Lsi02G000500 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi02G000500
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr02: 464915 .. 470686 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi02G000500
SyntenyLsi02G000500
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGTCGGCGTGGGTATAAACTCCAACTTTGAGTTTGAGCATTCCAGGCATCATGGACTGTCATCAGAGGGTTGGTAGTCAATGCATAAAATCTGTGAGCAGATTGATATAGTTGGCTGGAGTTGGTCCGTTTTTTATGCCAAAATAAAGTGTCTCTACCATTTGCAATATTAATCCAGCTAGCATGGGCAGTAACATGGTGATGAAGTTTAGCTATATTATACCAGGGGGATTTAGAACTACTGAAGTTACTTTTGACAGCAATGGCACCCTGATGATCGGCTTTATACTTGGCATCGATAACAAACCTCCATAGATGATCTTTTTTGGTTAAGTATCTCCATATCCATTTACAAAGCAGAGCAGAGTTTGTGATTTTTATCTTGTCGATGCCCAAACCTCCCACCGATTTAGGAGTAGTAATGATATCCTAACAAACAAGGTGGGAGGCACCATTTTTTTTCAGATCCTTCCCAAAGAAAATCTCTCATAAGTTTCTCAATTTTCTTGTAGATGGAGGCAAGGGCATTAAATAATGAGAGGTAATATGTGGGAAGGTTGCTGAGAACCGCATGAAGTAATGTGAGTCGACCACCTTTGGAAATGTATGAGAATTTCCAAGAATCTATTTTCTTTTCGATCTTTTCAACCATTGGATACCAAAATGCAAGGGATTTAGGATTGTCACCTAGCGGCATACCAAGATAAGTGATAGGAAGATTTGCAGAAGGGCAGCCCCATATATTCTCAATATGTGCATTGAATTCGGCATCAGTGTTAATCCCCGTGATGGAGGACTTCTGGAAATTGATATTAAGTTTAGAGGCCTTCTCAAAAGCAGATATGATATAGCGGAGATTTCTAAGCTTATCATTATCGGCGGTCGAGAATAGTAAAATGTCATCTGCAAAAAGAAGATGGTTGAGTTCAATCTGATCATTATTAAGTCGACAACCCAAGATAAGGTCTTTATGCTTAGCAAAAAATGTATTCTCTTCATCTTTGTTTTTAATCTTATGGAAATATAATAGTTTGTTAATTATGATGAAATTGAAATGTTTTGTGCAGGGGACCAAATTTGAGATTACAGAATACGTAAGAGTAAATTAGGCAGCTGACACTAGTTTAATTTACTTTATGACGTTCAAAGCAAAGCCAAATGAAACTTCTGTAGACCACCCAACCACTACATTTCGGACTCAAATCTTTGATGGTATAAAAGATATCGAGGTTTATTTTTGTAGGGTATCACTTTCATAATATATTGTTATTAATGTTTACTTTGTCTATGGTGTTTGTTGTATTTTGTTGAACAAATTTAAAGATACTAATTCTACATCTCGTGATAGACACTATTTGAAGGAAGTATTTTGAAGATAATTCTCATGGATTTAAAATATGAGTATTTGTCTGATTATAATTTGTATGATTTATCTTGAAGGTGCTTTTTAATATCAAAATTTAAAATATGGTATTAATTCTTATGGTTTAAAAAGTTTTTTTTTGTTAAATGTTTTTTCGGTTATATTATACTCATTGCATGATATACTTACCTCAGAAAAGAAATGAAATTATGTGTTTTTTTTTTATTAATTATATACTTTTATTTGCAAATGATGAGTATAAGAATATTTAGTTTTAAAGAAAAATATTATATTTTCATATAATATTTTTGTAGCTAGATAATTCAATGGTATTTTTTTTTTAACAATATACATGAGGAGATCGGGAGATTAGTAAATGCACCTAAATATCTCAATTAGGTTGACACATCCTTAACACCCTCATCATATCTCAAAATTAAACCACATCAAGAAATTACAAGAATTGAGTAGGTGCCTAATGCCAAGAGGAGAGGCTAGTAGAAAGTCTTCTAATTAAAGGCAACGGGTGTTTCTCTCCAGCCACATACACCATAAAATAGCACTAATGATATTAGATATTAAGATATTTTTGGTGAGACAAAATATTGTTTTTAAAAGTGTAAAATTATATATTAAATTAATTTCGAGTGATTAAAGACACATTTATTTTACATTTGACAAAATTAATTTTAACAATTCAAAATCACTCCTAAACATATACTAAATTCAACCGTTATTTGATTTTATTTTCAAATGTGCTAAGTTTATTCTTGAAATAACCAACTCCTTAAAAGTTTTTTTCCTTAAAAAATAGTTAGACAAGATTTTATATTGTATACAATTTAATTTGCTTAAGTAATTTGATGTGGCAGTTTATTCTTTCCTTACTAAAAAAAAATAATAAAATAAATAACCCTCAATGATTTCTGCACACTGGCTGTACGAAAGCGATCAATTAGGGCTTTTTCCCCAAATTTGTGAAGAGGTAGAATTCAAATACCTTTTTCTTCTCTTCTGCGGCTGAATTCAAGTTTGATCCAATTTTCTCCTCTAACTTCGATCAGATCACATTCGCAGGTAATCTCCTTTCAGATTTCGGTTTTCAATCGCTTGTCTCCAAATTTTCTTTACTATTTATTTGCTTTTTACTCGAATCGCTTCTACACTCTTTCCTTACCTCTTATGTTTTACATTACATTCCTAAGTAAATCTATTATTATATTTGGCTGTCAGTACATAGTTTGTAATTTTTATTTTTCTTTGGATGACTCCCTGTTGGTTCTGATTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTACTGGTTCAGGTTTTTTTTGTTCTTTTTCTTTTCCAGTTTTCAGAATTTGCCAATGAAACACTCTGTATACACAAAGTCAAGAATCCTGTTCTTTATTTTCTTGTCTATACCCTTTTGATCCCTTAACTCAATTGCCGTACTTTTCTTATTATGTTACTTTCCTTTGATTGCTCTGTTAACCGAACCGTGAACACCCCTAGTAATGAGTGACACATGGGGTTCAAGAGCAGATGCATTAGTGTGAACAAAACAAAAATATCAATGTCTTGACTAATTTTGCCTTTACCTTTTTCTCTCCACTCTTGAATTTTTCACCGTTTAGTACTTTTGACCCATAGAATCAAACCCCATATCCAAAACAACTCAAAATTTATGCAATAGATCTTTTACATTTGTCAACAAACAAAATAAATGGAATTATTAAATTATGATAACATACACTTAATTTGTAGATCAATGTTATTGGTTGTCGTCGAACATACAATTTAAACTGTTATTAGCTTCTTTTATTCTTAGATACTTCTAAATTTTAAACCAAAACAGTAGAAATAAAGTTAATTATTAGTTGGTACAAATAATATAAATAATTATATATTTTGTCAAATGGACTTACTTTCACACCTTTGCACTCCCTTAGTGCTGAATAGAAAATCAGATTCTATTACAATCTCATTTCTAATGATCCAATTATATGTATTCGACATAGATAAAGTTTATCGAAGTTATCTCTTTCATATCATATATGTTGGGTGATATAATACAATTTATTAAGCATTGAGTTGCTAACTGTAGCATATGGATGATTGGTTGCATAGTTAATCTTAATATTGTATAGGGACTCAACCACTTTTGTAGCTACAATGGCCCAACAACACCCTATGCTACTAGCTGTAGGTTGTTGACGGCTGCTGATAATTGTCATTGGCTGCATGTTGTGGACGATTGCTGGTAGCTGCTAATGACTACAAGTTGTTGACCTTTGTGTCCCGTTGTTGCAGCCTCGTGTGTCAACCACTTCTTAATTGGTTATGATTATTATGGTGTTAGATTTGTCATTTTTAAGATAGAATAAGTAGTAATGAGAAGATGAAGTGAGAGCAAGAAAAATAAGTAGAGAAAAAGTTAAATGTTGTGGCGCTAATTGTACAGCTTCATCATTATTAGCTGCATCTTTCATTATAATATTGTACAGTGATTCAATCACTCGAGTAGCGAGGATAGCCCAACAACATTTTATTAAAATACATACATTAGCATATTTATATACAAAAAAGATTAGTAAACAAACAATACTTTTTTAATATAAAAAATTATTTACTAGAATATAATAGTTAGTTATGATGAAATTGAAATGTTTTGTGGGTATATGCATGAGATCAAATTTAAGATTATAGAATATGTAAGAGTGAATTGTTCCATTGTCGCTGGTTTACTTTACTATATGACGTTCAAGTCAAGGCCAAATAGAACTTTTGTTGACCATTCAACCACCACATTTCGAACTCTAATCTTTGATAGCAAGAAGATACCGAGGTTATTTTTGTAGGGTATCATTTTTTAAATTTGACCCTTAATAATGAAGCTGATTTTCATAATATATTGACCGTTAATGTTTACTTTATGAATCTACCTCTGTAGCGAGAATTATATTTCAAGTCAATAGTGTTTATGGTACATTGTTGAACAAATTTAAAAATATTAATTATATATATTCGTATTAGGTCTTGATAGACACTATGAATCATTATTTTTTTTTATTACCAACAAATTGTGATCGATAGATTTTAATATTTGTGTTTTTTCATATTAAATGTTAAACATAATGGTTTTAATTTTGATGGTTTAAAAAGTCTTTTTTTTAATATTTTTCAGTTATATTATATTTATCGTTAATTTTAAAATTTATCCATGATATACTTAAGTTCTAAAATGAGTTGAGAGGGGAAAAAAAATGAAATTATGTATTTTTTTTCTTATTAATTATACACATCTACTTTTAGGTTAATACTGCATGACATATATTTCTATTTGGGAATGTTAAGGGTAAAGATATTTAATTTTAAATAAAAAAAATATTATATTGTCATATAATATTTTTATATTACTTTTGAAGCTAGAAAATTTTAGAATTTATTACTTTTTAATGTTTGTCACACACCTGACTAATATGGAAAATGAAAATACTAGAATTAGACAATTCATTGAACGATAACAAGTTCACATGCATTTGTGATCGGCGGAGAATATAAACAATGTCTTGACTAATTTTGTTGCACCCCTTTTTGTCCCCAGCCCTAGTGAATTTTTCATTTTTGGCCCATAAGATCAA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mRNA sequence

ATGGTCGGCGGGACCAAATTTGAGATTACAGAATACGCAGCTGACACTAGTTTAATTTACTTTATGACGTTCAAAGCAAAGCCAAATGAAACTTCTGTAGACCACCCAACCACTACATTTCGGACTCAAATCTTTGATGGTATAAAAGATATCGAGAATTCAAATACCTTTTTCTTCTCTTCTGCGGCTGAATTCAAGTTTGATCCAATTTTCTCCTCTAACTTCGATCAGATCACATTCGCAGAATTTGCCAATGAAACACTCTGTATACACAAAGTCAAGAATCCTGGACTCAACCACTTTTGTAGCTACAATGGCCCAACAACACCCTATGCTACTAGCTGTAGGTTGTTGACGGCTGCTGATAATTGTCATTGGCTGCATAATATAATAGTTAGTTATGATGAAATTGAAATGTTTTGTGGGTATATGCATGAGATCAAATTTAAGATTATAGAATATGTAAGAGTGAATTGTTCCATTGTCGCTGGTTTACTTTACTATATGACGTTCAAGTCAAGGCCAAATAGAACTTTTGTTGACCATTCAACCACCACATTTCGAACTCTAATCTTTGATAGCAAGAAGATACCGAGACAAAAAGGTTTAAAGAAAGCCCACCACTTGAACAACATTAATCTTATTTTAATATCCAACACCAACATTCTGTCAAAACAATCATCCCATCCTAAACCATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTCGGCGGGACCAAATTTGAGATTACAGAATACGCAGCTGACACTAGTTTAATTTACTTTATGACGTTCAAAGCAAAGCCAAATGAAACTTCTGTAGACCACCCAACCACTACATTTCGGACTCAAATCTTTGATGGTATAAAAGATATCGAGAATTCAAATACCTTTTTCTTCTCTTCTGCGGCTGAATTCAAGTTTGATCCAATTTTCTCCTCTAACTTCGATCAGATCACATTCGCAGAATTTGCCAATGAAACACTCTGTATACACAAAGTCAAGAATCCTGGACTCAACCACTTTTGTAGCTACAATGGCCCAACAACACCCTATGCTACTAGCTGTAGGTTGTTGACGGCTGCTGATAATTGTCATTGGCTGCATAATATAATAGTTAGTTATGATGAAATTGAAATGTTTTGTGGGTATATGCATGAGATCAAATTTAAGATTATAGAATATGTAAGAGTGAATTGTTCCATTGTCGCTGGTTTACTTTACTATATGACGTTCAAGTCAAGGCCAAATAGAACTTTTGTTGACCATTCAACCACCACATTTCGAACTCTAATCTTTGATAGCAAGAAGATACCGAGACAAAAAGGTTTAAAGAAAGCCCACCACTTGAACAACATTAATCTTATTTTAATATCCAACACCAACATTCTGTCAAAACAATCATCCCATCCTAAACCATAA

Protein sequence

MVGGTKFEITEYAADTSLIYFMTFKAKPNETSVDHPTTTFRTQIFDGIKDIENSNTFFFSSAAEFKFDPIFSSNFDQITFAEFANETLCIHKVKNPGLNHFCSYNGPTTPYATSCRLLTAADNCHWLHNIIVSYDEIEMFCGYMHEIKFKIIEYVRVNCSIVAGLLYYMTFKSRPNRTFVDHSTTTFRTLIFDSKKIPRQKGLKKAHHLNNINLILISNTNILSKQSSHPKP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi02G000500.1Lsi02G000500.1mRNA