Lsi03G008680 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGGTTAAATTTTCTTGGAGGAGATGCTCATAATTTAAACTTGTTGCATTCCAGTACTGATTTTCTTATTTAAAAGTTTGACATGCGTTTTTGCTTTTTAAGCACAAACTCGAGTTTTCTTTCATTTTTTTTATTGATCATTATGTAAACTCATTAGAAAATTAAACTTCACATGCAGCTTGTATCAATAGTTTGAAGAAGAATGTTGATAAAAATTGCATTCTTTTGGACGGGCAAGTGTATGTTATTGTTGCAATCAAGGTGTTTGGAATTGAAAGATCCCCAAGAGGTAATTTCTACAACTGTTTTTTCCCTTTTCAAATACGCTTGGAGCAATATGTCTTTCATTGATGAGTTGTTAGCAAAATCATGATTTACAGTCCATTACATATTAAGCACATCATAGCTCTAGATTTGTATCATGAAAAGTTTGAAATGAAAAGATTGAATGGTATATGGTTGCTAGGCCGTTATGTACTAGTTTTGAAACTTTTATGTGATGATCTTGCATGCTATGTAGTTGATTTCACTTGAAAATGTACTAAAAATTGGACTTGGAAAAGAATCAATTAATTTGAGTTGTAGTTTGTGAGTCCTGGACTTTTCATATCATTAAAAAAAATGAGAGTTGTTGGAGTTTTGTGAGCATGGTCTATCATAGGAATTTTGGGTATCTGTGGAAACCTATAATTGTTCTCAACCCCGAACTCATTTGTGGCCCTTCATGCTTATATGGCCAATTTAACTAGTTTGGCTAAAGGGATTTGCGTTGAACTGTGTAAAGCAATTAAGAATGTTTGATGATGACTAACTCACAACTCTTTAAATTTACAACATTGTTATGAAACTACATGTACAAATGTGAAAATTATGTCAAATATGCAATCAACAATACCCTTAGACAACATATTTGTGGAAATTCTGGTTTGCTTAGAAAGTGTAATCTGAATGTTGGCTTTATTATTTGTGCTATGGTCTCAGTTATACAATTTTTAAAAGCTTTTTGGTCAATTTTGAGAGTCAAAGTGGATTTTATGAACTTTTTAGGCTGTTTTGAGCATCAAAGTGCCACTTAAACACTTTTTACACAATTCTTAGGTTGGTTTTGAGACTAAAACTGGCACTTAGGAATTACTTTGTTTTTTTTAGCGTCAAAGTGTCACTTAGACACATTTTAGAATCTTTTTACATTGGTTTCAAAGCTAAAGTGTCAGTTGCACACTCTTTAGGAACTTTTTGGTCGATTTTAAGAGTGAAAGTGACTTTTAGAAACTTGATAGGTTGTTTTGATCCTCAAAGTATCACTTAGACACTTTTTAGGATATTTTTGGTCAGTTTCAAAGCTAAAACGTCAGTTGCACACTCTTTAGGAATTTTTTGGTCGATTTTGAGAGTCAAAGTGACTTTTAAACTTGATAGGTTGTTTTGATCCTCAAAGTGTCACTTAGACAATTTTTAGGATCTTTTTAGATCAGTTTCAAAGCTAAAGTGTTAGTTGCACACTCTTTAGAAACTTTTTGGTCGATTTTGAGAGTGAAAGTGACTTTTAGAAACTTGATTGGTTGTTTTGATCCTCAAAGTGTCACTTAGACACTTTTTAGGATCTTTTTAGGTCGGTTTCAAAGCTAAAGTGTTAGTTTCACTCTTTAGGAACTTTTAGGTTGATTTTGAGAGTCAAAGTGACTTTTAAAACTTGATAGGTTATTTTTAGCGTGAAAGTGTCACTTAGACACTTTTTAGGATATTTTTTGTCGATTTCAAAGCTAAAACGTCACTTGCACACTCTTTAGGAACTTTTTGGTCGATTTTGAGAGCTAAAGTGACTTTTAGAAACTTGATAGGTTGTTTTGATTCTCAAAGTGTCACTTAGACACTTTTTAGGATCCTTTTAGGTCAGTTTCAAAGCTAAAGTGTCAGTTGCACACTTTTTAGGAACTTTTTGGTCGATTTTGAGAATCAAAGTAACTTTTAGAAACTTGATAGGTTGTTTTGATTCTCAAAGTGTCACTCAGACACTTTTTAGGATCCTTTTAGGTTGGTTTCAAAGCTAAAGTGTCAGTTGCACACTCTTTTGGAACTTTTTGGTCGATTTTGAGAGTCAAAGTGACTTTTAAAACTTGATAGGTCGTTTTGAGCGTCAAAGTGTCACTTAGACACTTTTTAGGATATTTTTTGTCAGTTTCAAAGCTAAAACGTCACTTGCGCACTCTTTAGTAACTTTTTGGTTGATTTTGAGAGTCAAAGTGACTTTTAGAAAATTGATAGGTTGTTTTGATTCTCAAAGTGTCACTTAGACACTTTTTAGGATCCTTTTAGGTCGGTTTCAAAGCTAAAGTGCCAGTTGCACACTCTTTAGGAACTTTTTGGTCCATTTTGAGAGTGAAAGTGACTTTTAGAAACTTGATGGGTTGTTTTGATCCTCAAAGTGTCACTGAGACACTTTTTAGGATTTTTTTGTCGGTTTCAAAGCAAAACGTCAATGACACACTCTTTAGGAACCTTTTGGTCGATTTTGAGAGTCAAAGTGACTTTTAGAAACTTGATAGGTTGTTTTGATTCTCAAAGTGTCACTTAAACACTTTTTAGGATCCTTTTAGGTTGGTTTCAAAGCTAAAGTGTCAGTTGCACACTCTTTAGGAACTTTTTGGTCCATTTCGAGAGTGAAAGTGACTTTTAGAAACTTGATAGGTTGTTTTGATCCTCAAAGTGTCATTTAGATACTTTTTAGGATCTTTGTAGGTCGGTTTTAAAGCTAAAGTGTTAGTTTCACTCTTTAGGAACTTTTTGGTCGATTTTGAGAGTCGAAGTGACTTTTAAAATTTGATAGGTTGTCTTGAGCGCAAAGTGTCACTTAGAAACTTTTTAGGATATTTTTTTGTCGGTTTCAAAGCAAAACGTCAGTTGCAGAATCTTTAGGAACTTTTTGGTCGATTTTGAGAGTTAAAGTGACCTTCAGAAACTTGATAGGTTATTTTGATCCTCAAAGTGTCACTTAGACACTTTTTAGGATCTTTTTAGGTCGGTTTCAAAGCTAAAGTTTCTGTTGCACACTCTTTAGAAACTTTTTGGTCGATTTGGAGTGTGAAAATGACGTTTAGAAACTTGATAGGTTGTTTTGAGGTTTATTATTTTGTTTTTCATTTTTATTCAACACCCTCCTACTTGTTTAATAATGTTTTAACATTAATTCTTGGTTGGTGATGTTACAGTTCCAGGGAACTCATTAAAAAAATTAATCCTGGCATACCCATATCAATTGTTTCCAAAAGAATGTTTGACAAAGATTGAATTCACTTGAACAGGTATGAGTATGTTAAAAATGAAATTTAATACTAGCTTGAGATGACAGTTATTTTATTAGTTGAATAGATATGAGTATGTCAAACATTAATTGGTTGTGTTTGACTTTTTAATAGAGCTACCAATGAATATTTGAGAGGATCATGGAACTTTGTCAAACAAGTTGAGAGCAAGTTGGTTGGGGTAGACAAAATTCCATGTCCATGCAAGAAATGTAGAAACATGACTCATCAAAACTTTGACGACGTTTATGAACATCTAGTTATAAATGGCATGGATCCAACTTATAAAATTTGGTACCATCATGGTGAAGAAGTAGCACCAATAGCAGGTGAAGTTGGATTACAGTATATGTTTGAAGATCAACCCTTTTGTAACAATTTTAGCCCAAACAAAGAAAAAAATGAAGAACCTTTTGTGAACACTGATGTCACTCGAAAGGTTGTTGATGCAAATACTTCGTTGTATCCACAATGTACAAAGTATACAAAAATGTCGGCCATTTTATTGTTATACAACATTAAGGCTACTAATGATTGGACCGATAAAAGTTTTACATGTCTTTTAGAGCTTTTACATGACATGCTACTGCCTGAAAATGTCATCCCAAGATCTACATATGAAGTAAAGAAGTTTCTAAAAGTATTTGATTTAGGATATGAAAAATTTTCATGCTTGTGTAAATGATTGTTGTCTATTTACGAAAGAGAACAAAGGCAAAATGAAGTATTATGGCATTCTACCAAGGTATGGTAAGCTTTATGTTATGGTATAGTATGTAAATGATTTTATTATTACCATTAACTTTCTTCCTTGTATGTTTTGTTTTTTAGGCACGATATAATGTTGATCAAGAGTGGCAGAAAAAATACTACTTGAAGAAGATGGGTGGGTTGTGGAGGGCAAGCAAGTCTCGTTTGGTAAGTCAAATTCGAAATGCTTCAAGTGATGAGTTGGCTATGCTTAAGCCAGATAATATTTCCTCAATACAGGATTGGATGGACTTTGTCAAGGAAAAAAGAAGTGCAAAATTTAAGGTATGTGATACATAGTTGTTGGGTAAAATGATAATGATTTTGTATGACTTAATGTTTGATGTCCGTCAAAAAGTTCAAACTTCACACATTTATTTGAATATTCTGTTGGGCATAATTTCTTAGGCAAAAAGTGAGAAATTTAAGGAAATGAAAAAAAGATAACTTCCTCACACTTGTAGTCGGAAAGGTTATGCTCGACTACTGGAGGATATGGTATAATTCTTCATAATAATATTGTTATGATTTAACACAATAAATAATTAATAGGCTAACTTGTCATTGCTTAACCATGTAGAAGCATAGTTCTTGTTCTTCAACTACAGTTACACGAGTAATGGTTTGGAAAAAGGCACACCTGAAGAAAGATGAACAACCCATTAACTCACAGTAGCTGAGACTCTGGTAGGTACAATTATAAAAGTTGTACATAGTGTAGCTTTATCATTATGTTTGTTATTTAGAATATGTGAATATTGGTTCCCTCCCTCCCCCCCTCCCCCCAAATGAGAAATTTGTTATTTGTTATTTTGATTATAGGATTGAGACTCTTGGTTGTTATCTCAATTGACTTTAAGTTGTGTATTGTTTAGTGTAGTTTTATCATTATATTTGTTAATTACTTAGAATATGTAAATCTTAGTCCCCTCCCCCCCTC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Match: A0A5A7UPM1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold226G00340 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 2.9e-27 Identity = 54/68 (79.41%), Postives = 60/68 (88.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G008680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KCH8 (Transpos_assoc domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G237080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 110.2 bits (274), Expect = 6.8e-21 Identity = 45/68 (66.18%), Postives = 57/68 (83.82%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G008680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SME3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold219G00130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 6.0e-17 Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 41/48 (85.42%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G008680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TD89 (Putative TNP2-like transposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold128G002560 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 6.0e-17 Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 41/48 (85.42%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G008680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C1T0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold108G00430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 6.0e-17 Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 41/48 (85.42%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G008680 vs. NCBI nr
Match: KAA0056266.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold226G00340 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 5.9e-27 Identity = 54/68 (79.41%), Postives = 60/68 (88.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G008680 vs. NCBI nr
Match: KGN47253.1 (hypothetical protein Csa_017000 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 110.2 bits (274), Expect = 1.4e-20 Identity = 45/68 (66.18%), Postives = 57/68 (83.82%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G008680 vs. NCBI nr
Match: KAA0041270.1 (putative TNP2-like transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 1.2e-16 Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 41/48 (85.42%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G008680 vs. NCBI nr
Match: KAA0032202.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold219G00130 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 1.2e-16 Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 41/48 (85.42%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G008680 vs. NCBI nr
Match: TYK05234.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold108G00430 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 1.2e-16 Identity = 39/48 (81.25%), Postives = 41/48 (85.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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