTGGGGCACATGTCGGCTTTTTATTTGTCCAAAATGTAATAATTTCTAATTTTATCATTAGTTTGAGAAATGACGTGACAATTTGTGATTGATCCAAAATTTCTCATTCAACAAAAGAATTATCACAATTTTTTTTAAAAAGAATAGAAAAAACTATTTTGGTTTAGATTAAACTATTACTTATATCATCTAAAATTTTCAGTTTCACATTATTTACTTCAAAATATTCCTAAACTTTATATTATTTTGTAATTAATCTTCAATTTTTTTAAATTTTTTATGCTTTCGCATCAACATTTATAATATACATCTAAATATTATTTTACTAAATAATGATTAAGAATAGTTAATTATAGTCTCCCTAAAAAAATTTAATTATAGTTTAATTAAGCCATAAGTTTAATTAATTAATTATAACAATTTTCATCTATTTTCGTAAAACTTATGTAATTTTCTATCAAGATAGACATCGATACTTCAAATCATGATCCATATATCCATGAGATAGAAACCTCGATATTTCTATAGAGATATGAAAATGCCTTTGATCCGAAAACCTTCTAACACGTCCTGGAATTGGATATCCGCCGTTGATTGAAAACAAACGTTTTCCATCAACTCCCAATCTCACCGTTGGATTATCTACGGGTAAAATCCATAACCATAGAAGGATTTATAATAAGACTTCCTATTTAAAATCTCCGGGGATTGCATTCGGCAAAAATTTCTCTTGTTTCGGCAAACACTGGTGGGAATTCAACTGGAGGCCATCACGGATTCATCTGTAAATTGAGCTTTACTTTCGGCCTTAGGGTTTATAGGAATCCGCCATATTGCTCAAGGTATTGCAGTTTCTGATTTGTCCTCCACAGTTTGTTGTTTATTTTGTTGAGTAACTCTTTGGTTCGATTATGTACTTAATTCATTATCAAATTAAGATGAAAAATAGACGAGTTTTGATTAGTACTTAAGAAGAGAGCCCGCTTGAAGAATCGATATCATTAACAAGATCACGCCATGAAAATTTATGCGCTCAAGCGATTCTGTTTAATGGCCAATGATCGTTGTTCTTTCTGATAGTTTCTTAATCTTCCAAATGATGATGAATTTTGATAACTTAGGAAGAAACATCTGAGATTATTCTTGATCATTCGAGCAGTGAATGGCAGGAGATGGAGTTTTTCGCACTCGGATTAGTTGCATCGAAGTTCCAAGAGAAAGAAGAAGATGAAAGAAGTTCTCGATCTTTTTGCTTCATTGATATACCGTTGATTCCTCACAACCTCTAA

mRNA sequence

ATGGACTCGTCTCACTTGTCAACAATTGATCTTCACATGCATCTCCTACAACGTCCATGTGTCTGCTTTCCATCGATCCACATCGACAATACCAAGCCCGAGGCACTGCAAGAAGAAACATCTGAGATTATTCTTGATCATTCGAGCAGTGAATGGCAGGAGATGGAGTTTTTCGCACTCGGATTAGTTGCATCGAAGTTCCAAGAGAAAGAAGAAGATGAAAGAAGTTCTCGATCTTTTTGCTTCATTGATATACCGTTGATTCCTCACAACCTCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGACTCGTCTCACTTGTCAACAATTGATCTTCACATGCATCTCCTACAACGTCCATGTGTCTGCTTTCCATCGATCCACATCGACAATACCAAGCCCGAGGCACTGCAAGAAGAAACATCTGAGATTATTCTTGATCATTCGAGCAGTGAATGGCAGGAGATGGAGTTTTTCGCACTCGGATTAGTTGCATCGAAGTTCCAAGAGAAAGAAGAAGATGAAAGAAGTTCTCGATCTTTTTGCTTCATTGATATACCGTTGATTCCTCACAACCTCTAA

Protein sequence

MDSSHLSTIDLHMHLLQRPCVCFPSIHIDNTKPEALQEETSEIILDHSSSEWQEMEFFALGLVASKFQEKEEDERSSRSFCFIDIPLIPHNL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi05G005390.1Lsi05G005390.1mRNA