Lsi05G000150 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi05G000150
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr05: 264992 .. 270259 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi05G000150
SyntenyLsi05G000150
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAACAGTAGTGTATTTGGTTCATTTTCATTTATTACCCCTTCATTCATTCATTCATAATGATATATCTCATTCTTATTTATTTTTAGTATTGTTGCATTGTTGATTCAGTCATACACATTAAAATTTAAAGAGCTCTTTTTTCATACTTAATGCAAGTCTACAACTACGGGTTTAATCTTTATTTTCAGACTTCCATTAGATGATGTAGCTCTTTCTTTCCCTTCTTCAATTAGCATGATTTGGTGGAAGCTTTAAGATTGAGTTTTAGATATGATGATTTTCAGGAAAGATAAAAAGTGTTTTTAACTTTGTTTAAGTGCCTTTTCCTTTTTGATTGTTTAGTGGAAAAATGGTATTCTGACTGTTAATGCTTTATGGGTGCCAAAGGTCTGATCTTATCATCTAGCTCAGCTACCACCAGTGGAAGCTCAGAATTTTTAACTCCATAAATAGTGTTGGCTGTTATGGAACAAACCTAATTTTAACATTTGAATCCTGCAAATCTCTGTCGTGGAACAAATGATAAACTACAAAATTTCCCACTCATGTAAGCTTATTGTAGCTTTTTTAGCTCTATTTGTCTAATTGTTATTCAACAAATGTATGTATGTATATGTGTGTATATTTCAGCTTAACAGTAGTTTTGGAGGTCGGAGGTTCAAATTTGAACACTCATTATACTTAAGGAAAAAAAGTGGTGTAAGAAAGCATTTAACCTAGGAGTCATGGGTTCAATCTATGGTGGTCACCTATCTAAGATTTAATATTCTATGAGTTTCTTCGACACCCAAATATTGTATGGTCAGACAGGTTGTCCCTATGGTTAGACAGGTTGTCCCGTGAGATTAGTATAAGCTGGTTTGGATACTTACGGATATAAAAAAAGAAAAAAAGAAGTGTGTAACTTACACATGTGGATCTTTTATAGTTTTTGAGAAAAAGGAAAACAAACCATGATTTATAGGATTTAATCTAACATGGACTTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTCCTTTCCCTCTTGCTTAAGGTGATTCGGTGTTTTGTTAGGATATTTTAGACTTATAATATTATAAGTAAACTTTAAAGACATGTTTGGATTGACTTAGGTTAGACTTATAATTTTATTAATTAAATTTTAAACAAGTAAATTTAGACTCACTTAGGATTCCATTTGAAAATAATTCATAAATCAAATCTAACGTCTATTTTGTCGATATTAGGAGTAAGTATTAATATTCTTTGCAAAAACTAAAACTTAATTTAATCAAACTTTTATAAGTGAATTAATTTAGGCTTTTCAATAGAATGTTATTTTAGCATGTGATTTTAACACATATATATATAAGACTTCTTAAGACACAAAGATTAATGTAAATTAAAGAGAAATGTATGAATCAAATAGTTAGGGTTTATAGAATAAATTGTTATAATTATTAGTTTGAGCTTCCAATTGATAAGTTAAGGAATAAATTAATTTTTGCCTAAACAGAAGTTCAACATAGATCTAATTTTGATTTAAACAATTCTTTATTTGTTTATTGATTTCCTATTTCTATACAAGCCACATTTGGATTAAATATTGATTCTTTTTCATAAATTGAACAACGTTTATACTATGTTAATAAAATGTAATTGTTATCAGGATAAAAAATTCTTGACCAAGAGATTAGAGGCTCAAATCTCTACTTTCACAAATATAAACTCAAAAAACTCAAAAAACAAAGGTGTGAGTGGGGAAAAAAGAACAAGAAAACTATGGGGAAAATATTTTTATATCAATTTTCATTCCTTCAACAGGAAAAATCAATAAAAATAAAATACAAATTCCGTTGCCGGGACTTGAACCCGGGTCTTTCGGGTGAGAGCCGAATATCCTAACCAACTAGACTACAACGGATTTCGTTATCTTAAATTTAATTTATCAATAATTAACCTTTGATTTTTACACACGTGCAAGTTTTTTCTTTGAACTAATTAAAAATGCAAGTTTATTAAAATAAAAGGTGAACTTTTTTCATGGGATATTTTAGAGAGAATTAAAAAGCAAGCATGAATTATGACCGAGATTAAAAAAATTTGATTTAATGTGTTTAGTATGGTTGGTGCGCAGATCTTGTCGTGGTCTTGAGTCCTTGGACGAGGTCTCTCTTGACTCTACAAGTATGTCTTGGCTAACTTGTAAGAGAACTCACATCGATGTAGTGCCAAGCCATACACACACTCTGATACTTAAGTTCGTAGAAGAAGTGTTTAGTTTAACTAAGCTTACTTCTTGAGGTGGTGGTGAGGGACTATTTATAGAGTTCTTCGTCTGACATCCGCTTGGGATATGTGTCATACTGGCAGTGTCGATGATGTATTCCTCAAAGTCGTAGGCTTTCAATCACTGATTTTGGTTTGAATATTTTCCCTTTGGTGATAGGGATCGAGCTTGGCCTTGCTTACTCAACACTCGAGGCTTCAAATTTCCATTTAGGGATGCACGGTCCCCTAGGGTAGCCCTCAATACTTTCCTTCAGACGAGCTGGCTTAAGGTTGAGGGTCAGGTTGTCGACTTTAATGGGATATATGAGGTCGCGCGTGATGGCACTAATGATTACCTTTCGTGGCCATTGTGCTTCTCTGAGTGGTTGTCACAAGCTTCTGTCAGTCGTGTCTCTTGAGAGTGTCGGTTCATCTCCAATTGTTTAGAGCGTCAGATGCAAATCCAAGCTACAGTACTTGCCGAGCCTTCAATGGCGACAATAGGCAAGCTTTCTTCATGTCTGACTTAAGTAGACCCAACCTATCGAGCTTGTGGTAAATTTCCTTTGTCGCTTATTGTATTGTCTTTTCTTCTCAAGGTAATGGTTAAAATGTCTAGGCGGCCTAATAACGTTCTAGAGTTAGGGCACGATGGGCTTGTCTTCTCGGCTTCTTTCCCTCAAGATGGAGATTTGAGGGTTAGGTATGAGCACTACAACAAATTTGGGCTTAGATGTCGGTTGAAAAAAAATAAAAATGGATGTACAATGTCGGTTGTTAAAAAAAAAACGGATCTTTAATGTTGGTTTAAAACCAACATTAAAGATAATATTAATGAAGTTGCAACGTCGGTTTAAAACTGACATTGTAAACCCCCCTTTTACTAAAAAGCCTCATTTCTTAAATTTTTTATCTCTTTCCTTTCTCACAAAATTTCTCCCCCCCAAAACTCTTTCCCTTTGCTTTCACCATTTGGCCGCCAAGGAACCCGTCCGTCTGCTAGATCTACATCGGTCAACTCCCATCTGGCAGCTCCCATTTGTCAGCTCCAGATCGTTAGATCGTCAGCTCCAGCTGCCAGGTTGTCTGTCAGCTCCATTTTGTCAGCTCTAAGGAGTTCGGCAGCTCGCATATGCTCTCGTCCATCATTTGGTCATCCGTTGTCTCCTCTGTTAGGGATCTGGCCGTTCGTCCATTCTAGATCGTCAACTTGCCGTCTGTTTGTTCCAGATCTGGCCGTTCCAGATCCTAATCAGCTTGCCGTTCCAGATCCTAATCAGCTTGCCGTCTGTGTCCATTTCAGATCTGCCAAGTTCGTCTGTTCCAGATCTTCTAGGTTCGTACGTCCGTCGACTCGTCTAGTCCGTTCTCCGTTTAGAACAATTCAAGCTCCGATCTATTTGAGATCTTCAAGGTCGGATCTGTTCCAGCAGCTTGTGGGTTGAATGAAGCTATTCACATTTTCCTGTGGGTTGTTTGAGTTGTTTGATTGCTCCAAAGGTGAAATTTTCTTTTGATATTTATTTTTAATTTAGTAATCTAAAGTTATTTCATTCTTTTTTGTTTTTATTTTAATAATTATGGTTCATAAGATTTTTGTTTTTAGGTCTTGTTTTTTATTATGATTCACAGTTGTCTCATTTTGTTTAATAACTTCACTTTTATTTCTAAAACACATTTTCTTGTTAAAGCACCTTTATGTTTTCTTTGTGACAACCAAAACATAGGATAGTTATAGTTAACGTGAATGATTTGTGAATTTTTATTATGATTGAATAGTTTGATTTTGACGGATTTCTTTCTTCTTGTTGGTGAAAATGTGGATTGAATAGTTTGTACATAAATTGTGGTGTTTTAAACTTGTTTGTATTGTTTGATAGTCTTGTTGTTGATTATGGTTCATAAGGTTTTAAAGTGTTGAAATGAAAATTAATTTAAGAATATGGGCCTATTTGATAGTCTTGTTGTTGATTATGGTTCATAAGGTTTTGAAGTGTTGAAATGAAAATTAATTTAAAAATATAATTTTAGGTATTTTGGGTTGTGCCATTCTTCTAGCTTCTTGAGTTTCCTGAAATATATCCACTTGAAAAGTTGAAAATGAAGCTTACTAATGTATTTTGTTTGTTCTTTTCGTTTTCCCATATTTATCTTGAGATTGAACTAAGAATAGTAGTGGGTTGCTTTTGTTTCTAGAACTTTATATGACATGCTCATGGGTGAAGTTTCCTTTCTCTTAGTTTTTCTTGTTCTGGTTTGTTTCTTGTATCGTTTGTGTTCAATTTGCGTTCTGTGGTTGCTTGATGTTGCATAATTCGCTCTCTTTTGAGTGAATTGGGGAATATAGGTGAAACTACTCATTCAGTCTTTGGTTAGATCAATAAAATGTTAAATAGAGTAGAATAGTTCAGAAAAAATAAGAATAGTAGACCATTGCTTTCTTTAACCATATGCTTGAGTTTTTCTGTCTTGTGGACATGAGATATGTGTTCACTCAATAGCTGCCAACCTCTAGTGATTTCTTCATGTCTGATGGTGATACTTGTAGCACCTACGAAGCATAGAATTTTGATTTAGGCAATGTGTTCATGTCCCACACTTCGATCATTTGGGCAAATATCGAACACTTTTAGTATAATAAAAATGTGCCACATGCTTGGTTGGCATTTTCATAATGAAATGCAAAAAAGATGCATAAGCATAATTAACTTTTAATTTCTTCGTTGAATTATTGTCAAGCATGTCTGAGGCTGAGTG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mRNA sequence

ATGAACAGAAAAATCAATAAAAATAAAATACAAATTCCGTTGCCGGGACTTGAACCCGGGTCTTTCGGATCGTCAGCTCCAGCTGCCAGGTTGTCTGTCAGCTCCATTTTGTCAGCTCTAAGGAGTTCGGCAGCTCGCATATGCTCTCGTCCATCATTTGGTCATCCGTTGTCTCCTCTGTTAGGGATCTGGCCGTTCGTCCATTCTAGATCGTCAACTTGCCGTCTGTTTGTTCCAGATCTGGCCGTTCCAGATCCTAATCAGCTTGCCGTTCCAGATCCTAATCAGCTTGCCGTCTGTGTCCATTTCAGATCTGCCAAGTTCGTCTGTTCCAGATCTTCTAGGAAAAATCTTCAGATTGGCAAAATTATTTTGTTG

Coding sequence (CDS)

ATGAACAGAAAAATCAATAAAAATAAAATACAAATTCCGTTGCCGGGACTTGAACCCGGGTCTTTCGGATCGTCAGCTCCAGCTGCCAGGTTGTCTGTCAGCTCCATTTTGTCAGCTCTAAGGAGTTCGGCAGCTCGCATATGCTCTCGTCCATCATTTGGTCATCCGTTGTCTCCTCTGTTAGGGATCTGGCCGTTCGTCCATTCTAGATCGTCAACTTGCCGTCTGTTTGTTCCAGATCTGGCCGTTCCAGATCCTAATCAGCTTGCCGTTCCAGATCCTAATCAGCTTGCCGTCTGTGTCCATTTCAGATCTGCCAAGTTCGTCTGTTCCAGATCTTCTAGGAAAAATCTTCAGATTGGCAAAATTATTTTGTTG

Protein sequence

MNRKINKNKIQIPLPGLEPGSFGSSAPAARLSVSSILSALRSSAARICSRPSFGHPLSPLLGIWPFVHSRSSTCRLFVPDLAVPDPNQLAVPDPNQLAVCVHFRSAKFVCSRSSRKNLQIGKIILL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi05G000150.1Lsi05G000150.1mRNA