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Lsi01G019100 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTTAAGGGCGGGGGTTCCGTTATAAATTAAATATAGTATACCCAACCCGAATCAGCATATTTTTTTGTTTTACGCCCCGTAATTCTTCCTCAGCCAGGCTCGGGCAGAATAGCAGAGCAAGTACAAGTATTAGTAGAATAGCAAAAATGTGTTCCTCGTCATTAATATGTTTGCTCGCGGTAATTGTGACCTCTCGGGAGAATCGATGACTGCATCAAAGATGCACTTGCTAGTACTAGTACATCTGAGAATTCTTAATTGGCTAGTTGTAAATAGACCCAGACTGTGGAACAAAGGATTATCCCGGACCTACACCGAGGTATTGACGGTGATTCTCAAATATCGCAGAACAGAATTTGATACGATGAGATAGAATGCAATAGAAACAAAGACACAGGGAACGGGTTACCTACTCTTAACGGTCAAAGCGAACCCTTTCATTCCGAATTCTTTAATTCGGAATGAATCAAATCTCCCCAAGTAGGATTCGAACCTACGACCAATCGGTTAACAGCCGACCGCTCTACCACTGAGCTACTGAGGAACAACGGTAAATTAGGTCTCAGAGAATTCAATTCCCGTTCTCAACCCATGACCAATATGAGCTCGAGGTTTCCTTCGTAACTCCCGGAACTTCTTCGTAGTGGCTCCGTTCCATGCCTCATTTCATAGAGAACCTCAAAGTGGCTCTATTTCATTATATTCCATCCATATGCCAATTCCATTCATTTAATATCCCTGTGGTGTCATTGAGATAAGAGATGTCGTTTCTAGTCTATCTGTTTCTATTTCTATATATATGGAAAGTTAAAAAATCATCATATAATAATCCACAAATTGCAATAGAAAAGAAAAAGGGAGGTTTGTGATGATTTTAAAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCTTATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACCAGAAACTCAATGCGTAATCTTAGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGTCAGATTAGTCAACATTTCTATGTTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTGGTCACATTTTATTCATGAAATGGGTTGGATTGATATTAGTCTGGATACAGCAAAATAATTCTATTAGATCTAATGTACTTATTAGATCTAATAAGTACCTTGTGTCAGAATTGAGAAATTCTATGGCTCGAATCTTTAGTATTCTCTTATTTATTACCTGTGTCTACTATTTAGGCAGAATACCGTCACCCATTGTTACTAAGAAACTGAAAGAAACCTCAGAAACGGAGGAAAGGGGGGAAAGCGAGGAAGAAACAGATGTAGAAATAGAAACCACTTCAGAAGTGACGCAGACCACTCTGTTTTATTAATTTTTTTTCTTTTTTTAATTTATTGTTAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTAATGTTTTGATTTTGATTTGTTTATATATTTCATATTTCCTTTTAGCAATTTCTCATTATATTCTTAATAATTTTCTTTTAAATATAATATTTAATTATTTTATTTATCAAACTTCTCCCTTTGCTCTAATTTTTAATATGGTTATGTTTATGTTATAAAGTATACATTGTTAATACCCTTAAATCTTCACCTTTATTTTCTAAATGAACCGACGATGGAATTTAAAAAATTTGGGAGTACGATTTTCTGAAATTCTTGAGGTGAGGAGTCGATTCTTTGGGAGTCCGAGATCGATCTCCAATACATTTTATTAAAATTTTAATATTTACTTAGTTCATCGTTATGTTATGTTTTGATTTCTATTTGAAATTTATCCAACTTTTTATTTAAATCCTTTTTATAACTCTTCTTAACTCATTTAAGCTTTTCTTACAACTTTTTTTTCTAGCCTTTTAAAAAGAAATTAATCTATTATTTCATAAAGTTTTCCTAATAAATTTTTTTTAATAACCTACCGTTTTCTTAAAAAAAATTCCACGATGGAATCTAGAAATATCTGGGAGTCCGAGATATTGATCCTAAGAAAAAATGAATTTAATTAATGTTTTTTTAAATTTTATTAAAAGACTATTCCTACGATGGATTTTGAGAAATTGAAATAATTTCTCACATTCTTGACGTGATGAATTTTTCCTCAAATTTTAATATAGTCAAATTGATGGAAATTTTTCCACTTATTTTATGGGATCATTACCTCAATATTGGAGTAATGAGTGATAAATTAAGACATTTGTTTTAAAAAAATTTCTTCCCAAATGATTTTATTTAAAGAATAATTTTTAAATCAAGATTTAAAATTTGGCCACCGTTTTTCTAAACGGGTGTTGTGGGGTGCTAACACCTTCCCCATGCACAAACGACTCCCGAACCCAACTTTTTTTTTCGCAGACCATTTTTATTGATTTTCATTAAAAATTATTTACTTTATTTTCGGTGTCCAATCACACCGTAAAAAGATTGGTGGCGACTCCTTTTATTTTCTTTTTGTTAAGTTAACCCTTTTGAGGACATCGGCCGCTCCGCATCGTCTCGAGCACGTGGCGAAAATAACTTATCGTCTTCTTTAAGATGGATAACTCATGAACCTTGTCCAAATGTGGCCACATATTGTGGTTACGTGGTTAATGGTTGTCACTATCACACAAAAAAGTGCAATGATATTAGGAGGGTTCAAAACAGTGGAGTTAGTATAACAACTACTACAATGCAAGTCTCTAGTGCTAAAGACAAATGTCTTGTCATGTTAGATATGACCTTTTATGGCATAGTGCAATAAATATGAGAACTTGATTATGATGGTTTATCTTTTATTTTATTCAAATGTGATTGGGTTGAGAATAGAAATGGAGTCAAAATAGATGAGTTTGGATTTACTATTGTGGATCTCAATTGTATTGGACATAAATCAGACTCATTTATTTTAGCCACTCAAGCAAATCACGTTTTCTATGTAAAAGATCTTGCAAATCCTAGTTGGTCGGTGGTCTTAACATCTCCACAAACAACAATTGAAGATGAAGTGGGAGATATGCTTCAAGAGTGTGATTACGGGGTCATGCAAAGAATGCCAAATTTTGATACATCTAACGAGATTGATGATACAACATCCACATATGTTAGAAATGATTGTAAGGGTAGATGAGAAGATAAATAGTGTATTAAATATGGTATGTCATTTAGTGTATTGCATATTATATGTTTTATGTTTATATATATATATTGCAGATTCATACATGGAGAATTCAAGTAGCAATGAAGATTAGAGAAATATGATCCTAGAACAAAGTAGAAGAAGATTCTTTCCACGAGACCCAACTACTATGTATGAGTTGGCACTGGTAAGAAATTATGGGCAACGATTGCCCATTTCCTATAACCAGCATGGCCAACCCATTAGTCCCATTTCACAGAAAATGCTGAGCTACATTGGAGTTTGTGTTCAACAACAAATTCCATTGGCCTATGATTCTTGGAAAAAAGTTCCAAATGAGCTTAAAGATAAAATATTTTATTGTATAGCAGTATTGGTTTTATAATTTTAATTTCATGTGCTCATGTAGTTTATTAGTTTATGTTTACTACTTTATTGTGCGGATCTTGTTTGATCTGCACCGTAGGTCCAAACATGGTATTCTTATGTCCGCATGAAGAAAATTTTAAACTTTTAAGACCACGTTAACTTAGAAGTACATACTTCCATTTAAAGATGAACCATCGCTCCTGCAAACTCCTCCCACAAAGTATTCTCATATAGATCAAGAACAGTGGATGTCATTTGTTAATAGTAGGTTAAGGGAAGAGTGGGAGGTAACTATTTCTACTTAAATGTGTAATAGTCGATAGTTGTTTTGGTAGGTAACTCCAACTAATATGTTGTACTGGAATTTAATCATATTTAGAGAGAAAGAAGATCAAAATGTGTGTATAATCATCACATGTCTCGTAAGGGATATGTGAATCTCGCACATGGATTAGTAAGTTATGCAAGTTAAATTAAATGTATTATTCTATTATGTTTATGTTAATTAAATATATATGTTCATATAGGACCTATCGAATGATCCTTCCCATCGTTCGACTTTATGGAAGGCAGAACGAAAGGAAAAATTAATGAATATTTTAATGATGCCACTAGAGAATGCACTAATCAAATTGTAAGTTTATATTGTGCAAAACCTATAATAGGATATATAATTTATGATGACTTCACAAGAGCAAAACTTGTAATTTTTTGACAAGATGAGCTAGCTATCGTACATGAAGATGAAGATGTTTTAACTGAAGCATTGGGGATTGCAGAACATGGTGGACGTGTAAGGGGAGTGGGTGATTTTGTTTCACAATCCCAATATTTTAAGATAGCAAAAGGAAAGCCGAAAATGAGTCAAGCAACTCAAGGAGCATCTTGCAAAGAAGAGAATGTTGGAAGTGTCAAAGTAGTAGAAGACATAACTCAAAAACAATCTCAGCAAATTTCATTGTCTGTTGGAAGTGTCTCACTAAGTGCGTCTGAAAAAAGTTTGGAGGATGTTGTCAAGACGCCTGAAAAAAGTTTGGAGGTAATTGTATTTGTTGTGACTTCGGAATTTTTGCCATATTGCTTAACTTTGAATCACATTTATTTTTTAAAATTGGTCAAGGAAACACCATGCTACTTGGCTA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ATGGGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCTTATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACCAGAAACTCAATGCGTAATCTTAGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGTCAGATTAGTCAACATTTCTATGTTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTGGTCACATTTTATTCATGAAATGGGTTGGATTGATATTAGTCTGGATACAGCAAAATAATTCTATTAGATCTAATGTACTTATTAGATCTAATAAGTACCTTGTGTCAGAATTGAGAAATTCTATGGCTCGAATCTTTAGTATTCTCTTATTTATTACCTGTGTCTACTATTTAGGCAGAATACCGTCACCCATTGTTACTAAGAAACTGAAAGAAACCTCAGAAACGGAGGAAAGGGGGGAAAGCGAGGAAGAAACAGATTTTTTGGAGGGGCAGGTGGTCCCAAATGGGAAATATAGAACTGTTGATATGATCTCCTCCACTTCCCGGAGCAACCATCATTCCACCACCACTACCTCCGCCTTTGCTCCCACCTCCTCCGCCACTACTTTTGCCACCTCCACTTCCACCGCCACCTCCTCCGCCTCTATTACCACCTCCACCTCCTCCACCACCCTTTCCACCGCCGCCAGCCATCAGTTACGAAAATTTAAAGATCAAGGCTTTCTGATTTATGAAGAAGAAAATAATATAAGGGTATTATTGGAGTATGAAGGAAAATTAATACAAGATGAGACTATTATTTATATGCAACAAAAGATTTCTACTTTCGTGGAAAAGAACAAATCTGTACTGGGGAAGAGGCTGTTCAAAATTGAAAAT MGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGLILVWIQQNNSIRSNVLIRSNKYLVSELRNSMARIFSILLFITCVYYLGRIPSPIVTKKLKETSETEERGESEEETDFLEGQVVPNGKYRTVDMISSTSRSNHHSTTTTSAFAPTSSATTFATSTSTATSSASITTSTSSTTLSTAASHQLRKFKDQGFLIYEEENNIRVLLEYEGKLIQDETIIYMQQKISTFVEKNKSVLGKRLFKIEN Homology
BLAST of Lsi01G019100 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q06GT8 (Protein TIC 214 OS=Drimys granadensis OX=224735 GN=TIC214 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 478.0 bits (1229), Expect = 1.0e-133 Identity = 242/256 (94.53%), Postives = 249/256 (97.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A6MM95 (Protein TIC 214 OS=Buxus microphylla OX=153571 GN=TIC214 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 477.6 bits (1228), Expect = 1.3e-133 Identity = 242/256 (94.53%), Postives = 251/256 (98.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A6MMG9 (Protein TIC 214 OS=Chloranthus spicatus OX=13006 GN=TIC214 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 476.5 bits (1225), Expect = 2.9e-133 Identity = 242/256 (94.53%), Postives = 248/256 (96.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0ZIW0 (Protein TIC 214 OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=TIC214 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 475.7 bits (1223), Expect = 5.0e-133 Identity = 245/259 (94.59%), Postives = 251/259 (96.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0G9G1 (Protein TIC 214 OS=Liriodendron tulipifera OX=3415 GN=TIC214 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 472.6 bits (1215), Expect = 4.2e-132 Identity = 241/256 (94.14%), Postives = 247/256 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3S424 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii OX=3677 GN=ycf1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 3.5e-137 Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3RWE9 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii OX=3677 GN=ycf1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 3.5e-137 Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3RU58 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii var. japonica OX=61011 GN=ycf1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 3.5e-137 Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3S6W7 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii var. japonica OX=61011 GN=ycf1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 3.5e-137 Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A515BLT2 (Protein TIC 214 OS=Siraitia grosvenorii OX=190515 GN=ycf1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 3.5e-137 Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. NCBI nr
Match: YP_009753666.1 (Ycf1 protein [Trichosanthes wallichiana] >QIT04685.1 Ycf1 protein [Trichosanthes wallichiana]) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 7.2e-137 Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. NCBI nr
Match: QJD26342.1 (Ycf1 [Trichosanthes kirilowii] >QJD26429.1 Ycf1 [Trichosanthes kirilowii]) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 7.2e-137 Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. NCBI nr
Match: YP_009430686.1 (photosystem I assembly protein Ycf1 [Gynostemma cardiospermum] >ART65049.1 photosystem I assembly protein Ycf1 [Gynostemma cardiospermum]) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 7.2e-137 Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. NCBI nr
Match: YP_009738261.1 (Ycf1 [Siraitia siamensis] >QIB71654.1 Ycf1 [Siraitia siamensis]) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 7.2e-137 Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. NCBI nr
Match: YP_009440204.1 (hypothetical chloroplast RF19-like protein [Gynostemma longipes] >ATG86915.1 hypothetical chloroplast RF19-like protein [Gynostemma longipes]) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 7.2e-137 Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. TAIR 10
Match: ATCG01130.1 (Ycf1 protein ) HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 4.2e-127 Identity = 239/266 (89.85%), Postives = 245/266 (92.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. TAIR 10
Match: ATCG01000.1 (Ycf1 protein ) HSP 1 Score: 452.2 bits (1162), Expect = 4.2e-127 Identity = 239/266 (89.85%), Postives = 245/266 (92.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. TAIR 10
Match: ATMG00370.1 (Ycf1 protein ) HSP 1 Score: 297.4 bits (760), Expect = 1.7e-80 Identity = 157/181 (86.74%), Postives = 163/181 (90.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G019100 vs. TAIR 10
Match: AT2G07739.1 (Ycf1 protein ) HSP 1 Score: 295.0 bits (754), Expect = 8.6e-80 Identity = 156/181 (86.19%), Postives = 162/181 (89.50%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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