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Lsi01G018990 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAGAAGGTTGGTTACGTTGTTTTGTAGAAGAGATATACTTGAAAAGTTATGTTAGTTGGAGAAAAAGATACGTGCATGCATGGTCATTAAATAAGGGTGGATGGTAAAATGAGAGGCAAAATAGGAAGAAAAGATTCTCCCTCATTGTCTCTTTTAATATAGTAATAGATTTCTAAAAACTCAAGGACAATGTATATTTTGAAAATTTAGAGACCAAATGATTCTATTCTTATAAATTTGGGGACTAAAAAGTACATTTTAAAAACTTAAGGACCAAACGTACATATTGTTCAAAACTTGGGGATTAAAATAGTAATTTTTCCTTTAAAATTTTTTCAACATAAAATAATTAAACAAGAATACAATGATGTAAGTGGTTGACGAAACATAAAAGGTGCATGTAATTATATTCCACATAGTCGAGCTTATTTTTGTTAGTGAGGCAACTTAAAAAAACAAACTCCCACATTTTTTATAGTTTTGATAGCAATTAAAATGTACCATTTATGTCTTAAATTCATGTTAATTTTGTTATTCAGCATTTAATTGTTTATTTTGCATAGGTCGAGTAATTCGTGTTGGACCAAAATTGAGCAAATGTGTACTGAAAAATGAAGTCCAAAACCAAATGACCCCGTATAACGATCCGACTTTTAAGATTTTTAAGTGGGGTTCATTACGACATGTATGCAATTTCAAATTGAAAATTGGTTGACCATTAAACTTATAATAAAAAAAATTCTCAATTAAATAAAATTTAAAAAACAAAACATTACTAATATAATTTAAAGAATACTAAAACAAAGTTTAATTCGAGATTCTTAAAAACATTAATGAGAAAAAATATAAATTTTAAACTTCTAACTCGACGGTTTTCATAAAAACATCCATAACAATTTTGAAAACTTAACTATATGGAAGGGACAACACTAATCCTAGTTAACAAAACTCCCGTCAAGTGCCTGATACATTCTTTCTCTAAAAAATATTTTAAGAAAAGTATGAGTATTTAAAATACTCACTGAGTAACCACACTCTAGGGTAGGCTATTGATGGTGGATCTTTCAAGCGTCGTTTAATTCCCGAAAAGACCTCCGATCAAATGAAATTTATAATATACCAAACTACTACCTATACTACGATGACGTAGCATAAGCGGCAAGTCCGGGGTCGAACTACAGGAAAGCTTTAATGTAGTTTCAAGCTAATTAGCATTTTCTAGCTAAAGCGGTAACGGGGGAGGAGGTTTGGAATGGAATAGAGAAATGCATGAAAATAAAATAAAGTTAAAGCAGAAAAATGTAATTGTTGTTACATTTTCTTTATATTTAATAAGTTTATTATGAAGTTTCAATTTTTAATTTAATAAGAGAGTTTTCACTTTTGAAAAAAACGTATTTGTTGAATAAATTGCATAATAACGTTTAGATCTAATTTTACTATAAATAGGTCTTTACTTTGCTCCAAAATATAGACCAACCAACAAATACATCTTTCTCTCTTGCTTTCTCTCATTTCTATCCTTAGCTCTTTTAAGAGCAATTGGCCAAAAGAATGATGTTTCAGTTGTGGAGCTTTAAGCTCAATCTTTCAGTGCAGAGTGGTTTGAGCTACACAACGTTTCCGTCGTTGGGTTGTATTCTGGAGGGGACAGGCCAGAGAATATCTGTTGCATCGGTGGTTGACGTTAAATAATTTCAATATACACCGCAGAGGGCTTGAATCTCCTTAAAGAGAGAGAGATATCCCCGCCTCAACCTAATTGTTTACGTGTCTATTTCTCAATATTTACTCTATTTTTCCTCTATTATTTGTAATTCCCCCATCAATTTTAAGGAGATTCATTGATGGAGTCTACTATTGAGAAACCAAATGAGAATGTTGGAGATCTCAACAAGCCATTTCGATTTAAGGGAGCACACTTCAAAAGATGAAAAGGGAAAGTGTTGTTCTACCTTAATCTTCTCAAAGTGGCCTATGTCCTCACGGAAAAGAACCCAAAGAAGATTGATACTGAAAGCATGGGCCTTGAAGAGTTCATGGGACACCAAGAGAAAATTGACAAGTATGAGAAAGATGAATATAATTGTCGGTATTATCTTTTAAACTGTCTTGCTGATCATTTTTATGACTATTATGATAATACTTTCACGTCTGCCAAGAAAATATGGAAAGCCTTGCTTGCAGAATAAATATGATACTGAATAAGCCGGTGCGAAAAAATATGCTGCAAGTCGCTTTTTTCGTTTTCAAATGGTGGATGGAAAATCTGTGGTAGAGCAAGCACAAGACTTTCAGATGATAGTGGCTGAAGTAGCATCTGAAGGAATTAAGATTGGAGACAATCTTATTGTTGCCGGCATAATTGATAAATTTCCACCATCATGGAGAGAATTTCAGAAAAATATGCGTCACAAGCGAAAGGAAATCTCTCTGGAAGTATTAATTACTTGCATCCGTGTAGAGGAAGAGGCAAGAGGGCAAGATGCTTTGATTCAAGAAGGCAATGAAAATCTCACAAAGGTAAATCTAATCTCTTCTAATGATATATCTAATGGTTAGAGTCCTAAAAATAGTCATTTAAAGCCAAAGAAGAATAATGTGAAAAAGAAGAATAAATCTCACTTTTCTAATAACAAGAAATATCCAAATCACGTGAATAACAACCAAGCACATTCTCAACACTCCAAAACATTTTGTTTTGTTTGTGGCAAAAGTGGGCATATTGCTCGAATTTGCAAATTTCGGAAACGAGAACCTGTATCTCAGGCTAATGTTACCGAAGAGCCATTTGTGGCTATGATAACTGATATATATATATATATGGTTCAAAGTGTTGAAGGATGGTAGGCTGATTCTGGAGCCAATAGACATGTTTGTTATGACAAAAATTGGTTCAAAATTTATACTCCTTTTGAGGAGCCTAAAATAATAATGCTTGGTGATTCTCATACCACCCAAATTTTGGGATCTGGTGAGGTTGAATTAAAATTCACCTATGGAAGGGTTCTAATTTTGAAAGATGTGCTTTACACACCCTCCATGCGGAAGAATTTAATGTCAAGTTATCTTCTTAATAAAGCTGGCTTTAAACAGACTATGGAATCTGATCAGTATGTGATAACAAAAAAGGGAATTTTCATTGAAAAAGGTTATGCATGTGACGGAATGTTCAAATTAAACATTGAAAATATTAATAAAGCACCTACCAGTTCGGTTTATATGCTCTCTTCTTTAAATTTTTGGCATGCTCGATTATGTCATATAAATAGTAAATATGTGGGGATAATGAGTAGCCTTGGATTAATTTCTAGCTTAAAAAATAATTTTGAGAAATGTGAAATATGTAGCAAAACTAAGATTACAAAAGGACCTCATAAAAGTGTTGAGAGAAATACTGAATTATTAGAATTAATTCATATTGATTTGTGTGAATTTGAAGGAATTTTAACTAGAGGAGGAAATAGATATTTTATCACTTTTATCAATGATTTTTCAAAATATACTCATGTTTATTTATTGAAAAATAAAAGTGATGCTTTTGAGAATTTTAAAAAATTTCTCGTCGAAGTTGAAAATCAATTCGGTAGAAAAATTAAAAGAATTAGTATGTTGAATCATTTGAATTCAATTCATATGTTGAATCATTAGGAATAATTCATGAGACTACTCCCCATATCCACATGCTTCTAATGGAGTAGTTGAGAGGAAAAATAGAACCTTAATTGGTTTGACTAATGCAATGCTACTAGAATCAGGTGCATCTTTTAATCTTTGGGGTGAAGCAGTTTTGACTGCTTGTCATATGTTAAATAGAGTGCCACATAAAAAGACAAAGATTACACCTTTTCAATTATGGAAAGGGTATAAGCCAAATTTGGGATATCTAAGAGTTTGGGATGTTTAGCTTTTGTAAGGCTAACAGATCCTAAAAGACCAAAATTAGGGTCTAAAGCTATCACTTCTGTTTTTCTTGGATATGCAATTAATAGTACAACGTATAGATTTCTTGATATTGAGCATAATTTGATTTTTGAATCAAGCAATGCTATTTTTCATGAAGAAAAATTTCCTTTCAATTCAAGAAATAGTGGGGGTCAAAGTAGTGAACAAACTTCTAAGTTTGGTTCCTCTACTCCTAATGATAATAACGACAATAATTCTTTAGAATTGAGGAGGAGTAAAAGAGCTAGAATTATGAAGGATTTTGGTCTTGATTTTTATGTTTATAATATTCAGGAGACACCAATTTCTTTGCAAGAAGTTTTAACATCTCCAGATGCAATTTTCTGGAAGGAGGCTGTAAATGATGAGATAGAATCACTAATTTCTAATAAAACTTGGAAATTAGTTGATTTACCACCAGGTTGTAAAACTATTGGGTGTAAATGGGTCCTGAGAAAAAAACTCAAACCGGATGGTAGTATAGACAAGTATAAAGCTAGACTAGTTGCAAAAGGTTTCAAACAAAAGGAAGATTTAGACTTCTTTGATACTTTTTCTCTGGTTACGAGAATCACATCCATTAGATTATTAATTGCAATTCCTGCAATTTTTTATATGAGTGTTCATCAAATGGATGTGAAAACAACTTTTCTAAATGGTGATTTAGAAGAAGAAATTTATATGGACCAACCTGAAGGTTTTATAGAACCTGGACAAGAGAACAAAGTCTGTAAGCTTACTAAATCCCTATATGGCTTAAAACAACCTCCAAAGTAGTGGCATGAAAATTTTGATTCTTGCATGTTAAATAATGGTTATAAACCAAATGAATGTGATAAATGCATATATAATAAATCATGGAAAGATTCTCATGTTATTATTAGCCGATATGTTGATGATTTACTGATCTTTGGCTCAAGTATATTTGTTATAAATGAAACAAAAAATTTGTTGAGCAATCATTTTGATATGAAAGATGTTGGTGAGGCTAATTTTATTCTGGGTATGAAAATAACAAAAATACCATATGGATTTCTTCTTGACCA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ATGCAGAAGTTTGCGCATATAGTTGAGTCTAATATGCTGTTGTGTATTGGATTTGGAGCAGACCATCTGACCGATCCTTTGGGCATGCAAGTTAGGATGGATGAGGCAGGGGTTGGTGCGCTTGCACCCATTCCACTAAGATCAACAGTGGTAAACTCGTTAGAGCTTGGAGGAAGAGAAATTGATGTAAACTCGTTAGAGCTTGGAAGAAGGGAAATTGATGATTTAGGTACTTCAACAATAGATTCTTTAGAAGTAGGAATTGTAGCTTCCAAAGTTGTTGGAGCATGTATTGAATCAAGAAAGGTTCTAGAAGTTGCCATGAGTGTGGATGGAGAAGATATGATAAGGAGGAAGAAGAATGTGAAGAAGAATGTATCATATCGAAAAGCCATTGAATAA ATGCAGAAGTTTGCGCATATAGTTGAGTCTAATATGCTGTTGTGTATTGGATTTGGAGCAGACCATCTGACCGATCCTTTGGGCATGCAAGTTAGGATGGATGAGGCAGGGGTTGGTGCGCTTGCACCCATTCCACTAAGATCAACAGTGGTAAACTCGTTAGAGCTTGGAGGAAGAGAAATTGATGTAAACTCGTTAGAGCTTGGAAGAAGGGAAATTGATGATTTAGGTACTTCAACAATAGATTCTTTAGAAGTAGGAATTGTAGCTTCCAAAGTTGTTGGAGCATGTATTGAATCAAGAAAGGTTCTAGAAGTTGCCATGAGTGTGGATGGAGAAGATATGATAAGGAGGAAGAAGAATGTGAAGAAGAATGTATCATATCGAAAAGCCATTGAATAA MQKFAHIVESNMLLCIGFGADHLTDPLGMQVRMDEAGVGALAPIPLRSTVVNSLELGGREIDVNSLELGRREIDDLGTSTIDSLEVGIVASKVVGACIESRKVLEVAMSVDGEDMIRRKKNVKKNVSYRKAIE Homology
BLAST of Lsi01G018990 vs. NCBI nr
Match: KAE8649712.1 (hypothetical protein Csa_012861, partial [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 107.5 bits (267), Expect = 9.3e-20 Identity = 65/116 (56.03%), Postives = 78/116 (67.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018990 vs. NCBI nr
Match: KAG6581979.1 (OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 1.2e-06 Identity = 49/128 (38.28%), Postives = 67/128 (52.34%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018990 vs. NCBI nr
Match: KAE8649705.1 (hypothetical protein Csa_011947, partial [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 3.8e-05 Identity = 39/82 (47.56%), Postives = 50/82 (60.98%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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