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Lsi01G019190 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGAGTATCTGATTGATTCCTAGGAGTAACTTTGACGATGTAGGTGTGAGATTATTATATTTATGTGTATTGCTTATATTAAGTTGCTAAATATCACAATTTTTTTATTTACAAAATGGATAACATTAATCTCATATTCCATTTCAATGGTCAGCTTGTTGTAACTGATAATTATCAATATGTTGGAGGGACTGAGATTACTAAGGTTGATGGAGGGACTGAGATTACTAAGGTTGTTGATAAGGACATGTTATCTATCATTGAGTTAAATGCATTAATGTCAAAAGTAAATGTATTTAATATTGAATGTTATTGGTATTTGAAGCCTGATTTCGAACTACATCGCGATTTATGTTTAATCAGTCACGATGGTGATATTTTAAGTATGGTAAGTCTCATTCGTGGGGATAACACTTGGCACACATATGTTCAACATAACACAGCTAAAGATGTAATGCATTTAGATTGGAATGTCACTCATACATCTAGTCATGACTCTCTTGAGTTTGGAAAGAATGATTTAATTTCTGATAGGTCAATTGACTCATCTATTGATATGGATTTATTATTGGGTTTAAATCTTGGAGATTGTGAATCTGCTTATGCGTCATCTTCTAATTTAAAGTCTCCATGTTTATTTGATGAAGATAAAGAGGTGTGTAACTATCTAGAATTTAGATATCCGAAGGATATGGAGGATGTTACATTTCAAGTTACATTTCAAGTAGGAATGAAATTTAGCACTAAGGAGGTGTTAAAGGAAGCTATAAAGGAATATGCTGTGAAAGGCGCGTATAATGTGAAAATGGTGAAGAATGATAAAAGGCGAGTTAGGGTTATTTGTACTGGTGGATGTAAATGAAAATTACATGCCTGTGTTATTTCTGATGACTCAACGTTTGAAGTAAAAACATATTTTAATCATCACACTTGTTGTCGAGAGTTCCACAATAGAAATGTGAACTCTTCATGGGTGGCAATGAAATACTTAGAAAGATTTAGGTTTGATCTTAATATGAAGCTAAGTGATGTTCTAGAATTGGTTAAAGCATACTACAAAGTAAGTATTTCAGACAATCAAGCATATAGAGCTAGGAGGAAAGCAAACAAAAAATTAAATGGCTCACTAGTCCAACAATATAAAAAGGTTGAGAGACTATTGTGAAGAACTTATCCGATCGAATGAGGGGAGTACAGTTAAGATTGAGTGTCATAAAATTGATGTGCTCTATTCAAGCGGCTATATATGTGTTTCAAGGTGTGCAAAGATGGATTTGCTCATTATAGACCTTTTATATGTTTGGATGCATGCCATTTAAAGGGGACATGTCAAGGACAACTTATGTCTGTTGTAGGCGTGGATGGGAATGATTCAATTTATCCAATTGCATGGGCAGTTGTAGAAACTAAGACAAAAGATAGTTGGACTTGATTCCTTCAACTACTAGAGAGTGATATTGGCTCGTTCGTGACTAAAGGAATCACTTTCATGTTTGATCAACAAAAGATACAATATCATTTTCAAAATATTAAAAGTTTGAAAACATGATATGTGCTACTTTTTGTTTTTGTTTGATTTTATGTTGTTCTTTTACCATTTTAACCTTAGCCATTTAAATCTTCCATTTCCATTGAACTTGATTTCAACATCCTCATAATGCAAACAAAGAATTATTTCTGTTTAATGAATAACTTAAATCACTTCCCCATTTCTCGATTTCAAGGAACGACACTATACAAGAAATGGCAACAAATTGGAAGTTCAATTAAGAACTTGACTGTGTTGATTCTGCCATTCAATTTCCATGGAGAGATTATGCTCACAAATGTAGCTTTCAATTTGCCATTAGTTCTTGAGATTTTAACGAAAGTCGTGCAAGCAAAGATGAGCACGACAAAAATCATTACAAACAAGAGCAATCACAAACACGACGACACCCATAAAAACAGAAAATTAGAACTAAAATTGTTTAGTATGAGATCTGAATGCACAAAACCCTAACACCTAGCTGTCGAAATCAATGGAGATTGCATCATTCTTTATAATTTACACATCATTAAGTACAACTAACGCCTATGTCAGCTGATAACAGTCTAGTAAATATTTCGTTAACTTAAAGTTAATTCAGGGACCATTCAGAAGCATTTAGCAAACGTGGGGACCAAAGTGTCTCTAATGAAACTTCAGGGACCAAATAGACATCAACTCAAACTTAAGGGATCAAAAGTGCATTTTGTCCAATTCTCTAAATAAAATTCAATTTGATTCAAATGAATTTTCATATATTCCAATTTGGAGTTTTTAAAAACATTTCAATTTCAACTTTAATTGAAAATTTTCATGAATGATTTTAAACTTGATTTTAATCCAAAATTTTCTGCTGAATTTCAATTTCATTCAAATTTGAATGTTCTAAATAAAATTTCAATTTAGTTTTCACCTTGATTTACAAAATGAATTTCAATCTTCCTTTGAAGGGCTTACACCACTTGTAAAGATTGATTCATATTTTGCTTCTAAAATGTGATTTGATCCACATGAAACATTTTTCTATAAACATCATGTTAATCCAATGACGGAGTTGAGATTGTTAAATGTCTCAATTCTTGGGGTAAACACTTTTGCTAATTAGAGAATTCAAACTCAAACATGTTAATAAGTTAACGGACGTTTGTCGACTCACAAAATGTTGACTCTATTTTATTCTTATAAAGTAAGAGTAAGATTTAGTGGGACATTGTTCAAATTAAATTTTGACATTTAGCTGCTAATTAATTGTTCATCTTTTAAATAACATTTCTAAAAATAAACAAGGTTTGAGAATGAATTTTAAATAAAATTGACTATGCAATAAGTCATGTCCAAGTTGAGATACTTAAGTTGACCGTAAGGTAACATCTTTACTTAGAAATGTTCAATTAGTCATATTTTATTTAATTTCAGTTTTAATAAATAATCTTTTGTTTTCTTCAAGTAAAAACCATCTTTAATAAAATAAACTGGATAATAAAATAAAACGTTTTCAAACGAGTGTTGTAGGGTGCTAATACCTTCCCTACACTCAACGACCCCCCGAACCTATTTTTGAAAAGTAGACCGTTTTTCATTTTATTTTTAAATGGGTGACCAATTACACCCATAATGATTGGCGACGACTCCAAATCTTTCATCTCGAAAGTGACTCTTAGAAAAGGACGTCGGCGTTGGCCGCTCCTCGTCGCGATGACATTGCGACACAACCAAATAATTTAAGATAATTATATTAAAATTACCTTAAATTTGGGATGTCACAAAAGTATACAACGATTTAGTCTCTATACCATTAAAAAACCTCATCAAAGTAAAGTATCAAATATTAAGCATCTATTCCTTAGTCATTGTTGGATATTTAAAATGTTGCGAAAGATTTAAATCTCTATCCTTACAATTTTGTACAAAATTTTCTTATTAGATATTGAAGATAACTGTTCTAGATCCCAATTTTTACGTTCAATTATAGTACACTACAACTTTCAAAAGAATAAAGTTATTTGAAGTATTTTTTATAATTTAGTCTAAGTTTAATATAACATGAATATTGCCTGAAAAAGATATATAAGATTAAAAATATATATATATATATATATGAGATAGGCAGGATGTTCGGCGCTGACAAACAGTTGGAATGTAAAAAAGAAAAAGACACAGTAAATAAAAGAACAGAAACAGTAAAAAGGAAAGAAACGGCCGGCAGTGTTCAGCTTTTGTGAACGCTGACTTTTGGTTGTGATTTTACTGCGGGCATTAAAAGGTTAAAAAGTTAAAACCTGCAGTTCCCCGGCGAAGATCTAGGTAAAATTGTAGGCTGTCTTGGGTCAAGATTCTTTCATTTATTTTCTGGCCTATTGAAGAAACTCATCTCATCTCTCATTAATTTAATGCATTCATTGCAAACTTTCCATTATTTATTATTATTATTATTATTATTTGAAAAAAAACTTACGTCTTTAAGTTCTCAAATGTGTGTAATAGATTGTTTAAAAATCCGTCTTTTCCTTTTTAATTTGATGTCCATGAGGTATTGTTGAGAGAAATTTTCATAGATAGAAAAATATCAAACTATTTTCTAAAAATAGCAAAATAAATACGGATATACATTGATAGACTTCTATCAGCATTTATCAATAATAGATCCTAATAGACTTTTATCAACATCTATCGCAACTATCTAAAAATTTTGCTATTTTGCGTTATATAGTTTTCCTTATTTTTCTATTTTTAAAAATTTCCCTTTTGTTTAACAATAAATTTTTAAAAAAATTTATAGACCTATCAAATACAAAATAGAAAGTTTCACATCTTATTAATAGAAATGTATAAAATACTTTTATTAGGGTTTAAAAACGATAACTTTTATCAAGAATTTAACCATCTAAATGAAGATTCTTTGTGAGAATTAATCATTTAATCATTTTATTTTTTTGCAAAAAAAAAAAAGAAACACTAAACAAAGAACGATTTTTTTTTGTGGGGAACTTAAACACCACAGATTCCTGCCGACTAGTTAATTGCTTATGTGAAGTCATAATAAGAAGGCTTTTTATCCATTGAAATTTGTTGAGTTAGAGTAATTTCGGATTAATTTTAGGAATTTAAGAGCATGTTTGAGAGTGATTTTAAAATGGCTAGAATCACTTTTGTCATTTTCAAAATCACTGTAAAATATGTTTTTAATCCTTCATAACTAATTTTGATGATGGAAAATTATATTTAAAAGTGTAAAATTGAAAATTAAATTAATTTTGAGTGATTAAAGTGTGTTTTTAAATGATTTTAGAAATGACAAAAATGATTTTAACGATTTTAAAATCACTTCCAATCATGCCCTAAATCAATTTCAAAATTACCTTTTAAAATTGGCAAGCAAATAGCAATAGATAGGGAAAATTGCATATTTCAATATCTTGTAGGCGATACTCAACCTTGGCCATTACATTTATTACTCGACGCAT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BLAST of Lsi01G019190 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P31239 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase OS=Pisum sativum OX=3888 GN=ACO PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 1.4e-11 Identity = 36/45 (80.00%), Postives = 37/45 (82.22%), Query Frame = 0
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Match: D0V4H6 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491357 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 3.7e-10 Identity = 35/36 (97.22%), Postives = 35/36 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C3Q0 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1465G00060 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 3.7e-10 Identity = 35/36 (97.22%), Postives = 35/36 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A097BU17 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1 OS=Citrullus lanatus OX=3654 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 3.7e-10 Identity = 35/36 (97.22%), Postives = 35/36 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. ExPASy TrEMBL
Match: C8KIS1 (ACC oxidase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=CM-ACO1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 3.7e-10 Identity = 35/36 (97.22%), Postives = 35/36 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A103Y3Y7 (Non-heme dioxygenase N-terminal domain-containing protein OS=Cynara cardunculus var. scolymus OX=59895 GN=Ccrd_019667 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 72.8 bits (177), Expect = 1.1e-09 Identity = 37/45 (82.22%), Postives = 38/45 (84.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. NCBI nr
Match: BAI39989.1 (ACC oxidase [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 7.6e-10 Identity = 35/36 (97.22%), Postives = 35/36 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. NCBI nr
Match: XP_038887306.1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 7.6e-10 Identity = 35/36 (97.22%), Postives = 35/36 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. NCBI nr
Match: KAA0061654.1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK05852.1 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 7.6e-10 Identity = 35/36 (97.22%), Postives = 35/36 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. NCBI nr
Match: NP_001284392.1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1 [Cucumis melo] >Q04644.1 RecName: Full=1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1; Short=ACC oxidase 1; AltName: Full=Ethylene-forming enzyme; Short=EFE; AltName: Full=PMEL1 [Cucumis melo] >ACY08855.1 ACC oxidase [Cucumis melo] >CAA49553.1 enzyme-forming ethylene [Cucumis melo] >CAA64797.1 ACC oxidase [Cucumis melo] >BAA06526.1 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 7.6e-10 Identity = 35/36 (97.22%), Postives = 35/36 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. NCBI nr
Match: AIS71925.1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1 [Citrullus lanatus]) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 7.6e-10 Identity = 35/36 (97.22%), Postives = 35/36 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. TAIR 10
Match: AT1G05010.1 (ethylene-forming enzyme ) HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 5.6e-11 Identity = 29/36 (80.56%), Postives = 32/36 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. TAIR 10
Match: AT1G62380.1 (ACC oxidase 2 ) HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 5.6e-11 Identity = 28/36 (77.78%), Postives = 33/36 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. TAIR 10
Match: AT1G12010.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 1.1e-09 Identity = 27/35 (77.14%), Postives = 31/35 (88.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019190 vs. TAIR 10
Match: AT1G77330.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 40.8 bits (94), Expect = 8.7e-04 Identity = 22/88 (25.00%), Postives = 47/88 (53.41%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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