Lsi04G007940 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTCGGCTCTCGCAGTCGCCGCAGAAAGTTCTCCGTTTGAAGCTCAGAACGAATTTTTCTTCATTCTCAGTTAAAGAAAAAAGGAGAGAATTGGAGAAATTAGGGTTTGAAGATGTCGTACCTTCTACCACATCTGCACTCAGGATGGGCGGTGGATCAAGCGATTCTCGCTGAAGAAGAACGCGTCGTCATCATCCGCTTCGGCCATGATTGGGACGACACTTGTATGCAGGTAACCTCATTTTCAATCCTTAACTCTTCTTCTCTCGATCAGTTTCCAAGCTATAGGCATTTTTCTTTTTTGCTGATTCCGATTCTGTTCGGTGATCGAAATTCTGAGGAGCAGGATTTTCTTGTTCTTTTTTATGCGGAATTATGAAGTCTCTCTCATTTTGGCAGAGAAGAAAGAAAGGCGACGCCATATCTAATTGTTTCTTTATGGTTAAATTATTATTATTATTATTATTTGCATTCATTCCATTTTTTGTTTTTTTAATTCAAGGTCACGTTTTAATTTCATTAAAAAATACTTTCCCTTAAACTTAATTTAGTCTATATAAAATTAGTTTCTAGAATTTCGTAAGCAATTATTTATTCTTTAAAATTTTCAATTTATAACGATTTAGTGTCGTGTGTTGTAGTAATTATTATTAAAGTTTAGGGCAAATATCAGGTTGTGTCAAAATTAAATAGAGAAAAATAAAGGAAAAATTACTGTAAACAGAAAAAATATCAAACTATTTATAAATATAGAAAAATTTTACTGTCTGTGATAGAATTCTATCGCTTTTTATCGCTCAAGCAAATAAATTCTACTGCTTGAGCGATAGAAAATGATAGAATTCTATCGCGTTCTATCACTAATAGACTGTAAAAAATTTCTATATTTGTAAATAGTTTGATTCATTTTTCTATATTTGAAAACAACTCAAAAATAAATGTATATTTTTAAAAAAATTCATTTTTATTTAAAATCTTTGGATAAAAACTATTTAAAATAAATTTTGAAAGCCTTTCAAATGCTATTTTGAGTCCTTCAAACACTCTTATTTTTTTCTATTTTTTTTTTAAAATGACTTATTTTCAAAATTAAACATTCAAAAAGTTAAACCAAACACACTCAATCTAGTGTAAGTATATTAATGTACACTCTCCTTCCGATTTCATTCGACATATAAAACTTATTATTTGACTCAATCAAATTCTAAATTTTCATAAGTCAACCAATTTAGTTCTTCCATAACAATTATCTTTTGAAAATCATTCCTACATTAATTTTCAAATGTGTGTAGACTTTTTCAAATATCGTTTTACAACATGGATGATTAGAATAAATGCATAGACAATTACAAATTGATACACTTACAAAAGTTTAGGTTTAAATTAATATAATTATTAGTTCGGATTTTAAATTGACACAACCCCTAAAATTTAGGCGAATAAATGATACTTTTTCCAAAATTTTAATTTAAAAAATTTACCTAGATAAATTAATAAAACTAATTAGAAATCAAATTTCTTTTTAAAGTAAAGAGACCGCATTGACTTCGTGCTTATTTGTTATGCCTACTAGTCTCTTAACATTTAATTTCGTGTTTAACATGTATTTAACCTTTTCAATATTTTCTTCAAAATTCATGTCTAAAATTCTATTAAATAAAAAATTCAAATTACATTTAATAGATCAATTACTTAATTTTTTTTTTTTAAAAAATGCATATCTCTACGAGCTACTAGACATTTTATACTTCAAAAATTTATTCAATATAAGCCTAAAAAATTAAGGAACTAAACTTTGTAATTTAGTGAACTCTACAACATTCTTACTTTAACCCCCTTTTCCCTTAAAAAAATTAGATGAATTTTGGTAGCAGAATTAAAAGAAAATAGCTCATATAAAAAGAACTATACTTGTAATTCAATATTTGTTGTGTAGATGTGTTATTTAATAGCGACCAATTCGGTTAAAATTGTTGACTAAATTACTGGTGAATAGGAATAAAACAGACAGACTGAAGAAACCCTGGAGCCCATTTTCCGTCCTTCAACCTCCTATGATTTGGGCCGAAGAGTTGTTTATGTATATCTCTCTCTCAACTTTCTTTTTCTTCTTCTTGCTTCTACTGCAACTGAATTTGTTCTGTTTTCATTTCACAAAACAAGTCACTTTTTTAGTTCTTCAAGTTTTGATGCCTTGGTTGGTCAAAGTTTTTCTTGTTTTGCTTTCTTTTTGTGTATTTTTCTAATCTGGGTTTGAGCTTTGAATATTTGCTTGCTTGAATTGATCAGACTTCTTAAGATTAGTATTGATGAAGTTTCCCTAACTTGAACGAGTTTAAATTTTCAACTTTGTGTGCAGTTCTAAGATTTTTAGAGTGAAGTTGTTCGGTGGTGGGGCGTGATCCTTTGTTAGATTTCATACCTTGCTTTGAGTTTCCATTTCATTTGTAATTATCTTTCAGGTCTTATTTTGTTTAACTAGAGCCCCTTCTTAGAGAGTATTTGGACTTTTCTTGGGGGTGTCGTCTTTCATTTATTCTTAAAATGGAAGCTTAGCATTTTATTGGAGAAAAAAAAAATTCTATTCATTTGTTATTTATCCTTGTTGCCAGTGTTCACTTCTTTATTATCTTTTGTTGTAATTGTAACTATGGTCTTTGAACAAAACCTCGTAACAAACAAGGATATCAGAAACTCTTACCAATTCATATCCTCAATTCTTTGGTCTTATTTTGTTTAATAGGAGCCCCTTCTTAGACTAGTTGGACTTTTCTTGCATGTATTCTTTCATTTATTCTTAATAGAGGCTTAGCATTTTATTGGAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAATCATATTGTATTCATTTGTAAGTTATCCTATCTCCTTATTGCCTGTGTTCACTACTCTATTATCTTCTGCTGTAAGTATGGTTTTTTTAATCACATTTTGAGATGCTTTATCTGATTGATATGTGCTTTGATCTAGATGGACGAAGTGTTGGCGTCAGTTGCAGAGACGATTAAGAACTTTGCAGTAATATACCTTGTGGATATCACAGAAGTTCCTGATTTCAACACAATGTATGAATTGTATGATCCTTCCACCGTCATGTTCTTCTTTAGGAACAAGCACATAATGATTGATCTTGGTACTGGAAACAACAATAAGATAAATTGGGCACTCAAGGATAAACAAGAGTTCATTGATATAATTGAAACAGTTTATCGTGGAGCAAGGAAAGGACGTGGTTTGGTCATTGCACCTAAGGACTATTCAACCAAATATCGCTACTAGGATGTTTTGCTGCTTGTGCAAGCTCTTATTGATTTTAAATTTAAGAAATTGCATCTCGAAAATCTGTACTATATGATATCTGCTTTATTTGAATGGCATATAACTCTTTATGACATGTTCTCCTTCCTATTCATGGATTATGTATTGGATTATAATAGTTGGTAAGGAAACAACCGCTGAACTACCTTGTTTATAAACAGAAGGGTATGATACACAAATATAAAGTTTGTTTACCTTGTCTCATACACACCTCGCTTCTTAATTCTGTCATTTGTGATCACATATATCCATGTCTTTTTCCATTTTTATTATTGTACAACTATAAACTATACATGCAACTACTGTCTTTTAGATAAATTTACTATCTGTGTAATTCTCAAGGCCTAAGCTTTCTTGCAATCATTTCTACCATTCCCATCACTGCCATTCCAATGATATACCAAGTGATTCCTGTTAGTATCACCTGCATCCACTGACTGTTAACTAACTCCAGAGCCATAGAACCCGCGGGGTGTTCCTTTAAGCTGCTGGCACCATCATTTTTTACCATTTGCTGAATTATAGAAGTTGCAATTATCGATATTGAAACTGGTAATGCCAATCTCATGGGACTAACATGACCACCATTACTAACATCAAAACCAAGGTCGCTTGATTCTTTTGTAGGTTTGGTCTCCGCCCTTGGCTTTGAGATTGTGTTGTTTGGAGATTGAGTTGAGGCTGGAAGTGCAAAGGTGGTTGGAACCCAGTAATCATCCTTGTATAGGTATTTTGCTTTAGTTCTATTTCTGTCTTCAGCTTTTGCCCTGACTTGTTTCCTTGCAGTAACAGCAGCCTGAAGTTTGTTGATTTCGGGTGTGAATTTTCTGGAACTGCGTGCCAGGTTTTGACCGTGTTTCGATCCAGGTCCAGCCGGTGTGGCTGTCTGCCAAAATAGCCAATTTGAGATTGATCTGATAGCCTGAATTGCAGCCAACTGTGCTTCACTCTCAAAGGTTGCTCCCTGTAAAACAATCATACAACTTGATGAACTTACTACGCCATTGAGGAAGGAAAGGTAACATCAATTATTGAACTATTGCCATTAGTATATCTGAGTCTAACCTTGGATTGCTCTTTTGTAGCTTTCTCCATAGCCTCATTGAATCTGATTTGGAACTTCTTCACGTCCGTGAAGATGTTCGACACTCGTTCGCCAGCTGCATTGCCCATTCCTACTCTTACGTTCCCACGTGGTTGCTTTGACATTAAAAACTCCAGGGCTGCCAAATCTGCCCTTTCCACCATCCTGTGTTGAATTTGCCCAGAAAAAGAAGAAACTTATAAGAAAAATCAGGAGATAGAGAGAGAGGAATTTAGAAACATAACACACACTCACGAGATGCAGTCAACTGGGCAAGCTTCAATAGCCTCCGTAACTTTATATTCAGGATCTGCCCACTGTGCCACAACTCTAGCTCTCCCATACACAGATTCAACAGCAAAAGTTTTCCCAGCAAATAAAGCACATTTCAAGCAGCCAATACATTTCACTTCATCCACAAAAACTGCCCGTTGTTCACTTTCTGACCCCAACCACACTGAATAAACAGGCTTCCCAGTGTAACCTCGAAGTTCTGCCATTTTTGCTTGCTCCTGTGGACACAATTCTTATGTCAAATACCATAGTTTCCTGAAACAGATTGTGCAGAAATTAGAATAGTG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ATGTCGTACCTTCTACCACATCTGCACTCAGGATGGGCGGTGGATCAAGCGATTCTCGCTGAAGAAGAACGCGTCGTCATCATCCGCTTCGGCCATGATTGGGACGACACTTGTATGCAGATGGACGAAGTGTTGGCGTCAGTTGCAGAGACGATTAAGAACTTTGCAGTAATATACCTTGTGGATATCACAGAAGTTCCTGATTTCAACACAATATCAAGAAAACCCTTTTCTTCTGCTTCCTCTCTTCTAAATTCCTTTTTCATGTCCACTGTCAACGTTGCCGCCAATTCTCTCGTCTCCGTCGCCTCTAATGCTAAGAACGAACTTTCTGGCCGGAAATGGCGACCGGCGGATCATTTCCGGTTCATGCTCATGCTTACCTCTTGGTTTACGGTTTGGGTTTTGAGAATTGTCATGGATTGGTTTCCTGTCGCTCTCGCCCCTTCTCGCCGTCTCTTAACTCATTTCTGTGGCGGTGGCGATGGCGACGGCGGCGGGTCTAGGAGTACGCCGCCTTTGCTGTTGCCGCCGCCGTCCTCCGCCTCCTCCTCGGCGTTGGGTTCTTCGGCTTTGGCCTCGCTTTCCAAATTGGATTTGGTTCCTTTCGAATCTGTTGATTTTGGTGGTTCCTCTGTTAACCCTCTCACCCGCGCTCTCTCTCAAATCTTGGCGATCTTGAACGAGATGCCGGCGAGTTGCCGGAAGTATCAATTCACAATGGCAATGGCAGAGAAGATAATGGCGGAAAACGCTAGAAGCGGCCAGATCGAGCTTCTGCAGGTGAACCGGGCCGCCCTCTCTGCCGCCTTCGCCCGAACCTCCTCTCTACTCTACGACTCGCTCCATCGGACCCGGGAGATCGAAGAACGGACCAGAGCCGGCACGTGGCCGTCACGGATCATCGCGGCCCTCCCGTTCGCGGCCTACGTCACTCCGTACCTTAAATTTCTGGATCTGGCCGTCAGTGCCGTCGGCGCCATAGTCCCGAAGGCAGAGCCGTTGAATGGTCGGAGATCGGAGACGGGAATCGTGGAGGGGGAGTTCGGCGGCGAGATAGTGGTGGTGGAGAAGCTGGGGCAGGAGTTAATATGGATGACGGAGAAGCTGCGGGAGTATGGGGCGGTGGATGAGGCTATGTTGCAGTGGAGCTTTGCCGGCGGCTTGGCTTCTGTTTCCGTTGCCTGTAATCCTAGAATCCAGTGGTGCTTCGTCAAAATCTCAGCGACTCTGTTTCGAGAGCTAATGAGGAGCAAAGAAATGGAGGAAATGAATGCTATTACTATGGCTGCCATTGCTATGCCACGCTCGAAACGGATTAGCCTTTCCGGCGCTGATGAGGTTCGAGAAAGACGAGACCGAAAGAGCCGTGAATCAGATCATCGGAACCTTATCGCCGATGGATCAGGAACTCATCTTAACCAATTGGCTCCAAGATTACGCAATTTCCGCCTCCGAATGGCCCAATCTTCAGCCTTCTTACGACCGCTGGTGCAATTCCACTCGATTACTCGCCGCCTGATCCGCCGCACAAGGAAGAAGAAGAAGATTAACGAAGCCACCACTACCGCCACCAAACTTGGTTCTGATGGAGTCAAGCCGACCCCCACCACCACTACCGCCGCCGCCTCCTCCGACCATGATCAAAACCCCAATTCCAATCCATCTCCGCCCTCTGTTTCAGACCCCCAGAATGACACTACTGGATCCGACTCCACCTCCCTTCAAACCCCTTCTCGCCACTCCTCCAGAACTCCCTTCACTAATCTCACCCAGGTCGATGCTGACCTTGCCCTCGCTCGTACCCTTCAAGAACAGGAAAGGGCATATCTAATGCTTAGAATGACAAGTGAGGGGAGTGATTTTGGAAGTTGGGAAGCTGGAAGTTATGTATTAGACGATGAGGATGGTTTTGGTGATCCCCATGATCATACAGAATCTGATGGGGATGATGATGAGTATGACGGAACAGATGTCAACGATGATGACGATGTGTTTGATGTGCATGCTCATGAAGATGGTGGAGAGCATAACAACCCCAACTTTGAACTTGATCCAGGTAATTTTTCCAGTGACGAGGCTTATGCTAGAGCCCTACAAGATGCTGAAGACAGAGAAATGGCTGCCAGATTGTTGGCCCTTGCTGGATTACAGGATCAGGACGCAGATGACACGGATGATCAAGGTGAAAATTCCCAGGATACGTGGGAGGACGTTGACCCAGATGAACTGTCTTACGAGGAGTTGCTTGCATTGGGTGAAGTGGTAGGAACTGAAAGTAGAGGGCTATCTGCTGATACAATTGCTTCTTTACCCTCCATAAACTTCAAGGCAGGGAGTGGTCAGACTGGAAATAACGATTCGTGCGTCATCTGTCGATTGGATTTCGAGGACGGTGAAACCTTGACTGTTCTCTCTTGCAAACACTCCTACCATTCCGAGTGCATAAATAATTGGTTAAAGATAAACAAGGTCTGCCCTGTCTGCAGTGCTGAAGTCTCCACAGCTACCGGAAGCATGTGGATTCTCATATGGTCATGTCTCAATCTCAATTCGATTTACTTATCTTAA MSYLLPHLHSGWAVDQAILAEEERVVIIRFGHDWDDTCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYLVDITEVPDFNTISRKPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFTVWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGGDGDGGGSRSTPPLLLPPPSSASSSALGSSALASLSKLDLVPFESVDFGGSSVNPLTRALSQILAILNEMPASCRKYQFTMAMAEKIMAENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAALPFAAYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSETGIVEGEFGGEIVVVEKLGQELIWMTEKLREYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVACNPRIQWCFVKISATLFRELMRSKEMEEMNAITMAAIAMPRSKRISLSGADEVRERRDRKSRESDHRNLIADGSGTHLNQLAPRLRNFRLRMAQSSAFLRPLVQFHSITRRLIRRTRKKKKINEATTTATKLGSDGVKPTPTTTTAAASSDHDQNPNSNPSPPSVSDPQNDTTGSDSTSLQTPSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDGFGDPHDHTESDGDDDEYDGTDVNDDDDVFDVHAHEDGGEHNNPNFELDPGNFSSDEAYARALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVGTESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSECINNWLKINKVCPVCSAEVSTATGSMWILIWSCLNLNSIYLS Homology
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LT17 (E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BBR PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 1.8e-79 Identity = 182/323 (56.35%), Postives = 228/323 (70.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FE62 (Thioredoxin-like protein YLS8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=YLS8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 144.1 bits (362), Expect = 7.6e-33 Identity = 74/111 (66.67%), Postives = 84/111 (75.68%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P83876 (Thioredoxin-like protein 4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNL4A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 130.6 bits (327), Expect = 8.6e-29 Identity = 65/112 (58.04%), Postives = 80/112 (71.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P83877 (Thioredoxin-like protein 4A OS=Mus musculus OX=10090 GN=Txnl4a PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 130.6 bits (327), Expect = 8.6e-29 Identity = 65/112 (58.04%), Postives = 80/112 (71.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L649 (E3 ubiquitin-protein ligase BIG BROTHER OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BB PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 1.3e-21 Identity = 72/186 (38.71%), Postives = 104/186 (55.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KRW7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G175700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 614.4 bits (1583), Expect = 7.3e-172 Identity = 321/357 (89.92%), Postives = 333/357 (93.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KGM7 (E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493709 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 8.9e-162 Identity = 307/322 (95.34%), Postives = 312/322 (96.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SSX3 (BTB/POZ domain protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold65G00580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 580.1 bits (1494), Expect = 1.5e-161 Identity = 311/359 (86.63%), Postives = 322/359 (89.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BEK6 (uncharacterized protein LOC103488768 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488768 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 580.1 bits (1494), Expect = 1.5e-161 Identity = 311/359 (86.63%), Postives = 322/359 (89.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GZI2 (E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458563 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 574.3 bits (1479), Expect = 8.4e-160 Identity = 304/322 (94.41%), Postives = 309/322 (95.96%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. NCBI nr
Match: XP_004143698.1 (uncharacterized protein LOC101206051 [Cucumis sativus] >KGN50446.1 hypothetical protein Csa_000146 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 614.4 bits (1583), Expect = 1.5e-171 Identity = 321/357 (89.92%), Postives = 333/357 (93.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. NCBI nr
Match: XP_038892468.1 (E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 604.7 bits (1558), Expect = 1.2e-168 Identity = 314/322 (97.52%), Postives = 319/322 (99.07%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. NCBI nr
Match: XP_038893039.1 (uncharacterized protein LOC120081928 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 604.4 bits (1557), Expect = 1.6e-168 Identity = 318/353 (90.08%), Postives = 334/353 (94.62%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. NCBI nr
Match: XP_022999294.1 (E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 1.8e-161 Identity = 307/322 (95.34%), Postives = 312/322 (96.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. NCBI nr
Match: XP_008445882.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488768 [Cucumis melo] >KAA0034070.1 BTB/POZ domain protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 580.1 bits (1494), Expect = 3.1e-161 Identity = 311/359 (86.63%), Postives = 322/359 (89.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. TAIR 10
Match: AT3G19910.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 1.3e-80 Identity = 182/323 (56.35%), Postives = 228/323 (70.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. TAIR 10
Match: AT3G19920.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G64230.1); Has 217 Blast hits to 217 proteins in 16 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 215; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 201.1 bits (510), Expect = 3.7e-51 Identity = 140/346 (40.46%), Postives = 191/346 (55.20%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. TAIR 10
Match: AT5G08290.1 (mRNA splicing factor, thioredoxin-like U5 snRNP ) HSP 1 Score: 144.1 bits (362), Expect = 5.4e-34 Identity = 74/111 (66.67%), Postives = 84/111 (75.68%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. TAIR 10
Match: AT3G63530.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 9.5e-23 Identity = 72/186 (38.71%), Postives = 104/186 (55.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi04G007940 vs. TAIR 10
Match: AT3G63530.2 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 9.5e-23 Identity = 72/186 (38.71%), Postives = 104/186 (55.91%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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