Lsi04G007940 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi04G007940
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionE3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related
Locationchr04: 7485818 .. 7515435 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi04G007940
SyntenyLsi04G007940
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
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mRNA sequence

CTTCGGCTCTCGCAGTCGCCGCAGAAAGTTCTCCGTTTGAAGCTCAGAACGAATTTTTCTTCATTCTCAGTTAAAGAAAAAAGGAGAGAATTGGAGAAATTAGGGTTTGAAGATGTCGTACCTTCTACCACATCTGCACTCAGGATGGGCGGTGGATCAAGCGATTCTCGCTGAAGAAGAACGCGTCGTCATCATCCGCTTCGGCCATGATTGGGACGACACTTGTATGCAGATGGACGAAGTGTTGGCGTCAGTTGCAGAGACGATTAAGAACTTTGCAGTAATATACCTTGTGGATATCACAGAAGTTCCTGATTTCAACACAATATCAAGAAAACCCTTTTCTTCTGCTTCCTCTCTTCTAAATTCCTTTTTCATGTCCACTGTCAACGTTGCCGCCAATTCTCTCGTCTCCGTCGCCTCTAATGCTAAGAACGAACTTTCTGGCCGGAAATGGCGACCGGCGGATCATTTCCGGTTCATGCTCATGCTTACCTCTTGGTTTACGGTTTGGGTTTTGAGAATTGTCATGGATTGGTTTCCTGTCGCTCTCGCCCCTTCTCGCCGTCTCTTAACTCATTTCTGTGGCGGTGGCGATGGCGACGGCGGCGGGTCTAGGAGTACGCCGCCTTTGCTGTTGCCGCCGCCGTCCTCCGCCTCCTCCTCGGCGTTGGGTTCTTCGGCTTTGGCCTCGCTTTCCAAATTGGATTTGGTTCCTTTCGAATCTGTTGATTTTGGTGGTTCCTCTGTTAACCCTCTCACCCGCGCTCTCTCTCAAATCTTGGCGATCTTGAACGAGATGCCGGCGAGTTGCCGGAAGTATCAATTCACAATGGCAATGGCAGAGAAGATAATGGCGGAAAACGCTAGAAGCGGCCAGATCGAGCTTCTGCAGGTGAACCGGGCCGCCCTCTCTGCCGCCTTCGCCCGAACCTCCTCTCTACTCTACGACTCGCTCCATCGGACCCGGGAGATCGAAGAACGGACCAGAGCCGGCACGTGGCCGTCACGGATCATCGCGGCCCTCCCGTTCGCGGCCTACGTCACTCCGTACCTTAAATTTCTGGATCTGGCCGTCAGTGCCGTCGGCGCCATAGTCCCGAAGGCAGAGCCGTTGAATGGTCGGAGATCGGAGACGGGAATCGTGGAGGGGGAGTTCGGCGGCGAGATAGTGGTGGTGGAGAAGCTGGGGCAGGAGTTAATATGGATGACGGAGAAGCTGCGGGAGTATGGGGCGGTGGATGAGGCTATGTTGCAGTGGAGCTTTGCCGGCGGCTTGGCTTCTGTTTCCGTTGCCTGTAATCCTAGAATCCAGTGGTGCTTCGTCAAAATCTCAGCGACTCTGTTTCGAGAGCTAATGAGGAGCAAAGAAATGGAGGAAATGAATGCTATTACTATGGCTGCCATTGCTATGCCACGCTCGAAACGGATTAGCCTTTCCGGCGCTGATGAGGTTCGAGAAAGACGAGACCGAAAGAGCCGTGAATCAGATCATCGGAACCTTATCGCCGATGGATCAGGAACTCATCTTAACCAATTGGCTCCAAGATTACGCAATTTCCGCCTCCGAATGGCCCAATCTTCAGCCTTCTTACGACCGCTGGTGCAATTCCACTCGATTACTCGCCGCCTGATCCGCCGCACAAGGAAGAAGAAGAAGATTAACGAAGCCACCACTACCGCCACCAAACTTGGTTCTGATGGAGTCAAGCCGACCCCCACCACCACTACCGCCGCCGCCTCCTCCGACCATGATCAAAACCCCAATTCCAATCCATCTCCGCCCTCTGTTTCAGACCCCCAGAATGACACTACTGGATCCGACTCCACCTCCCTTCAAACCCCTTCTCGCCACTCCTCCAGAACTCCCTTCACTAATCTCACCCAGGTCGATGCTGACCTTGCCCTCGCTCGTACCCTTCAAGAACAGGAAAGGGCATATCTAATGCTTAGAATGACAAGTGAGGGGAGTGATTTTGGAAGTTGGGAAGCTGGAAGTTATGTATTAGACGATGAGGATGGTTTTGGTGATCCCCATGATCATACAGAATCTGATGGGGATGATGATGAGTATGACGGAACAGATGTCAACGATGATGACGATGTGTTTGATGTGCATGCTCATGAAGATGGTGGAGAGCATAACAACCCCAACTTTGAACTTGATCCAGGTAATTTTTCCAGTGACGAGGCTTATGCTAGAGCCCTACAAGATGCTGAAGACAGAGAAATGGCTGCCAGATTGTTGGCCCTTGCTGGATTACAGGATCAGGACGCAGATGACACGGATGATCAAGGTGAAAATTCCCAGGATACGTGGGAGGACGTTGACCCAGATGAACTGTCTTACGAGGAGTTGCTTGCATTGGGTGAAGTGGTAGGAACTGAAAGTAGAGGGCTATCTGCTGATACAATTGCTTCTTTACCCTCCATAAACTTCAAGGCAGGGAGTGGTCAGACTGGAAATAACGATTCGTGCGTCATCTGTCGATTGGATTTCGAGGACGGTGAAACCTTGACTGTTCTCTCTTGCAAACACTCCTACCATTCCGAGTGCATAAATAATTGGTTAAAGATAAACAAGGTCTGCCCTGTCTGCAGTGCTGAAGTCTCCACAGCTACCGGAAGCATGTGGATTCTCATATGGTCATGTCTCAATCTCAATTCGATTTACTTATCTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCGTACCTTCTACCACATCTGCACTCAGGATGGGCGGTGGATCAAGCGATTCTCGCTGAAGAAGAACGCGTCGTCATCATCCGCTTCGGCCATGATTGGGACGACACTTGTATGCAGATGGACGAAGTGTTGGCGTCAGTTGCAGAGACGATTAAGAACTTTGCAGTAATATACCTTGTGGATATCACAGAAGTTCCTGATTTCAACACAATATCAAGAAAACCCTTTTCTTCTGCTTCCTCTCTTCTAAATTCCTTTTTCATGTCCACTGTCAACGTTGCCGCCAATTCTCTCGTCTCCGTCGCCTCTAATGCTAAGAACGAACTTTCTGGCCGGAAATGGCGACCGGCGGATCATTTCCGGTTCATGCTCATGCTTACCTCTTGGTTTACGGTTTGGGTTTTGAGAATTGTCATGGATTGGTTTCCTGTCGCTCTCGCCCCTTCTCGCCGTCTCTTAACTCATTTCTGTGGCGGTGGCGATGGCGACGGCGGCGGGTCTAGGAGTACGCCGCCTTTGCTGTTGCCGCCGCCGTCCTCCGCCTCCTCCTCGGCGTTGGGTTCTTCGGCTTTGGCCTCGCTTTCCAAATTGGATTTGGTTCCTTTCGAATCTGTTGATTTTGGTGGTTCCTCTGTTAACCCTCTCACCCGCGCTCTCTCTCAAATCTTGGCGATCTTGAACGAGATGCCGGCGAGTTGCCGGAAGTATCAATTCACAATGGCAATGGCAGAGAAGATAATGGCGGAAAACGCTAGAAGCGGCCAGATCGAGCTTCTGCAGGTGAACCGGGCCGCCCTCTCTGCCGCCTTCGCCCGAACCTCCTCTCTACTCTACGACTCGCTCCATCGGACCCGGGAGATCGAAGAACGGACCAGAGCCGGCACGTGGCCGTCACGGATCATCGCGGCCCTCCCGTTCGCGGCCTACGTCACTCCGTACCTTAAATTTCTGGATCTGGCCGTCAGTGCCGTCGGCGCCATAGTCCCGAAGGCAGAGCCGTTGAATGGTCGGAGATCGGAGACGGGAATCGTGGAGGGGGAGTTCGGCGGCGAGATAGTGGTGGTGGAGAAGCTGGGGCAGGAGTTAATATGGATGACGGAGAAGCTGCGGGAGTATGGGGCGGTGGATGAGGCTATGTTGCAGTGGAGCTTTGCCGGCGGCTTGGCTTCTGTTTCCGTTGCCTGTAATCCTAGAATCCAGTGGTGCTTCGTCAAAATCTCAGCGACTCTGTTTCGAGAGCTAATGAGGAGCAAAGAAATGGAGGAAATGAATGCTATTACTATGGCTGCCATTGCTATGCCACGCTCGAAACGGATTAGCCTTTCCGGCGCTGATGAGGTTCGAGAAAGACGAGACCGAAAGAGCCGTGAATCAGATCATCGGAACCTTATCGCCGATGGATCAGGAACTCATCTTAACCAATTGGCTCCAAGATTACGCAATTTCCGCCTCCGAATGGCCCAATCTTCAGCCTTCTTACGACCGCTGGTGCAATTCCACTCGATTACTCGCCGCCTGATCCGCCGCACAAGGAAGAAGAAGAAGATTAACGAAGCCACCACTACCGCCACCAAACTTGGTTCTGATGGAGTCAAGCCGACCCCCACCACCACTACCGCCGCCGCCTCCTCCGACCATGATCAAAACCCCAATTCCAATCCATCTCCGCCCTCTGTTTCAGACCCCCAGAATGACACTACTGGATCCGACTCCACCTCCCTTCAAACCCCTTCTCGCCACTCCTCCAGAACTCCCTTCACTAATCTCACCCAGGTCGATGCTGACCTTGCCCTCGCTCGTACCCTTCAAGAACAGGAAAGGGCATATCTAATGCTTAGAATGACAAGTGAGGGGAGTGATTTTGGAAGTTGGGAAGCTGGAAGTTATGTATTAGACGATGAGGATGGTTTTGGTGATCCCCATGATCATACAGAATCTGATGGGGATGATGATGAGTATGACGGAACAGATGTCAACGATGATGACGATGTGTTTGATGTGCATGCTCATGAAGATGGTGGAGAGCATAACAACCCCAACTTTGAACTTGATCCAGGTAATTTTTCCAGTGACGAGGCTTATGCTAGAGCCCTACAAGATGCTGAAGACAGAGAAATGGCTGCCAGATTGTTGGCCCTTGCTGGATTACAGGATCAGGACGCAGATGACACGGATGATCAAGGTGAAAATTCCCAGGATACGTGGGAGGACGTTGACCCAGATGAACTGTCTTACGAGGAGTTGCTTGCATTGGGTGAAGTGGTAGGAACTGAAAGTAGAGGGCTATCTGCTGATACAATTGCTTCTTTACCCTCCATAAACTTCAAGGCAGGGAGTGGTCAGACTGGAAATAACGATTCGTGCGTCATCTGTCGATTGGATTTCGAGGACGGTGAAACCTTGACTGTTCTCTCTTGCAAACACTCCTACCATTCCGAGTGCATAAATAATTGGTTAAAGATAAACAAGGTCTGCCCTGTCTGCAGTGCTGAAGTCTCCACAGCTACCGGAAGCATGTGGATTCTCATATGGTCATGTCTCAATCTCAATTCGATTTACTTATCTTAA

Protein sequence

MSYLLPHLHSGWAVDQAILAEEERVVIIRFGHDWDDTCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYLVDITEVPDFNTISRKPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFTVWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGGDGDGGGSRSTPPLLLPPPSSASSSALGSSALASLSKLDLVPFESVDFGGSSVNPLTRALSQILAILNEMPASCRKYQFTMAMAEKIMAENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAALPFAAYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSETGIVEGEFGGEIVVVEKLGQELIWMTEKLREYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVACNPRIQWCFVKISATLFRELMRSKEMEEMNAITMAAIAMPRSKRISLSGADEVRERRDRKSRESDHRNLIADGSGTHLNQLAPRLRNFRLRMAQSSAFLRPLVQFHSITRRLIRRTRKKKKINEATTTATKLGSDGVKPTPTTTTAAASSDHDQNPNSNPSPPSVSDPQNDTTGSDSTSLQTPSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDGFGDPHDHTESDGDDDEYDGTDVNDDDDVFDVHAHEDGGEHNNPNFELDPGNFSSDEAYARALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVGTESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSECINNWLKINKVCPVCSAEVSTATGSMWILIWSCLNLNSIYLS
Homology
BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LT17 (E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BBR PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 1.8e-79
Identity = 182/323 (56.35%), Postives = 228/323 (70.59%), Query Frame = 0

Query: 516 KINEATTTATKLGSDGVKPTPTTTTAAASSDHDQNPNSNPSPPSVSDPQNDTTGSDSTSL 575
           KINE      +    GV     + T + S   +Q      S  +V+ P  ++       L
Sbjct: 23  KINETDGRLPENRQTGV----VSDTGSGSERGEQGVGE--SAVAVAVPVEESGSISVGEL 82

Query: 576 QTPSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDE 635
             P   S+R PFTNL+Q+DADLALARTLQEQERAY+ML M SE SD+GSWE GSYV  DE
Sbjct: 83  PAPRSSSARVPFTNLSQIDADLALARTLQEQERAYMMLTMNSEISDYGSWETGSYVY-DE 142

Query: 636 DGFGDPHDHTESDGDDDEYDGTDVNDDDDV-FDVHAHEDGGEHNNPNFELDPGNFSSDEA 695
           D F DP +  E D D+DEY+  D   +D +  +VHA+ED  E ++ N +++   ++ DEA
Sbjct: 143 DEFDDPENEDEDD-DEDEYETDDDPQEDGLDVNVHANEDDQE-DDGNSDIEEVAYTDDEA 202

Query: 696 YARALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGE 755
           YARALQ+AE+R+MAARL AL+GL ++  +D +D+   SQD W+++DPDELSYEELLALG+
Sbjct: 203 YARALQEAEERDMAARLSALSGLANRVVEDLEDESHTSQDAWDEMDPDELSYEELLALGD 262

Query: 756 VVGTESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSE 815
           +VGTESRGLSADTIASLPS  +K G  Q G N+SCVICRLD+ED E L +L CKHSYHSE
Sbjct: 263 IVGTESRGLSADTIASLPSKRYKEGDNQNGTNESCVICRLDYEDDEDLILLPCKHSYHSE 322

Query: 816 CINNWLKINKVCPVCSAEVSTAT 838
           CINNWLKINKVCPVCSAEVST+T
Sbjct: 323 CINNWLKINKVCPVCSAEVSTST 336

BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FE62 (Thioredoxin-like protein YLS8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=YLS8 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 144.1 bits (362), Expect = 7.6e-33
Identity = 74/111 (66.67%), Postives = 84/111 (75.68%), Query Frame = 0

Query: 1   MSYLLPHLHSGWAVDQAILAEEERVVIIRFGHDWDDTCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYL 60
           MSYLLPHLHSGWAVDQ+ILAEEER+V+IRFGHDWD+TCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYL
Sbjct: 1   MSYLLPHLHSGWAVDQSILAEEERLVVIRFGHDWDETCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYL 60

Query: 61  VDITEVPDFNTISR--KPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNE 110
           VDITEVPDFNT+     P +      N   M  +    N+ ++ A   K E
Sbjct: 61  VDITEVPDFNTMYELYDPSTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWALKDKQE 111

BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P83876 (Thioredoxin-like protein 4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNL4A PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 130.6 bits (327), Expect = 8.6e-29
Identity = 65/112 (58.04%), Postives = 80/112 (71.43%), Query Frame = 0

Query: 1   MSYLLPHLHSGWAVDQAILAEEERVVIIRFGHDWDDTCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYL 60
           MSY+LPHLH+GW VDQAIL+EE+RVV+IRFGHDWD TCM+MDEVL S+AE +KNFAVIYL
Sbjct: 1   MSYMLPHLHNGWQVDQAILSEEDRVVVIRFGHDWDPTCMKMDEVLYSIAEKVKNFAVIYL 60

Query: 61  VDITEVPDFNTISR--KPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNEL 111
           VDITEVPDFN +     P +      N   M  +    N+ ++ A   K E+
Sbjct: 61  VDITEVPDFNKMYELYDPCTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWAMEDKQEM 112

BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P83877 (Thioredoxin-like protein 4A OS=Mus musculus OX=10090 GN=Txnl4a PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 130.6 bits (327), Expect = 8.6e-29
Identity = 65/112 (58.04%), Postives = 80/112 (71.43%), Query Frame = 0

Query: 1   MSYLLPHLHSGWAVDQAILAEEERVVIIRFGHDWDDTCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYL 60
           MSY+LPHLH+GW VDQAIL+EE+RVV+IRFGHDWD TCM+MDEVL S+AE +KNFAVIYL
Sbjct: 1   MSYMLPHLHNGWQVDQAILSEEDRVVVIRFGHDWDPTCMKMDEVLYSIAEKVKNFAVIYL 60

Query: 61  VDITEVPDFNTISR--KPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNEL 111
           VDITEVPDFN +     P +      N   M  +    N+ ++ A   K E+
Sbjct: 61  VDITEVPDFNKMYELYDPCTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWAMEDKQEM 112

BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L649 (E3 ubiquitin-protein ligase BIG BROTHER OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BB PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 1.3e-21
Identity = 72/186 (38.71%), Postives = 104/186 (55.91%), Query Frame = 0

Query: 654 YDGTDVNDDDDVFDVHAHEDGGEHNNPNFELDP-GNFSSD--EAYARALQDAEDREMAAR 713
           + G+D       +D++ H         N++  P  N + D     AR++Q  +  E +  
Sbjct: 65  FSGSDNASFYGSYDMNDHLSRMSIGRTNWDYHPMVNVADDPENTVARSVQIGDTDEHSEA 124

Query: 714 LLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTW-EDVDPDELSYEELLALGEVVGTESRGLSADTIA 773
              +A   D D         + Q +W +D+DPD ++YEEL+ LGE VGTESRGLS + I 
Sbjct: 125 EECIANEHDPD---------SPQVSWQDDIDPDTMTYEELVELGEAVGTESRGLSQELIE 184

Query: 774 SLPSINFKAGS--GQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSECINNWLKINKVCP 833
           +LP+  +K GS   +    + CVIC+L ++ GE    L CKH YHSECI+ WL INKVCP
Sbjct: 185 TLPTKKYKFGSIFSRKRAGERCVICQLKYKIGERQMNLPCKHVYHSECISKWLSINKVCP 241

BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KRW7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G175700 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 614.4 bits (1583), Expect = 7.3e-172
Identity = 321/357 (89.92%), Postives = 333/357 (93.28%), Query Frame = 0

Query: 73  SRKPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 132
           SRKPFSS SSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT
Sbjct: 14  SRKPFSSTSSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 73

Query: 133 VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGGDGDGGGSRSTPPLLLPPPSS------ASSSA 192
           VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLT FCGGGD D  GSRS+ PLLLP PSS      +SSSA
Sbjct: 74  VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTRFCGGGDAD--GSRSSAPLLLPAPSSESSLSTSSSSA 133

Query: 193 LGSSALASLSKLDLVPFESVDFGGSSVNPLTRALSQILAILNEMPASCRKYQFTMAMAEK 252
           LGSSALASLSKLDLVPFE+VDFG SSV PLTRALSQILAILNEMP SC+KYQFTMAMAEK
Sbjct: 134 LGSSALASLSKLDLVPFETVDFGASSVKPLTRALSQILAILNEMPVSCQKYQFTMAMAEK 193

Query: 253 IMAENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAALP 312
           IM ENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSS LYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAALP
Sbjct: 194 IMEENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSSLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAALP 253

Query: 313 FAAYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSETGIVEGEFGGEIVVVEKLGQELIWM 372
           F+AYVTPY+KFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRS+ GIVEGE+GGE+VVVEKLGQEL+WM
Sbjct: 254 FSAYVTPYIKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSDRGIVEGEYGGEVVVVEKLGQELVWM 313

Query: 373 TEKLREYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVACNPRIQWCFVKISATLFRELMRSKEMEE 424
            EKLREYGA DEAM+QWSFAGGLAS SV CNPRIQWCFVKISA LF+ELMRSKEMEE
Sbjct: 314 VEKLREYGAADEAMVQWSFAGGLASASVTCNPRIQWCFVKISAMLFQELMRSKEMEE 368

BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KGM7 (E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493709 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 8.9e-162
Identity = 307/322 (95.34%), Postives = 312/322 (96.89%), Query Frame = 0

Query: 518 NEATTTATKLGSDGVKPTPTTTTAAASSDHDQNPNSNPSPPSVSDPQNDTTGSDSTSLQT 577
           NE TT ATKLGSDGVKPTPTTTT  ASSDH+QNP SNPSPPSV+DPQND TGSDSTSLQT
Sbjct: 3   NETTTNATKLGSDGVKPTPTTTT-TASSDHEQNPTSNPSPPSVADPQNDPTGSDSTSLQT 62

Query: 578 PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG 637
           PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG
Sbjct: 63  PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG 122

Query: 638 FGDPHDHTESDGDDDEYDGTDVNDDDDVFDVHAHEDGGEHNNPNFELDPGNFSSDEAYAR 697
           FGDPHDHTESDGDDDE+DGTDVNDDDDVFDVHAHED GE NNPNFELDPGNFSSDEAYAR
Sbjct: 123 FGDPHDHTESDGDDDEFDGTDVNDDDDVFDVHAHED-GEDNNPNFELDPGNFSSDEAYAR 182

Query: 698 ALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG 757
           ALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG
Sbjct: 183 ALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG 242

Query: 758 TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSECIN 817
           TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTG++DSCVICRLDFED ETLTVLSCKHSYHSECIN
Sbjct: 243 TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGSSDSCVICRLDFEDNETLTVLSCKHSYHSECIN 302

Query: 818 NWLKINKVCPVCSAEVSTATGS 840
           NWLKINKVCPVCS EVSTATGS
Sbjct: 303 NWLKINKVCPVCSTEVSTATGS 322

BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SSX3 (BTB/POZ domain protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold65G00580 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 580.1 bits (1494), Expect = 1.5e-161
Identity = 311/359 (86.63%), Postives = 322/359 (89.69%), Query Frame = 0

Query: 73  SRKPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 132
           SRKP SS  SLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT
Sbjct: 14  SRKPISSTPSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 73

Query: 133 VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGGDGDGGGSRSTPPLLLPPPSSASS-------S 192
           VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGG G GG + S P LL  PPSS SS       S
Sbjct: 74  VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGG-GGGGCTSSAPLLLTAPPSSESSLSLSSSMS 133

Query: 193 ALGSSALASLSKLDLVPFESVDFGGSSVNPLTRALSQILAILNEMPASCRKYQFTMAMAE 252
           ALGSSAL  LSKLDLVPFES+DF  SSVNPLTRALSQILAILNEMPASC+KYQFTMAMAE
Sbjct: 134 ALGSSALDPLSKLDLVPFESIDFVASSVNPLTRALSQILAILNEMPASCQKYQFTMAMAE 193

Query: 253 KIMAENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAAL 312
           KIM ENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSS LYDSLHRTR+ E+R RAGTWPSRIIAAL
Sbjct: 194 KIMEENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSFLYDSLHRTRQTEQRIRAGTWPSRIIAAL 253

Query: 313 PFAAYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSETGIVEGEFGGEIVVVEKLGQELIW 372
           PF+AYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSE GIVEGE+GGE VV EKLGQEL+W
Sbjct: 254 PFSAYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSERGIVEGEYGGE-VVAEKLGQELVW 313

Query: 373 MTEKLREYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVACNPRIQWCFVKISATLFRELMRSKEMEEM 425
           M EKL EYGA DEAM+QWSFAGGLAS SVACNPRIQWCFVKISA LF+EL  SKEME+M
Sbjct: 314 MAEKLGEYGAADEAMVQWSFAGGLASASVACNPRIQWCFVKISAMLFKEL-TSKEMEKM 369

BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BEK6 (uncharacterized protein LOC103488768 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488768 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 580.1 bits (1494), Expect = 1.5e-161
Identity = 311/359 (86.63%), Postives = 322/359 (89.69%), Query Frame = 0

Query: 73  SRKPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 132
           SRKP SS  SLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT
Sbjct: 14  SRKPISSTPSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 73

Query: 133 VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGGDGDGGGSRSTPPLLLPPPSSASS-------S 192
           VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGG G GG + S P LL  PPSS SS       S
Sbjct: 74  VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGG-GGGGCTSSAPLLLTAPPSSESSLSLSSSMS 133

Query: 193 ALGSSALASLSKLDLVPFESVDFGGSSVNPLTRALSQILAILNEMPASCRKYQFTMAMAE 252
           ALGSSAL  LSKLDLVPFES+DF  SSVNPLTRALSQILAILNEMPASC+KYQFTMAMAE
Sbjct: 134 ALGSSALDPLSKLDLVPFESIDFVASSVNPLTRALSQILAILNEMPASCQKYQFTMAMAE 193

Query: 253 KIMAENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAAL 312
           KIM ENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSS LYDSLHRTR+ E+R RAGTWPSRIIAAL
Sbjct: 194 KIMEENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSFLYDSLHRTRQTEQRIRAGTWPSRIIAAL 253

Query: 313 PFAAYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSETGIVEGEFGGEIVVVEKLGQELIW 372
           PF+AYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSE GIVEGE+GGE VV EKLGQEL+W
Sbjct: 254 PFSAYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSERGIVEGEYGGE-VVAEKLGQELVW 313

Query: 373 MTEKLREYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVACNPRIQWCFVKISATLFRELMRSKEMEEM 425
           M EKL EYGA DEAM+QWSFAGGLAS SVACNPRIQWCFVKISA LF+EL  SKEME+M
Sbjct: 314 MAEKLGEYGAADEAMVQWSFAGGLASASVACNPRIQWCFVKISAMLFKEL-TSKEMEKM 369

BLAST of Lsi04G007940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GZI2 (E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458563 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 574.3 bits (1479), Expect = 8.4e-160
Identity = 304/322 (94.41%), Postives = 309/322 (95.96%), Query Frame = 0

Query: 518 NEATTTATKLGSDGVKPTPTTTTAAASSDHDQNPNSNPSPPSVSDPQNDTTGSDSTSLQT 577
           NE T  ATKLGSDGVKPTP TTT  ASSDH+QNP SNPSPPSV+DPQND TGSDS SLQT
Sbjct: 3   NETTINATKLGSDGVKPTPATTT-TASSDHEQNPTSNPSPPSVADPQNDPTGSDSASLQT 62

Query: 578 PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG 637
           PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG
Sbjct: 63  PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG 122

Query: 638 FGDPHDHTESDGDDDEYDGTDVNDDDDVFDVHAHEDGGEHNNPNFELDPGNFSSDEAYAR 697
           FGDPHDHTESDGDDDE+DGTDVNDDDDVFDVHAHED GE NNPNFELDPGNFSSDEAYAR
Sbjct: 123 FGDPHDHTESDGDDDEFDGTDVNDDDDVFDVHAHED-GEDNNPNFELDPGNFSSDEAYAR 182

Query: 698 ALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG 757
           ALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG
Sbjct: 183 ALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG 242

Query: 758 TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSECIN 817
           TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTG++DSCVICRLDFED ETLTVLSCKHSYHSECIN
Sbjct: 243 TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGSSDSCVICRLDFEDDETLTVLSCKHSYHSECIN 302

Query: 818 NWLKINKVCPVCSAEVSTATGS 840
           NWLKINKVCPVCS EVSTATGS
Sbjct: 303 NWLKINKVCPVCSTEVSTATGS 322

BLAST of Lsi04G007940 vs. NCBI nr
Match: XP_004143698.1 (uncharacterized protein LOC101206051 [Cucumis sativus] >KGN50446.1 hypothetical protein Csa_000146 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 614.4 bits (1583), Expect = 1.5e-171
Identity = 321/357 (89.92%), Postives = 333/357 (93.28%), Query Frame = 0

Query: 73  SRKPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 132
           SRKPFSS SSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT
Sbjct: 14  SRKPFSSTSSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 73

Query: 133 VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGGDGDGGGSRSTPPLLLPPPSS------ASSSA 192
           VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLT FCGGGD D  GSRS+ PLLLP PSS      +SSSA
Sbjct: 74  VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTRFCGGGDAD--GSRSSAPLLLPAPSSESSLSTSSSSA 133

Query: 193 LGSSALASLSKLDLVPFESVDFGGSSVNPLTRALSQILAILNEMPASCRKYQFTMAMAEK 252
           LGSSALASLSKLDLVPFE+VDFG SSV PLTRALSQILAILNEMP SC+KYQFTMAMAEK
Sbjct: 134 LGSSALASLSKLDLVPFETVDFGASSVKPLTRALSQILAILNEMPVSCQKYQFTMAMAEK 193

Query: 253 IMAENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAALP 312
           IM ENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSS LYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAALP
Sbjct: 194 IMEENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSSLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAALP 253

Query: 313 FAAYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSETGIVEGEFGGEIVVVEKLGQELIWM 372
           F+AYVTPY+KFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRS+ GIVEGE+GGE+VVVEKLGQEL+WM
Sbjct: 254 FSAYVTPYIKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSDRGIVEGEYGGEVVVVEKLGQELVWM 313

Query: 373 TEKLREYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVACNPRIQWCFVKISATLFRELMRSKEMEE 424
            EKLREYGA DEAM+QWSFAGGLAS SV CNPRIQWCFVKISA LF+ELMRSKEMEE
Sbjct: 314 VEKLREYGAADEAMVQWSFAGGLASASVTCNPRIQWCFVKISAMLFQELMRSKEMEE 368

BLAST of Lsi04G007940 vs. NCBI nr
Match: XP_038892468.1 (E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 604.7 bits (1558), Expect = 1.2e-168
Identity = 314/322 (97.52%), Postives = 319/322 (99.07%), Query Frame = 0

Query: 518 NEATTTATKLGSDGVKPTPTTTTAAASSDHDQNPNSNPSPPSVSDPQNDTTGSDSTSLQT 577
           NEATTTATKLGSDGVKPTPT TT AASSD+DQNPNSNPSPPSVSDPQNDTTGSDSTSLQT
Sbjct: 3   NEATTTATKLGSDGVKPTPTATTTAASSDNDQNPNSNPSPPSVSDPQNDTTGSDSTSLQT 62

Query: 578 PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG 637
           PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG
Sbjct: 63  PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG 122

Query: 638 FGDPHDHTESDGDDDEYDGTDVNDDDDVFDVHAHEDGGEHNNPNFELDPGNFSSDEAYAR 697
           FGDPHDHTESDGDDDE+DGTDVNDDDDVFDVHAHEDGG+HNNPNFELDPGNFSSDEAYAR
Sbjct: 123 FGDPHDHTESDGDDDEFDGTDVNDDDDVFDVHAHEDGGDHNNPNFELDPGNFSSDEAYAR 182

Query: 698 ALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG 757
           ALQDAEDREMAARLLALAGLQD DADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG
Sbjct: 183 ALQDAEDREMAARLLALAGLQDHDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG 242

Query: 758 TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSECIN 817
           TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTG+NDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHS+CIN
Sbjct: 243 TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGSNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSDCIN 302

Query: 818 NWLKINKVCPVCSAEVSTATGS 840
           NWLKINKVCPVCSAEVSTATGS
Sbjct: 303 NWLKINKVCPVCSAEVSTATGS 324

BLAST of Lsi04G007940 vs. NCBI nr
Match: XP_038893039.1 (uncharacterized protein LOC120081928 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 604.4 bits (1557), Expect = 1.6e-168
Identity = 318/353 (90.08%), Postives = 334/353 (94.62%), Query Frame = 0

Query: 73  SRKPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 132
           SRKPFSS+SSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT
Sbjct: 14  SRKPFSSSSSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 73

Query: 133 VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGGDGDGGGSRSTPPLLLPPPSSA-SSSALGSSA 192
           VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLT FCGG  GDG GSR++PPLLLP PSS  S+S LGSSA
Sbjct: 74  VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTRFCGG--GDGSGSRNSPPLLLPLPSSVLSASPLGSSA 133

Query: 193 LASLSKLDLVPFESVDFGGSSVNPLTRALSQILAILNEMPASCRKYQFTMAMAEKIMAEN 252
           LASLSKLDLVPFE++DFGGSS  PLTRALSQILAILNEMPASC+KYQFTMAMAEK+M EN
Sbjct: 134 LASLSKLDLVPFETLDFGGSSFKPLTRALSQILAILNEMPASCQKYQFTMAMAEKMMEEN 193

Query: 253 ARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAALPFAAYV 312
           ARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEER RAGTWP+RIIAALPF AYV
Sbjct: 194 ARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEERHRAGTWPARIIAALPFGAYV 253

Query: 313 TPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSETGIVEGEFGGEIVVVEKLGQELIWMTEKLR 372
           TPYLKF +LAVSAVG IVPKAEPLNGRRSET +VEGEF  E+VVVEKLGQEL+WMTEKLR
Sbjct: 254 TPYLKFFNLAVSAVGTIVPKAEPLNGRRSETRMVEGEFDSEVVVVEKLGQELVWMTEKLR 313

Query: 373 EYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVACNPRIQWCFVKISATLFRELMRSKEMEEM 425
           EYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVAC+PRIQWCFVKISATLFRELM SKE+EE+
Sbjct: 314 EYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVACSPRIQWCFVKISATLFRELM-SKEIEEV 363

BLAST of Lsi04G007940 vs. NCBI nr
Match: XP_022999294.1 (E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 1.8e-161
Identity = 307/322 (95.34%), Postives = 312/322 (96.89%), Query Frame = 0

Query: 518 NEATTTATKLGSDGVKPTPTTTTAAASSDHDQNPNSNPSPPSVSDPQNDTTGSDSTSLQT 577
           NE TT ATKLGSDGVKPTPTTTT  ASSDH+QNP SNPSPPSV+DPQND TGSDSTSLQT
Sbjct: 3   NETTTNATKLGSDGVKPTPTTTT-TASSDHEQNPTSNPSPPSVADPQNDPTGSDSTSLQT 62

Query: 578 PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG 637
           PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG
Sbjct: 63  PSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDEDG 122

Query: 638 FGDPHDHTESDGDDDEYDGTDVNDDDDVFDVHAHEDGGEHNNPNFELDPGNFSSDEAYAR 697
           FGDPHDHTESDGDDDE+DGTDVNDDDDVFDVHAHED GE NNPNFELDPGNFSSDEAYAR
Sbjct: 123 FGDPHDHTESDGDDDEFDGTDVNDDDDVFDVHAHED-GEDNNPNFELDPGNFSSDEAYAR 182

Query: 698 ALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG 757
           ALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG
Sbjct: 183 ALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGEVVG 242

Query: 758 TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSECIN 817
           TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTG++DSCVICRLDFED ETLTVLSCKHSYHSECIN
Sbjct: 243 TESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGSSDSCVICRLDFEDNETLTVLSCKHSYHSECIN 302

Query: 818 NWLKINKVCPVCSAEVSTATGS 840
           NWLKINKVCPVCS EVSTATGS
Sbjct: 303 NWLKINKVCPVCSTEVSTATGS 322

BLAST of Lsi04G007940 vs. NCBI nr
Match: XP_008445882.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488768 [Cucumis melo] >KAA0034070.1 BTB/POZ domain protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 580.1 bits (1494), Expect = 3.1e-161
Identity = 311/359 (86.63%), Postives = 322/359 (89.69%), Query Frame = 0

Query: 73  SRKPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 132
           SRKP SS  SLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT
Sbjct: 14  SRKPISSTPSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFT 73

Query: 133 VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGGDGDGGGSRSTPPLLLPPPSSASS-------S 192
           VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGG G GG + S P LL  PPSS SS       S
Sbjct: 74  VWVLRIVMDWFPVALAPSRRLLTHFCGGG-GGGGCTSSAPLLLTAPPSSESSLSLSSSMS 133

Query: 193 ALGSSALASLSKLDLVPFESVDFGGSSVNPLTRALSQILAILNEMPASCRKYQFTMAMAE 252
           ALGSSAL  LSKLDLVPFES+DF  SSVNPLTRALSQILAILNEMPASC+KYQFTMAMAE
Sbjct: 134 ALGSSALDPLSKLDLVPFESIDFVASSVNPLTRALSQILAILNEMPASCQKYQFTMAMAE 193

Query: 253 KIMAENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAAL 312
           KIM ENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSS LYDSLHRTR+ E+R RAGTWPSRIIAAL
Sbjct: 194 KIMEENARSGQIELLQVNRAALSAAFARTSSFLYDSLHRTRQTEQRIRAGTWPSRIIAAL 253

Query: 313 PFAAYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSETGIVEGEFGGEIVVVEKLGQELIW 372
           PF+AYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSE GIVEGE+GGE VV EKLGQEL+W
Sbjct: 254 PFSAYVTPYLKFLDLAVSAVGAIVPKAEPLNGRRSERGIVEGEYGGE-VVAEKLGQELVW 313

Query: 373 MTEKLREYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVACNPRIQWCFVKISATLFRELMRSKEMEEM 425
           M EKL EYGA DEAM+QWSFAGGLAS SVACNPRIQWCFVKISA LF+EL  SKEME+M
Sbjct: 314 MAEKLGEYGAADEAMVQWSFAGGLASASVACNPRIQWCFVKISAMLFKEL-TSKEMEKM 369

BLAST of Lsi04G007940 vs. TAIR 10
Match: AT3G19910.1 (RING/U-box superfamily protein )

HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 1.3e-80
Identity = 182/323 (56.35%), Postives = 228/323 (70.59%), Query Frame = 0

Query: 516 KINEATTTATKLGSDGVKPTPTTTTAAASSDHDQNPNSNPSPPSVSDPQNDTTGSDSTSL 575
           KINE      +    GV     + T + S   +Q      S  +V+ P  ++       L
Sbjct: 23  KINETDGRLPENRQTGV----VSDTGSGSERGEQGVGE--SAVAVAVPVEESGSISVGEL 82

Query: 576 QTPSRHSSRTPFTNLTQVDADLALARTLQEQERAYLMLRMTSEGSDFGSWEAGSYVLDDE 635
             P   S+R PFTNL+Q+DADLALARTLQEQERAY+ML M SE SD+GSWE GSYV  DE
Sbjct: 83  PAPRSSSARVPFTNLSQIDADLALARTLQEQERAYMMLTMNSEISDYGSWETGSYVY-DE 142

Query: 636 DGFGDPHDHTESDGDDDEYDGTDVNDDDDV-FDVHAHEDGGEHNNPNFELDPGNFSSDEA 695
           D F DP +  E D D+DEY+  D   +D +  +VHA+ED  E ++ N +++   ++ DEA
Sbjct: 143 DEFDDPENEDEDD-DEDEYETDDDPQEDGLDVNVHANEDDQE-DDGNSDIEEVAYTDDEA 202

Query: 696 YARALQDAEDREMAARLLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTWEDVDPDELSYEELLALGE 755
           YARALQ+AE+R+MAARL AL+GL ++  +D +D+   SQD W+++DPDELSYEELLALG+
Sbjct: 203 YARALQEAEERDMAARLSALSGLANRVVEDLEDESHTSQDAWDEMDPDELSYEELLALGD 262

Query: 756 VVGTESRGLSADTIASLPSINFKAGSGQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSE 815
           +VGTESRGLSADTIASLPS  +K G  Q G N+SCVICRLD+ED E L +L CKHSYHSE
Sbjct: 263 IVGTESRGLSADTIASLPSKRYKEGDNQNGTNESCVICRLDYEDDEDLILLPCKHSYHSE 322

Query: 816 CINNWLKINKVCPVCSAEVSTAT 838
           CINNWLKINKVCPVCSAEVST+T
Sbjct: 323 CINNWLKINKVCPVCSAEVSTST 336

BLAST of Lsi04G007940 vs. TAIR 10
Match: AT3G19920.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G64230.1); Has 217 Blast hits to 217 proteins in 16 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 215; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 201.1 bits (510), Expect = 3.7e-51
Identity = 140/346 (40.46%), Postives = 191/346 (55.20%), Query Frame = 0

Query: 81  SSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKN-ELSGRKWRPADHFRFMLMLTSWFTVWVLRIV 140
           + LLNS FM+TVN AA SLVSVAS A   E+  R+W  +DH  F                
Sbjct: 21  TGLLNSIFMTTVNTAARSLVSVASTASTPEIPSRRWSASDHLSF---------------- 80

Query: 141 MDWFPVALAPSRRLLTHFCGGGDGDGGGSRSTPPLLLPPPSSASSSALGSSAL---ASLS 200
                     +  LLT              +     L P  ++SSS+  S+AL   +  S
Sbjct: 81  ----------ASGLLT--------------TAAENALVPAKASSSSSTSSTALVKYSGSS 140

Query: 201 KLDLVPFESVDFGGSSVNPLTRALSQILAILNEMPASCRKYQFTMAMAEKIMAENARSGQ 260
            L ++  + VD    SVN L RAL   LA++NE+P + RKYQF M MAEKIM +NA+SG 
Sbjct: 141 DLGMMICDGVD--EPSVNSLGRALCHALALMNEIPVTSRKYQFAMGMAEKIMEDNAQSGH 200

Query: 261 IELLQVNRAALSAAFARTSSLLYDSLHRTREIEERTRAGTWPSRIIAALPFAAYVTPYLK 320
           ++LL VNRAAL+++FART++ L D L R+R  +E    G  P R+++ALP   YV  Y++
Sbjct: 201 VDLLDVNRAALASSFARTTARLQDCLKRSRTADE--PFGGLPLRVVSALPLGGYVASYVR 260

Query: 321 FLDLAVSAVGAIVPKAEPL--NGRRSETGIVEG---EFGGEIVVVEKLGQELIWMTEKLR 380
            L   ++ V ++      L    RR E+ +V     +     + VEKL +EL+WMTEKLR
Sbjct: 261 GLSACINTVRSLADMTGNLLSQTRRRESAVVRAGGIQENEAELAVEKLAEELLWMTEKLR 320

Query: 381 EYGAVDEAMLQWSFAGGLASVSVACNPRIQWCFVKISATLFRELMR 418
            YGAV E + +WS+A GLAS+S+   PR+Q   VKISA L  EL R
Sbjct: 321 RYGAVAEGIKRWSYASGLASLSLTAAPRVQGLMVKISALLIGELAR 322

BLAST of Lsi04G007940 vs. TAIR 10
Match: AT5G08290.1 (mRNA splicing factor, thioredoxin-like U5 snRNP )

HSP 1 Score: 144.1 bits (362), Expect = 5.4e-34
Identity = 74/111 (66.67%), Postives = 84/111 (75.68%), Query Frame = 0

Query: 1   MSYLLPHLHSGWAVDQAILAEEERVVIIRFGHDWDDTCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYL 60
           MSYLLPHLHSGWAVDQ+ILAEEER+V+IRFGHDWD+TCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYL
Sbjct: 1   MSYLLPHLHSGWAVDQSILAEEERLVVIRFGHDWDETCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYL 60

Query: 61  VDITEVPDFNTISR--KPFSSASSLLNSFFMSTVNVAANSLVSVASNAKNE 110
           VDITEVPDFNT+     P +      N   M  +    N+ ++ A   K E
Sbjct: 61  VDITEVPDFNTMYELYDPSTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWALKDKQE 111

BLAST of Lsi04G007940 vs. TAIR 10
Match: AT3G63530.1 (RING/U-box superfamily protein )

HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 9.5e-23
Identity = 72/186 (38.71%), Postives = 104/186 (55.91%), Query Frame = 0

Query: 654 YDGTDVNDDDDVFDVHAHEDGGEHNNPNFELDP-GNFSSD--EAYARALQDAEDREMAAR 713
           + G+D       +D++ H         N++  P  N + D     AR++Q  +  E +  
Sbjct: 65  FSGSDNASFYGSYDMNDHLSRMSIGRTNWDYHPMVNVADDPENTVARSVQIGDTDEHSEA 124

Query: 714 LLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTW-EDVDPDELSYEELLALGEVVGTESRGLSADTIA 773
              +A   D D         + Q +W +D+DPD ++YEEL+ LGE VGTESRGLS + I 
Sbjct: 125 EECIANEHDPD---------SPQVSWQDDIDPDTMTYEELVELGEAVGTESRGLSQELIE 184

Query: 774 SLPSINFKAGS--GQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSECINNWLKINKVCP 833
           +LP+  +K GS   +    + CVIC+L ++ GE    L CKH YHSECI+ WL INKVCP
Sbjct: 185 TLPTKKYKFGSIFSRKRAGERCVICQLKYKIGERQMNLPCKHVYHSECISKWLSINKVCP 241

BLAST of Lsi04G007940 vs. TAIR 10
Match: AT3G63530.2 (RING/U-box superfamily protein )

HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 9.5e-23
Identity = 72/186 (38.71%), Postives = 104/186 (55.91%), Query Frame = 0

Query: 654 YDGTDVNDDDDVFDVHAHEDGGEHNNPNFELDP-GNFSSD--EAYARALQDAEDREMAAR 713
           + G+D       +D++ H         N++  P  N + D     AR++Q  +  E +  
Sbjct: 65  FSGSDNASFYGSYDMNDHLSRMSIGRTNWDYHPMVNVADDPENTVARSVQIGDTDEHSEA 124

Query: 714 LLALAGLQDQDADDTDDQGENSQDTW-EDVDPDELSYEELLALGEVVGTESRGLSADTIA 773
              +A   D D         + Q +W +D+DPD ++YEEL+ LGE VGTESRGLS + I 
Sbjct: 125 EECIANEHDPD---------SPQVSWQDDIDPDTMTYEELVELGEAVGTESRGLSQELIE 184

Query: 774 SLPSINFKAGS--GQTGNNDSCVICRLDFEDGETLTVLSCKHSYHSECINNWLKINKVCP 833
           +LP+  +K GS   +    + CVIC+L ++ GE    L CKH YHSECI+ WL INKVCP
Sbjct: 185 TLPTKKYKFGSIFSRKRAGERCVICQLKYKIGERQMNLPCKHVYHSECISKWLSINKVCP 241

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9LT171.8e-7956.35E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BBR P... [more]
Q9FE627.6e-3366.67Thioredoxin-like protein YLS8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=YLS8 PE=1 SV=1[more]
P838768.6e-2958.04Thioredoxin-like protein 4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TXNL4A PE=1 SV=1[more]
P838778.6e-2958.04Thioredoxin-like protein 4A OS=Mus musculus OX=10090 GN=Txnl4a PE=1 SV=1[more]
Q8L6491.3e-2138.71E3 ubiquitin-protein ligase BIG BROTHER OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BB PE... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KRW77.3e-17289.92Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G175700 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1KGM78.9e-16295.34E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493... [more]
A0A5A7SSX31.5e-16186.63BTB/POZ domain protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold6... [more]
A0A1S3BEK61.5e-16186.63uncharacterized protein LOC103488768 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488768 PE=... [more]
A0A6J1GZI28.4e-16094.41E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_004143698.11.5e-17189.92uncharacterized protein LOC101206051 [Cucumis sativus] >KGN50446.1 hypothetical ... [more]
XP_038892468.11.2e-16897.52E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related [Benincasa hispida][more]
XP_038893039.11.6e-16890.08uncharacterized protein LOC120081928 [Benincasa hispida][more]
XP_022999294.11.8e-16195.34E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-related [Cucurbita maxima][more]
XP_008445882.13.1e-16186.63PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488768 [Cucumis melo] >KAA0034070.1 BTB... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT3G19910.11.3e-8056.35RING/U-box superfamily protein [more]
AT3G19920.13.7e-5140.46unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TA... [more]
AT5G08290.15.4e-3466.67mRNA splicing factor, thioredoxin-like U5 snRNP [more]
AT3G63530.19.5e-2338.71RING/U-box superfamily protein [more]
AT3G63530.29.5e-2338.71RING/U-box superfamily protein [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR004123Dim1 familySMARTSM01410DIM1_2coord: 4..108
e-value: 9.1E-25
score: 98.3
IPR004123Dim1 familyPFAMPF02966DIM1coord: 4..72
e-value: 1.1E-27
score: 96.4
IPR001841Zinc finger, RING-typeSMARTSM00184ring_2coord: 789..829
e-value: 6.3E-6
score: 35.7
IPR001841Zinc finger, RING-typePFAMPF13639zf-RING_2coord: 787..829
e-value: 1.9E-11
score: 44.1
IPR001841Zinc finger, RING-typePROSITEPS50089ZF_RING_2coord: 789..830
score: 11.869652
NoneNo IPR availableGENE3D3.40.30.10Glutaredoxincoord: 1..81
e-value: 1.7E-32
score: 113.9
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 521..589
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 444..465
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 444..470
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 622..661
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 514..589
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 646..661
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 717..741
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 720..741
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR47530:SF4E3 UBIQUITIN LIGASE BIG BROTHER-RELATEDcoord: 540..837
NoneNo IPR availableCDDcd16454RING-H2_PA-TM-RINGcoord: 789..829
e-value: 2.60803E-17
score: 74.2605
NoneNo IPR availableSUPERFAMILY57850RING/U-boxcoord: 783..838
IPR013083Zinc finger, RING/FYVE/PHD-typeGENE3D3.30.40.10Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)coord: 754..836
e-value: 3.1E-21
score: 76.8
IPR043312E3 ubiquitin ligase BIG BROTHER-likePANTHERPTHR47530E3 UBIQUITIN LIGASE BIG BROTHER-RELATEDcoord: 540..837
IPR036249Thioredoxin-like superfamilySUPERFAMILY52833Thioredoxin-likecoord: 4..70

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi04G007940.1Lsi04G007940.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome
biological_process GO:0016567 protein ubiquitination
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
cellular_component GO:0046540 U4/U6 x U5 tri-snRNP complex