Lsi03G009100 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi03G009100
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr03: 16871830 .. 16877751 (+)
RNA-Seq ExpressionLsi03G009100
SyntenyLsi03G009100
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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ATGAGTGTAAACCACCACAATCAGCTGGAATGGAAGAAGAATGTTCCATTTTTTTTTCTCCCATGTTAGTTCTTTTACCAATTAAACATAGGATTTGGGAACTTTTACAAGTTGCCCTCAATCTGAAGCTTTGGAAGTGATGACCTTCTTAATCTTTGTAGGTGTTTATATGACCATCAGTTGGAACGGGTCACTAAAAACGTATTATTTGTTGATTTCTGGAATGGATCACTAAAAACTAGACTTGTTTTAAGTGATTTTGGATGGGTATGAACATGTTTTAGCTTTGATTTTAGGTATTATTTTTTATCTCGCAACTATCTTGCAACTTCTAAACTTAAAATGTTTACCTGCAAAACAATTTTATACTTGTGTTAGGTGATTTAGAGGTGATTTACATATGTTTTATCATGTTTTTAGGTATTATTTTTTATCTCTCAAAGTTGAAATGCTCAACTCGAACTCGTTTTTATAGGTGTTTTAGGTGATTTAGGGTGAGTATGAACCTTTGTTTGCTAGTTTTTTAGCTACTATTTTTTATCTCGCAGTATCTCACAACATCTTGCAACAACTTTCAAACTTGAAACGCTCAATTCAAACTCATTTTTATAGGTGTTTTAGGTGATTTAGGGTGAGTATGGACCTTTGTTTGCTAGTTTTTTAGCTATTGTTTTTTATCTCACAACATCTCGCAACATCGCTCTAGGTACATTTCATCGGTGTATGATGAGTATTTTCTCTAATTTTGTGGAAAAATGCATAGAAGTCTTTCTGGATGACTTTACAGTTTATGGGGACTCCTTTGATGAATGTTTGCACAATTTAGGGCTCCTAATGGAACGTTGCATTGAAACTATCTGGTTTTGAATTACGAGAAATGACACTTTATGACCCATCATGGCATTGTCCTAGGACATCTTGTTTATGTTTAGGGAATTGAGGTCGATAATGCCAAAATATATGTTATTGTTAACCTTCCCTACCCCACGAATGTTAGGGAAGTTTGATCTTTCCTTGGTAGTACAGGTTTCTACAGGCGCTTCATCAAGGACTTCTCCAAGATCACGTTGCCTCTATCTTCCCTTCTTCAGAAGGATGTTCCATTTGAGCTTGATGAAAATTACAAGGTTTTTAATGCTTTGAAGAGCAAGATGACGAGCGCTCCCATTCTTCAACCTCTTTGTTGGGACCTACCTTTCGAGATTATGTATAACGCCAGTAACCTGGCTGTGGAGCCGTCCTGGGACAGAAGGTCGATAAGAGAAGCCATGTATGCTTTGCATTGAGGACCTTGAATTCCACACAGATAAATTACACTACGATAGAGAAGGAACTTCTTGCCATAGTTTTTGCTTTAGATAAATTTTGTTCGTATGTTCTTGGTTCTAATATTATTATCTATATTGACCATGCTGCCCTCAAGTACTTAATGGCCAAGAAGGAATCCAAGTCACGCCTGGTGAGGTGGATTCTCCTTCTCCAAGAGTCCATCCTGACAATCAAGGATAGGAAGGGCACTAAAAACTCAATAGCTGACCATTTGAGTAGGATCGTGCAGGATGAAGACCCATTGCCCTTGAGGGAAGATTTTCCTAGGAAAACTTGGTTAATTGAGTTAGGGCTTTCCATTAATTAACCATACAATAGAATCCCAAAGCTTAAATGCATATGTTCTTAATTTTATATGACCTCTTTGAACCCAGTAGGACTTAAGACATGTAATTTAATTAGAGTCTTGGCTTTAATTACTAGTTAGGACGCTTCCTTGGTTCGTTTGTAATTAGTTGTCCGCCTTTGTAGAGGCTAGTTGAGTCGAGTGAAGAAAGTTTTTGTGCACGCATAAAATAAATACATGTCTTGTTAACATAATTCGATGATTGAAATTGCATAAGGTCCCTCTTGCTCTCGAAACTAAATAAATTCATCCTAGGTTACATTTACCATTGCACTTTATTTTCTTGCATGCTTTTATCTATTTCCACACCAAATTCCCCCTATTTAACGCTCTAATTAGATAATTAGCTTAGGGAAACATTATTTGCGCACTTCTCTGTGGATCGATCCAGACTTGCCACTTGTACTACGTCATCGTAGTATAGGTTGTAATTCGGTATTATAAATATTTGATGTGAGCAGAAAATGGGTGTCGTAAACCTCTATTCGATAATTAAATAAAATTTATAATTCACCAAACCAACTTCTTATACTACGACGGTGTAGCATAAGCCGCAAGTCCGAGGTCGAACCACAGAGAAGCTCGAATGTAGTTTCAAGCTAATTAGGATTTCTAGCTAAAGTGGTAACGAAGGGTTTTGGAATGGATTGAGAATTTAAAGCAAGAAAACTAAAGTGCAGGAATGTAAATTGCAGAAAATTAAAGTGCAAGAAAGTAAACAGGCCTAGCTTAGAGAATAGGATCCACCCAATTGTTTGATTTGATCATCAATTGGATTTCCATAAAAGAGGTCTTCAAGAATTAACGTGCTTAGCTAACTTGCCCGGATAGCCAAGGCGAGCGCCCTAATTACCAATTAATTACTTAATTAAACTAGAAGCTCAATTAACTAGGTTCGATAGCGTCCATAGAAATCTTACACCTACCCTAATTAATTCTTAATTAGACTAATTACTCAAATGTTTGGGTTCAATAGCGTCCATAACAATTAAGCAACCGCATTAAGCTCGATAGGTTCCACTAAGACGATTAGTAACTCAAGATAGCCTTAAATTACTAGTCGATTATGTTCTTGGAATATCCTAGCAATGCAGTGTTGTAAAATAGTTGTTCTAAACATCCTAAATTCACAAACAAGCATGCTTTGGACTTTGCCCTAATGAGAATCATACATATAGATGCACTCAACTCTAGCAAAGCAAAGAATACATGGAGATTGGTCAAATCAATCATATATTCTAAGCATAAATCATAAATCAAATCCAAGAACCACAGAAATTCCATGAGAAACTAGTACTACTACAAAATATATGTTACTTGACACTTGCAACTTTTAATTACTTGACATTCTTATGAAAAAAACATCAAGTAATGAGCTTTTTTAAAGAAAAAACGTCAAGAAAAAGCATAAAAAAGCGGAGATTTTACAAAATGTTTCGAATTTTTTCACGCAAACCTATTCCTGACATTTTCCTAGTGTCAAATATAATAACACTTTTTCCTAGTGTCAAATATAATAACACTTTTGTTTGACAATAAAACAATATCAAGAATAAAATTTATTTATCTATATATTATTTGACATGTTTTAAATATCAAGAAATGTCAATTAAAAAATAATAAAATATTATATTATTTTGAAAAGGGAAGAAAACAAAGCCCTAATCTCCCTAAATTGCTCTCTCTCTCGTGTCCGACTCCCAAGCGAAGCCTCCAGTGCCGTTTGCAGCAAATTTGTCCGTTCGTGGAGTAGCCAACCGTCTGTTCGTGCAGCAGCTAGCCGGTCGAAATCTCAGGTTCATTCACCTGCATTTAGTTCGTTGTCATCTGGTCGCCTCCGTCCATTCCTCGCCATCCGTTCGTCTTGAGCTACTGTTGTTCTCAATTTTCAGATTTTCCTCAATCTCACTCTACTTCTATTGAGAAACTTAGCCATGTAATTTCAAGACTTTTCAAAGCGATTTAGTCTTTTTTTTTATTCAATATCTGTTGTTTGCAATTTTCTACTTGCTTGGCTTAGCTTCTTTAATGTTTTAGGTCGAACTTTGCTTTCAGAAAAGGTTTTTTATAAAACCATAGAGAATAAAACCACAGAGGATTTTTCCTTTTGGTTTTCTTTCTTGTGGAATAAAAGTGGGTCAGAGTTCAAGATTTTTCTTCCTGCCCAAAGTTTTTTTGTTTTGATTCTGTTACACAAATTTTCTATTAGCAGTCATCAAGATCACGTTTTGATTCTTCTCCGCCAAGCTAATACTCTTGTTCTTGACCTAAGTTTATAGGCTCATCACTACTCAAGGTCAATTTTATCTACCTTTCTTCCTCTTGTTTCTGTTTGTTTTGTCATATCTAACCCACAAAGCTCTTGAAATATCTCTTAAGATTTTTAGGTTTAACTTGAATAAATGGCTTCATTTTCTTTGTGGGTTTCAGAAGTTACGAAAGATTTATCAGCAAAGAAACAAGGTTATTACCTTCAGCTCTTTTCAGTTATGTTGAGGCATTGCCAACATGAAAATATGAGTTGACAACAACTTTTCAAGTAAGTGGGAAAATTCTTGTCGTTTGAAAGATATATTGCTAGCTTTTTAGGTGATACCTTACTATATCTTTTATGGGTTTTCCATTATAAAATTCTTTTGAGTTTTTTACTATAGTTGTTTTGCTTATGCTCTTATTTTTCTTAATTTTGTAGAGTTTCTTCTGCTTCAGATATGCTTCAGGTAAGTATATCAAATAGTTATGACTTTTATTTTTTTATTTTTTCTCCTTAAAAAATGTTATTTATGGCTCCCTCATCTTAATGTTCACACTTTTTATGCATAAATTAATCAAGGGTTATTTTGAACGTGGTTTCTTTTCTAATGAAGAAGTTATGATCAACGAAAATCAATACTAAAACTGGTATGGATTTTTTTTTTGTCTTGCATTCTTCCATTCTTGCATAGGGAAGTGGAGTGGTCTATAATTTTTAACTGGACTTGCTCGATTATCTTGAAGGTGCTGCCATTGATCAAATATTGGGAGAAATAGTGCTAATGGTCATTCTATTAATTGGTAATTCCTCTCAGTTTCATAAAACAAATTGAACTACTCTACTACTGCACTAGTTCATGGTAGGAAGAACAAGAGTTTGGTACATTTCTTTTTGGATTTGTAGGTTTGTCAAGAAGCATAAGCTTTCTATCTAGGAAGAAGAAGAAGAAGCAAGAAGAAATGGAAGACCCAAATGATAAAGAATCAGAGATAATAAACATGGAAATAGCCAAATGAGGTAATTTGGTTAACTAGGTATATTTGTGTTTAATTTAAAATTGAAGTGGAAAAG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mRNA sequence

ATGAGTGATTTGGGAACTTTTACAAGTTGCCCTCAATCTGAAGCTTTGGAAGTGATGACCTTCTTAATCTTTGTAGAAAACAAAGCCCTAATCTCCCTAAATTGCTCTCTCTCTCGTGTCCGACTCCCAAGCGAAGCCTCCAGTGCCGTTTGCAGCAAATTTGTCCGTTCGTGGAGTAGCCAACCGTCTGTTCGTGCAGCAGCTAGCCGGTCGAAATCTCAGTTCGTTGTCATCTGGTCGCCTCCGTCCATTCCTCGCCATCCGTTCGTCTTGAGCTACTGTTGTTCTCAATTTTCAGATTTTCCTCAATCTCACTCTACTTCTATTGAGAAACTTAGCCATGTCGAACTTTGCTTTCAGAAAAGGTTTAACTTGAATAAATGGCTTCATTTTCTTTGTGGGTTTCAGAAGTTACGAAAGATTTATCAGCAAAGAAACAAGAGTTTCTTCTGCTTCAGATATGCTTCAGGTTTGTCAAGAAGCATAAGCTTTCTATCTAGGAAGAAGAAGAAGAAGCAAGAAGAAATGGAAGACCCAAATGATAAAGAATCAGAGATAATAAACATGGAAATAGCCAAATGAGGTGTTCTGAAACAATGACTATATGACCCTCCCAACTAGGCAACTAATTCTTGATCTTTAGACTTCAAAGCTCTAGGTATAAGATTAAGTAATGTATACTTTTTTGATAGATTACTTATTAAATAATTTTTCACTTTCTTTGTTGTGTTGCTATAATGAATAAGTTAACTTTTGTGATTATTGAAAGTTGAGTTGTGTATAAAACGACAATTGTTGATATTTTATTTTGTGCATGTACATGTGAGAAATATTATTATAATTTTGGGATTGCTCGTATGAAAGGTGATAGTTTAATA

Coding sequence (CDS)

ATGAGTGATTTGGGAACTTTTACAAGTTGCCCTCAATCTGAAGCTTTGGAAGTGATGACCTTCTTAATCTTTGTAGAAAACAAAGCCCTAATCTCCCTAAATTGCTCTCTCTCTCGTGTCCGACTCCCAAGCGAAGCCTCCAGTGCCGTTTGCAGCAAATTTGTCCGTTCGTGGAGTAGCCAACCGTCTGTTCGTGCAGCAGCTAGCCGGTCGAAATCTCAGTTCGTTGTCATCTGGTCGCCTCCGTCCATTCCTCGCCATCCGTTCGTCTTGAGCTACTGTTGTTCTCAATTTTCAGATTTTCCTCAATCTCACTCTACTTCTATTGAGAAACTTAGCCATGTCGAACTTTGCTTTCAGAAAAGGTTTAACTTGAATAAATGGCTTCATTTTCTTTGTGGGTTTCAGAAGTTACGAAAGATTTATCAGCAAAGAAACAAGAGTTTCTTCTGCTTCAGATATGCTTCAGGTTTGTCAAGAAGCATAAGCTTTCTATCTAGGAAGAAGAAGAAGAAGCAAGAAGAAATGGAAGACCCAAATGATAAAGAATCAGAGATAATAAACATGGAAATAGCCAAATGA

Protein sequence

MSDLGTFTSCPQSEALEVMTFLIFVENKALISLNCSLSRVRLPSEASSAVCSKFVRSWSSQPSVRAAASRSKSQFVVIWSPPSIPRHPFVLSYCCSQFSDFPQSHSTSIEKLSHVELCFQKRFNLNKWLHFLCGFQKLRKIYQQRNKSFFCFRYASGLSRSISFLSRKKKKKQEEMEDPNDKESEIINMEIAK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 169..193

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi03G009100.1Lsi03G009100.1mRNA