Lsi04G010720 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAGTTTGTAGCTTTCTTGTTTTATTTATATATTCATGCTTGGATGAATGGCAAGAAGGAAGAAATTGTGATGGCGATTATTCTTCTGATTTTCTTATTCCTATTCACTAATTCGAGAGCCGAAGAGCCACCGTTCGATGTAAAGCAACATCTCTCCACTGTTACTAGGTTCTTTTTATCATCTTTCTCATCTATTTTCGATCTCATTCTGTTTCTTTGAAAGCTAAGTTGGCTGCAAGTTTGACTGTTACTAGTTTGATGTTTAGGAATTCTTTTTATATTTTTGTATAAGGCTGACCAATAGAGGAATTTTTGTGTCTATTGTTCTGGTTACTATTCAAATATCAACAAAAAAAAAAAAATTAAATTATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTTATTCGTGAGTGTTTGAGCCTGTTTATGGGTACCTCGATTCATTTTACAAGATAACTCTCCTGACCCTACAACATTTGGGTGTCAAGAAAACTCGTAGGATATTAAATCTTAGGTAGTCACCCTGAATTGAACTAGTTCTTGTTTTTTATTAGAAAAAAAAAGAGACAATGTCCTATGTTTTGTGCAAGTGTGATTTAGAATCTGATTGGATATTAAATCTTAGGTAGCCACCCTCTAGTTCTTGTTTTTTATTAGAAAAAAAAAGAGACAATGTCCTATGTTTTGTGCAAGTGTGATTTAGAATCTGATTGGATATTAAATCTTAGGTAGCCACCCTCTAGTTCTTGTTTTTTATTAGAAAAAAAAAGAGACAATGTCCTATGTTTTGTGCAAGTGTGATTTAGAATCTGATTGGATATTAAATCTTAGGTAGCCACCCTCTAGTTCTTGTTTTTTATTAGAAAAAAAAAGAGACAATGTCCTATGTTTTGTGCAAGTGTGATTTAGAATCTGATTGGATATTAAATCTTAGGTAGCCACCCTCTAGTTCTTGTTTTTTATTAGAAAAAAAAAGAGACAATGTCCTATGTTTTGTGCAAGTGTGATTTAGAATCTGATTGGATATTAAATCTTAGGTAGCCACCCTCTAGTTCTTGTTTTTTATTAGAAAAAAAAAGAGACAATGTCCTATGTTTTGTGCAAGTGTGATTTAGAATCTGATTGGATATTAAATCTTAGGTAGCCACCCTCTAGTTCTTGTTTTTTATTAGAAAAAAAAAGAGACAATGTCCTATGTTTTGTGCAAGTGTGATTTAGAATCTGATTGGATATTAAATCTTAGGTAGCCACCCTCTAGTTCTTGTTTTTTATTAGAAAAAAAAAGAGACAATGTCCTATGTTTTGTGCAAGTGTGATTTAGAATCTGATTGGATATTAAATCTTAGGTAGCCACCCTCTAGTTCTTGTTTTTTATTAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTGGTTAATTAAAGTTCAACGTCTTAGTCGATATAAAATTGAAAGTTGGATGTATAAGGCATTGTTTAAACTATAGATCTATTAGAGATAAATTTAAAAGTTGAAGAACTAAACTTATAATGTTTTTTTTCTTCTTCTTTTTGACAATATATAGAGACTAAACTTGTAATGTTATCTTCATATAAATATAATTTTAAATAAATTGATATATTATATTAAGTATATTAATTCCAAAATTATAACATGCAACAACGAATAAAATTTTAAAAAATTATTGTTTCTAAATAGGATGAAATTTTTTTTCCAATTATTTTATGTAAAGTAATTTATTAAATATTAAGAAAATTTGTTTGTGTATATGTGAAAAATTAGAAGTTAAAAATGAACTAAATTGTCAACTATATCAAACTTAAACAGTATATATGATATATTTGAAAATAAAAAAAAACGAAGCCAAAATATATTAAAAACATATTAAAAAAAGAAATAAAAAAGGAAATAAAATCGGCATATCTACCATAGAAATTGTTTTACACGACAAAATAATGAAACTATTTACAAATATAGCAAAAAGCACACATTGGGATAAGTAAACTTTTTGTCATTTTGCTATATTCATAAATAGTTTTATTATTTTATTATTTATGAAAAACCCCTTATCTACCATATATGTAAAGATATATTCGAAAATAAATAAAACAAAAGCAATATAGATGAGTAATTGTTTTAAATGACAACATTGTTGGAAATACTTTTAAATATAGCAATAAATGTTATTGTCTATCCGTGATAAATAGTGATAAATATCGATAGATATTTATCAATGTTTATTAATAATGAATAGTGATAGATGATAGTATAGATTATCAATGTCTATTATTGATAGATAGTGACATTTTGCTTCGTTTGTAAATAAGTTGATTCATTTTGCTATATTTGAAAACAATTTGTATATATAAAGACGTATTTTTAAAAAAAATCAAAATTAAGAGTAAAACGAAGTAAAAGCCGCAAATAGACATTGACCCAGGACGAAATGATCCGTCAACAGCAACATTTAGTTGACAATTATTAATTTATTAATTATGAATAGGATTTATGTTAAAAAAAAACTATATAATTATTATTTTGTAATATTATATCATTTATAATATACTACATAATACCTATCTTATTTTTTTTAAAAAAATAATTTGAGTTTATAATGTGACATATTGTAAAACTAAATATTTTTATTTTTATTTAATATAATTATGTATTCTAAAATTCAAAATTTAAAATATGGATACAATAAAAACATAAAAAATGTTATTTTCAGAATTTTTCAAAAACAGAATGTGTGAGTGAGTTAGTCTGTTAAACACATATTTGCTTAATTGAGTGAATTTGAAAACATAAAACAAAATTTACAACATCGGCCAAATATGACCTAAAGATTCCATAGAAATGATTGATTAGATTTAATGGTTTATTTATTTTTTTTTCTCAGTCAAGGCACGGAACTCGTTCTCCAACCAAAAAATGGATCAAAGAGTTAACCAAAATGGAAAATGAAATAGAGATGCTTTTACGAGGTGATGAAGGAAATGAGTTGTCTCTGCATAAAGTTCCTTCGTGGATGAAGGGATGGAAATCTCCTTGGAGAGAACAAGTGAATGGTGGAGAATTGATTCCTAAAGGAGAGAAAGAATTGTATGATCTTGGAATCCGAACCAGAGAATTGTTTCCTAACTTGTTTCGTGATGATTATCACCCCGACATATATACAATCAAAGCTACTCAGGTTATTTTCGCTTTTGCCTATCATTTGTTTTGTGTTTCGAAAGCTATTTTCAAATATAGCAAAAACAAGTGAACTTATTTATAACTTATTATTATTGTTTGCTATATTTAAAAATATTTCTAACAGTTTTGCTATTTAAAATAATTATGTTGATCTTCATTCCTCTCTAAACAATTAGATTCCTCGGGCATCAGCTAGTGCTGTGGCATTTGGTATGGGACTATTCAGTGGGAGAGGAAGCCTTGGATCAAATCAACATCGAGCTTTTTCTGTTGTCAGTGAGAGTCGTGCCAGTGATACGATGCTTAGGTTTTTTGATTGTTGTAAAAAATATAAGGTAATTATGAATTCTTAATATCTTATTATTTATTTAGAGAATATTTAAAAATAGAAAAAATAAAGAAAACTATTTACACAAAATAACAAAGTTTTAAATAGTTATGATAGACACTTAGGGTCTATCAATGATAGAAATGATAGAAGTCTATCACTGATAGATGCTGATAGAAGTCTATCAATATCTATCATTATTTTTTTTTTTACTATTTTCTATAAATAATTTGACATTTTTTCTATTTGTAAAAATTTCTCTAATATTTGTCAAAATTTGTTTGCGTATTACTATTTTCATTAAAATCATACTTTTGTTCACTGTTTTGCAATTTTATTCTGTCAGTTTGTGCATGGAAAATCTAGCACTCATACCCTCCTAAACATATATTTAAATGTTATTTTTCATTTGTCTTTCTACACGTTTTTAATTTCTTGTAGGTGTTTAAAACTTGAGCATATGACGATGGACAATTGATTTTTTTTTTTTTAATATAGAATCAACCATTTTTATTGAGAAAAAAATGAAAGAATACAAGGACATACAAAAAACAAAAGACAAGCTCACAAAAACACTCCCTCTAAAAATAGGATTTTCAACTAAGTAAGATGTTAGGATCGATATGACAACCTTAGAGAGGTGAAAATGATTTATTTAAACCAATTACAACTTTTTCACTATTGTGAATCTAATTAAATAAATTTACACACTTTTAGCTAATAAGTAATCTAAACAAGAATTTTATGTAGAAATTTAAGAAATACCAATCAAAATAAACAACTATGAGCAATTGATTTCAAGAATAAATTAACAACAAAAATTAATTGCAAAAGTAAATTAGGAGAGGGATAAAGAAATTGACCTTGTGATTTTATAGTGGTTCGACATAACCGTCCTACTCCACTCTCTAAGCTTCTCTTGGGAATACTAATAGAAATCTCACCGACTCTTTCCACAAATTAGAGCCCAACAACTATACTGCTCTTTTTGTGAGTTCAAGAGCAAACTCCACTGTTTCTATAGATAACGATTAAACTATTACAACACTCTTGTTGTGGGTTCAATAGTAATCTCTTAGAATGGATTTGAAAGAATTAAAGAGCAAACTTAGAAACTCTCTCGGTAGGGTAGATTTACAAGTTGTAGCACTCAACAAATCAATCATCACAATACAATATATCTCTCTCAAGAATTAAATGAAAAGAAGAAAATTGAAGTTAAATGTGAATTACGAAGAGAGTGAAGGTGTTCAAAACCAAATTCAATTTGGGCCTTTAGATCTTGTTAAAATTTAAATCAATAGTGGACATTTTTAAAAGTAGTTAAAAATAATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTTCTTTTTAAAGAAAGTATATGCTCCCAACGGTCACTTTTGACCATTTTAACTTTTGAAAATTTTAAAATCATGCTCACATAATATATATATATATCACTCT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AAAGTTTGTAGCTTTCTTGTTTTATTTATATATTCATGCTTGGATGAATGGCAAGAAGGAAGAAATTGTGATGGCGATTATTCTTCTGATTTTCTTATTCCTATTCACTAATTCGAGAGCCGAAGAGCCACCGTTCGATGTAAAGCAACATCTCTCCACTGTTACTAGATATATTCGAAAATAAATAAAACAAAAGCAATATAGATGAGTAATTGTTTTAAATGTCAAGGCACGGAACTCGTTCTCCAACCAAAAAATGGATCAAAGAGTTAACCAAAATGGAAAATGAAATAGAGATGCTTTTACGAGGTGATGAAGGAAATGAGTTGTCTCTGCATAAAGTTCCTTCGTGGATGAAGGGATGGAAATCTCCTTGGAGAGAACAAGTGAATGGTGGAGAATTGATTCCTAAAGGAGAGAAAGAATTGTATGATCTTGGAATCCGAACCAGAGAATTGTTTCCTAACTTGTTTCGTGATGATTATCACCCCGACATATATACAATCAAAGCTACTCAGGATTACAAGAATAATCAAGAACATGAAGTTGACAAGCTTAAGGAACCTGTACTTGATGATATAACTAAGTCGCTCACTGAACGTTATGGTCTAAATTTTACCCGGCAGCACATTTCATCTCTTTGGTTTCTTTGTAAGCAGGAGGCATCCTTATTGGACATAACGGATCAAGCTTGTGCACTGTTCAGCCCTTCCGAGGTTGCTTTATTGGAGTGGACGAATGATATAGAGGCGTTTATATTGAAGGGTTATGGCAATTCATTAAACTATAGAATGGGAATTCCTTTGTTGCAAGATATTGTTGAATCCATGGAGAAAGCTATCAAAGCCAAAGAAGAAAACCAAGTTCCTGGCAGCTATGAGAAGGCAAGACTTCGTTTTGCTCATGCTGAAACTGTGGTTCCATTCACATGTTTGCTTGGGCTGTTCCTTGAAGGAGAAGGAGATGTATTTAAACAAATCCAAAAGGAGCAATCTTTGCAACTTCCTCCACAACCTCCAGCTACTAGAATTTGGAAGGCAAGCAGTGTTGCACCTTTTGCTGGGAATAACATGCTGGTTCTCTATAGTTGCCCCGTTAACTCCACGGACCACTACTTCGTGCGAGTCTTGCATAATGAACAACCCATAGCAATGCCGGATAAAATTGTGGCTCCTCATCTTGAGCATGATTTCAACACGTTGTGTACTGTGAATGAGGAAAAACCAACACCGACGCCTGAATCAAGTAAATTATCATTGTTACGTTGGCTCTTTTCGCTTCCCAATGATGATAAACAACCTCGAAATGATGAATTGTAGGAAATGATGTCTACTAACTACACAATCTTTGGTCTTGACATTGTTTGTTTTCTTAACTTGAAGATCATCAACATGCGCAGACGCATAATTCAGGTTTTACATGTAGGCAGACTCATATTCTATGCTAATTTTGAGTTTCGTTTTAATCGGATCTTGAGCTTCCATCTATTTCACACGTCTCTTGATTTAAAGATTTAGACTCAGACCATTTGGCATTTGCTTGGTGTTTTATTTCACCACAAAAATCAAATTTTCTTCTACTTCTAAATCAAGATTTAGTTCACTCTTTTACAATATTCTTATTTGTACAATAAGGGAAAGGATTGAGCTTGTTCATCCTTTTTAACATTTTTTCTCCAAGCCTTCTAAAATATTTTCTTCCTTGTT ATGTCAAGGCACGGAACTCGTTCTCCAACCAAAAAATGGATCAAAGAGTTAACCAAAATGGAAAATGAAATAGAGATGCTTTTACGAGGTGATGAAGGAAATGAGTTGTCTCTGCATAAAGTTCCTTCGTGGATGAAGGGATGGAAATCTCCTTGGAGAGAACAAGTGAATGGTGGAGAATTGATTCCTAAAGGAGAGAAAGAATTGTATGATCTTGGAATCCGAACCAGAGAATTGTTTCCTAACTTGTTTCGTGATGATTATCACCCCGACATATATACAATCAAAGCTACTCAGGATTACAAGAATAATCAAGAACATGAAGTTGACAAGCTTAAGGAACCTGTACTTGATGATATAACTAAGTCGCTCACTGAACGTTATGGTCTAAATTTTACCCGGCAGCACATTTCATCTCTTTGGTTTCTTTGTAAGCAGGAGGCATCCTTATTGGACATAACGGATCAAGCTTGTGCACTGTTCAGCCCTTCCGAGGTTGCTTTATTGGAGTGGACGAATGATATAGAGGCGTTTATATTGAAGGGTTATGGCAATTCATTAAACTATAGAATGGGAATTCCTTTGTTGCAAGATATTGTTGAATCCATGGAGAAAGCTATCAAAGCCAAAGAAGAAAACCAAGTTCCTGGCAGCTATGAGAAGGCAAGACTTCGTTTTGCTCATGCTGAAACTGTGGTTCCATTCACATGTTTGCTTGGGCTGTTCCTTGAAGGAGAAGGAGATGTATTTAAACAAATCCAAAAGGAGCAATCTTTGCAACTTCCTCCACAACCTCCAGCTACTAGAATTTGGAAGGCAAGCAGTGTTGCACCTTTTGCTGGGAATAACATGCTGGTTCTCTATAGTTGCCCCGTTAACTCCACGGACCACTACTTCGTGCGAGTCTTGCATAATGAACAACCCATAGCAATGCCGGATAAAATTGTGGCTCCTCATCTTGAGCATGATTTCAACACGTTGTGTACTGTGAATGAGGAAAAACCAACACCGACGCCTGAATCAAGTAAATTATCATTGTTACGTTGGCTCTTTTCGCTTCCCAATGATGATAAACAACCTCGAAATGATGAATTGTAG MSRHGTRSPTKKWIKELTKMENEIEMLLRGDEGNELSLHKVPSWMKGWKSPWREQVNGGELIPKGEKELYDLGIRTRELFPNLFRDDYHPDIYTIKATQDYKNNQEHEVDKLKEPVLDDITKSLTERYGLNFTRQHISSLWFLCKQEASLLDITDQACALFSPSEVALLEWTNDIEAFILKGYGNSLNYRMGIPLLQDIVESMEKAIKAKEENQVPGSYEKARLRFAHAETVVPFTCLLGLFLEGEGDVFKQIQKEQSLQLPPQPPATRIWKASSVAPFAGNNMLVLYSCPVNSTDHYFVRVLHNEQPIAMPDKIVAPHLEHDFNTLCTVNEEKPTPTPESSKLSLLRWLFSLPNDDKQPRNDEL Homology
BLAST of Lsi04G010720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O35217 (Multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Minpp1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 101.7 bits (252), Expect = 1.8e-20 Identity = 88/380 (23.16%), Postives = 158/380 (41.58%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54ND5 (Multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=mipp1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 2.6e-19 Identity = 100/448 (22.32%), Postives = 172/448 (38.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9UNW1 (Multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MINPP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 2.6e-19 Identity = 89/386 (23.06%), Postives = 159/386 (41.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Z2L6 (Multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Minpp1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 4.5e-19 Identity = 90/405 (22.22%), Postives = 165/405 (40.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R890 (Multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=MINPP1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 1.3e-18 Identity = 89/379 (23.48%), Postives = 159/379 (41.95%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KM02 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G211580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 591.7 bits (1524), Expect = 2.2e-165 Identity = 300/433 (69.28%), Postives = 332/433 (76.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZJ9 (multiple inositol polyphosphate phosphatase 1-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 578.6 bits (1490), Expect = 1.9e-161 Identity = 299/436 (68.58%), Postives = 328/436 (75.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T2S9 (Multiple inositol polyphosphate phosphatase 1-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold56G00410 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 565.5 bits (1456), Expect = 1.7e-157 Identity = 299/459 (65.14%), Postives = 328/459 (71.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D0N9 (multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015966 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 562.4 bits (1448), Expect = 1.4e-156 Identity = 283/432 (65.51%), Postives = 321/432 (74.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K8D6 (multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491066 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 560.1 bits (1442), Expect = 7.0e-156 Identity = 282/432 (65.28%), Postives = 322/432 (74.54%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. NCBI nr
Match: XP_038892483.1 (multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 604.4 bits (1557), Expect = 6.6e-169 Identity = 303/433 (69.98%), Postives = 336/433 (77.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. NCBI nr
Match: XP_011655004.2 (multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 590.5 bits (1521), Expect = 9.9e-165 Identity = 299/433 (69.05%), Postives = 332/433 (76.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. NCBI nr
Match: XP_008454817.1 (PREDICTED: multiple inositol polyphosphate phosphatase 1-like isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008454818.1 PREDICTED: multiple inositol polyphosphate phosphatase 1-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 578.6 bits (1490), Expect = 3.9e-161 Identity = 299/436 (68.58%), Postives = 328/436 (75.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. NCBI nr
Match: XP_038892484.1 (multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 566.2 bits (1458), Expect = 2.0e-157 Identity = 284/410 (69.27%), Postives = 317/410 (77.32%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. NCBI nr
Match: KAA0035877.1 (multiple inositol polyphosphate phosphatase 1-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 565.5 bits (1456), Expect = 3.4e-157 Identity = 299/459 (65.14%), Postives = 328/459 (71.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G010720 vs. TAIR 10
Match: AT1G09870.1 (histidine acid phosphatase family protein ) HSP 1 Score: 434.1 bits (1115), Expect = 1.1e-121 Identity = 222/424 (52.36%), Postives = 280/424 (66.04%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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