Lsi03G009040 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGCACATAAAATCTTTCCACTTAACTGAGTACTATTACTAACCAATTTCCTCTGCAGCTGACTATTTCCTTCTTCCATGGCGGCCATTTCACTAGACTCCGCGTCGGCCATTTCTCTCAGACCTACTTCTTCCGAATTCCCCTTCAAATTCCCAAGTTACTCCAAAACTTCATCTCTACCATTTTCTTCCCTTTCAAAATCCCGCTCCTATAACCATGAGATCAAGAAAGCGCCTCTCTCTGTGCAAAGCATCGCGGAAACAAGTTCCGGTCCCTCATTTTCTAGAAATAATTCTTCTACTTCAAAGATTATATCCGGGTATACACACATTATTATTATTATTTTTAATATGATATTTGTTTTCTTTTCGCAATTTTATCCAGCATGCTCTGTGTAAGGATTCGGGTTCATATTGCCAATCTAGTTGTGGTTTTCTTCTAGCATAGAGGTTAGGTTTCTTCTGCAAGTTTTAGTACCTCCTTCATCGACCAGCATGGAGAAGATTTGAGGAATTGGAGCCGGTCGTGAGTTGAAAATCATCTCCCCTTTGGACTTAGAAATGGGTGGAAAAATGCGTTTGTATGATCGTTTCATGCTAAAAGGATCACGCTTTTGGAATTTTAAGCCAAGCAGTCAAACTCTGCTATTAGATTATCTGTTAAAGTGTTTAGTTTATTAATAATGGGAAGCAGATTTCTGCTTATGTATTCCCTGATGGATGCTTGAATTTACATTAAAGAAAATGAAGAGTTACTGATCTGGACCTAAGAGTCATGTTGTGGGAGATATTCCCGATGTTCGATTCAAGGTTCTGAAGGTTTCTGGAGTAACTTTGTGAGAGGTTATTTGTGACGTCCTTATTTATAATTATTAAATTATTATTTGTTTTGAGTCCCATTACGCTCAAAGGCGAAATGACTCAACTCAACCATCTGCTGTCTACCAAATACCAGAGAAATGATAAAAGCATTGGAGCCATTCAAGTAAACTGGAGACATTAGATAGGCAAAAATTATGAAACCTAGGGAAAATTCTCCAGAATTCCGATTCAGCAAAGCTGACTTTCTTTTTTCCTTCCTAACCTCATATTAAAACTATTCAGCAATCCTATCAACGGCATTTCAGTTCCTCCCCCTGCAACGGTAATAAAATGACTGTAACAAGATGGAGCATGCAAGAATTAAAGACCAGTAATGATGTTTGGTTTATTTGTTAGATTCCCTGTTTCTCTCTAAGTCTCGGTGTCTATGATTTTTGTAATTACTCATTAAGTCTAGTTTTACTTGGTTGGAGTCTCTTCTTGTAGTTGGCTCTCTTTTTGTGGCTTTTTTTTATAAATCTTTTTTGGTAAGCTTGTGTATTCTTCCATTATTTCTCAATGAAAGTTAGGTATTATCTACAAATAACACCATCTTTTATCTTAGTAGTTTTGCAAGACCCTTAATTTAATCCAATTCAAAACACTGGCAATACATCTCACTATCTCAGTTGATTGTTCATTGTAATTACCTACTTATGATCACACTTTGAAGAAAAGTTGTACTCTGGGGTGAAGTAATATTAGGATTAACTTTATGTAGACATTATGATGAGGAGAGTTATAGGATAATTAGTATACTTTAGTAAATATTTAAATTAGTTGTTAATTTAGATAAATTACTATTTAATTGGTATTTTAGAATTACATTGTTAGTTGTCTTATTTTATTGTAAGGCTATAAATAGCCACTTTAGGGTTTGTAGTAGAAAGCTTTTGAATATTCATTTTGATATAAAACATTGTTCTTTGAGAGAGTTCTCTCTTTAGAGATGAATTTCCCTTGTTTGGCCATGGATTTGGCCTAATACCTATTCGGCTGCATCACATTAGCATTACATATCAAGCACATACCGCATTTTGTTGGATTTAATTGTTGGCCATCTGGTTTCATCTTCTGAAATTTTAATTTTATCTTTGTGGCTGTTCCATTTAGTAATTTTTATTCTTGAATGAATCATAATTGATAATCGTGTGATAGAAACAAAACTATAAAGTGTATGTACTCACTGTATCATAGATCATTTCCATCCAATCAGACTAAAATTCAAAGTTATTGTGGTTTTGATGGATGATGGATCTATCTTCTATGTTGGTTTCATGTTGTCTATTGTTGTGATCAACCAGACAATCAAAATTTGAATTTTTGAAAAACTTACACAAATTTGGTTGTGATGACATTGTTCGAATTATGTTACTGATGATGATGACATTGTTTGTAGAATTTAATCCATTGGATGGCTGTTTTGATGTAAATACTTATGTGGTGCATCCTATCATGTTCCCAGGGTGAGACGACATACAATTTCTGTGTTCGTTGGTGATGAAAGTGGAATGATTAATCGTATAGCTGGCGTTTTTGCCAGAAGAGGATATAACATCGAATCACTTGCTGTTGGCCTGAACAAGGACAAGGCTCTTTTCACTATAGTTGTCTCTGGGACTGAAAAGGTGTTAGAACAAGTTATCGAGCAGCTCCACAAGCTTGTAAATGTTCTGAAGGTTACAGTCTCATCTTTTTAGGCTTGTTTTTAATTATGGTTCCATCACATCTATTTAGCCCTTCCATTCTTGTAGGAAGTAGAAACCATATTAGGAACTGCCTCATGGATACTAATCTTCTAATCAGGTTGATGATCTCTCCAGTGTGCAACAAGTGGAACGTGAACTGATGCTTATAAAAATAAATGCTGATCCGACATATCGTGCTGAGGTAGTTTATAGGTGATTTATGTCTTCAGGATGTCCATTATCAGAATGCCTAAAGGCTAATCATTTGATTTATTTCTGCTACACTCAATTAACATTCTTTCTTGTTTTCCTTTTGTTTTGCCTTTTAGATTAAGAGGTTAGTGGACATCTTCAGAGCAAAAATTGTAGATATCTCAGATGATTGTGTAACAATTGAGGTGAGATAAGAACTCCCCCCCTTAAAAGGACTTCTGCAATTCTTTTAACTTTTGAGGTAATTGTGAGATTTGACCTTAATCTATTGCTAGGTTTACCTTGTTAAATTGCCTGGGTTTTACATGGTATGGATAATAATTAAGAAACTTAGGTGTTGCCAGACCCAAAAATTATAAAGGGAGATGATCAAGGGGTTTCTTCCCCATTTGCCCTTTTGAGAGAAGGGAAGATTTTTGTGGTAGGTTGGGGTTCATGTGACATTGTGGGGTTTGTGGAAGGACATAAACAATAGAACCTTTATAGGAGTGGAGAGGGGCCCTTGTGATATCTGATCATTCACTAGGTTCTATGTTTTTCTTTGGGTTTCGGTGATACAATCTTTTTGTAATTATCGTTAGGTCTTATTTTACTTGATTCAAGTCCCTTTCTTTAGCAGTACTTCTTTTTGTGGGATTGTTTATCTTGGATGCCCTTGTATTCTTTCATTTTTTTCTAAAGTCTGGTTCTTTGGAGTAAAAAAAAAACTTTATGTAGGAAAAAAAAACCTTTATGTAATCCTATATATTCAAGTATTGTTTTGTAGTAAGTATCTATTAATTATATCCCGATTTGCTTTTCTTTTCCCCTTTTTTGAGGCCTCGATATTTCTATTGTTTTAAGGCTATTTTTATTGTGTAGGTAACTGGGGATCCAGGGAAGATGGTTGCTTTTCAAAGAAATTTAAGCAAATTTGGAATTAGAGAAATCGCTAGAACTGGAAAGGTCAGTAACTTAATCTTAAATTTTTTAAAATATTATTCTCTCTTCCCATTTTTGTATTGTCTAGTTAAGTTTTGTTTGCCAAATATATAATTTGTCTTTGATTTTGATGTGTAAGCCCTTTTTATGTTCTTCCTCAAAAGGAAATTAGTTAAGGAGTTGCTGTTTTAAGAGTGTCCTGACATAGTTGTGCTGTTGGAGACTAAGAGAAATTCGTTTTGTCTCAAATGGATTCGAAGGATTTGGAAGAGTAGGAGGATTGATTGGGAAAGTCTTGATTCAATTGGTTCTTCGGGGAGCATTTTGATTATGTGGAATAGTAATTCTTGTATTGCTCGTGAAGTGGTTAGAGGCAATTTTCCCTCTCTATTTGCTTTTATGACTCTGGGGGCGAGGGTTTTTTTTGGGTGTCTGGAGTTGATGGTCCTCCGAGAGTTAGAGGTAGGTTGTTTTTTTGGGATGAGCTGGGGGACCTCTTCACTTACAGTGGTTCGAGATGGTGTGTGACTGGCGACTTTAATGTCATCTGGACCCCTGGGGAAAAGGCTTCAGGTGATAGGATTACTTGCTCCATGAGACGTTTCAATAGTTTCATTGATTTATTTCTCTCGTTTGATAGAGACGTAATTAGAAACTTCTTTTTTCTTTTTTGTTAAAAAAAATAGTTTCATTGATTGAAGTAAGCTCTATGATTCTCCTTTGCTAAAAGTTTACGTGGGCTAATAGTAGGGCTGCTTTGGATTGATAGATTTTTACTCTAAGAAGGTTGGATTGAAAGGTTTGGTAGCCTTAGAAAATCGAGAGGGCCAAGAGTTACGTCAGATCATTGACCTATTATTCTGACTATGGGTCCTTGGAGATGGGGCCCAAGCCGCTTTCGCTTTGAGGACCTAATGGGAAGGTTATTGTTTTATGTGGGTAACTGAAAGGGATTCTTAAGTCATGGAATAGAGATGTTTTTGGGGATGTTAAAACTAAGAAGCAAGAGATTCTTAAAAGGATTGATGAGATTGACTCAAAGGAGGTGGAAAGTCCTTTGGATCCTGCTATTAAAGTGGAAAGGGAGTCTCTGAAAGGGGAGTCTACTGAGGTGTTTGAAAAAGAGTACATTAGTTGGAGTCAAAAGCCGAAAGTTGATTGGGTGAAGGATGGGGATTGCAACACCGGCTTCTTCCAGAGGGTCTGTCACACCCCGATCTAGATCACCTCCTTTACCTAGAGAAGGATGCGATGACGACGGATGCCATACCCTTTCAATGACACTTGACGCCTCACCTTTTACTCTTTCCTTT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Match: Q9SMC2 (Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic OS=Nicotiana plumbaginifolia OX=4092 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 572.8 bits (1475), Expect = 3.8e-162 Identity = 296/369 (80.22%), Postives = 323/369 (87.53%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FFF4 (Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VAT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 570.5 bits (1469), Expect = 1.9e-161 Identity = 303/434 (69.82%), Postives = 358/434 (82.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55141 (Acetolactate synthase small subunit OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=ilvH PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 190.3 bits (482), Expect = 5.2e-47 Identity = 93/164 (56.71%), Postives = 130/164 (79.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9TLY1 (Acetolactate synthase small subunit OS=Cyanidium caldarium OX=2771 GN=ilvH PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 183.7 bits (465), Expect = 4.9e-45 Identity = 90/170 (52.94%), Postives = 131/170 (77.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BPI4 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491925 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 885.9 bits (2288), Expect = 7.4e-254 Identity = 464/495 (93.74%), Postives = 477/495 (96.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EY73 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439566 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 879.8 bits (2272), Expect = 5.3e-252 Identity = 455/488 (93.24%), Postives = 474/488 (97.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I8P8 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472463 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 865.5 bits (2235), Expect = 1.0e-247 Identity = 450/488 (92.21%), Postives = 470/488 (96.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D5Y0 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017604 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 792.0 bits (2044), Expect = 1.5e-225 Identity = 426/490 (86.94%), Postives = 447/490 (91.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BPV4 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491925 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 770.8 bits (1989), Expect = 3.5e-219 Identity = 417/495 (84.24%), Postives = 429/495 (86.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. NCBI nr
Match: XP_008450269.1 (PREDICTED: acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 885.9 bits (2288), Expect = 1.5e-253 Identity = 464/495 (93.74%), Postives = 477/495 (96.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. NCBI nr
Match: XP_038886845.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 882.9 bits (2280), Expect = 1.3e-252 Identity = 464/489 (94.89%), Postives = 478/489 (97.75%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. NCBI nr
Match: XP_022932952.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] >KAG6571736.1 Acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 879.8 bits (2272), Expect = 1.1e-251 Identity = 455/488 (93.24%), Postives = 474/488 (97.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. NCBI nr
Match: XP_004149627.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic [Cucumis sativus] >KAE8648164.1 hypothetical protein Csa_018396 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 879.4 bits (2271), Expect = 1.4e-251 Identity = 458/489 (93.66%), Postives = 473/489 (96.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. NCBI nr
Match: XP_023554791.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 872.1 bits (2252), Expect = 2.3e-249 Identity = 453/488 (92.83%), Postives = 472/488 (96.72%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. TAIR 10
Match: AT2G31810.1 (ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein ) HSP 1 Score: 624.0 bits (1608), Expect = 1.0e-178 Identity = 342/492 (69.51%), Postives = 394/492 (80.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. TAIR 10
Match: AT2G31810.2 (ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein ) HSP 1 Score: 573.5 bits (1477), Expect = 1.6e-163 Identity = 295/386 (76.42%), Postives = 333/386 (86.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. TAIR 10
Match: AT5G16290.1 (VALINE-TOLERANT 1 ) HSP 1 Score: 570.5 bits (1469), Expect = 1.3e-162 Identity = 303/434 (69.82%), Postives = 358/434 (82.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. TAIR 10
Match: AT5G16290.2 (VALINE-TOLERANT 1 ) HSP 1 Score: 570.5 bits (1469), Expect = 1.3e-162 Identity = 303/434 (69.82%), Postives = 358/434 (82.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009040 vs. TAIR 10
Match: AT2G31810.3 (ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein ) HSP 1 Score: 569.3 bits (1466), Expect = 2.9e-162 Identity = 321/492 (65.24%), Postives = 373/492 (75.81%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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