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Lsi01G018410 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTGTACAAACTAGGTTATTGATTAATTGAAATGAAACAAACAAGTTTTATTTCGTATTCATTTAGGACCTATTCTTATTATAAGTCTCTGATAACTATAGGTTATTTAAATTCAATTATATGACTTTATGATTTTTTATATCCTTATTTTTTGTCCCTTCCTTTTGGTATTAACCGTACAATACTTAAGTTATCTTGATATACAGGTACATGGTAATTTCATGGTTCATTGGACCATATGTGGAACACATTGATGAACTGAGTTTTTTTTTCCTTCTCGATTTGTTTGATTTTTTAGGTATATCAGTGGAGATTTCTGCTGCTACTATGTGATTTAATTTTCATTTAATTTTCCTTGTGTTTTTCTTTGAGTTTGCGGATACTAGTGAACTGAGGACTGGATATGCTGCATTGATTTTGTTGGTTTCATAAATTTGTTGTTAACAGTACAATATTAGTGAGCTAGTTTGTACAACAGGTGGAGAGCTAATACTTATACATCTCTTGCAAGACTTGGCTTTCAACCTTCACTTATACTTATTGTAATTGACATTTGCGCTAACTTATGTTTTTCACTTATCTTTTTAATCAACTAGTCAAGAGTTTTTCTAAAAAAATGAAGAACAAATTTTAGAATATCTCAGTTAGTGAAAACATCATGTTAAATAATTTACTGAACTTCTGCAGTGATGTTTTGTTTTTAACCATAGTTTTCGTTATGCTAAGAAAATGCATGTTTATTGTTGAGTTTGTTTCCATTAATTGTTTTTGTTTAAGTTTGTTTGTGTTTAATAAGTTTGTTTGGGTGTTTGCTTTTAGTCCTTATGTGGTAATTGTTTAAACTTTGACTTGTAGCGGCACGATTATTGTACCAACAACAATAGGATTGGAGTTTGTTTCACAGGCATGGAGATAACAATTATGTTCTTGTTAATACTTTAAATCTCTTACTTTCTCTTTGCAGAGTGGTCATTGCTTTTGCTGCATGGGACATACTTTGTAATATTTTGAGTGGCTAATGTATATATTAGATGAATTCATATTTATTGCATTTCGAGCATAAGTCGAACGCTCTTTCTCAATGCAGGAATATGCTTTAACTTACAGATGAATTCATCACTGCAGTTAAACAGTGTTATATAGAGAAGCTTCTAATTCAGGTATATATGTTGCTATAACTACACTTATGATGTCTGTATGATTTTTGCAGTGTGTAATCTCTCATTCAGATACAAAGATTTTGCTTGTCAATGGTATTATTGTTCATCTTGTTTATGTTTGGTATCTACGCATTATTTAGGGTTTTGAAAATTTAAGTCACTGATTTTTTTGTTGTTTGTAGGTTTTTGCTTCAAAAATTAAATTCTGAACTTGACGATGGGGCTTCACGAAGTATTTGACGCTCGAAAAGATAATTATTGAGAGTCAACATGTAATTTAAGATTTTAGAGTCTTGTATTTAAAGTTTTGTTTATCTCTGTGAAGTGAATGTAGTTTGTGGAGAGACGGATAGTCATATTACTTTTGTTGGAGTGAATTAGTTAATTGTTGTGTTTGTTGAAAGTTGAGTTATAGTGTATACAAATATCATATTACTTTTATCATATGCATAGAAATATTAATTTTGTTAGTCAGCCATGTATGCAACTAATTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTAATAAAGCAATGATGACAATCATTACCTTTCACAAAAAATTAATATTTAATGACGGGCAATTTCATTTAATGTCGATCAGACGACCAACATTGAAGCTGTTAGTGTTCAATGTCAGTCATTTATAATGTCGGTCAAAAATTGACATTAAAGACATCGATAATGTTGGTCAAAAACCAACATTAAAGGCGACCAACATTGAACATCTTTAAGAAAACGTTCTTTGATGTTGATCGCTTGACTGACACCGTACTCCTATAATGTTAGTTTTTCACTAACATTATAGCCTATTTTTGTTGTAGTGATATTGTAATATATCTTATACAATATTTTAATTGCATCATATACAATTAATTTCCTAAATCAACTTGAACATTTCAAATTCTTTGAACACTTAATTTCCTTATTTAATCCGTTATAATCTGGCAGAGGGACCTTATGAACCAACAATCATAAGCTCCAATGATTCGAAATTTAATTAATTAAACTTTTTAATTATATTAATCAACCTTCATTAATTATGGGGCATGCCATTAAAGATCCATAGTTGCACTCTTATGAACTGTAGAATATTTATGTGTCCATTGAATTAACCAATTCATGTAAGTCAATCTTTCACAAGTTTTTCATGATTACAGTTTGGTCAAATTATCATTATACCCCTATAATTACTTCTTGCACCTTAAATACCACTGATTCTCTAGTGAACAATTATGTTTATTGTCCAACCATAAACAAAAGTCCCTCTCGAGGTAGTGAGAGGGTGAGACCTTATTGTTCAAGTCCTGGAGTCAGCACTAAAGGGAACAACCTTTCTACTCACCCTAAGGGCGGGAAAGAGTGAATTCCTTCTTGTGAAGTTAATTATGTTCCTACCTCCTCACTCAGTATTGTTTCAAAAATGGTAGGCATGTTGAGTCGACAGCTAAGGTCACTCTCGCCCATACAAATCAAAGAACAACCCTTGTGAGTAGGAGTTCATAACTCACTTAGGATTGAAATCGAGTTACATGGTTATTGTTCGAAATATAAAACTCATCATTTAACGATGTTACAAAGAGAGATTTAATTTTGTGGTCCAGTCTTCTCAACCTCTTCAGGTATCTTAGGACATTATTTCTTAGATAATGTAATTCCATGCCTGAAAGGTAAATTACCTTTCTTGGAATTTTGCATCGAATATCTGACAAACATTTTGTCAATATAAGATACCTAAGACAAGGTTAATGTTATGTTCCTGCGATTTCGAACAATTTGAATTCCAAGAACAAACTGCGTTTCTCCCAAATCTTTCATTTGAAATTGGCAGATAGCCAATTCTTAATGTCAGTAAGGAATCCTACATAATTTCCAATGAGTAGGATGTCATCTACATATGACACAAGAAAAGAACTAGTACCTTCAATAATTTTCTTGTATATACAAGGTTCAACAAAATAACATAAGTTTGTTTAGGTGTTTGCTTTTGATCAAAGTCATGAGATTTGATGGCAGTGTCAAACCTTATATTCCATGATCGGGATGCCTGTTTCAATGGCAAGAATTATGTAGGATTCCTGCAATTTCAAACAATTTGAATTCCAAGAACAAATCGTGCTTCTCCCAAATCTTTCATTTAGAATTGGCAGATAGCCAATTACTAATATTAGTAAGGAATCCTACATACATTATAAGAAATCTGGGCGTTGATGTCAGTTGAAAAAACTAAAAACGGATGTACAATGTCGGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTAGATCCTTAATGTCGATTTTAAACCAACATTATAGGCTTACCTATAATGTCAGTGTAAAACCGACATTAAAGATCCGCTTTTTTTTTTTAATCTCAAACAATCTTTTAATCTTCATTTTTTTTGTTTCCCTCCTTTCCTCATTTTCATTTCCCTCTTAAATTTTGTTTCCCTCATTCCCAAATTATCAATTAGAAAATGAAGAATAATATATATTTTTTTATTTTTTTAGTAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAACTCCTCTTCTTTTGAATCTCTTTCATTTCTCTAACTTTCTCCTCTCTCCTTTCTCACTTCTCTCCTTCAAACCTTCACCTTCCATTGTGTTCATTTTTCTGTCAATCAGGTCCGTTCAATCCGTTCGTCGTGTAGGTTCGACATCATTTAGCTCGTGTTCAGCTTGTCACCGACATCATTCAGCTCGTTGTGTAGCTCATCGTCGTCGTTGGCGTCATTTAGCTCGTGTTCAACCCGCCGCTGTGAGTCGTGCGTTATATCGTCGATTCCTTCATCAGATCGTCGATTTGTTCATCATATCCAAAGGATCTGAATCGAAGGTGAAAATTTTATGGGTTTTCATTCCCTCCGTGTGGGTTATTTTTGTCGACGTTATGGATGTTTGATAAAAGTTTGCCCTTTAAAACCACATTAGAAGCTATAACTTGCAAGAAATTTTCATCTAGTGTTTTGTGATTCATCACTTGTCTAGTCTCTCTTTTTGTTGGTTTTTTTTTGTTCTATTTGGTTGGGTAGAAAATGAAAGAAATTTTGTTGTAGTTGTTTGGAGCCTTTTTAGTTGAAATTATCATTTGGAATAAGACCCTTAATGTTGAAGTTAATTAATTTTTTTTCATGATTTAGAATTTGATTCAAGATTCCTTAAGCCAAAAAGAGATTGTTGTGTTTGGATAATGATTTAGAATTTGGGCCATTTTGGTGTAGTTCGGTGGGTAATAACGTTGTTTAGATCATTTTAAACTCTTTTTAAGGTGTGTTATAATTGTCCTTAATACTTAAGCTTTTGTGTGTAGCTTTGAATTAGTTTTGGACTCCTTCAAACACTTTTAAGCTAGACTTAAGTCATTTTGGTAAGTTTTATGTGTTCAAAACTTTGTTTAAATCCTTCCAAGTTAAACTAAGTATTGCATATTAGTTTATAATCCTTGGTAACTCTATGTTTGTAGTTTGAAACTAATTAGGAGTGCTCAAATTAATTTTTAAGGTTTTGTTAAGGTAATAACATCTCCCATGGACATTATTTTAATTCGATTAAGATTTTACAACTAAAGTTTCGCCTCTAAAACCTTATTCATATTGTCTAGGAAATCTTGGGTTTGTTTTTAGGAGCATAGTAAGCAAGTGGAGTTCTAACTACCATGGCGCATTTTTATAAGGTAATACTTATGCTAAAAACTCTAAAATCTTATTCATGTTGTCTAGTAGATCTTCCAATTATTTTAAGAGTATAGTGATGCATATTTTACAAGGTAATATTTATAAGACATTTTGCTTAAAACTCTATTTTATTCTAAAGTGTTAAATTAGAAAAAGTGTTAG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ATTATTCTCTCTATTCTTTTTTTTTTCAAACACATCCAATTTGAATTAAATCTACCTAGTAATATAAGCAACAAAAGCCTCAAATTCCCTACGAGACTCGCCATCGTCTTCCATCGACTGTCGCACAACATTCCCTAGCCTTTCTGCATTCTTCCTTACCTGTGCCCCTTCCTCCGACACCATCAACTTTCGAACAACCTCCTCCACTGCATCAGCCGTCACCACGTCTCGCCGCCAATCCTCTAGCACCACCCCTACGCGCAATACCATAGTCATGAGCACTGTGTTCCTCGGCTGGTCGGAGTGCATTGGCCAAGCAGCCACTGGAACCCCCGTCGTCATGCTCTCCATGCACGAGTTCCAGCCGCAATGCGTCATGAATCCCCCCGTCGCCCAGTGGCTCAGTATCTCCACCTGTGGCGCCCAGTCTCTTATTACCAACCCTCTGTTGCCAATTAAGTGTTTGTAG ATGGTGTTTTTGCTTCAAAAATTAAATTCTGAACTTGACGATGGGGCTTCACGAACAACAAAAGCCTCAAATTCCCTACGAGACTCGCCATCGTCTTCCATCGACTGTCGCACAACATTCCCTAGCCTTTCTGCATTCTTCCTTACCTGTGCCCCTTCCTCCGACACCATCAACTTTCGAACAACCTCCTCCACTGCATCAGCCGTCACCACGTCTCGCCGCCAATCCTCTAGCACCACCCCTACGCGCAATACCATAGTCATGAGCACTGTGTTCCTCGGCTGGTCGGAGTGCATTGGCCAAGCAGCCACTGGAACCCCCGTCGTCATGCTCTCCATGCACGAGTTCCAGCCGCAATGCGTCATGAATCCCCCCGTCGCCCAGTGGCTCAGTATCTCCACCTGTGGCGCCCAGTCTCTTATTACCAACCCTCTGTTGCCAATTAAGTGTTTGTAG ATGGTGTTTTTGCTTCAAAAATTAAATTCTGAACTTGACGATGGGGCTTCACGAACAACAAAAGCCTCAAATTCCCTACGAGACTCGCCATCGTCTTCCATCGACTGTCGCACAACATTCCCTAGCCTTTCTGCATTCTTCCTTACCTGTGCCCCTTCCTCCGACACCATCAACTTTCGAACAACCTCCTCCACTGCATCAGCCGTCACCACGTCTCGCCGCCAATCCTCTAGCACCACCCCTACGCGCAATACCATAGTCATGAGCACTGTGTTCCTCGGCTGGTCGGAGTGCATTGGCCAAGCAGCCACTGGAACCCCCGTCGTCATGCTCTCCATGCACGAGTTCCAGCCGCAATGCGTCATGAATCCCCCCGTCGCCCAGTGGCTCAGTATCTCCACCTGTGGCGCCCAGTCTCTTATTACCAACCCTCTGTTGCCAATTAAGTGTTTGTAG MVFLLQKLNSELDDGASRTTKASNSLRDSPSSSIDCRTTFPSLSAFFLTCAPSSDTINFRTTSSTASAVTTSRRQSSSTTPTRNTIVMSTVFLGWSECIGQAATGTPVVMLSMHEFQPQCVMNPPVAQWLSISTCGAQSLITNPLLPIKCL Homology
BLAST of Lsi01G018410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P5BYP0 (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Parasponia andersonii OX=3476 GN=PanWU01x14_199110 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 104.8 bits (260), Expect = 3.3e-19 Identity = 67/128 (52.34%), Postives = 78/128 (60.94%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0S3SU27 (Uncharacterized protein OS=Vigna angularis var. angularis OX=157739 GN=Vigan.08G326900 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 101.7 bits (252), Expect = 2.8e-18 Identity = 64/127 (50.39%), Postives = 79/127 (62.20%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7RK42 (Pyrimidine-specific ribonucleoside hydrolase RihB (Fragment) OS=Striga asiatica OX=4170 GN=STAS_35345 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 4.0e-17 Identity = 59/110 (53.64%), Postives = 71/110 (64.55%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: U5CRB9 (Uncharacterized protein OS=Amborella trichopoda OX=13333 GN=AMTR_s00039p00079820 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 2.2e-15 Identity = 58/108 (53.70%), Postives = 66/108 (61.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P5C7M8 (Uncharacterized protein OS=Trema orientale OX=63057 GN=TorRG33x02_294610 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 2.2e-15 Identity = 60/115 (52.17%), Postives = 68/115 (59.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018410 vs. NCBI nr
Match: PON53914.1 (hypothetical protein PanWU01x14_199110, partial [Parasponia andersonii]) HSP 1 Score: 104.8 bits (260), Expect = 6.8e-19 Identity = 67/128 (52.34%), Postives = 78/128 (60.94%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018410 vs. NCBI nr
Match: BAT96348.1 (hypothetical protein VIGAN_08326900 [Vigna angularis var. angularis]) HSP 1 Score: 101.7 bits (252), Expect = 5.8e-18 Identity = 64/127 (50.39%), Postives = 79/127 (62.20%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018410 vs. NCBI nr
Match: GER57529.1 (pyrimidine-specific ribonucleoside hydrolase RihB, partial [Striga asiatica]) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 8.4e-17 Identity = 59/110 (53.64%), Postives = 71/110 (64.55%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018410 vs. NCBI nr
Match: PON57033.1 (hypothetical protein TorRG33x02_294610 [Trema orientale]) HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 4.6e-15 Identity = 60/115 (52.17%), Postives = 68/115 (59.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi01G018410 vs. NCBI nr
Match: ERN15756.1 (hypothetical protein AMTR_s00039p00079820 [Amborella trichopoda]) HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 4.6e-15 Identity = 58/108 (53.70%), Postives = 66/108 (61.11%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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