Lsi03G015750 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGTAATTGGTGTGGTCACAATCTTAATTGGGAGAGAAAATTGATATGATTGGTGTAGAACCAAGTAATCAACACAATTTTTTTTTTTTTTAGTACAATTGAAGGTGAGGAGATTCGAACCATAAACGTCTTGTTACAAACGATATATGTCAATTGAGCTATACTCGTTTTGACACAATTCTAAATGAATAGAAAGCGACATACATATAAGCAGAAAATATGCTCATAACTAATGTCCAAAACAAATTCCCTTTGAATTTTCTGCTCATAACTAATGTCCAAAACAAATTCCCTTTGAATTATCCATTGTTGTTAAAGAAAGGATCCTAATGGTGACAGTGAAATTTGTCTGTCCAATTTTACTTGTGAATAGCACTCGTCTTCTTCCAATTTTAATTTGTTGAAGAAGAACGTGGCCGAGATTTTTTTTTTTCAAGAGTATATCTTAAAAACATTTTTTTTTTTAAGTCTAGGACTAATTTGAAATAAACTTCCAAACACATCATCCAAATCTTAAATAATTTTGAACAATTAAGTCAAAATTGTGGTTTCTCATTTTTTAACTTTTTTTCTCCCCAACTTCCAAAACACATCATCCAAATCTCACCTTCAGCGTTGTATTAAAAAAGATTGCTCAATTTTGAATTCTACGGATCAATTTAAAATGATAATTTTCATTTCAAACGAAGAAAAAAATTTAAAATCCTTACTCGATATTGAAATCACACTCATTTAGAATTATTTCTTTAACTTTTTTTAATCCAAATAGATGTCCTTTTCAACTTTAATAAAAAGAATTTGTGGATATCCAAATATATAAAATTCGAATTCAATACTATAGCACTTTTTAAGAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGGTACGCAAAAGTAAATACTTATCTTCAAAATCAGTAAAAAAAATTATGTATAAACTTCTTTTTCCTGGGTATTAGCTTTCTAAAAAGAAAATACAGGAAATTAGAAAAGTATAACTTAAAAAGCGTTTGATATGCAGGTTTAGAATCTTAATTTGGAAATGTTAATCTTAGAGGTTTAAGATGTGGGTTTAGATAGCATGAGTTTATGAAAACGGAATGCAAGTTTAGGAAGTCTAGGTTGGCTTAAAAAATTGTGTTTGGAGTGGAGACTTATGAAAGCTGTAAGTGAAGTGTAGATTCTTGAGTTTTTTTTAATATTTTATTGTATTTAATCCTTGATTAGATTTTAGAGTAGTTTAAATTTGACATATTAATTATTTTAATATAGTTAAGTTTAAAAGAAACTAATTTTTATATTTTTCAAATATAACTAAACTTAAACTTAAAATTGTATTTCTTATGTTTTTGTTATTTTAAAATTGACTGACTTATATAGCATAAAAAAATGGACTAACTTAAATATGTAACCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGACTAATGTAAACAAAATATCTTGGGTATTTTTTTTTAAATGACTATGTAAAAGGTGAAATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTAAATAACTAAGATCAAATTGAACATCATATATATATTTATATCCTGAATAAATTTAATTTGTCAATTAAATACTTTTTTTTAATATGAATAATCTAAAATTAAATATTATTTATTTCTAACATTAATTTATAATTCAAATTCAACTCAATTCAATTAAAAAAGATAGAAGAATATTTGTTGTTTTTTAATTTTGAATAGAGATTTGAGTAAAATTAAATAAAATTATAATTTTATTTTACTTATTGTTTTAATAATTTGATTTCAATTTTAGTAGGTTTTGTAGTAAAATTTTATAGACTTTTTTCATTTTAATCTCCATCTCCACATCTCCGTCCCGTTCTCTTTTATTTATTTATTATAATATTTTAATATTACGTTATTATTACTATATAAATACTTATATCTAAACTTAAAGTTTTATTGTTTAATGGTTAAGAGATATTAATTAATATGTTTGAATTTAATCTTTAAATTTAGATTATATTTGGTATTTTTTTTTCTTCTAGATTCTTTTTTATTAATTTTTCTTAAATTCAAATTATTCATGTGAAACTAATCATATTACAAATTACTGAGAAATTTAACTATTCAATTAAAATTTGTCCAATATAGTCATTTTAAGCTAATTGATTTTTTTTTTCACAAAAAAGGACAATAAAAATCAAACGGGCAAAAATTTGCTGGGGAACTCGATTCCCTCAGATTCTCCGTGGGAAATCCCCACCCCGATCCCCGTGAAAAATTTCGTAGGGATCGAAAATGAAATAAGAAATGGGGAGCGAGGAGAGAGGAGCGGGGAAGCCATCCAAAAATGTGTAGGAAACTAAGCTTCCTAGACCTTTGCCCCAAACAACATTATTGTAAAGTGTTTTTTTAAAGAGGTCAAAAGTCTACAATTTTCCTTTGACAGCATACATCCCCAGTTTAAGAGGTCAGAAGTTTGAATACTCATCCTGTATATTGTTACATAAATAATTAAAAAGTCTAAAATTTTCTATTAAAAAAAGCTCTTAAATTCAAGACGTCTATATTGTTACATTATGGATGATTTTCCCTTCTTATTAGAAAAGTCACAGAAAATTCAAAGACCAAACATAGTCCTCCCTGAAATTGGAACTTAAGAACAAAGAATGAGAAATAATGGAAAATAGTGTAGGGGAAAATTATATTTTGTTTCTTTTAATTTTCCTTATAAAATCTTCCATTATTGAGGAAAACTTATAGTTTTATATAGATGAGATGAATTTAAACCATTTAGGTGAAATAATAATATTCAATTTTCAAAACACAATAAATTTTGTAGAGAAACATTGTCATATTTTATCTTCTTTTTCCATCTTTTTATAAATATTTCATCATTGTGGAAAATTTAACTTCATAAAGAAGATGCCAATTTAAACAATTTTGGTCAAATAAAAACCTCTAATTTTCATAAGAGAATAAATTTAAAATGAACTTTGCCCGCTTTACTTTAAGTCATGGGAATATGATGCCAGAATAAAAAGATGAGAATATAAATACTCGAACAGTTTCCTAAAATATAGGAATGAAATCAATTCATCCAATTTGAGAACGGAGGATTTTTTTTTAAAAAAATAATAAAATAAGGAAAACTATTTATACAAAATAGTAAAATTTTTAAATAGTTGTGATAAACGCCGATAGAAGTCTATCAGTGATAGAAATGATAAAAGTCTATCAACGTCTGTAAGAGTTTTTTTTTCTATCTTTTGTAAATAGTTTGACATTTTTTCTATGGGTGAAAATTCTTCTTTTTTAAAATTTCCTTTTGAGAATTCCTAATCACTTTTATATTACTTACTTTAGGAAAGAAAAAAAAAAATACTTTTTTAGTTTCTAAAGTTTTGGTATTTTGGATATAGTTTCACATTTGGTCCCTAGAGTTCAAAATGTTACACTTTTAGTTCTTAAATTTTAAGTTTGATTTCAATTTAGTCCCTAGATTTTGAAATGTTACCACTTTACCCTTGAGATTTTAGTTTTGTTTCAATTTTTAGTCCTTAAATTTTCATATTCACACTTTCAATATTGATTTTTCACTAAACACTCACTTCTAGTTTTCAGCATTAAGCTGCAATTCTGGTGAATTTTGACTTTCTTATTTCAATAATGGTTAAACTAAAGTTTAGTATATGAACTTTAATGTTTTTATATACTTTTGATTTTTAAACTTATGAAATTAGTACGCAATAATTAAATCGTTACTTTCAATTTTATGTAGTTTAATAAGTTTCTAAATTTGTAATTGTATAGGTATATTTCATTGACAAATTCAAAAAATTCAAAATCTAAATAATTTATTAGATGTAGATTTAGATTTTATGTCTAATATAACTTTAAATTTTTAATGGTGTTTATTATATTCGTAACTTTTTTTTTTTTATGAATATCAAATTTTAGAATTTTAGACATGGAATGAACACAAAACACAAAAATGAAAATTAGGGCTAATTTAATCTTCAATAACTTAAAAAAAAGTGTAGCCCTGATATAAAACAGCATTGTCAGCCAAGAGTTGACAGATCAACGAAAACAAAGACGAACCATAAATTATATTTGGATACATTTTAGGTTAAAATACTATTTTGTTTTCTATACTTGAAAATTATTTAATTTTAATCTCTGTATTTTATGTTCAATTTTAATTTTCTGACTTTAATATTTGTACTTTTAATAATATTCTCCAATGCTAATCTATTGTGGATTTTTTTTGTTATTTAATAATATTTGTACTACCAAATTTGAAATTATATTCACATATTGAATTTTCTTGCATTAAAGTTATCATTTAAGATCTATTAAAAGTATGGGGACTAAAATTAGATAATTGAAAGTATATGGATTAAAAGTATATCGTTTTTGGACTGGAGTGTGATGCGCGTGTTAAGAATGTGTCAACCTAGTTGAGATATCTGGGTGCACCTACTGACCCCTCGACCTCTAGTATCTTGTTAAAAAAGAAAGTATATGGACTAAAATTGAACAAATTTCAAAATATGAAGACTAAAATGATATTGGGAATGGTCCACTTCCCAATGATGGTGAAAGCAAAGTGATAATCAACCACTTATTATGTAATATAATAGTAGCACCCATGTTTCAAACGAGAGAGAAACGGTCCAACCATGTTACATATCAACTCGAGCATGGTTTAACTAGATAAGTCGGGTTAAAAAAAAAAAAGAAAACACAATATTTAAGTAATTAAATTGAAAATATTAATTTATACTCCTAATAATCCTGTCAATTTAAAACCTGAACTTTATAATTGTATTAATTTATATCTCTAATTAATTTAAAACCTAGTCTTCTTCCAAATAATTATAATTAATTAAGTTTCACTATATTTTCATCATTATTAAAATTAATTTTAAAATTTCACTACATAATTTTTCTATATTTGTAAATAGTTTGACTCATGGGTTGACCTAGT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MIKRSCFPRDFVFGTASSAYQIEGGAFEDGKGPSIWDTFTHKHPEKIEDGNNGDEDVAIMKQLGFNAYRFSIAWSRILPNGKLNGGVNEKGIEYYNNLINELIANDYAEVCFKEFGDRVKHWITLNEPYIFITRSCVREEFAPCKCCSQHSFDSFKGDCGTEPYIVGHNQLLTHAACVEVYKTKYQAQQKGVIGMTFLAEWYVPYSNSEADERAASRALDFSLGWLERLPKFTEEEAILIIESFDFLGINYYTAKYAKDNSSEAIPKPSYSTDFCATLTNERDGIPIGPKADASSWLATYPQGLEDVTGVQVKGYFAWSLLDNFEWPRGYTERFGLTYIDFKNNLERIPKDSAKWFHNFLTT Homology
BLAST of Lsi03G015750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5Z9Z0 (Beta-glucosidase 24 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU24 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 404.8 bits (1039), Expect = 1.0e-111 Identity = 213/477 (44.65%), Postives = 264/477 (55.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XKV4 (Beta-glucosidase 12 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU12 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 401.0 bits (1029), Expect = 1.5e-110 Identity = 209/476 (43.91%), Postives = 264/476 (55.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8AVF0 (Beta-glucosidase 12 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=BGLU12 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 400.2 bits (1027), Expect = 2.5e-110 Identity = 209/476 (43.91%), Postives = 263/476 (55.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O64879 (Beta-glucosidase 15 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BGLU15 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 392.5 bits (1007), Expect = 5.2e-108 Identity = 203/472 (43.01%), Postives = 267/472 (56.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XKV2 (Beta-glucosidase 13 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU13 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 385.2 bits (988), Expect = 8.2e-106 Identity = 215/477 (45.07%), Postives = 258/477 (54.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B7N5 (beta-glucosidase 24-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486919 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 548.5 bits (1412), Expect = 2.1e-152 Identity = 281/475 (59.16%), Postives = 309/475 (65.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D2B7 (beta-glucosidase 12-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016655 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 5.0e-146 Identity = 265/477 (55.56%), Postives = 306/477 (64.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DQK2 (Beta-glucosidase 24-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold352G007020 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 500.7 bits (1288), Expect = 5.0e-138 Identity = 265/481 (55.09%), Postives = 303/481 (62.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B7R2 (beta-glucosidase 24-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486920 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 500.7 bits (1288), Expect = 5.0e-138 Identity = 265/481 (55.09%), Postives = 303/481 (62.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0M2N7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G611280 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 488.4 bits (1256), Expect = 2.6e-134 Identity = 249/475 (52.42%), Postives = 296/475 (62.32%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. NCBI nr
Match: XP_038905426.1 (beta-glucosidase 12-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 585.5 bits (1508), Expect = 3.2e-163 Identity = 293/476 (61.55%), Postives = 324/476 (68.07%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. NCBI nr
Match: XP_008443298.1 (PREDICTED: beta-glucosidase 24-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 548.5 bits (1412), Expect = 4.3e-152 Identity = 281/475 (59.16%), Postives = 309/475 (65.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. NCBI nr
Match: XP_022147808.1 (beta-glucosidase 12-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 1.0e-145 Identity = 265/477 (55.56%), Postives = 306/477 (64.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. NCBI nr
Match: XP_008443299.1 (PREDICTED: beta-glucosidase 24-like isoform X1 [Cucumis melo] >TYK25550.1 beta-glucosidase 24-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 500.7 bits (1288), Expect = 1.0e-137 Identity = 265/481 (55.09%), Postives = 303/481 (62.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. NCBI nr
Match: XP_004136782.1 (beta-glucosidase 24 [Cucumis sativus] >KGN59642.2 hypothetical protein Csa_002452 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 489.2 bits (1258), Expect = 3.1e-134 Identity = 261/481 (54.26%), Postives = 301/481 (62.58%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. TAIR 10
Match: AT2G44450.1 (beta glucosidase 15 ) HSP 1 Score: 392.5 bits (1007), Expect = 3.7e-109 Identity = 203/472 (43.01%), Postives = 267/472 (56.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. TAIR 10
Match: AT5G44640.1 (beta glucosidase 13 ) HSP 1 Score: 382.1 bits (980), Expect = 5.0e-106 Identity = 200/476 (42.02%), Postives = 265/476 (55.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. TAIR 10
Match: AT3G60130.1 (beta glucosidase 16 ) HSP 1 Score: 381.7 bits (979), Expect = 6.5e-106 Identity = 202/473 (42.71%), Postives = 260/473 (54.97%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. TAIR 10
Match: AT5G42260.1 (beta glucosidase 12 ) HSP 1 Score: 375.6 bits (963), Expect = 4.6e-104 Identity = 199/475 (41.89%), Postives = 261/475 (54.95%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G015750 vs. TAIR 10
Match: AT2G25630.1 (beta glucosidase 14 ) HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 3.8e-98 Identity = 190/457 (41.58%), Postives = 260/457 (56.89%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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