Lsi03G021920 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi03G021920
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr03: 33003808 .. 33008766 (+)
RNA-Seq ExpressionLsi03G021920
SyntenyLsi03G021920
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAATAGTATTCTATGTTCTTCATGTTCTTGTTATAGTCAGCATAAATTATGAATATTGTGATCATGAACTGCTCAGTACTAGAATTATCATAAGGAATTGAAGAATCGAAAAAGATAAATAACGTGCTAGGAGTGTCTGGAGATCAAATTTTATCATTTAGTGTGTTGTCTTTACTCTTTAGAATAATGAGTTCGCCATCCACTAAAACAAAGTAAGATTTAGTCCATTCTCAAGACTTGATTCTTCAGAGTTCTCCATGAAGAGAAGACCATTCATTCTCCAGAGGCACAAAGTTCCCAGCAATGTTAAGCAAGTCAACAAGTCGTTTTGTGAGTAGACTAACTCATGTTAATTCACGAGGATGTTTCATAATATTTACATGATTGACTTGAGTTTTCTTGGGTATGGATTACTAGTGTTGGTTATTGCATCAGGATGAAAGATCTACATTATGAAATACACAATAAAATAAGTTAAGCATCCAGAGAAAGCCACCGAGGAGAATACAAAGCCTACAACGGATGTGGATCCTCCCCTCTTATTCGAGTTGACTGACACGTTACTTGGAATATATCTCAAGCGATACTTTAAGTGGGATTTTGATTATACGAGGACCATGGGCAATCTCTGAAGTTATCTCTGAAGTTAAAGAGGAACAAAGAATCTAAATGGAGAATAAATTTTGACAGAAGAACTTTAAATTTGTAAGGAATTTAATAATATCGACATGCAGAATAATCATATCAGACTTTGATAGCAAAAACAAAGTAGAATGAGAAATATTCCGTTCTAGAGATGTGCCTGTGTCATAACAGGTGGTTAATAAGATGCTAGATCTGATGGGAAATAACACCAAGTGAGCATTATCCGTAAAGGGGAGATGAAGATTACCATTGAAGAGGTAATTCTTTAAACAGCTTTCAATTAATTTACTTTCTTGTGACCTCGCAGAAATAAGAAGGATCCACACCAATGTTATTCGAAGGTTGGAAGCTGTTAGTTCCACAAATGGCAGTGTAGTTTCTTTTTTTAACCCATTCATTTTTTTTGTTCTTGACCTGATAGGCTTATTACCAATTTTGATCTTTTGGACAAATTGCGTTATTTATGTACTTCTAATTTCTTTCTTTGCTACCCAAACTGCATAAATTGTCTTGTTCTTGTAAATATGTATGTACTGTTGCCCTTTTGTTTAGTTGAGGAAACAAGATGGCGACCCTCATTTCAAGTTGATTCTCTTCAGTGTTGGTGAAAAAACCTTCATGTTTAGCTCTAGTATCAACTCTGTCAAGTTGCAACATATGTATATATATTTTTGAAGACCATGTTCTTGAATCGTCAGCGTCTGTGCTTCCTTATAACAATTTTGTAGGTGTTAATGTTGCATGGAATGCCATGTTAAGCTTCCTTGGCTACACATTCGAGAAGACAAGTTAATTGTGATCCAGAGTAGTCTGGTAAGTCTCTGTCTCAATGTATTGTATTTTTGTAACTGTCTTCACTTCTTTTCAAATGCTATGTTTGGCCGAGTGATGAAGTTTTAATGCGTCATTTCTATTTCTGCTAGGCTTAAGTGATGAACGGCATGGGTCTGCAGGTTGTATCTGCAGCCCACCATATGGCCCAATTTTATTGGGTCACGTGTTGACCTTTTTTTAGAACCTGGTAATTGCATATGTTGGGGAGTTTCCACGCTTTTTTTTTTTTTAACGTCTTTAAACCAAAAGCTAGCTTCCCCCATCCCATCGCTGGATCGTTTTTCACTCTCTTGAGCTGGGGCGATTCGAAATTAACACTCCTTCTCCCACCAATCATCATTACTAAGTCCCAAAAATATCAAAGTCACCATATTCTCTCAATGTTACCTAAAATACAGCCATTGGAGGATGTTACCATTGGAGTCTGCTCCTCCTAACCCAAGAGTGACAAATGCGTCGATGATGGAACAAGAAAGTCACAGAGAAAGATGGAAATGGTTTAGGAACTTAGGTTTAAGTTTAACGCAAATTAAAAATTAAAAAAAAAAAAACTGGAAACTTAGACACAATTATTAACAGGATTAAAAAGATAAAACGTGGCCCAATAAAATCAGGCCACGTGGTGGGCTGCAAATACAACCTGCAGACCCACCTTCAGGTAAGTTTTTCTCTTTAACTTAAACTTTATCGGATTTTTTTTGTTTTTTGTTTACATTTTAATTCATTTAGTAAGTTAATGTAAACTATTTGAAAAGTACAGTGCCACTCTCAATTTATAATATAAATTCTCCGACTCGCTTGTCTTTCGCTTGAAATCAGTTCCAAGGTACTCTATCACAAAATATTGGATTTACTCTTCCAAGTCTCCAGGGCTTTCTTAGTGGTCACAATAATTCTAGGTGGCGAATTCCCATGTCATTTGCCAATGCCTCGAGTCTTTCGATATTAGGTATCGCTGAAAACAATTTCATTGGAATGCTACTTGATGATTTGGGGAGTTTAAAACGATTAGAGGTACTCAATTTCTAGGGAAACAAACTTGGGAGTGGAAAAGTTGGTGATTTACAATATATTTTTAGATAACCTAGCCTTTCGAGAGGGCTAGTCTCTCTCAAATTTTCCAAAGGAAATCTTACAAAACTCTTTACACCCTCCCGACTCCACTCCCTCTATTTATTATAATTAAAAGCCCTAACAAACTTATTACCTATTTTTTAATATGCTCTAATGACTATACTAATATTCTACTAAAAATTCTAATATATCTTTAACTAGGGTGCCTAAAGGACTAATTTCCAATTCAACCATGGTTTCTATCATTGTGAAGAATAATTTATGTGATAATTTTCTAGAGTTACACTTACCTCCATCCACCATAACCCTAACACATTTGTCCAAGAAGCAATTTGTAGCATCGAAGGTGTTAATTATCATAGTATCAATTGTCAAATTCATTGTTTTGGTGAGCATCGCTTTTGTGTGTTTTGTGTTTAAGAAGTTGGGGAAGGAGGCTTCAACTAATTCATCTTTTGCATAGGAGTTTTTACCGCAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTTTTTTTACTTTGATTTCATTAAATCAACTAACAGACAGATTCTCTATGGATAATTTGGTTAGTGTAGGTAGTTTTGGCTGAGTGTATATAGGTGTTTTTTCAATGGATCTATTGTTGTTGTTAAGGTTCTGACCTCCAACAACAAGGTGCTTTCAAGAGTTTTGTTAATAAATGCAATGCTCTTTCAAACATACGACATCAAGATTTTTAGATCATAACTTTCTTGCTCAAGTATTGAAGCACAAGGCAATGAATTTAAAGATTTGATCAGTAATTTCATGTCCAATGAAAAAAGCGTTGTAGAGATTGAACATTGCTGTTGATATTGCATGTGGATTAGGTTATCTTTGTAATGATTGTCAACTCCTATTGTTCACTATGATCTAAAGGCCAACAATATTTTGCTCGACCACGATATGGTTGGAAACCTCAGGTTAGCTAGATTCAAGTTGGAAGAATTAATAATCAAATATCTTTTAGTCAAACAATGTCGTTTGCACTTAAGGCTCTTGTAGAGTATATTCCTCAAGGTATTTTCCTTCCATCTACACCCTATCATTTTCAATAGTAATTGCTCTCGATTTTCCAAAGTTACCTAGTATAACCATGAACGAAATATTGCCAAGTACGATATTTGTAGCAGAATTTTCATTGATGGAGATATCTTCAACTAGGGAGTATTACTATTAGAGATAATTGATGGAAAAGACCCATTGATGTGTTTGGTAATGGTGTGAACATTTATTTGTTTATTGACCATTTTATAATATTTGAATAAACGTGTTAAGAAGAGACAGTAGAGATTGAATACAAGAAATAACAATTACGTCGTTGAGGAATTGTGCTCAGATGGATGGAAAAAAAAAGAATCTGCTTGTCATTCTCTTTGAGGGCACCTAGAGAGAGAATGTCAATGAATGTTGCGTTAATGAATTGCAAGGCTATTAAAACTCGTATCTCAAGTTTAAGAAAGCACACTGAAGGTTTTTCCTATTGTTCTTTTAGACTAATTCGGATTATATTTCATTAGCCCAAATATTGGGATGTGTTTAACAACCTTTACCAAATGCTAACCTACCTTTAGAACACACAGTTTGAAGTGCAATGCTACCACGTATGATTAATTATGGTTAAATTTCATTTATGAGTCCCTATATGAAAGATTAATGATGTAGTATTTTTGCTTCTTGACCTTGACTTTTCAATATTTTTGGAGTTGAACTAATTCTAATAAATAATGAGTAATGGGAGAGATTGGGAGTGCCGTGGGGGTGGGGGTGGAAAAAAAGGGGAAAAAAAAGGACAATTGACATTTTTAACCCATTTGAGGTGTGGGTTGGTTTTTTGTTTTTTAAATTTTGACCCTTTTTTTAAAATGTTATTTTTTTTGACCCCTTATGTTTTCCAGATACATGAAATTACCATTTTGTCCCTTTATTAAAATTTCAAAAGTCCTTTTCTTTTGACCCCTAACTTCTTCACGCTTTGACTTCACCTCTCTCGATTTTGTTGCTTCAATTTCCTTGCTTGTAAACTTTGATTTCTTCGGCGTTTACATTAGATTCAACCGGATTTCTCATCTCAACAAGTTTCAATTTACCTTTTTTTTTTTTTGCACATAATGTAGGTTTTTGTTTGAGAATATTTTGAGATGACCTTTAAAGGTTAAAATCCATGTCTGGGTTAAAATCTATATGCATGTTTAGCATTTTTACCCAAACATCGATTTTAACTCAGAAAAGGCCATCTCAAAACATCCTCAAATAAAAACTTATATTATGTGAAAAAAAAAAGGAAATACGAACCTGTTGAGATGAGAAATTCGGTTGAATCTGATGTAAACGTCGACGAAATCAAAGTTTGCAAGCAAGGAAATCGGGAAAGGTGA

mRNA sequence

ATGAATAACCATGTTCTTGAATCGTCAGCGTCTGTGCTTCCTTATAACAATTTTGTAGGTGTTAATGTTGCATGGAATGCCATGTTAAGCTTCCTTGGCTACACATTCGAGAAGACAAAGTTACACTTACCTCCATCCACCATAACCCTAACACATTTGTCCAAGAAGCAATTTGTAGCATCGAAGGCCAACAATATTTTGCTCGACCACGATATGGTTGGAAACCTCAGGAAATACGAACCTGTTGAGATGAGAAATTCGGTTGAATCTGATGTAAACGTCGACGAAATCAAAGTTTGCAAGCAAGGAAATCGGGAAAGGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAATAACCATGTTCTTGAATCGTCAGCGTCTGTGCTTCCTTATAACAATTTTGTAGGTGTTAATGTTGCATGGAATGCCATGTTAAGCTTCCTTGGCTACACATTCGAGAAGACAAAGTTACACTTACCTCCATCCACCATAACCCTAACACATTTGTCCAAGAAGCAATTTGTAGCATCGAAGGCCAACAATATTTTGCTCGACCACGATATGGTTGGAAACCTCAGGAAATACGAACCTGTTGAGATGAGAAATTCGGTTGAATCTGATGTAAACGTCGACGAAATCAAAGTTTGCAAGCAAGGAAATCGGGAAAGGTGA

Protein sequence

MNNHVLESSASVLPYNNFVGVNVAWNAMLSFLGYTFEKTKLHLPPSTITLTHLSKKQFVASKANNILLDHDMVGNLRKYEPVEMRNSVESDVNVDEIKVCKQGNRER
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi03G021920.1Lsi03G021920.1mRNA